| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| MC JC | NC_000913 | 1,673,532 | Δ181 bp | intergenic (‑31/‑201) | mdtJ ← / → tqsA | multidrug efflux system transporter/pheromone AI‑2 transporter |
| Missing coverage evidence... | ||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | start | end | size | ←reads | reads→ | gene | description | |||
| * | * | ÷ | NC_000913 | 1673532 | 1673712 | 181 | 124 [0] | [0] 125 | mdtJ/tqsA | multidrug efflux system transporter/pheromone AI‑2 transporter |
| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | = 1673531 | 0 (0.000) | 124 (1.130) | 101/298 | 0.0 | 100% | intergenic (‑30/‑382) | mdtJ/tqsA | multidrug efflux system transporter/pheromone AI‑2 transporter |
| ? | NC_000913 | 1673713 = | 0 (0.000) | intergenic (‑212/‑200) | mdtJ/tqsA | multidrug efflux system transporter/pheromone AI‑2 transporter | |||||
Only 100 of 124 total aligned reads displayed.
CCAGCATTAAAATAAAGCCGCCATTTCCCTCACTGACGCTCGCCCATTTCATTGACAGCGTACCGGTAATTTCTGTAGCAATAGCCAGACCTAATAAAATCCAATAAATATACATTGTCCTTCTCCTGCAAGAGAATTATTTTAA‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > NC_000913/1673387‑1673531‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ATTACAATTATCCGCAGTGTTGCTTCTCGTCATCGCGGATGATAATTGTCCTCGGTAGTTGAACACGCCTGATTTGTATCATAGCTTAAGAATTAACTCAAAATATTTTCACTTCTTTACCTGAGCGGTTTGATTTTCGTTATGATGAC > NC_000913/1673713‑1673861 CCAGCATTAAAATAAAGCCGCCATTTCCCTCACTGACGCTCGCCCATTTCATTGACAGCGTACCGGTAATTTCTGTAGCAATAGCCAGACCTAATAAAATCCAATAAATATACATTGTCCTTCTCCTGCAAGAGAATTATTTTAAATTAC > 2:673572/1‑150 AGCATTAAAATAAAGCCGCCATTTCCCTCACTGACGCTCGCCCATTTCATTGACAGCGTACCGGTAATTTCTGTAGCAATAGCCAGACCTAATAAAATCCAATAAATATACATTGTCCTTCTCCTGCAAGAGAATTATTTTAAATTACAAT < 1:319760/151‑1 AGCATTAAAATAAAGCCGCCATTTCCCTCACTGACGCTCGCCCATTTCATTGACAGCGTACCGGTAATTTCTGTAGCAATAGCCAGACCTAATAAAATCCAATAAATATACATTGTCCTTCTCCTGCAAGAGAATTATTTTAAATTACAAT < 1:749980/151‑1 CATTAAAATAAAGCCGCCATTTCCCTCACTGACGCTCGCCCATTTCATTGACAGCGTACCGGTAATTTCTGTAGCAATAGCCAGACCTAATAAAATCCAATAAATATACATTGTCCTTCTCCTGCAAGAGAATTATTTTAAATTACAATT > 1:788135/1‑150 TTAAAATAAAGCCGCCATTTCCCTCACTGACGCTCGCCCATTTCATTGACAGCGTACCGGTAATTTCTGTAGCAATAGCCAGACCTAATAAAATCCAATAAATATACATTGTCCTTCTCCTGCAAGAGAATTATTTTAAATTACAATTATC > 1:471089/1‑151 AAAATAAAGCCGCCATTTCCCTCACTGACGCTCGCCCATTTCATTGACAGCGTACCGGTAATTTCTGTAGCAATAGCCAGACCTAATAAAATCCAATAAATATACATTGTCCTTCTCCTGCAAGAGAATTATTTTAAATTACAATTATCCG < 1:23804/151‑1 AAATAAAGCCGCCATTTCCCTCACTGACGCTCGCCCATTTCATTGACAGCGTACCGGTAATTTCTGTAGCAATAGCCAGACCTAATAAAATCCAATAAATATACATTGTCCTTCTCCTGCAAGAGAATTATTTTAAATTACAATTATCCGC < 2:1292952/151‑1 ATAAAGCCGCCATTTCCCTCACTGACGCTCGCCCATTTCATTGACAGCGTACCGGTAATTTCTGTAGCAATAGCCACACCTAATAAAATCCAATAAATATACATTGTCCTTCTCCTGCAAGAGAATTATTTTAAATTACAATTATCCGC > 1:537572/1‑149 TAAAGCCGCCATTTCCCTCACTGACGCTCGCCCATTTCATTGACAGCGTACCGGTAATTTCTGTAGCAATAGCCAGACCTAATAAAATCCAATAAATATACATTGTCCTTCTCCTGCAAGAGAATTATTTTAAATTACAATTATCCGCAGT > 1:796861/1‑151 AAAGCCGCCATTTCCCTCACTGACGCTCGCCCATTTCATTGACAGCGTACCGGTAATTTCTGTAGCAATAGCCAGACCTAATAAAATCCAATAAATATACATTGTCCTTCTCCTGCAAGAGAATTATTTTAAATTACAATTATCCGCAGT < 2:689883/150‑1 GCCGCCATTTCCCTCACTGACGCTCGCCCATTTCATTGACAGCGTACCGGTAATTTCTGTAGCAATAGCCAGACCTAATAAAATCCAATAAATATACATTGTCCTTCTCCTGCAAGAGAATTATTTTAAATTACAATTATCCGCAGTGTTG > 2:4796/1‑151 CCGCCATTTCCCTCACTGACGCTCGCCCATTTCATTGACAGCGTACCGGTAATTTCTGTAGCAATAGCCAGACCTAATAAAATCCAATAAATATACATTGTCCTTCTCCTGCAAGAGAATTATTTTAAATTACAATTATCCGCAGTGTTGC > 1:1620422/1‑151 CGCCATTTCCCTCACTGACGCTCGCCCATTTCATTGACAGCGTACCGGTAATTTCTGTAGCAATAGCCAGACCTAATAAAATCCAATAAATATACATTGTCCTTCTCCTGCAAGAGAATTATTTTAAATTACAATTATCCGCAGTGTTGCT > 2:46358/1‑151 GCCATTTCCCTCACTGACGCTCGCCCATTTCATTGACAGCGTACCGGTAATTTCTGTAGCAATAGCCAGACCTAATAAAATCCAATAAATATACATTGTCCTTCTCCTGCAAGAGAATTATTTTAAATTACAATTATCCGCAGTGTTGCTT > 1:1528413/1‑151 CATTTCCCTCACTGACGCTCGCCCATTTCATTGACAGCGTACCGGTAATTTCTGTAGCAATAGCCAGACCTAATAAAATCCAATAAATATACATTGTCCTTCTCCTGCAAGAGAATTATTTTAAATTACAATTATCCGCAGTGTTGCTTCT > 1:777775/1‑151 TTTCCCTCACTGACGCTCGCCCATTTCATTGACAGCGTACCGGTAATTTCTGTAGCAATAGCCAGACCTAATAAAATCCAATAAATATACATTGTCCTTCTCCTGCAAGAGAATTATTTTAAATTACAATTATCCGCAGTGTTGCTTCTCG > 2:813672/1‑151 TTCCCTCACTGACGCTCGCCCATTTCATTGACAGCGTACCGGTAATTTCTGTAGCAATAGCCAGACCTAATAAAATCCAATAAATATACATTGTCCTTCTCCTGCAAGAGAATTATTTTAAATTACAATTATCCGCAGTGTTGCTTCTCG < 2:934009/150‑1 TCCCTCACTGACGCTCGCCCATTTCATTGACAGCGTACCGGTAATTTCTGTAGCAATAGCCAGACCTAATAAAATCCAATAAATATACATTGTCCTTCTCCTGCAAGAGAATTATTTTAAATTACAATTATCCGCAGTGTTGCTTCTCGTC > 1:719292/1‑151 CCTCACTGACGCTCGCCCATTTCATTGACAGCGTACCGGTAATTTCTGTAGCAATAGCCAGACCTAATAAAATCCAATAAATATACATTGTCCTTCTCCTGCAAGAGAATTATTTTAAATTACAATTATCCGCAGTGTTGCTTCTCGTCAT > 1:1378709/1‑151 ACTGACGCTCGCCCATTTCATTGACAGCGTACCGGTAATTTCTGTAGCAATAGCCAGACCTAATAAAATCCAATAAATATACATTGTCCTTCTCCTGCAAGAGAATTATTTTAAATTACAATTATCCGCAGTGTTGCTTCTCGTCATCGCG > 2:1282794/1‑151 ACTGACGCTCGCCCATTTCATTGACAGCGTACCGGTAATTTCTGTAGCAATAGCCAGACCTAATAAAATCCAATAAATATACATTGTCCTTCTCCTGCAAGAGAATTATTTTAAATTACAATTATCCGCAGTGTTGCTTCTCGTCATCGCG > 2:1529992/1‑151 TGACGCTCGCCCATTTCATTGACAGCGTACCGGTAATTTCTGTAGCAATAGCCAGACCTAATAAAATCCAATAAATATACATTGTCCTTCTCCTGCAAGAGAATTATTTTAAATTACAATTATCCGCAGTGTTGCTTCTCGTCATCGCGG > 1:1683454/1‑150 CGCTCGCCCATTTCATTGACAGCGTACCGGTAATTTCTGTAGCAATAGCCAGACCTAATAAAATCCAATAAATATACATTGTCCTTCTCCTGCAAGAGAATTATTTTAAATTACAATTATCCGCAGTGTTGCTTCTCGTCATCGCGGATGA < 1:1058245/151‑1 GCTCGCCCATTTCATTGACAGCGTACCGGTAATTTCTGTAGCAATAGCCAGACCTAATAAAATCCAATAAATATACATTGTCCTTCTCCTGCAAGAGAATTATTTTAAATTACAATTATCCGCAGTGTTGCTTCTCGTCATCGCGGATGAT > 2:1547620/1‑151 CCCATTTCATTGACAGCGTACCGGTAATTTCTGTAGCAATAGCCAGACCTAATAAAATCCAATAAATATACATTGTCCTTCTCCTGCAAGAGAATTATTTTAAATTACAATTATCCGCAGTGTTGCTTCTCGTCATCGCGGATGATAATTG > 1:501757/1‑151 CATTTCATTGACAGCGTACCGGTAATTTCTGTAGCAATAGCCAGACCTAATAAAATCCAATAAATATACATTGTCCTTCTCCTGCAAGAGAATTATTTTAAATTACAATTATCCGCAGTGTTGCTTCTCGTCATCGCGGATGATAATTGTC > 2:137899/1‑151 ATTTCATTGACAGCGTACCGGTAATTTCTGTAGCAATAGCCAGACCTAATAAAATCCAATAAATATACATTGTCCTTCTCCTGCAAGAGAATTATTTTAAATTACAATTATCCGCAGTGTTGCTTCTCGTCATCGCGGATGATAATTGTCC > 1:1367356/1‑151 TCATTGACAGCGTACCGGTAATTTCTGTAGCAATAGCCAGACCTAATAAAATCCAATAAATATACATTGTCCTTCTCCTGCAAGAGAATTATTTTAAATTACAATTATCCGCAGTGTTGCTTCTCGTCATCGCGGATGATAATTGTCCTC < 2:1131021/150‑1 CATTGACAGCGTACCGGTAATTTCTGTAGCAATAGCCAGACCTAATAAAATCCAATAAATATACATTGTCCTTCTCCTGCAAGAGAATTATTTTAAATTACAATTATCCGCAGTGTTGCTTCTCGTCATCGCGGATGATAATTGTCCTCGG > 2:1279265/1‑151 ATTGACAGCGTACCGGTAATTTCTGTAGCAATAGCCAGACCTAATAAAATCCAATAAATATACATTGTCCTTCTCCTGCAAGAGAATTATTTTAAATTACAATTATCCGCAGTGTTGCTTCTCGTCATCGCGGATGATAATTGTCCTCGGT > 1:481622/1‑151 TGACAGCGTACCGGTAATTTCTGTAGCAATAGCCAGACCTAATAAAATCCAATAAATATACATTGTCCTTCTCCTGCAAGAGAATTATTTTAAATTACAATTATCCGCAGTGTTGCTTCTCGTCATCGCGGATGATAATTGTCCTCGGTA < 2:1144933/150‑1 TGACAGCGTACCGGTAATTTCTGTAGCAATAGCCAGACCTAATAAAATCCAATAAATATACATTGTCCTTCTCCTGCAAGAGAATTATTTTAAATTACAATTATCCGCAGTGTTGCTTCTCGTCATCGCGGATGATAATTGTCCTCGGT > 1:1205154/1‑149 GACAGCGTACCGGTAATTTCTGTAGCAATAGCCAGACCTAATAAAATCCAATAAATATACATTGTCCTTCTCCTGCAAGAGAATTATTTTAAATTACAATTATCCGCAGTGTTGCTTCTCGTCATCGCGGATGATAATTGTCCTCGGTAGT > 2:802171/1‑151 GACAGCGTACCGGTAATTTCTGTAGCAATAGCCAGACCTAATAAAATCCAATAAATATACATTGTCCTTCTCCTGCAAGAGAATTATTTTAAATTACAATTATCCGCAGTGTTGCTTCTCGTCATCGCGGATGATAATTGTCCTCGGTAGT < 2:343156/151‑1 GACAGCGTACCGGTAATTTCTGTAGCAATAGCCAGACCTAATAAAATCCAATAAATATACATTGTCCTTCTCCTGCAAGAGAATTATTTTAAATTACAATTATCCGCAGTGTTGCTTCTCGTCATCGCGGATGATAATTGTCCTCGGTAG < 1:1468994/150‑1 CAGCGTACCGGTAATTTCTGTAGCAATAGCCAGACCTAATAAAATCCAATAAATATACATTGTCCTTCTCCTGCAAGAGAATTATTTTAAATTACAATTATCCGCAGTGTTGCTTCTCGTCATCGCGGATGATAATTGTCCTCGGTAGTTG > 1:447473/1‑151 GTACCGGTAATTTCTGTAGCAATAGCCAGACCTAATAAAATCCAATAAATATACATTGTCCTTCTCCTGCAAGAGAATTATTTTAAATTACAATTATCCGCAGTGTTGCTTCTCGTCATCGCGGATGATAATTGTCCTCGGTAGTTGAAC > 2:904391/1‑150 TACCGGTAATTTCTGTAGCAATAGCCAGACCTAATAAAATCCAATAAATATACATTGTCCTTCTCCTGCAAGAGAATTATTTTAAATTACAATTATCCGCAGTGTTGCTTCTCGTCATCGCGGATGATAATTGTCCTCGGTAGTTGAACAC > 2:1325700/1‑151 ACCGGTAATTTCTGTAGCAATAGCCAGACCTAATAAAATCCAATAAATATACATTGTCCTTCTCCTGCAAGAGAATTATTTTAAATTACAATTATCCGCAGTGTTGCTTCTCGTCATCGCGGATGATAATTGTCCTCGGTAGTTGAACAC < 2:447143/150‑1 CGGTAATTTCTGTAGCAATAGCCAGACCTAATAAAATCCAATAAATATACATTGTCCTTCTCCTGCAAGAGAATTATTTTAAATTACAATTATCCGCAGTGTTGCTTCTCGTCATCGCGGATGATAATTGTCCTCGGTAGTTGAACACGCC < 1:407455/151‑1 GGTAATTTCTGTAGCAATAGCCAGACCTAATAAAATCCAATAAATATACATTGTCCTTCTCCTGCAAGAGAATTATTTTAAATTACAATTATCCGCAGTGTTGCTTCTCGTCATCGCGGATGATAATTGTCCTCGGTAGTTGAACACGCC > 2:28721/1‑150 GTAATTTCTGTAGCAATAGCCAGACCTAATAAAATCCAATAAATATACATTGTCCTTCTCCTGCAAGAGAATTATTTTAAATTACAATTATCCGCAGTGTTGCTTCTCGTCATCGCGGATGATAATTGTCCTCGGTAGTTGAACACGCCTG < 1:1251054/151‑1 AATTTCTGTAGCAATAGCCAGACCTAATAAAATCCAATAAATATACATTGTCCTTCTCCTGCAAGAGAATTATTTTAAATTACAATTATCCGCAGTGTTGCTTCTCGTCATCGCGGATGATAATTGTCCTCGGTAGTTGAACACGCCTGA < 2:393450/150‑1 TTCTGTAGCAATAGCCAGACCTAATAAAATCCAATAAATATACATTGTCCTTCTCCTGCAAGAGAATTATTTTAAATTACAATTATCCGCAGTGTTGCTTCTCGTCATCGCGGATGATAATTGTCCTCGGTAGTTGAACACGCCTGATTT < 1:7302/150‑1 TTCTGTAGCAATAGCCAGACCTAATAAAATCCAATAAATATACATTGTCCTTCTCCTGCAAGAGAATTATTTTAAATTACAATTATCCGCAGTGTTGCTTCTCGTCATCGCGGATGATAATTGTCCTCGGTAGTTGAACACGCCTGATTT < 2:1620486/150‑1 CTGTAGCAATAGCCAGACCTAATAAAATCCAATAAATATACATTGTCCTTCTCCTGCAAGAGAATTATTTTAAATTACAATTATCCGCAGTGTTGCTTCTCGTCATCGCGGATGATAATTGTCCTCGGTAGTTGAACACGCCTGATTTGT > 1:1585048/1‑150 GTAGCAATAGCCAGACCTAATAAAATCCAATAAATATACATTGTCCTTCTCCTGCAAGAGAATTATTTTAAATTACAATTATCCGCAGTGTTGCTTCTCGTCATCGCGGATGATAATTGTCCTCGGTAGTTGAACACGCCTGATTTGTAT < 2:161417/150‑1 GTAGCAATAGCCAGACCTAATAAAATCCAATAAATATACATTGTCCTTCTCCTGCAAGAGAATTATTTTAAATTACAATTATCCGCAGTGTTGCTTCTCGTCATCGCGGATGATAATTGTCCTCGGTAGTTGAACACGCCTGATTTGTAT < 1:1218706/150‑1 AGCAATAGCCAGACCTAATAAAATCCAATAAATATACATTGTCCTTCTCCTGCAAGAGAATTATTTTAAATTACAATTATCCGCAGTGTTGCTTCTCGTCATCGCGGATGATAATTGTCCTCGGTAGTTGAACACGCCTGATTTGTATCAT > 1:1615526/1‑151 AATAGCCAGACCTAATAAAATCCAATAAATATACATTGTCCTTCTCCTGCAAGAGAATTATTTTAAATTACAATTATCCGCAGTGTTGCTTCTCGTCATCGCGGATGATAATTGTCCTCGGTAGTTGAACACGCCTGATTTGTATCATAGC < 1:943540/151‑1 ATAGCCAGACCTAATAAAATCCAATAAATATACATTGTCCTTCTCCTGCAAGAGAATTATTTTAAATTACAATTATCCGCAGTGTTGCTTCTCGTCATCGCGGATGATAATTGTCCTCGGTAGTTGAACACGCCTGATTTGTATCATAGCT < 1:770554/151‑1 AGCCAGACCTAATAAAATCCAATAAATATACATTGTCCTTCTCCTGCAAGAGAATTATTTTAAATTACAATTATCCGCAGTGTTGCTTCTCGTCATCGCGGATGATAATTGTCCTCGGTAGTTGAACACGCCTGATTTGTATCATAGCTT > 2:311211/1‑150 AGCCAGACCTAATAAAATCCAATAAATATACATTGTCCTTCTCCTGCAAGAGAATTATTTTAAATTACAATTATCCGCAGTGTTGCTTCTCGTCATCGCGGATGATAATTGTCCTCGGTAGTTGAACACGCCTGATTTGTATCATAGCTT > 1:92627/1‑150 GCCAGACCTAATAAAATCCAATAAATATACATTGTCCTTCTCCTGCAAGAGAATTATTTTAAATTACAATTATCCGCAGTGTTGCTTCTCGTCATCGCGGATGATAATTGTCCTCGGTAGTTGAACACGCCTGATTTGTATCATAGCTTA > 2:932451/1‑150 CCAGACCTAATAAAATCCAATAAATATACATTGTCCTTCTCCTGCAAGAGAATTATTTTAAATTACAATTATCCGCAGTGTTGCTTCTCGTCATCGCGGATGATAATTGTCCTCGGTAGTTGAACACGCCTGATTTGTATCATAGCTTAAG < 1:952318/151‑1 CAGACCTAATAAAATCCAATAAATATACATTGTCCTTCTCCTGCAAGAGAATTATTTTAAATTACAATTATCCGCAGTGTTGCTTCTCGTCATCGCGGATGATAATTGTCCTCGGTAGTTGAACACGCCTGATTTGTATCATAGCTTAAGA < 2:676295/151‑1 CAGACCTAATAAAATCCAATAAATATACATTGTCCTTCTCCTGCAAGAGAATTATTTTAAATTACAATTATCCGCAGTGTTGCTTCTCGTCATCGCGGATGATAATTGTCCTCGGTAGTTGAACACGCCTGATTTGTATCATAGCTTAAGA < 1:1509873/151‑1 AGACCTAATAAAATCCAATAAATATACATTGTCCTTCTCCTGCAAGAGAATTATTTTAAATTACAATTATCCGCAGTGTTGCTTCTCGTCATCGCGGATGATAATTGTCCTCGGTAGTTGAACACGCCTGATTTGTATCATAGCTTAAGA > 1:704990/1‑150 AGACCTAATAAAATCCAATAAATATACATTGTCCTTCTCCTGCAAGAGAATTATTTTAAATTACAATTATCCGCAGTGTTGCTTCTCGTCATCGCGGATGATAATTGTCCTCGGTAGTTGAACACGCCTGATTTGTATCATAGCTTAAGA > 2:1641561/1‑150 AGACCTAATAAAATCCAATAAATATACATTGTCCTTCTCCTGCAAGAGAATTATTTTAAATTACAATTATCCGCAGTGTTGCTTCTCGTCATCGCGGATGATAATTGTCCTCGGTAGTTGAACACGCCTGATTTGTATCATAGCTTAAGA > 2:233910/1‑150 ACCTAATAAAATCCAATAAATATACATTGTCCTTCTCCTGCAAGAGAATTATTTTAAATTACAATTATCCGCAGTGTTGCTTCTCGTCATCGCGGATGATAATTGTCCTCGGTAGTTGAACACGCCTGATTTGTATCATAGCTTAAGAATT > 1:446771/1‑151 CCTAATAAAATCCAATAAATATACATTGTCCTTCTCCTGCAAGAGAATTATTTTAAATTACAATTATCCGCAGTGTTGCTTCTCGTCATCGCGGATGATAATTGTCCTCGGTAGTTGAACACGCCTGATTTGTATCATAGCTTAAGAATTA < 1:100185/151‑1 CCTAATAAAATCCAATAAATATACATTGTCCTTCTCCTGCAAGAGAATTATTTTAAATTACAATTATCCGCAGTGTTGCTTCTCGTCATCGCGGATGATAATTGTCCTCGGTAGTTGAACACGCCTGATTTGTATCATAGCTTAAGAATT < 2:1396191/150‑1 CCTAATAAAATCCAATAAATATACATTGTCCTTCTCCTGCAAGAGAATTATTTTAAATTACAATTATCCGCAGTGTTGCTTCTCGTCATCGCGGATGATAATTGTCCTCGGTAGTTGAACACGCCTGATTTGTATCATAGCTTAAGAATT > 1:356009/1‑150 AATAAAATCCAATAAATATACATTGTCCTTCTCCTGCAAGAGAATTATTTTAAATTACAATTATCCGCAGTGTTGCTTCTCGTCATCGCGGATGATAATTGTCCTCGGTAGTTGAACACGCCTGATTTGTATCATAGCTTAAGAATTAA < 1:1513823/149‑1 ATAAAATCCAATAAATATACATTGTCCTTCTCCTGCAAGAGAATTATTTTAAATTACAATTATCCGCAGTGTTGCTTCTCGTCATCGCGGATGATAATTGTCCTCGGTAGTTGAACACGCCTGATTTGTATCATAGCTTAAGAATTAACTC < 1:964202/151‑1 AAAATCCAATAAATATACATTGTCCTTCTCCTGCAAGAGAATTATTTTAAATTACAATTATCCGCAGTGTTGCTTCTCGTCATCGCGGATGATAATTGTCCTCGGTAGTTGAACACGCCTGATTTGTATCATAGCTTAAGAATTAACTCA > 1:809540/1‑150 ATCCAATAAATATACATTGTCCTTCTCCTGCAAGAGAATTATTTTAAATTACAATTATCCGCAGTGTTGCTTCTCGTCATCGCGGATGATAATTGTCCTCGGTAGTTGAACACGCCTGATTTGTATCATAGCTTAAGAATTAACTCAAAAT > 1:15506/1‑151 CCAATAAATATACATTGTCCTTCTCCTGCAAGAGAATTATTTTAAATTACAATTATCCGCAGTGTTGCTTCTCGTCATCGCGGATGATAATTGTCCTCGGTAGTTGAACACGCCTGATTTGTATCATAGCTTAAGAATTAACTCAAAATAT < 2:90739/151‑1 ATAAATATACATTGTCCTTCTCCTGCAAGAGAATTATTTTAAATTACAATTATCCGCAGTGTTGCTTCTCGTCATCGCGGATGATAATTGTCCTCGGTAGTTGAACACGCCTGATTTGTATCATAGCTTAAGAATTAACTCAAAATATTTT < 2:292227/151‑1 ATACATTGTCCTTCTCCTGCAAGAGAATTATTTTAAATTACAATTATCCGCAGTGTTGCTTCTCGTCATCGCGGATGATAATTGTCCTCGGTAGTTGAACACGCCTGATTTGTATCATAGCTTAAGAATTAACTCAAAATATTTTCACTTC < 2:1347939/151‑1 ATACATTGTCCTTCTCCTGCAAGAGAATTATTTTAAATTACAATTATCCGCAGTGTTGCTTCTCGTCATCGCGGATGATAATTGTCCTCGGTAGTTGAACACGCCTGATTTGTATCATAGCTTAAGAATTAACTCAAAATATTTTCACTTC > 1:868271/1‑151 ATACATTGTCCTTCTCCTGCAAGAGAATTATTTTAAATTACAATTATCCGCAGTGTTGCTTCTCGTCATCGCGGATGATAATTGTCCTCGGTAGTTGAACACGCCTGATTTGTATCATAGCTTAAGAATTAACTCAAAATATTTTCACTT < 2:788160/150‑1 ACATTGTCCTTCTCCTGCAAGAGAATTATTTTAAATTACAATTATCCGCAGTGTTGCTTCTCGTCATCGCGGATGATAATTGTCCTCGGTAGTTGAACACGCCTGATTTGTATCATAGCTTAAGAATTAACTCAAAATATTTTCACTTCTT > 1:299639/1‑151 CATTGTCCTTCTCCTGCAAGAGAATTATTTTAAATTACAATTATCCGCAGTGTTGCTTCTCGTCATCGCGGATGATAATTGTCCTCGGTAGTTGAACACGCCTGATTTGTATCATAGCTTAAGAATTAACTCAAAATATTTTCACTTCTTT > 1:313033/1‑151 CATTGTCCTTCTCCTGCAAGAGAATTATTTTAAATTACAATTATCCGCAGTGTTGCTTCTCGTCATCGCGGATGATAATTGTCCTCGGTAGTTGAACACGCCTGATTTGTATCATAGCTTAAGAATTAACTCAAAATATTTTCACTTCTTT < 2:821824/151‑1 ATTGTCCTTCTCCTGCAAGAGAATTATTTTAAATTACAATTATCCGCAGTGTTGCTTCTCGTCATCGCGGATGATAATTGTCCTCGGTAGTTGAACACGCCTGATTTGTATCATAGCTTAAGAATTAACTCAAAATATTTTCACTTCTTTA < 2:265743/151‑1 ATTGTCCTTCTCCTGCAAGAGAATTATTTTAAATTACAATTATCCGCAGTGTTGCTTCTCATCATCGCGGATGATAATTGTCCTCGGTAGTTGAACACGCCTGATTTGTATCATAGCTTAAGAATTAACTCAAAATATTTTCACTTCTTTA < 1:1373197/151‑1 TGTCCTTCTCCTGCAAGAGAATTATTTTAAATTACAATTATCCGCAGTGTTGCTTCTCGTCATCGCGGATGATAATTGTCCTCGGTAGTTGAACACGCCTGATTTGTATCATAGCTTAAGAATTAACTCAAAATATTTTCACTTCTTTAC < 2:579409/150‑1 TGTCCTTCTCCTGCAAGAGAATTATTTTAAATTACAATTATCCGCAGTGTTGCTTCTCGTCATCGCGGATGATAATTGTCCTCGGTAGTTGAACACGCCTGATTTGTATCATAGCTTAAGAATTAACTCAAAATATTTTCACTTCTTTAC < 2:1536910/150‑1 CCTGCAAGAGAATTATTTTAAATTACAATTATCCGCAGTGTTGCTTCTCGTCATCGCGGATGATAATTGTCCTCGGTAGTTGAACACGCCTGATTTGTATCATAGCTTAAGAATTAACTCAAAATATTTTCACTTCTTTACCTGAGCGGTT < 2:407300/151‑1 CCTGCAAGAGAATTATTTTAAATTACAATTATCCGCAGTGTTGCTTCTCGTCATCGCGGATGATAATTGTCCTCGGTAGTTGAACACGCCTGATTTGTATCATAGCTTAAGAATTAACTCAAAATATTTTCACTTCTTTACCTGAGCGGTT > 1:1348852/1‑151 GCAAGAGAATTATTTTAAATTACAATTATCCGCAGTGTTGCTTCTCGTCATCGCGGATGATAATTGTCCTCGGTAGTTGAACACGCCTGATTTGTATCATAGCTTAAGAATTAACTCAAAATATTTTCACTTCTTTACCTGAGCGGTTTG > 2:1644242/1‑150 AGAATTATTTTAAATTACAATTATCCGCAGTGTTGCTTCTCGTCATCGCGGATGATAATTGTCCTCGGTAGTTGAACACGCCTGATTTGTATCATAGCTTAAGAATTAACTCAAAATATTTTCACTTCTTTACCTGAGCGGTTTGATTTTC < 1:812380/151‑1 AGAATTATTTTAAATTACAATTATCCGCAGTGTTGCTTCTCGTCATCGCGGATGATAATTGTCCTCGGTAGTTGAACACGCCTGATTTGTATCATAGCTTAAGAATTAACTCAAAATATTTTCACTTCTTTACCTGAGCGGTTTGATTTTC < 2:821579/151‑1 GAATTATTTTAAATTACAATTATCCGCAGTGTTGCTTCTCGTCATCGCGGATGATAATTGTCCTCGGTAGTTGAACACGCCTGATTTGTATCATAGCTTAAGAATTAACTCAAAATATTTTCACTTCTTTACCTGAGCGGTTTGATTTTCG > 1:773951/1‑151 AATTATTTTAAATTACAATTATCCGCAGTGTTGCTTCTCGTCATCGCGGATGATAATTGTCCTCGGTAGTTGAACACGCCTGATTTGTATCATAGCTTAAGAATTAACTCAAAATATTTTCACTTCTTTACCTGAGCGGTTTGATTTTCGT > 1:256500/1‑151 AATTATTTTAAATTACAATTATCCGCAGTGTTGCTTCTCGTCATCGCGGATGATAATTGTCCTCGGTAGTTGAACACGCCTGATTTGTATCATAGCTTAAGAATTAACTCAAAATATTTTCACTTCTTTACCTGAGCGGTTTGATTTTCGT < 1:448804/151‑1 ATTATTTTAAATTACAATTATCCGCAGTGTTGCTTCTCGTCATCGCGGATGATAATTGTCCTCGGTAGTTGAACACGCCTGATTTGTATCATAGCTTAAGAATTAACTCAAAATATTTTCACTTCTTTACCTGAGCGGTTTGATTTTCGTT < 1:342130/151‑1 TTATTTTAAATTACAATTATCCGCAGTGTTGCTTCTCGTCATCGCGGATGATAATTGTCCTCGGTAGTTGAACACGCCTGATTTGTATCATAGCTTAAGAATTAACTCAAAATATTTTCACTTCTTTACCTGAGCGGTTTGATTTTCGTT > 2:218930/1‑150 TTATTTTAAATTACAATTATCCGCAGTGTTGCTTCTCGTCATCGCGGATGATAATTGTCCTCGGTAGTTGAACACGCCTGATTTGTATCATAGCTTAAGAATTAACTCAAAATATTTTCACTTCTTTACCTGAGCGGTTTGATTTTCGTT > 2:661814/1‑150 TATTTTAAATTACAATTATCCGCAGTGTTGCTTCTCGTCATCGCGGATGATAATTGTCCTCGGTAGTTGAACACGCCTGATTTGTATCATAGCTTAAGAATTAACTCAAAATATTTTCACTTCTTTACCTGAGCGGTTTGATTTTCGTTAT > 2:74938/1‑151 TATTTTAAATTACAATTATCCGCAGTGTTGCTTCTCGTCATCGCGGATGATAATTGTCCTCGGTAGTTGAACACGCCTGATTTGTATCATAGCTTAAGAATTAACTCAAAATATTTTCACTTCTTTACCTGAGCGGTTTGATTTTCGTTAT > 1:998910/1‑151 TATTTTAAATTACAATTATCCGCAGTGTTGCTTCTCGTCATCGCGGATGATAATTGTCCTCGGTAGTTGAACACGCCTGATTTGTATCATAGCTTAAGAATTAACTCAAAATATTTTCACTTCTTTACCTGAGCGGTTTGATTTTCGTTA > 1:271017/1‑150 ATTTTAAATTACAATTATCCGCAGTGTTGCTTCTCGTCATCGCGGATGATAATTGTCCTCGGTAGTTGAACACGCCTGATTTGTATCATAGCTTAAGAATTAACTCAAAATATTTTCACTTCTTTACCTGAGCGGTTTGATTTTCGTTAT < 2:790441/150‑1 ATTTTAAATTACAATTATCCGCAGTGTTGCTTCTCGTCATCGCGGATGATAATTGTCCTCGGTAGTTGAACACGCCTGATTTGTATCATAGCTTAAGAATTAACTCAAAATATTTTCACTTCTTTACCTGAGCGGTTTGATTTTCGTTAT < 2:1051292/150‑1 TTTTAAATTACAATTATCCGCAGTGTTGCTTCTCGTCATCGCGGATGATAATTGTCCTCGGTAGTTGAACACGCCTGATTTGTATCATAGCTTAAGAATTAACTCAAAATATTTTCACTTCTTTACCTGAGCGGTTTGATTTTCGTTAT > 2:833463/1‑149 TTAAATTACAATTATCCGCAGTGTTGCTTCTCGTCATCGCGGATGATAATTGTCCTCGGTAGTTGAACACGCCTGATTTGTATCATAGCTTAAGAATTAACTCAAAATATTTTCACTTCTTTACCTGAGCGGTTTGATTTTCGTTATGAT < 2:1346375/150‑1 AAATTACAATTATCCGCAGTGTTGCTTCTCGTCATCGCGGATGATAATTGTCCTCGGTAGTTGAACACGCCTGATTTGTATCATAGCTTAAGAATTAACTCAAAATATTTTCACTTCTTTACCTGAGCGGTTTGATTTTCGTTATGATGAC > 2:1141837/1‑151 AAATTACAATTATCCGCAGTGTTGCTTCTCGTCATCGCGGATGATAATTGTCCTCGGTAGTTGAACACGCCTGATTTGTATCATAGCTTAAGAATTAACTCAAAATATTTTCACTTCTTTACCTGAGCGGTTTGATTTTCGTTATGATGAC < 2:1486341/151‑1 CCAGCATTAAAATAAAGCCGCCATTTCCCTCACTGACGCTCGCCCATTTCATTGACAGCGTACCGGTAATTTCTGTAGCAATAGCCAGACCTAATAAAATCCAATAAATATACATTGTCCTTCTCCTGCAAGAGAATTATTTTAA‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > NC_000913/1673387‑1673531‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ATTACAATTATCCGCAGTGTTGCTTCTCGTCATCGCGGATGATAATTGTCCTCGGTAGTTGAACACGCCTGATTTGTATCATAGCTTAAGAATTAACTCAAAATATTTTCACTTCTTTACCTGAGCGGTTTGATTTTCGTTATGATGAC > NC_000913/1673713‑1673861 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |