| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| MC JC | NC_000913 | 1,673,532 | Δ181 bp | intergenic (‑31/‑201) | mdtJ ← / → tqsA | multidrug efflux system transporter/pheromone AI‑2 transporter |
| Missing coverage evidence... | ||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | start | end | size | ←reads | reads→ | gene | description | |||
| * | * | ÷ | NC_000913 | 1673532 | 1673712 | 181 | 124 [0] | [0] 125 | mdtJ/tqsA | multidrug efflux system transporter/pheromone AI‑2 transporter |
| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | = 1673531 | 0 (0.000) | 124 (1.130) | 101/298 | 0.0 | 100% | intergenic (‑30/‑382) | mdtJ/tqsA | multidrug efflux system transporter/pheromone AI‑2 transporter |
| ? | NC_000913 | 1673713 = | 0 (0.000) | intergenic (‑212/‑200) | mdtJ/tqsA | multidrug efflux system transporter/pheromone AI‑2 transporter | |||||
Only 100 of 125 total aligned reads displayed.
CAAGCCCCGCGCATAGCGCAAGCTTTGGCAGAAGAAAGGACTAAAGCGCGTTGCGCCAGTGCTGCTCACCTACGAGCAAGATAGTGGATGAGGTACGAAGATGGGTAAATGTAGAAAATAACGTCCTGAACAAATTGTCCATAATATTACAATTATCCGCAGTGTTGCTTCTCGTCATCGCGGATGATAATTGTCCTCGGTAGTTGAACACGCCTGATTTGTATCATAGCTTAAGAATTAACTCAAAATATTTTCACTTCTTTACCTGAGCGGTTTGATTTTCGTTATGATGACGG > NC_000913/1673568‑1673863 | ccagcattaaaataaagccgccatttccctcactgacgctcgcccatttcattgacagcgtaccggtaatttctgtagcaatagccagacctaataaaatccaataaatatacattgtccttctcctgcaagagaattattttaaATTAc > 2:673572‑M2/146‑150 (MQ=255)ccagcattaaaataaagccgccatttccctcactgacgctcgcccatttcattgacagcgtaccggtaatttctgtagcaatagccagacctaataaaatccaataaatatacattgtccttctcctgcaagagaattattttaaATTACa < 2:1478969‑M2/6‑1 (MQ=255) agcattaaaataaagccgccatttccctcactgacgctcgcccatttcattgacagcgtaccggtaatttctgtagcaatagccagacctaataaaatccaataaatatacattgtccttctcctgcaagagaattattttaaATTACAAt < 1:749980‑M2/8‑1 (MQ=255) agcattaaaataaagccgccatttccctcactgacgctcgcccatttcattgacagcgtaccggtaatttctgtagcaatagccagacctaataaaatccaataaatatacattgtccttctcctgcaagagaattattttaaATTACAAt < 1:796722‑M2/8‑1 (MQ=255) cattaaaataaagccgccatttccctcactgacgctcgcccatttcattgacagcgtaccggtaatttctgtagcaatagccagacctaataaaatccaataaatatacattgtccttctcctgcaagagaattattttaaATTACAAtt > 1:788135‑M2/142‑150 (MQ=255) ttaaaataaagccgccatttccctcactgacgctcgcccatttcattgacagcgtaccggtaatttctgtagcaatagccagacctaataaaatccaataaatatacattgtccttctcctgcaagagaattattttaaATTACAATTATc > 1:471089‑M2/140‑151 (MQ=255) aaaataaagccgccatttccctcactgacgctcgcccatttcattgacagcgtaccggtaatttctgtagcaatagccagacctaataaaatccaataaatatacattgtccttctcctgcaagagaattattttaaATTACAATTATcc < 1:977001‑M2/13‑1 (MQ=255) aaaataaagccgccatttccctcactgacgctcgcccatttcattgacagcgtaccggtaatttctgtagcaatagccagacctaataaaatccaataaatatacattgtccttctcctgcaagagaattattttaaATTACAATTATCCg < 1:23804‑M2/14‑1 (MQ=255) aaataaagccgccatttccctcactgacgctcgcccatttcattgacagcgtaccggtaatttctgtagcaatagccagacctaataaaatccaataaatatacattgtccttctcctgcaagagaattattttaaATTACAATTATCCGc < 2:199429‑M2/15‑1 (MQ=255) aaataaagccgccatttccctcactgacgctcgcccatttcattgacagcgtaccggtaatttctgtagcaatagccagacctaataaaatccaataaatatacattgtccttctcctgcaagagaattattttaaATTACAATTATCCGc < 2:1292952‑M2/15‑1 (MQ=255) ataaagccgccatttccctcactgacgctcgcccatttcattgacagcgtaccggtaatttctgtagcaatagccagacctaataaaatccaataaatatacattgtccttctcctgcaagagaattattttaaATTACAATTATCCGCAg < 1:1647717‑M2/17‑1 (MQ=255) ataaagccgccatttccctcactgacgctcgcccatttcattgacagcgtaccggtaatttctgtagcaatagccacacctaataaaatccaataaatatacattgtccttctcctgcaagagaattattttaaATTACAATTATCCGc > 1:537572‑M2/135‑149 (MQ=255) taaagccgccatttccctcactgacgctcgcccatttcattgacagcgtaccggtaatttctgtagcaatagccagacctaataaaatccaataaatatacattgtccttctcctgcaagagaattattttaaATTACAATTATCCGCAgt > 1:796861‑M2/134‑151 (MQ=255) aaagccgccatttccctcactgacgctcgcccatttcattgacagcgtaccggtaatttctgtagcaatagccagacctaataaaatccaataaatatacattgtccttctcctgcaagagaattattttaaATTACAATTATCCGCAgtg > 1:758677‑M2/133‑151 (MQ=255) aaagccgccatttccctcactgacgctcgcccatttcattgacagcgtaccggtaatttctgtagcaatagccagacctaataaaatccaataaatatacattgtccttctcctgcaagagaattattttaaATTACAATTATCCGCAgt < 2:689883‑M2/18‑1 (MQ=255) aagccgccatttccctcactgacgctcgcccatttcattgacagcgtaccggtaatttctgtagcaatagccagacctaataaaatccaataaatatacattgtccttctcctgcaagagaattattttaaATTACAATTATCCGCAgtgt > 1:679169‑M2/132‑151 (MQ=255) gccgccatttccctcactgacgctcgcccatttcattgacagcgtaccggtaatttctgtagcaatagccagacctaataaaatccaataaatatacattgtccttctcctgcaagagaattattttaaATTACAATTATCCGCAGTGTTg > 2:4796‑M2/130‑151 (MQ=255) cgccatttccctcactgacgctcgcccatttcattgacagcgtaccggtaatttctgtagcaatagccagacctaataaaatccaataaatatacattgtccttctcctgcaagagaattattttaaATTACAATTATCCGCAGTGTTGCt > 2:46358‑M2/128‑151 (MQ=255) catttccctcactgacgctcgcccatttcattgacagcgtaccggtaatttctgtagcaatagccagacctaataaaatccaataaatatacattgtccttctcctgcaagagaattattttaaATTACAATTATCCGCAGTGTTGCTtct > 1:777775‑M2/125‑151 (MQ=255) tttccctcactgacgctcgcccatttcattgacagcgtaccggtaatttctgtagcaatagccagacctaataaaatccaataaatatacattgtccttctcctgcaagagaattattttaaATTACAATTATCCGCAGTGTTGCTTCTCg > 2:813672‑M2/123‑151 (MQ=255) ttccctcactgacgctcgcccatttcattgacagcgtaccggtaatttctgtagcaatagccagacctaataaaatccaataaatatacattgtccttctcctgcaagagaattattttaaATTACAATTATCCGCAGTGTTGCTTCTCg < 2:934009‑M2/29‑1 (MQ=255) tccctcactgacgctcgcccatttcattgacagcgtaccggtaatttctgtagcaatagccagacctaataaaatccaataaatatacattgtccttctcctgcaagagaattattttaaATTACAATTATCCGCAGTGTTGCTTCTCGTc > 2:1163240‑M2/121‑151 (MQ=255) cactgacgctcgcccatttcattgacagcgtaccggtaatttctgtagcaatagccagacctaataaaatccaataaatatacattgtccttctcctgcaagagaattattttaaATTACAATTATCCGCAGTGTTGCTTCTCGTCATcgc < 1:1294072‑M2/36‑1 (MQ=255) actgacgctcgcccatttcattgacagcgtaccggtaatttctgtagcaatagccagacctaataaaatccaataaatatacattgtccttctcctgcaagagaattattttaaATTACAATTATCCGCAGTGTTGCTTCTCGTCATcgcg > 2:1282794‑M2/115‑151 (MQ=255) actgacgctcgcccatttcattgacagcgtaccggtaatttctgtagcaatagccagacctaataaaatccaataaatatacattgtccttctcctgcaagagaattattttaaATTACAATTATCCGCAGTGTTGCTTCTCGTCATcgcg > 2:1529992‑M2/115‑151 (MQ=255) tgacgctcgcccatttcattgacagcgtaccggtaatttctgtagcaatagccagacctaataaaatccaataaatatacattgtccttctcctgcaagagaattattttaaATTACAATTATCCGCAGTGTTGCTTCTCGTCATCGCgg > 1:1683454‑M2/113‑150 (MQ=255) cgctcgcccatttcattgacagcgtaccggtaatttctgtagcaatagccagacctaataaaatccaataaatatacattgtccttctcctgcaagagaattattttaaATTACAATTATCCGCAGTGTTGCTTCTCGTCATCGCGgatga < 1:1058245‑M2/42‑1 (MQ=255) gctcgcccatttcattgacagcgtaccggtaatttctgtagcaatagccagacctaataaaatccaataaatatacattgtccttctcctgcaagagaattattttaaATTACAATTATCCGCAGTGTTGCTTCTCGTCATCGCGgatgat > 2:1547620‑M2/109‑151 (MQ=255) cccatttcattgacagcgtaccggtaatttctgtagcaatagccagacctaataaaatccaataaatatacattgtccttctcctgcaagagaattattttaaATTACAATTATCCGCAGTGTTGCTTCTCGTCATCGCGGATGATAATTg > 1:501757‑M2/104‑151 (MQ=255) catttcattgacagcgtaccggtaatttctgtagcaatagccagacctaataaaatccaataaatatacattgtccttctcctgcaagagaattattttaaATTACAATTATCCGCAGTGTTGCTTCTCGTCATCGCGGATGATAATTGTc > 2:137899‑M2/102‑151 (MQ=255) atttcattgacagcgtaccggtaatttctgtagcaatagccagacctaataaaatccaataaatatacattgtccttctcctgcaagagaattattttaaATTACAATTATCCGCAGTGTTGCTTCTCGTCATCGCGGATGATAATTGTcc > 1:1367356‑M2/101‑151 (MQ=255) tcattgacagcgtaccggtaatttctgtagcaatagccagacctaataaaatccaataaatatacattgtccttctcctgcaagagaattattttaaATTACAATTATCCGCAGTGTTGCTTCTCGTCATCGCGGATGATAATTGTCCTc < 2:1131021‑M2/53‑1 (MQ=255) tgacagcgtaccggtaatttctgtagcaatagccagacctaataaaatccaataaatatacattgtccttctcctgcaagagaattattttaaATTACAATTATCCGCAGTGTTGCTTCTCGTCATCGCGGATGATAATTGTCCTCGGt > 1:1205154‑M2/94‑149 (MQ=255) tgacagcgtaccggtaatttctgtagcaatagccagacctaataaaatccaataaatatacattgtccttctcctgcaagagaattattttaaATTACAATTATCCGCAGTGTTGCTTCTCGTCATCGCGGATGATAATTGTCCTCGGTa < 2:1144933‑M2/57‑1 (MQ=255) gacagcgtaccggtaatttctgtagcaatagccagacctaataaaatccaataaatatacattgtccttctcctgcaagagaattattttaaATTACAATTATCCGCAGTGTTGCTTCTCGTCATCGCGGATGATAATTGTCCTCGGTAg < 1:1468994‑M2/58‑1 (MQ=255) gacagcgtaccggtaatttctgtagcaatagccagacctaataaaatccaataaatatacattgtccttctcctgcaagagaattattttaaATTACAATTATCCGCAGTGTTGCTTCTCGTCATCGCGGATGATAATTGTCCTCGGTAGt > 2:802171‑M2/93‑151 (MQ=255) gacagcgtaccggtaatttctgtagcaatagccagacctaataaaatccaataaatatacattgtccttctcctgcaagagaattattttaaATTACAATTATCCGCAGTGTTGCTTCTCGTCATCGCGGATGATAATTGTCCTCGGTAGt < 2:343156‑M2/59‑1 (MQ=255) cagcgtaccggtaatttctgtagcaatagccagacctaataaaatccaataaatatacattgtccttctcctgcaagagaattattttaaATTACAATTATCCGCAGTGTTGCTTCTCGTCATCGCGGATGATAATTGTCCTCGGTAGTTg > 1:447473‑M2/91‑151 (MQ=255) gtaccggtaatttctgtagcaatagccagacctaataaaatccaataaatatacattgtccttctcctgcaagagaattattttaaATTACAATTATCCGCAGTGTTGCTTCTCGTCATCGCGGATGATAATTGTCCTCGGTAGTTGAac > 2:904391‑M2/87‑150 (MQ=255) taccggtaatttctgtagcaatagccagacctaataaaatccaataaatatacattgtccttctcctgcaagagaattattttaaATTACAATTATCCGCAGTGTTGCTTCTCGTCATCGCGGATGATAATTGTCCTCGGTAGTTGAacac > 2:1325700‑M2/86‑151 (MQ=255) accggtaatttctgtagcaatagccagacctaataaaatccaataaatatacattgtccttctcctgcaagagaattattttaaATTACAATTATCCGCAGTGTTGCTTCTCGTCATCGCGGATGATAATTGTCCTCGGTAGTTGAacac < 2:447143‑M2/66‑1 (MQ=255) cggtaatttctgtagcaatagccagacctaataaaatccaataaatatacattgtccttctcctgcaagagaattattttaaATTACAATTATCCGCAGTGTTGCTTCTCGTCATCGCGGATGATAATTGTCCTCGGTAGTTGAACACGcc < 1:407455‑M2/69‑1 (MQ=255) ggtaatttctgtagcaatagccagacctaataaaatccaataaatatacattgtccttctcctgcaagagaattattttaaATTACAATTATCCGCAGTGTTGCTTCTCGTCATCGCGGATGATAATTGTCCTCGGTAGTTGAACACGcc > 2:28721‑M2/82‑150 (MQ=255) aatttctgtagcaatagccagacctaataaaatccaataaatatacattgtccttctcctgcaagagaattattttaaATTACAATTATCCGCAGTGTTGCTTCTCGTCATCGCGGATGATAATTGTCCTCGGTAGTTGAACACGCCTGa < 2:393450‑M2/72‑1 (MQ=255) ttctgtagcaatagccagacctaataaaatccaataaatatacattgtccttctcctgcaagagaattattttaaATTACAATTATCCGCAGTGTTGCTTCTCGTCATCGCGGATGATAATTGTCCTCGGTAGTTGAACACGCCTGAttt < 1:7302‑M2/75‑1 (MQ=255) ttctgtagcaatagccagacctaataaaatccaataaatatacattgtccttctcctgcaagagaattattttaaATTACAATTATCCGCAGTGTTGCTTCTCGTCATCGCGGATGATAATTGTCCTCGGTAGTTGAACACGCCTGAttt < 2:1620486‑M2/75‑1 (MQ=255) ctgtagcaatagccagacctaataaaatccaataaatatacattgtccttctcctgcaagagaattattttaaATTACAATTATCCGCAGTGTTGCTTCTCGTCATCGCGGATGATAATTGTCCTCGGTAGTTGAACACGCCTGATTTGt > 1:1585048‑M2/74‑150 (MQ=255) gtagcaatagccagacctaataaaatccaataaatatacattgtccttctcctgcaagagaattattttaaATTACAATTATCCGCAGTGTTGCTTCTCGTCATCGCGGATGATAATTGTCCTCGGTAGTTGAACACGCCTGATTTGt < 1:275969‑M2/77‑1 (MQ=255) gtagcaatagccagacctaataaaatccaataaatatacattgtccttctcctgcaagagaattattttaaATTACAATTATCCGCAGTGTTGCTTCTCGTCATCGCGGATGATAATTGTCCTCGGTAGTTGAACACGCCTGATTTGTAt < 1:1218706‑M2/79‑1 (MQ=255) agcaatagccagacctaataaaatccaataaatatacattgtccttctcctgcaagagaattattttaaATTACAATTATCCGCAGTGTTGCTTCTCGTCATCGCGGATGATAATTGTCCTCGGTAGTTGAACACGCCTGATTTGTATCAt > 1:1615526‑M2/70‑151 (MQ=255) atagccagacctaataaaatccaataaatatacattgtccttctcctgcaagagaattattttaaATTACAATTATCCGCAGTGTTGCTTCTCGTCATCGCGGATGATAATTGTCCTCGGTAGTTGAACACGCCTGATTTGTATCATAGCt < 1:770554‑M2/86‑1 (MQ=255) agccagacctaataaaatccaataaatatacattgtccttctcctgcaagagaattattttaaATTACAATTATCCGCAGTGTTGCTTCTCGTCATCGCGGATGATAATTGTCCTCGGTAGTTGAACACGCCTGATTTGTATCATAGCtt > 1:92627‑M2/64‑150 (MQ=255) agccagacctaataaaatccaataaatatacattgtccttctcctgcaagagaattattttaaATTACAATTATCCGCAGTGTTGCTTCTCGTCATCGCGGATGATAATTGTCCTCGGTAGTTGAACACGCCTGATTTGTATCATAGCtt > 2:311211‑M2/64‑150 (MQ=255) gccagacctaataaaatccaataaatatacattgtccttctcctgcaagagaattattttaaATTACAATTATCCGCAGTGTTGCTTCTCGTCATCGCGGATGATAATTGTCCTCGGTAGTTGAACACGCCTGATTTGTATCATAGCTTa > 2:932451‑M2/63‑150 (MQ=255) ccagacctaataaaatccaataaatatacattgtccttctcctgcaagagaattattttaaATTACAATTATCCGCAGTGTTGCTTCTCGTCATCGCGGATGATAATTGTCCTCGGTAGTTGAACACGCCTGATTTGTATCATAGCTTAAg < 1:952318‑M2/90‑1 (MQ=255) cagacctaataaaatccaataaatatacattgtccttctcctgcaagagaattattttaaATTACAATTATCCGCAGTGTTGCTTCTCGTCATCGCGGATGATAATTGTCCTCGGTAGTTGAACACGCCTGATTTGTATCATAGCTTAAGa < 1:1509873‑M2/91‑1 (MQ=255) cagacctaataaaatccaataaatatacattgtccttctcctgcaagagaattattttaaATTACAATTATCCGCAGTGTTGCTTCTCGTCATCGCGGATGATAATTGTCCTCGGTAGTTGAACACGCCTGATTTGTATCATAGCTTAAGa < 2:676295‑M2/91‑1 (MQ=255) agacctaataaaatccaataaatatacattgtccttctcctgcaagagaattattttaaATTACAATTATCCGCAGTGTTGCTTCTCGTCATCGCGGATGATAATTGTCCTCGGTAGTTGAACACGCCTGATTTGTATCATAGCTTAAGa > 2:1641561‑M2/60‑150 (MQ=255) agacctaataaaatccaataaatatacattgtccttctcctgcaagagaattattttaaATTACAATTATCCGCAGTGTTGCTTCTCGTCATCGCGGATGATAATTGTCCTCGGTAGTTGAACACGCCTGATTTGTATCATAGCTTAAGa > 2:233910‑M2/60‑150 (MQ=255) agacctaataaaatccaataaatatacattgtccttctcctgcaagagaattattttaaATTACAATTATCCGCAGTGTTGCTTCTCGTCATCGCGGATGATAATTGTCCTCGGTAGTTGAACACGCCTGATTTGTATCATAGCTTAAGa > 1:704990‑M2/60‑150 (MQ=255) agacctaataaaatccaataaatatacattgtccttctcctgcaagagaattattttaaATTACAATTATCCGCAGTGTTGCTTCTCGTCATCGCGGATGATAATTGTCCTCGGTAGTTGAACACGCCTGATTTGTATCATAGCTTAAGa > 1:349127‑M2/60‑150 (MQ=255) cctaataaaatccaataaatatacattgtccttctcctgcaagagaattattttaaATTACAATTATCCGCAGTGTTGCTTCTCGTCATCGCGGATGATAATTGTCCTCGGTAGTTGAACACGCCTGATTTGTATCATAGCTTAAGAAtt < 2:1396191‑M2/94‑1 (MQ=255) cctaataaaatccaataaatatacattgtccttctcctgcaagagaattattttaaATTACAATTATCCGCAGTGTTGCTTCTCGTCATCGCGGATGATAATTGTCCTCGGTAGTTGAACACGCCTGATTTGTATCATAGCTTAAGAAtt > 1:356009‑M2/57‑150 (MQ=255) cctaataaaatccaataaatatacattgtccttctcctgcaagagaattattttaaATTACAATTATCCGCAGTGTTGCTTCTCGTCATCGCGGATGATAATTGTCCTCGGTAGTTGAACACGCCTGATTTGTATCATAGCTTAAGAATTa < 1:100185‑M2/95‑1 (MQ=255) aataaaatccaataaatatacattgtccttctcctgcaagagaattattttaaATTACAATTATCCGCAGTGTTGCTTCTCGTCATCGCGGATGATAATTGTCCTCGGTAGTTGAACACGCCTGATTTGTATCATAGCTTAAGAATTaa < 1:1513823‑M2/96‑1 (MQ=255) ataaaatccaataaatatacattgtccttctcctgcaagagaattattttaaATTACAATTATCCGCAGTGTTGCTTCTCGTCATCGCGGATGATAATTGTCCTCGGTAGTTGAACACGCCTGATTTGTATCATAGCTTAAGAATTAACTc < 1:964202‑M2/99‑1 (MQ=255) atccaataaatatacattgtccttctcctgcaagagaattattttaaATTACAATTATCCGCAGTGTTGCTTCTCGTCATCGCGGATGATAATTGTCCTCGGTAGTTGAACACGCCTGATTTGTATCATAGCTTAAGAATTAACTCAAAat > 1:15506‑M2/48‑151 (MQ=255) ccaataaatatacattgtccttctcctgcaagagaattattttaaATTACAATTATCCGCAGTGTTGCTTCTCGTCATCGCGGATGATAATTGTCCTCGGTAGTTGAACACGCCTGATTTGTATCATAGCTTAAGAATTAACTCAAAatat < 2:90739‑M2/106‑1 (MQ=255) aataaatatacattgtccttctcctgcaagagaattattttaaATTACAATTATCCGCAGTGTTGCTTCTCGTCATCGCGGATGATAATTGTCCTCGGTAGTTGAACACGCCTGATTTGTATCATAGCTTAAGAATTAACTCAAAATAttt > 1:1445233‑M2/44‑151 (MQ=255) atacattgtccttctcctgcaagagaattattttaaATTACAATTATCCGCAGTGTTGCTTCTCGTCATCGCGGATGATAATTGTCCTCGGTAGTTGAACACGCCTGATTTGTATCATAGCTTAAGAATTAACTCAAAATATTTTCActtc < 2:1347939‑M2/115‑1 (MQ=255) atacattgtccttctcctgcaagagaattattttaaATTACAATTATCCGCAGTGTTGCTTCTCGTCATCGCGGATGATAATTGTCCTCGGTAGTTGAACACGCCTGATTTGTATCATAGCTTAAGAATTAACTCAAAATATTTTCActtc > 1:868271‑M2/37‑151 (MQ=255) atacattgtccttctcctgcaagagaattattttaaATTACAATTATCCGCAGTGTTGCTTCTCGTCATCGCGGATGATAATTGTCCTCGGTAGTTGAACACGCCTGATTTGTATCATAGCTTAAGAATTAACTCAAAATATTTTCActt < 2:788160‑M2/114‑1 (MQ=255) acattgtccttctcctgcaagagaattattttaaATTACAATTATCCGCAGTGTTGCTTCTCGTCATCGCGGATGATAATTGTCCTCGGTAGTTGAACACGCCTGATTTGTATCATAGCTTAAGAATTAACTCAAAATATTTTCActtctt > 1:299639‑M2/35‑151 (MQ=255) acattgtccttctcctgcaagagaattattttaaATTACAATTATCCGCAGTGTTGCTTCTCGTCATCGCGGATGATAATTGTCCTCGGTAGTTGAACACGCCTGATTTGTATCATAGCTTAAGAATTAACTCAAAATATTTTCActtct < 1:1530143‑M2/116‑1 (MQ=255) cattgtccttctcctgcaagagaattattttaaATTACAATTATCCGCAGTGTTGCTTCTCGTCATCGCGGATGATAATTGTCCTCGGTAGTTGAACACGCCTGATTTGTATCATAGCTTAAGAATTAACTCAAAATATTTTCACTTCttt > 1:313033‑M2/34‑151 (MQ=255) cattgtccttctcctgcaagagaattattttaaATTACAATTATCCGCAGTGTTGCTTCTCGTCATCGCGGATGATAATTGTCCTCGGTAGTTGAACACGCCTGATTTGTATCATAGCTTAAGAATTAACTCAAAATATTTTCACTTCttt < 2:821824‑M2/118‑1 (MQ=255) attgtccttctcctgcaagagaattattttaaATTACAATTATCCGCAGTGTTGCTTCTCGTCATCGCGGATGATAATTGTCCTCGGTAGTTGAACACGCCTGATTTGTATCATAGCTTAAGAATTAACTCAAAATATTTTCACTTCTTTa < 2:265743‑M2/119‑1 (MQ=255) attgtccttctcctgcaagagaattattttaaATTACAATTATCCGCAGTGTTGCTTCTCATCATCGCGGATGATAATTGTCCTCGGTAGTTGAACACGCCTGATTTGTATCATAGCTTAAGAATTAACTCAAAATATTTTCACTTCTTTa < 1:1373197‑M2/119‑1 (MQ=255) tgtccttctcctgcaagagaattattttaaATTACAATTATCCGCAGTGTTGCTTCTCGTCATCGCGGATGATAATTGTCCTCGGTAGTTGAACACGCCTGATTTGTATCATAGCTTAAGAATTAACTCAAAATATTTTCACTTCTTTAc < 2:1536910‑M2/120‑1 (MQ=255) tgtccttctcctgcaagagaattattttaaATTACAATTATCCGCAGTGTTGCTTCTCGTCATCGCGGATGATAATTGTCCTCGGTAGTTGAACACGCCTGATTTGTATCATAGCTTAAGAATTAACTCAAAATATTTTCACTTCTTTAc < 2:579409‑M2/120‑1 (MQ=255) gtccttctcctgcaagagaattattttaaATTACAATTATCCGCAGTGTTGCTTCTCGTCATCGCGGATGATAATTGTCCTCGGTAGTTGAACACGCCTGATTTGTATCATAGCTTAAGAATTAACTCAAAATATTTTCACTTCTTTACCt < 2:1332462‑M2/122‑1 (MQ=255) cctgcaagagaattattttaaATTACAATTATCCGCAGTGTTGCTTCTCGTCATCGCGGATGATAATTGTCCTCGGTAGTTGAACACGCCTGATTTGTATCATAGCTTAAGAATTAACTCAAAATATTTTCACTTCTTTACCTGAGCGGtt < 2:407300‑M2/130‑1 (MQ=255) cctgcaagagaattattttaaATTACAATTATCCGCAGTGTTGCTTCTCGTCATCGCGGATGATAATTGTCCTCGGTAGTTGAACACGCCTGATTTGTATCATAGCTTAAGAATTAACTCAAAATATTTTCACTTCTTTACCTGAGCGGtt < 1:901225‑M2/130‑1 (MQ=255) cctgcaagagaattattttaaATTACAATTATCCGCAGTGTTGCTTCTCGTCATCGCGGATGATAATTGTCCTCGGTAGTTGAACACGCCTGATTTGTATCATAGCTTAAGAATTAACTCAAAATATTTTCACTTCTTTACCTGAGCGGtt > 1:1348852‑M2/22‑151 (MQ=255) tgcaagagaattattttaaATTACAATTATCCGCAGTGTTGCTTCTCGTCATCGCGGATGATAATTGTCCTCGGTAGTTGAACACGCCTGATTTGTATCATAGCTTAAGAATTAACTCAAAATATTTTCACTTCTTTACCTGAGCGGTTTg > 2:288076‑M2/20‑151 (MQ=255) gcaagagaattattttaaATTACAATTATCCGCAGTGTTGCTTCTCGTCATCGCGGATGATAATTGTCCTCGGTAGTTGAACACGCCTGATTTGTATCATAGCTTAAGAATTAACTCAAAATATTTTCACTTCTTTACCTGAGCGGTTTg > 2:1644242‑M2/19‑150 (MQ=255) caagagaattattttaaATTACAATTATCCGCAGTGTTGCTTCTCGTCATCGCGGATGATAATTGTCCTCGGTAGTTGAACACGCCTGATTTGTATCATAGCTTAAGAATTAACTCAAAATATTTTCACTTCTTTACCTGAGCGGTTTGAt > 1:463728‑M2/18‑151 (MQ=255) agaattattttaaATTACAATTATCCGCAGTGTTGCTTCTCGTCATCGCGGATGATAATTGTCCTCGGTAGTTGAACACGCCTGATTTGTATCATAGCTTAAGAATTAACTCAAAATATTTTCACTTCTTTACCTGAGCGGTTTGATTTTc < 2:821579‑M2/138‑1 (MQ=255) agaattattttaaATTACAATTATCCGCAGTGTTGCTTCTCGTCATCGCGGATGATAATTGTCCTCGGTAGTTGAACACGCCTGATTTGTATCATAGCTTAAGAATTAACTCAAAATATTTTCACTTCTTTACCTGAGCGGTTTGATTTTc < 1:812380‑M2/138‑1 (MQ=255) aattattttaaATTACAATTATCCGCAGTGTTGCTTCTCGTCATCGCGGATGATAATTGTCCTCGGTAGTTGAACACGCCTGATTTGTATCATAGCTTAAGAATTAACTCAAAATATTTTCACTTCTTTACCTGAGCGGTTTGATTTTCGt < 1:448804‑M2/140‑1 (MQ=255) attattttaaATTACAATTATCCGCAGTGTTGCTTCTCGTCATCGCGGATGATAATTGTCCTCGGTAGTTGAACACGCCTGATTTGTATCATAGCTTAAGAATTAACTCAAAATATTTTCACTTCTTTACCTGAGCGGTTTGATTTTCGtt < 1:342130‑M2/141‑1 (MQ=255) ttattttaaATTACAATTATCCGCAGTGTTGCTTCTCGTCATCGCGGATGATAATTGTCCTCGGTAGTTGAACACGCCTGATTTGTATCATAGCTTAAGAATTAACTCAAAATATTTTCACTTCTTTACCTGAGCGGTTTGATTTTCGtt > 2:661814‑M2/10‑150 (MQ=255) tattttaaATTACAATTATCCGCAGTGTTGCTTCTCGTCATCGCGGATGATAATTGTCCTCGGTAGTTGAACACGCCTGATTTGTATCATAGCTTAAGAATTAACTCAAAATATTTTCACTTCTTTACCTGAGCGGTTTGATTTTCGTTat > 2:74938‑M2/9‑151 (MQ=255) tattttaaATTACAATTATCCGCAGTGTTGCTTCTCGTCATCGCGGATGATAATTGTCCTCGGTAGTTGAACACGCCTGATTTGTATCATAGCTTAAGAATTAACTCAAAATATTTTCACTTCTTTACCTGAGCGGTTTGATTTTCGTTat > 1:998910‑M2/9‑151 (MQ=255) tattttaaATTACAATTATCCGCAGTGTTGCTTCTCGTCATCGCGGATGATAATTGTCCTCGGTAGTTGAACACGCCTGATTTGTATCATAGCTTAAGAATTAACTCAAAATATTTTCACTTCTTTACCTGAGCGGTTTGATTTTCGTTat > 2:1597978‑M2/9‑151 (MQ=255) tattttaaATTACAATTATCCGCAGTGTTGCTTCTCGTCATCGCGGATGATAATTGTCCTCGGTAGTTGAACACGCCTGATTTGTATCATAGCTTAAGAATTAACTCAAAATATTTTCACTTCTTTACCTGAGCGGTTTGATTTTCGTTa > 1:271017‑M2/9‑150 (MQ=255) attttaaATTACAATTATCCGCAGTGTTGCTTCTCGTCATCGCGGATGATAATTGTCCTCGGTAGTTGAACACGCCTGATTTGTATCATAGCTTAAGAATTAACTCAAAATATTTTCACTTCTTTACCTGAGCGGTTTGATTTTCGTTat < 2:790441‑M2/143‑1 (MQ=255) ttttaaATTACAATTATCCGCAGTGTTGCTTCTCGTCATCGCGGATGATAATTGTCCTCGGTAGTTGAACACGCCTGATTTGTATCATAGCTTAAGAATTAACTCAAAATATTTTCACTTCTTTACCTGAGCGGTTTGATTTTCGTTat > 2:833463‑M2/7‑149 (MQ=255) aaATTACAATTATCCGCAGTGTTGCTTCTCGTCATCGCGGATGATAATTGTCCTCGGTAGTTGAACACGCCTGATTTGTATCATAGCTTAAGAATTAACTCAAAATATTTTCACTTCTTTACCTGAGCGGTTTGATTTTCGTTATGATGAc > 2:1141837‑M2/3‑151 (MQ=255) atTACAATTATCCGCAGTGTTGCTTCTCGTCATCGCGGATGATAATTGTCCTCGGTAGTTGAACACGCCTGATTTGTATCATAGCTTAAGAATTAACTCAAAATATTTTCACTTCTTTACCTGAGCGGTTTGATTTTCGTTATGATGACgg < 1:219994/151‑1 (MQ=255) | CAAGCCCCGCGCATAGCGCAAGCTTTGGCAGAAGAAAGGACTAAAGCGCGTTGCGCCAGTGCTGCTCACCTACGAGCAAGATAGTGGATGAGGTACGAAGATGGGTAAATGTAGAAAATAACGTCCTGAACAAATTGTCCATAATATTACAATTATCCGCAGTGTTGCTTCTCGTCATCGCGGATGATAATTGTCCTCGGTAGTTGAACACGCCTGATTTGTATCATAGCTTAAGAATTAACTCAAAATATTTTCACTTCTTTACCTGAGCGGTTTGATTTTCGTTATGATGACGG > NC_000913/1673568‑1673863 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |