Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A2 F73 I2 R1
|
76 |
833.2 |
37290668 |
99.4% |
37066923 |
136.3 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
AE015451_phaM1 |
542,514 |
C→G |
L252V (CTG→GTG) |
rpoC CDS (DNA‑directed RNA polymerase subunit beta') → |
|
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | AE015451_phaM1 | 542,514 | 0 | C | G | 100.0%
| 2697.1
/ NA
| 680 | L252V (CTG→GTG) | rpoC CDS (DNA‑directed RNA polymerase subunit beta') | |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (0/0); new base G (421/259); total (421/259) |
Only 100 of 691 total aligned reads displayed.
GACCAACTCGGAAACCAAGATCAAGAAGCTTTCCAAGCGTCTGAAGCTGATGGAAGCTTTCCAGGGCTCGGGCAACCTGCCTGAGTGGATGGTCCTGACCGTCCTGCCAGTGCTGCCGCCGGACCTGCGTCCGCTGGTTCCGCTGGATGGTGGCCGTTTCGCGACTTCCGACCTGAA‑‑‑‑‑CGACCTGTATCGCCGGGTGATCAACCGTAACAACCGTCTGAAGCGCCTGCTGGATCTGTCGGCGCCGGACATCATCGTGCGCAACG > AE015451_phaM1/542381‑542643
|
aCCAACTCGGAAACCAAGATCAAGAAGCTTTCCAAGCGTCTGAAGCTGATGGAAGCTTTCCAGGGCTCGGGCAACCTGCCTGAGTGGATGGTCCTGACCGTCCTGCCAGTGCTGCCGCCGGACCTGCGTCCggtggt > 2:10762069/1‑137 (MQ=255)
aCCAACTCGGAAACCAAGATCAAGAAGCTTTCCAAGCGTCTGAAGCTGATGGAAGCTTTCCAGGGCTCGGGCAACCTGCCTGAGTGGATGGTCCTGACCGTCCTGCCAGTGCTGCCGCCGGACCTGCGTCCggtggt > 1:8531799/1‑137 (MQ=255)
ccAACTCGGAAACCAAGATCAAGAAGCTTTCCAAGCGTCTGAAGCTGATGGAAGCTTTCCAGGGCTCGGGCAACCTGCCTGAGTGGATGGTCCTGACCGTCCTGCCAGTGCTGCCGCCGGACCTGCGTCCGGTGGtt < 1:8113249/137‑1 (MQ=255)
cAACTCGGAAACCAAGATCAAGAAGCTTTCCAAGCGTCTGAAGCTGATGGAAGCTTTCCAGGGCTCGGGCAACCTGCCTGAGTGGATGGTCCTGACCGTCCTGCCAGTGCTGCCGCCGGACCTGCGTCCGGTGGTTc < 1:6562325/137‑1 (MQ=255)
aaCTCGGAAACCAAGATCAAGAAGCTTTCCAAGCGTCTGAAGCTGATGGAAGCTTTCCAGGGCTCGGGCAACCTGCCTGAGTGGATGGTCCTGACCGTCCTGCCAGTGCTGCCGCCGGACCTGCGTCCGGTGGTTcc > 2:11552198/1‑137 (MQ=255)
cTCGGAAACCAAGATCAAGAAGCTTTCCAAGCGTCTGAAGCTGATGGAAGCTTTCCAGGGCTCGGGCAACCTGCCTGAGTGGATGGTCCTGACCGTCCTGCCAGTGCTGCCGCCGGACCTGCGTCCGGTGGTTCCGc > 1:7234301/1‑137 (MQ=255)
ccAAGATCAAGAAGCTTTCCAAGCGTCTGAAGCTGATGGAAGCTTTCCAGGGCTCGGGCAACCTGCCTGAGTGGATGGTCCTGACCGTCCTGCCAGTGCTGCCGCCGGACCTGCGTCCGGTGGTTCCGCTGGAtggt > 2:6352856/1‑137 (MQ=255)
ccAAGATCAAGAAGCTTTCCAAGCGTCTGAAGCTGATGGAAGCTTTCCAGGGCTCGGGCAACCTGCCTGAGTGGATGGTCCTGACCGTCCTGCCAGTGCTGCCGCCGGACCTGCGTCCGGTGGTTCCGCTGGAtggt > 2:17522952/1‑137 (MQ=255)
ccAAGATCAAGAAGCTTTCCAAGCGTCTGAAGCTGATGGAAGCTTTCCAGGGCTCGGGCAACCTGCCTGAGTGGATGGTCCTGACCGTCCTGCCAGTGCTGCCGCCGGACCTGCGTCCGGTGGTTCCGCTGGAtggt > 1:13081680/1‑137 (MQ=255)
ccAAGATCAAGAAGCTTTCCAAGCGTCTGAAGCTGATGGAAGCCTTCCAGGGCTCGGGCAACCTGCCTGAGTGGATGGTCCTGACCGTCCTGCCAGTGCTGCCGCCGGACCTGCGTCCGGTGGTTCCGCTGGAtggt > 2:6649038/1‑137 (MQ=255)
ccAAGATCAAGAAGCTTTACAAGCGTCTGAAGCTGATGGAGGCTTTCCAGGGCTCAGGCAACCTGCCCGAGTGGATGGTCCTGAACGTCCTGCCAGTGCTGCCGCCGGACCTGCATCCGGTGGTTCCGCTGGAtggt > 2:988331/1‑137 (MQ=255)
tCAAGAAGCTTTCCAAGCGTCTGAAGCTGATGGAAGCTTTCCAGGGCTCGGGCAACCTGCCTGAGTGGATGGTCCTGACCGTCCTGCCAGTGCTGCCGCCGGACCTGCGTCCGGTGGTTCCGCTGGATGGTGGCCGt > 2:7215663/1‑137 (MQ=255)
aagaagCTTTCCAAGCGTTTGAAGCTGATGGAAGCTTTCCAGGGCTCGGGCAACCTGCCTGAGTGGATGGTCCTGACCGTCCTGCCAGTGCTGCCGCCGGACCTGCGTCCGGTGGTTCCGCTGGATGGTGGCCGttt < 2:7040029/137‑1 (MQ=255)
aagaagCTTTCCAAGCGTCTGAAGCTGATGGAAGCTTTCCAGGGCTCGGGCAACCTGCCTGAGTGGATGGTCCTGACCGTCCTGCCAGTGCTGCCGCCGGACCTGCGTCCGGTGGTTCCGCTGGATGGTGGCCGttt < 1:16837355/137‑1 (MQ=255)
aagaagCTTTCCAAGCGTCTGAAGCTGATGGAAGCTTTCCAGGGCTCGGGCAACCTGCCTGAGTGGATGGTCCTGACCGTCCTGCCAGTGCTGCCGCCGGACCTGCGTCCGGTGGTTCCGCTGGATGGTGGCCGttt < 1:1668765/137‑1 (MQ=255)
gCTTTCCAAGCGTCTGAAGCTGATGGACGCTTTCCAGGGCTCGGACAAACTGCCTGAGTGGATGGTCCTGACCGTCCTGCCAGTGCTGCCGCCGGACCTGCGTCCGGTGGTTCCGATGGATGGTGGCAGTGTcgcgg > 2:4540811/1‑136 (MQ=255)
gCTTTCCAAGCGTCTGAAGCTGATGGAAGCTTTCCAGGGCTCGGGCAACCTGCCTGAGTGGATGGTCCTGACCGTCCTGCCAGTGCTGCCGCCGGACCTGCGTCCGGTGGTTCCGCTGGATGGTGGCCGTTTCGCGa < 2:16470765/137‑1 (MQ=255)
cAAGCGTCTGAAGCTGATGGAAGCTTTCCAGGGCTCGGGCAACCTGCCTGAGTGGATGGTCCTGACCGTCCTGCCAGTGCTGCCGCCGGACCTGCGTCCGGTGGTTCCGCTGGATGGTGGCCGTTTCGCGACTTCCg > 2:18097365/1‑137 (MQ=255)
tCTGAAGCTGATGGAAGCTTTCCAGGGCTCGGGCAACCTGCCTGAGTGGATGGTCCTGACCGTCCTGCCAGTGCTGCCGCCGGACCTGCGTCCGGTGGTTCCGCTGGATGGTGGCCGTTTCGCGACTTCCGACCTGa < 2:16829835/137‑1 (MQ=255)
tGAAGCTGATGGAAGCTTTCCAGGGCTCGGGCAACCTGCCTGAGTGGATGGTCCTGACCGTCCTGCCAGTGCTGCCGCCGGACCTGCGTCCGGTGGTTCCGCTGGATGGTGGCCGTTTCGCGACTTCCGACCTGAA‑‑‑‑‑c < 1:13481151/137‑1 (MQ=255)
aGCTGATGGAAGCTTTCCAGGGCTCGGGCAACCTGCCTGAGTGGATGGTCCTGACCGTCCTGCCAGTGCTGCCGCCGGACCTGCGTCCGGTGGTTCCGCTGGATGGTGGCCGTTTCGCGACTTCCGACCTGAA‑‑‑‑‑CGAc > 2:2455139/1‑137 (MQ=255)
ggAAGCTTTCCAGGGCTCGGGCAACCTGCTTGAGTGGATGGTCCTGACCGTCCTGCCAGTGCTGCCGCCGGACCTGCGTCCGGTGGTTCCGCTGGATGGTGGCCGTTTCGCGACTTCCGACCTGAA‑‑‑‑‑CGACCTGTATc < 1:17313655/137‑1 (MQ=255)
ggAAGCTTTCCAGGGCTCGGGCAACCTGCCTGAGTGGATGGTCCTGACCGTCCTGCCAGTGCTGCCGCCGGACCTGCGTCCGGTGGTTCCGCTGGATGGTGGCCGTTTCGCGACTTCCGACCTGAA‑‑‑‑‑CGACCTGTATc < 2:12430775/137‑1 (MQ=255)
ggAAGCTTTCCAGGGCTCGGGCAACCTGCCTGAGTGGATGGTCCTGACCGTCCTGCCAGTGCTGCCGCCGGACCTGCGTCCGGTGGTTCCGCTGGATGGTGGCCGTTTCGCGACTTCCGACCTGAA‑‑‑‑‑CGACCTGTATc < 1:9240953/137‑1 (MQ=255)
ggAAGCTTTCCAGGGCTCGGGCAACCTGCCTGAGTGGATGGTCCTGACCGTCCTGCCAGTGCTGCCGCCGGACCTGCGTCCGGTGGTTCCGCTGGATGGTGGCCGTTTCGCGACTTCCGACCTGAA‑‑‑‑‑CGACCTGTATc < 1:7445856/137‑1 (MQ=255)
gAAGCTTTCCAGGGCTCGGGCACCCTGCCTGAGTGGATGGTCCTGACCGTCCTGCCAGTGCTGCCGCCGGACCTGCGTCCGGTGGTTCCGCTGAATGGTGGCCGTTTCGCGACTTCCGAACTGAA‑‑‑‑‑CGACCTTTATCg > 2:3807351/1‑137 (MQ=255)
gAAGCTTTCCAGGGCTCGGGCAACCTGCCTGAGTGGATGGTCCTGACCGTCCTGCCAGTGCTGCCGCCGGACCTGCGTCCGGTGGTTCCGCTGGATGGTGGCCGTTTCGCGACTTCCGACCTGAA‑‑‑‑‑CGACCTGTATCg > 2:6150204/1‑137 (MQ=255)
aaGCTTTCCAGGGCTCGGGCAACCTGCCTGAGTGGATGGTCCTGACCGTCCTGCCAGTGCTGCCGCCGGACCTGCGTCCGGTGGTTCCGCTGGATGGTGGCCGTTTCGCGACTTCCGACCTGAA‑‑‑‑‑CGACCTGTATCGc > 1:12022106/1‑137 (MQ=255)
ttCCAGGGCTCGGGCAACCTGCCTGAGTGGATGGTCCTGACCGTCCTGCCAGTGCTGCCGCCGGACCTGCGTCCGGTGGTTCCGCTGGATGGTGGCCGTTTCGCGACTTCCGACCTGAA‑‑‑‑‑CGACCTGTATCGCCGGGt < 2:3279478/137‑1 (MQ=255)
tCCAGGGCTCGGGCAACCTGCCTGAGTGGATGGTCCTGACCGTCCTGCCAGTGCTGCCGCCGGACCTGCGTCCGGTGGTTCCGCTGGATGGTGGCCGTTTCGCGACTTCCGACCTGAA‑‑‑‑‑CGACCTGTATCGCCGGGTg < 2:10189610/137‑1 (MQ=255)
ccAGGGCTCGGGCAACCTGCCTGAGTGGATGGTCCTGACCGTCCTGCCAGTGCTGCCGCCGGACCTGCGTCCGGTGGTTCCGCTGGATGGTGGCCGTTTCGCGACTTCCGACCTGAA‑‑‑‑‑CGACCTGTATCGCCGGGTGa < 1:7883951/137‑1 (MQ=255)
aGGGCTCGGGCAACCTGCCTGAGTGGATGGTCCTGACCGTCCTGCCAGTGCTGCCGCCGGACCTGCGTCCGGTGGTTCCGCTGGATGGTGGCCGTTTCGCGACTTCCGACCTGAA‑‑‑‑‑CGACCTGTATCGCCGGGTGATc > 1:3914099/1‑137 (MQ=255)
aGGGCTCGGGCAACCTGCCTGAGTGGATGGTCCTGACCGTCCTGCCAGTGCTGCCGCCGGACCTGCGTCCGGTGGTTCCGCTGGATGGTGGCCGTTTCGCGACTTCCGACCTGAA‑‑‑‑‑CGACCTGTATCGCCGGGTGATc < 1:15898600/137‑1 (MQ=255)
gggCAACCTGCCTGAGTGGATGGTCCTGACCGTCCTGCCAGTGCTGCCGCCGGACCTGCGTCCGGTGGTTCCGCTGGATGGTGGCCGTTTCGCGACTTCCGACCTGAA‑‑‑‑‑CGACCTGTATCGCCGGGTGATCAACCGTa < 2:15543836/137‑1 (MQ=255)
gggCAACCTGCCTGAGTGGATGGTCCTGACCGTCCTGCCAGTGCTGCCGCCGGACCTGCGTCCGGTGGTTCCGCTGGATGGTGGCCGTTTCGCGACTTCCGACCTGAA‑‑‑‑‑CGACCTGTATCGCCGGGTGATCAACCGTa < 1:4661711/137‑1 (MQ=255)
gggCAACCTGCCTGAGTGGATGGTCCTGACCGTCCTGCCAGTGCTGCCGCCGGACCTGCGTCCGGTGGTTCCGCTGGATGGTGGCCGTTTCGCGACTTCCGACCTGAA‑‑‑‑‑CGACCTGTATCGCCGGGTGATCAACCGTa < 2:14258643/137‑1 (MQ=255)
gggCAACCTGCCTGAGTGGATGGTCCTGACCGTCCTGCCAGTGCTGCCGCCGGACCTGCGTCCGGTGGTTCCGCTGGATGGTGGCCGTTTCGCGACTTCCGACCTGAA‑‑‑‑‑CGACCTGTATCGCCGGGTGATCAACCGTa > 1:14437432/1‑137 (MQ=255)
cAACCTGCCTGAGTGGATGGTCCTGACCGTCCTGCCAGTGCTGCCGCCGGACCTGCGTCCGGTGGTTCCGCTGGATGGTGGCCGTTTCGCGACTTCCGACCTGAA‑‑‑‑‑CGACCTGTATCGCCGGGTGATCAACCGTaaca > 2:2591775/1‑137 (MQ=255)
cAACCTGCCTGAGTGGATGGTCCTGACCGTCCTGCCAGTGCTGCCGCCGGACCTGCGTCCGGTGGTTCCGCTGGATGGTGGCCGTTTCGCGACTTCCGACCTGAA‑‑‑‑‑CGACCTGTATCGCCGGGTGATCAACCGTaaca > 1:18252114/1‑137 (MQ=255)
cAACCTGCCTGAGTGGATGGTCCTGACCGTCCTGCCAGTGCTGCCGCCGGACCTGCGTCCGGTGGTTCCGCTGGATGGTGGCCGTTTCGCGACTTCCGACCTGAA‑‑‑‑‑CGACCTGTATCGCCGGGTGATCAACCGTaaca > 2:7508/1‑137 (MQ=255)
cAACCTGCCTGAGTGGATGGTCCTGACCGTCCTGCCAGTGCTGCCGCCGGACCTGCGTCCGGTGGTTCCGCTGGATGGTGGCCGTTTCGCGACTTCCGACCTGAA‑‑‑‑‑CGACCTGTATCGCCGGGTGATCAACCGTaaca > 1:3147136/1‑137 (MQ=255)
cAACCTGCCTGAGTGGATGGTCCTGACCGTCCTGCCAGTGCTGCCGCCGGACCTGCGTCCGGTGGTTCCGCTGGATGGTGGCCGTTTCGCGACTTCCGACCTGAA‑‑‑‑‑CGACCTGTATCGCCGGGTGATCAACCGTaaca > 1:15203506/1‑137 (MQ=255)
tgcctgAGTGGATGGTCCTGACCGTCCTGCCAGTGCTGCCGCCGGACCTGCGTCCGGTGGTTCCGCTGGATGGTGGCCGTTTCGCGACTTCCGACCTGAA‑‑‑‑‑CGACCTGTATCGCCGGGTGATCAACCGTAACAACCGt > 2:11042017/1‑137 (MQ=255)
tgcctgAGTGGATGGTCCTGACCGTCCTGCCAGTGCTGCCGCCGGACCTGCGTCCGGTGGTTCCGCTGGATGGTGGCCGTTTCGCGACTTCCGACCTGAA‑‑‑‑‑CGACCTGTATCGCCGGGTGATCAACCGTAACAACCGt > 2:18637453/1‑137 (MQ=255)
gcctgAGTGGATGGTCCTGACCGTCCTGCCAGTGCTGCCGCCGGACCTGCGTCCGGTGGTTCCGCTGGATGGTGGCCGTTTCGCGACTTCCGACCTGAA‑‑‑‑‑CGACCTGTATCGCCGGGTGATCAACCGTAACAACCGTc < 2:17218890/137‑1 (MQ=255)
gcctgAGTGGATGGTCCTGACCGTCCTGCCAGTGCTGCCGCCGGACCTGCGTCCGGTGGTTCCGCTGGATGGTGGCCGTTTCGCGACTTCCGACCTGAA‑‑‑‑‑CGACCTGTATCGCCGGGTGATCAACCGTAACAACCGTc > 1:14887264/1‑137 (MQ=255)
ctgAGTGGATGGTCCTGACCGTCCTGCCAGTGCTGCCGCCGGACCTGCGTCCGGTGGTTCCGCTGGATGGTGGCCGTTTCGCGACTTCCGACCTGAA‑‑‑‑‑CGACCTGTATCGCCGGGTGATCAACCGTAACAACCGTCTg < 2:2194076/137‑1 (MQ=255)
gAGTGGATGGTCCTGACCGTCCTGCCAGTGCTGCCGCCGGACCTGCGTCCGGTGGTTCCGCTGGATGGTGGCCGTTTCGCGACTTCCGACCTGAA‑‑‑‑‑CGACCTGTATCGCCGGGTGATCAACCGTAACAACCGTCTGaa > 2:14954085/1‑137 (MQ=255)
gAGTGGATGGTCCTGACCGTCCTGCCAGTGCTGCCGCCGGACCTGCGTCCGGTGGTTCCGCTGGATGGTGGCCGTTTCGCGACTTCCGACCTGAA‑‑‑‑‑CGACCTGTATCGCCGGGTGATCAACCGTAACAACCGTCTGaa < 1:5198365/137‑1 (MQ=255)
tGGATGGTCCTGACCGTCCTGCCCGTGCTGCCGCCGGACCTGCGTCCGGTGGTTCCGCTGGATGGTGGCAGTTTCGCGACTTCCGACCTGAA‑‑‑‑‑CGACCTGTATCGCCGGGTGATCAACCGTAACAACCGTCTGAAgcg > 2:5872391/1‑137 (MQ=255)
aTGGTCCTGACCGTCCTGCCGGTGCTGTCGCCGGACCTGCGTCCGGTGGTTCCGCTGGATGGTGGCCGTTTCGCGACTTCCGACCTGAA‑‑‑‑‑CGACCTGTATCGCCGGGTGATCAACCGTACCAACCGTCTGAAGCGCct > 2:17016449/1‑137 (MQ=255)
aTGGTCCTGACCGTCCTGCCAGTGCTGCCGCCGGACCTGCGTCCGGTGGTTCCGCTGGATGGTGGCCGTTTCGCGACTTCCGACCTGAA‑‑‑‑‑CGACCTGTATCGCCGGGTGATCAACCGTAACAACCGTCTGAAGCGCct > 2:5023993/1‑137 (MQ=255)
aTGGTCCTGACCGTCCTGCCAGTGCTGCCGCCGGACCTGCGTCCGGTGGTTCCGCTGGATGGTGGCCGTTTCGCGACTTCCGACCTGAA‑‑‑‑‑CGACCTGTATCGCCGGGTGATCAACCGTAACAACCGTCTGAAGCGCct > 2:15239152/1‑137 (MQ=255)
aTGGTCCTGACCGTCCTGCCAGTGCTGCCGCCGGACCTGCGTCCGGTGGTTCCGCTGGATGGTGGCCGTTTCGCGACTTCCGACCTGAA‑‑‑‑‑CGACCTGTATCGCCGGGTGATCAACCGTAACAACCGTCTGAAGCGCct > 2:3995884/1‑137 (MQ=255)
gTCCTGACCGTCCTGCCAGTGCTGCCGCCGGACCTGCGTCCGGTGGTTCCGCTGGATGGTAGCCGTTTCACGACTTCCGACCTGAA‑‑‑‑‑CGACCTGTATCGCCGGGTGATCAACCGTAACAACCGTCTGAAGCGCctgct > 1:5442384/1‑137 (MQ=255)
tCCTGACCGTCCTGCCAGTGCTGCCGCCGGACCTGCGTCCGGTGGTTCCGCTGGATGGTGGCCGTTTCGCGACTTCCGACCTGAA‑‑‑‑‑CGACCTGTATCGCCGGGTGa > 2:18352104/1‑105 (MQ=255)
tCCTGACCGTCCTGCCAGTGCTGCCGCCGGACCTGCGTCCGGTGGTTCCGCTGGATGGTGGCCGTTTCGCGACTTCCGACCTGAA‑‑‑‑‑CGACCTGTATCGCCGGGTGATCAACCGTAACAACCGTCTGAAGCGCctgctg > 2:557042/1‑137 (MQ=255)
ccTGACCGTCCTGCCAGTGCTGCCGCCGGACCTGCGTCCGGTGGTTCCGCTGGATGGTGGCCGTTTCGCGACTTCCGACCTGAA‑‑‑‑‑CGACCTGTATCGCCGGGTGATCAACCGTAACAACCGTCTGAAGCGCCTGCTgg > 1:207899/1‑137 (MQ=255)
gACCGTCCTGCCAGTGCTGCCGCCGGACCTGCGTCCGGTGGTTCCGCTGGATGGTGGCCGTTTCGCGACTTCCGACCTGAA‑‑‑‑‑CGACCTGTATCGCCGGGTGATCAACCGTAACAACCGTCTGAAGCGCCTGCTGGATc < 1:1706179/137‑1 (MQ=255)
gACCGTCCTGCCAGTGCTGCCGCCGGACCTGCGTCCGGTGGTTCCGCTGGATGGTGGCCGTTTCGCGACTTCCGACCTGAA‑‑‑‑‑CGACCTGTATCGCCGGGTGATCAACCGTAACAACCGTCTGAAGCGCCTGCTGGATc < 2:13255147/137‑1 (MQ=255)
cGTCCTGCCAGTGCTGCCGCCGGACCTGCGTCCGGTGGTTCCGCTGGATGGTGGCCGTTTCGCGACTTCCGACCTGAA‑‑‑‑‑CGACCTGTATCGCCGGGTGATCAACCGTAACAACCGTCTGAAGCGCCTGCTGGATCTGt < 1:12288419/137‑1 (MQ=255)
gTCCTGCCAGTGCTGCCGCCGGACCTGCGTCCGGTGGTTCCGCTGGATGGTGGCCGTTTCGCGACTTCCGACCTGAA‑‑‑‑‑CGACCTGTATCGCCGGGTGATCAACCGTAACAACCGTCTGAAGCGCCTGCTGGATCTGTc > 2:13442515/1‑137 (MQ=255)
gTCCTGCCAGTGCTGCCGCCGGACCTGCGTCCGGTGGTTCCGCTGGATGGTGGCCGTTTCGCGACTTCCGACCTGAA‑‑‑‑‑CGACCTGTATCGCCGGGTGATCAACCGTAACAACCGTCTGAAGCGCCTGCTGGATCTGTc > 1:6037949/1‑137 (MQ=255)
gTCCTGCCAGTGCTGCCGCCGGACCTGCGTCCGGTGGTTCCGCTGGATGGTGGCCGTTTCGCGACTTCCGACCTGAA‑‑‑‑‑CGACCTGTATCGCCGGGTGATCAACCGTAACAACCGTCTGAAGCGCCTGCTGGATCTGTc > 2:8183996/1‑137 (MQ=255)
gTCCTGCCAGTGCTGCCGCCGGACCTGCGTCCGGTGGTTCCGCTGGATGGTGGCCGTTTCGCGACTTCCGACCTGAA‑‑‑‑‑CGACCTGTATCGCCGGGTGATCAACCGTAACAACCGTCTGAAGCGCCTGCTGGATCTGTc > 1:11686399/1‑137 (MQ=255)
gTCCTGCCAGTGCTGCCGCCGGACCTGCGTCCGGTGGTTCCGCTGGATGGTGGCCGTTTCGCGACTTCCGACCTGAA‑‑‑‑‑CGACCTGTATCGCCGGGTGATCAACCGTAACAACCGTCTGAAGCGCCTGCTGGATCTGTc > 1:12803956/1‑137 (MQ=255)
tCCTGCCAGTGCTGCCGCCGGACCTGCGTCCGGTGGTTCCGCTGGATGGTGGCCGTTTCGCGACTTCCGACCTGAA‑‑‑‑‑CGACCTGTATCGCCGGGTGATCAACCGTAACAACCGTCTGAAGCGCCTGCTGGATCTGTCg < 1:15041932/137‑1 (MQ=255)
tCCTGCCAGTGCTGCCGCCGGACCTGCGTCCGGTGGTTCCGCTGGATGGTGGCCGTTTCGCGACTTCCGACCTGAA‑‑‑‑‑CGACCTGTATCGCCGGGTGATCAACCGTAACAACCGTCTGAAGCGCCTGCTGGATCTGTCg < 2:13554319/137‑1 (MQ=255)
tCCTGCCAGTGCTGCCGCCGGACCTGCGTCCGGTGGTTCCGCTGGATGGTGGCCGTTTCGCGACTTCCGACCTGAA‑‑‑‑‑CGACCTGTATCGCCGGGTGATCAACCGTAACAACCGTCTGAAGCGCCTGCTGGATCTGTCg < 2:12199277/137‑1 (MQ=255)
tCCTGCCAGTGCTGCCGCCGGACCTGCGTCCGGTGGTTCCGCTGGATGGTGGCCGTTTCGCGACTTCCGACCTGAA‑‑‑‑‑CGACCTGTATCGCCGGGTGATCAACCGTAACAACCGTCTGAAGCGCCTGCTGGATCTGTCg < 1:5727536/137‑1 (MQ=255)
tCCTGACAGTGCTGCCGCCGGACCTGCGTCCGGTGGTTCCGCTGGATGGTGGCCGTTTCGCGACTTCCGACCTGAA‑‑‑‑‑CGACCTGTATCGCCGGGTGATCAACCATAACAACCGTCTGAAGCGCCTGCTGGATCTGTCg < 1:17693434/137‑1 (MQ=255)
ccTGCCAGTGCTGCCGCCGGACCTGCGTCCGGTGGTTCCGCTGGATGGTGGCCGTTTCGCGACTTCCGACCTGAA‑‑‑‑‑CGACCTGTATCGCCGGGTGATCAACCGTAACAACCGTCTGAAGCGCCTGCTGGATCTGTCgg > 2:14523378/1‑137 (MQ=255)
cTGCCAGTGCTGCCGCCGGACCTGCGTCCGGTGGTTCCGCTGGATGGTGGCCGTTTCGCGACTTCCGACCTGAA‑‑‑‑‑CGACCTGTATCGCCGGGTGATCAACCGTAACAACCGTCTGAAGCGCCTGCTGGATCTGTCGgc < 1:6861265/137‑1 (MQ=255)
tGCCAGTGCTGCCGCCGGACCTGCGTCCGGTGGTTCCGCTGGATGGTGGCCGTTTCGCGACTTCCGACCTGAA‑‑‑‑‑CGACCTGTATCGCCGGGTGATCAACCGTAACAACCGTCTGAAGCGCCTGCTGGATCTGTCGgcg > 1:3628245/1‑137 (MQ=255)
tGCCAGTGCTGCCGCCGGACCTGCGTCCGGTGGTTCCGCTGGATGGTGGCCGTTTCGCGACTTCCGACCTGAA‑‑‑‑‑CGACCTGTATCGCCGGGTGATCAACCGTAACAACCGTCTGAAGCGCCTGCTGGATCTGTCGgcg > 2:8807223/1‑137 (MQ=255)
tGCCAGTGCTGCCGCCGGACCTGCGTCCGGTGGTTCCGCTGGATGGTGGCCGTTTCGCGACTTCCGACCTGAA‑‑‑‑‑CGACCTGTATCGCCGGGTGATCAACCGTAACAACCGTCTGAAGCGCCTGCTGGATCTGTCGgcg > 2:2869015/1‑137 (MQ=255)
gCCATTGCTGCCGCCGGACCTGCGTCCGGTGGTTCCGCTGGATGGTGGCCGTTTCGCGACTTCCGACCTGAA‑‑‑‑‑CGACCTGTATCGCCGGGTGATCAACCGTAACAACCGTCTGAAGCGCCTGCTGGATCTGTCGgcgc > 1:6148747/1‑137 (MQ=255)
gCCAGTGCTGCCGCCGGACCTGCGTCCGGTGGTTCCGCTGGATGGTGGCCGTTTCGCGACTTCCGACCTGAA‑‑‑‑‑CGCCCTGTATCGCCGGGTGATCAACCGTCACACCCGTCTGACGCGCCTGCTGGATCTGTCGgcgc > 1:8773730/1‑137 (MQ=255)
gCCAGTGCTGCCGCCGGACCTGCGTCCGGTGGTTCCGCTGGATGGTGGCCGTTTCGCGACTTCCGACCTGAA‑‑‑‑‑CGACCTGTATCGCCGGGTGATCAACCGTAACAACCGTCTGAAGCGCCTGCTGGATCTGTCGgcgt > 1:10905292/1‑136 (MQ=255)
gCCAGTGCTGCCGCCGGACCTGCGTCCGGTGGTTCCGCTGGATGGTGGCCGTTTCGCGACTTCCGACCTGAA‑‑‑‑‑CGACCTGTATCGCCGGGTGATCAACCGTAACAACCGTCTGAAGCGCCTGCTGGATCTGTCGgcgc > 1:2392303/1‑137 (MQ=255)
gCCAGTGCTGCCGCCGGACCTGCGTCCGGTGGTTCCGCTGGATGGTGGCCGTTTCGCGACTTCCGACCTGAA‑‑‑‑‑CGACCTGTATCGCCGGGTGATCAACCGTAACAACCGTCTGAAGCGCCTGCTGGATCTGTCGgcgc > 1:294654/1‑137 (MQ=255)
gCCAGTGCTGCCGCCGGACCTGCGTCCGGTGGTTCCGCTGGATGGTGGCCGTTTCGCGACTTCCGACCTGAA‑‑‑‑‑CGACCTGTATCGCCGGGTGATCAACCGTAACAACCGTCTGAAGCGCCTGCTGGATCTGTCGgcgc > 1:10309843/1‑137 (MQ=255)
gCCAGTGCTGCCGCCGGACCTGCGTCCGGTGGTTCCGCTGGATGGTGGCCGTTTCGCGACTTCCGACCTGAA‑‑‑‑‑CGACCTGTATCGCCGGGTGATCAACCGTAACAACCGTCTGAAGCGCCTGCTGGATCTGTCGgcgc > 1:4900027/1‑137 (MQ=255)
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GCCGGACCTGCGTCCGGTGGTTCCGCTGGATGGTGGCCGTTTCGCGACTTCCGACCTGAACGACCTGTATCGCCGGGTGATCAACCGTAACAACCGTCTGAAGCGCCTGCTGGATCTGTCGGCGCCGGACATCATCGTGCGCAACGAAAAG > LH00941:114:22FVMWLT1:2:2212:5521:18438/1‑151 (MQ=60)
CCGGACCTGCGTCCGGTGGTTCCGCTGGATGGTGGCCGTTTCGCGACTTCCGACCTGAACGACCTGTATCGCCGGGTGATCAACCGTAACAACCGTCTGAAGCGCCTGCTGGATCTGTCGGCGCCGGACATCATCGTGCGCAACGAAAAGC > LH00941:114:22FVMWLT1:2:2205:15404:12433/1‑151 (MQ=60)
CCTGCGTCCGGTGGTTCCGCTGGATGGTGGCCGTTTCGCGACTTCCGACCTGAACGACCTGTATCGCCGGGTGATCAACCGTAACAACCGTCTGAAGCGCCTGCTGGATCTGTCGGCGCCGGACATCATCGTGCGCAACGAAAAGCGCATG > LH00941:114:22FVMWLT1:2:1219:19435:16661/1‑151 (MQ=60)
CGTCCGGTGGTTCCGCTGGATGGTGGCCGTTTCGCGACTTCCGACCTGAACGACCTGTATCGCCGGGTGATCAACCGTAACAACCGTCTGAAGCGCCTGCTGGATCTGTCGGCGCCGGACATCATCGTGCGCAACGAAAAGCGCATGCTGC > LH00941:114:22FVMWLT1:2:2123:36464:6092/1‑151 (MQ=60)
GTCCGGTGGTTCCGCTGGATGGTGGCCGTTTCGCGCCTTCCGACCTGAACGACCTGTATCGCCGGGTGATCAACCGTAACAACCGTCTGAAGCGCCTGCTGGATCTGTCGGCGCCGGACATCATCGTGCGCAACGAAAAGCACATGCTGCA > LH00941:114:22FVMWLT1:2:2244:18843:14835/1‑151 (MQ=60)
CGGTGGTTCCGCTGGATGGTGGCCGTTTCGCGACTTCCGACCTGAACGACCTGTATCGCCGGGTGATCAACCGTAACAACCGTCTGAAGCGCCTGCTGGATCTGTCGGCGCCGGACATCATCGTGCGCAACGAAAAGCGCATGCTGCAGGA < LH00941:114:22FVMWLT1:2:2149:35715:3418/151‑1 (MQ=60)
CGGTGGTTCCGCTGGATGGTGGCCGTTTCGCGACTTCCGACCTGAACGACCTGTATCGCCGGGTGATCAACCGTAACAACCGTCTGAAGCGCCTGCTGGATCTGTCGGCGCCGGACATCATCGTGCGCAACGAAAAGCGCATGCTGCAGGA < LH00941:114:22FVMWLT1:2:2251:47475:7677/151‑1 (MQ=60)
CGGTGGTTCCGCTGGATGGTGGCCGTTTCGCGACTTCCGACCTGAACGACCTGTATCGCCGGGTGATCAACCGTAACAACCGTCTGAAGCGCCTGCTGGATCTGTCGGCGCCGGACATCATCGTGCGCAACGAAAAGCGCATGCTGCAGGA > LH00941:114:22FVMWLT1:2:2244:16199:8078/1‑151 (MQ=60)
GTGGTTCCGCTGGATGGTGGCCGTTTCGCGACTTCCGACCTGAACGACCTGTATCGCCGGGTGATCAACCGTAACAACCGTCTGAAGCGCCTGCTGGATCTGTCGGCGCCGGACATCATCGTGCGCAACGAAAAGCGCATGCTGCAGGAAG < LH00941:114:22FVMWLT1:2:1142:28800:5307/151‑1 (MQ=60)
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CGCGAAGAAATTCCGCAGACCAACTCGGAAACCAAGATCAAGAAGCTTTCCAAGCGTCTGAAGCTGATGGAAGCTTTCCAGGGCTCGGGCAACCTGCCTGAGTGGATGGTCCTGACCGTCCTGCCAGTGCTGCCGCCGGACCTGCGTCCGCTGGTTCCGCTGGATGGTGGCCGTTTCGCGACTTCCGACCTGAACGACCTGTATCGCCGGGTGATCAACCGTAACAACCGTCTGAAGCGCCTGCTGGATCTGTCGGCGCCGGACATCATCGTGCGCAACGAAAAGCGCATGCTGCAGGAAG > AE015451_phaM1/542364‑542664
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| Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 0 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
