Predicted mutation | ||||||
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MC JC | CP009974 | 2,509,653 | Δ2,602 bp | RPPX_11210–[RPPX_11220] | RPPX_11210, RPPX_11215, [RPPX_11220] |
Missing coverage evidence... | ||||||||||
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* | * | ÷ | CP009974 | 2509653–2512249 | 2512254 | 6–2602 | 277 [0] | [0] 275 | RPPX_11210–[RPPX_11220] | RPPX_11210,RPPX_11215,[RPPX_11220] |
New junction evidence | |||||||||||
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* | ? | CP009974 | = 2509652 | 0 (0.000) | 266 (1.050) | 171/288 | 0.0 | 100% | intergenic (+3590/‑204) | RPPX_11200/RPPX_11210 | beta‑aspartyl peptidase/integrase |
? | CP009974 | 2512255 = | 0 (0.000) | coding (24/1236 nt) | RPPX_11220 | hypothetical protein |
Only 100 of 275 total aligned reads displayed.
GGACGCAGAAATTGACGACGCCAGCCAACCCGGACTAACAATGCCACCCCTGCGTCGCTGCGCTCCGACTGCCTGTCCGAATGAGCGTGGAACAGGTGTCCGGATCAGCGTGGGCTGAGTGTCCGAATGGCGTGGAATCCGCACAACATCCGGTTTTTTCAGGCCATGGGGCTGGTCGAGCTGGCCCTGCAGTGGCGCAAAGGTGCGTCCACCCAACACTACATGATCTTTCGCGATGCACTCGCCGGTCATCGTTTGCGGGTGGCCGCGCAGACGCATAATCTGCTGATGTTCTGTGA > CP009974/2512106‑2512404 | cttgaagagcagcccaggatcatcgatgtctccagccagctggatcgtctgttggctgtaaccgatatcgacatgcaagtgccttatgtcaatgccaccttgagcgtctcgggcattatcagtaatcgcacgacgactacggtcaacatcc > 1:3863008‑M2/150‑151 (MQ=255) cttgaagagcagcccaggatcatcgatgtctccagccagctggatcgtctgttggctgtaaccgatatcgacatgcaagtgccttatgtcaatgccaccttgagcgtctcgggcattatcagtaatcgcacgacgactacggtcaacatcc < 1:1141333‑M2/2‑1 (MQ=255) cttgaagagcagcccaggatcatcgatgtctccagccagctggatcgtctgttggctgtaaccgatatcgacatgcaagtgccttatgtcaatgccaccttgagcgtctcgggcattatcagtaatcgcacgacgactacggtcaacatcc < 2:374146‑M2/2‑1 (MQ=255) ttgaagagcagcccaggatcatcgatgtctccagccagctggatcgtctgttggctgtaaccgatatcgacatgcaagtgccttatgtcaatgccaccttgagcgtctcgggcattatcagtaatcgcacgacgactacggtcaacatCCg < 1:455342‑M2/3‑1 (MQ=255) tgaagagcagcccaggatcatcgatgtctccagccagctggatcgtctgttggctgtaaccgatatcgacatgcaagtgccttatgtcaatgccaccttgagcgtctcgggcattatcagtaatcgcacgacgactacggtcaacatCCgg > 2:812675‑M2/148‑151 (MQ=255) tgaagagcagcccaggatcatcgatgtctccagccagctggatcgtctgttggctgtaaccgatatcgacatgcaagtgccttatgtcaatgccaccttgagcgtctcgggcattatcagtaatcgcacgacgactacggtcaacatCCgg < 2:1433145‑M2/4‑1 (MQ=255) agagcagcccaggatcatcgatgtctccagccagctggatcgtctgttggctgtaaccgatatcgacatgcaagtgccttatgtcaatgccaccttgagcgtctcgggcattatcagtaatcgcacgacgactacggtcaacatCCGGttt > 1:2415258‑M2/145‑151 (MQ=255) agcagcccaggatcatcgatgtctccagccagctggatcgtctgttggctgtaaccgatatcgacatgcaagtgccttatgtcaacgccaccttgagcgtctcgggcattatcagtaatcgcacgacgactacggtcaacatCCGGttttt > 2:2014890‑M2/143‑151 (MQ=255) gcagcccaggatcatcgatgtctccagccagctggatcgtctgttggctgtaaccgatatcgacatgcaagtgccttatgtcaatgccaccttgagcgtctcgggcattatcagtaatcgcacgacgactacggtcaacatCCGGtttttt > 2:4192217‑M2/142‑151 (MQ=255) cagcccaggatcatcgatgtctccagccagctggatcgtctgttggctgtaaccgatatcgacatgcaagtgccttatgtcaatgccaccttgagcgtctcgggcattatcagtaatcgcacgacgactacggtcaacatCCGGTTTTTTc < 2:1832532‑M2/11‑1 (MQ=255) ccaggatcatcgatgtctccagccagctggatcgtctgttggctgtaaccgatatcgacatgcaagtgccttatgtcaatgccaccttgagcgtctcgggcattatcagtaatcgcacgacgactacggtcaacatCCGGTTTTTTCAGGc > 2:1385468‑M2/137‑151 (MQ=255) gatcatcgatgtctccagccagctggatcgtctgttggctgtaaccgatatcgacatgcaagtgccttatgtcaatgccaccttgagcgtctcgggcattatcagtaatcgcacgacgactacggtcaacatCCGGTTTTTTCAGGCCATg < 2:3348017‑M2/19‑1 (MQ=255) atcatcgatgtctccagccagctggatcgtctgttggctgtaacctatatcgacatgcaagtgccttatgtcaatgccaccttgagcgtctcgggcattatcagtaatcgcacgacgactacggtcaacatCCGGTTTTTTCAGGCCATgg < 1:471881‑M2/20‑1 (MQ=255) atcgatgtctccagccagctggatcgtctgttggctgtaaccgatatcgacatgcaagtgccttatgtcaatgccaccttgagcgtctcgggcattatcagtaatcgcacgacgactacggtcaacatCCGGTTTTTTCAGGCCATGGGGc > 1:956789‑M2/129‑151 (MQ=255) atcgatgtctccagccagctggatcgtctgttggctgtaaccgatatcgacatgcaagtgccttatgtcaatgccaccttgagcgtctcgggcattatcagtaatcgcacgacgactacggtcaacatCCGGTTTTTTCAGGCCATCGGGc > 2:2659084‑M2/129‑151 (MQ=255) tgtctccagccagctggatcgtctgttggctgtaaccgatatcgacatgcaagtgccttatgtcaatgccaccttgagcgtctcgggcattatcagtaatcgcacgacgactacggtcaacatCCGGTTTTTTCAGGCCATGGGGCTGGTc < 1:2179217‑M2/28‑1 (MQ=255) gtctccagccagctggatcgtctgttggctgtaaccgatatcgacatgcaagtgccttatgtcaatgccaccttgagcgtctcgggcattatcagtaatcgcacgacgactacggtcaacatCCGGTTTTTTCAGGCCATGGGGCTGGTCg < 1:3624976‑M2/29‑1 (MQ=255) tctccagccagctggatcgtctgttggctgtaaccgatatcgacatgcaagtgccttatgtcaatgccaccttgagcgtctcgggcattatcagtaatcgcacgacgactacggtcaacatCCGGTTTTTTCAGGCCATGGGGCTGGTCGa > 1:4048209‑M2/122‑151 (MQ=255) 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tggatcgtctgttggctgtaaccgatatcgacatgcaagtgccttatgtcaatgccaccttgagcgtctcgggcattatcagtaatcgcacgacgactacggtcaacatCCGGTTTTTTCAGGCCATGGGGCTGGTCGAGCTGGCCCTGCa < 1:2874635‑M2/42‑1 (MQ=255) tggatcgtctgttggctgtaaccgatatcgacatgcaagtgccttatgtcaatgccaccttgagcgtctcgggcattatcagtaatcgcacgacgactacggtcaacatCCGGTGTTTTCAGGCCATGGGGCTGGTCGAGCTTGCCCTGCa > 2:3599925‑M2/110‑151 (MQ=255) gatcgtctgttggctgtaaccgatatcgacatgcaagtgccttatgtcaatgccaccttgagcgtctcgggcattatcagtaatcgcacgacgactacggtcaacatCCGGTTTTTTCAGGCCATGGGGCTGGTCGAGCTGGCCCTGCAGt < 1:1581431‑M2/44‑1 (MQ=255) gatcgtctgttggctgtaaccgatatcgacatgcaagtgccttatgtcaatgccaccttgagcgtctcgggcattatcagtaatcgcacgacgactacggtcaacatCCGGTTTTTTCAGGCCATGGGGCTGGTCGAGCTGGCCCTGCAGt < 1:2404868‑M2/44‑1 (MQ=255) atcgtctgttggctgtaaccgatatcgacatgcaagtgccttatgtcaatgccaccttgagcgtctcgggcattatcagtaatcgcacgacgactacggtcaacatCCGGTTTTTTCAGGCCATGGGGCTGGTCGAGCTGGCCCTGCAGTg < 1:3352241‑M2/45‑1 (MQ=255) 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tcagtaatcgcacgacgactacggtcaacatCCGGTTTTTTCAGGCCATGGGGCTGGTCGAGCTGGCCCTGCAGTGGCGCAAAGGTGCGTCCACCCAACACTACATGATCTTTCGCGATGCACTCGCCGGGCATCGTTTGCGGGCggcccc > 2:2959126‑M2/32‑149 (MQ=255) cagtaatcgcacgacgactacggtcaacgtCCGGTTTTTTCAGGCCATGGGGCTGGTCGAGCTGGCCCTGCAGTGGCGCAAAGGTGCGTCCACCCAACACTACATGATCTTTCGCGATGCACTCGCCGGTCATCGTTTGCGGGTGGCcgcg < 2:4581524‑M2/121‑1 (MQ=255) cagtaatcgcacgacgactacggtcaacatCCGGTTTTTTCAGGCCATGGGGCTGGTCGAGCTGGCCCTGCAGTGGCGCAAAGGTGCGTCCACCCAACACTACATGATCTTTCGCGATGCACTCGCCGGTCATCGTTTGCGGGTGGccgcc > 1:2056499‑M2/31‑150 (MQ=255) gtaatcgcacgacgactacggtcaacatCCGGTTTTTTCAGGCCATGGGGCTGGTCGAGCTGGCCCTGCAGTGGCGCAAAGGTGCGTCCACCCAACACTACATGATCTTTCGCGATGCACTCGCCGGTCATCGTTTGCGGGTGGCCGCGCa > 1:1411585‑M2/29‑151 (MQ=255) aatcgcacgacgactacggtcaacatCCGGTTTTTTCAGGCCATGGGGCTGGTCGAGCTGGCCCTGCAGTGGCGCAAAGGTGCGTCCACCCAACACTACATGATCTTTCGCGATGCACTCGCCGGTCATCGTTTGCGGGTGGCCGCGCAGa > 2:4155868‑M2/27‑151 (MQ=255) 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cacgacgactacggtcaacatCCGGTTTTTTCAGGCCATGGGGCTGGTCGAGCTGGCCCTGCAGTGGCGCAAAGGTGCGTCCACCCAACACTACATGATCTTTCGCGATGCACTCGCCGGTCATCGTTTGCGGGTGGCCGCGCAGACGCAt < 2:2526841‑M2/130‑1 (MQ=255) acgacgactacggtcaacatCCGGTTTTTTCAGGCCATGGGGCTGGTCGAGCTGGCCCTGCAGTGGCGCAAAGGTGCGTCCACCCAACACTACATGATCTTTCGCGATGCACTCGCCGGTCATCGTTTGCGGGTGGCCGCGCAGACGCATa > 1:3683564‑M2/21‑151 (MQ=255) gacgactacggtcaacatCCGGTTTTTTCTGGCCATGGGGCTGGTCGAGCTGGCCCTGCAGTGGCGCAAAGGTGCGTCCACCCAACACTACATGATCTTTCGCGATGCACTCGCCGGTCATCGTTTGCGGGTGGCCGCGCAGACGCATAAt > 2:2213378‑M2/19‑151 (MQ=255) gacgactacggtcaacatCCGGTTTTTTCAGGCCATGGGGCTGGTCGAGCTGGCCCTGCAGTGGCGCAAAGGTGCGTCCACCCAACACTACATGATCTTTCGCGATGCACTCGCCGGTCATCGTTTGCGGGTGGCCGCGCAGACGCATAAt > 1:3767275‑M2/19‑151 (MQ=255) acgactacggtcaacatCCGGTTTTTTCAGGCCATGGGGCTGGTCGAGCTGGCCCTGCAGTGGCGCAAAGGTGCGTCCACCCAACACTACATGATCTTTCGCGATGCACTCGCCGGTCATCGTTTGCGGGTGGCCGCGCAGACGCATAATc > 1:1938441‑M2/18‑151 (MQ=255) actacggtcaacatCCGGTTTTTTCAGGCCATGGGGCTGGTCGAGCTGGCCCTGCAGTGGCGCAAAGGTGCGTCCACCCAACACTACATGATCTTTCGCGATGCACTCGCCGGTCATCGTTTGCGGGTGGCCGCGCAGACGCATAATctgc > 1:4314453‑M2/15‑151 (MQ=255) gtcaacatCCGGGTTTTTCAGGCCATGGGGCTGGTCGCGCTGGCCCTGCAGTGGCGCAAAGGTGCGTCCACCCAGCATTATATGATCTTTAGCGATGCACGCGGCGGTCATCGTTTGCGGGTGCCCGCGCAGACGCATAATCCGCAGAtgc > 2:3814966‑M2/9‑150 (MQ=255) tcaacatCCGGTTTTTTCAGGCCATGGGGCTGGTCGAGCTGGCCCTGCAGTGGCGCAAAGGTGCGTCCACCCAACACTACATGATCTTTCGCGATGCACTCGCCGGTCATCGTTTGCGGGTGGCCGCGCAGACGCATAATCTGCTGATGtt < 2:5176184‑M2/144‑1 (MQ=255) aacatCCGGTTTTTTCAGGCCATGGGGCTGGTCGAGCTGGCCCTGCAGTGGCGCAAAGGTGCGTCCACCCAACACTACATGATCTTTCGCGATGCACTCGCCGGTCATCGTTTGCGGGTGGCCGCGCAGACGCATAATCTGCTGATGTCCt > 2:5153402‑M2/6‑151 (MQ=255) acagCCGGTTTTTGCAGGCCATGGGGCTGGCCGAGCTGGCCCTGCAGTGGCGCAAAGGTGCGTCCACCCAACACTACATGATCTTTCGCGATGCACTCGCCGGTCATCGTTTGCGGGTGGCCGCGCAGACGCATAATCTGCTGATGTTCtg < 1:3019079‑M2/147‑1 (MQ=255) 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Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |