Predicted mutation | ||||||
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evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
MC JC | NC_000913 | 3,651,293 | Δ2,422 bp | [yhiS]–yhiS | [yhiS], insH‑11, yhiS |
Missing coverage evidence... | ||||||||||
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seq id | start | end | size | ←reads | reads→ | gene | description | |||
* | * | ÷ | NC_000913 | 3651293 | 3653714 | 2422 | 140 [0] | [0] 139 | [yhiS]–yhiS | [yhiS],insH‑11,yhiS |
New junction evidence | |||||||||||
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seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_000913 | = 3651292 | 0 (0.000) | 131 (1.200) | 68/94 | 0.0 | 100% | pseudogene (2/746 nt) | yhiS | putative uncharacterized protein YhiS |
? | NC_000913 | 3653715 = | 0 (0.000) | intergenic (+2/‑246) | yhiS/slp | putative uncharacterized protein YhiS/starvation lipoprotein |
Only 100 of 139 total aligned reads displayed.
GTAAAAGAATTCGCTTATCAAATCATTACCAGAATATAATACCATAATATTGATTATTAGCACTTTATAATCATTGAATAAAAATAGATTTTATGTA > NC_000913/3653667‑3653763 | caatttaaacatcttagcataaaacaaatgatgaataaggaattttatat > 1:1372330‑M2/49‑50 (MQ=255) caatttaaacatcttagcataaaacaaatgatgaataaggaattttatat < 1:3925188‑M2/2‑1 (MQ=255) caatttaaacatcttagcataaaacaaatgatgaataaggaattttatat > 1:8012860‑M2/49‑50 (MQ=255) aatttaaacatcttagcataaaacaaatgatgaataaggaattttatAtt < 1:8131025‑M2/3‑1 (MQ=255) aatttaaacatcttagcataaaacaaatgatgaataaggaattttatAtt > 1:4351729‑M2/48‑50 (MQ=255) aatttaaacatcttagcataaaacaaatgatgaataaggaattttatAtt > 1:705874‑M2/48‑50 (MQ=255) aatttaaacatcttagcataaaacaaatgatgaataaggaattttatAtt > 1:3665394‑M2/48‑50 (MQ=255) atttaaacatcttagcataaaacaaatgatgaataaggaattttatAtt > 1:2769268‑M2/47‑49 (MQ=255) tttaaacatcttagcataaaacaaatgatgaataaggaattttatATTGa < 1:5984315‑M2/5‑1 (MQ=255) tttaaacatcttagcataaaacaaatgatgaataaggaattttatATTGa > 1:7991025‑M2/46‑50 (MQ=255) tttaaacatcttagcataaaacaaatgatgaataaggaattttatATTGa < 1:2109158‑M2/5‑1 (MQ=255) tttaaacatcttagcataaaacaaatgatgaataaggaattttatATTGa < 1:5708577‑M2/5‑1 (MQ=255) tttaaacatcttagcataaaacaaatgatgaataaggaattttatATTGa < 1:2670578‑M2/5‑1 (MQ=255) ttaaacatcttagcataaaacaaatgatgaataaggaattttatATTGat > 1:3553878‑M2/45‑50 (MQ=255) aacatcttagcataaaacaaatgatgaataaggaattttatATTGattat < 1:4672627‑M2/9‑1 (MQ=255) aacatcttagcataaaacaaatgatgaataaggaattttatATTGattat < 1:7810237‑M2/9‑1 (MQ=255) aacatcttagcataaaacaaatgatgaataaggaattttatATTGattat < 1:8475699‑M2/9‑1 (MQ=255) aacatcttagcataaaacaaatgatgaataaggaattttatATTGatta < 1:3538174‑M2/8‑1 (MQ=255) acatcttagcataaaacaaatgatgaataaggaattttatATTGattatt < 1:7260293‑M2/10‑1 (MQ=255) acatcttagcataaaacaaatgatgaataaggaattttatATTGattatt < 1:7832329‑M2/10‑1 (MQ=255) catcttagcataaaacaaatgatgaataaggaattttatATTGattat > 1:4040643‑M2/40‑48 (MQ=255) catcttagcataaaacaaatgatgaataaggaattttatATTGAttatta < 1:2050326‑M2/11‑1 (MQ=255) atcttagcataaaacaaatgatgaataaggaattttatATTGATTATTAg < 1:7500952‑M2/12‑1 (MQ=255) atcttagcataaaacaaatgatgaataaggaattttatATTGATTATTAg > 1:3021294‑M2/39‑50 (MQ=255) atcttagcataaaacaaatgatgaataaggaattttatATTGATTATTAg > 1:7640711‑M2/39‑50 (MQ=255) atctgagcataaaacaaatgatgaataaggaattttatATTGATTATTAg < 1:5716881‑M2/12‑1 (MQ=255) tcttagcataaaacaaatgatgaataaggaattttatATTGATTATTAg > 1:1558108‑M2/38‑49 (MQ=255) tcttagcataaaacaaatgatgaataaggaattttatATTGATTATTAg > 1:2331080‑M2/38‑49 (MQ=255) cttagcataaaacaaatgatgaataaggaattttatATTGATTATTAGCa > 1:1998801‑M2/37‑50 (MQ=255) ttagcataaaacaaatgatgaataaggaattttatATTGATTATTAGCAc > 1:8211396‑M2/36‑50 (MQ=255) tagcataaaacaaatgatgaataaggaattttatATTGATTATTAGCACt > 1:3116588‑M2/35‑50 (MQ=255) agcataaaacaaatgatgaataaggaattttatATTGATTATTAGCa < 1:2133409‑M2/14‑1 (MQ=255) agcataaaacaaatgatgaataaggaattttatATTGATTATTAGCACt < 1:5375566‑M2/16‑1 (MQ=255) agcataaaacaaatgatgaataaggaattttatATTGATTATTAGCACt < 1:7718566‑M2/16‑1 (MQ=255) gcataaaacaaatgatgaataaggaattttatATTGATTATTAGCACttt < 1:4698833‑M2/18‑1 (MQ=255) ataaaacaaatgatgaataaggaattttatATTGATTATTAGCACTTtat < 1:2665553‑M2/20‑1 (MQ=255) ataaaacaaatgatgaataaggaattttatATTGATTATTAGCACTTtat < 1:2355039‑M2/20‑1 (MQ=255) taaaacaaatgatgaataaggaattttatATTGATTATTAGCACTTtata < 1:2833987‑M2/21‑1 (MQ=255) taaaacaaatgatgaataaggaattttatATTGATTATTAGCACTTtat > 1:6439945‑M2/30‑49 (MQ=255) aaaacaaatgatgaataaggaattttatATTGATTATTAGCACTTTATaa > 1:921456‑M2/29‑50 (MQ=255) aaacaaatgatgaataaggaattttatATTGATTATTAGCACTTTATAAt < 1:7317376‑M2/23‑1 (MQ=255) aaacaaatgatgaataaggaattttatATTGATTATTAGCACTTTATAAt < 1:4149937‑M2/23‑1 (MQ=255) aaacaaatgatgaataaggaattttatATTGATTATTAGCACTTTATAAt > 1:909831‑M2/28‑50 (MQ=255) aaacaaatgatgaataaggaattttatATTGATTATTAGCACTTTATAAt > 1:1373650‑M2/28‑50 (MQ=255) aaacaaatgatgaataaggaattttatATTGATTATTAGCACTTTATAAt < 1:5754453‑M2/23‑1 (MQ=255) aaacaaatgatgaataaggaattttatATTGATTATTAGCACTTTATAAt < 1:5159722‑M2/23‑1 (MQ=255) aaacaaatgatgaataaggaattttatATTGATTATTAGCACTTTATAAt > 1:5140906‑M2/28‑50 (MQ=255) aaacaaatgatgaataaggaattttatATTGATTATTAGCACTTTATAAt > 1:2252704‑M2/28‑50 (MQ=255) aaacaaatgatgaataaggaaatttatATTGATTATTAGCACTTTATaa < 1:7469275‑M2/22‑1 (MQ=255) aacaaatgatgaataaggaattttatATTGATTATTAGCACTTTATAATc < 1:7643701‑M2/24‑1 (MQ=255) acaaatgatgaataaggaattttatATTGATTATTAGCACTTTATAATCa > 1:8219283‑M2/26‑50 (MQ=255) acaaatgatgaataaggaattttatATTGATTATTAGCACTTTATAATCa < 1:2980420‑M2/25‑1 (MQ=255) caaatgatgaataaggaattttatATTGATTATTAGCACTTTATAATCAt < 1:3291056‑M2/26‑1 (MQ=255) aaatgatgaataaggaattttatATTGATTATTAGCACTTTATAATCAtt < 1:3715348‑M2/27‑1 (MQ=255) aaatgatgaataaggaattttatATTGATTATTAGCACTTTATAATCAtt < 1:5951925‑M2/27‑1 (MQ=255) aaatgatgaataaggaattttatATTGATTATTAGCACTTTATAATCAtt > 1:8342314‑M2/24‑50 (MQ=255) aatgatgaataaggaattttatATTGATTATTAGCACTTTATAATCAtt > 1:2433461‑M2/23‑49 (MQ=255) aatgatgaataaggaattttatATTGATTATTAGCACTTTATAATCAtt > 1:3153389‑M2/23‑49 (MQ=255) atgatgaataaggaattttatATTGATTATTAGCACTTTATAATCATTGa < 1:5345753‑M2/29‑1 (MQ=255) 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aataaggaattttatATTGATTATTAGCACTTTATAATCATTGAATaaa > 1:5331004‑M2/16‑49 (MQ=255) taaggaattttatATTGATTATTAGCACTTTATAATCATTGAATAAAAAt < 1:216822‑M2/37‑1 (MQ=255) taaggaattttatATTGATTATTAGCACTTTATAATCATTGAATAAAAAt < 1:6675090‑M2/37‑1 (MQ=255) aaggaattttatATTGATTATTAGCACTTTATAATCATTGAATaaaaa > 1:4280350‑M2/13‑48 (MQ=255) aggaattttatATTGATTATTAGCACTTTATAATCATTGAATaaaaa > 1:5410945‑M2/12‑47 (MQ=255) aggaattttatATTGATTATTAGCACTTTATAATCATTGAATAAAAATa < 1:6458219‑M2/38‑1 (MQ=255) aggaattttatATTGATTATTAGCACTTTATAATCATTGAATAAAAATa < 1:8582408‑M2/38‑1 (MQ=255) aggaattttatATTGATTATTAGCACTTTATAATCATTGAATAAAAATa < 1:4427373‑M2/38‑1 (MQ=255) aggaattttatATTGATTATTAGCACTTTATAATCATTGAATAAAAATAg < 1:3784093‑M2/39‑1 (MQ=255) ggaattttatATTGATTATTAGCACTTTATAATCATTGAATaaaaa > 1:6682490‑M2/11‑46 (MQ=255) gaattttatATTGATTATTAGCACTTTATAATCATTGAATAAAAATAGAt < 1:2229193‑M2/41‑1 (MQ=255) gaattttatATTGATTATTAGCACTTTATAATCATTGAATAAAAATAGAt < 1:1812686‑M2/41‑1 (MQ=255) aattttatATTGATTATTAGCACTTTATAATCATTGAATAAAAATAGAtt < 1:6964903‑M2/42‑1 (MQ=255) aattttatATTGATTATTAGCACTTTATAATCATTGAATAAAAATAGAtt < 1:7526079‑M2/42‑1 (MQ=255) attttatATTGATTATTAGCACTTTATAATCATTGAATAAAAATAGAttt < 1:7538943‑M2/43‑1 (MQ=255) attttatATTGATTATTAGCACTTTATAATCATTGAATAAAAATAGAttt < 1:1460275‑M2/43‑1 (MQ=255) ttttatATTGATTATTAGCACTTTATAATCATTGAATAAAAATAGAtttt < 1:7601824‑M2/44‑1 (MQ=255) ttttatATTGATTATTAGCACTTTATAATCATTGAATAAAAATAGAtttt < 1:1772965‑M2/44‑1 (MQ=255) ttttatATTGATTATTAGCACTTTATAATCATTGAATAAAAATAGAtttt < 1:5265366‑M2/44‑1 (MQ=255) ttttatATTGATTATTAGCACTTTATAATCATTGAATAAAAATAGAttt > 1:5526421‑M2/7‑49 (MQ=255) ttttatATTGATTATTAGCACTTTATAATCATTGAATAAAAATAGAttt > 1:6374364‑M2/7‑49 (MQ=255) ttatATTGATTATTAGCACTTTATAATCATTGAATAAAAATAGATTTTa < 1:6035261‑M2/45‑1 (MQ=255) ttatATTGATTATTAGCACTTTATAATCATTGAATAAAAATAGATTTTAt > 1:3976240‑M2/5‑50 (MQ=255) tatATTGATTATTAGCACTTTATAATCATTGAATAAAAATAGATTTTATg > 1:2284122‑M2/4‑50 (MQ=255) atATTGATTATTAGCACTTTATAATCATTGAATAAAAATAGATTTTATg < 1:1884035‑M2/47‑1 (MQ=255) atATTGATTATTAGCACTTTATAATCATTGAATAAAAATAGATTTTATg > 1:6039482‑M2/3‑49 (MQ=255) atATTGATTATTAGCACTTTATAATCATTGAATAAAAATAGATTTTATg < 1:3761291‑M2/47‑1 (MQ=255) tATTGATTATTAGCACTTTATAATCATTGAATAAAAATAGATTTTATGTa < 1:6973100‑M2/49‑1 (MQ=255) tATTGATTATTAGCACTTTATAATCATTGAATAAAAATAGATTTTATGTa < 1:4489399‑M2/49‑1 (MQ=255) | GTAAAAGAATTCGCTTATCAAATCATTACCAGAATATAATACCATAATATTGATTATTAGCACTTTATAATCATTGAATAAAAATAGATTTTATGTA > NC_000913/3653667‑3653763 |
Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |