| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| MC JC | NC_000913 | 1,673,532 | Δ181 bp | intergenic (‑31/‑201) | mdtJ ← / → tqsA | multidrug efflux system transporter/pheromone AI‑2 transporter |
| Missing coverage evidence... | ||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | start | end | size | ←reads | reads→ | gene | description | |||
| * | * | ÷ | NC_000913 | 1673532 | 1673712 | 181 | 124 [0] | [0] 125 | mdtJ/tqsA | multidrug efflux system transporter/pheromone AI‑2 transporter |
| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | = 1673531 | 0 (0.000) | 124 (1.130) | 101/298 | 0.0 | 100% | intergenic (‑30/‑382) | mdtJ/tqsA | multidrug efflux system transporter/pheromone AI‑2 transporter |
| ? | NC_000913 | 1673713 = | 0 (0.000) | intergenic (‑212/‑200) | mdtJ/tqsA | multidrug efflux system transporter/pheromone AI‑2 transporter | |||||
Only 100 of 124 total aligned reads displayed.
CCAGCATTAAAATAAAGCCGCCATTTCCCTCACTGACGCTCGCCCATTTCATTGACAGCGTACCGGTAATTTCTGTAGCAATAGCCAGACCTAATAAAATCCAATAAATATACATTGTCCTTCTCCTGCAAGAGAATTATTTTAATTTTCGCTTAATTCAGCGAAACCAAAGTAAAGTGGTCAAGCCCCGCGCATAGCGCAAGCTTTGGCAGAAGAAAGGACTAAAGCGCGTTGCGCCAGTGCTGCTCACCTACGAGCAAGATAGTGGATGAGGTACGAAGATGGGTAAATGTA > NC_000913/1673387‑1673680 | ccAGCATTAAAATAAAGCCGCCATTTCCCTCACTGACGCTCGCCCATTTCATTGACAGCGTACCGGTAATTTCTGTAGCAATAGCCAGACCTAATAAAATCCAATAAATATACATTGTCCTTCTCCTGCAAGAGAATTATTTTAAattac > 2:673572‑M1/1‑145 (MQ=255) aGCATTAAAATAAAGCCGCCATTTCCCTCACTGACGCTCGCCCATTTCATTGACAGCGTACCGGTAATTTCTGTAGCAATAGCCAGACCTAATAAAATCCAATAAATATACATTGTCCTTCTCCTGCAAGAGAATTATTTTAAattacaat < 1:319760‑M1/151‑9 (MQ=255) aGCATTAAAATAAAGCCGCCATTTCCCTCACTGACGCTCGCCCATTTCATTGACAGCGTACCGGTAATTTCTGTAGCAATAGCCAGACCTAATAAAATCCAATAAATATACATTGTCCTTCTCCTGCAAGAGAATTATTTTAAattacaat < 1:749980‑M1/151‑9 (MQ=255) cATTAAAATAAAGCCGCCATTTCCCTCACTGACGCTCGCCCATTTCATTGACAGCGTACCGGTAATTTCTGTAGCAATAGCCAGACCTAATAAAATCCAATAAATATACATTGTCCTTCTCCTGCAAGAGAATTATTTTAAattacaatt > 1:788135‑M1/1‑141 (MQ=255) ttAAAATAAAGCCGCCATTTCCCTCACTGACGCTCGCCCATTTCATTGACAGCGTACCGGTAATTTCTGTAGCAATAGCCAGACCTAATAAAATCCAATAAATATACATTGTCCTTCTCCTGCAAGAGAATTATTTTAAattacaattatc > 1:471089‑M1/1‑139 (MQ=255) aaaaTAAAGCCGCCATTTCCCTCACTGACGCTCGCCCATTTCATTGACAGCGTACCGGTAATTTCTGTAGCAATAGCCAGACCTAATAAAATCCAATAAATATACATTGTCCTTCTCCTGCAAGAGAATTATTTTAAattacaattatccg < 1:23804‑M1/151‑15 (MQ=255) aaaTAAAGCCGCCATTTCCCTCACTGACGCTCGCCCATTTCATTGACAGCGTACCGGTAATTTCTGTAGCAATAGCCAGACCTAATAAAATCCAATAAATATACATTGTCCTTCTCCTGCAAGAGAATTATTTTAAattacaattatccgc < 2:1292952‑M1/151‑16 (MQ=255) aTAAAGCCGCCATTTCCCTCACTGACGCTCGCCCATTTCATTGACAGCGTACCGGTAATTTCTGTAGCAATAGCCACACCTAATAAAATCCAATAAATATACATTGTCCTTCTCCTGCAAGAGAATTATTTTAAattacaattatccgc > 1:537572‑M1/1‑134 (MQ=255) tAAAGCCGCCATTTCCCTCACTGACGCTCGCCCATTTCATTGACAGCGTACCGGTAATTTCTGTAGCAATAGCCAGACCTAATAAAATCCAATAAATATACATTGTCCTTCTCCTGCAAGAGAATTATTTTAAattacaattatccgcagt > 1:796861‑M1/1‑133 (MQ=255) aaaGCCGCCATTTCCCTCACTGACGCTCGCCCATTTCATTGACAGCGTACCGGTAATTTCTGTAGCAATAGCCAGACCTAATAAAATCCAATAAATATACATTGTCCTTCTCCTGCAAGAGAATTATTTTAAattacaattatccgcagt < 2:689883‑M1/150‑19 (MQ=255) gccgccATTTCCCTCACTGACGCTCGCCCATTTCATTGACAGCGTACCGGTAATTTCTGTAGCAATAGCCAGACCTAATAAAATCCAATAAATATACATTGTCCTTCTCCTGCAAGAGAATTATTTTAAattacaattatccgcagtgttg > 2:4796‑M1/1‑129 (MQ=255) ccgccATTTCCCTCACTGACGCTCGCCCATTTCATTGACAGCGTACCGGTAATTTCTGTAGCAATAGCCAGACCTAATAAAATCCAATAAATATACATTGTCCTTCTCCTGCAAGAGAATTATTTTAAattacaattatccgcagtgttgc > 1:1620422‑M1/1‑128 (MQ=255) cgccATTTCCCTCACTGACGCTCGCCCATTTCATTGACAGCGTACCGGTAATTTCTGTAGCAATAGCCAGACCTAATAAAATCCAATAAATATACATTGTCCTTCTCCTGCAAGAGAATTATTTTAAattacaattatccgcagtgttgct > 2:46358‑M1/1‑127 (MQ=255) gccATTTCCCTCACTGACGCTCGCCCATTTCATTGACAGCGTACCGGTAATTTCTGTAGCAATAGCCAGACCTAATAAAATCCAATAAATATACATTGTCCTTCTCCTGCAAGAGAATTATTTTAAattacaattatccgcagtgttgctt > 1:1528413‑M1/1‑126 (MQ=255) cATTTCCCTCACTGACGCTCGCCCATTTCATTGACAGCGTACCGGTAATTTCTGTAGCAATAGCCAGACCTAATAAAATCCAATAAATATACATTGTCCTTCTCCTGCAAGAGAATTATTTTAAattacaattatccgcagtgttgcttct > 1:777775‑M1/1‑124 (MQ=255) tttCCCTCACTGACGCTCGCCCATTTCATTGACAGCGTACCGGTAATTTCTGTAGCAATAGCCAGACCTAATAAAATCCAATAAATATACATTGTCCTTCTCCTGCAAGAGAATTATTTTAAattacaattatccgcagtgttgcttctcg > 2:813672‑M1/1‑122 (MQ=255) ttCCCTCACTGACGCTCGCCCATTTCATTGACAGCGTACCGGTAATTTCTGTAGCAATAGCCAGACCTAATAAAATCCAATAAATATACATTGTCCTTCTCCTGCAAGAGAATTATTTTAAattacaattatccgcagtgttgcttctcg < 2:934009‑M1/150‑30 (MQ=255) tCCCTCACTGACGCTCGCCCATTTCATTGACAGCGTACCGGTAATTTCTGTAGCAATAGCCAGACCTAATAAAATCCAATAAATATACATTGTCCTTCTCCTGCAAGAGAATTATTTTAAattacaattatccgcagtgttgcttctcgtc > 1:719292‑M1/1‑120 (MQ=255) ccTCACTGACGCTCGCCCATTTCATTGACAGCGTACCGGTAATTTCTGTAGCAATAGCCAGACCTAATAAAATCCAATAAATATACATTGTCCTTCTCCTGCAAGAGAATTATTTTAAattacaattatccgcagtgttgcttctcgtcat > 1:1378709‑M1/1‑118 (MQ=255) aCTGACGCTCGCCCATTTCATTGACAGCGTACCGGTAATTTCTGTAGCAATAGCCAGACCTAATAAAATCCAATAAATATACATTGTCCTTCTCCTGCAAGAGAATTATTTTAAattacaattatccgcagtgttgcttctcgtcatcgcg > 2:1282794‑M1/1‑114 (MQ=255) aCTGACGCTCGCCCATTTCATTGACAGCGTACCGGTAATTTCTGTAGCAATAGCCAGACCTAATAAAATCCAATAAATATACATTGTCCTTCTCCTGCAAGAGAATTATTTTAAattacaattatccgcagtgttgcttctcgtcatcgcg > 2:1529992‑M1/1‑114 (MQ=255) tGACGCTCGCCCATTTCATTGACAGCGTACCGGTAATTTCTGTAGCAATAGCCAGACCTAATAAAATCCAATAAATATACATTGTCCTTCTCCTGCAAGAGAATTATTTTAAattacaattatccgcagtgttgcttctcgtcatcgcgg > 1:1683454‑M1/1‑112 (MQ=255) cGCTCGCCCATTTCATTGACAGCGTACCGGTAATTTCTGTAGCAATAGCCAGACCTAATAAAATCCAATAAATATACATTGTCCTTCTCCTGCAAGAGAATTATTTTAAattacaattatccgcagtgttgcttctcgtcatcgcggatga < 1:1058245‑M1/151‑43 (MQ=255) gCTCGCCCATTTCATTGACAGCGTACCGGTAATTTCTGTAGCAATAGCCAGACCTAATAAAATCCAATAAATATACATTGTCCTTCTCCTGCAAGAGAATTATTTTAAattacaattatccgcagtgttgcttctcgtcatcgcggatgat > 2:1547620‑M1/1‑108 (MQ=255) cccATTTCATTGACAGCGTACCGGTAATTTCTGTAGCAATAGCCAGACCTAATAAAATCCAATAAATATACATTGTCCTTCTCCTGCAAGAGAATTATTTTAAattacaattatccgcagtgttgcttctcgtcatcgcggatgataattg > 1:501757‑M1/1‑103 (MQ=255) cATTTCATTGACAGCGTACCGGTAATTTCTGTAGCAATAGCCAGACCTAATAAAATCCAATAAATATACATTGTCCTTCTCCTGCAAGAGAATTATTTTAAattacaattatccgcagtgttgcttctcgtcatcgcggatgataattgtc > 2:137899‑M1/1‑101 (MQ=255) aTTTCATTGACAGCGTACCGGTAATTTCTGTAGCAATAGCCAGACCTAATAAAATCCAATAAATATACATTGTCCTTCTCCTGCAAGAGAATTATTTTAAattacaattatccgcagtgttgcttctcgtcatcgcggatgataattgtcc > 1:1367356‑M1/1‑100 (MQ=255) tCATTGACAGCGTACCGGTAATTTCTGTAGCAATAGCCAGACCTAATAAAATCCAATAAATATACATTGTCCTTCTCCTGCAAGAGAATTATTTTAAattacaattatccgcagtgttgcttctcgtcatcgcggatgataattgtcctc < 2:1131021‑M1/150‑54 (MQ=255) cATTGACAGCGTACCGGTAATTTCTGTAGCAATAGCCAGACCTAATAAAATCCAATAAATATACATTGTCCTTCTCCTGCAAGAGAATTATTTTAAattacaattatccgcagtgttgcttctcgtcatcgcggatgataattgtcctcgg > 2:1279265‑M1/1‑96 (MQ=255) aTTGACAGCGTACCGGTAATTTCTGTAGCAATAGCCAGACCTAATAAAATCCAATAAATATACATTGTCCTTCTCCTGCAAGAGAATTATTTTAAattacaattatccgcagtgttgcttctcgtcatcgcggatgataattgtcctcggt > 1:481622‑M1/1‑95 (MQ=255) tGACAGCGTACCGGTAATTTCTGTAGCAATAGCCAGACCTAATAAAATCCAATAAATATACATTGTCCTTCTCCTGCAAGAGAATTATTTTAAattacaattatccgcagtgttgcttctcgtcatcgcggatgataattgtcctcggta < 2:1144933‑M1/150‑58 (MQ=255) tGACAGCGTACCGGTAATTTCTGTAGCAATAGCCAGACCTAATAAAATCCAATAAATATACATTGTCCTTCTCCTGCAAGAGAATTATTTTAAattacaattatccgcagtgttgcttctcgtcatcgcggatgataattgtcctcggt > 1:1205154‑M1/1‑93 (MQ=255) gACAGCGTACCGGTAATTTCTGTAGCAATAGCCAGACCTAATAAAATCCAATAAATATACATTGTCCTTCTCCTGCAAGAGAATTATTTTAAattacaattatccgcagtgttgcttctcgtcatcgcggatgataattgtcctcggtagt > 2:802171‑M1/1‑92 (MQ=255) gACAGCGTACCGGTAATTTCTGTAGCAATAGCCAGACCTAATAAAATCCAATAAATATACATTGTCCTTCTCCTGCAAGAGAATTATTTTAAattacaattatccgcagtgttgcttctcgtcatcgcggatgataattgtcctcggtagt < 2:343156‑M1/151‑60 (MQ=255) gACAGCGTACCGGTAATTTCTGTAGCAATAGCCAGACCTAATAAAATCCAATAAATATACATTGTCCTTCTCCTGCAAGAGAATTATTTTAAattacaattatccgcagtgttgcttctcgtcatcgcggatgataattgtcctcggtag < 1:1468994‑M1/150‑59 (MQ=255) cAGCGTACCGGTAATTTCTGTAGCAATAGCCAGACCTAATAAAATCCAATAAATATACATTGTCCTTCTCCTGCAAGAGAATTATTTTAAattacaattatccgcagtgttgcttctcgtcatcgcggatgataattgtcctcggtagttg > 1:447473‑M1/1‑90 (MQ=255) gTACCGGTAATTTCTGTAGCAATAGCCAGACCTAATAAAATCCAATAAATATACATTGTCCTTCTCCTGCAAGAGAATTATTTTAAattacaattatccgcagtgttgcttctcgtcatcgcggatgataattgtcctcggtagttgaac > 2:904391‑M1/1‑86 (MQ=255) tACCGGTAATTTCTGTAGCAATAGCCAGACCTAATAAAATCCAATAAATATACATTGTCCTTCTCCTGCAAGAGAATTATTTTAAattacaattatccgcagtgttgcttctcgtcatcgcggatgataattgtcctcggtagttgaacac > 2:1325700‑M1/1‑85 (MQ=255) aCCGGTAATTTCTGTAGCAATAGCCAGACCTAATAAAATCCAATAAATATACATTGTCCTTCTCCTGCAAGAGAATTATTTTAAattacaattatccgcagtgttgcttctcgtcatcgcggatgataattgtcctcggtagttgaacac < 2:447143‑M1/150‑67 (MQ=255) cGGTAATTTCTGTAGCAATAGCCAGACCTAATAAAATCCAATAAATATACATTGTCCTTCTCCTGCAAGAGAATTATTTTAAattacaattatccgcagtgttgcttctcgtcatcgcggatgataattgtcctcggtagttgaacacgcc < 1:407455‑M1/151‑70 (MQ=255) ggTAATTTCTGTAGCAATAGCCAGACCTAATAAAATCCAATAAATATACATTGTCCTTCTCCTGCAAGAGAATTATTTTAAattacaattatccgcagtgttgcttctcgtcatcgcggatgataattgtcctcggtagttgaacacgcc > 2:28721‑M1/1‑81 (MQ=255) gTAATTTCTGTAGCAATAGCCAGACCTAATAAAATCCAATAAATATACATTGTCCTTCTCCTGCAAGAGAATTATTTTAAattacaattatccgcagtgttgcttctcgtcatcgcggatgataattgtcctcggtagttgaacacgcctg < 1:1251054‑M1/151‑72 (MQ=255) aaTTTCTGTAGCAATAGCCAGACCTAATAAAATCCAATAAATATACATTGTCCTTCTCCTGCAAGAGAATTATTTTAAattacaattatccgcagtgttgcttctcgtcatcgcggatgataattgtcctcggtagttgaacacgcctga < 2:393450‑M1/150‑73 (MQ=255) ttCTGTAGCAATAGCCAGACCTAATAAAATCCAATAAATATACATTGTCCTTCTCCTGCAAGAGAATTATTTTAAattacaattatccgcagtgttgcttctcgtcatcgcggatgataattgtcctcggtagttgaacacgcctgattt < 1:7302‑M1/150‑76 (MQ=255) ttCTGTAGCAATAGCCAGACCTAATAAAATCCAATAAATATACATTGTCCTTCTCCTGCAAGAGAATTATTTTAAattacaattatccgcagtgttgcttctcgtcatcgcggatgataattgtcctcggtagttgaacacgcctgattt < 2:1620486‑M1/150‑76 (MQ=255) cTGTAGCAATAGCCAGACCTAATAAAATCCAATAAATATACATTGTCCTTCTCCTGCAAGAGAATTATTTTAAattacaattatccgcagtgttgcttctcgtcatcgcggatgataattgtcctcggtagttgaacacgcctgatttgt > 1:1585048‑M1/1‑73 (MQ=255) gTAGCAATAGCCAGACCTAATAAAATCCAATAAATATACATTGTCCTTCTCCTGCAAGAGAATTATTTTAAattacaattatccgcagtgttgcttctcgtcatcgcggatgataattgtcctcggtagttgaacacgcctgatttgtat < 2:161417‑M1/150‑80 (MQ=255) gTAGCAATAGCCAGACCTAATAAAATCCAATAAATATACATTGTCCTTCTCCTGCAAGAGAATTATTTTAAattacaattatccgcagtgttgcttctcgtcatcgcggatgataattgtcctcggtagttgaacacgcctgatttgtat < 1:1218706‑M1/150‑80 (MQ=255) aGCAATAGCCAGACCTAATAAAATCCAATAAATATACATTGTCCTTCTCCTGCAAGAGAATTATTTTAAattacaattatccgcagtgttgcttctcgtcatcgcggatgataattgtcctcggtagttgaacacgcctgatttgtatcat > 1:1615526‑M1/1‑69 (MQ=255) aaTAGCCAGACCTAATAAAATCCAATAAATATACATTGTCCTTCTCCTGCAAGAGAATTATTTTAAattacaattatccgcagtgttgcttctcgtcatcgcggatgataattgtcctcggtagttgaacacgcctgatttgtatcatagc < 1:943540‑M1/151‑86 (MQ=255) aTAGCCAGACCTAATAAAATCCAATAAATATACATTGTCCTTCTCCTGCAAGAGAATTATTTTAAattacaattatccgcagtgttgcttctcgtcatcgcggatgataattgtcctcggtagttgaacacgcctgatttgtatcatagct < 1:770554‑M1/151‑87 (MQ=255) aGCCAGACCTAATAAAATCCAATAAATATACATTGTCCTTCTCCTGCAAGAGAATTATTTTAAattacaattatccgcagtgttgcttctcgtcatcgcggatgataattgtcctcggtagttgaacacgcctgatttgtatcatagctt > 2:311211‑M1/1‑63 (MQ=255) aGCCAGACCTAATAAAATCCAATAAATATACATTGTCCTTCTCCTGCAAGAGAATTATTTTAAattacaattatccgcagtgttgcttctcgtcatcgcggatgataattgtcctcggtagttgaacacgcctgatttgtatcatagctt > 1:92627‑M1/1‑63 (MQ=255) gCCAGACCTAATAAAATCCAATAAATATACATTGTCCTTCTCCTGCAAGAGAATTATTTTAAattacaattatccgcagtgttgcttctcgtcatcgcggatgataattgtcctcggtagttgaacacgcctgatttgtatcatagctta > 2:932451‑M1/1‑62 (MQ=255) ccAGACCTAATAAAATCCAATAAATATACATTGTCCTTCTCCTGCAAGAGAATTATTTTAAattacaattatccgcagtgttgcttctcgtcatcgcggatgataattgtcctcggtagttgaacacgcctgatttgtatcatagcttaag < 1:952318‑M1/151‑91 (MQ=255) cAGACCTAATAAAATCCAATAAATATACATTGTCCTTCTCCTGCAAGAGAATTATTTTAAattacaattatccgcagtgttgcttctcgtcatcgcggatgataattgtcctcggtagttgaacacgcctgatttgtatcatagcttaaga < 2:676295‑M1/151‑92 (MQ=255) cAGACCTAATAAAATCCAATAAATATACATTGTCCTTCTCCTGCAAGAGAATTATTTTAAattacaattatccgcagtgttgcttctcgtcatcgcggatgataattgtcctcggtagttgaacacgcctgatttgtatcatagcttaaga < 1:1509873‑M1/151‑92 (MQ=255) aGACCTAATAAAATCCAATAAATATACATTGTCCTTCTCCTGCAAGAGAATTATTTTAAattacaattatccgcagtgttgcttctcgtcatcgcggatgataattgtcctcggtagttgaacacgcctgatttgtatcatagcttaaga > 1:704990‑M1/1‑59 (MQ=255) aGACCTAATAAAATCCAATAAATATACATTGTCCTTCTCCTGCAAGAGAATTATTTTAAattacaattatccgcagtgttgcttctcgtcatcgcggatgataattgtcctcggtagttgaacacgcctgatttgtatcatagcttaaga > 2:1641561‑M1/1‑59 (MQ=255) aGACCTAATAAAATCCAATAAATATACATTGTCCTTCTCCTGCAAGAGAATTATTTTAAattacaattatccgcagtgttgcttctcgtcatcgcggatgataattgtcctcggtagttgaacacgcctgatttgtatcatagcttaaga > 2:233910‑M1/1‑59 (MQ=255) aCCTAATAAAATCCAATAAATATACATTGTCCTTCTCCTGCAAGAGAATTATTTTAAattacaattatccgcagtgttgcttctcgtcatcgcggatgataattgtcctcggtagttgaacacgcctgatttgtatcatagcttaagaatt > 1:446771‑M1/1‑57 (MQ=255) ccTAATAAAATCCAATAAATATACATTGTCCTTCTCCTGCAAGAGAATTATTTTAAattacaattatccgcagtgttgcttctcgtcatcgcggatgataattgtcctcggtagttgaacacgcctgatttgtatcatagcttaagaatta < 1:100185‑M1/151‑96 (MQ=255) ccTAATAAAATCCAATAAATATACATTGTCCTTCTCCTGCAAGAGAATTATTTTAAattacaattatccgcagtgttgcttctcgtcatcgcggatgataattgtcctcggtagttgaacacgcctgatttgtatcatagcttaagaatt < 2:1396191‑M1/150‑95 (MQ=255) ccTAATAAAATCCAATAAATATACATTGTCCTTCTCCTGCAAGAGAATTATTTTAAattacaattatccgcagtgttgcttctcgtcatcgcggatgataattgtcctcggtagttgaacacgcctgatttgtatcatagcttaagaatt > 1:356009‑M1/1‑56 (MQ=255) aataaAATCCAATAAATATACATTGTCCTTCTCCTGCAAGAGAATTATTTTAAattacaattatccgcagtgttgcttctcgtcatcgcggatgataattgtcctcggtagttgaacacgcctgatttgtatcatagcttaagaattaa < 1:1513823‑M1/149‑97 (MQ=255) ataaAATCCAATAAATATACATTGTCCTTCTCCTGCAAGAGAATTATTTTAAattacaattatccgcagtgttgcttctcgtcatcgcggatgataattgtcctcggtagttgaacacgcctgatttgtatcatagcttaagaattaactc < 1:964202‑M1/151‑100 (MQ=255) aaaaTCCAATAAATATACATTGTCCTTCTCCTGCAAGAGAATTATTTTAAattacaattatccgcagtgttgcttctcgtcatcgcggatgataattgtcctcggtagttgaacacgcctgatttgtatcatagcttaagaattaactca > 1:809540‑M1/1‑50 (MQ=255) aTCCAATAAATATACATTGTCCTTCTCCTGCAAGAGAATTATTTTAAattacaattatccgcagtgttgcttctcgtcatcgcggatgataattgtcctcggtagttgaacacgcctgatttgtatcatagcttaagaattaactcaaaat > 1:15506‑M1/1‑47 (MQ=255) ccAATAAATATACATTGTCCTTCTCCTGCAAGAGAATTATTTTAAattacaattatccgcagtgttgcttctcgtcatcgcggatgataattgtcctcggtagttgaacacgcctgatttgtatcatagcttaagaattaactcaaaatat < 2:90739‑M1/151‑107 (MQ=255) ataaataTACATTGTCCTTCTCCTGCAAGAGAATTATTTTAAattacaattatccgcagtgttgcttctcgtcatcgcggatgataattgtcctcggtagttgaacacgcctgatttgtatcatagcttaagaattaactcaaaatatttt < 2:292227‑M1/151‑110 (MQ=255) ataCATTGTCCTTCTCCTGCAAGAGAATTATTTTAAattacaattatccgcagtgttgcttctcgtcatcgcggatgataattgtcctcggtagttgaacacgcctgatttgtatcatagcttaagaattaactcaaaatattttcacttc < 2:1347939‑M1/151‑116 (MQ=255) ataCATTGTCCTTCTCCTGCAAGAGAATTATTTTAAattacaattatccgcagtgttgcttctcgtcatcgcggatgataattgtcctcggtagttgaacacgcctgatttgtatcatagcttaagaattaactcaaaatattttcacttc > 1:868271‑M1/1‑36 (MQ=255) ataCATTGTCCTTCTCCTGCAAGAGAATTATTTTAAattacaattatccgcagtgttgcttctcgtcatcgcggatgataattgtcctcggtagttgaacacgcctgatttgtatcatagcttaagaattaactcaaaatattttcactt < 2:788160‑M1/150‑115 (MQ=255) aCATTGTCCTTCTCCTGCAAGAGAATTATTTTAAattacaattatccgcagtgttgcttctcgtcatcgcggatgataattgtcctcggtagttgaacacgcctgatttgtatcatagcttaagaattaactcaaaatattttcacttctt > 1:299639‑M1/1‑34 (MQ=255) cATTGTCCTTCTCCTGCAAGAGAATTATTTTAAattacaattatccgcagtgttgcttctcgtcatcgcggatgataattgtcctcggtagttgaacacgcctgatttgtatcatagcttaagaattaactcaaaatattttcacttcttt > 1:313033‑M1/1‑33 (MQ=255) cATTGTCCTTCTCCTGCAAGAGAATTATTTTAAattacaattatccgcagtgttgcttctcgtcatcgcggatgataattgtcctcggtagttgaacacgcctgatttgtatcatagcttaagaattaactcaaaatattttcacttcttt < 2:821824‑M1/151‑119 (MQ=255) aTTGTCCTTCTCCTGCAAGAGAATTATTTTAAattacaattatccgcagtgttgcttctcgtcatcgcggatgataattgtcctcggtagttgaacacgcctgatttgtatcatagcttaagaattaactcaaaatattttcacttcttta < 2:265743‑M1/151‑120 (MQ=255) aTTGTCCTTCTCCTGCAAGAGAATTATTTTAAattacaattatccgcagtgttgcttctcatcatcgcggatgataattgtcctcggtagttgaacacgcctgatttgtatcatagcttaagaattaactcaaaatattttcacttcttta < 1:1373197‑M1/151‑120 (MQ=255) tGTCCTTCTCCTGCAAGAGAATTATTTTAAattacaattatccgcagtgttgcttctcgtcatcgcggatgataattgtcctcggtagttgaacacgcctgatttgtatcatagcttaagaattaactcaaaatattttcacttctttac < 2:579409‑M1/150‑121 (MQ=255) tGTCCTTCTCCTGCAAGAGAATTATTTTAAattacaattatccgcagtgttgcttctcgtcatcgcggatgataattgtcctcggtagttgaacacgcctgatttgtatcatagcttaagaattaactcaaaatattttcacttctttac < 2:1536910‑M1/150‑121 (MQ=255) ccTGCAAGAGAATTATTTTAAattacaattatccgcagtgttgcttctcgtcatcgcggatgataattgtcctcggtagttgaacacgcctgatttgtatcatagcttaagaattaactcaaaatattttcacttctttacctgagcggtt < 2:407300‑M1/151‑131 (MQ=255) ccTGCAAGAGAATTATTTTAAattacaattatccgcagtgttgcttctcgtcatcgcggatgataattgtcctcggtagttgaacacgcctgatttgtatcatagcttaagaattaactcaaaatattttcacttctttacctgagcggtt > 1:1348852‑M1/1‑21 (MQ=255) gCAAGAGAATTATTTTAAattacaattatccgcagtgttgcttctcgtcatcgcggatgataattgtcctcggtagttgaacacgcctgatttgtatcatagcttaagaattaactcaaaatattttcacttctttacctgagcggtttg > 2:1644242‑M1/1‑18 (MQ=255) agaATTATTTTAAattacaattatccgcagtgttgcttctcgtcatcgcggatgataattgtcctcggtagttgaacacgcctgatttgtatcatagcttaagaattaactcaaaatattttcacttctttacctgagcggtttgattttc < 1:812380‑M1/151‑139 (MQ=255) agaATTATTTTAAattacaattatccgcagtgttgcttctcgtcatcgcggatgataattgtcctcggtagttgaacacgcctgatttgtatcatagcttaagaattaactcaaaatattttcacttctttacctgagcggtttgattttc < 2:821579‑M1/151‑139 (MQ=255) gaATTATTTTAAattacaattatccgcagtgttgcttctcgtcatcgcggatgataattgtcctcggtagttgaacacgcctgatttgtatcatagcttaagaattaactcaaaatattttcacttctttacctgagcggtttgattttcg > 1:773951‑M1/1‑12 (MQ=255) aaTTATTTTAAattacaattatccgcagtgttgcttctcgtcatcgcggatgataattgtcctcggtagttgaacacgcctgatttgtatcatagcttaagaattaactcaaaatattttcacttctttacctgagcggtttgattttcgt > 1:256500‑M1/1‑11 (MQ=255) aaTTATTTTAAattacaattatccgcagtgttgcttctcgtcatcgcggatgataattgtcctcggtagttgaacacgcctgatttgtatcatagcttaagaattaactcaaaatattttcacttctttacctgagcggtttgattttcgt < 1:448804‑M1/151‑141 (MQ=255) attattTTAAattacaattatccgcagtgttgcttctcgtcatcgcggatgataattgtcctcggtagttgaacacgcctgatttgtatcatagcttaagaattaactcaaaatattttcacttctttacctgagcggtttgattttcgtt < 1:342130‑M1/151‑142 (MQ=255) ttattTTAAattacaattatccgcagtgttgcttctcgtcatcgcggatgataattgtcctcggtagttgaacacgcctgatttgtatcatagcttaagaattaactcaaaatattttcacttctttacctgagcggtttgattttcgtt > 2:218930‑M1/1‑9 (MQ=255) ttattTTAAattacaattatccgcagtgttgcttctcgtcatcgcggatgataattgtcctcggtagttgaacacgcctgatttgtatcatagcttaagaattaactcaaaatattttcacttctttacctgagcggtttgattttcgtt > 2:661814‑M1/1‑9 (MQ=255) tattTTAAattacaattatccgcagtgttgcttctcgtcatcgcggatgataattgtcctcggtagttgaacacgcctgatttgtatcatagcttaagaattaactcaaaatattttcacttctttacctgagcggtttgattttcgttat > 2:74938‑M1/1‑8 (MQ=255) tattTTAAattacaattatccgcagtgttgcttctcgtcatcgcggatgataattgtcctcggtagttgaacacgcctgatttgtatcatagcttaagaattaactcaaaatattttcacttctttacctgagcggtttgattttcgttat > 1:998910‑M1/1‑8 (MQ=255) tattTTAAattacaattatccgcagtgttgcttctcgtcatcgcggatgataattgtcctcggtagttgaacacgcctgatttgtatcatagcttaagaattaactcaaaatattttcacttctttacctgagcggtttgattttcgtta > 1:271017‑M1/1‑8 (MQ=255) attTTAAattacaattatccgcagtgttgcttctcgtcatcgcggatgataattgtcctcggtagttgaacacgcctgatttgtatcatagcttaagaattaactcaaaatattttcacttctttacctgagcggtttgattttcgttat < 2:790441‑M1/150‑144 (MQ=255) attTTAAattacaattatccgcagtgttgcttctcgtcatcgcggatgataattgtcctcggtagttgaacacgcctgatttgtatcatagcttaagaattaactcaaaatattttcacttctttacctgagcggtttgattttcgttat < 2:1051292‑M1/150‑144 (MQ=255) ttttAAattacaattatccgcagtgttgcttctcgtcatcgcggatgataattgtcctcggtagttgaacacgcctgatttgtatcatagcttaagaattaactcaaaatattttcacttctttacctgagcggtttgattttcgttat > 2:833463‑M1/1‑6 (MQ=255) ttAAattacaattatccgcagtgttgcttctcgtcatcgcggatgataattgtcctcggtagttgaacacgcctgatttgtatcatagcttaagaattaactcaaaatattttcacttctttacctgagcggtttgattttcgttatgat < 2:1346375‑M1/150‑147 (MQ=255) aaattacaattatccgcagtgttgcttctcgtcatcgcggatgataattgtcctcggtagttgaacacgcctgatttgtatcatagcttaagaattaactcaaaatattttcacttctttacctgagcggtttgattttcgttatgatgac > 2:1141837‑M1/1‑2 (MQ=255) aaattacaattatccgcagtgttgcttctcgtcatcgcggatgataattgtcctcggtagttgaacacgcctgatttgtatcatagcttaagaattaactcaaaatattttcacttctttacctgagcggtttgattttcgttatgatgac < 2:1486341‑M1/151‑150 (MQ=255) | CCAGCATTAAAATAAAGCCGCCATTTCCCTCACTGACGCTCGCCCATTTCATTGACAGCGTACCGGTAATTTCTGTAGCAATAGCCAGACCTAATAAAATCCAATAAATATACATTGTCCTTCTCCTGCAAGAGAATTATTTTAATTTTCGCTTAATTCAGCGAAACCAAAGTAAAGTGGTCAAGCCCCGCGCATAGCGCAAGCTTTGGCAGAAGAAAGGACTAAAGCGCGTTGCGCCAGTGCTGCTCACCTACGAGCAAGATAGTGGATGAGGTACGAAGATGGGTAAATGTA > NC_000913/1673387‑1673680 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |