| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| JC JC | NC_000913 | 486,025 | IS1 (+) +9 bp | coding (265‑273/648 nt) | acrR → | DNA‑binding transcriptional repressor AcrR |
| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | 486025 = | 0 (0.000) | 96 (1.890) | 43/128 | 0.0 | 100% | coding (265/648 nt) | acrR | DNA‑binding transcriptional repressor AcrR |
| ? | NC_000913 | = 4519239 | NA (NA) | noncoding (768/768 nt) | IS1 | repeat region | |||||
| * | ? | NC_000913 | = 486033 | 0 (0.000) | 59 (1.160) | 28/128 | 0.2 | 100% | coding (273/648 nt) | acrR | DNA‑binding transcriptional repressor AcrR |
| ? | NC_000913 | 4518472 = | NA (NA) | noncoding (1/768 nt) | IS1 | repeat region | |||||
TCAATAATCGACGCCGTTCTTCTGTCACCGTGGATTCAAGAACATGAATTAATATCTCTCTTAA‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < NC_000913/486088‑486025‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑GGTAATGACTCCAACTTACTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACCTTGTCAT < NC_000913/4519239‑4519178 TCAATAATCGACGCCGTTCTTCTGTCACCGTGGATTCAAGAACATGAATTAATATCTCTCTTAAG > 1:985806/1‑65TCAATAATCGACGCCGTTCTTCTGTCACCGTGGATTCAAGAACATGAATTAATATCTCTCTTAAG > 1:3742735/1‑65TCAATAATCGACGCCGTTCTTCTGTCACCGTGGATTCAAGAACATGAATTAATATCTCTCTTAAG < 1:192965/65‑1 CAATAATCGACGCCGTTCTTCTGTCACCGTGGATTCAAGAACATGAATTAATATCTCTCTTAAGG < 1:567502/65‑1 CAATAATCGACGCCGTTCTTCTGTCACCGTGGATTCAAGAACATGAATTAATATCTCTCTTAAGG < 1:427398/65‑1 CAATAATCGACGCCGTTCTTCTGTCACCGTGGATTCAAGAACATGAATTAATATCTCTCTTAAGG < 1:2824433/65‑1 CAATAATCGACGCCGTTCTTCTGTCACCGTGGATTCAAGAACATGAATTAATATCTCTCTTAAGG < 1:1888943/65‑1 CAATAATCGACGCCGTTCTTCTGTCACCGTGGATTCAAGAACATGAATTAATATCTCTCTTAAGG < 1:1488811/65‑1 CAATAATCGACGCCGTTCTTCTGTCACCGTGGATTCAAGAACATGAATTAATATCTCTCTTAAGG < 1:140542/65‑1 AATAATCGACGCCGTTCTTCTGTCACCGTGGATTCAAGAACATGAATTAATATCTCTCTTAAGGT < 1:2874578/65‑1 TCGACGCCGTTCTTCTGTCACCGTGGATTCAAGAACATGAATTAATATCTCTCTTAAGGTAATGA < 1:1376394/65‑1 TCGACGCCGTTCTTCTGTCACCGTGGATTCAAGAACATGAATTAATATCTCTCTTAAGGTAATGA < 1:868689/65‑1 TCGACGCCGTTCTTCTGTCACCGTGGATTCAAGAACATGAATTAATATCTCTCTTAAGGTAATGA < 1:763377/65‑1 TCGACGCCGTTCTTCTGTCACCGTGGATTCAAGAACATGAATTAATATCTCTCTTAAGGTAATGA < 1:598953/65‑1 TCGACGCCGTTCTTCTGTCACCGTGGATTCAAGAACATGAATTAATATCTCTCTTAAGGTAATGA > 1:566406/1‑65 TCGACGCCGTTCTTCTGTCACCGTGGATTCAAGAACATGAATTAATATCTCTCTTAAGGTAATGA < 1:3073424/65‑1 TCGACGCCGTTCTTCTGTCACCGTGGATTCAAGAACATGAATTAATATCTCTCTTAAGGTAATGA < 1:1884960/65‑1 TCGACGCCGTTCTTCTGTCACCGTGGATTCAAGAACATGAATTAATATCTCTCTTAAGGTAATGA < 1:1627471/65‑1 gcCGCCGTTCTTCTGTCACCGTGGATTCAAGAACATTAATTAATATCTCTCTTAAGGTAATGACT < 1:2838244/63‑1 GACGCCGTTCTTCTGTCACCGTGGATTCAAGAACATGAATTAATATCTCTCTTAAGGTAATGACT < 1:96660/65‑1 GACGCCGTTCTTCTGTCACCGTGGATTCAAGAACATGAATTAATATCTCTCTTAAGGTAATGACT < 1:2505243/65‑1 ACGCCGTTCTTCTGTCACCGGGGATTCAAGAACATGAATTAATATCTCTCTTAAGGTAATGACTC > 1:480634/1‑65 CGCCGTTCTTCTGTCACCGTGGATTCAAGAACATGAATTAATATCTCTCTTAAGGTAATGACTCC < 1:3257605/65‑1 GCCGTTCTTCTGTCACCGTGGATTCAAGAACATGAATTAATATCTCTCTTAAGGTAATGACTCCA < 1:3013220/65‑1 CCGTTCTTTTGTCACCGTGGATTCAAGAACATGAATTAATATCTCTCTTAAGGTAATGACTCCAA < 1:3692188/65‑1 CCGTTCTTCTGTCACCGTGGATTCAAGAACATGAATTAATATCTCTCTTAAGGTAATGACTCCAA > 1:1711040/1‑65 CCGTTCTTCTGTCACCGTGGATTCAAGAACATGAATTAATATCTCTCTTAAGGTAATGACTCCAA < 1:3945049/65‑1 CCGTTCTTCTGTCACCGTGGATTCAAGAACATGAATTAATATCTCTCTTAAGGTAATGACTCCAA > 1:717770/1‑65 GTTCTTCTGTCACCGTGGATTCAAGAACATGAATTAATATCTCTCTTAAGGTAATGACTCCAACT < 1:334715/65‑1 GTTCTTCTGTCACCGTGGATTCAAGAACATGAATTAATATCTCTCTTAAGGTAATGACTCCAACT < 1:337723/65‑1 GTTCTTCTGTCACCGCGGATTCAAGAACATGAATTAATATCTCTCTTAAGGTAATGACTCCAACT < 1:3677651/65‑1 TCTTCTGTCACCGTGGATTCAAGAACATGAATTAATATCTCTCTTAAGGTAATGACTCCAACTTA > 1:150792/1‑65 TCTGTCACCGTGGATTCAAGAACATGAATTAATATCTCTCTTAAGGTAATGACTCCAACTTACTG > 1:1257166/1‑65 TCTGTCACCGTGGATTCAAGAACATGAATTAATATCTCTCTTAAGGTAATGACTCCAACTTACTG > 1:868699/1‑65 TGTCACCGTGGATTCAAGAACATGAATTAATATCTCTCTTAAGGTAATGACTCCAACTTACTGAT > 1:3813101/1‑65 TGTCACCGTGGATTCAAGAACATGAATTAATATCTCTCTTAAGGTAATGACTCCAACTTACTGAT > 1:3556055/1‑65 CACCGTGGATTCAAGAACATGAATTAATATCTCTCTTAAGGTAATGACTCCAACTTACTGATAGT < 1:3505115/65‑1 ACCGTGGATTCAAGAACATGAATTAATATCTCTCTTAAGGTAATGACTCCAACTTACTGATAGTG < 1:1227341/65‑1 ACCGTGGATTCAAGAACATGAATTAATATCTCTCTTAAGGTAATGACTCCAACTTACTGATAGTG < 1:83820/65‑1 ACCGTGGATTCAAGAACATGAATTAATATCTCTCTTAAGGTAATGACTCCAACTTACTGATAGTG < 1:127435/65‑1 ACCGTGGATTCAAGAACATGAATTAATATCTCTCTTAAGGTAATGACTCCAACTTACTGATAGTG < 1:2446073/65‑1 ACCGTGGATTCAAGAACATGAATTAATATCTCTCTTAAGGTAATGACTCCAACTTACTGATAGTG < 1:2819093/65‑1 CCGTGGATTCAAGAACATGAATTAATATCTCTCTTAAGGTAATGACTCCAACTTACTGATAGTGT < 1:3227321/65‑1 CCGTGGATTCAAGAACATGAATTAATATCTCTCTTAAGGTAATGACTCCAACTTACTGATAGTGT < 1:3184083/65‑1 CCGTGGATTCAAGAACATGAATTAATATCTCTCTTAAGGTAATGACTCCAACTTACTGATAGTGT > 1:557494/1‑65 CCGTGGATTCAAGAACATGAATTAATATCTCTCTTAAGGTAATGACTCCAACTTACTGATAGTGT < 1:2772103/65‑1 CCGTGGATTCAAGAACATGAATTAATATCTCTCTTAAGGTAATGACTCCAACTTACTGATAGTGT < 1:1217328/65‑1 CCGTGGATTCAAGAACATGAATTAATATCTCTCTTAAGGTAATGACTCCAACTTACTGATAGTGT < 1:2180755/65‑1 CCGTGGATTCAAGAACATGAATTAATATCTCTCTTAAGGTAATGACTCCAACTTACTGATAGTGT < 1:1352223/65‑1 CGTGGATTCAAGAACATGAATTAATATCTCTCTTAAGGTAATGACTCCAACTTACTGATAGTGTT > 1:1156843/1‑65 GTGGATTCAAGAACATGAATTAATATCTCTCTTAAGGTAATGACTCCAACTTACTGATAGTGTTT < 1:3663080/65‑1 GTGGATTCAAGAACATGAATTAATATCTCTCTTAAGGTAATGACTCCAACTTACTGATAGTGTTT < 1:3318090/65‑1 GATTCAAGAACATGAATTAATATCTCTCTTAAGGTAATGACTCCAACTTACTGATAGTGTTTTAT < 1:1159244/65‑1 GATTCAAGAACATGAATTAATATCTCTCTTAAGGTAATGACTCCAACTTACTGATAGTGTTTTAT < 1:2175334/65‑1 ATTCAAGAACATGAATTAATATCTCTCTTAAGGTAATGACTCCAACTTACTGATAGTGTTTTATG < 1:2731643/65‑1 ATTCAAGAACATGAATTAATATCTCTCTTAAGGTAATGACTCCAACTTACTGATAGTGTTTTATG > 1:100247/1‑65 TTCAAGAACATGAATTAATATCTCTCTTAAGGTAATGACTCCAACTTACTGATAGTGTTTTATGT < 1:166101/65‑1 TTCAAGAACATGAATTAATATCTCTCTTAAGGTAATGACTCCAACTTACTGATAGTGTTTTATGT < 1:469239/65‑1 TTCAAGAACATGAATTAATATCTCTCTTAAGGTAATGACTCCAACTTACTGATAGTGTTTTATGT < 1:2083439/65‑1 TTCAAGAACATGAATTAATATCTCTCTTAAAGTAATGACTCCAACTTACTGATAGTGTTCTATGT < 1:3337911/65‑1 AGAACATGAATTAATATCTCTCTTAAGGTAATGACTCCAACTTACTGATAGTGTTTTATGTTCAG > 1:1971092/1‑65 AGAACATGAATTAATATCTCCCTTAAGGT‑ATGACTCCAACTTACTGATAGTGTTTTATGTTCAGA < 1:1338913/65‑1 GAACATGAATTAATATCTCTCTTAAGGTAATGACTCCAACTTACTGATAGTGTTTTATGTTCAGA < 1:1765602/65‑1 GAACATGAATTAATATCTCTCTTAAGGTAATGACTCCAACTTACTGATAGTGTTTTATGTTCAGA < 1:1646178/65‑1 GAACATGAATTAATATCTCTCTTAAGGTAATGACTCCAACTTACTGATAGTGTTTTATGTTCAGA < 1:2211042/65‑1 GAACATGAATTAATATCTCTCTTAAGGTAATGACTCCAACTTACTGATAGTGTTTTATGTTCAGA < 1:662460/65‑1 GAACATGAATTAATATCTCTCTTAAGGTAATGACTCCAACTTACTGATAGTGTTTTATGTTCAGA < 1:2370300/65‑1 GAACATGAATTAATATCTCTCTTAAGGTAATGACTCCAACTTACTGATAGTGTTTTATGTTCAGA < 1:593449/65‑1 GAACATGAATTAATATCTCTCTTAAGGTAATGACTCCAACTTACTGATAGTGTTTTATGATCAGA < 1:3774933/65‑1 ACATGAATTAATATCTCTCTTAAGGTAATGACTCCAACTTACTGATAGTGTTTTATGTTCAGATA > 1:3732124/1‑65 ATGAATTAATATCTCTCTTAAGGTAATGACTCCAACTTACTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAAT > 1:1061568/1‑65 ATGAATTAATATCTCTCTTAAGGTAATGACTCCAACTTACTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAAT > 1:1873713/1‑65 AATTAATATCTCTCTTAAGGTAATGACTCCAACTTACTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCC < 1:3451722/65‑1 AATTAATATCTCTCTTAAGGTAATGACTCCAACTTACTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCC < 1:3595669/65‑1 AATTAATATCTCTCTTAAGGTAATGACTCCAACTTACTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCC < 1:226017/65‑1 AATTAATATCTCTCTTAAGGTAATGACGCCAACTTACTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCC < 1:3521288/65‑1 ATTAATATCTCTCTTAAGGTAATGACTCCAACTTACTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCC > 1:1568520/1‑65 ATTAATATCTCTCTTAAGGTAATGACTCCAACTTACTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCC < 1:1609319/65‑1 ATTAATATCTCTCTTAAGGTAATGACTCCAACTTACTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCC < 1:2985824/65‑1 TAATATCTCTCTTAAGGTAATGACTCCAACTTACTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGA > 1:1912761/1‑65 TAATATCTCTCTTAAGGTAATGACTCCAACTTACTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGA > 1:2310238/1‑65 AATATCTCTCTTAAGGTAATGACTCCAACTTACTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGAT < 1:3754319/65‑1 AATATCTCTCTTAAGGTAATGACTCCAACTTACTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGAT < 1:3241469/65‑1 ATCTCTCTTAAGGTAATGACTCCAACTTACTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGAC > 1:1170867/1‑65 ATCTCTCTTAAGGTAATGACTCCAACTTACTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGAC < 1:175497/65‑1 ATCTCTCTTAAGGTAATGACTCCAACTTACTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGAC < 1:4041458/65‑1 TCTCTCTTAAGGTAATGACTCCAACTTACTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACC > 1:2984848/1‑65 TCTCTCTTAAGGTAATGACTCCAACTTACTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACC > 1:2761924/1‑65 TCTCTCTTAAGGTAATGACTCCAACTTACTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACC > 1:3387177/1‑65 CTCTTAAGGTAATGACTCCAACTTACTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACCTTG < 1:2746905/65‑1 TCTTAAGGTAATGACTCCAACTTACTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACCTTGT < 1:923920/65‑1 TCTTAAGGTAATGACTCCAACTTACTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACCTTGT > 1:1707932/1‑65 CTTAAGGTAATGACTCCAACTTACTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACCTTGTC < 1:1951378/65‑1 TAAGGTAATGACTCCAACTTACTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACCTTGTCAT < 1:3059188/65‑1 TAAGGTAATGACTCCAACTTACTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACCTTGTCAT < 1:3359357/65‑1 TAAGGTAATGACTCCAACTTACTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACCTTGTCAT < 1:1691043/65‑1 TCAATAATCGACGCCGTTCTTCTGTCACCGTGGATTCAAGAACATGAATTAATATCTCTCTTAA‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < NC_000913/486088‑486025‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑GGTAATGACTCCAACTTACTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACCTTGTCAT < NC_000913/4519239‑4519178 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |