| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| JC JC | REL606 | 784,729 | Δ2 bp :: IS186 (+) +9 bp | coding (598‑606/2262 nt) | ybhJ → | predicted hydratase |
| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | REL606 | 590717 = | NA (NA) | 150 (0.940) | 84/150 | 0.4 | 99.2% | noncoding (3/1343 nt) | IS186 | repeat region |
| ? | REL606 | = 784737 | 1 (0.010) | coding (606/2262 nt) | ybhJ | predicted hydratase | |||||
| * | ? | REL606 | = 592057 | NA (NA) | 134 (0.880) | 76/144 | 0.6 | 99.2% | noncoding (1343/1343 nt) | IS186 | repeat region |
| ? | REL606 | 784729 = | 1 (0.010) | coding (598/2262 nt) | ybhJ | predicted hydratase | |||||
Only 100 of 136 total aligned reads displayed.
CGTCTTAACGAGGCACCGAGGCGTCGCATTCTTCAGATGGTTCAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGG‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > REL606/591991‑592057‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑gggCCACAGGATGTGGCGCTGGCTATCATTGGCGCGGTGTTCAAAAACGGTTACGTCAAAAACAAAGTCATGGAGTT > REL606/784729‑784802 CGTCTTAACGAGGCACCGAGGCGTCGCATTCTTCAGATGGTTCAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGCCACAGGAT > 2:1297085/1‑76CGTCTTAACGAGGCACCGAGGCGTCGCATTCTTCAGATGGTTCAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGCCACAGGAT < 2:1931154/76‑1CGTCTTAACGAGGCACCGAGGCGTCGCATTCTTCAGATGGTTCAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGCCACAGGAT > 1:2181250/1‑76 TTAACGAGGCACCGAGGCGTCGCATTCTTCAGATGGTTCAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGCCACAGGATGTGG < 1:1436129/76‑1 TAACGAGGCACCGAGGCGTCGCATTCTTCAGATGGTTCAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGCCACAGGATGTGGC < 1:2830558/76‑1 CGAGGCACCGAGGCGTCGCATTCTTCAGATGGTTCAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGCCACAGGATGTGGCGag < 2:4602540/76‑3 CGAGGCACCGAGGCGTCGCATTCTTCAGATGGTTCAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGCCACAGGATGTGGCGCT < 1:1227231/76‑1 CGAGGCACCGAGGCGTCGCATTCTTCAGATGGTTCAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGCCACAGGATGTGGCGCT > 1:4867776/1‑76 GAGGCACCGAGGCGTCGCATTCTTCAGATGGTTCAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGCCACAGGATGTGGCGCTG < 1:2981988/76‑1 GAGGCACCGAGGCGTCGCATTCTTCAGATGGTTCAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGCCACAGGATGTGGCGCTG < 1:338303/76‑1 GCACCGAGGCGTCGCATTCTTCAGATGGTTCAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGCCACAGGATGTGGCGCTGGCT < 2:3647308/76‑1 CACCGAGGCGTCGCATTCTTCAGATGGTTCAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGCCACAGGATGTGGCGCTGGCTA > 1:4354993/1‑76 CACCGAGGCGTCGCATTCTTCAGATGGTTCAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGCCACAGGATGTGGCGCTGGCTA < 2:4184372/76‑1 CACCGAGGCGTCGCATTCTTCAGATGGTTCAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGCCACAGGATGTGGCGCTGGCTA < 1:1354080/76‑1 CACCGAGGCGTCGCATTCTTCAGATGGTTCAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGCCACAGGATGTGGCGCTGGCTA > 2:1725089/1‑76 ACCGAGGCGTCGCATTCTTCAGATGGTTCAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGCCACAGGATGTGGCGCTGGCTAT > 2:2794694/1‑76 ACCGAGGCGTCGCATTCTTCAGATGGTTCAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGCCACAGGATGTGGCGCTGGCTAT < 2:816158/76‑1 ACCGAGGCGTCGCATTCTTCAGATGGTTCAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGCCACAGGATGTGGCGCTGGCTAT < 2:2202827/76‑1 ACCGAGGCGTCGCATTCTTCAGATGGTTCAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGCCACAGGATGTGGCGCTGGCTAT < 1:2636993/76‑1 ACCGAGGCGTCGCATTCTTCAGATGGTTCAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGCCACAGGATGTGGCGCTGGCTAT > 2:640966/1‑76 CGAGGCGTCGCATTCTTCAGATGGTTCAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGCCACAGGATGTGGCGCTGGCTATCA > 2:4001217/1‑76 CGAGGCGTCGCATTCTTCAGATGGTTCAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGCCACAGGATGTGGCGCTGGCTATCA > 1:3316565/1‑76 GAGGCGTCGCATTCTTCAGATGGTTCAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGCCACAGGATGTGGCGCTGGCTATCAT < 2:3565687/76‑1 GGCGTCGCATTCTTCAGATGGTTCAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGCCACAGGATGTGGCGCTGGCTATCATTG < 2:2553207/76‑1 GCGTCGCATTCTTCAGATGGTTCAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGCCACAGGATGTGGCGCTGGCTATCATTGG < 2:5076085/76‑1 CGTCGCATTCTTCAGATGGTTCAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGCCACAGGATGTGGCGCTGGCTATCATTGGC < 1:256408/76‑1 CGTCGCATTCTTCAGATGGTTCAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGCCACAGGATGTGGCGCTGGCTATCATTGGC > 2:4254500/1‑76 GTCGCATTCTTCAGATGGTTCAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGCCACAGGATGTGGCGCTGGCTATCATTGGCG < 2:2386416/76‑1 TCGCATTCTTCAGATGGTTCAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGCCACAGGATGTGGCGCTGGCTATCATTGGCGC > 1:2829035/1‑76 CGCATTCTTCAGATGGTTCAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGACACAGGATGTGGCGCTGGCTATCATTGGCGCG > 1:1135109/1‑76 GCATTCTTCAGATGGTTCAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGCCACAGGATGTGGCGCTGGCTATCATTGGCGCGG > 1:4233543/1‑76 ATTCTTCAGATGGTTCAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGCCACAGGATGTGGCGCTGGCTATCATTGGCGCGGTG > 1:187156/1‑76 ATTCTTCAGATGGTTCAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGCCACAGGATGTGGCGCTGGCTATCATTGGCGCGGTG > 1:108132/1‑76 ATTCTTCAGATGGTTCAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGCCACAGGATGTGGCGCTGGCTATCATTGGCGCGGTG < 2:543597/76‑1 TCTTCAGATGGTTCAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGCCACAGGATGTGGCGCTGGCTATCATTGGCGCGGTGTT < 2:431942/76‑1 CTTCAGATGGTTCAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGCCACAGGATGTGGCGCTGGCTATTATTGGCGCGGTGTTC < 2:4052179/76‑1 CTTCAGATGGTTCAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGCCACAGGATGTGGCGCTGGCTATCATTGGCGCGGTGTTC < 2:3204149/76‑1 CTTCAGATGGTTCAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGCCACAGGATGTGGCGCTGGCTATCATTGGCGCGATGTTC < 2:4063560/76‑1 TTCAGATGGTTCAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGCCACAGGATGTGGCGCTGGCTATCATTGGCGCGGTGTTCA > 1:88883/1‑76 TTCAGATGGTTCAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGCCACAGGATGTGGCGCTGGCTATCATTGGCGCGGTGTTCA > 1:443838/1‑76 TTCAGATGGTTCAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGCCACAGGATGTGGCGCTGGCTATCATTGGCGCGGTGTTCA < 1:4819759/76‑1 TCAGATGGTTCAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGCCACAGGATGTGGCGCTGGCTATCATTGGCGCGGTGTTCAA < 2:1652702/76‑1 CAGATGGTTCAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGCCACAGGATGTGGCGCTGGCTATCATTGGCGCGGTGTTCAAA < 1:3525944/76‑1 CAGATGGTTCAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGCCACAGGATGTGGCGCTGGCTATCATTGGCGCGGGGTTCAAA > 2:1880510/1‑76 GATGGTTCAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGCCACAGGATGTGGCGCTGGCTATCATTGGCGCGGTGTTCAAAAA < 2:1394606/76‑1 ATGGTTCAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGCCACAGGATGTGGCGCTGGCTATCATTGGCGCGGTGTTCAAAAAC > 1:4758767/1‑76 GTTCAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGCCACAGGATGTGGCGCTGGCTATCATTGGCGCGGTGTTCAAAAACGGT < 1:2997126/76‑1 GTTCAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGCCACAGGATGTGGCGCTGGCTATCATTGGCGCGGTGTTCAAAAACGGT > 2:434338/1‑76 GTTCAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGCCACAGGATGTGGCGCTGGCTATCATTGGCGCGGTGTTCAAAAACGGT > 1:1837812/1‑76 TTCAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGCCACAGGATGTGGCGCTGGCTATCATTGGCGCGGTGTTCAAAAACGGTT < 2:1528187/76‑1 TTCAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGCCACAGGATGTGGCGCTGGCTATCATTGGCGCGGTGTTCAAAAACGGTT < 1:137512/76‑1 TCAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGCCACAGGATGTGGCGCTGGCTATCATTGGCGCGGTGTTCAAAAACGGTTA > 2:812719/1‑76 TCAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGCCACAGGATGTGGCGCTGGCTATCATTGGCGCGGTGTTCAAAAACGGTTA > 1:211975/1‑76 CAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGCCACAGGATGTGGCGCTGGCTATCATTGGCGCGGTGTTCAAAAACGGTTAC > 1:811795/1‑76 CAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGCCACAGGATGTGGCGCTGGCTATCATTGGCGCGGTGTTCAAAAACGGTTAC > 1:2879951/1‑76 CAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGCCACAGGATGTGGCGCTGGCTATCATTGGCGCGGTGTTCAAAAACGGTTAC < 2:4560464/76‑1 AACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGCCACAGGATGTGGCGCTGGCTATCATTGGCGCGGTGTTCAAAAACGGTTACG > 2:5043549/1‑76 AACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGCCACAGGATGTGGCGCTGGCTATCATTGGCGCGGTGTTCAAAAACGGTTACG < 2:3921414/76‑1 AACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGCCACAGGATGTGGCGCTGGCTATCATTGGCGCGGTGTTCAAAAACGGTTACG > 1:949557/1‑76 CCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGCCACAGGATGTGGCGCTGGCTATCATTGGCGCGGTGTTCAAAAACGGTTACGTC < 2:1809322/76‑1 CCTTAAGTTAGCGCTTATGGGCCACAGGATGTGGCGCTGGCTATCATTGGCGCGGTGTTCAAAAACGGTTACGTCA < 2:2097727/76‑1 CCTTAAGTTAGCGCTTATGGGCCACAGGATGTGGCGCTGGCTATCATTGGCGCGGTGTTCAAAAACGGTTACGTCA < 1:565245/76‑1 CTTAAGTTAGCGCTTATGGGCCACAGGATGTGGCGCTGGCTATCATTGGCGCGGTGTTCAAAAACGGTTACGTCAA > 2:583276/1‑76 CTTAAGTTAGCGCTTATGGGCCACAGGATGTGGCGCTGGCTATCATTGGCGCGGTGTTCAAAAACGGTTACGTCAA > 1:3760842/1‑76 CTTAAGTTAGCGCTTATGGGCCACAGGATGTGGCGCTGGCTATCATTGGCGCGGTGTTCAAAAACGGTTACGTCAA < 2:4024826/76‑1 CTTAAGTTAGCGCTTATGGGCCACAGGATGTGGCGCTGGCTATCATTGGCGCGGTGTTCAAAAACGGTTACGTCAA > 1:301389/1‑76 CTTAAGTTAGCGCTTATGGGCCACAGGATGTGGCGCTGGCTATCATTGGCGCGGTGTTCAAAAACGGTTACGTCAA > 2:3284683/1‑76 TTAAGTTAGCGCTTATGGGCCACAGGATGTGGCGCTGGCTATCATTGGCGCGGTGTTCAAAAACGGTTACGTCAAA > 1:173539/1‑76 TTAAGTTAGCGCTTATGGGCCACAGGATGTGGCGCTGGCTATCATTGGCGCCGTGTTCAAAAACGGTTAAGGCAAA > 2:73819/1‑76 TAAGTTAGCGCTTATGGGCCACAGGATGTGGCGCTGGCTATCATTGGCGCGGTGTTCAAAAACGGTTACGTCAAAA < 1:2901273/76‑1 TAAGTTAGCGCTTATGGGCCACAGGATGTGGCGCTGGCTATCATTGGCGCGGTGTTCAAAAACGGTTACGTCAAAA < 1:325460/76‑1 TAAGTTAGCGCTTATGGGCCACAGGATGTGGCGCTGGCTATCATTGGCGCGGTGTTCAAAAACGGTTACGTCAAAA < 2:2916644/76‑1 TAAGTTAGCGCTTATGGGCCACAGGATGTGGCGCTGGCTATCATTGGCGCGGTGTTCAAAAACGGTTACGTCAAAA < 1:51149/76‑1 AAGTTAGCGCTTATGGGCCACAGGATGTGGCGCTGGCTATCATTGGCGCGGTGTTCAAAAACGGTTACGTCAAAAA > 1:1640110/1‑76 AGTTAGCGCTTATGGGCCACAGGATGTGGCGCTGGCTATCATTGGCGCGGTGTTCAAAAACGGTTACGTCAAAAAC < 2:3104872/76‑1 AGTTAGCGCTTATGGGCCACAGGATGTGGCGCTGGCTATCATTGGCGCGGTGTTCAAAAACGGTTACGTCAAAAAC > 2:1732566/1‑76 AGTTAGCGCTTATGGGCCACAGGATGTGGCGCTGGCTATCATTGGCGCGGTGTTCAAAAACGGTTACGTCAAAAAC < 1:1585146/76‑1 GTTAGCGCTTATGGGCCACAGGATGTGGCGCTGGCTATCATTGGCGCGGTGTTCAAAAACGGTTACGTCAAAAACA > 1:1079234/1‑76 TAGCGCTTATGGGCCACAGGATGTGGCGCTGGCTATCATTGGCGCGGTGTTCAAAAACGGTTACGTCAAAAACAAA > 2:631164/1‑76 AGCGCTTATGGGCCACAGGATGTGGCGCTGGCTATCATTGGCGCGGTGTTCAAAAACGGTTACGTCAAAAACAAAG > 1:1021602/1‑76 AGCGCTTATGGGCCACAGGATGTGGCGCTGGCTATCATTGGCGCGGTGTTCAAAAACGGTTACGTCAAAAACAAAG > 2:29674/1‑76 GCGCTTATGGGCCACAGGATGTGGCGCTGGCTATCATTGGCGCGGTGTTCAAAAACGGTTACGTCAAAAACAAAGT > 1:2476233/1‑76 CGCTTATGGGCCACAGGATGTGGCGCTGGCTATCATTGGCGCGGTGTTCAAAAACGGTTACGTCAAAAACAAAGTC < 1:3397471/76‑1 GCTTATGGGCCACAGGATGTGGCGCTGGCTATCATTGGCGCGGTGTTCAAAAACGGTTACGTCAAAAACAAAGTCA > 1:121139/1‑76 CTTATGGGCCACAGGATGTGGCGCTGGCTATCATTGGCGCGGTGTTCAAAAACGGTTACGTCAAAAACCAAGTCAT > 2:3927878/1‑76 CTTATGGGCCACAGGATGTGGCGCTGGCTATCATTGGCGCGGTGTTCAAAAACGGTTACGTCAAAAACAAAGTCAT > 2:3542007/1‑76 CTTATGGGCCACAGGATGTGGCGCTGGCTATCATTGGCGCGGTGTTCAAAAACGGTTACGTCAAAAACAAAGTCAT < 2:2184104/76‑1 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |