| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| JC JC | NC_000913 | 2,536,312 | Δ1 bp :: IS186 (+) +6 bp :: Δ1 bp | coding (479‑484/510 nt) | crr → | glucose‑specific enzyme IIA component of PTS |
| New junction evidence | |||||||||||
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| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | 2514274 = | NA (NA) | 47 (0.790) | 41/278 | 0.4 | 100% | noncoding (2/1345 nt) | IS186 | repeat region |
| ? | NC_000913 | = 2536317 | 0 (0.000) | coding (484/510 nt) | crr | glucose‑specific enzyme IIA component of PTS | |||||
| * | ? | NC_000913 | = 2515616 | NA (NA) | 64 (1.060) | 47/280 | 0.2 | 100% | noncoding (1344/1345 nt) | IS186 | repeat region |
| ? | NC_000913 | 2536312 = | 0 (0.000) | coding (479/510 nt) | crr | glucose‑specific enzyme IIA component of PTS | |||||
Only 100 of 114 total aligned reads displayed.
TTGGCGATACTGTCATTGAATTTGATCTGCCGCTGCTGGAAGAGAAAGCCAAGTCTACCCTGACTCCGGTTGTTATCTCCAACATGGACGAAATCAAAGAACTGATCAAACTGTCCGGTAGCGTAACCGTGGGTGAAACCCCGGTTATCCGCATCAAGAAGTAATTCTTGCCGCAGTGAAAAATGGCGCCCATCGGCGCCATTTTTTTATGCTTCCGCCAGCGGCGGCAAAATCAATTCATCGCTCTCATGCTGCTGGGTGTAGCGCATCACTTCCAGT > NC_000913/2536180‑2536458 | aggtggcaatgcgtgggacagtatccctgacagccgacaaaacggaattgaggcacgcgaggcatcgtcttaacgtggcaccgaggcgtcgcattcttcagatggttcaacccttaagttagtgcttataggGTGAAACCCCg < 2:198291‑M2/11‑1 (MQ=255) ggtggccattcgtgggacagtatccctgacggcctacaaaacgcaattgaagaacgcgaggcatcgtcttaacgaggcaccgaggcgtcgcattcttcagatggttcaacccttaagttagcgcttatgggGTGAAACCCCgg < 1:459139‑M2/12‑1 (MQ=255) ggtggccattcgtgggacagtatccctgacagcctacaaaacgcaattgaagaacgcgaggcatcgtcttaacgaggcaccgaggcgtcgcattcttcagatggttcaacccttaagttagcgcttatgggGTGAAACCCCgg < 1:541536‑M2/12‑1 (MQ=255) gtggccattcgtgggacagtatccctgacagcctacaaaacgcaattgaagaacgcgaggcatcgtcttaacgaggcaccgaggcctcgcattcttcagatggttcaacccttaagttagcacttatggaGTGAAACACCGGt > 1:349993‑M2/131‑143 (MQ=255) ggCGATACTGTCATTGAATTTGATCTGCCGCTGCCGGAAGAGAAAGCCAAGTCTACCCTGACTCCGGTTGTTATCTCCAACATGGACGAAATCAAAGAACTGATCAAACTGTCCGGTAGCGTAACCGTGGGTGAAAcccataa > 1:366559‑M2/1‑136 (MQ=255) ctaCTGTCATTGAATTTGATCTGCCGCTGCTGGAAGAGAAAGCCAAGTCTACCCTGACTCCGGTTGTTATCTCCAACATGGACGAAATCAAAGAACTGATCAAACTGTCCGGTAGCGTAACCGTGGGTGAAAcccataagcgc > 2:298838‑M2/2‑132 (MQ=255) cattcgtgggacagtatccctgacagcctacaaaaagcaattgaagaacgcgaggcatcgtcttaacgaggcaccgaggcgtcgcattcttcagatggttcaacccttaggttagcgcttatgggGTGAAACCCCGGTTATcc > 1:177347‑M2/126‑143 (MQ=255) tGTCATTGAATTTGATCTGCCGCTGCTGGAAGAGAAAGCCAAGTCTACCCTGACTCCGGTTGTTATCTCCAACATGGACGAAATCAAAGAACTGATCAAACTGTCCGGTAGCGTAACCGTGGGTGAAAcgcataagcgctcac < 1:224912‑M2/143‑16 (MQ=255) cgggggacggtgtccctgacggcctacaatacgcaatggaagaacgcgaggcatcgtcttaacgaggcaccgaggcgtcgcattcttcagatggttcaacccttaagttagcgcttatgggGTGAAACCCCGGTTATCCGCAt < 2:1099667‑M2/22‑1 (MQ=255) tCATTGAATTTGATCTGCCGCTGCTGGAAGAGAAAGCCAAGTCTACCCTGACTCCGGTTGTTATCGCCAACATGGAGGAAATCAAAGAACTGATCAAACTGTCCGGTAGCGTAACCGTGGGTGCAGcccatgagcgctaactt < 1:303201‑M2/143‑18 (MQ=255) gtgggacagtatccctgacagcctacaaaacgcaattgaagaacgcgaggcatcgtcttaacgaggcaccgaggcgtcgcattcttcagatggttcaacccttacgttcgcgcttatgggGTGAAAACCCGGATATCAGCata > 1:435224‑M2/121‑142 (MQ=255) gggacagtatccctgccagcctacaaaacgcaattgaagaacgcgaggcatcgtcttaacgaggcaccgaggcgtcgcattcttcagatgtttcaacccttaagttagcgcttatgggGTGAAACCCCGGTTATCCGCATCaa < 1:315420‑M2/25‑1 (MQ=255) gacagtatccctgacagcctacaaaacgcaattgaagaacgcgaggcatcgtcttaacgaggcaccgaggcgtcgcattcttcagatggttcaacccttaagttagcgcttatgggGTGAAACCCCGGTTATCCGCATCaaga > 1:303832‑M2/117‑143 (MQ=255) gacagtatccccgacagcctacaaaacgcaattgaagaacgcgaggcatcgtcttaacgaggcaccgaggcgtcgcattcttcagatggttcaacccttaagttagcgcttatgggGTGAAACCCCGGTTATCCGCATCaaga < 1:272709‑M2/27‑1 (MQ=255) gAATTTGATCTGCCGCTGCTGGAAGAGAAAGCCAAGTCTACCCTGACTCCGGTTGTTATCTCCAACATGGACGAAATCAAAGAACTGATCAAACTGTCCGGTAGCGTAACCGTGGGTGAAAcccataagcgctcacttaaggg < 2:765761‑M2/143‑23 (MQ=255) acggtatcccttacagcctacacaacgcaatggaagaacgcgaggcatcgtcttaacgaggcaccgaggcgtcgcattcttcagatggttcaacccttaagttagcgcttatgggGTGAAACCCCGGTTATCCGCATCaagaa < 2:112456‑M2/28‑1 (MQ=255) acagtatccctgacagcctgcaaagcgcaattgaagaacgcgaggtagcgtcttaacgaggcaccgaggcggcgcattcttcagatggttcaacccttaagttagcgcttatgggGTGAAACCCCGGTTATCCGCATCaagaa < 2:74453‑M2/28‑1 (MQ=255) acagtatccctcacagcccacaaaacgcaattgaagaacgcgaggcatcgtcttaacgaggcaccgaggcgtcgcattcttcagatggttcaacccttaagttagcgcttatgggGTGAAACCCCGGTTATCCGCATCaagaa < 1:413802‑M2/28‑1 (MQ=255) ttgtatctgCCGCTGCTGGAAGAGAAAGCTAGGTCTACCCTGACTCCGGTTGTTATCTCCAACATGGACGAAATCAAAGAACTGATCAAACTGTCCGGTAGCGTAACCGTGGGTGAAAcccataagcgctaacttaagggttg > 2:619791‑M2/5‑118 (MQ=255) ttGATCTGCCGCTGCTGGAAGAGAAAGCCAAGTCTACCCTGACTCCGGTTGTTATCTCCAACATGGACGAAATCAAAGAACTGAGCAAACTGTCCGGTAGCGTAACCGTGGGTGAAAcccataagcgctaacttaagggttgt > 1:893947‑M2/1‑117 (MQ=255) tggcgcggccggggcGGGAAGAGAAGGCCAGGTCTACCCTGGCGCCGGTTGTTATCTCCAACATGGACGAAATCAAAGAACTGATCAAACTGTCCGGTAGCGTAACCGTGGGTGAAAcccataagcgctaacttaagggttgt > 2:1060845‑M2/8‑117 (MQ=255) tatccctgacagcctacaaaacgcaattgaagaacgcgaggcatcgtcttaacgaggcaccgaggcgtcgcattcttcagatggttcgacgcttaagttagcgcttatgggGTGAAACCCCGGTTATCCGCATCACGAAGTaa > 1:74219‑M2/112‑143 (MQ=255) tagccctgacagccgacaaaacgcaattgaagaacgcgaggcatcgtcttaacgaggcaccgaggcgtcgcattcttcagatggttcaacctttaagttagcgcttatgggGTGAAACCCCGGTTATCCGCATCAAGAAGTaa < 1:45973‑M2/32‑1 (MQ=255) tccctgacagcctacaaaacgcaattgaagaacgcgaggcatcgtcttaacgaggcaccgaggcgtcgcattcttcagatggttcaacccttaagttagcgcttatgggGTGAAACCCCGGTTATCCGCATCAAGAAGTAAtt > 1:394952‑M2/110‑143 (MQ=255) gATCTGCCGCTGCTGGAAGAGAAAGCCAAGTCTACCCTGACTCCGGTTGTTATCTCCAACATGGACGAACTCCAAGACCTGTTCCACCTTTCCGCTAGCGTAACCGTGAGTTAAAcccataagcactaacttaaggattgaag < 1:185896‑M2/143‑29 (MQ=255) gATCTGCCGCTGCTGGAAGAGAAAGCCAAGTCTACCCTGACTCCGGTTGTTATCTCCAACATGGACGAAATCAAAGAACTGATCAAACTGTCCGGTAGCGTAACCGTGGGTGAAAcccataagcgctaccttaagggctgtgg < 1:952284‑M2/143‑29 (MQ=255) accctgaccgcctacaaaacgcaattgaagaacgcgaggcatcgtcttaacgaggcaccgaggcgtcgcattcttcagatggttcaacccttaagttagcgcttatgggGTGAAACCCCGGTTATCCGCATCAAGAAGTAAtt < 1:873692‑M2/34‑1 (MQ=255) accatgacagccaacaaaacgcaattgaagaacgcgaggcatcgtcttaacgaggcaccgaggcgtcgcattcttcagatggctcaacccttaagttagcgcttatgggGTGAAACCCCGGTTATCCGCATCAAGAAGTAAtt < 1:1097269‑M2/34‑1 (MQ=255) aTCTGCCGCTGCTGGAAGAGAAAGCCAAGTCTACCCTGACTCCGGTTGTTATCTCCAACATGGACGAAATCAAAGAACTGATCAAACTGTCCGGTAGCGTAACCGTGGGTGAAAcccataagcgctaacttaagggttgtggt > 1:951531‑M2/1‑114 (MQ=255) ctgacagcctacaaaacgcaattgaagaacgcgaggcatcgtcttaacgaggcaccgaggcgtcgcattcttcagatggttcaacccttaagttagcgcttatgggGTGACACCCCGGTTATCCGCATCCAGACGTAATTCtt > 1:893820‑M2/107‑143 (MQ=255) cggctgttgaAAGAGAAAGGCAAGTCTACCCCGACTCCGGTTGTTATCTCCAACATGGACGAAATCAAAGAACTGATCAAACTGTCCGGTAGCGTAACCGTGGGTGAAAcccataagcgctaacttaagggttgtggtattac > 1:927469‑M2/3‑109 (MQ=255) gcatacaaaacgaaattgaagaaaacgacgcatcgtcttaacgaggcaccgaggcgtcgcattcttcagatggttcaacccttaagttagcgcttatgggGTGAAACCCCGGTTATCCGCATCAAGAAGTAATTCTTGCCGCa < 1:961762‑M2/43‑1 (MQ=255) cctacaaaacgcaattgaagaacgcgaggcatcgtcttaacgaggcaccgaggcgtcgcattcttcagatggttcagcccttaagttagcgcttatgggGTGAAACCACGGTTATCGGCAGCAAGAAGTAATTCTGGCcgccg > 2:307704‑M2/100‑141 (MQ=255) ctacaaaacgcaattgaagaacgcgaagcatcgtcataacgaggcaccgaggcgtcgcattcttcagatggttcaacccttaagttagcgcttatgggGTGAAACCCCGGTTATCCGCATCAAGAAGTAATTCTTGCCGCAGt < 1:462657‑M2/45‑1 (MQ=255) ctgGAAGAGAAAGCCAAGTCTACCCTGACGCCGGTTGGTATCTCCAACATGGACGAAATCAAAGAACTGAGCAAACTGTCCGGTAGCGTAACCGTGGGTGAAAcccataagcgctaacttaagggttgtggtattacgcctga > 2:529052‑M2/1‑103 (MQ=255) tgGAAGAGAAAGCCAAGTCTACCCTGACTCCGGTTGTTATCTCCAACATGGACGAAATCAAAGAACTGATCAAACTGTCCGGTAGCGTAACCGTGGGTGAAAcccctaaatccgaagtgaagggttgtggtattacgcctgat < 1:1050329‑M2/143‑42 (MQ=255) caaaacgcaattgaagaacgcgaggcatcgtcttaacgaggcaccgaggcgtcgcattcttcagatggttcaacccttaagttagcgcttatgggGTGAAACCCCGGTTATCCGCATCAAGAAGTAATTCTTGCCGCAGTGaa > 1:17013‑M2/96‑143 (MQ=255) agagAAAGCCAAGTCTACCCTGACTCCGGTTGTTATCTCCAACATGGACGAAATCAAAGAACTGATCAAACTGTCCGGTAGCGTAACCGTGGGTGAAAcccataagcgctaacttaagggttgtggtattacgcctgatatga < 1:724592‑M2/143‑46 (MQ=255) gaAAGCCAAGTCTACCCTGACTCCGGTTGTTATCTCCAACATGGACGAAATCAAAGAACTGATCAAACTGTCCGGTAGCGTAACCGTGGGTGAAAcccataagagctaacttaagggtggtggtattagccctgatatgattc < 2:465667‑M2/143‑49 (MQ=255) 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ccttaagttagcgcttatgggGTGAAACCCCGGTTATCCGCATCAAGAAGTAATTCTTGCCGCAGTGAAAAATGGCGCCCATCGGCGCCATTTTTTTATGCTTCCGCCAGCGGCGGCAAAATCAATTCATCGCTCTCAtgctg > 1:839370‑M2/22‑143 (MQ=255) cttaagttagcgcttatgggGTGAAACCCCGGTTATCCGCATCAAGCAGTAATTCTTGCCGTAGTGAAAAATGGCGCCCATCGGCGCCAGTTTGTTATGGTTCCGCCATCGGCGGCAAAAGCCACTGATCGGTgtcatggtcc > 1:371371‑M2/21‑139 (MQ=255) ggTAGCGTAACCGTGGGTGAAAcccataagcgctaacttaagggttgtggtattacgcctgatatgatttaacgtgccgatgaattactctcacgataactggtcagcaattctggcccatattggtaagcccgaagaactgg < 2:952426‑M2/143‑122 (MQ=255) ggtagggcttaggggGTGAAACCCCCGTTATCCGCATCAAGAAGTAATTCTTGCCGCAGTGAAAAATGGCGCCCATCGGCGCCATTTTTTTATGCTTCCGCCAGCGGCGGCAAAATCAATTCATCGCTCTCATGCTGCTGGgt < 1:338570‑M2/128‑1 (MQ=255) tagcgcttatgggGTGAAACCCCGGTTATCCGCATCAAGAAGTAATTCTTGCCGCAGTGCAAAATGGCGCCCATCGGCGCCAGTTTTTTATGCTTCCGCCCGCGGCGGCAAAAGCAATTCATCCCTCCCATCCtgcggggcga > 2:838492‑M2/14‑140 (MQ=255) 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TTGGCGATACTGTCATTGAATTTGATCTGCCGCTGCTGGAAGAGAAAGCCAAGTCTACCCTGACTCCGGTTGTTATCTCCAACATGGACGAAATCAAAGAACTGATCAAACTGTCCGGTAGCGTAACCGTGGGTGAAACCCCGGTTATCCGCATCAAGAAGTAATTCTTGCCGCAGTGAAAAATGGCGCCCATCGGCGCCATTTTTTTATGCTTCCGCCAGCGGCGGCAAAATCAATTCATCGCTCTCATGCTGCTGGGTGTAGCGCATCACTTCCAGT > NC_000913/2536180‑2536458 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 13 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |