| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
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| JC JC | NC_000913 | 2,942,878 | IS4 (+) +13 bp | intergenic (‑311/+28) | gcvA ← / ← ygdI | glycine cleavage system transcriptional activator; autorepressor/DUF903 family verified lipoprotein |
| New junction evidence | |||||||||||
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| * | ? | NC_000913 | 2942878 = | 0 (0.000) | 38 (0.700) | 32/294 | 0.3 | 100% | intergenic (‑311/+40) | gcvA/ygdI | glycine cleavage system transcriptional activator; autorepressor/DUF903 family verified lipoprotein |
| ? | NC_000913 | 4502090 = | NA (NA) | noncoding (1426/1426 nt) | IS4 | repeat region | |||||
| * | ? | NC_000913 | = 2942890 | 0 (0.000) | 66 (1.220) | 41/294 | 0.1 | 100% | intergenic (‑323/+28) | gcvA/ygdI | glycine cleavage system transcriptional activator; autorepressor/DUF903 family verified lipoprotein |
| ? | NC_000913 | = 4503515 | NA (NA) | noncoding (1/1426 nt) | IS4 | repeat region | |||||
Only 100 of 138 total aligned reads displayed.
GAGAAGTCAGTGGGTTACGCAGAGAATCGTAACGGGATACCAGATCAAGAGCCTGTCCAATGTGCATAAAAAAATCCGGAAACAAGTGAGCGTTTCCGGATTCTTACACAGCCACTGGATCGGTCAACTGATCCTTAACTGATCGGCATTAATCTTGGTTCTGGTGTTTGTAACAAACTATCAGCTACAAAAATATGCTCAATTTGTGACATCAGTAACAAAACGCGTTTTGTTATGTGGATTGCTTGTTTTTTGATCTGGTATAACAGGTATAAAGGTATACAGAAAAGCAAAGAAATAC > NC_000913/4503365‑4503665 | gagaAGTCAGTGGGTTACGCAGAGAATCGTAACGGGATACCAGATCAAGAGCCTGTCCAATGTGCATAAAAAAATCCGGAAACAAGTGAGCGTTTCCGGATTCTTACACAGCCACTGGATCGGTCAACTGATCCTTAACTGATCGGCATTA < 2:669749‑M2/151‑1 (MQ=255) gTCAGTGGGTTACGCAGAGAATCGTAACGGGATACCAGATCAAGAGCCTGTCCAATGTGCATAAAAAAATCCGGAAACAAGTGAGCGTTTCCGGATTCTTACACAGCCACTGGATCGGTCAACTGATCCTTAACTGATCGGCATTAATCtt > 2:546270/1‑151 (MQ=255) tGGGTTACGCAGAGAATCGTAACGGGATACCAGATCAAGAGCCTGTCCAATGTGCATAAAAAAATCCGGAAACAAGTGAGCGTTTCCGGATTCTTACACAGCCACTGGATCGGTCAACTGATCCTTAACTGATCGGCATTAATCTTGGTTc < 1:696283/151‑1 (MQ=255) 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aTCGGTCAACTGATCCTTAACTGATCGGCATTAATCTTGGTTCTGGTGTTTGTAACAAACTATCAGCTACAAAAATATGCTCAATTTGTGACATCAGTAACAAAACGCGTTTTGTTATGTGGATTGCTTGTTTTTTGATCTGGTATAACAg < 1:2525/151‑1 (MQ=255) cAACTGATCCTTAACTGATCGGCATTAATCTTGGTTCTGGTGTTTGTAACAAACTATCAGCTACAAAAATATGCTCAATTTGTGACATCAGTAACAAAACGCGTTTTGTTATGTGGATTGCTTGTTTTTTGATCTGGTATAACAGGTATaa > 1:447388/1‑151 (MQ=255) aCTGATCCTTAACTGATCGGCATTAccgcaattaggcggtgctacattaatcactatggacagacagggtaaatgtacaggaagtgaaaaaaggtagctttgctaccatggtctgaatcgcagaccaattgcaaacacaacaacacaacat < 2:199364‑M2/151‑127 (MQ=255) aCTGATCCTTAACTGATCGGCATTAccgcaattaggcggtgctacattaatcactatggacagacagggtaaatgtacaggaagtgaaaaaaggtagctttgctaccatggtctgaatcgcagaccaattgcaaacacaacaacacaacat > 2:779843‑M2/1‑25 (MQ=255) aCTGATCCTTAACTGATCGGCATTAATCTTGGTTCTGGTGTTTGTAACAAACTATCAGCTACAAAAATATGCTCAATTTGTGACATCAGTAACAAAACGCGTTTTGTTATGTGGATTGCTTGTTTTTTGATCTGGTATAACAGGTATAAAg > 1:740157/1‑151 (MQ=255) cTGATCCTTAACTGATCGGCATTAATCTTGGTTCTGGTGTTTGTAACAAACTATCAGCTACAAAAATATGCTCAATTTGTGACATCAGTAACAAAACGCGTTTTGTTATGTGGATTGCTTGTTTTTTGATCTGGTATAACAGGTATAAAgg < 2:437035/151‑1 (MQ=255) cTGATCCTTAACTGATCGGCATTAATCTTGGTTCTGGTGTTTGTAACAAACTATCAGCTACAAAAATATGCTCAATTTGTGACATCAGTAACAAAACGCGTTTTGTTATGTGGATTGCTTGTTTTTTGATCTGGTATAACAGGTATAAAgg < 2:31274/151‑1 (MQ=255) cTGATCCTTAACTGATCGGCATTAATCTTGGTTCTGGTGTTTGTAACAAACTATCAGCTACAAAAATATGCTCAATTTGTGACATCAGTAACAAAACGCGTTTTGTTATGTGGATTGCTTGTTTTTTGATCTGGTATAACAGGTATAAAgg < 2:347895/151‑1 (MQ=255) gATCCTTAACTGATCGGCATTAccgcaattaggcggtgctacattaatcactatggacagacagggtaaatgtacaggaagtgaaaaaaggtagctttgctaccatggtctgaatcgcagaccaattgcaaacacaacaacacaacatca < 1:612676‑M2/150‑129 (MQ=255) gATCCTTAACTGATCGGCATTAATCTTGGTTCTGGTGTTTGTAACAAACTATCAGCTACAAAAATATGCTCAATTTGTGACATCAGTAACAAAACGCGTTTTGTTATGTGGATTGCTTGTTTTTTGATCTGGTATAACAGGTATAAAGGta > 2:777018/1‑151 (MQ=255) gATCCTTAACTGATCGGCATTAATCTTGGTTCTGGTGTTTGTAACAAACTATCAGCTACAAAAATATGCTCAATTTGTGACATCAGTAACAAAACGCGTTTTGTTATGTGGATTGCTTGTTTTTTGATCTGGTATAACAGGTATAAAGGta > 2:521017/1‑151 (MQ=255) gATCCTTAACTGATCGGCATTAATCTTGGTTCTGGTGTTTGTAACAAACTATCAGCTACAAAAATATGCTCAATTTGTGACATCAGTAACAAAACGCGTTTTGTTATGTGGATTGCTTGTTTTTTGATCTGGTATAACAGGTATAAAGGta > 1:692670/1‑151 (MQ=255) gATCCTTAACTGATCGGCATTAATCTTGGTTCTGGTGTTTGTAACAAACTATCAGCTACAAAAATATGCTCAATTTGTGACATCAGTAACAAAACGCGTTTTGTTATGTGGATTGCTTGTTTTTTGATCTGGTATAACAGGTATAAAGGta > 2:375360/1‑151 (MQ=255) aTCCTTAACTGATCGGCATTAccgcaattaggcggtgctacattaatcactatggacagacagggtaaatgtacaggaagtgaaaaaaggtagctttgctaccatggtctgaatcgcagaccaattgcaaacacaacaacacaacatcaca < 2:629703‑M2/151‑131 (MQ=255) aTCCTTAACTGATCGGCATTAccgcaattaggcggtgctacattaatcactatggacagacagggtaaatgtacaggaagtgaaaaaaggtagctttgctaccatggtctgaatcgcagaccaattgcaaacacaacaacacaacatcaca < 1:819123‑M2/151‑131 (MQ=255) aTCCTTAACTGATCGGCATTAccgcaattaggcggtgctacattaatcactatggacagacagggtaaatgtacaggaagtgaaaaaaggtagctttgctaccatggtctgaatcgcagaccaattgcaaacacaacaacacaacatcac > 1:529940‑M2/1‑21 (MQ=255) aTCCTTAACTGATCGGCATTAccgcaattaggcggtgctacattaatcactatggacagacagggtaaatgtacaggaagtgaaaaaaggtagctttgctaccatggtctgaatcgcagaccaattgcaaacacaacaacacaacatcac > 2:500116‑M2/1‑21 (MQ=255) aTCCTTAACTGATCGGCATTAccgcaattaggcggtgctacattaatcactatggacagacagggtaaatgtacaggaagtgaaaaaaggtagctttgctaccatggtctgaatcgcagaccaattgcaaacacaacaacacaacatcac > 2:101874‑M2/1‑21 (MQ=255) aTCCTTAACTGATCGGCATTAATCTTGGTTCTGGTGTTTGTAACAAACTATCAGCTACAAAAATATGCTCAATTTGTGACATCAGTAACAAAACGCGTTTTGTTATGTGGATTGCTTGTTTTTTGATCTGGTATAACAGGTATAAAGGtat > 2:508870/1‑151 (MQ=255) aTCCTTAACTGATCGGCATTAATCTTGGTTCTGGTGTTTGTAACAAACTATCAGCTACAAAAATATGCTCAATTTGTGACATCAGTAACAAAACGCGTTTTGTTATGTGGATTGCTTGTTTTTTGATCTGGTATAACAGGTATAAAGGtat > 2:262180/1‑151 (MQ=255) tCCTTAACTGATCGGCATTAccgcaattaggcggtgctacattaatcactctggacagacagggtaaatgtacaggaagtgaaaaaaggtagctttgctaccatggtctgaatcgcagaccaattgcaaacacaaaaacacaacatcacaa < 1:656452‑M2/151‑132 (MQ=255) ccTTAACTGATCGGCATTAccgcaattaggcggtgctacattaatcactatggacagacagggtaaatgtacaggaagtgaaaaaaggtagctttgctaccatggtctgaatcgcagaccaattgcaaacacaacaacacaacatcacaac > 1:365513‑M2/1‑19 (MQ=255) ccTTAACTGATCGGCATTAccgcaattaggcggtgctacattaatcactatggacagacagggtaaatgtacaggaagtgaaaaaaggtagctttgctaccatggtctgaatcgcagaccaattgcaaacacaacaacacaacatcacaac > 2:417588‑M2/1‑19 (MQ=255) ttAACTGATCGGCATTAATCTTGGTTCTGGTGTTTGTAACAAACTATCAGCTACAAAAATATGCTCAATTTGTGACATCAGTAACAAAACGCGTTTTGTTATGTGGATTGCTTGTTTTTTGATCTGGTATAACAGGTATAAAGGTATACAg < 2:403770/151‑1 (MQ=255) gCATTAccgcaattaggcggtgctacattaatcactatggacagacagggtaaatgtacaggaagtgaaaaaaggtagctttgctaccatggtctgaatcgcagaccaattgcaaacacaacaacacaacatcacaaccgtaagccaaaag < 1:261298‑M2/151‑146 (MQ=255) cATTAccgcaattaggcggtgctacattaatcactatggacagacagggtaaatgtacaggaagtgaaaaaaggtagctttgctaccatggtctgaatcgcagaccaattgcaaacacaacaacacaacatcacaaccgtaagccaaaagt > 1:271973‑M2/1‑5 (MQ=255) aaTCTTGGTTCTGGTGTTTGTAACAAACTATCAGCTACAAAAATATGCTCAATTTGTGACATCAGTAACAAAACGCGTTTTGTTATGTGGATTGCTTGTTTTTTGATCTGGTATAACAGGTATAAAGGTATACAGAAAAGCAAAGAAATa > 1:20880/1‑150 (MQ=255) | GAGAAGTCAGTGGGTTACGCAGAGAATCGTAACGGGATACCAGATCAAGAGCCTGTCCAATGTGCATAAAAAAATCCGGAAACAAGTGAGCGTTTCCGGATTCTTACACAGCCACTGGATCGGTCAACTGATCCTTAACTGATCGGCATTAATCTTGGTTCTGGTGTTTGTAACAAACTATCAGCTACAAAAATATGCTCAATTTGTGACATCAGTAACAAAACGCGTTTTGTTATGTGGATTGCTTGTTTTTTGATCTGGTATAACAGGTATAAAGGTATACAGAAAAGCAAAGAAATAC > NC_000913/4503365‑4503665 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |