| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| JC JC | NC_000913 | 1,720,868 | IS5 (+) +4 bp | intergenic (‑44/‑154) | slyA ← / → ydhI | DNA‑binding transcriptional dual regulator SlyA/DUF1656 domain‑containing protein YdhI |
| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | 1396044 = | NA (NA) | 71 (1.400) | 35/128 | 0.1 | 100% | noncoding (1/1195 nt) | IS5 | repeat region |
| ? | NC_000913 | = 1720871 | 0 (0.000) | intergenic (‑47/‑154) | slyA/ydhI | DNA‑binding transcriptional dual regulator SlyA/DUF1656 domain‑containing protein YdhI | |||||
| * | ? | NC_000913 | = 1397238 | NA (NA) | 92 (1.810) | 42/128 | 0.0 | 100% | noncoding (1195/1195 nt) | IS5 | repeat region |
| ? | NC_000913 | 1720868 = | 0 (0.000) | intergenic (‑44/‑157) | slyA/ydhI | DNA‑binding transcriptional dual regulator SlyA/DUF1656 domain‑containing protein YdhI | |||||
TGAAGAAATGAAATGACTGAGTCAGCCGAGAAGAATTTCCCCGCTTATTCGCACCTTCCCTAACTAATCAATGCGTTGATTGTAAATCCAGCTAAGAGGTGAGGTTTTCAGAGCAGACAACGG > NC_000913/1397180‑1397302 | tGAAGAAATGAAATGACTCAGTCAGCCGAGAAGAATTTCCCCGCTTATTCGCACCTTCCctaact < 1:301895/65‑1 (MQ=14) aagaaATGAAATGACTGAGTCAGCCGAGAAGAATTTCCCCGCTTATTCGCACCTTCCctaactaa < 1:3681696/65‑1 (MQ=35) aagaaATGAAATGACTGAGTCAGCCGAGAAGAATTTCCCCGCTTATTCGCACCTTCCctaactaa < 1:3259845/65‑1 (MQ=35) agaaATGAAATGACTGAGTCAGCCGAGAAGAATTTCCCCGCTTATTCGCACCTTCCCTAACTAAt > 1:1155883/1‑65 (MQ=35) agaaATGAAATGACTGAGTCAGCCGAGAAGAATTTCCCCGCTTATTCGCACCTTCCCTAACTAAt > 1:266987/1‑65 (MQ=35) agaaATGAAATGACTGAGTCAGCCGAGAAGAATTTCCCCGCTTATTCGCACCTTCCCTAACTAAt > 1:1981350/1‑65 (MQ=35) agaaATGAAATGACTGAGTCAGCCGAGAAGAATTTCCCCGCTTATTCGCACCTTCCCTAACTAAt > 1:1778466/1‑65 (MQ=35) agaaATGAAATGACTGAGTCAGCCGAGAAGAATTTCCCCGCTTATTCGCACCTTCCCTAACTAAt > 1:1509274/1‑65 (MQ=35) agaaATGAAATGACTGAGTCAGCCGAGAAGAATTTCCCCGCTTATTCGCACCTTCCCTAACTAAt > 1:618398/1‑65 (MQ=35) agaaATGAAATGACTGAGTCAGCCGAGAAGAATTTCCCCGCTTATTCGCACCTTCCCTAACTAAt > 1:1298288/1‑65 (MQ=35) gaaatgaaatGACTGAGTCAGCCGAGAAGAATTTCCCCGCTTATTCGCACCTTGCCTAACTAATc < 1:31007/65‑1 (MQ=255) gaaatgaaatGACTGAGTCAGCCGAGAAGAATTTCCCCGCTTATTCGCACCTTCCCTAACTAATc < 1:2702748/65‑1 (MQ=37) aaatgaaatgACTGAGTCAGCCGAGAAGAATTTCCCCGCTTATTCGCACCTTCCCTAACTAATCa > 1:1862999/1‑65 (MQ=39) atgaaatgaCTGAGTCAGCCGAGAAGAATTTCCCCGCTTATTCGCACCTTCCCTAACTAATCAAt < 1:2311470/65‑1 (MQ=255) aaatgaCTGAGTCAGCCGAGAAGAATTTCCCCGCTTATTCGCACCTTCCCTAACTAATCAATGCg < 1:2479041/65‑1 (MQ=255) aatgaCTGAGTCAGCCGAGAAGAATTTCCCCGCTTATTCGCACCTTCCCTAACTAATCAATGCGt > 1:2696880/1‑65 (MQ=255) aatgaCTGAGTCAGCCGAGAAGAATTTCCCCGCTTATTCGCACCTTCCCTAACTAATCAATGCGt > 1:591255/1‑65 (MQ=255) tgaCTGAGTCAGCCGAGAAGAATTTCCCCGCTTATTCGCACCTTCCCTAACTAATCAATGCGTTg > 1:1586060/1‑65 (MQ=255) tgaCTGAGTCAGCCGAGAAGAATTTCCCCGCTTATTCGCACCTTCCCTAACTAATCAATGCGTTg > 1:116893/1‑65 (MQ=255) gaCTGAGTCAGCCGAGAAGAATTTCCCCGCTTATTCGCACCTTCCCTAACTAATCAATGCGTTGa < 1:1818473/65‑1 (MQ=255) gaCTGAGTCAGCCGAGAAGAATTTCCCCGCTTATTCGCACCTTCCCTAACTAATCAATGCGTTGa < 1:2781241/65‑1 (MQ=255) ccTGAGTCAGCCGAGAAGAATTTCCCCGCTTATTCGCACCTTCCCTAACTAATCAATGCGTTGAt < 1:3635523/64‑1 (MQ=255) aCTGAGTCAGCCGAGAAGAATTTCCCCGCTTATTCGCACCTTCCCTAACTAATCAATGCGTTGAt < 1:1322190/65‑1 (MQ=255) cTGAGTCAGCCGAGAAGAATTTCCCCGCTTATTCGCACCTTCCCTAACTAATCAATGCGTTGAtt < 1:3263244/65‑1 (MQ=255) cTGAGTCAGCCGAGAAGAATTTCCCCGCTTATTCGCACCTTCCCTAACTAATCAATGCGTTGAtt < 1:3692784/65‑1 (MQ=255) cTGAGTCAGCCGAGAAGAATTTCCCCGCTTATTCGCACCTTCCCTAACTAATCAATGCGTTGAtt < 1:1745974/65‑1 (MQ=255) cTGAGTCAGCCGAGAAGAATTTCCCCGCTTATTCGCACCTTCCCTAACTAATCAATGCGTTGAtt < 1:3906984/65‑1 (MQ=255) tGAGTCAGCCGAGAAGAATTTCCCCGCTTATTCGCACCTTCCCTAACTAATCAATGCGTTGATTg < 1:1104183/65‑1 (MQ=255) tGAGTCAGCCGAGAAGAATGTCCCCGCTTATTCGCACCTTCCCTAACTAATCAATGCGTTGATTg < 1:3446044/65‑1 (MQ=255) gTCAGCCGAGAAGAATTTCCCCGCTTATTCGCACCTTCCCTAACTAATCAATGCGTTGATTGTaa > 1:414138/1‑65 (MQ=255) gTCAGCCGAGAAGAATTTCCCCGCTTATTCGCACCTTCCCTAACTAATCAATGCGTTGATTGTaa < 1:1595606/65‑1 (MQ=255) gTCAGCCGAGAAGAATTCCCCCGCTTATTCGCCCCTTCCCTAACTAATCAATGCGTTGATTGTaa < 1:2130022/65‑1 (MQ=255) tCAGCCGAGAAGAATTTCCCCGCTTATTCGCACCTTCCCTAACTAATCAATGCGTTGATTGTaaa > 1:2880745/1‑65 (MQ=255) tCAGCCGAGAAGAATTTCCCCGCTTATTCGCACCTTCCCTAACTAATCAATGCGTTGATTGTaaa > 1:563396/1‑65 (MQ=255) tCAGCCGAGAAGAATTTCCCCGCTTATTCGCACCTTCCCTAACTAATCAATGCGTTGATTGTaaa > 1:3313173/1‑65 (MQ=255) cAGCCGAGAAGAATTTCCCCGCTTATTCGCACCTTCCCTAACTAATCAATGCGTTGATTGTAAAt < 1:1994711/65‑1 (MQ=255) cAGCCGAGAAGAATTTCCCCGCTTATTCGCACCTTCCCTAACTAATCAATGCGTTGATTGTAAAt < 1:205536/65‑1 (MQ=255) gCCGAGAAGAATTTCCCCGCTTATTCGCACCTTCCCTAACTAATCAATGCGTTGATTGTAAATcc < 1:3637398/65‑1 (MQ=255) ccGAGAAGAATTTCCCCGCTTATTCGCACCTTCCCTAACTAATCAATGCGTTGATTGTAAATCCa > 1:3885470/1‑65 (MQ=255) ccGAGAAGAATTTCCCCGCTTATTCGCACCTTCCCTAACTAATCAATGCGTTGATTGTAAATCCa > 1:2465005/1‑65 (MQ=255) ccGAGAAGAATTTCCCCGCTTATTCGCACCTTCCCTAACTAATCAATGCGTTGATTGTAAATCCa > 1:189677/1‑65 (MQ=255) cGAGAAGAATTTCCCCGCTTATTCGCACCTTCCCTAACTAATCAATGCGTTGATTGTAAATCCAg > 1:2866638/1‑65 (MQ=255) gagaAGAATTTCCCCGCTTATTCGCACCTTCCCTAACTAATCAATGCGTTGATTGTAAATCCAGc < 1:2767841/65‑1 (MQ=255) gagaAGAATTTCCCCGCTTATTCGCACCTTCCCTAACTAATCAATGCGTTGATTGTAAATCCAGc < 1:511569/65‑1 (MQ=255) gagaAGAATTTCCCCGCTTATTCGCACCTTCCCTAACTAATCAATGCGTTGATTGTAAATCCAGc < 1:322339/65‑1 (MQ=255) gagaAGAATTGCCCCGCTTATTCGGACCTTCCCTAACTAATCAATGCGTTGATTGTAAATCCAGc < 1:2890673/65‑1 (MQ=255) agaaTTTCCCCGCTTATTCGCATCTTCCCTAACTAATCAATGCGTTGATTGTAAATCCAGATAag > 1:597854/1‑65 (MQ=255) agaaTTTCCCCGCTTATTCGCACCTTCCCTAACTAATCAATGCGTTGATTGTAAATCCAGCTAag > 1:3697072/1‑65 (MQ=255) agaaTTTCCCCGCTTATTCGCACCTTCCCTAACTAATCAATGCGTTGATTGTAAATCCAGCTAag > 1:3752338/1‑65 (MQ=255) agaaTTTCCCCGCTTATTCGCACCTTCCCTAACTAATCAATGCGTTGATTGTAAATCCAGCTAag > 1:2379407/1‑65 (MQ=255) aaTTTCCCCGCTTATTCGCACCTTCCCTAACTAATCAATGCGTTGATTGTAAATCCAGCTAagag < 1:2008847/65‑1 (MQ=255) tttCCCCGCTTATTCGCACCTTCCCTAACTAATCAATGCGTTGATTGTAAATCCAGCTAAgaggt > 1:2036838/1‑65 (MQ=255) ttCCCCGCTTATTCGCACCTTCCCTAACTAATCAATGCGTTGATTGTAAATCCAGCTAAgaggtg > 1:1673474/1‑65 (MQ=255) cccGCTTATTCGCACCTTCCCTAACTAATCAATGCGTTGATTGTAAATCCAGCTAAgaggtgagg < 1:510666/65‑1 (MQ=255) cccGCTTATTCGCACCTTCCCTAACTAATCAATGCGTTGATTGTAAATCCAGCTAAgaggtgagg > 1:533196/1‑65 (MQ=255) cccGCTTATTCGCACCTTCCCTAACTAATCAATGCGTTGATTGTAAATCCAGCTAAgaggtgagg > 1:1838238/1‑65 (MQ=255) cccGCTTATTCGCACCTTCCCTAACTAATCAATGCGTTGATTGTAAATCCAGCTAAgaggtgagg < 1:2130594/65‑1 (MQ=255) cccGCTTATTCGCACCTTCCCTAACTAATCAATGCGTTGATTGTAAATCCAGCTAAgaggtgagg < 1:2478471/65‑1 (MQ=255) gCTTATTCGCACCTTCCCTAACTAATCAATGCGTTGATTGTAAATCCAGCTAAGAGGTGAGGttt < 1:3033999/65‑1 (MQ=255) gCTTATTCGCACCTTCCCTAACTAATCAATGCGTTGATTGTAAATCCAGCTAAGAGGTGAGGttt < 1:2188826/65‑1 (MQ=255) ttATTCGCACCTTCCCTAACTAATCAATGCGTTGATTGTAAATCCAGCTAAGAGGTGAGGTTTTc < 1:2580192/65‑1 (MQ=255) ttCGCACCTTCCCTAACTAATCAATGCGTTGATTGTAAATCCAGCTAAGAGGTGAGGTTTTCaga < 1:2848400/65‑1 (MQ=255) ttCGCACCTTCCCTAACTAATCAATGCGTTGATTGTAAATCCAGCTAAGAGGTGAGGTTTTCaga < 1:2929821/65‑1 (MQ=255) cGCACCTTCCCTAACTAATCAATGCGTTGATTGTAAATCCAGCTAAGAGGTGAGGTTTTCAGAGc < 1:3897467/65‑1 (MQ=255) cGCACCTTCCCTAACTAATCAATGCGTTGATTGTAAATCCAGCTAAGAGGTGAGGTTTTCAGAGc < 1:79792/65‑1 (MQ=255) cGCACCTTCCCTAACTAATCAATGCGTTGATCGTAAATCCAGCTAAGAGGTGAGGTTTTCAGAGc < 1:2651867/65‑1 (MQ=255) aCCTTCCCTAACTAATCAATGCGTTGATTGTAAATCCAGCTAAGAGGTGAGGTTTTCAGAGCAGa < 1:3680858/65‑1 (MQ=255) aCCTTCCCTAACTAATCAATGCGTTGATTGTAAATCCAGCTAAGAGGTGAGGTTTTCAGAGCAGa < 1:3463713/65‑1 (MQ=255) ccTTCCCTAACTAATCAATGCGTTGATTGTAAATCCAGCTAAGAGGTGAGGTTTTCAGAGCAGAc > 1:1492711/1‑65 (MQ=255) ccTTCCCTAACTAATCAATGCGTTGATTGTAAATCCAGCTAAGAGGGGAGGTTTTCAGAGCAGAc > 1:3354841/1‑65 (MQ=255) cTTCCCTAACTAATCAATGCGTTGATTGTAAATCCAGCTAAGAGGTGAGGTTTTCAGAGCAGACa > 1:2908707/1‑65 (MQ=255) ccTAACTAATCAATGCGTTGATTGTAAATCCAGCTAAGAGGTGAGGTTTTCAGAGCAGACAACgg > 1:3339679/1‑65 (MQ=255) | TGAAGAAATGAAATGACTGAGTCAGCCGAGAAGAATTTCCCCGCTTATTCGCACCTTCCCTAACTAATCAATGCGTTGATTGTAAATCCAGCTAAGAGGTGAGGTTTTCAGAGCAGACAACGG > NC_000913/1397180‑1397302 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |