Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A2 F42 I4 R1
|
76 |
794.2 |
35354760 |
99.3% |
35107276 |
136.2 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
AE015451_phaM1 |
542,514 |
C→G |
L252V (CTG→GTG) |
rpoC CDS (DNA‑directed RNA polymerase subunit beta') → |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | AE015451_phaM1 | 542,514 | 0 | C | G | 99.8%
| 1843.2
/ NA
| 461 | L252V (CTG→GTG) | rpoC CDS (DNA‑directed RNA polymerase subunit beta') | |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (0/0); major base G (281/179); minor base A (1/0); total (282/179) |
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 |
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
Only 100 of 463 total aligned reads displayed.
ACCAACTCGGAAACCAAGATCAAGAAGCTTTCCAAGCGTCTGAAGCTGATGGAAGCTTTCCAGGGCTCGGGCAACCTGCCTGAGTGGATGGTCCTGACCGTCCTGCCAGTGCTGCCGCCGGACCTGCGTCCGCTGGTTCCGCTGGATGGTGGCCGTTTCGCGACTTCCGACCTGAACGACCTGTATCGCCGGGTGATCAACCGTAACAACCGTCTGAAGCGCCTGCTGGATCTGTCGGCGCCGGACATCATCGTGCGCAACGAAA > AE015451_phaM1/542382‑542646
|
aCCAACTCGGAAACCAAGATCAAGAAGCTTTCCAAGCGTCTGAAGCTGATGGAAGCTTTCCAGGGCTCGGGCAACCTGCCTGAGTGGATGGTCCTGACCGTCCTGCCAGTGCTGCCGCCGGACCTGCGTCCggtggt > 2:4877289/1‑137 (MQ=255)
aCCAACTCGGAAACCAAGATCAAGAAGCTTTCCAAGCGTCTGAAGCTGATGGAAGCTTTCCAGGGCTCGGGCAACCTGCCTGAGTGGATGGTCCTGACCGTCCTGCCAGTGCTGCCGCCGGACCTGCGTCCggtggt > 1:8412129/1‑137 (MQ=255)
cAACTCGGAAACCAAGATCAAGAAGCTTTCCAAGCGTCTGAAGCTGATGGAAGCTTTCCAGGGCTCGGGCAACCTGCCTGAGTGGATGGTCCTGACCGTCCTGCCAGTGCTGCCGCCGGACCTGCGTCCGGTGGTTc > 1:11143750/1‑137 (MQ=255)
cAACTCGGAAACCAAGATCAAGAAGCTTTCCAAGCGTCTGAAGCTGATGGAAGCTTTCCAGGGCTCGGGCAACCTGCCTGAGTGGATGGTCCTGACCGTCCTGCCAGTGCTGCCGCCGGACCTGCGTCCGGTGGTTc < 2:12149679/137‑1 (MQ=255)
aaCTCGGAAACCAAGATCAAGAAGCTTTCCAAGCGTCTGAAGCTGATGGAAGCTTTCCAGGGCTCGGGCAACCTGCCTGAGTGGATGGTCCTGACCGTCCTGCCAGTGCTGCCGCCGGACCTGCGTCCGGTGGTTcc < 2:9388700/137‑1 (MQ=255)
ggAAACCAAGATCAAGAAGCTTTCCAAGCGTCTGAAGCTGATGGAAGCTTTCCAGGGCTCGGGCAACCTGCCTGAGTGGATGGTCCTGACCGTCCTGCCAGTGCTGCCGCCGGACCTGCGTCCGGTGGTTCCGCTgg > 2:15691683/1‑137 (MQ=255)
tCAAGAAGCTTTCCAAGCGTCTGAAGCTGATGGAAGCTTTCCAGGGCTCGGGCAACCTGCCTGAGTGGATGGTCCTGACCGTCCTGCCAGTGCTGCCGCCGGACCTGCGTCCGGTGGTTCCGCTg < 1:13946298/125‑1 (MQ=255)
aagaagCTTTCCAAGCGTCTGAAGCTGATGGAAGCTTTCCAGGGCTCGGGCAACCTGCCTGAGTGGATGGTCCTGACCGTCCTGCCAGTGCTGCCGCCGGACCTGCGTCCGGTGGTTCCGCTGGATGGTGGCCGttt < 1:5903797/137‑1 (MQ=255)
aagaagCTTTCCAAGCGTCTGAAGCTGATGGAAGCTTTCCAGGGCTCGGGCAACCTGCCTGAGTGGATGGTCCTGACCGTCCTGCCAGTGCTGCCGCCGGACCTGCGTCCGGTGGTTCCGCTGGATGGTGGCCGttt < 2:7223233/137‑1 (MQ=255)
aagaagCTTTCCAAGCGTCTGAAGCTGATGGAAGCTTTCCAGGGCTCGGGCAACCTGCCTGAGTGGATGGTCCTGACCGTCCTGCCAGTGCTGCCGCCGGACCTGCGTCCGGTGGTTCCGCTGGATGGTGGCCGttt < 2:5941981/137‑1 (MQ=255)
gCTTTCCAAGCGTCTGAAGCTGATGGAAGCTTTCCAGGGCTCGGGCAACCTGCCTGAGTGGATGGTCCTGACCGTCCTGCCAGTGCTGCCGCCGGACCTGCGTCCGGTGGTTCCGCTGGATGGTGGCCGTTTCGCGa < 1:6786195/137‑1 (MQ=255)
gCTTTCCAAGCGTCTGAAGCTGATGGAAGCTTTCCAGGGCTCGGGCAACCTGCCTGAGTGGATGGTCCTGACCGTCCTGCCAGTGCTGCCGCCGGACCTGCGTCCGGTGGTTCCGCTGGATGGTGGCCGTTTCGCGa < 2:6661558/137‑1 (MQ=255)
tCCAAGCGTCTGAAGCTGATGGAAGCTTTCCAGGGCTCGGGCAACCTGCCTGAGTGGATGGTCCTGACCGTCCTGCCAGTGCTGCCGCCGGACCTGCGTCCGGTGGTTCCGCTGGATGGTGGCCGTTTCGCGACTTc < 1:5421710/137‑1 (MQ=255)
cAAGCGTCTGAAGCTGATGGAAGCTTTCCAGGGCTCGGGCAACCTGCCTGAGTGGATGGTCCTGACCGTCCTGCCAGTGCTGCCGCCGGACCTGCGTCCGGTGGTTCCGCTGGATGGTGGCCGTTTCGCGACTTCCg > 2:16468183/1‑137 (MQ=255)
cAAGCGTCTGAAGCTGATGGAAGCTTTCCAGGGCTCGGGCAACCTGCCTGAGTGGATGGTCCTGACCGTCCTGCCAGTGCTGCCGCCGGACCTGCGTCCGGTGGTTCCGCTGGATGGTGGCCGTTTCGCGACTTCCg > 1:14941280/1‑137 (MQ=255)
aaGCGTCTGAAGCTGATGGAAGCTTTCCAGGGCTCGGGCAACCTGCCTGAGTGGATGGTCCTGACCGTCCTGCCAGTGCTGCCGCCGGACCTGCGTCCGGTGGTTCCGCTGGATGGTGGCCGTTTCGCGACTTCCGa > 2:6820996/1‑137 (MQ=255)
gCGTCTGAAGCTGATGGAAGCTTTCCAGGGCTCGGGCAACCTGCCTGAGTGGATGGTCCTGACCGTCCTGCCAGTGCTGCCGCCGGACCTGCGTCCGGTGGTTCCGCTGGATGGTGGCCGTTTCGCGACTTCCGAcc < 2:1775599/137‑1 (MQ=255)
cGTCTTAAGCTGATGGAAGCCTTCCAGGGCTCGGGCAACCTGCCTGATTGGATGGTCCTTACCGTCCCGCCAGTGCTGCCGCCGAACCTGCGTCCGGTGGTTCCGCTGGATGGTGGCCGTTTCGCGACTTCCGAccc < 2:2073511/137‑2 (MQ=255)
tCTGAAGCTGATGGAAGCTTTCCAGGGCTCGGGCAACCTGCCTGAGTGGATGGTCCTGACCGTCCTGCCAGTGCTGCCGCCGGACCTGCGTCCGGTGGTTCCGCTGGATGGTGGCCGTTTCGCGACTTCCGACCTGa < 2:14652158/137‑1 (MQ=255)
tCTGAAGCTGATGGAAGCTTTCCAGGGCTCGGGCAACCTGCCTGAGTGGATGGTCCTGACCGTCCTGCCAGTGCTGCCGCCGGACCTGCGTCCGGTGGTTCCGCTGGATGGTGGCCGTTTCGCGACTTCCGACCTGa > 2:8356020/1‑137 (MQ=255)
tCTGAAGCTGATGGAAGCTTTCCAGGGCTCGGGCAACCTGCCTGAGTGGATGGTCCTGACCGTCCTGCCAGTGCTGCCGCCGGACCTGCGTCCGGTGGTTCCGCTGGATGGTGGCCGTTTCGCGACTTCCGACCTGa < 2:9721878/137‑1 (MQ=255)
tGAAGCTGATGGAAGCTTTCCAGGGCTCGGGCAACCTGCCTGAGTGGATGGTCCTGACCGTCCTGCCAGTGCTGCCGCCGGACCTGCGTCCGGTGGTTCCGCTGGATGGTGGCCGTTTCGCGACTTCCGACCTGAAc < 2:17512648/137‑1 (MQ=255)
tGAAGCTGATGGAAGCTTTCCAGGGCTCGGGCAACCTGCCTGAGTGGATGGTCCTGACCGTCCTGCCAGTGCTGCCGCCGGACCTGCGTCCGGTGGTTCCGCTGGATGGTGGCCGTTTCGCGACTTCCGACCTGAAc < 1:16542898/137‑1 (MQ=255)
tGAAGCTGATGGAAGCTTTCCAGGGCTCGGGCAACCTGCCTGAGTGGACGGTCCTGACCGTCCTGCCAGTGCTGCCGACGGACCTGCGTCCGGTGGTTCCGCTGGATGGTGGCCGTTTCGCGACTTCCGACCTGAAc > 2:10228259/1‑137 (MQ=255)
gAAGCTGATGGAAGCTTTCCAGGGCTCGGGCAACCTGCCTGAGTGGATGGTCCTGACCGTCCTGCCAGTGCTGCCGCCGGACCTGCGTCCGGTGGTTCCGCTGGATGGTGGCCGTTTCGCGACTTCCGACCTGAACg > 1:2655573/1‑137 (MQ=255)
aaGCTGATGGAAGCTTTCCAGGGCTCGGGCAACCTGCCTGAGTGGATGGTCCTGACCGTCCTGCCAGTGCTGCCGCCGGACCTGCGTCCGGTGGTTCCGCTGGATGGTGGCCGTTTCGCGACTTCCGACCTGAACGa < 1:1889006/137‑1 (MQ=255)
aaGCTGATGGAAGCTTTCCAGGGCTCGGGCAACCTGCCTGAGTGGATGGTCCTGACCGTCCTGCCAGTGCTGCCGCCGGACCTGCGTCCGGTGGTTCCGCTGGATGGTGGCCGTTTCGCGACTTCCGACCTGAACGa < 1:13191790/137‑1 (MQ=255)
aaGCTGATGGAAACTTTCCAGGGCTCGGGCAACCTGCCTGAGTGGATGGTCCTGACCGTCCTGCCAGTGCTGCCGCCGGACCTGCGTCCGGTGGTTCCGCTGGATGGTGGCCGTTTCGCGACTTCCGACCTGAACGa < 1:17310392/137‑1 (MQ=255)
aGCTGATGGAAGCTTTCCAGGGCTCGGGCAACCTGCCTGAGTGGATGGTCCTGACCGTCCTGCCAGTGCTGCCGCCGGACCTGCGTCCGGTGGTTCCGCTGGATGGTGGCCGTTTCGCGACTTCCGACCTGAACGaa > 2:1149675/1‑136 (MQ=255)
aGCTGATGGAAGCTTTCCAGGGCTCGGGCAACCTGCCTGAGTGGATGGTCCTGACCGTCCTGCCAGTGCTGCCGCCGGACCTGCGTCCGGTGGTTCCGCTGGATGGTGGCCGTTTCGCGACTTCCGACCTGAACGAc > 1:10723310/1‑137 (MQ=255)
aGCTGATGGAAGCTTTCCAGGGCTCGGGCAACCTGCCTGAGTGGATGGTCCTGACCGTCCTGCCAGTGCTGCCGCCGGACCTGCGTCCGGTGGTTCCGCTGGATGGTGGCCGTTTCGCGACTTCCGACCTGAACGAc > 2:12483992/1‑137 (MQ=255)
aGCTGATGGAAGCTTTCCAGGGCTCGGGCAACCTGCCTGAGTGGATGGTCCTGACCGTCCTGCCAGTGCTGCCGCCGGACCTGCGTCCGGTGGTTCCGCTGGATGGTGGCCGCTTCGCGACTTCCGACCTGAACGAc > 2:7317493/1‑137 (MQ=255)
aGCTGATGGAAGCTTTCCAGGGCTCGGGCAACCTGCCTGAGTGGATGGTCCGGACCGTCCTGCCAGTGCTGCCGCCGGACCTGCGTCCGGTGGTTCCGCTGGATGGTGGCCGTTTCGCGACTTCCGACCt < 2:14547817/130‑1 (MQ=255)
tGGAAGCTTTCCAGGGCTCGGGCAACCTGCCTGATTGGATGGTCCTGACCGTCCTGCCAGTGCTGCCGCCGGACCTGCGTCCGGTGGTTCCGCTGGATGGTGGCCGTTTCGCGACTTCCGACCTGAACGACCTGTAt < 2:12364110/137‑1 (MQ=255)
ggAAGCTTTCCAGTGCTCGGGCAACCTGCCTGAGTGGATGGTCCTGACCGTCCTGCCAGTGCTGCCGCCGGACCTGCGTCCGGTGGTTCCGCTGGATGGTGGCCGTTTCGCGACTTCCGACCTGAACGACCTGTATc < 2:11604349/137‑1 (MQ=255)
gAAGCTTTCCAGGGCTCGGGCAACCTGCCTGAGTGGATGGTCCTGACCGTCCTGCCAGTGCTGCCGCCGGACCTGCGTCCGGTGGTTCCGCTGGATGGTGGCCGTTTCGCGACTTCCGACCTGAACGACCTGTATCg > 2:15041523/1‑137 (MQ=255)
aGCTTTCCAGGGCTCGGGCAACCTGCCTGAGTGGATGGTCCTGACCGTCCTGCCAGTGCTGCCGCCGGACCTGCGTCCGGTGGTTCCGCTGGATGGTGGCCGTTTCGCGACTTCCGACCTGAACGACCTGTATCGcc > 1:1628633/1‑137 (MQ=255)
aGCTTTCCAGGGCTCGGGCAACCTGCCTGAGTGGATGGTCCTGACCGTCCTGCCAGTGCTGCCGCCGGACCTGCGTCCGGTGGTTCCGCTGGATGGTGGCCGTTTCGCGACTTCCGACCTGAACGACCTGTATCGcc < 2:1699134/137‑1 (MQ=255)
cTTTCCAGGGCTCGGGCAACCTGCCTGAGTGGATGGTCCTGACCGTCCTGCCAGTGCTGCCGCCGGACCTGCGTCCGGTGGTTCCGCTGGATGGTGGCCGTTTCGCGACTTCCGACCTGAACGACCTGTATCGCCgg < 2:10474402/137‑1 (MQ=255)
tttCCAGGGCTCGGGCAACCTGCCTGAGTGGATGGTCCTGACCGTCCTGCCAGTGCTGCCGCCGGACCTGCGTCCGGTGGTTCCGCTGGATGGTGGCCGTTTCGCGACTTCCGACCTGAACGACCTGTATCGCCggg < 1:4745101/137‑1 (MQ=255)
ttCCAGGGCTCGGGCAACCTGCCTGAGTGGATGGTCCTGACCGTCCTGCCAGTGCTGCCGCCGGACCTGCGTCCGGTGGTTCCGCTGGATGGTGGCCGTTTCGCGACTTCCGACCTGAACGACCTGTATCGCCGGGt < 1:5189188/137‑1 (MQ=255)
ccAGGGCTCGGGCAACCTGCCTGAGTGGATGGTCCTGACCGTCCTGCCAGTGCTGCCGCCGGACCTGCGTCCGGTGGTTCCGCTGGATGGTGGCCGTTTCGCGACTTCCGACCTGAACGACCTGTATCGCCGGGTGa < 1:15395241/137‑1 (MQ=255)
ccAGGGCTCGGGCAACCTGCCTGAGTGGATGGTCCTGACCGTCCTGCCAGTGCTGCCGCCGGACCTGCGTCCGGTGGTTCCGCTGGATGGTGGCCGTTTCGCGACTTCCGACCTGAACGACCTGTATCGCCGGGTGa < 1:12422168/137‑1 (MQ=255)
aGGGCTCGGGCAACCTGCCTGAGTGGATGGTCCTGACCGTCCTGCCAGTGCTGCCGCCGGACCTGCGTCCGGTGGTTCCGCTGGATGGTGGCCGTTTCGCGACTTCCGACCTGAACGACCTGTATCGCCGGGTGATc < 1:2416278/137‑1 (MQ=255)
tCGGGCAACCTGCCTGAGTGGATGGTCCTGACCGTCCTGCCAGTGCTGCCGCCGGACCTGCGTCCGGTGGTTCCGCTGGATGGTGGCCGTTTCGCGACTTCCGACCTGAACGACCTGTATCGCCGGGTGATCAACCg < 1:2924513/137‑1 (MQ=255)
gggCAACCTGCCTGAGTGGATGGTCCTGACCGTCCTGCCAGTGCTGCCGCCGGACCTGCGTCCGGTGGTTCCGCTGGATGGTGGCCGTTTCGCGACTTCCGACCTGAACGACCTGTATCGCCGGGTGATCAACCGTa > 1:9825092/1‑137 (MQ=255)
gggCAACCTGCCTGAGTGGATGGTCCTGACCGTCCTGCCAGTGCTGCCGCCGGACCTGCGTCCGGTGGTTCCGCTGGATGGTGGCCGTTTCGCGACTTCCGACCTGAACGACCTGTATCGCCGGGTGATCAACCGTa < 2:13464312/137‑1 (MQ=255)
gggCAACCTGCCTGAGTGGATGGTCCTGACCGTCCTGCCAGTGCTGCCGCCGGACCTGCGTCCGGTGGTTCCGCTGGATGGTGGCCGTTTCGCGACTTCCGACCTGAACGACCTGTATCGCCGGGTGATCAACCGTa < 2:4190021/137‑1 (MQ=255)
gggCAACCTGCCTGAGTGGATGGTCCTGACCGTCCTGCCAGTGCTGCCGCCGGACCTGCGTCCGGTGGTTCCGCTGGATGGTGGCCGTTTCGCGACTTCCGACCTGAACGACCTGTATCGCCGGGTGATCAACCGTa < 1:9471966/137‑1 (MQ=255)
gggCAACCTGCCTGAGTGGATGGTCCTGACCGTCCTGCCAGTGCTGCCGCCGGACCTGCGTCCGGTGGTTCCGCTGGATGGTGGCCGTTTCGCGACTTCCGACCTGAACGACCTGTATCGCCGGGTGATCAACCGTa < 1:14372490/137‑1 (MQ=255)
gggCAACCTGCCTGAGTGGATGGTCCTGACCGTCCTGCCAGTGCTGCCGCCGGACCTGCGTCCGGTGGTTCCGCTGGATGGTGGCCGTTTCGCGACTTCCGACCTGAACGACCTGTATCGCCGGGTGATCAACCGTa < 1:11433411/137‑1 (MQ=255)
cAACCTGCCTGAGTGGATGGTCCTGACCGTCCTGCCAGTGCTGCCGCCGGACCTGCGTCCGGTGGTTCCGCTGGATGGTGGCCGTTTCGCGACTTCCGACCTGACCGACCTGTATCGCCGGGTGATCAACCGTaaca > 1:2236599/1‑137 (MQ=255)
cAACCTGCCTGAGTGGATGGTCCTGACCGTCCTGCCAGTGCTGCCGCCGGACCTGCGTCCGGTGGTTCCGCTGGATGGTGGCCGTTTCGCGACTTCCGACCTGAACGACCTGTATCGCCGGGTGATCAACCGTaaca > 2:5618761/1‑137 (MQ=255)
cAACCTGCCTGAGTGGATGGTCCTGACCGTCCTGCCAGTGCTGCCGCCGGACCTGCGTCCGGTGGTTCCGCTGGATGGTGGCCGTTTCGCGACTTCCGACCTGAACGACCTGTATCGCCGGGTGATCAACCGTaaca > 1:1597599/1‑137 (MQ=255)
gcctgAGTGGATGGTCCTGACCGTCCTGCCAGTGCTGCCGCCGGACCTGCGTCCGGTGGTTCCGCTGGATGGTGGCCGTTTCGCGACTTCCGACCTGAACGACCTGTATCGCCGGGTGATCAACCGTAACAACCGTc > 1:796935/1‑137 (MQ=255)
gcctgAGTGGATGGTCCTGACCGTCCTGCCAGTGCTGCCGCCGGACCTGCGTCCGGTGGTTCCGCTGGATGGTGGCCGTTTCGCGACTTCCGACCTGAACGACCTGTATCGCCGGGTGATCAACCGTAACAACCGTc > 1:14814888/1‑137 (MQ=255)
gcctgAGTGGATGGTCCTGACCGTCCTGCCAGTGCTGCCGCCGGACCTGCGTCCGGTGGTTCCGCTGGATGGTGGCCGTTTCGCGACTTCCGACCTGAACGACCTGTATCGCCGGGTGATCAACCGTAACAACCGTc > 2:17446228/1‑137 (MQ=255)
ccTGACCGTCCTGCCAGTGCTGCCGCCGGACCTGCGTCCGGTGGTTCCGCTGGATGGTGGCCGTTTCGCGACTTCCGACCTGAACGACCTGTATCGCCGGGTGATCAACCGTAACAACCGTCTGAAGCGCCTGCTgg > 2:6238716/1‑137 (MQ=255)
gACCGTCCTGCCAGTGCTGCCGCCGGACCTGCGTCCGGTGGTTCCGCTGGATGGTGGCCGTTTCGCGACTTCCGACCTGAACGACCTGTATCGCCGGGTGATCAACCGTAACAACCGTCTGAAGCGCCTGCTGGATc < 1:1452071/137‑1 (MQ=255)
gACCGTCCTGCCAGTGCTGCCGCCGGACCTGCGTCCGGTGGTTCCGCTGGATGGTGGCCGTTTCGCGACTTCCGACCTGAACGACCTGTATCGCCGGGTGATCAACCGTAACAACCGTCTGAAGCGCCTGCTGGATc > 1:11662178/1‑137 (MQ=255)
gACCGTCCTGCCAGTGCTGCCGCCGGACCTGCGTCCGGTGGTTCCGCTGGATGGTGGCCGTTTCGCGACTTCCGACCTGAACGACCTGTATCGCCGGGTGATCAACCGTAACAACCGTCTGAAGCGCCTGCTGGATc < 1:370845/137‑1 (MQ=255)
gTCCTGCCAGTGCTGCCGCCGGACCTGCGTCCGGTGGTTCCGCTGGATGGTGGCCGTTTCGCGACTTCCGACCTGAACGACCTGTATCGCCGGGTGATCAACCGTAACAACCGTCTGAAGCGCCTGCTGGATCTGTc > 2:8045216/1‑137 (MQ=255)
gTCCTGCCAGTGCTGCCGCCGGACCTGCGTCCGGTGGTTCCGCTGGATGGTGGCCGTTTCGCGACTTCCGACCTGAACGACCTGTATCGCCGGGTGATCAACCGTAACAACCGTCTGAAGCGCCTGCTGGATCTGTc > 1:3546990/1‑137 (MQ=255)
gTCCTGCCAGTGCTGCCGCCGGACCTGCGTCCGGTGGTTCCGCTGGATGGTGGCCGTTTCGCGACTTCCGACCTGAACGACCTGTATCGCCGGGTGATCAACCGTAACAACCGTCTGAAGCGCCTGCTGGATCTGTc > 1:7438516/1‑137 (MQ=255)
gTCCTGCCAGTGCTGCCGCCGGACCTGCGTCCGGTGGTTCCGCTGGATGGTGGCCGTTTCGCGACTTCCGACCTGAACGACCTGTATCGCCGGGTGATCAACCGTAACAACCGTCTGAAGCGCCTGCTGGATCTGTc > 1:4277889/1‑137 (MQ=255)
gTCCTGCCAGTGCTGCCGCCGGACCTGCGTCCGGTGGTTCCGCTGGATGGTGGCCGTTTCGCGACTTCCGACCTGAACGACCTGTATCGCCGGGTGATCAACCGTAACAACCGTCTGAAGCGCCTGCTGGATCCGTc > 1:14024752/1‑137 (MQ=255)
tCCTGCCAGTTCTGCCGCCGGACCTGCTTCCGGTGGTTCCGCTGGAGGGTGGCCGTTTCGCGACTCCCGACCTGAACGACCTGTATCGCCGGGTGATCAACCGTAACAACCGTCTGAAGCGCCTGCTGGATCTGTCg < 2:15379091/137‑1 (MQ=255)
tCCTGCCAGTGCTGCCGCCGGACCTGCGTCCGGTGGTTCCGCTGGATGGTGGCCGTTTCGCGACTTCCGACCTGAACGACCTGTATCGCCGGGTGATCAACCGTAACAACCGTCTGAAGCGCCTGCTGGATCTGTCg < 2:3894561/137‑1 (MQ=255)
tCCTGCCAGTGCTGCCGCCGGACCTGCGTCCGGTGGTTCCGCTGGATGGTGGCCGTTTCGCGACTTCCGACCTGAACGACCTGTATCGCCGGGTGATCAACCGTAACAACCGTCTGAAGCGCCTGCTGGATCTGTCg < 1:3635976/137‑1 (MQ=255)
tCCTGCCAGTGCTGCCGCCGGACCTGCGTCCGGTGGTTCCGCTGGATGGTGGCCGTTTCGCGACTTCCGACCTGAACGACCTGTATCGCCGGGTGATCAACCGTAACAACCGTCTGAAGCGCCTGCTGGATCTGTCg < 1:10115365/137‑1 (MQ=255)
tCCTGCCAGTGCTGCCGCCGGACCTGCGTCCGGTGGTTCCGCTGGATGGTGGCCGTTTCGCGACTTCCGACCTGAACGACCTGTATCGCCGGGTGATCAACCGTAACAACCGTCTGAAGCGCCTGCTGGATCTGTCg < 1:7373007/137‑1 (MQ=255)
ccTGCCAGTGCTGCCGCCGGACCTGCGTCCGGTGGTTCCGCTGGATGGTGGCCGTTTCGCGACTTCCGACCTGAACGACCTGTATCGCCGGGTGATCAACCGTAACAACCGTCTGAAGCGCCCGCTGGATCTGTCgg < 1:8774410/137‑1 (MQ=255)
cTGCCAGTGCTGCCGCCGGACCTGCGTCCGGTGGTTCCGCTGGATGGTGGCCGTTTCGCGACTTCCGACCTGAACGACCTGTATCGCCGGGTGATCAACCGTAACAACCGTCTGAAGCGCCTGCTGGATCTGTCGgc < 1:6281887/137‑1 (MQ=255)
cTGCCAGTGCTGCCGCCGGACCTGCGTCCGGTGGTTCCGCTGGATGGTGGCCGTTTCGCGACTTCCGACCTGAACGACCTGTATCGCCGGGTGATCAACCGTAACAACCGTCTGAAGCGCCTGCTGGATCTGTCGgc < 2:3250128/137‑1 (MQ=255)
tGCCAGTGCTGCCGCCGGACCTGCGTCCGGTGGTTCCGCTGGATGGTGGCCGTTTCGCGACTTCCGACCTGAACGACCTGTATCGCCGGGTGATCAACCGTAACAACCGTCTGAAGCGCCTGCTGGATCTGTCGgcg > 1:13441058/1‑137 (MQ=255)
tGCCAGTGCTGCCGCCGGACCTGCGTCCGGTGGTTCCGCTGGATGGTGGCCGTTTCGCGACTTCCGACCTGAACGACCTGTATCGCCGGGTGATCAACCGTAACAACCGTCTGAAGCGCCTGCTGGATCTGTCGgcg > 2:7630010/1‑137 (MQ=255)
gCCAGTGCTGCCGCCGGACCTGCGTCCGGTGGTTCCGCTGGATGGTGGCCGTTTCGCGACTTCCGACCTGAACGACCTGTATCGCCGGGTGATTAACCGTAACAACCGTCTGAAGCGCCTGCTGGATCTGTCGgcgc > 2:4315837/1‑137 (MQ=255)
gCCAGTGCTGCCGCCGGACCTGCGTCCGGTGGTTCCGCTGGATGGTGGCCGTTTCGCGACTTCCGACCTGAACGACCTGTATCGCCGGGTGATCAACCGTAACAACCGTCTGAAGCGCCTGCTGGATCTGTCGgcgc > 2:11246340/1‑137 (MQ=255)
gCCAGTGCTGCCGCCGGACCTGCGTCCGGTGGTTCCGCTGGATGGTGGCCGTTTCGCGACTTCCGACCTGAACGACCTGTATCGCCGGGTGATCAACCGTAACAACCGTCTGAAGCGCCTGCTGGATCTGTCGgcgc > 2:5109612/1‑137 (MQ=255)
gCCAGTGCTGCCGCCGGACCTGCGTCCGGTGGTTCCGCTGGATGGTGGCCGTTTCGCGACTTCCGACCTGAACGACCTGTATCGCCGGGTGATCAACCGTAACAACCGTCTGAAGCGCCTGCTGGATCTGTCGgcgc > 1:7715091/1‑137 (MQ=255)
gCCAGTGCTGCCGCCGGACCTGCGTCCGGTGGTTCCGCTGGATGGTGGCCGTTTCGCGACTTCCGACCTGAACGACCTGTATCGCCGGGTGATCAACCGTAACAACCGTCTGAAGCGCCTGCTGGATCTGTCGgcgc > 1:9202009/1‑137 (MQ=255)
gCCAGTGCTGCCGCCGGACCTGCGTCCGGTGGTTCCGCTGGATGGTGGCCGTTTCGCGACTTCCGACCTGAACGACCTGTATCGCCGGGTGATCAACCGTAACAACCGTCTGAAGCGCCTGCTGGATCTGTCGgcgc > 1:12769130/1‑137 (MQ=255)
gCCAGTGCTGCCGCCGGACCTGCGTCCGGTGGTTCCGCTGGATGGTGGCCGTTTCGCGACTTCCGACCTGAACGACCTGTATCGCCGGGTGATCAACCGTAACAACCGTCTGAAGCGCCTGCTGGATCTGTCGgcgc > 2:3607447/1‑137 (MQ=255)
gCCAGTGCTGCCGCCGGACCTGCGTCCGGTGGTTCCGCTGGATGGTGGCCGTTTCGCGACTTCCGACCTGAACGACCTGTATCGCCGGGTGATCAACCGTAACAACCGTCTGAAGCGCCTGCTGGATCTGTCGgcgc > 2:4623441/1‑137 (MQ=255)
gCCAGTGCTGCCGCCGGACCTGCGTCCGGTGGTTCCGCTGGATGGTGGCCGTTTCGCGACTTCCGACCTGAACGACCTGTATCGCCGGGTGATCAACCGTAACAACCGTCTGAAGCGCCTGCTGGATCTGTCGgcgc > 1:16743423/1‑137 (MQ=255)
gCCAGTGCTGCCGCCGGACCTGCGTCCGGTGGTTCCGCTGGATGGTGGCCGTTTCGCGACTTCCGACCTGAACGACCTGTATCGCCGGGTGATCAACCGTAACAACCGTCTGAAGCGCCTGCTGGATCTGTCGgcgc > 1:17552766/1‑137 (MQ=255)
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CGTCCGGTGGTTCCGCTGGATGGTGGCCGTTTCGCGACTTCCGACCTGAACGACCTGTATCGCCGGGTGATCAACCGTAACAACCGTCTGAAGCtgtctcttatacacatctccgagcccacgagacattagaagacatctggtgggtcgt > LH00941:114:22FVMWLT1:2:1157:19656:4587/1‑94 (MQ=60)
CGTCCGGTGGTTCCGCTGGATGGTGGCCGTTTCGCGACTTCCGACCTGAACGACCTGTATCGCCGGGTGATCAACCGTAACAACCGTCTGAAGCGCCTGCTGGATCTGTCGGCGCCGGACATCATCGTGCGCAACGAAAAGCGCATGCTGC < LH00941:114:22FVMWLT1:2:1234:16042:25900/151‑1 (MQ=60)
CGTCCGGTGGTTCCGCTGGATGGTGGCCGTTTCGCGACTTCCGACCTGAACGACCTGTATCGCCGGGTGATCAACCGTAACAACCGTCTGAAGCGCCTGCTGGATCTGTCGGCGCCGGACATCATCGTGCGCAACGAAAAGCGCATGCTGC < LH00941:114:22FVMWLT1:2:1234:16051:25916/151‑1 (MQ=60)
GTCCGGTGGTTCCGCTGGATGGTGGCCGTTTCGCGACTTCCGACCTGAACGACCTGTATCGCCGGGTGATCAACCGTAACAACCGTCTGAAGCGCCTGCTGGATCTGTCGGCGCCGGACATCATCGTGCGCAACGAAAAGCGCATGCTGCA > LH00941:114:22FVMWLT1:2:1237:23364:22025/1‑151 (MQ=60)
GTCCGGTGGTTCCGCTGGATGGTGGCCGTTTCGCGACTTCCGACCTGAACGACCTGTATCGCCGGGTGATCAACCGTAACAACCGTCTGAAGCGCCTGCTGGATCTGTCGGCGCCGGACATCATCGTGCGCAACGAAAAGCGCATGCTGCA > LH00941:114:22FVMWLT1:2:1253:2008:9919/1‑151 (MQ=60)
CGGTGGTTCCGCTGGATGGTGGCCGTTTCGCGACCTCCGACCTGAACGACCTGTATCGCCGGGTGATCAACCGTAACAACCGTCTGAAGCGCCTGCTGGATCTGTCGGCGCCGGACATCATCGTGCGCAACGAAAAGCGCATGCTGCAGGA > LH00941:114:22FVMWLT1:2:2124:10217:20584/1‑151 (MQ=60)
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CGCGAAGAAATTCCGCAGACCAACTCGGAAACCAAGATCAAGAAGCTTTCCAAGCGTCTGAAGCTGATGGAAGCTTTCCAGGGCTCGGGCAACCTGCCTGAGTGGATGGTCCTGACCGTCCTGCCAGTGCTGCCGCCGGACCTGCGTCCGCTGGTTCCGCTGGATGGTGGCCGTTTCGCGACTTCCGACCTGAACGACCTGTATCGCCGGGTGATCAACCGTAACAACCGTCTGAAGCGCCTGCTGGATCTGTCGGCGCCGGACATCATCGTGCGCAACGAAAAGCGCATGCTGCAGGA > AE015451_phaM1/542364‑542662
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| Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 0 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |