| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| JC JC | REL606 | 784,729 | Δ2 bp :: IS186 (+) +9 bp | coding (598‑606/2262 nt) | ybhJ → | predicted hydratase |
| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | REL606 | 590717 = | NA (NA) | 150 (0.940) | 84/150 | 0.4 | 99.2% | noncoding (3/1343 nt) | IS186 | repeat region |
| ? | REL606 | = 784737 | 1 (0.010) | coding (606/2262 nt) | ybhJ | predicted hydratase | |||||
| * | ? | REL606 | = 592057 | NA (NA) | 134 (0.880) | 76/144 | 0.6 | 99.2% | noncoding (1343/1343 nt) | IS186 | repeat region |
| ? | REL606 | 784729 = | 1 (0.010) | coding (598/2262 nt) | ybhJ | predicted hydratase | |||||
Only 100 of 291 total aligned reads displayed.
AATGACACCTGGGATATCGACTATCCGGGCGTGGTTGCGGTGCATCTGACCGGAAAACCTGCGCCGTATGTGGGGCCACAGGATGTGGCGCTGGCTATCATTGGCGCGGTGTTCAAAAACGGTTACGTCAAAAACAAAGTCATGGAGTTCG > REL606/784654‑784804 | aaTGACACCTGGGATATCGACTATCCGGGCGTGGTTGCGGTGCATCTGACCGGAAAACCTGCGCCGTATGTGGGGc < 2:4331068/76‑1 (MQ=255)aaTGACACCTGGGATATCGACTATCCGGGCGTGGTTGCGGTGCATCTGACCGGAAAACCTGCGCCGTATGTGGGGc < 2:2857376/76‑1 (MQ=255) aTGACACCTGGGATATCGACTATCCGGGCGTGGTTGCGGTGCATCTGACCGGAAAACCTGCGCCGTATGTGGGGcc > 1:45173/1‑76 (MQ=255) tGACACCTGGGATATCGACTATCCGGGCGTGGTTGCGGTGCATCTGACCGGAAAACCTGCGCCGTATGTGGGGCca < 1:4322611/76‑1 (MQ=255) tGACACCTGGGATATCGACTATCCGGGCGTGGTTGCGGTGCATCTGACCGGAAAACCTGCGCCGTATGTGGGGCca < 2:627301/76‑1 (MQ=255) ccTGGGATATCGACTATCCGGGCGTGGTTGCGGTGCATCTGACCGGAAAACCTGCGCCGTATGTGGGGCCACAGGa > 1:3882265/1‑76 (MQ=255) cgtcttaacgaggcaccgaggcgtcgcattcttcagatggttcaacccttaagttagcgcttatgggCCACAGGAt > 2:1297085‑M2/68‑76 (MQ=255) cgtcttaacgaggcaccgaggcgtcgcattcttcagatggttcaacccttaagttagcgcttatgggCCACAGGAt < 2:3040396‑M2/9‑1 (MQ=255) cTGGGATATCGACTATCCGGGCGTGGTTGCGGTGCATCTGACCGGAAAACCTGCGCCGTATGTGGGGCCACAGGAt > 2:4630754/1‑76 (MQ=255) gggATATCGACTATCCGGGCGTGGTTGCGGTGCATCTGACCGGAAAACCTGCGCCGTATGTGGGGCCACAGGATca > 2:2179586‑M2/1‑74 (MQ=255) gggATATCGACTATCCGGGCGTGGTTGCGGTGCATCTGACCGGAAAACCTGCGCCGTATGTGGGGCCACAGGATca > 1:71187‑M2/1‑74 (MQ=255) ggATATCGACTATCCGGGCGTGGTTGCGGTGCATCTGACCGGAAAACCTGCGCCGTATGTGGGGCCACAGGATcat > 2:676553‑M2/1‑73 (MQ=255) ggATATCGACTATCCGGGCGTGGTTGCGGTGCATCTGACCGGAAAACCTGCGCCGTATGTGGGGCCACAGGATcat > 1:3289256‑M2/1‑73 (MQ=255) atatCGACTATCCGGGCGTGGTTGCGGTGCATCTGACCGGAAAACCTGCGCCGTATGTGGGGCCACAGGATcataa < 1:2200888‑M2/76‑6 (MQ=255) tatCGACTATCCGGGCGTGGTTGCGGTGCATCTGACCGGAAAACCTGCGCCGTATGTGGGGCCACAGGATcataag > 2:4971749‑M2/1‑70 (MQ=255) atCGACTATCCGGGCGTGGTTGCGGTGCATCTGACCGGAAAACCTGCGCCGTATGTGGGGCCACAGGATcataagc < 1:4276760‑M2/76‑8 (MQ=255) atCGACTATCCGGGCGTGGTTGCGGTGCATCTGACCGGAAAACCTGCGCCGTATGTGGGGCCACAGGATcataagc > 1:633772‑M2/1‑69 (MQ=255) atCGACTATCCGGGCGTGGTTGCGGTGCATCTGACCGGAAAACCTGCGCCGTATGTGGGGCCACAGGATcataaga > 2:765627‑M2/1‑69 (MQ=255) cgaggcaccgaggcgtcgcattcttcagatggttcaacccttaagttagcgcttatgggCCACAGGATGtggcgag < 2:4602540‑M2/17‑3 (MQ=255) cgaggcaccgaggcgtcgcattcttcagatggttcaacccttaagttagcgcttatgggCCACAGGATGTGGCGCt > 1:1979037‑M2/60‑76 (MQ=255) gaggcaccgaggcgtcgcattcttcagatggttcaacccttaagttagcgcttatgggCCACAGGATGTGGCGCTg < 1:338303‑M2/18‑1 (MQ=255) gaggcaccgaggcgtcgcattcttcagatggttcaacccttaagttagcgcttatgggCCACAGGATGTGGCGCTg < 1:2981988‑M2/18‑1 (MQ=255) gaggcaccgaggcgtcgcattcttcagatggttcaacccttaagttagcgcttatgggCCACAGGATGTGGCGCTg < 2:3302511‑M2/18‑1 (MQ=255) aCTATCCGGGTGTGGTTGCGGTGCATCTGACCGGAAAACCTGCGCCGTATGTGGGGCCACAGGATcataagcgcta > 1:4899869‑M2/1‑65 (MQ=255) aCTATCCGGGCGTGGTTGCGGTGCATCTGACCGGAAAACCTGCGCCGTATGTGGGGCCACAGGATcataagcgcta > 1:4666409‑M2/1‑65 (MQ=255) gcaccgaggcgtcgcattcttcagatggttcaacccttaagttagcgcttatgggCCACAGGATGTGGCGCTGGCt < 2:3647308‑M2/21‑1 (MQ=255) tATCCGGGCGTGGTTGCGGTGCATCTGACCGGAAAACCTGCGCCGTATGTGGGGCCACAGGATcataagcgctaac > 1:3744837‑M2/1‑63 (MQ=255) tATCCGGGCGTGGTTGCGGTGCATCTGACCGGAAAACCTGCGCCGTATGTGGGGCCACAGGATcataagcgctaac < 1:3808144‑M2/76‑14 (MQ=255) caccgaggcgtcgcattcttcagatggttcaacccttaagttagcgcttatgggCCACAGGATGTGGCGCTGGCTa < 2:4260126‑M2/22‑1 (MQ=255) caccgaggcgtcgcattcttcagatggttcaacccttaagttagcgcttatgggCCACAGGATGTGGCGCTGGCTa < 1:1354080‑M2/22‑1 (MQ=255) accgaggcgtcgcattcttcagatggttcaacccttaagttagcgcttatgggCCACAGGATGTGGCGCTGGCTAt < 2:816158‑M2/23‑1 (MQ=255) accgaggcgtcgcattcttcagatggttcaacccttaagttagcgcttatgggCCACAGGATGTGGCGCTGGCTAt > 2:2794694‑M2/54‑76 (MQ=255) aTCCGGGCGTGGTTGCGGTGCATCTGACCGGAAAACCTGCGCCGTATGTGGGGCCACAGGATcataagcgctaact > 2:1877995‑M2/1‑62 (MQ=255) aTCCGGGCGTGGTTGCGGTGCATCTGACCGGAAAACCTGCGCCGTATGTGGGGCCACAGGATcataagcgctaact < 2:3957674‑M2/76‑15 (MQ=255) cgaggcgtcgcattcttcagatggttcaacccttaagttagcgcttatgggCCACAGGATGTGGCGCTGGCTATCa > 2:4001217‑M2/52‑76 (MQ=255) ggcgtcgcattcttcagatggttctacccttaagttatcgcttatgggCCACAGGATTTGGCGCTGGCTATCATTg < 2:512551‑M2/28‑1 (MQ=255) ggcgtcgcattcttcagatggttcaacccttaagttagcgcttatgggCCACAGGATGTGGCGCTGGCTATCATTg < 2:2553207‑M2/28‑1 (MQ=255) cgtcgcattcttcagatggttcaacccttaagttagcgcttatgggCCACAGGATGTGGCGCTGGCTATCATTGgc < 1:256408‑M2/30‑1 (MQ=255) tcgcattcttcagatggttcaacccttaagttagcgcttatgggCCACAGGATGTGGCGCTGGCTATCATTGgcgc > 1:2829035‑M2/45‑76 (MQ=255) cggcattcttcagatggttcaacccttaagttagcgcttatgggCCACAGGATGTGGCGCTGGCTATCATTGgcgc < 1:4239866‑M2/32‑1 (MQ=255) cgcattcttcagatggttcaacccttaagttagcgcttatgggACACAGGATGTGGCGCTGGCTATCATTGGcgcg > 1:1135109‑M2/44‑76 (MQ=255) tGCGGTGCATCTGACCGGAAAACCTGCGCCGTATGTGGGGCCACAGGATcataagcgctaacttaagggttgtggt < 2:1461865‑M2/76‑28 (MQ=255) tGCGGTGCATCTGACCGGAAAACCTGCGCCGTATGTGGGGCCACAGGATcataagcgctaacttaagggttgtggt > 2:1210382‑M2/1‑49 (MQ=255) attcttcagatggttcaacccttaagttagcgcttatgggCCACAGGATGTGGCGCTGGCTATCATTGGCGCGgtg > 1:108132‑M2/41‑76 (MQ=255) attcttcagatggttcaacccttaagttagcgcttatgggCCACAGGATGTGGCGCTGGCTATCATTGGCGCGgtg < 2:543597‑M2/36‑1 (MQ=255) ggTGCATCTGACCGGAAAACCTGCGCCGTATGTGGGGCCACAGGATcataagcgctaacttaagggttgtggtatt > 1:3250328‑M2/1‑46 (MQ=255) cttcagatggttcaacccttaagttagcgcttatgggCCACAGGATGTGGCGCTGGCTATCATTGGCGCGGTGTTc < 2:3204149‑M2/39‑1 (MQ=255) ttcagatggttcaacccttaagttagcgcttatgggCCACAGGATGTGGCGCTGGCTATCATTGGCGCGGTGTTCa > 1:443838‑M2/37‑76 (MQ=255) ttcagatggttcaacccttaagttagcgcttatgggCCACAGGATGTGGCGCTGGCTATCATTGGCGCGGTGTTCa < 1:4819759‑M2/40‑1 (MQ=255) gTGCATCTGACCGGAAAACCTGCGCCGTATGTGGGGCCACAGGATcataagcgctaacttaagggttgtggtatta > 2:4712760‑M2/1‑45 (MQ=255) gTGCATCTGACCGGAAAACCTGCGCCGTATGTGGGGCCACAGGATcataagcgctaacttaagggttgtggtatta > 2:3447759‑M2/1‑45 (MQ=255) gTGCATCTGACCGGAAAACCTGCGCCGTATGTGGGGCCACAGGATcataagcgctaacttaagggttgtggtatta > 2:38817‑M2/1‑45 (MQ=255) cagatggttcaacccttaagttagcgcttatgggCCACAGGATGTGGCGCTGGCTATCATTGGCGCGGTGTTCaaa < 2:1720992‑M2/42‑1 (MQ=255) cATCTGACCGGAAAACCTGCGCCGTATGTGGGGCCACAGGATcataagcgctaacttaagggttgtggtattacgc < 2:89210‑M2/76‑35 (MQ=255) cATCTGACCGGAAAACCTGCGCCGTATGTGGGGCCACAGGATcataagcgctaacttaagggttgtggtattacgc < 1:471664‑M2/76‑35 (MQ=255) gttcaacccttaagttagcgcttatgggCCACAGGATGTGGCGCTGGCTATCATTGGCGCGGTGTTCAAAAACGGt > 1:1837812‑M2/29‑76 (MQ=255) gACCGGAAAACCTGCGCCGTATGTGGGGCCACAGGATcataagcgctaacttaagggttgtggtattacgcctgat > 1:904581‑M2/1‑37 (MQ=255) ttcaacccttaagttagcgcttatgggCCACAGGATGTGGCGCTGGCTATCATTGGCGCGGTGTTCAAAAACGGtt < 2:1528187‑M2/49‑1 (MQ=255) aCCGGAAAACCTGCGCCGTATGTGGGGCCACAGGATcataagcgctaacttaagggttgtggtattacgcctgata > 1:496088‑M2/1‑36 (MQ=255) caacccttaagttagcgcttatgggCCACAGGATGTGGCGCTGGCTATCATTGGCGCGGTGTTCAAAAACGGTTAc < 2:4560464‑M2/51‑1 (MQ=255) caacccttaagttagcgcttatgggCCACAGGATGTGGCGCTGGCTATCATTGGCGCGGTGTTCAAAAACGGTTAc > 1:2879951‑M2/26‑76 (MQ=255) caacccttaagttagcgcttatgggCCACAGGATGTGGCGCTGGCTATCATTGGCGCGGTGTTCAAAAACGGTTAc > 1:811795‑M2/26‑76 (MQ=255) cGGAAAACCTGCGCCGTATGTGGGGCCACAGGATcataagcgctaacttaagggttgtggtattacgcctgatatg < 1:2112737‑M2/76‑43 (MQ=255) cGGAAAACCTGCGCCGTATGTGGGGCCACAGGATcataagcgctaacttaagggttgtggtattacgcctgatatg < 2:4067151‑M2/76‑43 (MQ=255) ggAAAACCTGCGCCGTATGTGGGGCCACAGGATcataagcgctaacttaagggttgtggtattacgcctgatatga > 2:1044047‑M2/1‑33 (MQ=255) aacccttaagttagcgcttatgggCCACAGGATGTGGCGCTGGCTATCATTGGCGCGGTGTTCAAAAACGGTTACg > 1:2792225‑M2/25‑76 (MQ=255) aacccttaagttagcgcttatgggCCACAGGATGTGGCGCTGGCTATCATTGGCGCGGTGTTCAAAAACGGTTACg < 2:3921414‑M2/52‑1 (MQ=255) aacccttaagttagcgcttatgggCCACAGGATGTGGCGCTGGCTATCATTGGCGCGGTGTTCAAAAACGGTTACg > 1:949557‑M2/25‑76 (MQ=255) cccttaagttagcgcttatgggCCACAGGATGTGGCGCTGGCTATCATTGGCGCGGTGTTCAAAAACGGTTACGTc < 2:1809322‑M2/54‑1 (MQ=255) ccttaagttagcgcttatgggCCACAGGATGTGGCGCTGGCTATCATTGGCGCGGTGTTCAAAAACGGTTACGTCa < 2:2097727‑M2/55‑1 (MQ=255) aaaCCTGCGCCGTATGTGGGGCCACAGGATcataagcgctaacttaagggttgtggtattacgcctgatatgattt > 2:1910393‑M2/1‑30 (MQ=255) aaaCCTGCGCCGTATGTGGGGCCACAGGATcataagcgctaacttaagggttgtggtattacgcctgatatgattt < 1:3541571‑M2/76‑47 (MQ=255) cttaagttagcgcttatgggCCACAGGATGTGGCGCTGGCTATCATTGGCGCGGTGTTCAAAAACGGTTACGTCaa > 2:583276‑M2/21‑76 (MQ=255) cttaagttagcgcttatgggCCACAGGATGTGGCGCTGGCTATCATTGGCGCGGTGTTCAAAAACGGTTACGTCaa > 1:301389‑M2/21‑76 (MQ=255) cttaagttagcgcttatgggCCACAGGATGTGGCGCTGGCTATCATTGGCGCGGTGTTCAAAAACGGTTACGTCaa < 2:4024826‑M2/56‑1 (MQ=255) ttaagttagcgcttatgggCCACAGGATGTGGCGCTGGCTATCATTGGCGCGGTGTTCAAAAACGGTTACGTCaaa > 1:173539‑M2/20‑76 (MQ=255) taagttagcgcttatgggCCACAGGATGTGGCGCTGGCTATCATTGGCGCGGTGTTCAAAAACGGTTACGTCaaaa < 1:51149‑M2/58‑1 (MQ=255) taagttagcgcttatgggCCACAGGATGTGGCGCTGGCTATCATTGGCGCGGTGTTCAAAAACGGTTACGTCaaaa < 1:2901273‑M2/58‑1 (MQ=255) ccTGCGCCGTATGTGGGGCCACAGGATcataagcgctaacttaagggttgtggtattacgcctgatatgatttaac < 1:1439219‑M2/76‑50 (MQ=255) cTGCGCCGTATGTGGGGCCACAGGATcataagcgctaacttaagggttgtggtattacgcctgatatgatttaacg < 2:2236531‑M2/76‑51 (MQ=255) aagttagcgcttatgggCCACAGGATGTGGCGCTGGCTATCATTGGCGCGGTGTTCAAAAACGGTTACGTCaaaaa > 1:1640110‑M2/18‑76 (MQ=255) tGCGCCGTATGTGGGGCCACAGGATcataagcgctaacttaagggttgtggtattacgcctgatatgatttaacgt > 2:2910927‑M2/1‑25 (MQ=255) tGCGCCGTATGTGGGGCCACAGGATcataagcgctaacttaagggttgtggtattacgcctgatatgatttaacgt > 1:2066462‑M2/1‑25 (MQ=255) gcgcCGTATGTGGGGCCACAGGATcataagcgctaacttaagggttgtggtattacgcctgatatgatttaacgtg < 2:3082271‑M2/76‑53 (MQ=255) gcgcCGTATGTGGGGCCACAGGATcataagcgctaacttaagggttgtggtattacgcctgatatgatttaacgtg < 2:4483521‑M2/76‑53 (MQ=255) ccGTATGTGGGGCCACAGGATcataagcgctaacttaagggttgtggtattacgcctgatatgatttaacgtgccg < 1:1579800‑M2/76‑56 (MQ=255) ccGTATGTGGGGCCACAGGATcataagcgctaacttaagggttgtggtattacgcctgatatgatttaacgtgccg < 1:4134358‑M2/76‑56 (MQ=255) agcgcttatgggCCACAGGATGTGGCGCTGGCTATCATTGGCGCGGTGTTCAAAAACGGTTACGTCAAAAACAAAg > 1:1021602‑M2/13‑76 (MQ=255) gTATGTGGGGCCACAGGATcataagcgctaacttaagggttgtggtattacgcctgatatgatttaacgtgccgat < 2:2368692‑M2/76‑58 (MQ=255) cgcttatgggCCACAGGATGTGGCGCTGGCTATCATTGGCGCGGTGTTCAAAAACGGTTACGTCAAAAACAAAGTc < 1:1280100‑M2/66‑1 (MQ=255) tATGTGGGGCCACAGGATcataagcgctaacttaagggttgtggtattacgcctgatatgatttaacgtgccgatg < 2:357781‑M2/76‑59 (MQ=255) ttatgggCCACAGGATGTGGCGCTGGCTATCATTGGCGCGGTGTTCAAAAACGGTTACGTCAAAAACAAAGTCATg > 2:1643349‑M2/8‑76 (MQ=255) tgGGGCCACAGGATcataagcgctaacttaagggttgtggtattacgcctgatatgatttaacgtgccgatgaatt < 2:4390619‑M2/76‑63 (MQ=255) tgGGGCCACAGGATcataagcgctaacttaagggttgtggtattacgcctgatatgatttaacgtgccgatgaatt < 2:2390786‑M2/76‑63 (MQ=255) tgggCCACAGGATGTGGCGCTGGCTATCATTGGCGCGGTGTTCAAAAACGGTTACGTCAAAAACAAAGTCATGGAg > 2:3680170‑M2/5‑76 (MQ=255) tgggCCACAGGATGTGGCGCTGGCTATCATTGGCGCGGGGTTCAAAAACGGTTACGTCAAAAACAAAGTCATGGAg > 2:489837‑M2/5‑76 (MQ=255) ggCCACAGGATcataagcgctaacttaagggttgtggtattacgcctgatatgatttaacgtgccgatgaattact > 1:1484245‑M2/1‑11 (MQ=255) ggCCACAGGATGTGGCGCTGGCTATCATTGGCGCGGTGTTCAAAAACGGTTACGTCAAAAACAAAGTCATGGAGtt < 2:4170653‑M2/74‑1 (MQ=255) ccACAGGATcataagcgctaacttaagggttgtggtattacgcctgatatgatttaacgtgccgatgaattactct < 2:1742386‑M2/76‑68 (MQ=255) ccACAGGATGTGGCGCTGGCTATCATTGGCGCGGTGTTCAAAAACGGTTACGTCAAAAACAAAGTCATGGAGTTCg < 2:736086/76‑1 (MQ=255) | AATGACACCTGGGATATCGACTATCCGGGCGTGGTTGCGGTGCATCTGACCGGAAAACCTGCGCCGTATGTGGGGCCACAGGATGTGGCGCTGGCTATCATTGGCGCGGTGTTCAAAAACGGTTACGTCAAAAACAAAGTCATGGAGTTCG > REL606/784654‑784804 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |