| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| JC JC | NC_000913 | 883,553 | IS30 (+) +2 bp | intergenic (‑165/‑119) | ybjG ← / → mdfA | undecaprenyl pyrophosphate phosphatase/multidrug efflux pump MdfA/Na(+):H(+) antiporter/K(+):H(+) antiporter |
| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | 270541 = | NA (NA) | 260 (5.120) | 54/128 | 0.0 | 99.6% | noncoding (1/1221 nt) | IS30 | repeat region |
| ? | NC_000913 | = 883554 | 1 (0.020) | intergenic (‑166/‑119) | ybjG/mdfA | undecaprenyl pyrophosphate phosphatase/multidrug efflux pump MdfA/Na(+):H(+) antiporter/K(+):H(+) antiporter | |||||
| * | ? | NC_000913 | 883553 = | 1 (0.020) | 343 (6.750) | 54/128 | 0.0 | 99.7% | intergenic (‑165/‑120) | ybjG/mdfA | undecaprenyl pyrophosphate phosphatase/multidrug efflux pump MdfA/Na(+):H(+) antiporter/K(+):H(+) antiporter |
| ? | NC_000913 | = 1470516 | NA (NA) | noncoding (1221/1221 nt) | IS30 | repeat region | |||||
Only 100 of 111 total aligned reads displayed.
TGAAGTTCAAAACACCGAAAGAGATAATTGAAAGGGGTGTTGCATTGACAGATTGAATCTACACTGTTGAAATTCAGAATTTAGGTTTTGCTTTTGTTACTGGTGAAAATACAACAGGTATAAATAG > NC_000913/1470454‑1470580 | tGAAGTTCAAAACACCGAAAGAGATAATTGAAAGGGGTGTTGCATTGACAGATTGAATCTACACt < 1:2806651/65‑1 (MQ=33)tGAAGTTCAAAACACCGAAAGAGATAATTGAAAGGGGTGTTGCATTGACAGATTGAATCTACACt < 1:1899775/65‑1 (MQ=33) gAAGTTCAAAACACCGAAAGAGATAATTGAAAGGGGTGTTGCATTGACAGATTGAATCTACACTg > 1:1660626/1‑65 (MQ=35) gAAGTTCAAAACACCGAAAGAGATAATTGAAAGGGGTGTTGCATTGACAGATTGAATCTACACTg > 1:649439/1‑65 (MQ=35) gattCAAAACACCGAAAGAGATAATTGAAAGGGGTGTTGCATTGACAGATTGAATCTACACTGtt < 1:73621/63‑1 (MQ=255) aGTTCAAAACACCGAAAGAGATAATTGAAAGGGGTGTTGCATTGACAGATTGAATCTACACTGtt < 1:3683272/65‑1 (MQ=39) aGTTCAAAACACCGAAAGAGATAATTGAAAGGGGTGTTGCATTGACAGATTGAATCTACACTGtt < 1:477426/65‑1 (MQ=39) aGTTCAAAACACCGAAAGAGATAATTGAAAGGGGTGTTGCATTGACAGATTGAATCTACACTGtt > 1:1427260/1‑65 (MQ=39) tCAAAACACCGAAAGAGATAATTGAAAGGGGTGTTGCATTGACAGATTGAATCTACACTGTTGaa > 1:1585493/1‑65 (MQ=255) tCAAAACACCGAAAGAGATAATTGAAAGGGGTGTTGCATTGACAGATTGAATCTACACTGTTGaa > 1:3159057/1‑65 (MQ=255) aaaaCACCGAAAGAGATAATTGAAAGGGGTGTTGCATTGACAGATTGAATCTACACTGTTGAAAt < 1:3103368/65‑1 (MQ=255) acacCGAAAGAGATAATTGAAAGGGGTGTTGCATTGACAGATTGAATCTACACTGTTGAAATTCa < 1:2691585/65‑1 (MQ=255) acCGAAAGAGATAATTGAAAGGGGTGTTGCATTGACAGATTGAATCTACACTGTTGAAATTCAGa < 1:2480138/65‑1 (MQ=255) agaTAATTGAAAGGGGTGTTGCATTGACAGATTGAATCTACACTGTTGAAATTCAGAATTTAGGt > 1:1847169/1‑65 (MQ=255) tGAAAGGGGTGTTGCATTGACAGATTGAATCTACACTGTTGAAATTCAGAATTTAGGTTTTGCtt > 1:3221017/1‑65 (MQ=255) tGAAAGGGGTGTTGCATTGACAGATTGAATCTACACTGTTGAAATTCAGAATTTAGGTTTTGCtt > 1:1716874/1‑65 (MQ=255) tGAAAGGGGTGTTGCATTGACAGATTGAATCTACACTGTTGAAATTCAGAATTTAGGTTTTGCtt > 1:2115722/1‑65 (MQ=255) tGAAAGGGGTGTTGCATTGACAGATTGAATCTACACTGTTGAAATTCAGAATTTAGGTTTTGCtt > 1:3656568/1‑65 (MQ=255) tGAAAGGGGTGTTGCATTGACAGATTGAATCTACACTGTTGAAATTCAGAATTTAGGTTTTGCtt > 1:797205/1‑65 (MQ=255) tGAAAGGGGCGTTGCATTGACAGATTGAATCTACACTGTTGAAATTCAGAATTTAGGTTTTGCtt > 1:1408805/1‑65 (MQ=255) aaGGGGTGTTGCATTGACAGATTGAATCTACACTGTTGAAATTCAGAATTTAGGTTTTGCTTTTg > 1:1367144/1‑65 (MQ=255) aaGGGGTGTTGCATTGACAGATTGAATCTACACTGTTGAAATTCAGAATTTAGGTTTTGCTTTTg < 1:1206217/65‑1 (MQ=255) ggggTGTTGCATTGACAGATTGAATCTACACTGTTGAAATTCAGAATTTAGGTTTTGCTTTTGtt > 1:3616903/1‑65 (MQ=255) ggggTGTTGCATTGACAGATTGAATCTACACTGTTGAAATTCAGAATTTAGGTTTTGCTTTTGtt > 1:371638/1‑65 (MQ=255) ggggTGTTGCATTGACAGATTGAATCTACACTGTTGAAATTCAGAATTTAGGTTTTGCTTTTGtt > 1:3727037/1‑65 (MQ=255) ggggTGTTGCATTGACAGATTGAATCTACACTGTTGAAATTCAGAATTTAGGTTTTGCTTTTGtt > 1:4034085/1‑65 (MQ=255) ggggTGTTGCATTGACAGATTGAATCTACACTGTTGAAATTCAGAATTTAGGTTTTGCTTTTGtt > 1:481293/1‑65 (MQ=255) ggggTGTTGCATTGACAGATTGAATCTACACTGTTGAAATTCAGAATTTAGGTTTTGCTTTTGtt > 1:760159/1‑65 (MQ=255) ggggTGTTGCATTGACAGATTGAATCTACACTGTTGAAATTCAGAATTTAGGTTTTGCTTTTGtt > 1:1243159/1‑65 (MQ=255) ggggTGTTGCATTGACAGATTGAATCTACACTGTTGAAATTCAGAATTTAGGTTTTGCTTTTGtt > 1:2065025/1‑65 (MQ=255) gtTGCATTGACAGATTGAATCTACACTGTTGAAATTCAGAATTTAGGTTTTGCTTTTGTTACTgg < 1:914507/65‑1 (MQ=255) tGCATTGACAGATTGAATCTACACTGTTGAAATTCAGAATTTAGGTTTTGCTTTTGTTACTGGTg > 1:2880491/1‑65 (MQ=255) tGCATTGACAGATTGAATCTACACTGTTGAAATTCAGAATTTAGGTTTTGCTTTTGTTACTGGTg > 1:3851197/1‑65 (MQ=255) tGCATTGACAGATTGAATCTACACTGTTGAAATTCAGAATTTAGGTTTTGCTTTTGTTACTGGTg > 1:1561166/1‑65 (MQ=255) gCATTGACAGATTGAATCTACACTGTTGAAATTCAGAATTTAGGTTTTGCTTTTGTTACTGGTGa > 1:2851592/1‑65 (MQ=255) aTTGACAGATTGAATCTACACTGTTGAAATTCAGAATTTAGGTTTTGCTTTTGTTACTGGTGaaa < 1:3628808/65‑1 (MQ=255) aTTGACAGATTGAATCTACACTGTTGAAATTCAGAATTTAGGTTTTGCTTTTGTTACTGGTGaaa > 1:3002375/1‑65 (MQ=255) aTTGACAGATTGAATCTACACTGTTGAAATTCAGAATTTAGGTTTTGCTTTTGTTACTGGTGaaa < 1:3111277/65‑1 (MQ=255) aTTGACAGATTGAATCTACACTGTTGAAATTCAGAATTTAGGTTTTGCTTTTGTTACTGGTGaaa < 1:3119368/65‑1 (MQ=255) aTTGACAGATTGAATCTACACTGTTGAAATTCAGAATTTAGGTTTTGCTTTTGTTACTGGTGaaa < 1:3193943/65‑1 (MQ=255) aTTGACAGATTGAATCTACACTGTTGAAATTCAGAATTTAGGTTTTGCTTTTGTTACTGGTGaaa < 1:3302290/65‑1 (MQ=255) aTTGACAGATTGAATCTACACTGTTGAAATTCAGAATTTAGGTTTTGCTTTTGTTACTGGTGaaa < 1:3411213/65‑1 (MQ=255) aTTGACAGATTGAATCTACACTGTTGAAATTCAGAATTTAGGTTTTGCTTTTGTTACTGGTGaaa > 1:3441902/1‑65 (MQ=255) aTTGACAGATTGAATCTACACTGTTGAAATTCAGAATTTAGGTTTTGCTTTTGTTACTGGTGaaa < 1:3603487/65‑1 (MQ=255) aTTGACAGATTGAATCTACACTGTTGAAATTCAGAATTTAGGTTTTGCTTTTGTTACTGGTGaaa > 1:2269943/1‑65 (MQ=255) aTTGACAGATTGAATCTACACTGTTGAAATTCAGAATTTAGGTTTTGCTTTTGTTACTGGTGaaa < 1:1341890/65‑1 (MQ=255) aTTGACAGATTGAATCTACACTGTTGAAATTCAGAATTTAGGTTTTGCTTTTGTTACTGGTGaaa < 1:800434/65‑1 (MQ=255) aTTGACAGATTGAATCTACACTGTTGAAATTCAGAATTTAGGTTTTGCTTTTGTTACTGGTGaaa > 1:896908/1‑65 (MQ=255) aTTGACAGATTGAATCTACACTGTTGAAATTCAGAATTTAGGTTTTGCTTTTGTTACTGGTGaaa < 1:2078927/65‑1 (MQ=255) tGACAGATTGAATCTACACTGTTGAAATTCAGAATTTAGGTTTTGCTTTTGTTACTGGTGAAAAt > 1:1481992/1‑65 (MQ=255) gACAGATTGAATCTACACTGTTGAAATTCAGAATTTAGGTTTTGCTTTTGTTACTGGTGAAAATa < 1:1517534/65‑1 (MQ=255) gACAGATTGAATCTACACTGTTGAAATTCAGAATTTAGGTTTTGCTTTTGTTACTGGTGAAAATa < 1:2200169/65‑1 (MQ=255) aCAGATTGAATCTACACTGTTGAAATTCAGAATTTAGGTTTTGCTTTTGTTACTGGTGAAAATac > 1:1135600/1‑65 (MQ=255) aCAGATTGAATCTACACTGTTGAAATTCAGAATTTAGGTTTTGCTTTTGTTACTGGTGAAAATac > 1:3435762/1‑65 (MQ=255) cAGATTGAATCTACACTGTTGAAATTCAGAATTTAGGTTTTGCTTTTGTTACTGGTGAAAATaca > 1:2932270/1‑65 (MQ=255) cAGATTGAATCTACACTGTTGAAATTCAGAATTTAGGTTTTGCTTTTGTTACTGGTGAAAATaca > 1:2522898/1‑65 (MQ=255) cAGATTGAATCTACACTGTTGAAATTCAGAATTTAGGTTTTGCTTTTGTTACTGGTGAAAATaca > 1:2181547/1‑65 (MQ=255) cAGATTGAATCTACACTGTGGAAATTCAGAATTTAGGTTTTGCTTTTGTTACTGGTGAAAATaca > 1:180668/1‑65 (MQ=255) tGAATCTACACTGTTGAAATTCAGAATTTAGGTTTTGCTTTTGTTACTGGTGAAAATACAACAgg < 1:2426668/65‑1 (MQ=255) tGAATCTACACTGTTGAAATTCAGAATTTAGGTTTTGCTTTTGTTACTGGTGAAAATACAACAgg < 1:158448/65‑1 (MQ=255) tGAATCTACACTGTTGAAATTCAGAATTTAGGTTTTGCTTTTGTTACTGGTGAAAATACAACAgg < 1:1506774/65‑1 (MQ=255) tGAATCTACACTGTTGAAATTCAGAATTTAGGTTTTGCTTTTGTTACTGGTGAAAATACAACAgg < 1:3924147/65‑1 (MQ=255) tGAATCTACACTGTTGAAATTCAGAATTTAGGTTTTGCTTTTGTTACTGGTGAAAATACAACAgg < 1:3530129/65‑1 (MQ=255) tGAATCTACACTGTTGAAATTCAGAATTTAGGTTTTGCTTTTGTTACTGGTGAAAATACAACAgg < 1:1491862/65‑1 (MQ=255) tGAATCTACACTGTTGAAATTCAGAATTTAGGTTTTGCTTTTGTTACTGGTGAAAATACAACAgg < 1:2573135/65‑1 (MQ=255) tGAATCTACACTGTTGAAATTCAGAATTTAGGTTTTGCTTTTGTTACTGGTGAAAATACAACAgg < 1:1350187/65‑1 (MQ=255) tGAATCTACACTGTTGAAATTCAGAATTTAGGTTTTGCTTTTGTTACTGGTGAAAATACAACAgg < 1:1242678/65‑1 (MQ=255) tGAATCTACACTGTTGAAATTCAGAATTTAGGTTTTGCTTTTGTTACTGGTGAAAATACAACAgg < 1:2781366/65‑1 (MQ=255) tGAATCTACACTGTTGAAATTCAGAATTTAGGTTTTGCTTTTGTTACTGGTGAAAATACAACAgg < 1:1846846/65‑1 (MQ=255) tGAATCTACACTGTTGAAATTCAGAATTTAGGTTTTGCTTTTGTTACTGGTGAAAATACAACAgg < 1:843276/65‑1 (MQ=255) tGAATCTACACTGTTGAAATTCAGAATTTAGGTTTTGCTTTTGTTACTGGTGAAAATACAACAgg < 1:2841726/65‑1 (MQ=255) tGAATCTACACTGTTGAAATTCAGAATTTAGGTTTTGCTTTTGTTACTGGTGAAAATACAACAgg < 1:87117/65‑1 (MQ=255) tGAATCTACACTGTTGAAATTCAGAATTTAGGTTTTGCTTTTGTTACTGGTGAAAATACAACAgg < 1:29715/65‑1 (MQ=255) tGAATCTACACTGTTGAAATTCAGAATTTAGGTTTTGCTTTTGTTACTGGTGAAAATACAACAgg < 1:1905615/65‑1 (MQ=255) tGAATCTACACTGTTGAAATTCAGAATTTAGGTTTTGCTTTTGTAACTGGTGAAAATACAACAgg < 1:471663/65‑1 (MQ=255) aaTCTACACTGTTGAAATTCAGAATTTAGGTTTTGCTTTTGTTACTGGTGAAAATACAACAGGta < 1:3507285/65‑1 (MQ=255) tCTACACTGTTGAAATTCAGAATTTAGGTTTTGCTTTTGTTACTGGTGAAAATACAACAGGtata > 1:2241197/1‑65 (MQ=255) tCTACACTGTTGAAATTCAGAATTTAGGTTTTGCTTTTGTTACTGGTGAAAATACAACAGGtata > 1:2085602/1‑65 (MQ=255) tCTACACTGTTGAAATTCAGAATTTAGGTTTTGCTTTTGTTACTGGTGAAAATACAACAGGtata > 1:1590762/1‑65 (MQ=255) tCTACACTGTTGAAATTCAGAATTTAGGTTTTGCTTTTGTTACTGGTGAAAATACAACAGGtata > 1:3514923/1‑65 (MQ=255) tCTACACTGTTGAAATTCAGAATTTAGGTTTTGCTTTTGTTACTGGTGAAAATACAACAGGtata > 1:3480363/1‑65 (MQ=255) tCTACACTGTTGAAATTCAGAATTTAGGTTTTGCTTTTGTTACTGGTGAAAATACAACAGGtata > 1:1916453/1‑65 (MQ=255) tCTACACTGTTGAAATTCAGAATTTAGGTTTTGCTTTTGTTACTGGTGAAAATACAACAGGtata > 1:330972/1‑65 (MQ=255) cTACACTGTTGAAATTCAGAATTTAGGTTTTGCTTTTGTTACTGGTGAAAATACAACAGGTATaa < 1:380358/65‑1 (MQ=255) cacTGTTGAAATTCAGAATTTAGGTTTTGCTTTTGTTACTGGTGAAAATACAACAGGTATAAATa > 1:2507990/1‑65 (MQ=255) cacTGTTGAAATTCAGAATTTAGGTTTTGCTTTTGTTACTGGTGAAAATACAACAGGTATAAATa > 1:2296465/1‑65 (MQ=255) acTGTTGAAATTCAGAATTTAGGTTTTGCTTTTGTTACTGGTGAAAATACAACAGGTATAAATAg > 1:311019/1‑65 (MQ=255) acTGTTGAAATTCAGAATTTAGGTTTTGCTTTTGTTACTGGTGAAAATACAACAGGTATAAATAg > 1:205713/1‑65 (MQ=255) acTGTTGAAATTCAGAATTTAGGTTTTGCTTTTGTTACTGGTGAAAATACAACAGGTATAAATAg > 1:899268/1‑65 (MQ=255) acTGTTGAAATTCAGAATTTAGGTTTTGCTTTTGTTACTGGTGAAAATACAACAGGTATAAATAg > 1:2136413/1‑65 (MQ=255) acTGTTGAAATTCAGAATTTAGGTTTTGCTTTTGTTACTGGTGAAAATACAACAGGTATAAATAg > 1:2912442/1‑65 (MQ=255) acTGTTGAAATTCAGAATTTAGGTTTTGCTTTTGTTACTGGTGAAAATACAACAGGTATAAATAg > 1:3120958/1‑65 (MQ=255) acTGTTGAAATTCAGAATTTAGGTTTTGCTTTTGTTACTGGTGAAAATACAACAGGTATAAATAg > 1:2711969/1‑65 (MQ=255) acTGTTGAAATTCAGAATTTAGGTTTTGCTTTTGTTACTGGTGAAAATACAACAGGTATAAATAg > 1:1434564/1‑65 (MQ=255) acTGTTGAAATTCAGAATTTAGGTTTTGCTTTTGTTACTGGTGAAAATACAACAGGTATAAATAg > 1:525712/1‑65 (MQ=255) acTGTTGAAATTCAGAATTTAGGTTTTGCTTTTGTTACTGGTGAAAATACAACAGGTATAAATAg > 1:490456/1‑65 (MQ=255) acTGTTGAAATTCAGAATTTAGGTTTTGCTTTTGTTACTGGTGAAAATACAACAGGTATAAATAg > 1:1970141/1‑65 (MQ=255) acTGTTGAAATTCAGAATTTAGGTTTTGCTTTTGTTACTGGTGAAAATACAACAGGTATAAATAg > 1:480584/1‑65 (MQ=255) acTGTTGAAATTCAGAATTTAGGTTTTGCTTTTGTTACTGGTGAAAATACAACAGGTATAAATAg > 1:1503709/1‑65 (MQ=255) acTGTTGAAATTCAGAATTTAGGTTTTGCTTTTGTTACTGGTGAAAATACAACAGGAATAAATAg > 1:2190264/1‑65 (MQ=255) | TGAAGTTCAAAACACCGAAAGAGATAATTGAAAGGGGTGTTGCATTGACAGATTGAATCTACACTGTTGAAATTCAGAATTTAGGTTTTGCTTTTGTTACTGGTGAAAATACAACAGGTATAAATAG > NC_000913/1470454‑1470580 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 19 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |