| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| JC JC | NC_000913 | 2,536,312 | Δ1 bp :: IS186 (+) +6 bp :: Δ1 bp | coding (479‑484/510 nt) | crr → | glucose‑specific enzyme IIA component of PTS |
| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | 2514274 = | NA (NA) | 47 (0.790) | 41/278 | 0.4 | 100% | noncoding (2/1345 nt) | IS186 | repeat region |
| ? | NC_000913 | = 2536317 | 0 (0.000) | coding (484/510 nt) | crr | glucose‑specific enzyme IIA component of PTS | |||||
| * | ? | NC_000913 | = 2515616 | NA (NA) | 64 (1.060) | 47/280 | 0.2 | 100% | noncoding (1344/1345 nt) | IS186 | repeat region |
| ? | NC_000913 | 2536312 = | 0 (0.000) | coding (479/510 nt) | crr | glucose‑specific enzyme IIA component of PTS | |||||
Only 100 of 114 total aligned reads displayed.
CGCGTGAAAGTTGGCGATACTGTCATTGAATTTGATCTGCCGCTGCTGGAAGAGAAAGCCAAGTCTACCCTGACTCCGGTTGTTATCTCCAACATGGACGAAATCAAAGAACTGATCAAACTGTCCGGTAGCGTAACCGTGGGTGAAACCCCGGTTATCCGCATCAAGAAGTAATTCTTGCCGCAGTGAAAAATGGCGCCCATCGGCGCCATTTTTTTATGCTTCCGCCAGCGGCGGCAAAATCAATTCATCGCTCTCATGCTGCTGGGTGTAGCGCATCACTTC > NC_000913/2536170‑2536454 | tggcgcttacaggtggccaggcgggggacagtatccctgacagcctacaaaacgcaattgaagaacgcgaggcatcgtcttaacgaggcaccgaggcgtcgcattcttcagatggttcaacccttaagttagcgcttatgggg < 2:942702‑M2/1‑1 (MQ=255)ctgagcttacaggtggccactcgtgggacagtatcgctgacagcctacaaaacgcaattgaagaacgcgaggcatcgtcttaactaggcaccgaggcgtcgtattcttcagatggttcaacccttaagttagcgcttatgggg < 2:248241‑M2/1‑1 (MQ=255) ggagcttacaggtggccattcgtgggacagtatccctgacagcctacaaaacgcaattgaagaacgcgaggcatcgtcttaacgaggcaccgaggcgtcgcattcttcagatggttcaacccttaagttagcgcttatgggGt > 1:3635‑M2/142‑143 (MQ=255) ggagcttacaggtggccattcgtgggacagtatccctgacagcctacaaaacgcaattgaagaacgcgaggcatcgtcttaacgaggcaccgaggagccgcattcttcatgttgttcaacccttaagttagcgcttatgggGt < 1:211928‑M2/2‑1 (MQ=255) ggagcttacaggtggccattcgtgggacagcacccctgacagcctacaaaacgcaattgaagaacgcgaggcatcgtcttaacgaggcaccgaggcgtcgcattcttcagatggttcaacccttaagttagcgcttatgggGt < 1:781088‑M2/2‑1 (MQ=255) gcttcaaaGTTGGCGTTACTGTCATTGATTTTGATCTGTTGCTGCTGGAAGAGAAAGCCAAGTCTACCGTGGCACCGGTTGTTATCTCCAACATGGACGAAATCAAAGAACTGATCAAACTGTCCGGTAGCGTAACCGTGGGt < 1:647324/138‑1 (MQ=255) aggtggcaatgcgtgggacagtatccctgacagccgacaaaacggaattgaggcacgcgaggcatcgtcttaacgtggcaccgaggcgtcgcattcttcagatggttcaacccttaagttagtgcttataggGTGAAACCCCg < 2:198291‑M2/11‑1 (MQ=255) ggtggccattcgtgggacagtatccctgacggcctacaaaacgcaattgaagaacgcgaggcatcgtcttaacgaggcaccgaggcgtcgcattcttcagatggttcaacccttaagttagcgcttatgggGTGAAACCCCgg < 1:459139‑M2/12‑1 (MQ=255) ggtggccattcgtgggacagtatccctgacagcctacaaaacgcaattgaagaacgcgaggcatcgtcttaacgaggcaccgaggcgtcgcattcttcagatggttcaacccttaagttagcgcttatgggGTGAAACCCCgg < 1:541536‑M2/12‑1 (MQ=255) gtggccattcgtgggacagtatccctgacagcctacaaaacgcaattgaagaacgcgaggcatcgtcttaacgaggcaccgaggcctcgcattcttcagatggttcaacccttaagttagcacttatggaGTGAAACACCGGt > 1:349993‑M2/131‑143 (MQ=255) ggCGATACTGTCATTGAATTTGATCTGCCGCTGCCGGAAGAGAAAGCCAAGTCTACCCTGACTCCGGTTGTTATCTCCAACATGGACGAAATCAAAGAACTGATCAAACTGTCCGGTAGCGTAACCGTGGGTGAAAcccataa > 1:366559‑M2/1‑136 (MQ=255) ctaCTGTCATTGAATTTGATCTGCCGCTGCTGGAAGAGAAAGCCAAGTCTACCCTGACTCCGGTTGTTATCTCCAACATGGACGAAATCAAAGAACTGATCAAACTGTCCGGTAGCGTAACCGTGGGTGAAAcccataagcgc > 2:298838‑M2/2‑132 (MQ=255) cattcgtgggacagtatccctgacagcctacaaaaagcaattgaagaacgcgaggcatcgtcttaacgaggcaccgaggcgtcgcattcttcagatggttcaacccttaggttagcgcttatgggGTGAAACCCCGGTTATcc > 1:177347‑M2/126‑143 (MQ=255) tGTCATTGAATTTGATCTGCCGCTGCTGGAAGAGAAAGCCAAGTCTACCCTGACTCCGGTTGTTATCTCCAACATGGACGAAATCAAAGAACTGATCAAACTGTCCGGTAGCGTAACCGTGGGTGAAAcgcataagcgctcac < 1:224912‑M2/143‑16 (MQ=255) cgggggacggtgtccctgacggcctacaatacgcaatggaagaacgcgaggcatcgtcttaacgaggcaccgaggcgtcgcattcttcagatggttcaacccttaagttagcgcttatgggGTGAAACCCCGGTTATCCGCAt < 2:1099667‑M2/22‑1 (MQ=255) tCATTGAATTTGATCTGCCGCTGCTGGAAGAGAAAGCCAAGTCTACCCTGACTCCGGTTGTTATCGCCAACATGGAGGAAATCAAAGAACTGATCAAACTGTCCGGTAGCGTAACCGTGGGTGCAGcccatgagcgctaactt < 1:303201‑M2/143‑18 (MQ=255) gtgggacagtatccctgacagcctacaaaacgcaattgaagaacgcgaggcatcgtcttaacgaggcaccgaggcgtcgcattcttcagatggttcaacccttacgttcgcgcttatgggGTGAAAACCCGGATATCAGCata > 1:435224‑M2/121‑142 (MQ=255) gggacagtatccctgccagcctacaaaacgcaattgaagaacgcgaggcatcgtcttaacgaggcaccgaggcgtcgcattcttcagatgtttcaacccttaagttagcgcttatgggGTGAAACCCCGGTTATCCGCATCaa < 1:315420‑M2/25‑1 (MQ=255) gacagtatccctgacagcctacaaaacgcaattgaagaacgcgaggcatcgtcttaacgaggcaccgaggcgtcgcattcttcagatggttcaacccttaagttagcgcttatgggGTGAAACCCCGGTTATCCGCATCaaga > 1:303832‑M2/117‑143 (MQ=255) gacagtatccccgacagcctacaaaacgcaattgaagaacgcgaggcatcgtcttaacgaggcaccgaggcgtcgcattcttcagatggttcaacccttaagttagcgcttatgggGTGAAACCCCGGTTATCCGCATCaaga < 1:272709‑M2/27‑1 (MQ=255) 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tggcgcggccggggcGGGAAGAGAAGGCCAGGTCTACCCTGGCGCCGGTTGTTATCTCCAACATGGACGAAATCAAAGAACTGATCAAACTGTCCGGTAGCGTAACCGTGGGTGAAAcccataagcgctaacttaagggttgt > 2:1060845‑M2/8‑117 (MQ=255) tatccctgacagcctacaaaacgcaattgaagaacgcgaggcatcgtcttaacgaggcaccgaggcgtcgcattcttcagatggttcgacgcttaagttagcgcttatgggGTGAAACCCCGGTTATCCGCATCACGAAGTaa > 1:74219‑M2/112‑143 (MQ=255) tagccctgacagccgacaaaacgcaattgaagaacgcgaggcatcgtcttaacgaggcaccgaggcgtcgcattcttcagatggttcaacctttaagttagcgcttatgggGTGAAACCCCGGTTATCCGCATCAAGAAGTaa < 1:45973‑M2/32‑1 (MQ=255) tccctgacagcctacaaaacgcaattgaagaacgcgaggcatcgtcttaacgaggcaccgaggcgtcgcattcttcagatggttcaacccttaagttagcgcttatgggGTGAAACCCCGGTTATCCGCATCAAGAAGTAAtt > 1:394952‑M2/110‑143 (MQ=255) gATCTGCCGCTGCTGGAAGAGAAAGCCAAGTCTACCCTGACTCCGGTTGTTATCTCCAACATGGACGAACTCCAAGACCTGTTCCACCTTTCCGCTAGCGTAACCGTGAGTTAAAcccataagcactaacttaaggattgaag < 1:185896‑M2/143‑29 (MQ=255) 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aaaCTGGCCGGTAGCGTAACCGTGGGTGAAAcccataagcgctaacttaagggttgtggtattacgcctgatatgatttaacgtgccgatgaattactctcacgataactggtcagcaattctggcccatattggtaagcccg < 2:193797‑M2/143‑113 (MQ=255) aaaCCGTCCGGTAGCGTAACCGTGGGTGAAAcccataagcgctaacttaagggttgtggtattacgcctgatatgatttaacgtgccgatgaattactctcacgatgactggtcagcaattctggcccatattggtaagcccg < 1:787476‑M2/143‑113 (MQ=255) aaCTGTCCGGTAGCGTAACCGTGGGTGAAAcccataagcgctaacttaagggttgtggtattacgcctgatatgatttaacgtgccgatgaattactctcacgataactggtcagcaattctggcccatattggtaagcacgc < 2:1114342‑M2/143‑114 (MQ=255) ccttaagttagcgcttatgggGTGAAACCCCGGTTATCCGCATCAAGAAGTAATTCTTGCCGCAGTGAAAAATGGCGCCCATCGGCGCCATTTTTTTATGCTTCCGCCAGCGGCGGCAAAATCAATTCATCGCTctcatacaa > 1:651778‑M2/22‑139 (MQ=255) ccttaagttagcgcttatgggGTGAAACCCCGGTTATCCGCATCAAGAAGTAATTCTTGCCGCAGTGAAAAATGGCGCCCATCGGCGCCATTTTTTTATGCTTCCGCCAGCGGCGGCAAAATCAATTCATCGCTCTCAtgctg > 1:839370‑M2/22‑143 (MQ=255) ggTAGCGTAACCGTGGGTGAAAcccataagcgctaacttaagggttgtggtattacgcctgatatgatttaacgtgccgatgaattactctcacgataactggtcagcaattctggcccatattggtaagcccgaagaactgg < 2:952426‑M2/143‑122 (MQ=255) ggtagggcttaggggGTGAAACCCCCGTTATCCGCATCAAGAAGTAATTCTTGCCGCAGTGAAAAATGGCGCCCATCGGCGCCATTTTTTTATGCTTCCGCCAGCGGCGGCAAAATCAATTCATCGCTCTCATGCTGCTGGgt < 1:338570‑M2/128‑1 (MQ=255) tagcgcttatgggGTGAAACCCCGGTTATCCGCATCAAGAAGTAATTCTTGCCGCAGTGCAAAATGGCGCCCATCGGCGCCAGTTTTTTATGCTTCCGCCCGCGGCGGCAAAAGCAATTCATCCCTCCCATCCtgcggggcga > 2:838492‑M2/14‑140 (MQ=255) gTAACCGTGGGTGAAAcccataagcgctaacttaagggttgttgtattacgcctgatatgatttaacttgtcgatgaattactctcacgataactggtcagcaatgctggcccatattggtaagcccgaagaactggatactt > 1:653667‑M2/1‑16 (MQ=255) atccgtGTGTGAAAcccatacgcgctaccttaagggttgtggtattacgcctgatatgatttaacgtgccgatgaagtactctcacgataactggtcagcaattctggcccatattggtaagcccgaagaactggatacttcg > 1:384989‑M2/3‑14 (MQ=255) gggGTGAAACCCCGGTTATCCGCATCAAGAAGTAATTCTTGCCGCAGTGAAAAATGGCGCCCATCGGCGCCATTTTTTTATGCTTCCGCCAGCGGCGGCAAAATCAATTCATCGCTCTCATGCTGCTGGGTGTAGCGCatccc > 1:340190‑M2/4‑141 (MQ=255) gggGTGAAACCCCGGTTATCCGCATCAAGAAGTAATTCTTGCCGCAGTGAAAAATGGCGCCCATCGGCGCCATTTTTTTATGCTTCCGCCAGCGGCGGCAAAATCAATTCATCGCTCTCATGCTGCTGGGTGTAGCGCATCAc > 1:485353‑M2/4‑143 (MQ=255) gGTGAAACCCCGGTTATCCGCATCAAGAAGTAATTCTTGCCGCAGTGAAAAATGGCGCCCATCGGCGCCATTTTTTTATGCTTCCGCCAGCGGCGGCAAAAt > 2:1114629‑M2/2‑102 (MQ=255) gGTGAAACCCCGGTTATCCGCATCAAGAAGTAATTCTTGCCGCAGTGAAAAATGGCGCCCATCGGCGCCATTTTTTTATGCTTCCGCCAGCGGCGGCAAAAt < 1:1114629‑M2/101‑1 (MQ=255) gTGAAACCCCGGTTATCCGCATCAAGAAGTAATTCTTGCCGCAGTGAAAAATGGCGCCCATCGGCGCCATTTTTTTATGCTTCCGCCAGCGGCGGCAAAATCAATTCATCGCTCTCATGCTGCTGGGTGTCGCGCGTCACttg > 1:326554/1‑142 (MQ=255) | CGCGTGAAAGTTGGCGATACTGTCATTGAATTTGATCTGCCGCTGCTGGAAGAGAAAGCCAAGTCTACCCTGACTCCGGTTGTTATCTCCAACATGGACGAAATCAAAGAACTGATCAAACTGTCCGGTAGCGTAACCGTGGGTGAAACCCCGGTTATCCGCATCAAGAAGTAATTCTTGCCGCAGTGAAAAATGGCGCCCATCGGCGCCATTTTTTTATGCTTCCGCCAGCGGCGGCAAAATCAATTCATCGCTCTCATGCTGCTGGGTGTAGCGCATCACTTC > NC_000913/2536170‑2536454 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 13 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |