Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A2 F73 I2 R1
|
76 |
833.2 |
37290668 |
99.4% |
37066923 |
136.3 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
AE015451_phaM1 |
541,353 |
A→G |
Y1244C (TAC→TGC) |
rpoB CDS (DNA‑directed RNA polymerase subunit beta) → |
|
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | AE015451_phaM1 | 541,353 | 0 | A | G | 99.6%
| 2709.9
/ ‑2.7
| 674 | Y1244C (TAC→TGC) | rpoB CDS (DNA‑directed RNA polymerase subunit beta) | |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (0/0); major base G (328/343); minor base T (0/3); total (328/346) |
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 2.49e-01 |
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.78e-01 |
Only 100 of 810 total aligned reads displayed.
CCGGTCTTCGATGGTGCCAAGGAGCGCGAGATCAAGGCCATGCTGAAGCTGGCCGACCTGCCAGAGAGCGGCCAGATGGTGCTGTTCGATGGCCGTACCGGCAACAAGTTCGAGCGTCCTGTGACCGTTGGTTACATGTACATGCTCAAGCTGAACCACTTGGTGGACGACAAGATGCACGCGCGTTCCACTGGTTCCTACAGCCTGGTTACCCAGCAGCCGCTGGGTGGTAAGGCGCAGTTCGGTGGTCAGCGTTTCGGGGAGATG > AE015451_phaM1/541220‑541486
|
ccGGTCTTCGATGGTGCCAAGGAGCGCGAGATCAAGGCCATGCTGAAGCTGGCCGACCTGCCAGAGAGCGGCCAGATGGTGCTGTTCGATGGCCGTACCGGCAACAAGTTCGAGCGTCCTGTGACCGTTGGTtgcat < 1:9060046/137‑1 (MQ=255)
ccGGTCTTCGATGGTGCCAAGGAGCGCGAGATCAAGGCCATGCTGAAGCTGGCCGACCTGCCAGAGAGCGGCCAGATGGTGCTGTTCGATGGCCGTACCGGCAACAAGTTCGAGCGTCCTGTGACCGTTGGTtgcat < 1:14398343/137‑1 (MQ=255)
ccGGTCTTCGATGGTGCCAAGGAGCGCGAGATCAAGGCCATGCTGAAGCTGGCCGACCTGCCAGAGAGCGGCCAGATGGTGCTGTTCGATGGCCGTACCGGCAACAAGTTCGAGCGTCCTGTGACCGTTGGTtgcat < 2:17489208/137‑1 (MQ=255)
cGGTCTTCGATGGTGCCAAGGAGCGCGAGATCAAGGCCATGCTGAAGCTGGCCGACCTGCCAGAGAGCGGCCAGATGGTGCTGTTCGATGGCCGTACCGGCAACAAGTTCGAGCGTCCTGTGACCGTTGGTtgcatg > 2:15551402/1‑137 (MQ=255)
cGGTCTTCGATGGTGCCAAGGAGCGCGAGATCAAGGCCATGCTGAAGCTGGCCGACCTGCCAGAGAGCGGCCAGATGGTGCTGTTCGATGGCCGTACCGGCAACAAGTTCGAGCGTCCTGTGACCGTTGGTtgcatg > 2:5780609/1‑137 (MQ=255)
ggTCTTCGATGGTGCCAAGGAGCGCGAGATCAAGGCCATGCTGAAGCTGGCCGACCTGCCAGAGAGCGGCCAGATGGTGCTGTTCGATGGCCGTACCGGCAACAAGTTCGAGCGTCCTGTGACCGTTGGTtgcatgt > 1:12659508/1‑137 (MQ=255)
ggTCTTCGATGGTGCCAAGGAGCGCGAGATCAAGGCCATGCTGAAGCTGGCCGACCTGCCAGAGAGCGGCCAGATGGTGCTGTTCGATGGCCGTACCGGCAACAAGTTCGAGCGTCCTGTGACCGTTGGTtgcatgt > 1:9904681/1‑137 (MQ=255)
ggTCTTCGATGGTGCCAAGGAGCGCGAGATCAAGGCCATGCTGAAGCTGGCCGACCTGCCAGAGAGCGGCCAGATGGTGCTGTTCGATGGCCGTACCGGCAACAAGTTCGAGCGTCCTGTGACCGTTGGTtgcatgt > 1:14779316/1‑137 (MQ=255)
ggTCTTCGATGGTGCCAAGGAGCGCGAGATCAAGGCCATGCTGAAGCTGGCCGACCTGCCAGAGAGCGGCCAGATGGTGCTGTTCGATGGCCGTACCGGCAACAAGTTCGAGCGTCCTGTGACCGTTGGTtgcatgt > 1:6794567/1‑137 (MQ=255)
ttCGATGGTGCCAAGGAGCGCGAGATCAAGGCCATGCTGAAGCTGGCCGACCTGCCAGAGAGCGGCCAGATGGTGCTGTTCGATGGCCGTACCGGCAACAAGTTCGAGCGTCCTGTGACCGTTGGTtgcatgtacat > 2:7597495/1‑137 (MQ=255)
ttCGATGGTGCCAAGGAGCGCGAGATCAAGGCCATGCTGAAGCTGGCCGACCTGCCAGAGAGCGGCCAGATGGTGCTGTTCGATGGCCGTACCGGCAACAAGTTCGAGCGTCCTGTGACCGTTGGTtgcatgtacat < 2:2416347/137‑1 (MQ=255)
ttCGATGGTGCCAAGGAGCGCGAGATCAAGGCCATGCTGAAGCTGGCCGACCTGCCAGAGAGCGGCCAGATGGTGCTGTTCGATGGCCGTACCGGCAACAAGTTCGAGCGTCCTGTGACCGTTGGTtgcatgtacat > 1:16204855/1‑137 (MQ=255)
tCGATGGTGCCAAGGAGCGCGAGATCAAGGCCATGCTGAAGCTGGCCGACCTGCCAGAGAGCGGCCAGATGGTGCTGTTCGATGGCCGTACCGGCAACAAGTTCGAGCGTCCTGTGACCGTTGGTtgcatgtacatg > 1:12426348/1‑137 (MQ=255)
tCGATGGTGCCAAGGAGCGCGAGATCAAGGCCATGCTGAAGCTGGCCGACCTGCCAGAGAGCGGCCAGATGGTGCTGTTCGATGGCCGTACCGGCAACAAGTTCGAGCGTCCTGTGACCGTTGGTtgcatgtacatg > 2:11456543/1‑137 (MQ=255)
tCGATGGTGCCAAGGAGCGCGAGATCAAGGCCATGCTGAAGCTGGCCGACCTGCCAGAGAGCGGCCAGATGGTGCTGTTCGATGGCCGTACCGGCAACAAGTTCGAGCGTCCTGTGACCGTTGGTtgcatgtacatg > 1:9757049/1‑137 (MQ=255)
tCGATGGTGCCAAGGAGCGCGAGATCAAGGCCATGCTGAAGCTGGCCGACCTGCCAGAGAGCGGCCAGATGGTGCTGTTCGATGGCCGTACCGGCAACAAGTTCGAGCGTCCTGTGACCGTTGGTtgcatgtacatg > 1:17540783/1‑137 (MQ=255)
cGATGGTGCCAAGGAGCGCGAGATCAAGGCCATGCTGAAGCTGGCCGACCTGCCAGAGAGCGGCCAGATGGTGCTGTTCGATGGCCGTACCGGCAACAAGTTCGAGCGTCCTGTGACCGTTGGTTGCATGTACATGc < 2:3079326/137‑1 (MQ=255)
gATGGTGCCAAGGAGCGCGAGATCAAGGCCATGCTGAAGCTGGCCGACCTGCCAGAGAGCGGCCAGATGGTGCTGTTCGATGGCCGTACCGGCAACAAGTTCGAGCGTCCTGTGACCGTTGGTTGCATGTACATGCt > 2:9618944/1‑137 (MQ=255)
ccAAGGAGCGCGAGATCAAGGCCATGCTGAAGCTGGCCGACCTGCCANAGAGCGGCCAGATGGTGCTGTTCGATGGCCGTACCGGCAACAAGTTCGAGCGTCCTGTGACCGTTGGTTGCATGTACATGCTCAAGCTg < 1:15049505/137‑1 (MQ=255)
ccAAGGAGCGCGAGATCAAGGCCATGCTGAAGCTGGCCGACCTGCCAGAGAGCGGCCAGATGGTGCTGTTCGATGGCCGTACCGGCAACAAGTTCGAGCGTCCTGTGACCGTTGGTTGCATGTACATGCTCAAGCTg < 1:6265210/137‑1 (MQ=255)
ccAAGGAGCGCGAGATCAAGGCCATGCTGAAGCTGGCCGACCTGCCAGAGAGCGGCCAGATGGTGCTGTTCGATGGCCGTACCGGCAACAAGTTCGAGCGTCCTGTGACCGTTGGTTGCATGTACATGCTCAAGCTg < 1:2242143/137‑1 (MQ=255)
cAAGGAGCGCGAGATCAAGGCCATGCTGAAGCTGGCCGACCTGCCAGAGAGCGGCCAGATGGTGCTGTTCGATGGCCGTACCGGCAACAAGTTCGAGCGTCCTGTGACCGTTGGTTGCATGTACATGCTCAAGCTGa > 1:8346859/1‑137 (MQ=255)
cAAGGAGCGCGAGATCAAGGCCATGCTGAAGCTGGCCGACCTGCCAGAGAGCGGCCAGATGGTGCTGTTCGATGGCCGTACCGGCAACAAGTTCGAGCGTCCTGTGACCGTTGGTTGCATGTACATGCTCAAGCTGa > 2:12149931/1‑137 (MQ=255)
ggAGCGCGAGATCAAGGCCATGCTGAAGCTGGCCGACCTGCCAGAGAGCGGCCAGATGGTGCTGTTCGATGGCCGTACCGGCAACAAGTTCGAGCGTCCTGTGACCGTTGGTTGCATGTACATGCTCAAGCTGAAcc < 2:3505401/137‑1 (MQ=255)
ggAGCGCGAGATCAAGGCCATGCTGAAGCTGGCCGACCTGCCAGAGAGCGGCCAGATGGTGCTGTTCGATGGCCGTACCGGCAACAAGTTCGAGCGTCCTGTGACCGTTGGTTGCATGTACATGCTCAAGCTGAAcc < 2:12969478/137‑1 (MQ=255)
ggAGCGCGAGATCAAGGCCATGCTGAAGCTGGCCGACCTGCCAGAGAGCGGCCAGATGGTGCTGTTCGATGGCCGTACCGGCAACAAGTTCGAGCGTCCTGTGACCGTTGGTTGCATGTACATGCTCAAGCTGAAcc < 2:16963683/137‑1 (MQ=255)
gcgAGATCAAGGCCATGCTGAAGCTGGCCGACCTGCCAGAGAGCGGCCAGATGGTGCTGTTCGATGGCCGTACCGGCAACAAGTGCGAGCGTCCTGTGACCGTTGGTTGCATGTACATGCTCAAGCTGAACCACTtg < 2:5597555/137‑1 (MQ=255)
cgAGATCAAGGCCATGCTGAAGCTGGCCGACCTGCCAGAGAGCGGCCAGATGGTGCTGTTCGATGGCCGTACCGGCAACAAGTTCGAGCGTCCTGTGACCGTTGGTTGCATGTACATGCTCAAGCTGAACCACTtgg > 2:4078329/1‑137 (MQ=255)
gagaTCAAGGCCATGCTGAAGCTGGCCGACCTGCCCGAGAGCGGCAAGATGGTGCTGTTCGATGGCCGTACCGGCAACAAGTTCGCGCGTCCTGTGACCGTGGGTTGCATGTACATGCTCAAGCTGAACCAATtggt > 2:9315012/1‑137 (MQ=255)
gagaTCAAGGCCATGCTGAAGCTGGCCGACCTGCCAGAGAGCGGCCAGATGGTGCTGTTCGATNGCCGTACCGGCAACAAGTTCGAGCGTCCTGTGACCGTTGGTTGCATGTACATGCTCAAGCTGAACCACTtggt > 1:17205251/1‑137 (MQ=255)
gagaTCAAGGCCATGCTGAAGCTGGCCGACCTGCCAGAGAGCGGCCAGATGGTGCTGTTCGATGGCCGTACCGGCAACAAGTTCGAGCGTCCTGTGACCGTTGGTTGCATGTACATGCTCAAGCTGAACCACTtggt > 2:1955150/1‑137 (MQ=255)
gagaTCAAGGCCATGCTGAAGCTGGCCGACCTGCCAGAGAGCGGCCAGATGGTGCTGTTCGATGACCGTATCGGCAACAAGTTCGAGCGTCCTGTGACCGTTGGTTGCATGTACATGCTCAAGCTGAACCACTtggt > 1:12970563/1‑137 (MQ=255)
gaTCAAGGCCATGCTGAAGCTGGCCGACCTGCCAGAGAGCGGCCAGATGGTGCTGTTCGATGGCCGTACCGGCAACAAGTTCGAGCGTCCTGTGACCGTTGGTTGCATGTACATGCTCAAGCTGAACCACTtggtgg > 1:9568767/1‑137 (MQ=255)
gaTCAAGGCCATGCTGAAGCTGGCCGACCTGCCAGAGAGCGGCCAGATGGTGCTGTTCGATGGCCGTACCGGCAACAAGTTCGAGCGTCCTGTGACCGTTGGTTGCATGTACATGCTCAAGCTGAACCACTtggtgg > 1:7962117/1‑137 (MQ=255)
cAAGGCCATGCTGAAGCTGGCCGACCTGCCAGAGAGCGGCCAGATGGTGCTGTTCGATGGCCGTACCGGCAACAAGTTCGAGCGTCCTGTGACCGTTGGTTGCATGTACATGCTCAAGCTGAACCACTTGGTGgacg < 2:6252624/137‑1 (MQ=255)
ccATGCTGAAGCTGGCCGACCTGCCAGAGAGCGGCCAGATGGTGCTGTTCGATGGCCGTACCGGCAACAAGTTCGAGCGTCCTGTGACCGTTGGTTGCATGTACATGCTCAAGCTGAACCACTTGGTGGACGACAAg < 2:7387651/137‑1 (MQ=255)
tGAAGCTGGCCGACCTGCCAGAGAGCGGCCAGATGGTGCTGTTCGATGGCCGTACCGGCAACAAGTTCGAGCGTCCTGTGACCGTTGGTTGCATGTACATGCTCAAGCTGAACCACTTGGTGGACGACAAGATGCAc < 2:17216196/137‑1 (MQ=255)
tGAAGCTGGCCGACCTGCCAGAGAGCGGCCAGATGGTGCTGTTCGATGGCCGTACCGGCAACAAGTTCGAGCGTCCTGTGACCGTTGGTTGCATGTACATGCTCAAGCTGAACCACTTGGTGGACGACAAGATGCAc > 1:1147384/1‑137 (MQ=255)
tGAAGCTGGCCGACCTGCCAGAGAGCGGCCAGATGGTGCTGTTCGATGGCCGTACCGGCAACAAGTTCGAGCGTCCTGTGAACGTTGGTTGCATGTACATGCTCAAGCTGAACCACTTGGTGGACGACAAGATGCaa > 2:11646938/1‑136 (MQ=255)
gAAGCTGGCCGACCTGCCAGAGAGCGGCCAGATGGTGCTGTTCGATGGCCGTACCGGCAACAAGTTCGAGCGTCCTGTGACCGTTGGTTGCATGTACATGCTCAAGCTGAACCACTTGGTGGACGACAAGATGCAcg > 2:702282/1‑137 (MQ=255)
aaGCTGGCCGACCTGCCAGAGAGCGGCCAGATGGTGCTGTTCGATGGCCGTACCGGCAACAAGTTCGAGCGTCCTGTGACCGTTGGTTGCATGTACATGCTCAAGCTGAACCACTTGGTGGACGACAAGATGCAcgc < 2:15325210/137‑1 (MQ=255)
ggCCGACCTGCCATAGAGCGGCCAGATGGTGCTGTTCGATGGCCGTACCGGCAACAAGTTCGAGCGTCCTGTGACCGTTGGTTGCATGTACATGCTCAAGCTGAACCACTTGGTGGACGACAAGATGCACGCGCGtt < 1:10664719/137‑1 (MQ=255)
ggCCGACCTGCCAGAGAGCGGCCAGATGGTGCTGTTCGATGGCCGTACCGGCAACAAGTTCGAGCGTCCTGTGACCGTTGGTTTCATGTACATGCTCAAGCTGAACCACTTGGTGGACGACAAGATGCACGCGCGtt < 1:718319/137‑1 (MQ=255)
ggCCGACCTGCCAGAGAGCGGCCAGATGGTGCTGTTCGATGGCCGTACCGGCAACAAGTTCGAGCGTCCTGTGACCGTTGGTTGCATGTACATGCTCAAGCTGAACCACTTGGTGGACGACAAGATGCACGCGCGtt < 1:7534984/137‑1 (MQ=255)
ggCCGACCTGCCAGAGAGCGGCCAGATGGTGCTGTTCGATGGCCGTACCGGCAACAAGTTCGAGCGTCCTGTGACCGTTGGTTGCATGTACATGCTCAAGCTGAACCACTTGGTGGACGACAAGATGCACGCGCGtt < 2:5262402/137‑1 (MQ=255)
ggCCGACCTGCCAGAGAGCGGCCAGATGGTGCTGTTCGATGGCCGTACCGGCAACAAGTTCGAGCGTCCTGTGACCGTTGGTTGCATGTACATGCTCAAGCTGAACCACTTGGTGGACGACAAGATGCACGCGCGtt < 2:8313609/137‑1 (MQ=255)
ggCCGACCTGCCAGAGAGCGGCCAGATGGTGCTGTTCGATGGCCGTACCGGCAACAAGTTCGAGCGTCCTGTGACCGTTGGTTGCATGTACATGCTCAAGCTGAACCACTTGGTGGACGACAAGATGCACGCGCGtt < 1:4532438/137‑1 (MQ=255)
ggCCGACCTGCCAGAGAGCGGCCAGATGGTGCTGTTCGATGGCCGTACCGGCAACAAGTTCGAGCGTCCTGTGACCGTTGGTTGCATGTACATGCTCAAGCTGAACCACTTGGTGGACGACAAGATGCACGCGCGtt < 2:11355287/137‑1 (MQ=255)
ggCCGACCTGCCAGAGAGCGGCCAGATGGTGCTGTTCGATGGCCGTACCGGCAACAAGTTCGAGCGTCCTGTGACCGTTGGTTGCATGTACATGCTCAAGCTGAACCACTTGGTGGACGACAAGATGCACGCGCGtt > 2:10443252/1‑137 (MQ=255)
ggCCGACCTGCCAGAGAGCGGCCAGATGGTGCTGTTCGATGGCCGTACCGGCAACAAGTTCGAGCGTCCTGTGACCGTTGGTTGCATGTACATGCTCAAGCTGAACCACTTGGTGGACGACAAGATGCACGCGCGtt < 1:702282/137‑1 (MQ=255)
cGACCTGCCAGAGAGCGGCCAGATGGTGCTGTTCGATGGCCGTACCGGCAACAAGTTCGAGCGTCCTGTGACCGTTGGTTGCATGTACATGCTCAAGCTGAACCACTTGGTGGACGCCAAGATGCACGCGCGTTccc > 2:6104/1‑136 (MQ=255)
cGACCTGCCAGAGAGCGGCCAGATGGTGCTGTTCGATGGCCGTACCGGCAACAAGTTCGAGCGTCCTGTGACCGTTGGTTGCATGTACATGCTCAAGCTGAACCACTTGGTGGACGACAAGATGCACGCGCGTTCCa > 2:7670189/1‑137 (MQ=255)
gACCTGCCAGAGAGCGGCCAGATGGTGCTGTTCGATGGCCGTACCGGCAACAAGTTCGAGCGTCCTGTGACCGTTGGTTGCATGTACATGCTCAAGCTGAACCACTTGGTGGACGACAAGATGCACGCGCGTTCCAc > 1:16550637/1‑137 (MQ=255)
gACCTGCCAGAGAGCGGCCAGATGGTGCTGTTCGATGGCCGTACCGGCAACAAGTTCGAGCGTCCTGTGACCGTTGGTTGCATGTACATGCTCAAGCTGAACCACTTGGTGGACGACAAGATGCACGCGCGTTCCAc < 1:2830960/137‑1 (MQ=255)
gACCTGCCAGAGAGCGGCCAGATGGTGCTGTTCGATGGCCGTACCGGCAACAAGTTCGAGCGTCCTGTGACCGTTGGTTGCATGTACATGCTCAAGCTGAACCACTTGGTGGACGACAAGATGCACGCGCGTTCCAc > 2:2073381/1‑137 (MQ=255)
gACCTGCCAGAGAGCGGCCAGATGGTGCTGTTCGATGGCCGTACCGGCAACAAGTTCGAGCGTCCTGTGACCGTTGGTTGCATGTACATGCTCAAGCTGAACCACTTGGTGGACGACAAGATGCACGCGCGTTCCAc < 1:4950771/137‑1 (MQ=255)
aCCTGCCAGAGAGCGGCCAGATGGTGCTGTTCGATGGCCGTACCGGCAACAAGTTCGAGCGTCCTGTGACCGTTGGTTGCATGTACATGCTCAAGCTGAACCACTTGGTGGACGACAAGATGCACGCGCGTTCCACt > 1:17919185/1‑137 (MQ=255)
ccAGAGAGCGGCCAGATGGTGCTGTTCGATGGCCGTACCGGCAACAAGTTCGAGCGTCCTGTGACCGTTGGTTGCATGTACATGCTCAAGCTGAACCACTTGGTGGACGACAAGATGCACGCGCGTTCCACTGGTTc < 1:3692495/137‑1 (MQ=255)
gagagCGGCCAGATGGTGCTGTTCGATGGCCGTACCGGCAACAAGTTCGAGCGTCCTGTGACCGTTGGTTGCATGTACATGCTCAAGCTGAACCACTTGGTGGACGACAAGATGCACGCGCGTTCCACTGGTTCCTa < 2:1796412/137‑1 (MQ=255)
agagCGGCCAGATGGTGCTGTTCGATGGCCGTACCGGCAACAAGTTCGAGCGTCCTGTGACCGTTGGTTGCATGTACATGCTCAAGCTGAACCACTTGGTGGACGACAAGATGCACGCGCGTTCCACTGGTTCCTAc > 2:11991260/1‑137 (MQ=255)
ggCCAGATGGTGCTGTTCGATGGCCGTACCGGCAACAAGTTCGAGCGTCCTGTGACCGTTGGTTGCATGTACATGCTCAAGCTGAACCACTTGGTGGACGACAAGATGCACGCGCGTTCCACTGGTTCCTACAGCCt > 2:12435356/1‑137 (MQ=255)
ggCCAGATGGTGCTGTTCGATGGCCGTACCGGCAACAAGTTCGAGCGTCCTGTGACCGTTGGTTGCATGTACATGCTCAAGCTGAACCACTTGGTGGACGACAAGATGCACGCGCGTTCCACTGGTTCCTACAGCCt > 1:5329084/1‑137 (MQ=255)
ggCCAGATGGTGCTGTTCGATGGCCGTACCGGCAACAAGTTCGAGCGTCCTGTGACCGTTGGTTGCATGTACATGCTCAAGCTGAACCACTTGGTGGACGACAAGATGCACGCGCGTTCCACTGGTTCCTACAGCCt > 2:17786920/1‑137 (MQ=255)
ggCCAGATGGTGCTGTTCGATGGCCGTACCGGCAACAAGTTCGAGCGTCCTGTGACCGTTGGTTGCATGTACATGCTCAAGCTGAACCACTTGGTGGACGACAAGATGCACGCGCGTTCCACTGGTTCCTACAGCCt > 2:13792513/1‑137 (MQ=255)
ccAGATGGTGCTGTTCGATGGCCGTACCGGCAACAAGTTCGCGCGTCCTGTGACCGTTGGTTGCCTGTACATGCTCAAGCTGAACCACTTGGTGGACGACAAGATGCACGCGCGTTCCACTGGTTCCTACAgaatgg > 2:125804/1‑132 (MQ=255)
ccAGATGGTGCTGTTCGATGGCCGTACCGGCAACAAGTTCGAGCGTCCTGTGACCGTTGGTTGCATGTACATGCTCAAGCTGAACCACTTGGTGGACGACAAGATGCACGCGCGTTCCACTGGTTCCTACAGCCTgg > 2:7970846/1‑137 (MQ=255)
aGATGGTGCTGTTCGATGGCCGTACCGGCAACAAGTTCGAGCGTCCTGTGACCGTTGGTTGCATGTACATGCTCAAGCTGAACCACTTGGTGGACGACAAGATGCACGCGCGTTCCACTGGTTCCTACAGCCTGGtt > 1:10149727/1‑137 (MQ=255)
aGATGGTGCTGTTCGATGGCCGTACCGGCAACAAGTTCGAGCGTCCTGTGACCGTTGGTTGCATGTACATGCTCAAGCTGAACCACTTGGTGGACGACAAGATGCACGCGCGTTCCACTGGTTCCTACAGCCTGGtt > 1:16911706/1‑137 (MQ=255)
tGTTCGATGGCCGTACCGGCAACAGGTTCGAGCGTCCTGTGACCGGTGGTTGCGTGTACATGCTCAAGCTGAACCACTTGGTGGACGACAAGATGCACGCGCGTTCCACTGGTTCCTACAGCCTGGTTACCcagcag < 2:18213453/137‑1 (MQ=255)
tGTTCGATGGCCGTACCGGCAACAAGTTCGAGCGTCCTGTGACCGTTGGTTGCATGTACATGCTCAAGCTGAACCACTTGGTGGACGACAAGATGCACGCGCGTTCCACTGGTTCCTACAGCCTGGTTACCcagcag < 1:6514513/137‑1 (MQ=255)
tGTTCGATGGCCGTACCGGCAACAAGTTCGAGCGTCCTGTGACCGTTGGTTGCATGTACATGCTCAAGCTGAACCACTTGGTGGACGACAAGATGCACGCGCGTTCCACTGGTTCCTACAGCCTGGTTACCcagcag < 2:2778953/137‑1 (MQ=255)
gATGGCCGTACCGGCAACAAGTTCGAGCGTCCTGTGACCGTTGGTTGCATGTACATGCTCAAGCTGAACCACTTGGTGGACGACAAGATGCACGCGCGTTCCACTGGTTCCTACAGCCTGGTTACCCAGCAGCCGCt < 1:13445483/137‑1 (MQ=255)
gATGGCCGTACCGGCAACAAGTTCGAGCGTCCTGTGACCGTTGGTTGCATGTACATGCTCAAGCTGAACCACTTGGTGGACGACAAGATGCACGCGCGTTCCACTGGTTCCTACAGCCTGGTTACCCAGCAGCCGCt > 2:10240509/1‑137 (MQ=255)
gATGGCCGTACCGGCAACAAGTTCGAGCGTCCTGTGACCGTTGGTTGCATGTACATGCTCAAGCTGAACCACTTGGTGGACGACAAGATGCACGCGCGTTCCACTGGTTCCTACAGCCTGGTTACCCAGCAGCCGCt > 2:8597943/1‑137 (MQ=255)
aTGGCCGTACCGGCAACAAGTTCGAGCGTCCTGTGACCGTTGGTTGCATGTCCATGCTCAAGCTGAACCACTTGGTGGACGACAAGATGCACGCGCGTTCCACTGGTTCCTACAGCCTGGTTACCCAGCAGCCGCTg > 1:4029250/1‑137 (MQ=255)
aTGGCCGTACCGGCAACAAGTTCGAGCGTCCTGTGACCGTTGGTTGCATGTACATGCTTAAGCTGAACCACTTGGTGGACGACAAGATGCACGCGCGTTCCACTGGTTCCTACAGCCTGGTTACCCAGCAGCCGCTg > 2:110742/1‑137 (MQ=255)
ccGTACCGGCAACAAGTTCGAGCGTCCTGTGACCGTTGGTTGCATGTACATGCTCAAGCTGAACCACTTGGTGGACGACAAGATGCACGCGCGtt > 1:15287841/1‑95 (MQ=255)
ccGTACCGGCAACAAGTTCGAGCGTCCTGTGACCGTTGGTTGCATGTACATGCTCAAGCTGAACCACTTGGTGGACGACAAGATGCACGCGCGTTCCACTGGTTCCTACAGCCTGGTTACCCAGCAGCCGCTGggtg > 2:4609094/1‑137 (MQ=255)
ccGTACCGGCAACAAGTTCGAGCGTCCTGTGACCGTTGGTTGCATGTACATGCTCAAGCTGAACCACTTGGTGGACGACAAGATGCACGCGCGTTCCACTGGTTCCTACAGCCTGGTTACCCAGCAGCCGCTGggtg > 1:8638247/1‑137 (MQ=255)
gTACCGGCAACAAGTTCGAGCGTCCTGTGACCGTTGGTTGCATGTACATGCTCAAGCTGAACCACTTGGTGGACGACAAGATGCACGCGCGTTCCACTGGTTCCTACAGCCTGGTTACCCAGCAGCCGCTGggtggt > 1:5692220/1‑137 (MQ=255)
cctgCAACAAGTTCGAGCGTCCTGTGACCGTTGGTTGCATGTACATGCTCAAGCTGAACTACTTGGTGGACGACAAGATGCACGCGCGTTCCACTGGTTCCTACAGCCTGGTTACCCAGCAGCCGCTGGGTGGTAAg < 2:16681910/134‑1 (MQ=255)
ccGGCAACAAGTTCGAGCGTCCTGTGACCGTTGGTTGCATGTACATGCTCAAGCTGAACCACTTGGTGGACGACAAGATGCACGCGCGTTCCACTGGTTCCTACAGCCTGGTTACCCAGCAGCCGCTGGGTGGTAAg < 2:13600876/137‑1 (MQ=255)
cGGCAACAAGTTCGAGCGTCCTGTGACCGTTGGTTGCATGTACATGCTCAAGCTGAACCACTTGGTGGACGACAAGATGCACGCGCGTTCCACTGGTTCCTACAGCCTGGTTACCCAGCAGCCGCTGGGTGGTAAgg > 1:13945540/1‑137 (MQ=255)
ggCAACAAGTTCGAGCGTCCTGTGACCGTTGGTTGCATGTACATGCTCAAGCTGAACCACTTGGTGGACGACAAGATGCACGCGCGTTCCACTGGTTCCTACAGCCTGGTTACCCAGCAGCCGCTGGGTGGTAAGgc < 1:3336797/137‑1 (MQ=255)
aacaaGTTCGAGCGTCCTGTGACCGTTGGTTGCATGTACATGCTCAAGCTGAACCACTTGGTGGACGACAAGATGCACGCGCGTTCCACTGGTTCCTACAGCCTGGTTACCCAGCAGCCGCTGGGTGGTAAGGCGCa < 1:8712643/137‑1 (MQ=255)
ttCGAGCGTCCTGTGACCGTTGGTTGCATGTACATGCTCAAGCTGAACCACTTGGTGGACGACAAGATGCACGCGCGTTCCACTGGTTCCTACAGCCTGGTTACCCAGCAGCCGCTGGGTGGTAAGGCGCAGTTCgg > 1:18116444/1‑137 (MQ=255)
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aGCGTCCTGTGACCGTTGGTTGCATGTACATGCTCAAGCTGAACCACTTGGTGGACGACAAGATGCACGCGCGTTCCACTGGTTCCTACAGCCTGGTTACCCAGCAGCCGCTGGGTGGTAAGGCGCAGTTCggtggt < 1:11193930/137‑1 (MQ=255)
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GACCGTTGGTTGCATGTACATGCTCAAGCTGAACCACTTGGTGGACGACAAGATGCACGCGCGTTCCACTGGTTCCTACAGCCTGGTTACCCAGCAGCCGCTGGGTGGTAAGGCGCAGTTCGGTGGTCAGCGTTTCGGGGAGATGGAAGGG < LH00941:114:22FVMWLT1:2:2168:12824:7517/151‑1 (MQ=60)
ACCGTTGGTTGCATGTACATGCTCAAGCTGAACCACTTGGTGGACGACAAGATGCACGCGCGTTCCACTGGTTCCTACAGCCTGGTTACCCAGCCGCCGCTGGGTGGTAAGGCGCAGTTCGGTGGTCAGCGTTTCGGGGAGATGGAAGTGT > LH00941:114:22FVMWLT1:2:1148:50692:9054/1‑151 (MQ=60)
CCGTTGGTTGCATGTACATGCTCAAGCTGAACCACTTGGTGGACGACAAGATGCACGCGCGTTCCACTGGTTCCTACAGCCTGGTTACCCAGCAGCCGCTGGGTGGTAAGGCGCAGTTCGGTGGTCAGCGTTTCGGGGAGATGGAAGTGTG > LH00941:114:22FVMWLT1:2:1163:6344:25436/1‑151 (MQ=60)
CGTTGGTTGCATGTACATGCTCAAGCTGAACCACTTGGTGGACGACAAGATGCACGCGCGTTCCACTGGTTCCTACAGCCTGGTTACCCAGCAGCCGCTGGGTGGTAAGGCGCAGTTCGGTGGTCAGCGTTTCGGGGAGATGGAAGTGTGG < LH00941:114:22FVMWLT1:2:2149:5022:2073/151‑1 (MQ=60)
GTTGGTTGCATGTACATGCTCAAGCTGAACCACTTGGTGGACGACAAGATGCACGCGCGTTCCACTGGTTCCTACAGCCTGGTTACCCAGCAGCCGCTGGGTGGTAAGGCGCAGTTCGGTGGTCAGCGTTTCGGGGAGATGGAAGTGTGGG < LH00941:114:22FVMWLT1:2:1165:42889:3354/151‑1 (MQ=60)
TTGGTTGCATGTACATGCTCAAGCTGAACCACTTGGTGGACGACAAGATGCACGCGCGTTCCACTGGTTCCTACAGCCTGGTTACCCAGCAGCCGCTGGGTGGTAAGGCGCAGTTCGGTGGTCAGCGTTTCGGGGAGATGGAAGTGTGGGC > LH00941:114:22FVMWLT1:2:1205:19555:19046/1‑151 (MQ=60)
GGTTGCATGTACATGCTCAAGCTGAACCACTTGGTGGACGACAAGATGCACGCGCGTTCCAATGGTTCCTACAGCCTGGTTACACAGCAGCCGCTGGGTGGTAAGGCGCAGTTCGGTGGTCAGCGTTTCGGGGAGATGGAAGTGTGGGCGC > LH00941:114:22FVMWLT1:2:1118:16735:2857/1‑151 (MQ=60)
GTTGCATGTACATGCTCAAGCTGAACCACTTGGTGGACGACAAGATGCACGCGCGTTCCACTGGTTCCTACAGCCTGGTTACCCAGCAGCCGCTGGGTGGTAAGGCGCAGTTCGGTGGTCAGCGTTTCGGGGAGATGGAAGTGTGGGCGCT > LH00941:114:22FVMWLT1:2:1224:10263:9935/1‑151 (MQ=60)
TGCATGTACATGCTCAAGCTGAACCACTTGGTGGACGACAAGATGCACGCGCGTTCCACTGGTTCCTACAGCCTGGTTACCCAGCAGCCGCTGGGTGGTAAGGCGCAGTTCGGTGGTCAGCGTTTCGGGGAGATGGAAGTGTGGGCGCTGG > LH00941:114:22FVMWLT1:2:1110:23133:18550/1‑151 (MQ=60)
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GCGTGCCTATGGCTACCCCGGTCTTCGATGGTGCCAAGGAGCGCGAGATCAAGGCCATGCTGAAGCTGGCCGACCTGCCAGAGAGCGGCCAGATGGTGCTGTTCGATGGCCGTACCGGCAACAAGTTCGAGCGTCCTGTGACCGTTGGTTACATGTACATGCTCAAGCTGAACCACTTGGTGGACGACAAGATGCACGCGCGTTCCACTGGTTCCTACAGCCTGGTTACCCAGCAGCCGCTGGGTGGTAAGGCGCAGTTCGGTGGTCAGCGTTTCGGGGAGATGGAAGTGTGGGCGCTGGA > AE015451_phaM1/541203‑541503
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| Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 0 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
