| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| MC JC | NC_000913 | 3,090,347 | Δ708 bp | coding (1‑708/708 nt) | endA → | DNA‑specific endonuclease I |
| Missing coverage evidence... | ||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | start | end | size | ←reads | reads→ | gene | description | |||
| * | * | ÷ | NC_000913 | 3090347 | 3091054 | 708 | 100 [0] | [0] 97 | endA | DNA‑specific endonuclease I |
| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | = 3090346 | 0 (0.000) | 97 (0.990) | 48/98 | 0.1 | 100% | intergenic (+94/‑1) | yggI/endA | conserved protein YggI/DNA‑specific endonuclease I |
| ? | NC_000913 | 3091055 = | 0 (0.000) | intergenic (+1/‑79) | endA/rsmE | DNA‑specific endonuclease I/16S rRNA m(3)U1498 methyltransferase | |||||
CCAAAACAGCTTTCGCTACGTTGCTGGCTCGTTTTAACACGGAGTAAGTG‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > NC_000913/3090297‑3090346‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑CCTACACTAGCGGGATTCTTTTTGTTAACCCCTACCCCACGCGTAC > NC_000913/3091055‑3091100 CCAAAACAGCTTTCGCTACGTTGCTGGCTCGTTTTAACATGGAG‑AAGTGC > 1:3657674/1‑50CCAAAACAGCTTTCGCTACGTTGCTGGCTCGTTTTAACACGGAG‑AAGTGC > 1:534567/1‑50 CAAAACAGCTTTCGCTACGTTGCTGGCTCGTTTTAACACGGAG‑AAGTGCC > 1:4601650/1‑50 CAAAACAGCTTTCGCTACGTTGCTGGCTCGTTTTAACACGGAG‑AAGTGCC < 1:5708920/50‑1 CAAAACAGCTTTCGCTACGTTGCTGGCTCGTTTTAACACGGAG‑AAGTGCC < 1:1995103/50‑1 CAAAACAGCTTTCGCTACGTTGCTGGCTCGTTTTAACACGGAG‑AAGTGCC > 1:7078249/1‑50 AAAACAGCTTTCGCTACGTTGCTGGCTCGTTTTAACACGGAG‑AAGTGCC > 1:6955186/1‑49 AAAACAGCTTTCGCTACGTTGCTGGCTCGTTTTAACACGGAG‑AAGTGCC > 1:1717056/1‑49 AAAACAGCTTTCGCTACGTTGCTGGCTCGTTTTAACACGGAG‑AAGTGCC > 1:2658240/1‑49 AAACAGCTTTCGCTACGTTGCTGGCTCGTTTTAACACGGAG‑AAGTGCCca > 1:6682756/1‑48 AAACAGCTTTCGCTACGTTGCTGGCTCGTTTTAACACGGAG‑AAGTGCCTA < 1:5985780/50‑1 AAACAGCTTTCGCTACGTTGCTGGCTCGTTTTAACACGGAG‑AAGTGCCTA < 1:1908408/50‑1 AAACAGCTTTCGCTACGTTGCTGGCTCGTTTTAACACGGAG‑AAGTGCCTA > 1:2190082/1‑50 AACAGCTTTCGCTACGTTGCTGGCTCGTTTTAACACGGAG‑AAGTGCCTAC < 1:1657817/50‑1 AACAGCTTTCGCTACGTTGCTGGCTCGTTTTAACACGGAG‑AAGTGCCTAC < 1:6751979/50‑1 AACAGCTTTCGCTACGTTGCTGGCTCGTTTTAACACGGAG‑AAGTGCCTAC < 1:2174946/50‑1 AACAGCTTTCGCTACGTTGCTGGCTCGTTTTAACACGGAG‑AAGTGCCTA > 1:6648843/1‑49 AACAGCTTTCGCTACGTTGCTGGCTCGTTTTAACACGGAG‑AAGTGCCTA > 1:1297058/1‑49 AACAGCTTTCGCTACGTTGCTGGCTCGTTTTAACACGGAG‑AAGTGCCTA > 1:307016/1‑49 ACAGCTTTCGCTACGTTGCTGGCTCGTTTTAACACGGAG‑AAGTGCCTACA < 1:6506845/50‑1 AGCTTTCGCTACGTTGCTGGCTCGTTTTAACACGGAG‑AAGTGCCTACACT < 1:873051/50‑1 GCTTTCGCTACGTTGCTGGCTCGTTTTAACACGGAG‑AAGTGCCTACACTA < 1:2939587/50‑1 GCTTTCGCTACGTTGCTGGCTCGTTTTAACACGGAG‑AAGTGCCTACACTA < 1:5746464/50‑1 GCTTTCGCTACGTTGCTGGCTCGTTTTAACACGGAG‑AAGTGCCTACACTA < 1:5209711/50‑1 GCTTTCGCTACGTTGCTGGCTCGTTTTAACACGGAG‑AAGTGCCTACAC > 1:4286275/1‑48 GCTTTCGCTACGTTGCTGGCTCGTTTTAACACGGAG‑AAGTGCCTACAC > 1:6018553/1‑48 CTTTCGCTACGTTGCTGGCTCGTTTTAACACGGAG‑AAGTGCCTACACTAG < 1:5167678/50‑1 CTTTCGCTACGTTGCTGGCTCGTTTTAACACGGAG‑AAGTGCCTACACTAG < 1:4142898/50‑1 TTTCGCTACGTTGCTGGCTCGTTTTAACACGGAG‑AAGTGCCTACACTAGC > 1:3016553/1‑50 TTTCGCTACGTTGCTGGCTCGTTTTAACACGGAG‑AAGTGCCTACACTAGC > 1:5993671/1‑50 TTTCGCTACGTTGCTGGCTCGTTTTAACACGGAG‑AAGTGCCTACACTAGC > 1:6927531/1‑50 TTTCGCTACGTTGCTGGCTCGTTTTAACACGGAG‑AAGTGCCTACACTAGC > 1:7117734/1‑50 TCGCTACGTTGCTGGCTCGTTTTAACACGGAG‑AAGTGCCTACACTAGCG < 1:3085113/49‑1 TCGCTACGTTGCTGGCTCGTTTTAACACGGAG‑AAGTGCCTACACTAGC < 1:5116068/48‑1 TCGCTACGTTGCTGGCTCGTTTTAACACGGAG‑AAGTGCCTACACTAGC < 1:1457946/48‑1 GCTACGTTGCTGGCTCGTTTTAACACGGAG‑AAGTGCCTACACTAGCGGGA > 1:2953165/1‑50 GCTACGTTGCTGGCTCGTTTTAACACGGAG‑AAGTGCCTACACTAGCGGGA > 1:4693007/1‑50 GCTACGTTGCTGGCTCGTTTTAACACGGAG‑AAGTGCCTACACTAGCGGGA > 1:4504376/1‑50 GCTACGTTGCTGGCTCGTTTTAACACGGAG‑AAGTGCCTACACTAGCGGGA > 1:101731/1‑50 GCTACGTTGCTGGCTCGTTTTAACACGGAG‑AAGTGCCTACACTAGCGGGA > 1:5428852/1‑50 CTACGTTGCTGGCTCGTTTTAACACGGA‑AAAGTGCCTACACTAGCGGGAT > 1:7156266/1‑50 TACGTTGCTGGCTCGTTTTAACACGGAG‑AAGTGCCTACACTAGCGGGATT > 1:216546/1‑50 TACGTTGCTGGCTCGTTTTAACACGGAG‑AAGTGCCTACACTAGCGGGATT > 1:6138998/1‑50 ACGTTGCTGGCTCGTTTTAACACGGAG‑AAGTGCCTACACTAGCGGGATTC > 1:1306482/1‑50 CGTTGCTGGCTCGTTTTAACACGGAG‑AAGTGCCTACACTAGCGGGATT < 1:4130110/48‑1 GTTGCTGGCTCGTTTTAACACGGAG‑AAGTGCCTACACTAGCGGGATTCTT < 1:5658706/50‑1 GTTGCTGGCTCGTTTTAACACGGAG‑AAGTGCCTACACTAGCGGGATTCTT < 1:242048/50‑1 GTTGCTGGCTCGTTTTAACACGGAG‑AAGTGCCTACACTAGCGGGATTCTT > 1:6277384/1‑50 GTTGCTGGCTCGTTTTAACACGGAG‑AAGTGCCTACACTAGCGGGATTCTT < 1:7379645/50‑1 GTTGCTGGCTCGTTTTAACACGGAG‑AAGTGCCTACACTAGCGGGATTCTT < 1:2961248/50‑1 GTTGCTGGCTCGTTTTAACACGGAG‑AAGTGCCTACACTAGCGGGATTCTT < 1:989875/50‑1 GTTGCTGGCTCGTTTTAACACGGAG‑AAGTGCCTACACTAGCGGGATTCTT > 1:5938981/1‑50 TGCTGGCTCGTTTTAACACGGAG‑AAGTGCCTACACTAGCGGGATTCTTTT > 1:549802/1‑50 TGCTGGCTCGTTTTAACACGGAG‑AAGTGCCTACACTAGCGGGATTCTTTT > 1:1012114/1‑50 GCTGGCTCGTTTTAACACGGAG‑AAGTGCCTACACTAGCGGGATTCTTTT < 1:250266/49‑1 GCTGGCTCGTTTTAACACGGAG‑AAGCGCCTACACTAGCGGGATTCTTTTT > 1:2437684/1‑50 CTGGCTCGTTTTAACACGGAG‑AAGTGCCTACACTAGCGGGATTCTTTTT < 1:1434798/49‑1 CTGGCTCGTTTTAACACGGAG‑AAGTGCCTACACTAGCGGGATTCTTTTT < 1:2275573/49‑1 TGGCTCGTTTTAACACGGAG‑AAGTGCCTACACTAGCGGGCTTCTTTTTGT > 1:2560353/1‑50 TGGCTCGTTTTAACACGGAG‑AAGTGCCTACACTAGCGGGATTCTTTTTGT > 1:5332134/1‑50 TGGCTCGTTTTAACACGGAG‑AAGTGCCTACACTAGCGGGATTCTTTTTGT > 1:5695726/1‑50 GGCTCGTTTTAACACGGAG‑AAGTGCCTACACTAGCGGGATTCTTTTTGT > 1:563245/1‑49 GCTCGTTTTAACACGGAG‑AAGTGCCTACACTAGCGGGATTCTTTTTGTT < 1:732560/49‑1 GCTCGTTTTAACACGGAG‑AAGTGCCTACACTAGCGGGATTCTTTTTGTT < 1:1949240/49‑1 GCTCGTTTTAACACGGAG‑AAGTGCCTACACTAGCGGGATTCTTTTTGTT > 1:3130959/1‑49 GCTCGTTTTAACACGGAG‑AAGTGCCTACACTAGCGGGATTCTTTTTGT < 1:4279685/48‑1 GCTCGTTTTAACACGGAG‑AAGTGCCTACACTAGCGGGATTCTTTTTGT < 1:6160948/48‑1 GCTCGTTTTAACACGGAG‑AAGTGCCTACACTAGCGGGATTCTTTTTGT < 1:5504148/48‑1 CTCGTTTTAACACGGAG‑AAGTGCCTACACTAGCGGGATTCTTTTTGTTAA > 1:2344210/1‑50 GTTTTAACACGGAG‑AAGTGCCTACACTAGCGGGATTCTTTTTGTTAACCC > 1:6937670/1‑50 GTTTTAACACGGAG‑AAGTGCCTACACTAGCGGGATTCTTTTTGTTAACCC > 1:122598/1‑50 GTTTTAACACGGAG‑AAGTGCCTACACTAGCGGGATTCTTTTTGTTAACCC > 1:1005588/1‑50 GTTTTAACACGGAG‑AAGTGCCTACACTAGCGGGATTCTTTTTGTTAACCC < 1:5267167/50‑1 GTTTTAACACGGAG‑AAGTGCCTACACTAGCGGGATTCTTTTTGTTAACCC > 1:393330/1‑50 TTTTAACACGGAG‑AAGTGCCTACACTAGCGGGATTCTTTTTGTTAACCCC > 1:4984297/1‑50 TTTTAACACGGAG‑AAGTGCCTACACTAGCGGGATTCTTTTTGTTAACCCC > 1:2617404/1‑50 TTTTAACACGGAG‑AAGTGCCTACACTAGCGGGATTCTTTTTGTTAACCCC < 1:3348852/50‑1 TTTAACACGGAG‑AAGTGCCTACACTAGCGGGATTCTTTTTGTTAACCCC > 1:286698/1‑49 TTAACACGGAG‑AAGTGCCTACACTAGCGGGATTCTTTTTGTTAACCCCTA > 1:6085937/1‑50 TTAACACGGAG‑AAGTGCCTACACTAGCGGGATTCTTTTTGTTAACCCCTA > 1:534798/1‑50 TTAACACGGAG‑AAGTGCCTACACTAGCGGGATTCTTTTTGTTAACCCCTA > 1:5400924/1‑50 TTAACACGGAG‑AAGTGCCTACACTAGCGGGATTCTTTTTGTTAACCCCT < 1:2767759/49‑1 AACACGGAG‑AAGTGCCTACACTAGCGGGATTCTTTTTGTTAACCCCTACC > 1:226356/1‑50 AACACGGAG‑AAGTGCCTACACTAGCGGGATTCTTTTTGTTAACCCCTAC < 1:4080011/49‑1 AACACGGAG‑AAGTGCCTACACTAGCGGGATTCTTTTTGTTAACCCCTAC < 1:2799960/49‑1 ACACGGAG‑AAGTGCCTACACTAGCGGGATTCTTTTTGTTAACCCCTACC < 1:5237009/49‑1 ACACGGAG‑AAGTGCCTACACTAGCGGGATTCTTTTTGTTAACCCCTACC < 1:767281/49‑1 CACGGAG‑AAGTGCCTACACTAGCGGGATTCTTTTTGTTAACCCCTACCCC < 1:1525028/50‑1 ACGGAG‑AAGTGCCTACACTAGCGGGATTCTTTTTGTTAACCCCTACCCCA < 1:5777585/50‑1 agAAGTGCCTACACTAGCGGGATTCTTTTTGTTAACCCCTACCCCACGCG > 1:5850096/3‑50 agAAGTGCCTACACTAGCGGGATTCTTTTTGTTAACCCCTACCCCACGCG > 1:2154640/3‑50 agAAGTGCCTACACTAGCGGGATTCTTTTTGTTAACCCCTACCCCACGCG > 1:1252307/3‑50 gAAGTGCCTACACTAGCGGGATTCTTTTTGTTAACCCCTACCCCACGCG > 1:3233402/2‑49 AAGTGCCTACACTAGCGGGATTCTTTTTGTTAACCCCTACCCCACGCGTA > 1:1602731/1‑50 AGTGCCTACACTAGCGGGATTCTTTTTGTTAACCCCTACCCCACGCGTAC < 1:2923887/50‑1 AGTGCCTACACTAGCGGGATTCTTTTTGTTAACCCCTACCCCACGCGTAC < 1:1679801/50‑1 AGTGCCTACACTAGCGGGATTCTTTTTGTTAACCCCTACCCCACGCGTA > 1:6135551/1‑49 CCAAAACAGCTTTCGCTACGTTGCTGGCTCGTTTTAACACGGAGTAAGTG‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > NC_000913/3090297‑3090346‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑CCTACACTAGCGGGATTCTTTTTGTTAACCCCTACCCCACGCGTAC > NC_000913/3091055‑3091100 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 17 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |