| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| JC JC | NC_000913 | 3,247,848 | IS2 (+) +5 bp | coding (76‑80/663 nt) | yqjA → | general envelope maintenance protein; DedA family inner membrane protein; putative multidrug efflux transporter |
| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | = 2070271 | NA (NA) | 76 (1.160) | 51/198 | 0.3 | 96.0% | noncoding (1/1331 nt) | IS2 | repeat region |
| ? | NC_000913 | = 3247852 | 3 (0.050) | coding (80/663 nt) | yqjA | general envelope maintenance protein; DedA family inner membrane protein; putative multidrug efflux transporter | |||||
| * | ? | NC_000913 | 2996361 = | NA (NA) | 60 (0.920) | 45/198 | 0.6 | 95.0% | noncoding (1331/1331 nt) | IS2 | repeat region |
| ? | NC_000913 | 3247848 = | 3 (0.050) | coding (76/663 nt) | yqjA | general envelope maintenance protein; DedA family inner membrane protein; putative multidrug efflux transporter | |||||
TCAATCATCTGTTCTCCAATGACTAGTCTAAAAACTAGTATTAAGACTATCACTTATTTAAGTGATATTGGTTGTCTGGAGATTCAGGGGGCCAGTCTA‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > NC_000913/2070173‑2070271‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ATGCCAAT‑CATCGATGGATTGGCCAGGGTTTCAAAATCCTGCGCCCACAGGGCTTGCAGCAATTGGGTCAAAAGTTCCATTCATTATTCCTGGTGAATC < NC_000913/3247852‑3247754 TCAATCATCTGTTCTCCAATGACTAGTCTAAAAACTAGTATTAAGACTATCACTTATTTAAGTGATATTGGTTGTCTGGAGATTCAGGGGGCCAGTCTAA < 1:43651/100‑1TCAATCATCTGTTCTCCAATGACTAGTCTAAAAACTAGTATTAAGACTATCACTTATTTAAGTGATATTGGTTGTCTGGAGATTCAGGGGGCCAGTCTAA < 1:1498705/100‑1TCAATCATCTGTCCTCCAATGAATAGTCTAAAAACTGGTATTAAGACTATCACTTATTTAAGTGATATTGGTTGTCTGGACATTCAGCGGGCCAGTCTAA < 1:1342444/100‑1 CAATCATCTGTTCTCCAATGACTAGTCTAAAAACTAGTATTAAGACTATCACTTATTTAAGTGATATTGGTTGTCTGGAGATTCAGGGGGCCAGTCTAAT > 2:1394933/1‑100 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CCAATGACTAGTCTAAAAACTAGTATTAAGACTATCACTTATTTAAGTGATATTGGTTGTCTGGAGATTCAGGGGGCCAGTCTAATGCCAAT‑CATCGATG > 1:134448/1‑100 CAATGACTAGTCTAAAAACTAGTATTAAGACTATCACTTATTTAAGTGATATTGGTTGTCTGGAGATTCAGGGGGCCAGTCTAATGCCAAT‑CATCGATGG < 1:224154/100‑1 nATGACTAGTCTAAAAACTAGTATTAAGACTATCACTTATTTAAGTGATATTGGTTGTCTGGAGATTCAGGGGGCCAGTCTAATGCCAAT‑CATCGATGGA > 1:277966/2‑100 ATGACTAGTCTAAAAACTAGTATTAAGACTATCACTTATTTAAGTGATATTGGTTGTCTGGAGATTCAGGGGGCCAGTCTAATGCCAAT‑CATCGATGGAT > 1:136599/1‑100 nGACTAGTCTAAAAACTAGTATTAAGACTATCACTTATTTAAGTGATATTGGTTGTCTGGAGATTCAGGGGGCCAGTCTAATGCCAAT‑CATCGATGGATT > 1:808107/2‑100 TGACTAGTCTAAGAACTAGTATTAAGACTATCACTTATTTAAGTGATATTGGTTGTCTGGAGATTCAGGGGGCCAGTCTAATGCCAAT‑CATCGATGGATT > 2:1047856/1‑100 TGACTAGTCTAAAAACTAGTATTAAGACTATCACTTATTTAAGTGATATTGGTTGTCTGGAGATTCAGGGGGCCAGTCTAATGCCAAT‑CATCGATGGATT < 2:911065/100‑1 AGTCTAAAAACTAGTATTAAGACTATCACTTATTTAAGTGATATTGGTTGTCTGGAGATTCAGGGGGCCAGTCTAATGCCAAT‑CATCGATGGATTGGCCA > 2:606596/1‑100 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TAAGACTATCACTTATTTAAGTGATATTGGTTGTCTGGAGATTCAGGGGGCAAGTCTAATGCCAAT‑CATCGATGGATTGGCCAGGGTTTCAAAATCCTGC > 1:889977/1‑100 accaaTATCACTTAAATAAGTGATATTGGTTGTCTGGAGATTCAGGGGGCCAGTCTAATGCCAAT‑CATCGATGGATTGGCCAGGGTTTCAAAATCCTGCG > 2:1484037/6‑100 AAGACTATCACTGATTTAAGTGATATTGGTTGTCTGGAGATTCAGGGGGCCAGTCTAATGCCAAT‑CATCGATGGATTGGCCAGGGTTTCAAAATCCTGCG < 1:1307667/100‑1 CTATCACTTATTTAAGTGATATTGGTTGTCTGGAGATTCAGGGGGCCAGTCTAATGCCAAT‑CATCGATGGATTGGCCAGGGTTTCAAAATCCTGCGCCCA > 1:1376483/1‑100 CTATCACTTATTTAAGTGATATTGGTTGTCTGGAGATTCAGGGGGCCAGTCTAATGCCAAT‑CATCGATGGATTGGCCAGGGTTTCAAAATCCTGCGCCCA > 2:229923/1‑100 ATCACTTATTTAAGTGATATTGGTTGTCTGGAGATTCAGGGGGCCAGTCTAATGCCAAT‑CATCGATGGATTGGCCAGGGTTTCAAAATCCTGCGCCCACA > 1:833093/1‑100 cacttaaaTAAGTGATATTGGTTGTCTGGAGATTCAGGGGGCCAGTCTAATGCCAAT‑CATCGATGGATTGGCCAGGGTTTCAAAATCCTGCGCCCACAGG > 1:429061/9‑100 nTATTTAAGTGATATTGGTTGTCTGGAGATTCAGGGGGCCAGTCTAATGCCAAT‑CATCGATGGATTGGCCAGGGTTTCAAAATCCTGCGCCCACAGGGCT > 2:917652/2‑100 TTATTTAAGTGATATTGGTTGTCTGGAGATTCAGGGGGCCAGTCTAATGCCAAT‑CATCGATGGCTTGGCCAGGGTTTCAAAATCCTGCGCCCACAGGGCT < 2:1129304/100‑1 ATTTAAGTGATATTGGTTGTCTGGAGATTCAGGGGGCCAGTCTAATGCCAAT‑CATCGATGGATTGGCCAGGGTTTCAAAATCCTGCGCCCACAGGGCTTG < 2:134450/100‑1 TTTAAGTGATATTGGTTGTCTGGAGATTCAGGGGGCCAGTCTAATGCCAAT‑CATCGATGGATTGGCCAGGGTTTCAAAATCCTGCGCCCACAGGGCTTGC < 1:364576/100‑1 TTTAAGTGATATTGGTTGTCTGGAGATTCAGGGGGCCAGTCTAATGCCAAT‑CATCGATGGATTGGCCAGGGTTTCAAAATCCTGCGCCCACAGGGCTTGC < 1:757262/100‑1 TTAAGTGATATTGGTTGTCTGGAGATTCAGGGGGCCAGTCTAATGCCAAT‑CATCGATGGATTGGCCAGGGTTTCAAAATCCTGCGCCCACAGGGCTTGCA < 2:780771/100‑1 TAAGTGATATTGGTTGTCTGGAGATTCAGGGGGCCAGTCTAATGCCAAT‑CATCGATGGATTGGCCAGGGTTTCAAAATCCTGCGCCCACAGGGCTTGCA < 1:380831/99‑1 AAGTGATATTGGTTGTCTGGAGATTCAGGGGGCCAGTCTAATGCCAAT‑CATCGATGGATTGGCCAGGGTTTCAAAATCCTGCGCCCACAGGGCTTGCAGC < 2:146461/100‑1 TGATATTGGTTGTCTGGAGATTCAGGGGGCCAGTCTAATGCCAAT‑CATCGATGGATTGGCCAGGGTTTCAAAATCCTGCGCCCACAGGGCTTGCAGCAAT > 1:1359147/1‑100 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TCAATCATCTGTTCTCCAATGACTAGTCTAAAAACTAGTATTAAGACTATCACTTATTTAAGTGATATTGGTTGTCTGGAGATTCAGGGGGCCAGTCTA‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > NC_000913/2070173‑2070271‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ATGCCAAT‑CATCGATGGATTGGCCAGGGTTTCAAAATCCTGCGCCCACAGGGCTTGCAGCAATTGGGTCAAAAGTTCCATTCATTATTCCTGGTGAATC < NC_000913/3247852‑3247754 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |