| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| JC JC | NC_000913 | 486,025 | IS1 (+) +9 bp | coding (265‑273/648 nt) | acrR → | DNA‑binding transcriptional repressor AcrR |
| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | 486025 = | 0 (0.000) | 96 (1.890) | 43/128 | 0.0 | 100% | coding (265/648 nt) | acrR | DNA‑binding transcriptional repressor AcrR |
| ? | NC_000913 | = 4519239 | NA (NA) | noncoding (768/768 nt) | IS1 | repeat region | |||||
| * | ? | NC_000913 | = 486033 | 0 (0.000) | 59 (1.160) | 28/128 | 0.2 | 100% | coding (273/648 nt) | acrR | DNA‑binding transcriptional repressor AcrR |
| ? | NC_000913 | 4518472 = | NA (NA) | noncoding (1/768 nt) | IS1 | repeat region | |||||
TGGTGAACTAGAGCTTGAGTATCAGGCAAAATTCCCTGGCGATCCACTCTCAGTATTAAGAGAG‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > NC_000913/485970‑486033‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑GGTAATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGATTTTAAGGTGCTTGCGTGGCT > NC_000913/4518472‑4518532 TGGTGAACTAGGGCTTGAGTATCAGGCAAAATTCCCTGGCGATCCCCTCTCAGTATTAAGAGAGG < 1:1322474/65‑1TGGTGAACTAGAGTTTGAGTATCAGGCAAAATTCCCTGGCGATCCACTCTCAGTATTAAGAGAGG < 1:2688380/65‑1TGGTGAACTAGAGCTTGAGTATCAGGCAAAATTCCCTGGCGATCCACTCTCAGTATTAAGAGAGG < 1:3355983/65‑1TGGTGAACTAGAGCTTGAGTATCAGGCAAAATTCCCTGGCGATCCACTCTCAGTATTAAGAGAGG < 1:2008941/65‑1TGGTGAACTAGAGCTTGAGTATCAGGCAAAATTCCCTGGCGATCCACTCTCAGTATTAAGAGAGG < 1:1990722/65‑1TGGTGAACTAAAGCTTGAGTATCAGGCAAAATTCCCTGGCGATCCACTCTCAGTATTAAGAGAGG < 1:834418/65‑1 GGTGAACTAGAGCTTGAGTATCAGGCAAAATTCCCTGGCGATCCACTCTCAGTATTAAGAGAGGG > 1:3352870/1‑65 GGTGAACTAGAGCTTGAGTATCAGGCAAAATTCCCTGGCGATCCACTCTCAGTATTAAGAGAGGG > 1:1701619/1‑65 ACTAGAGCTTGAGTATCAGGCAAAATTCCCTGGCGATCCACTCTCAGTATTAAGAGAGGGTAATG > 1:1148292/1‑65 CTAGAGCTTGAGTATCAGGCAAAATTCCCTGGCGATCCACTCTCAGTATTAAGAGAGGGTAATGC > 1:1041224/1‑65 AGCTTGAGTATCAGGCAAAATTCCCTGTCAATCCACTCTCAGTCTTAAGAGAGCGTAATGCTGCC > 1:652192/1‑65 AGCTTGAGTATCAGGCAAAATTCCCTGGCGATCCACTCTCAGTATTAAGAGAGGGTAATGCTGCC > 1:3158336/1‑65 AGCTTGAGTATCAGGCAAAATTCCCTGGCGATCCACTCTCAGTATTAAGAGAGGGTAATGCTGCC > 1:2221844/1‑65 AGCTTGAGTATCAGGCAAAATTCCCTGGCGATCCACTCTCAGTATTAAGAGAGGGTAATGCTGCC > 1:2553011/1‑65 GCTTGAGTATCAGGCAAAATTCCCTGGCGATCCACTCTCAGTATTAAGAGAGGGTAATGCTGCCA > 1:1177576/1‑65 GCTTGAGTATCAGGCAAAATTCCCTGGCGATCCACTCTCAGTATTAAGAGAGGGTAATGCTGCCA > 1:2569862/1‑65 CTTGAGTATCAGGCAAAATTCCCTGGCGATCCACTCTCAGTATTAAGAGAGGGTAATGCTGCCAA < 1:3157372/65‑1 CTTGAGTATCAGGCAAAATTCCCTGGCGATCCACTCTCAGTATTAAGAGAGGGTAATGCTGCCAA > 1:19479/1‑65 TGAGTATCAGGCAAAATTCCCTGGCGATCCACTCTCAGTATTAAGAGAGGGTAATGCTGCCAACT < 1:1904878/65‑1 atTATCAGGCAAAATTCCCTGGCGATCCACTCTCAGTATTAAGAGAGGGTAATGCTGCCAACTTA < 1:3717227/63‑1 AGTATCAGGCAAAATTCCCGGGCGATCCACTCTCAGTATTAAGAGAGGGTAATGCTGCCAACTTA < 1:64457/65‑1 ATCAGGCAAAATTCCCTGGCGATCCACTCTCAGTATTAAGAGAGGGTAATGCTGCCAACTTACTG > 1:1544442/1‑65 TCAGGCAAAAGTCCCTGGCGATCCACTCTCAGTATTAAGAGAGGGTAATGCTGCCAACTTACTGA < 1:2973533/65‑1 TCAGCCAAAATTCCCTCGCGATCCACTCTCAGTATTAAGAGAGGGTAATGCTGCCAACTTACTGA < 1:3446684/65‑1 CAAAATTCCCTGGCGATCCACTCTCAGTATTAAGAGAGGGTAATGCTGCCAACTTACTGATTTAG < 1:2287677/65‑1 AAAATTCCCTGGCGATCCACTCTCAGTATTAAGAGAGGGTAATGCTGCCAACTTACTGATTTAGT < 1:2956646/65‑1 AAAATTCCCTGGCGATCCACTCTCAGTATTAAGAGAGGGTAATGCTGCCAACTTACTGATTTAGT < 1:1643501/65‑1 AAAATTCCCTGGCGATCCACTCTCAGTATTAAGAGAGGGTAATGCTGCCAACTTACTGATTTAGT < 1:3462665/65‑1 AAAATTCCCTGGCGATCCACTCTCAGTATTAAGAGAGGGTAATGCTGCCAACTTACTGATTTAGT < 1:3686512/65‑1 AAAATTCCCTGGCGATCCACTCTCAGTATTAAGAGAGGGTAATGCTGCCAACTTACTGATTTAGT < 1:65638/65‑1 AAAATTCCCTGGCGATCCACTCTCAGTATTAAGAGAGGGTAATGCTGCCAACTTACTGATTTAGT < 1:382650/65‑1 AAAATTCCCTGGCGATCCACTCTCAGTATTAAGAGAGGGTAATGCTGCCAACTTACTGATTTAGT < 1:395440/65‑1 AAAATTCCCTGCCGATCCACTCTCAGTATTAAGAGAGGGTAATGCTGCCAACTTACTGATTTAGT < 1:2442887/65‑1 AAAATGCCCTGGCGATCCACTCTCAGTATTAAGAGAGGGTAATGCTGCCAACTTACTGATTTAGT < 1:2798153/65‑1 AATTCCCTGGCGATCCACTCTCAGTATTAAGAGAGGGTAATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGT < 1:2858146/65‑1 AATTCCCTGGCGATCCACTCTCAGTATTAAGAGAGGGTAATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGT < 1:3065795/65‑1 CCTGGCGATCCACTCTCAGTATTAGGAGAGGGTAATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGAT < 1:704331/65‑1 CGATCCACTCTCAGTATTAAGAGAGGGTAATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGA > 1:2922790/1‑65 GATCCACTCTCAGTATTAAGAGAGGGTAATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGAT < 1:1282898/65‑1 CACTCTCAGTATTAAGAGAGGGTAATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGATTTTA > 1:852104/1‑65 CACTCTCAGTATTAAGAGAGGGTAATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGATTTTA > 1:3001873/1‑65 CACTCTCAGTATTAAGAGAGGGTAATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGATTTTA > 1:3641541/1‑65 ACTCTCAGTATTAAGAGAGGGTAATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGATTTTAA > 1:3416868/1‑65 TCTCAGTATTAAGAGAGGGTAATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGATTTTAAGG > 1:1365518/1‑65 TCTCAGTATTAAGAGAGGGTAATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGATTTTAAGG > 1:1458202/1‑65 CTCAGTATTAAGAGAGGGTAATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGATTTTAAGGT < 1:3452327/65‑1 CTCAGTATTAAGAGAGGGTAATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGATTTTAAGGT < 1:1447502/65‑1 CAGTATTAAGAGAGGGTAATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGATTTTAAGGTGC < 1:1480515/65‑1 GTATTAAGAGAGGGTAATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGATTTTAAGGTGCTT > 1:54621/1‑65 TATTAAGAGAGGGTAATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGATTTTAAGGTGCTTG > 1:2077881/1‑65 AAGAGAGGGTAATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGATTTTAAGGTGCTTGCGTG > 1:4022212/1‑65 GAGAGGGTAATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGATTTTAAGGTGCTTGCGTGGC > 1:1757374/1‑65 GAGAGGGTAATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGATTTTAAGGTGCTTGCGTGGC > 1:610179/1‑65 GAGAGGGTAATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGATTTTAAGGTGCTTGCGTGGC > 1:3334545/1‑65 GAGAGGGTAATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGATTTTAAGGTGCTTGCGTGGC > 1:2398501/1‑65 GAGAGGGTAATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGATTTTAAGGTGCTTGCGTGGC > 1:2868784/1‑65 GAGAGGGTAATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGATTTTAAGGTGCTTGCGTGGC > 1:2979012/1‑65 GAGAGGGTAATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGATTTTAAGGTGCTTGCGTGGC > 1:3309096/1‑65 AGAGGGTAATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGATTTTAAGGTGCTTGCGTGGCT < 1:1746526/65‑1 TGGTGAACTAGAGCTTGAGTATCAGGCAAAATTCCCTGGCGATCCACTCTCAGTATTAAGAGAG‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > NC_000913/485970‑486033‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑GGTAATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGATTTTAAGGTGCTTGCGTGGCT > NC_000913/4518472‑4518532 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |