| Predicted mutation | ||||||
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| MC JC | NC_000913 | 1,978,503 | Δ776 bp | insB1–insA | insB1, insA | |
| Missing coverage evidence... | ||||||||||
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| New junction evidence | |||||||||||
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| * | ? | NC_000913 | = 1978502 | 0 (0.000) | 90 (1.380) | 68/268 | 0.0 | 100% | intergenic (‑305/+16) | flhD/insB1 | flagellar class II regulon transcriptional activator, with FlhC/IS1 transposase B |
| ? | NC_000913 | 1979279 = | 0 (0.000) | intergenic (‑64/‑474) | insA/uspC | IS1 repressor TnpA/universal stress protein | |||||
GGCGGTGCTTTTGCCGTTACGCACCACCCCGTCAGTAGCTGAACAGGAGGGACAGCTGATAGAAACAGAAGCCACTGGAGCACCTCAAAAACACCATCATACACTAAATCAGTAAGTTGGCAGCATCACCCATAAATGTATAAGTCATACTTTTGTTTTGGGTGTATTTCAATCTGTTAAAAAGTTTTTCGCTACGCTAGCAAGC‑AAAAATGAAACAGGAATAAT‑CGAAATGGGATGTTGCGCACAGTCAAAATAACTCACCGTAAATAATCATCTGC > NC_000913/1979141‑1979418 | gttttcacttagcgaagcttgttcgtaaatcgacggaactgtactcgtcactgcacgcacatacaaaggaggggggctgcgattttcaataatgcgtgatgcagatcacacaaaacactcaattacttaacataaatgTATaa < 2:313519‑M2/5‑1 (MQ=255)ctttacacttatctaagatttttcctaaatcgacgcaactgtactcgtcactacacgcacatacaacggaggggggctgcgattttcaataatgcgtgatgcagatcacacaaaacactcaattacttaacataaatgTATaa < 2:1016287‑M2/5‑1 (MQ=255) tttacacttatctaagatttttcctaaatcgacgcaactgtactcgtcactacacgcacatacaacggacgggggctgcgattttcaataatgcgtgatgcagatcacacaaaacactcaattacttaacataaatgTATAAg > 2:507841‑M2/138‑143 (MQ=255) ttacacttatctaagatttttcctaaatcgacgcaactgtactcgtcactacacgcacatacaacggaggggggctgcgattttcaataatgcgtgatgcagagcacacaaaacactcaattacttaacataaatgtagcagt > 2:773152‑M2/137‑138 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attacttaacataaatgTATAAGTCATACTTTTGTTTTGGGTGTATTTCAATCTGTTAAAAAGTTTTTCGCTACGATAGCAAGC‑AAAAATGAAACATAGATAAT‑CGAAATGGGATGTTGCGCACAGTAaaaaaaaccaaacgt > 2:553439‑M2/18‑136 (MQ=255) ttacttaacataaatgTATAAGTCATACTTTTGTTTTGGGTGTATTTCAATCTGTTAAAAAGTTTTTCGCTACGCTAGCAAGC‑AAAAATGAAACAGGAATAAT‑CGAAATGGGATGTTGCGCACAGTCAAAATAACTCACCGTa > 1:938543‑M2/17‑143 (MQ=255) ttaacataaatgTATAAGTCATACTTTTGTTTTGGGTGTATTTCAATCTGTTAAAAAGTTTTTCGCTACGCTAGCAAGC‑AAAAATGAAACAGGAATAAT‑CGAAATGGGATGTTGCGCACAGTCAAAATAACTCACCGTAaata > 1:1132245‑M2/13‑143 (MQ=255) taacataaatgTATAAGTCATACTTTTGTTTTGGGTGTATTTCAATCTGTTAAAAAGTTTTTCGCTACGCTAGCAAGC‑AAAAATGAAACAGGAATAAT‑CGAAATGGGATTTGGCGCACAGTCAAAATAACTCACCGTAaataa < 2:385422‑M2/132‑1 (MQ=255) aacataaatgTATAAGTCATACTTTTGTTTTGGGTGTATTTCAATCTGTTAAAAAGTTTTTCGCTACGCTAGCAAGC‑AAAAATGAAACAGGAATAAT‑CGAAATGGGATGTTGCGCACCGTCAAAATAACTCACCGTAaataat > 1:554541‑M2/11‑143 (MQ=255) 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NC_000913/1979141‑1979418 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 13 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |