| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| JC JC | NC_000913 | 2,942,878 | IS4 (+) +13 bp | intergenic (‑311/+28) | gcvA ← / ← ygdI | glycine cleavage system transcriptional activator; autorepressor/DUF903 family verified lipoprotein |
| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | 2942878 = | 0 (0.000) | 38 (0.700) | 32/294 | 0.3 | 100% | intergenic (‑311/+40) | gcvA/ygdI | glycine cleavage system transcriptional activator; autorepressor/DUF903 family verified lipoprotein |
| ? | NC_000913 | 4502090 = | NA (NA) | noncoding (1426/1426 nt) | IS4 | repeat region | |||||
| * | ? | NC_000913 | = 2942890 | 0 (0.000) | 66 (1.220) | 41/294 | 0.1 | 100% | intergenic (‑323/+28) | gcvA/ygdI | glycine cleavage system transcriptional activator; autorepressor/DUF903 family verified lipoprotein |
| ? | NC_000913 | = 4503515 | NA (NA) | noncoding (1/1426 nt) | IS4 | repeat region | |||||
Only 100 of 101 total aligned reads displayed.
TGCGTGTTCTGGTGAACTTTTGGCTTACGGTTGTGATGTTGTGTTGTTGTGTTTGCAATTGGTCTGCGATTCAGACCATGGTAGCAAAGCTACCTTTTTTCACTTCCTGTACATTTACCCTGTCTGTCCATAGTGATTAATGTAGCACCGCCTAATTGCGGTGCTTTTTTTTACCTTGCGATCGCGAATTACTGATCCAGTTCGACCATCTCTTTCACGTCAGTACGGTTGATCTGCTGTTTGTTGCCATTAGCGTCTTTATACGAAATCATACCGGTATCGTTATCAGTCTGTGGTTT > NC_000913/2942730‑2943028 | ctgatgcgcgatcttgcaagtatgggacaacttgtgaaattaccgacaagaagggaaagggccttcccgagagtggtaaaggagaggccctggaaataccccacagccccgaaaaagagccagtcagttgcttaactgactggcattaCGc > 2:197441‑M1/149‑151 (MQ=255) ttCTGGTGAACTTTTGGCTTACGGTTGTGATGTTGTGTTGTTGTGTTTGCAATTGGTCTGCGATTCAGACCATGGTAGCAAAGCTACCTTTTTTCACTTCCTGTACATTTACCCTGTCTGTCCATAGTGATTAATGTAGCACCGCCTAAt < 1:299640/150‑1 (MQ=255) cgatcttgcaagtatgggacaacttgtgaaattaccgacaagaagggaaagggccttcccgagagtggtaaaggagaggccctggaaataccccacagccccgaaaaagagccagtcagttgcttaactgactggcattaCGCCTAATTg > 2:809118‑M1/141‑150 (MQ=255) aCTTTTGGCTTACGGTTGTGATGTTGTGTTGTTGTGTTTGCAATTGGTCTGCGATTCAGACCATGGTAGCAAAGCTACCTTTTTTCACTTCCTGTACATTTACCCTGTCTGTCCATAGTGATTAATGTAGCACCGCCTAATTGCGGtaatg > 1:271973‑M1/1‑146 (MQ=255) cTTTTGGCTTACGGTTGTGATGTTGTGTTGTTGTGTTTGCAATTGGTCTGCGATTCAGACCATGGTAGCAAAGCTACCTTTTTTCACTTCCTGTACATTTACCCTGTCTGTCCATAGTGATTAATGTAGCACCGCCTAATTGCGGtaatgc < 1:261298‑M1/151‑7 (MQ=255) gtatgggacaacttgtgaaattaccgacaagaagggaaagggccttcccgagagtggtaaaggagaggccctggaaataccccacagccccgaaaaagagccagtcagttgcttaactgactggcattaCGCCTAATTGCGGTGCtttttt < 1:622470‑M1/22‑1 (MQ=255) tgggacaacttgtgaaattaccgacaagaagggaaagggccttcccgagagtggtaaaggagaggccctggaaataccccacagccccgaaaaagagccagtcagttgcttaactgactggcattaCGCCTAATTGCGGTGCTTTTTTTTa < 1:30420‑M1/25‑1 (MQ=255) ggacaacttgtgaaattaccgacaagaagggaaagggccttcccgagagtggtaaaggagaggccctggaaataccccacagccccgaaaaagagccagtcagttgcttaactgactggcattaCGCCTAATTGCGGTGCTTTTTTTTAc > 2:610844‑M1/125‑150 (MQ=255) ggacaacttgtgaaattaccgacaagaagggaaagggccttcccgagagtggtaaaggagaggccctggaaataccccacagccccgaaaaagagccagtcagttgcttaactgactggcattaCGCCTAATTGCGGTGCTTTTTTTTAc < 2:677459‑M1/26‑1 (MQ=255) ggacaacttgtgaaattaccgacaagaagggaaagggccttcccgagagtggtaaaggagaggccctggaaataccccacagccccgaaaaagagccagtcagttgcttaactgactggcattaCGCCTAATTGCGGTGCTTTTTTTTAc > 2:525926‑M1/125‑150 (MQ=255) gTTGTGATGTTGTGTTGTTGTGTTTGCAATTGGTCTGCGATTCAGACCATGGTAGCAAAGCTACCTTTTTTCACTTCCTGTACATTTACCCTGTCTGTCCATAGTGATTAATGTAGCACCGCCTAATTGCGGtaatgccgatcagttaagg > 1:365513‑M1/1‑132 (MQ=255) gTTGTGATGTTGTGTTGTTGTGTTTGCAATTGGTCTGCGATTCAGACCATGGTAGCAAAGCTACCTTTTTTCACTTCCTGTACATTTACCCTGTCTGTCCATAGTGATTAATGTAGCACCGCCTAATTGCGGtaatgccgatcagttaagg > 2:417588‑M1/1‑132 (MQ=255) ttGTGATGTTGTGTTTTTGTGTTTGCAATTGGTCTGCGATTCAGACCATGGTAGCAAAGCTACCTTTTTTCACTTCCTGTACATTTACCCTGTCTGTCCAGAGTGATTAATGTAGCACCGCCTAATTGCGGtaatgccgatcagttaagga < 1:656452‑M1/151‑21 (MQ=255) cttgtgaaattaccgacaagaagggaaagggccttcccgagagtggtaaaggagaggccctggaaataccccacagccccgaaaaagagccagtcagttgcttaactgactggcattaCGCCTAATTGCGGTGCTTTTTTTTACCTTGCGa < 2:42718‑M1/33‑1 (MQ=255) cttgtgaaattaccgacaagaagggaaagggccttcccgagagtggtaaaggagaggccctggaaataccccacagccccgaaaaagagccagtcagttgcttaactgactggcattaCGCCTAATTGCGGTGCTTTTTTTTACCTTGCGa < 1:375038‑M1/33‑1 (MQ=255) tgtgATGTTGTGTTGTTGTGTTTGCAATTGGTCTGCGATTCAGACCATGGTAGCAAAGCTACCTTTTTTCACTTCCTGTACATTTACCCTGTCTGTCCATAGTGATTAATGTAGCACCGCCTAATTGCGGtaatgccgatcagttaaggat < 1:819123‑M1/151‑22 (MQ=255) tgtgATGTTGTGTTGTTGTGTTTGCAATTGGTCTGCGATTCAGACCATGGTAGCAAAGCTACCTTTTTTCACTTCCTGTACATTTACCCTGTCTGTCCATAGTGATTAATGTAGCACCGCCTAATTGCGGtaatgccgatcagttaaggat < 2:629703‑M1/151‑22 (MQ=255) gtgATGTTGTGTTGTTGTGTTTGCAATTGGTCTGCGATTCAGACCATGGTAGCAAAGCTACCTTTTTTCACTTCCTGTACATTTACCCTGTCTGTCCATAGTGATTAATGTAGCACCGCCTAATTGCGGtaatgccgatcagttaaggat > 1:529940‑M1/1‑129 (MQ=255) gtgATGTTGTGTTGTTGTGTTTGCAATTGGTCTGCGATTCAGACCATGGTAGCAAAGCTACCTTTTTTCACTTCCTGTACATTTACCCTGTCTGTCCATAGTGATTAATGTAGCACCGCCTAATTGCGGtaatgccgatcagttaaggat > 2:101874‑M1/1‑129 (MQ=255) gtgATGTTGTGTTGTTGTGTTTGCAATTGGTCTGCGATTCAGACCATGGTAGCAAAGCTACCTTTTTTCACTTCCTGTACATTTACCCTGTCTGTCCATAGTGATTAATGTAGCACCGCCTAATTGCGGtaatgccgatcagttaaggat > 2:500116‑M1/1‑129 (MQ=255) tgATGTTGTGTTGTTGTGTTTGCAATTGGTCTGCGATTCAGACCATGGTAGCAAAGCTACCTTTTTTCACTTCCTGTACATTTACCCTGTCTGTCCATAGTGATTAATGTAGCACCGCCTAATTGCGGtaatgccgatcagttaaggatc < 1:612676‑M1/150‑23 (MQ=255) aTGTTGTGTTGTTGTGTTTGCAATTGGTCTGCGATTCAGACCATGGTAGCAAAGCTACCTTTTTTCACTTCCTGTACATTTACCCTGTCTGTCCATAGTGATTAATGTAGCACCGCCTAATTGCGGtaatgccgatcagttaaggatcagt > 2:779843‑M1/1‑126 (MQ=255) aTGTTGTGTTGTTGTGTTTGCAATTGGTCTGCGATTCAGACCATGGTAGCAAAGCTACCTTTTTTCACTTCCTGTACATTTACCCTGTCTGTCCATAGTGATTAATGTAGCACCGCCTAATTGCGGtaatgccgatcagttaaggatcagt < 2:199364‑M1/151‑26 (MQ=255) gtgttgttgtgttTGCAATTGGTCTGCGATTCAGACCATGGTAGCAAAGCTACCTTTTTTCACTTCCTGTACATTTACCCTGTCTGTCCATAGTGATTAATGTAGCACCGCCTAATTGCGGtaatgccgatcagttaaggatcagttgac > 1:260905‑M1/1‑121 (MQ=255) gttgttgtgttTGCAATTGGTCTGCGATTCAGACCATGGTAGCAAAGCTACCTTTTTTCACTTCCTGTACATTTACCCTGTCTGTCCATAGTGATTAATGTAGCACCGCCTAATTGCGGtaatgccgatcagttaaggatcagttgaccga > 1:23086‑M1/1‑119 (MQ=255) acaagaagggaaagggccttcccgagagtggtaaaggagaggccctggaaataccccacagccccgaaaaagagccagtcagttgcttaactgactggcattaCGCCTAATTGCGGTGCTTTTTTTTACCTTGCGATCGCGAATTACTGAt < 1:27305‑M1/48‑1 (MQ=255) aagaagggaaagggccttcccgagagtggtaaaggagaggccctggaaataccccacagccccgaaaaagagccagtcagttgcttaactgactggcattaCGCCTAATTGCGGTGCTTTTTTTTACCTTGCGATCGCGAATTACTGATcc > 1:330601‑M1/102‑151 (MQ=255) agaagggcaagggccttcccgagagtggtaaaggagaggccctggaaataccccacagccccgaaaaagagccagtcagttgcttaactgactggcattaCGCCTAATTGCGGTGCTTTTTTTTACCTTGCGATCGCGAATTACTGATCCa < 1:841342‑M1/51‑1 (MQ=255) gaagggaaagggccttcccgagagtggtaaaggagaggccctggaaataccccacagccccgaaaaagagccagtcagttgcttaactgactggcattaCGCCTAATTGCGGTGCTTTTTTTTACCTTGCGATCGCGAATTACTGATCCAg < 2:762886‑M1/52‑1 (MQ=255) gttTGCAATTGGTCTGCGATTCAGACCATGGTAGCAAAGCTACCTTTTTTCACTTCCTGTACATTTACCCTGTCTGTCCATAGTGATTAATGTAGCACCGCCTAATTGCGGtaatgccgatcagttaaggatcagttgaccgatccagtgg > 2:441492‑M1/1‑111 (MQ=255) tttGCAATTGGTCTGCGATTCAGACCATGGTAGCAAAGCTACCTTTTTTCACTTCCTGTACATTTACCCTGTCTGTCCATAGTGATTGATGTAGCACCGCCTAATTGCGGtaatgccgatcagttaaggatcagttgaccgatccagtggc < 2:294028‑M1/151‑42 (MQ=255) tttGCAATTGGTCTGCGATTCAGACCATGGTAGCAAAGCTACCTTTTTTCACTTCCTGTACATTTACCCTGTCTGTCCATAGTGATTAATGTAGCACCGCCTAATTGCGGtaatgccgatcagttaaggatcagttgaccgatccagtggc < 2:793092‑M1/151‑42 (MQ=255) tttGCAATTGGTCTGCGATTCAGACCATGGTAGCAAAGCTACCTTTTTTCACTTCCTGTACATTTACCCTGTCTGTCCATAGTGATTAATGTAGCACCGCCTAATTGCGGtaatgccgatcagttaaggatcagttgaccgatccagtgg < 1:717276‑M1/150‑41 (MQ=255) tttGCAATTGGTCTGCGATTCAGACCATGGTAGCAAAGCTACCTTTTTTCACTTCCTGTACATTTACCCTGTCTGTCCATAGTGATTAATGTAGCACCGCCTAATTGCGGtaatgccgatcagttaaggatcagttgaccgatccagtgg < 1:698994‑M1/150‑41 (MQ=255) tttGCAATTGGTCTGCGATTCAGACCATGGTAGCAAAGCTACCTTTTTTCACTTCCTGTACATTTACCCTGTCTGTCCATAGTGATTAATGTAGCACCGCCTAATTGCGGtaatgccgatcagttaaggatcagttgaccgatccagtgg < 1:101874‑M1/150‑41 (MQ=255) gggaaagggccttcccgagagtggtaaaggagaggccctggaaataccccacagccccgaaaaagagccagtcagttgcttaactgactggcattaCGCCTAATTGCGGTGCTTTTTTTTACCTTGCGATCGCGAATTACTGATCCAGtt < 1:339957‑M1/54‑1 (MQ=255) gccttcccgagagtggtaaaggagaggccctggaaataccccacagccccgaaaaagagccagtcagttgcttaactgactggcattaCGCCTAATTGCGGTGCTTTTTTTTACCTTGCGATCGCGAATTACTGATCCAGTTCGACCAtc > 1:145685‑M1/89‑150 (MQ=255) gTCTGCGATTCAGACCATGGTAGCAAAGCTACCTTTTTTCACTTCCTGTACATTTACCCTGTCTGTCCATAGTGATTAATGTAGCACCGCCTAATTGCGGtaatgccgatcagttaaggatcagttgaccgatccagtggctgtgtaagaa > 2:579747‑M1/1‑100 (MQ=255) tcccgagagtggtaaaggagaggccctggaaataccccacagccccgaaaaagagccagtcagttgcttaactgactggcattaCGCCTAATTGCGGTGCTTTTTTTTACCTTGCGATCGCGAATTACTGATCCAGTTCGACCATCTCttt < 1:142541‑M1/67‑1 (MQ=255) tcccgagagtggtaaaggagaggccctggaaataccccacagccccgaaaaagagccagtcagttgcttaactgactggcattaCGCCTAATTGCGGTGCTTTTTTTTACCTTGCGATCGCGAATTACTGATCCAGTTCGACCATCTCttt > 1:461634‑M1/85‑151 (MQ=255) gATTCAGACCATGGTAGCAAAGCTACCTTTTTTCACTTCCTGTACATTTACCCTGTCTGTCCATAGTGATTAATGTAGCACCGCCTAATTGCGGtaatgccgatcagttaaggatcagttgaccgatccagtggctgtgtaagaatccgga > 1:852692‑M1/1‑94 (MQ=255) cgagagtggtaaaggagaggccctggaaataccccacagccccgaaaaagagccagtcagttgcttaactgactggcattaCGCCTAATTGCGGTGCTTTTTTTTACCTTGCGATCGCGAATTACTGATCCAGTTCGACCATCTCTTTCAc > 2:544195‑M1/82‑151 (MQ=255) aTTCAGACCATGGTAGCAAAGCTACCTTTTTTCACTTCCTGTACATTTACCCTGTCTGTCCATAGTGATTAATGTAGCACCGCCTAATTGCGGtaatgccgatcagttaaggatcagttgaccgatccagtggctgtgtaagaatccggaa > 2:711800‑M1/1‑93 (MQ=255) gagtggtaaaggagaggccctggaaataccccacagccccgaaaaagagccagtcagttgcttaactgactggcattaCGCCTAATTGCGGTGCTTTTTTTTACCTTGCGATCGCGAATTACTGATCCAGTTCGACCATCTCTTTCACGt < 1:63689‑M1/72‑1 (MQ=255) gagtggtaaaggagaggccctggaaataccccacagccccgaaaaagagccagtcagttgcttaactgactggcattaCGCCTAATTGCGGTGCTTTTTTTTACCTTGCGATCGCGAATTACTGATCCAGTTCGACCATCTCTTCCACGt < 1:837023‑M1/72‑1 (MQ=255) ggtaaaggagaggccctggaaataccccacagccccgaaaaagagccagtcagttgcttaactgactggcattaCGCCTAATTGCGGTGCTTTTTTTTACCTTGCGATCGCGAATTACTGATCCAGTTCGACCATCTCTTTCACGTCAGTa < 2:6708‑M1/77‑1 (MQ=255) ggtaaaggagaggccctggaaataccccacagccccgaaaaagagccagtcagttgcttaactgactggcattaCGCCTAATTGCGGTGCTTTTTTTTACCTTGCGATCGCGAATTACTGATCCAGTTCGACCATCTCTTTCACGTCAGTa < 1:27843‑M1/77‑1 (MQ=255) gtaaaggagaggccctggaaataccccacagccccgaaaaagagccagtcagttgcttaactgactggcattaCGCCTAATTGCGGTGCTTTTTTTTACCTTGCGATCGCGAATTACTGATCCAGTTCGACCATCTCTTTCACGTCAGTa < 1:586864‑M1/77‑1 (MQ=255) gCTACCTTTTTTCACTTCCTGTACATTTACCCTGTCTGTCCATAGTGATTAATGTAGCACCGCCTAATTGCGGtaatgccgatcagttaaggatcagttgaccgatccagtggctgtgtaagaatccggaaacgctcacttgtttccggat > 2:168089‑M1/1‑73 (MQ=255) gaaataccccacagccccgaaaaagagccagtcagttgcttaactgactggcattaCGCCTAATTGCGGTGCTTTTTTTTACCTTGCGATCGCGAATTACTGATCCAGTTCGACCATCTCTTTCACGTCAGTACGGTTGATCTGCtgtttg < 2:545134‑M1/95‑1 (MQ=255) aaatgccccgcagccccgagaaagagccagtcagttgcttaactgactggcattaCGCCTAATTGCGGTGCTTTTTTTTTCCTTGCGGTCGCGAATTACTGATCCAGTTCGACCATCTCTTTCACGTCAGTACGGTTGATCTGCtttttgt > 1:324829‑M1/56‑151 (MQ=255) taccccacagccccgaaaaagagccagtcagttgcttaactgactggcattaCGCCTAATTGCGGTGCTTTTTTTTACCTTGCGATCGCGAATTACTGATCCAGTTCGACCATCTCTTTCACGTCAGTACGGTTGATCTGCTGTTTGTTGc > 1:849699‑M1/53‑151 (MQ=255) cTTCCTGTACATTTACCCTGTCTGTCCATAGTGATTAATGTAGCACCGCCTAATTGCGGtaatgccgatcagttaaggatcagttgaccgatccagtggctgtgtaagaatccggaaacgctcacttgtttccggatttttttatgcacat > 1:801517‑M1/1‑59 (MQ=255) tGTACATTTACCCTGTCTGTCCATAGTGATTAATGTAGCACCGCCTAATTGCGGtaatgccgatcagttaaggatcagttgaccgatccagtggctgtgtaagaatccggaaacgctcacttgtttccggatttttttatgcacattgga > 1:135661‑M1/1‑54 (MQ=255) ccgaaaaagagccagtcagttgcttaactgactggcattaCGCCTAATTGCGGTGCTTTTTTTTACCTTGCGATCGCGAATTACTGATCCAGTTCGACCATCTCTTTCACGTCAGTACGGTTGATCTGCTGTTTGTTGCCATTAGCGTCtt < 2:254467‑M1/111‑1 (MQ=255) cATTTACCCTGTCTGTCCATAGTGATTAATGTAGCACCGCCTAATTGCGGtaatgccgatcagttaaggatcagttgaccgatccagtggctgtgtaagaatccggaaacgctcacttgtttccggatttttttatgcacattggacagg > 1:318863‑M1/1‑50 (MQ=255) cATTTACCCTGTCTGTCCATAGTGATTAATGTAGCACCGCCTAATTGCGGtaatgccgatcagttaaggatcagttgaccgatccagtggctgtgtaagaatccggaaacgctcacttgtttccggatttttttatgcacattggacagg > 1:53724‑M1/1‑50 (MQ=255) tttACCCTGTCTGTCCATAGTGATTAATGTAGCACCGCCTAATTGCGGtaatgccgatcagttaaggatcagttgaccgatccagtggctgtgtaagaatccggaaacgctcacttgtttccggatttttttatgcacattggacaggct > 2:372106‑M1/1‑48 (MQ=255) tACCCTGTCTGTCCATAGTGATTAATGTAGCACCGCCTAATTGCGGtaatgccgatcagttaaggatcagttgaccgatccagtggctgtgtaagaatccggaaacgctcacttgtttccggatttttttatgcacattggacaggctctt > 2:534944‑M1/1‑46 (MQ=255) aCCCTGTCTGTCCATAGTGATTAATGTAGCACCGCCTAATTGCGGtaatgccgatcagttaaggatcagttgaccgatccagtggctgtgtaagaatccggaaacgctcacttgtttccggatttttttatgcacattggacaggctcttg > 2:242327‑M1/1‑45 (MQ=255) ctgtctgtCCATAGTGATTAATGTAGCACCGCCTAATTGCGGtaatgccgatcagttaaggatcagttgaccgatccagtggctgtgtaagaatccggaaacgctcacttgtttccggatttttttatgcacattggacaggctcttgatc < 1:585673‑M1/151‑110 (MQ=255) tgtctgtcCATAGTGATTAATGTAGCACCGCCTAATTGCGGtaatgccgatcagttaaggatcagttgaccgatccagtggctgtgtaagaatccggaaacgctcacttgtttccggatttttttatgcacattggacaggctcttgat > 1:45369‑M1/1‑41 (MQ=255) gtctgtcCATAGTGATTAATGTAGCACCGCCTAATTGCGGtaatgccgatcagttaaggatcagttgaccgatccagtggctgtgtaagaatccggaaacgctcacttgtttccggatttttttatgcacattggacaggctcttgat > 2:819528‑M1/1‑40 (MQ=255) gtctgtcCATAGTGATTAATGTAGCACCGCCTAATTGCGGtaatgccgatcagttaaggatcagttgaccgatccagtggctgtgtaagaatccggaaacgctcacttgtttccggatttttttatgcacattggacaggctcttgat > 2:538861‑M1/1‑40 (MQ=255) gtctgtcCATAGTGATTAATGTAGCACCGCCTAATTGCGGtaatgccgatcagttaaggatcagttgaccgatccagtggctgtgtaagaatccggaaacgctcacttgtttccggatttttttatgcacattggacaggctcttgat > 1:434228‑M1/1‑40 (MQ=255) tctgtcCATAGTGATTAATGTAGCACCGCCTAATTGCGGtaatgccgatcagttaaggatcagttgaccgatccagtggctgtgtaagaatccggaaacgctcacttgtttccggatttttttatgcacattggacaggctcttgatctgg < 2:811777‑M1/151‑113 (MQ=255) cagttgcttaactgactggcattaCGACTAATTGCGGTGCTTTTTTTTACCTTGCGATCGCGAATTACTGATCCAGTTCGACCATCTCTTTCACGTCCGTACGGTTGATCTGCTGTTTGTTGCCATTAGCGTCTTTATACGAAATCATAc < 1:798931‑M1/126‑1 (MQ=255) gtcCATAGTGATTAATGTAGCACCGCCTAATTGCGGtaatgccgatcagttaaggatcagttgaccgatccagtggctgtgtaagaatccggaaacgctcacttgtttccggatttttttatgcacattggacaggctcttgatctggtat > 1:607652‑M1/1‑36 (MQ=255) gtcCATAGTGATTAATGTAGCACCGCCTAATTGCGGtaatgccgatcagttaaggatcagttgaccgatccagtggctgtgtaagaatccggaaacgctcacttgtttccggatttttttatgcacattggacaggctcttgatctggtat > 1:575837‑M1/1‑36 (MQ=255) gtcCATAGTGATTAATGTAGCACCGCCTAATTGCGGtaatgccgatcagttaaggatcagttgaccgatccagtggctgtgtaagaatccggaaacgctcacttgtttccggatttttttatgcacattggacaggctcttgatctggtat > 2:443759‑M1/1‑36 (MQ=255) gtcCATAGTGATTAATGTAGCACCGCCTAATTGCGGtaatgccgatcagttaaggatcagttgaccgatccagtggctgtgtaagaatccggaaacgctcacttgtttccggatttttttatgcacattggacaggctcttgatctggtat > 2:790584‑M1/1‑36 (MQ=255) gtcCATAGTGATTAATGTAGCACCGCCTAATTGCGGtaatgccgatcagttaaggatcagttgaccgatccagtggctgtgtaagaatccggaaacgctcacttgtttccggatttttttatgcacattggacaggctcttgatctggtat > 1:814166‑M1/1‑36 (MQ=255) agttgcttaactgactggcattaCGCCTAATTGCGGTGCTTTTTTTTACCTTGCGATCGCGAATTACTGATCCAGTTCGACCATCTCTTTCACGTCAGTACGGTTGATCTGCTGTTTGTTGCCATTAGCGTCTTTATACGAAATCATACCg < 1:92132‑M1/128‑1 (MQ=255) tcCATAGTGATTAATGTAGCACCGCCTAATTGCGGtaatgccgatcagttaaggatcagttgaccgatccagtggctgtgtaagaatccggaaacgctcacttgtttccggatttttttatgcacattggacaggctcttgatctggtat < 2:22303‑M1/150‑116 (MQ=255) gttgcttaactgactggcattaCGCCTAATTGCGGTGCTTTTTTTTACCTTGCGATCGCGAATTACTGATCCAGTTCGACCATCTCTTTCACGTCAGTACGGTTGATCTGCTGTTTGTTGCCATTAGCGTCTTTATACGAAATCATACCgg < 1:517216‑M1/129‑1 (MQ=255) ttgcttaactgactggcattaCGCCTAATTGCGGTGCTTTTTTTTACCTTGCGATCGCGAATTACTGATCCAGTTCGACCATCTCTTTCACGTCAGTACGGTTGATCTGCTGTTTGTTGCCATTAGCGTCTTTATACGAAATCATACCg > 1:561193‑M1/22‑149 (MQ=255) ccATAGTGATTAATGTAGCACCGCCTAATTGCGGtaatgccgatcagttaaggatcagttgaccgatccagtggctgtgtaagaatccggaaacgctcacttgtttccggatttttttatgcacattggagaggctcttgatctggtatcc < 1:770225‑M1/151‑118 (MQ=255) ttaactgactggcattaCGCCTAATTGCGGTGCTTTTTTTTACCTTGCGATCGCGAATTACTGATCCAGTTCGACCATCTCTTTCACGTCAGTACGGTTGATCTGCTGTTTGTTGCCATTAGCGTCTTTATACGAAATCATACCGGTATCg > 2:755709‑M1/18‑151 (MQ=255) gTGATTAATGTAGCACCGCCTAATTGCGGtaatgccgatcagttaaggatcagttgaccgatccagtggctgtgtaagaatccggaaacgctcacttgtttccggatttttttatgcacattggacaggctcttgatctggtatcccgtta > 1:720449‑M1/1‑29 (MQ=255) gATTAATGTAGCACCGCCTAATTGCGGtaatgccgatcagttaaggatcagttgaccgatccagtggctgtgtaagaatccggaaacgctcacttgtttccggatttttttatgcacattggacaggctcttgatctggtatcccgttacg > 1:269631‑M1/1‑27 (MQ=255) gATTAATGTAGCACCGCCTAATTGCGGtaatgccgatcagttaaggatcagttgaccgatccagtggctgtgtaagaatccggaaacgctcacttgtttccggatttttttatgcacattggacaggctcttgatctggtatcccgttacg > 1:285626‑M1/1‑27 (MQ=255) gATTAATGTAGCACCGCCTAATTGCGGtaatgccgatcagttaaggatcagttgaccgatccagtggctgtgtaagaatccggaaacgctcacttgtttccggatttttttatgcacattggacaggctcttgatctggtatcccgttacg > 1:68021‑M1/1‑27 (MQ=255) gATTAATGTAGCACCGCCTAATTGCGGtaatgccgatcagttaaggatcagttgaccgatccagtggctgtgtaagaatccggaaacgctcacttgtttccggatttttttatgcacattggacaggctcttgatctggtatcccgttacg > 2:148420‑M1/1‑27 (MQ=255) actgactggcattaCGCCTAATTGCGGTGCTTTTTTTTACCTTGCGATCGCGAATTACTGATCCAGTTCGACCATCTCTTTCACGTCAGTACGGTTGATCTGCTGTTTGTTGCCATTAGCGTCTTTATACGAAATCATACCGGTATCGTTa > 1:262389‑M1/15‑151 (MQ=255) ttAATGTAGCACCGCCTAATTGCGGtaatgccgatcagttaaggatcagttgaccgatccagtggctgtgtaagaatccggaaacgctcacttgtttccggatttttttatgcacattggacaggctcttgatctggtatcccgttacgat < 1:201846‑M1/151‑127 (MQ=255) gactggcattaCGCCTAATTGCGGTGCTTTTTTTTACCTTGCGATCGCGAATTACTGATCCAGTTCGACCATCTCTTTCACGTCAGTACGGTTGATCTGCTGTTTGTTGCCATTAGCGTCTTTATACGAAATCATACCGGTATCGTTATCa < 2:38784‑M1/140‑1 (MQ=255) aTGTAGCACCGCCTAATTGCGGtaatgccgatcagttaaggatcagttgaccgatccagtggctgtgtaagaatccggaaacgctcacttgtttccggatttttttatgcacattggacaggctcttgatctggtatcccgttacgatt > 2:563214‑M1/1‑22 (MQ=255) aTGTAGCACCGCCTAATTGCGGtaatgccgatcagttaaggatcagttgaccgatccagtggctgtgtaagaatccggaaacgctcacttgtttccggatttttttatgcacattggacaggctcttgatctggtatcccgttacgatt > 2:638198‑M1/1‑22 (MQ=255) aTGTAGCACCGCCTAATTGCGGtaatgccgatcagttaaggatcagttgaccgatccagtggctgtgtaagaatccggaaacgctcacttgtttccggatttttttatgcacattggacaggctcttgatctggtatcccgttacgatt > 1:657864‑M1/1‑22 (MQ=255) aTGTAGCACCGCCTAATTGCGGtaatgccgatcagttaaggatcagttgaccgatccagtggctgtgtaagaatccggaaacgctcacttgtttccggatttttttatgcacattggacaggctcttgatctggtatcccgttacgatt > 1:742942‑M1/1‑22 (MQ=255) aTGTAGCACCGCCTAATTGCGGtaatgccgatcagttaaggatcagttgaccgatccagtggctgtgtaagaatccggaaacgctcacttgtttccggatttttttatgcacattggacaggctcttgatctggtatcccgttacgatt > 1:335993‑M1/1‑22 (MQ=255) aTGTAGCACCGCCTAATTGCGGtaatgccgatcagttaaggatcagttgaccgatccagtggctgtgtaagaatccggaaacgctcacttgtttccggatttttttatgcacattggacaggctcttgatctggtatcccgttacgatt > 2:112643‑M1/1‑22 (MQ=255) ggcattaCGCCTAATTGCGGTGCTTTTTTTTACCTTGCGATCGCGAATTACTGATCCAGTTCGACCATCTCTTTCACGTCAGTACGGTTGATCTGCTGTTTGTTGCCATTAGCGTCTTTATACGAAATCATACCGGTATCGTTATCAGt < 1:615656‑M1/142‑1 (MQ=255) taCGCCTAATTGCGGTGCTTTTTTTTACCTTGCGATCGCGAATTACTGATCCAGTTCGACCATCTCTTTCACGTCAGTACGGTTGATCTGCTGTTTGTTGCCATTAGCGTCTTTATACGAAATCATACCGGTATCGTTATCAGTCTGTGGt > 2:790311‑M1/3‑151 (MQ=255) taCGCCTAATTGCGGTGCTTTTTTTTACCTTGCGATCGCGAATTACTGATCCAGTTCGACCATCTCTTTCACGTCAGTACGGTTGATCTGCTGTTTGTTGCCATTAGCGTCTTTATACGAAATCATACCGGTATCGTTATCAGTCTGTGGt > 1:858142‑M1/3‑151 (MQ=255) taCGCCTAATTGCGGTGCTTTTTTTTACCTTGCGATCGCGAATTACTGATCCAGTTCGACCATCTCTTTCACGTCAGTACGGTTGATCTGCTGTTTGTTGCCATTAGCGTCTTTATACGAAATCATACCGGTATCGTTATCAGTCTGTGGt > 2:2781‑M1/3‑151 (MQ=255) ccGCCTAATTGCGGtaatgccgatcagttaaggatcagttgaccgatccagtggctgtgtaagaatccggaaacgctcacttgtttccggatttttttatgcacattggacaggctcttgatctggtatcccgttacgattctctgcgtaa > 2:449902‑M1/1‑14 (MQ=255) cGCCTAATTGCGGtaatgccgatcagttaaggatcagttgaccgatccagtggctgtgtaagaatccggaaacgctcacttgtttccggatttttttatgcacattggacaggctcttgatctggtatcccgttacgattctctgcgtaac < 1:426314‑M1/151‑139 (MQ=255) cGCCTAATTGCGGtaatgccgatcagttaaggatcagttgaccgatccagtggctgtgtaagaatccggaaacgctcacttgtttccggatttttttatgcacattggacaggctcttgatctggtatcccgttacgattctctgcgtaac < 2:25894‑M1/151‑139 (MQ=255) CGCCTAATTGCGGTGCTTTTTTTTACCTTGCGATCGCGAATTACTGATCCAGTTCGACCATCTCTTTCACGTCAGTACGGTTGATCTGCTGTTTGTTGCCATTAGCGTCTTTATACGAAATCATACCGGTATCGTTATCAGTCTGTGGttt < 1:670777‑M1/151‑1 (MQ=255) | TGCGTGTTCTGGTGAACTTTTGGCTTACGGTTGTGATGTTGTGTTGTTGTGTTTGCAATTGGTCTGCGATTCAGACCATGGTAGCAAAGCTACCTTTTTTCACTTCCTGTACATTTACCCTGTCTGTCCATAGTGATTAATGTAGCACCGCCTAATTGCGGTGCTTTTTTTTACCTTGCGATCGCGAATTACTGATCCAGTTCGACCATCTCTTTCACGTCAGTACGGTTGATCTGCTGTTTGTTGCCATTAGCGTCTTTATACGAAATCATACCGGTATCGTTATCAGTCTGTGGTTT > NC_000913/2942730‑2943028 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |