| Predicted mutation | ||||||
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| JC JC | NC_000913 | 2,942,878 | IS4 (+) +13 bp | intergenic (‑311/+28) | gcvA ← / ← ygdI | glycine cleavage system transcriptional activator; autorepressor/DUF903 family verified lipoprotein |
| New junction evidence | |||||||||||
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| ? | NC_000913 | = 4503515 | NA (NA) | noncoding (1/1426 nt) | IS4 | repeat region | |||||
Only 100 of 107 total aligned reads displayed.
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ggcattaCGCCTAATTGCGGTGCTTTTTTTTACCTTGCGATCGCGAATTACTGATCCAGTTCGACCATCTCTTTCACGTCAGTACGGTTGATCTGCTGTTTGTTGCCATTAGCGTCTTTATACGAAATCATACCGGTATCGTTATCAGt < 1:615656‑M1/142‑1 (MQ=255) taCGCCTAATTGCGGTGCTTTTTTTTACCTTGCGATCGCGAATTACTGATCCAGTTCGACCATCTCTTTCACGTCAGTACGGTTGATCTGCTGTTTGTTGCCATTAGCGTCTTTATACGAAATCATACCGGTATCGTTATCAGTCTGTGGt > 2:2781‑M1/3‑151 (MQ=255) taCGCCTAATTGCGGTGCTTTTTTTTACCTTGCGATCGCGAATTACTGATCCAGTTCGACCATCTCTTTCACGTCAGTACGGTTGATCTGCTGTTTGTTGCCATTAGCGTCTTTATACGAAATCATACCGGTATCGTTATCAGTCTGTGGt > 1:858142‑M1/3‑151 (MQ=255) taCGCCTAATTGCGGTGCTTTTTTTTACCTTGCGATCGCGAATTACTGATCCAGTTCGACCATCTCTTTCACGTCAGTACGGTTGATCTGCTGTTTGTTGCCATTAGCGTCTTTATACGAAATCATACCGGTATCGTTATCAGTCTGTGGt > 2:790311‑M1/3‑151 (MQ=255) ccGCCTAATTGCGGtaatgccgatcagttaaggatcagttgaccgatccagtggctgtgtaagaatccggaaacgctcacttgtttccggatttttttatgcacattggacaggctcttgatctggtatcccgttacgattctctgcgtaa > 2:449902‑M1/1‑14 (MQ=255) cGCCTAATTGCGGtaatgccgatcagttaaggatcagttgaccgatccagtggctgtgtaagaatccggaaacgctcacttgtttccggatttttttatgcacattggacaggctcttgatctggtatcccgttacgattctctgcgtaac < 2:25894‑M1/151‑139 (MQ=255) cGCCTAATTGCGGtaatgccgatcagttaaggatcagttgaccgatccagtggctgtgtaagaatccggaaacgctcacttgtttccggatttttttatgcacattggacaggctcttgatctggtatcccgttacgattctctgcgtaac < 1:426314‑M1/151‑139 (MQ=255) CGCCTAATTGCGGTGCTTTTTTTTACCTTGCGATCGCGAATTACTGATCCAGTTCGACCATCTCTTTCACGTCAGTACGGTTGATCTGCTGTTTGTTGCCATTAGCGTCTTTATACGAAATCATACCGGTATCGTTATCAGTCTGTGGttt < 1:670777‑M1/151‑1 (MQ=255) gCCTAATTGCGGtaatgccgatcagttaaggatcagttgaccgatccagtggctgtgtaagaatccggaaacgctcacttgtttccggatttttttatgcacattggacaggctcttgatctggtatcccgttacgattctctgcgtaac > 2:389874‑M1/1‑12 (MQ=255) gCCTAATTGCGGtaatgccgatcagttaaggatcagttgaccgatccagtggctgtgtaagaatccggaaacgctcacttgtttccggatttttttatgcacattggacaggctcttgatctggtatcccgttacgattctctgcgtaac > 2:352252‑M1/1‑12 (MQ=255) gCCTAATTGCGGTGCTTTTTTTTACCTTGCGATCGCGAATTACTGATCCAGTTCGACCATCTCTTTCACGTCAGTACGGTTGATCTGCTGTTTGTTGCCATTAGCGTCTTTATACGAAATCATACCGGTATCGTTATCAGTCTGTGGTTTg > 2:241427/1‑151 (MQ=255) gCCTAATTGCGGTGCTTTTTTTTACCTTGCGATCGCGAATTACTGATCCAGTTCGACCATCTCTTTCACGTCAGTACGGTTGATCTGCTGTTTGTTGCCATTAGCGTCTTTATACGAAATCATACCGGTATCGTTATCAGTCTGTGGTTTg > 1:14110/1‑151 (MQ=255) ccTAATTGCGGtaatgccgatcagttaaggatcagttgaccgatccagtggctgtgtaagaatccggaaacgctcacttgtttccggatttttttatgcacattggacaggctcttgatctggtatcccgttacgattctctgcgtaaccc < 1:88037‑M1/151‑141 (MQ=255) aTTGCGGTGCTTTTTTTTACCTTGCGATCGCGAATTACTGATCCAGTTCGACCATCTCTTTCACGTCAGTACGGTTGATCTGCTGTTTGTTGCCATTAGCGTCTTTATACGAAATCATACCGGTATCGTTATCAGTCTGTGGTTTGCCGt > 1:542273/1‑150 (MQ=255) ttGCGGtaatgccgatcagttaaggatcagttgaccgatccagtggctgtgtaagaatccggaaacgctcacttgtttccggatttttttatgcacattggacaggctcttgatctggtatcccgttacgattctctgcgtaacccactga > 2:371663‑M1/1‑6 (MQ=255) ttGCGGTGCTTTTTTTTACCTTGCGATCGCGAATTACTGATCCAGTTCGACCATCTCTTTCACGTCAGTACGGTTGATCTGCTGTTTGTTGCCATTAGCGTCTTTATACGAAATCATACCGGTATCGTTATCAGTCTGTGGTTTGCCGTCa > 1:108184/1‑151 (MQ=255) tGCGGtaatgccgatcagttaaggatcagttgaccgatccagtggctgtgtaagaatccggaaacgctcacttgtttccggatttttttatgcacattggacaggctcttgatctggtatcccgttacgattctctgcgtaacccactgac < 2:289314‑M1/151‑147 (MQ=255) | ACTTTTGGCTTACGGTTGTGATGTTGTGTTGTTGTGTTTGCAATTGGTCTGCGATTCAGACCATGGTAGCAAAGCTACCTTTTTTCACTTCCTGTACATTTACCCTGTCTGTCCATAGTGATTAATGTAGCACCGCCTAATTGCGGTGCTTTTTTTTACCTTGCGATCGCGAATTACTGATCCAGTTCGACCATCTCTTTCACGTCAGTACGGTTGATCTGCTGTTTGTTGCCATTAGCGTCTTTATACGAAATCATACCGGTATCGTTATCAGTCTGTGGTTTGCCGTCAG > NC_000913/2942745‑2943036 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |