| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| JC JC | NC_000913 | 883,553 | IS30 (+) +2 bp | intergenic (‑165/‑119) | ybjG ← / → mdfA | undecaprenyl pyrophosphate phosphatase/multidrug efflux pump MdfA/Na(+):H(+) antiporter/K(+):H(+) antiporter |
| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | 270541 = | NA (NA) | 260 (5.120) | 54/128 | 0.0 | 99.6% | noncoding (1/1221 nt) | IS30 | repeat region |
| ? | NC_000913 | = 883554 | 1 (0.020) | intergenic (‑166/‑119) | ybjG/mdfA | undecaprenyl pyrophosphate phosphatase/multidrug efflux pump MdfA/Na(+):H(+) antiporter/K(+):H(+) antiporter | |||||
| * | ? | NC_000913 | 883553 = | 1 (0.020) | 343 (6.750) | 54/128 | 0.0 | 99.7% | intergenic (‑165/‑120) | ybjG/mdfA | undecaprenyl pyrophosphate phosphatase/multidrug efflux pump MdfA/Na(+):H(+) antiporter/K(+):H(+) antiporter |
| ? | NC_000913 | = 1470516 | NA (NA) | noncoding (1221/1221 nt) | IS30 | repeat region | |||||
Only 100 of 260 total aligned reads displayed.
CAAAAAACCTCCGCAACCCCATGTTTTCACATAACTGTTGCGTTGACCAATTGAATCTACA‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < NC_000913/270601‑270541‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ACGCTTTCTTTAAGTTTTATTTAACCTATGCCCGTTACAATCACCCACCGTAAACAGGCCGCT < NC_000913/883554‑883492 AAAACCTCCGCAACCCCATGTTTTCACATAACTGTTGCGTTGACCAATTGAATCTACAACGCTTT < 1:444654/65‑1 AAAACCTCCGCAACCCCATGTTTTCACATAACTGTTGCGTTGACCAATTGAATCTACAACGCTTT > 1:2282910/1‑65 AAAACCTCCGCAACCCCATGTTTTCACATAACTGTTGCGTTGACCAATTGAATCTACAACGCTTT < 1:2024437/65‑1 AAAACCTCCGCAACCCCATGTTTTCACATAACTGTTGCGTTGACCAATTGAATCTACAACGCTTT > 1:149073/1‑65 AACCTCCGCAACCCCATGTTTTCACATAACTGTTGCGTTGACCAATTGAATCTACAACGCTTTCT < 1:2066799/65‑1 AACCTCCGCAACCCCATGTTTTCACATAACTGTTGCGTTGACCAATTGAATCTACAACGCTTTCT < 1:3598876/65‑1 CCGCAACCCCATGTTTTCACATAACTGTTGCGTTGACCAATTGAATCTACAACGCTTTCTTTAAG < 1:3541324/65‑1 CGCAACCCCATGTTTTCACATAACTGTTGCGTTGACCAATTGAATCTACAACGCTTTCTTTAAGT < 1:2797492/65‑1 CGCAACCCCATGTTTTCACATAACTGTTGCGTTGACCAATTGAATCTACAACGCTTTCTTTAAGT < 1:2020893/65‑1 CGCAACCCCATGTTTTCACATAACTGTTGCGTTGACCAATTGAATCTACAACGCTTTCTTTAAGT < 1:3364655/65‑1 GCAACCCCATGTTTTCACATAACTGTTGCGTTGACCAATTGAATCTACAACGCTTTCTTTAAGTT > 1:318042/1‑65 ACCCCATGTTTTCACATAACTGTTGCGTTGACCAATTGAATCTACAACGCTTTCTTTAAGTTTTA < 1:782489/65‑1 ACCCCATGTTTTCACATAACTGTTGCGTTGACCAATTGAATCTACAACGCTTTCTTTAAGTTTTA < 1:2801589/65‑1 ACCCCATGTTTTCACATAACTGTTGCGTTGACCAATTGAATCTACAACGCTTTCTTTAAGTTTTA < 1:3068666/65‑1 ACCCCATGTTTTCACATAACTGTTGCGTTGACCAATTGAATCTACAACGCTTTCTTTAAGTTTTA < 1:3444524/65‑1 ACCCCATGTTTTCACATAACTGTTGCGTTGACCAATTGAATCTACAACGCTTTCTTTAAGTTTTA < 1:551812/65‑1 ACCACATGTTTTCACATAACTGTTGCGTTGACCAATTGAATCTACAACGCTTTCTTTAAGTTTTA < 1:592763/65‑1 CCCCATGTTTTCACATAACTGTTGCGTTGACCAATTGAATCTACAACGCTTTCTTTAAGTTTTAT < 1:505908/65‑1 CCCCATGTTTTCACATAACTGTTGCGTTGACCAATTGAATCTACAACGCTTTCTTTAAGTTTTAT < 1:1001963/65‑1 CCCATGTTTTCACATAACTGTTGCGTTGACCAATTGAATCTACAACGCTTTCTTTAAGTTTTATT > 1:1241768/1‑65 CCCATGTTTTCACATAACTGTTGCGTTGACCAATTGAATCTACAACGCTTTCTTTAAGTTTTATT > 1:3972815/1‑65 CCCATGTTTTCACATAACTGTTGCGTTGACCAATTGAATCTACAACGCTTTCTTTAAGTTTTATT > 1:2967379/1‑65 CCCATGTTTTCACATAACTGTTGCGTTGACCAATTGAATCTACAACGCTTTCTTTAAGTTTTATT > 1:2044571/1‑65 CCCATGTTTTCACATAACTGTTGCGTTGACCAATTGAATCTACAACGCTTTCTTTAAGTTTTATT > 1:3746449/1‑65 CCCATGTTTTCACATAACTGTTGCGTTGACCAATTGAATCTACAACGCTTTCTTTAAGTTTTATT > 1:1721082/1‑65 TGTTTTCACATAACTGTTGCGTTGACCAATTGAATCTACAACGCTTTCTTTAAGTTTTATTTAAC < 1:2988756/65‑1 TGTTTTCACATAACTGTTGCGTTGACCAATTGAATCTACAACGCTTTCTTTAAGTTTTATTTAAC < 1:2915528/65‑1 TGTTTTCACATAACTGTTGCGTTGACCAATTGAATCTACAACGCTTTCTTTAAGTTTTATTTAAC < 1:365676/65‑1 TGTTTTCACATAACTGTTGCGTTGACCAATTGAATCTACAACGCTTTCTTTAAGTTTTATTTAAC < 1:311746/65‑1 TGTTTTCACATAACTGTTGCGTTGACCAATTGAATCTACAACGCTTTCTTTAAGTTTTATTTAAC < 1:2722671/65‑1 TGTTTTCACATAACTGTTGCGTTGACCAATTGAATCTACAACGCTTTCTTTAAGTTTTATTTAAC < 1:2604549/65‑1 TGTTTTCACATAACTGTTGCGTTGACCAATTGAATCTACAACGCTTTCTTTAAGTTTTATTTAAC < 1:1027252/65‑1 TGTTTTCACATAACTGTTGCGTTGACCAATTGAATCTACAACGCTTTCTTTAAGTTTTATTTAAC < 1:816839/65‑1 TGTTTTCACATAACTGTTGCGTTGACCAATTGAATCTACAACGCTTTCTTTAAGTTTTATTTAAC < 1:2105798/65‑1 TGTTTTCACATAACTGTTGCGTTGACCAATTGAATCTACAACGCTTTCTTTAAGTTTTATTTAAC < 1:2145329/65‑1 TGTTTTCACATAACTGTTGCGTTGACCAATTGAATCTACAACGCTTTCTTTAAGTTTTATTTAAC < 1:231389/65‑1 TGTTTTCACATAACTGTTGCGTTGACCAATTGAATCTACAACGCTTTCTTTAAGTTTTATTTAAC > 1:1649139/1‑65 TGTTTTCACATAACTGTTGCGTTGACCAATTGAATCTACAACGCTTTCTTTAAGTTTTATTTAAC < 1:899952/65‑1 TGTTTTCACATAACTGTTGCGTTGACCAATTGAATCTACAACGCTTTCTTTAAGTTTTATTTAAC < 1:1144518/65‑1 GTTTTCACATAACTGTTGCGTTGACCAATTGAATCTACAACGCTTTCTTTAAGTTTTATTTAACC < 1:2360091/65‑1 GTTTTCACATAACTGTTGCGTTGACCAATTGAATCTACAACGCTTTCTTTAAGTTTTATTTAACC > 1:3791441/1‑65 TTCACATAACTGTTGCGTTGACCAATTGAATCTACAACGCTTTCTTTAAGTTTTATTTAACCTAT < 1:3253919/65‑1 TTCACATAACTGTTGCGTTGACCAATTGAATCTACAACGCTTTCTTTAAGTTTTATTTAACCTAT < 1:2482407/65‑1 CACATAACTGTTGCGTTGACCAATTGAATCTACAACGCTTTCTTTAAGTTTTATTTAACCTATGC < 1:2836560/65‑1 CATAACTGTTGCGTTGACCAATTGAATCTACAACGCTTTCTTTAAGTTTTATTTAACCTATGCCC < 1:924545/65‑1 ATAACTGTTGCGTTGACCAATTGAATCTACAACGCTTTCTTTAAGTTTTATTTAACCTATGCCCG < 1:3642756/65‑1 ATAACTGTTGCGTTGACCAATTGAATCTACAACGCTTTCTTTAAGTTTTATTTAACCTATGCCCG < 1:648339/65‑1 ATAACTGTTGCGTTGACCAATTGAATCTACAACGCTTTCTTTAAGTTTTATTTAACCTATGCCCG < 1:3351644/65‑1 ATAACTGTTGCGTTGACCAATTGAATCTACAACGCTTTCTTTAAGTTTTATTTAACCTATGCCCG < 1:3853870/65‑1 ATAACTGTTGCGTTGACCAATTGAATCTACAACGCTTTCTTTAAGTTTTATTTAACCTATGCCCG < 1:2462678/65‑1 ACTGTTGCGTTGACCAATTGAATCTACAACGCTTTCTTTAAGGTTTATTTAACTTATGCCCGTTA > 1:2615277/1‑65 CTGTTGCGTTGACCAATTGAATCTACAACGCTTTCTTTAAGTTTTATTTAACCTATGCCCGTTAC > 1:3285005/1‑65 CTGTTGCGTTGACCAATTGAATCTACAACGCTTTCTTTAAGTTTTATTTAACCTATGCCCGTTAC > 1:855752/1‑65 TGTTGCGTTGACCAATTGAATCTACAACGCTTTCTTTAAGTTTTATTTAACCTATGCCCGTTACA < 1:3722734/65‑1 TGTTGCGTTGACCAATTGAATCTACAACGCTTTCTTTAAGTTTTATTTAACCTATGCCCGTTACA < 1:3742744/65‑1 TGTTGCGTTGACCAATTGAATCTACAACGCTTTCTTTAAGTTTTATTTAACCTATGCCCGTTACA < 1:239702/65‑1 TGTTGCGTTGACCAATTGAATCTACAACGCTTTCTTTAAGTTTTATTTAACCTATGCCCGTTACA < 1:842379/65‑1 TGTTGCGTTGACCAATTGAATCTACAACGCTTTCTTTAAGTTTTATTTAACCTATGCCCGTTACA < 1:532206/65‑1 TGTTGCGTTGACCAATTGAATCTACAACGCTTTCTTTAAGTTTTATTTAACCTATGCCCGTTACA < 1:3943298/65‑1 TGTTGCGTTGACCAATTGAATCTACAACGCTTTCTTTAAGTTTTATTTAACCTATGCCCGTTACA < 1:2161886/65‑1 TGTTGCGTTGACCAATTGAATCTACAACGCTTTCTTTAAGTTTTATTTAACCTATGCCCGTTACA < 1:4030065/65‑1 GTTGCGTTGACCAATTGAATCTACAACGCTTTCTTTAAGTTTTATTTAACCTATGCCCGTTACAA > 1:2307517/1‑65 GTTGCGTTGACCAATTGAATCTACAACGCTTTCTTTAAGTTTTATTTAACCTATGCCCGTTACAA > 1:1091270/1‑65 TTGCGTTGACCAATTGAATCTACAACGCTTTCTTTAAGTTTTATTTAACCTATGCCCGTTACAAT < 1:476925/65‑1 TTGCGTTGACCAATTCAATCTACAACGCTTTCTTTAAGTTTTATTTAACCTATGCCCGTTACAAT < 1:1619869/65‑1 TGCGTTGACCAATTGAATCTACAACGCTTTCTTTAAGTTTTATTTAACCTATGCCCGTTACAATC > 1:3837051/1‑65 GCGTTGACCAATTGAATCTACAACGCTTTCTTTAAGTTTTATTTAACCTATGCCCGTTACAATCA < 1:1092821/65‑1 GCGTTGACCAATTGAATCTACAACGCTTTCTTTAAGTTTTATTTAACCTATGCCCGTTACAATCA < 1:3305149/65‑1 CGTTGACCAATTGAATCTACAACGCTTTCTTTAAGTTTTATTTAACCTATGCCCGTTACAATCAC < 1:3787359/65‑1 CGTTGACCAATTGAATCTACAACGCTTTCTTTAAGTTTTATTTAACCTATGCCCGTTACAATCAC < 1:1785065/65‑1 CGTTGACCAATTGAATCTACAACGCTTTCTTTAAGTTTTATTTAACCTATGCCCGTTACAATCAC > 1:310384/1‑65 GTTGACCAATTGAATCTACAACGCTTTCTTTAAGTTTTATTTAACCTATGCCCGTTACAATCACC > 1:135186/1‑65 GTTGACCAATTGAATCTACAACGCTTTCTTTAAGTTTTATTTAACCTATGCCCGTTACAATCACC > 1:1264916/1‑65 GTTGACCAATTGAATCTACAACGCTTTCTTTAAGTTTTATTTAACCTATGCCCGTTACAATCACC > 1:575369/1‑65 GTTGACCAATTGAATCTACAACGCTTTCTTTAAGTTTTATTTAACCTATGCCCGTTACAATCACC > 1:1630515/1‑65 GTTGACCAATTGAATCTACAACGCTTTCTTTAAGTTTTATTTAACCTATGCCCGTTACAATCACC > 1:3869573/1‑65 GTTGACCAATTGAATCTACAACGCTTTCTTTAAGTTTTATTTAACCTATGCCCGTTACAATCACC > 1:630723/1‑65 GTTGACCAATTGAATCTACAACGCTTTCTTTAAGTTTTATTTAACCTATGCCCGTTACAATCACC > 1:2884318/1‑65 GTTGACCAATTGAATCTACAACGCTTTCTTTAAGTTTTATTTAACCTATGCCCGTTACAATCACC > 1:255653/1‑65 GTTGACCAATTGAATCTACAACGCTTTCTTTAAGTTTTATTTAACCTATGCCCGTTACAATCACC > 1:751215/1‑65 GTTGACCAATTGAATCTACAACGCTTTCTCTAAGTTTTATTTAACCTATGCCCGTTACAATCACC > 1:2779104/1‑65 GACCAATTGAATCTACAACGCTTTCTTTAAGTTTTATTTAACCTATGCCCGTTACAATCACCCAC < 1:715749/65‑1 GACCAATTGAATCTACAACGCTTTCTTTAAGTTTTATTTAACCTATGCCCGTTACAATCACCCAC < 1:967189/65‑1 GACCAATTGAATCTACAACGCTTTCTTTAAGTTTTATTTAACCTATGCCCGTTACAATCACCCAC < 1:3998548/65‑1 GACCAATTGAATCTACAACGCTTTCTTTAAGTTTTATTTAACCTATGCCCGTTACAATCACCCAC < 1:1888908/65‑1 GACCAATTGAATCTACAACGCTTTCTTTAAGTTTTATTTAACCTATGCCCGTTACAATCACCCAC < 1:2760118/65‑1 GACCAATTGAATCTACAACGCTTTCTTTAAGTTTTATTTAACCTATGCCCGTTACAATCACCCAC < 1:3035659/65‑1 GACCAATTGAATCTACAACGCTTTCTTTAAGTTTTATTTAACCTATGCCCGTTACAATCACCCAC < 1:3904537/65‑1 GACCAATTGAATCTACAACGCTTTCTTTAAGTTTTATTTAACCTATGCCCGTTACAATCACCCAC < 1:434654/65‑1 ACCAATTGAATCTACAACGCTTTCTTTAAGTTTTATTTAACCTATGCCCGTTACAATCACCCACC < 1:1581939/65‑1 ACCAATTGAATCTACAACGCTTTCTTTAAGTTTTATTTAACCTATGCCCGTTACAATCACCCACC < 1:1418708/65‑1 ACCAATTGAATCTACAACGCTTTCTTTAAGTTTTATTTAACCTATGCCCGTTACAATCACCCACC > 1:1334627/1‑65 CCAATTGAATCTACAACGCTTTCTTTAAGTTTTATTTAACCTATGCCCGTTACAATCACCCACCG > 1:2508640/1‑65 CCAATTGAATCTACAACGCTTTCTTTAAGTTTTATTTAACCTATGCCCGTTACAATCACCCACCG > 1:1976496/1‑65 TGAATCTACAACGCTTTCTTTAAGTTTTATTTAACCTATGCCCGTTACAATCACCCACCGTAAAC > 1:2423245/1‑65 TGAATCTACAACGCTTTCTTTAAGTTTTATTTAACCTATGCCCGTTACAATCACCCACCGTAAAC > 1:1678449/1‑65 TGAATCTACAACGCTTTCTTTAAGCTTTATTTAACCTATGCCCGTTACAATCACCCACCGTAAAC > 1:3549796/1‑65 AATCTACAACGCTTTCTTTAAGTTTTATTTAACCTATGCCCGTTACAATCACCCACCGTAAACAG > 1:381828/1‑65 CTACAACGCTTTCTTTAAGTTTTATTTAACCTATGCCCGTTACAATCACCCACCGTAAACAGGCC > 1:3414486/1‑65 CTACAACGCTTTCTTTAAGTTTTATTTAACCTATGCCCGTTACAATCACCCACCGTAAACAGGCC > 1:3059195/1‑65 CAAAAAACCTCCGCAACCCCATGTTTTCACATAACTGTTGCGTTGACCAATTGAATCTACA‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < NC_000913/270601‑270541‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ACGCTTTCTTTAAGTTTTATTTAACCTATGCCCGTTACAATCACCCACCGTAAACAGGCCGCT < NC_000913/883554‑883492 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 31 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |