Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A4 F84 I10 R1
|
267 |
426.1 |
13521957 |
97.0% |
13116298 |
150.5 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
NC_000913 |
2,137,543 |
G→A |
intergenic (‑300/‑359) |
wza ← / → yegH |
colanic acid export protein; outer membrane auxillary lipoprotein/inner membrane protein |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | NC_000913 | 2,137,543 | 0 | G | A | 95.8%
| 1572.5
/ 38.5
| 478 | intergenic (‑300/‑359) | wza/yegH | colanic acid export protein; outer membrane auxillary lipoprotein/inner membrane protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (7/13); new base A (216/242); total (223/255) |
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 3.62e-01 |
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 8.39e-01 |
Only 100 of 479 total aligned reads displayed.
TTCAGACTGGTCTTTCAGGCATCCAGACACGCTACCGCCCCTGGCTTTTTAGCTACCAATACACTGATTTAGTTTAATTTTTCACACCCTCTCAGCATGCAGTCGTTGATGAGAAAGGGTTATTACGGAAATTAACTTCCGAATATAAGGTGACATTATGGTAATTGAATATTGGCTTTCCAATAATGCAGGAGGAAGTGTTACAGCTAACGGAATAGCAGGCAAGATAACAATTCGGTAATTGGCTATTTTTAAGAATTATATTAAGTGTCATTCAATATGGTTTTTAGGAGTTT > NC_000913/2137395‑2137690
|
cAGACTGGTCTTTCAGGCATCCAGACACGCTACCGCCCCTGGCTTTTTAGCTACCAATACACTGATTTAGTTTAATTTTTCACACCCTCTCAGCATGCAGTCGTTGATGAGAAAGGGTTATTACGGAAATTAACTTCCGAATATAAAGTGa < 7:179262/151‑1 (MQ=255)
gACTGGTCTTTCAGGCATCCAGACACGCTACCGCCCCTGGCTTTTTAGCTACCAATACACTGATTTAGTTTAATTTTTCACACCCTCTCAGCATGCAGTCGTTGATGAGAAAGGGTTATTACGGAAATTAACTTCCGAATATAAAGTGACa < 8:760286/151‑1 (MQ=255)
gACTGGTCTTTCAGGCATCCAGACACGCTACCGCCCCTGGCTTTTTAGCTACCAATACACTGATTTAGTTTAATTTTTCACACCCTCTCAGCATGCAGTCGTTGATGAGAAAGGGTTATTACGGAAATTAACTTCCGAATATAAAGTGACa < 3:1607670/151‑1 (MQ=255)
ggTCTTTCAGGCATCCAGACACGCTACCGCCCCTGGCTTTTTAGCTACCAATACACTGATTTAGTTTAATTTTTCACACCCTCTCAGCATGCAGTCGTTGATGAGAAAGGGTTATTACGGAAATTAACTTCCGAATATAAAGTGACATTAt > 6:1140149/1‑151 (MQ=255)
tttCAGGCATCCAGACACGCTACCGCCCCTGGCTTTTTAGCTACCAATACACTGATTTAGTTTAATTTTTCACACCCTCTCAGCATGCAGTCGTTGATGAGAAAGGGTTATTACGGAAATTAACTTCCGAATATAAAGTGACATTATGGt > 4:1411916/1‑150 (MQ=255)
ttCAGGCATCCAGACACGCTACCGCCCCTGGCTTTTTAGCTACCAATACACTGATTTAGTTTAATTTTTCACACCCTCTCAGCATGCAGTCGTTGATGAGAAAGGGTTATTACGGAAATTAACTTCCGAATATAAAGTGACATTATGGt < 8:119756/149‑1 (MQ=255)
cAGGCATCCAGACACGCTACCGCCCCTGGCTTTTTAGCTACCAATACACTGATTTAGTTTAATTTTTCACACCCTCTCAGCATGCAGTCGTTGATGAGAAAGGGTTATTACGGAAATTAACTTCCGAATATAAAGTGACATTATGGTAAtt < 3:1220426/151‑1 (MQ=255)
cAGGCATCCAGACACGCTACCGCCCCTGGCTTTTTAGCTACCAATACACTGATTTAGTTTAATTTTTCACACCCTCTCAGCATGCAGTCGTTGATGAGAAAGGGTTATTACGGAAATTAACTTCCGAATATAAAGTGACATTATGGTAAtt > 4:108900/1‑151 (MQ=255)
ggCATCCAGACACGCTACCGCCCCTGGCTTTTTAGCTACCAATACACTGATTTAGTTTAATTTTTCACACCCTCTCAGCATGCAGTCGTTGATGAGAAAGGGTTATTACGGAAATTAACTTCCGAATATAAAGTGACATTATGGTAATTGa < 3:1678393/151‑1 (MQ=255)
gCATCCAGACACGCTACCGCCCCTGGCTTTTTAGCTACCAATACACTGATTTAGTTTAATTTTTCACACCCTCTCAGCATGCAGTCGTTGATGAGAAAGGGTTATTACGGAAATTAACTTCCGAATATAAAGTGACATTATGGTAATTGaa < 8:875906/151‑1 (MQ=255)
aGACACGCTACCGCCCCTGGCTTTTTAGCTACCAATACACTGATTTAGTTTAATTTTTCACACCCTCTCAGCATGCAGTCGTTGATGAGAAAGGGTTATTACGGAAATTAACTTCCGAATATAAAGTGACATTATGGTAATTGAATATTgg > 6:1633773/1‑151 (MQ=255)
gACACGCTACCGCCCCTGGCTTTTTAGCTACCAATACACTGATTTAGTTTAATTTTTCACACCCTCTCAGCATGCAGTCGTTGATGAGAAAGGGTTATTACGGAAATTAACTTCCGAATATAAAGTGACATTATGGTAATTGAATATTGGc < 5:282206/151‑1 (MQ=255)
cacGCTACCGCCCCTGGCTTTTTAGCTACCAATACACTGATTTAGTTTAATTTTTCACACCCTCTCAGCATGCAGTCGTTGATGAGAAAGGGTTATTACGGAAATTAACTTCCGAATATAAAGTGACATTATGGTAATTGAATATTGGCtt > 2:578301/1‑151 (MQ=255)
cGCTACCGCCCCTGGCTTTTTAGCTACCAATACACTGATTTAGTTTAATTTTTCACACCCTCTCAGCATGCAGTCGTTGATGAGAAAGGGTTATTACGGAAATTAACTTCCGAATATAAAGTGACATTATGGTAATTGAATATTGGCTTTc > 6:30375/1‑151 (MQ=255)
aCCGCCCCTGGCTTTTTAGCTACCAATACACTGATTTAGTTTAATTTTTCACACCCTCTCAGCATGCAGTCGTTGATGAGAAAGGGTTATTACGGAAATTAACTTCCGAATATAAAGTGACATTATGGTAATTGAATATTGGCTTTCCaa < 4:1600100/150‑1 (MQ=255)
cGCCCCTGGCTTTTTAGCTACCAATACACTGATTTAGTTTAATTTTTCACACCCTCTCAGCATGCAGTCGTTGATGAGAAAGGGTTATTACGGAAATTAACTTCCGAATATAAAGTGACATTATGGTAATTGAATATTGGCTTTCCaataa < 7:1207596/151‑1 (MQ=255)
cGCCCCTGGCTTTTTAGCTACCAATACACTGATTTAGTTTAATTTTTCACACCCTCTCAGCATGCAGTCGTTGATGAGAAAGGGTTATTACGGAAATTAACTTCCGAATATAAAGTGACATTATGGTAATTGAATATTGGCTTTCCaata > 6:215776/1‑150 (MQ=255)
ccccTGGCTTTTTAGCTACCAATACACTGATTTAGTTTAATTTTTCACACCCTCTCAGCATGCAGTCGTTGATGAGAAAGGGTTATTACGGAAATTAACTTCCGAATATAAAGTGACATTATGGTAATTGAATATTGGCTTTCCAATAATg < 1:545371/151‑1 (MQ=255)
cccTGGCTTTTTAGCTACCAATACACTGATTTAGTTTAATTTTTCACACCCTCTCAGCATGCAGTCGTTGATGAGAAAGGGTTATTACGGAAATTAACTTCCGAATATAAAGTGACATTATGGTAATTGAATATTGGCTTTCCAATAATGc > 2:633571/1‑151 (MQ=255)
cccTGGCTTTTTAGCTACCAATACACTGATTTAGTTTAATTTTTCACACCCTCTCAGCATGCAGTCGTTGATGAGAAAGGGTTATTACGGAAATTAACTTCCGAATATAAAGTGACATTATGGTAATTGAATATTGGCTTTCCAATAATGc < 2:1635117/151‑1 (MQ=255)
ggCTTTTTAGCTACCAATACACTGATTTAGTTTAATTTTTCACACCCTCTCAGCATGCAGTCGTTGATGAGAAAGGGTTATTACGGAAATTAACTTCCGAATATAAAGTGACATTATGGTAATTGAATATTGGCTTTCCAATAATGCagga < 8:1490743/151‑1 (MQ=255)
gCTTTTTAGCTACCAATACACTGATTTAGTTTAATTTTTCACACCCTCTCAGCATGCAGTCGTTGATGAGAAAGGGTTATTACGGAAATTAACTTCCGAATATAAAGTGACATTATGGTAATTGAATATTGGCTTTCCAATAATGCagg > 1:1144545/1‑149 (MQ=255)
cTTTTTAGCTACCAATACACTGATTTAGTTTAATTTTTCACACCCTCTCAGCATGCAGTCGTTGATGAGAAAGGGTTATTACGGAAATTAACTTCCGAATATAAAGTGACATTATGGTAATTGAATATTGGCTTTCCAATAATGCagtagg > 2:493223/1‑151 (MQ=255)
ttAGGTACCTATTGACTTATTTAGTTTAATTTTTCACACCCTCTAAGCATGCAGTCGTTGTTGAGAAAGGGTTATTTCGGAAATTAACTTCCGAATATAAAGTGACATTATGGTAATTGAATTTTGGCTTTCCAATAATTCAGGTGGAAg < 1:829498/150‑1 (MQ=255)
ttAGCTACCAATACACTGATTTAGTTTAATTTTTCACACCCTCTCAGCATGCAGTCGTTGATGAGAAAGGGTTATTACGGAAATTAACTTCCGAATATAAAGTGACATTATGGTAATTGAATATTGGCTTTCCAATAATGCAGGAGGAAg < 6:232334/150‑1 (MQ=255)
aGCTACCAATACACTGATTTAGTTTAATTTTTCACACCCTCTCAGCATGCAGTCGTTGATGAGAAAGGGTTATTACGGAAATTAACTTCCGAATATAAAGTGACATTATGGTAATTGAATATTGGCTTTCCAATAATGCAGGAGGAAgtg < 2:996515/150‑1 (MQ=255)
gtACCAATACACTGATTTAGTTTAATTTTTCACACCCTCTCAGCATGCAGTCGTTGATGAGAAAGGGTTATTACGGAAATTAACTTCCGAATATAAAGTGACATTATGGTAATTGAATATTGGCTTTCCAATAATGCAGGAGGAAGTGTTa < 4:240751/150‑1 (MQ=255)
cTACCAATACACTGATTTAGTTTAATTTTTCACACCCTCTCAGCATGCAGTCGTTGATGAGAAAGGGTTATTACGGAAATTAACTTCCGAATATAAAGTGACATTATGGTAATTGAATATTGGCTTTCCAATAATGCAGGAGGAAGTGtt > 4:913594/1‑150 (MQ=255)
cTACCAATACACTGATTTAGTTTAATTTTTCACACCCTCTCAGCATGCAGTCGTTGATGAGAAAGGGTTATTACGGAAATTAACTTCCGAATATAAAGTGACATTATGGTAATTGAATATTGGCTTTCCAATAATGCAGGAGGAAGTGtt > 5:1677892/1‑150 (MQ=255)
aCCAATACACTGATTTAGTTTAATTTTTCACACCCTCTCAGCATGCAGTCGTTGATGAGAAAGGGTTATTACGGAAATTAACTTCCGAATATAAAGTGACATTATGGTAATTGAATATTGGCTTTCCAATAATGCAGGAGGAAGTGTTAc < 2:1671396/150‑1 (MQ=255)
aCCAATACACTGATTTAGTTTAATTTTTCACACCCTCTCAGCATGCAGTCGTTGATGAGAAAGGGTTATTACGGAAATTAACTTCCGAATATAAAGTGACATTATGGTAATTGAATATTGGCTTTCCAATAATGCAGGAGGAAGTGTTAc > 3:93089/1‑150 (MQ=255)
aCCAATACACTGATTTAGTTTAATTTTTCACACCCTCTCAGCATGCAGTCGTTGATGAGAAAGGGTTATTACGGAAATTAACTTCCGAATATAAAGTGACATTATGGTAATTGAATATTGGCTTTCCAATAATGCAGGAGGAAGTGTTACa < 5:345378/151‑1 (MQ=255)
aCCAATACACTGATTTAGTTTAATTTTTCACACCCTCTCAGCATGCAGTCGTTGATGAGAAAGGGTTATTACGGAAATTAACTTCCGAATATAAAGTGACATTATGGTAATTGAATATTGGCTTTCCAATAATGCAGGAGGAAGTGTTACa < 3:392158/151‑1 (MQ=255)
aTACACTGATTTAGTTTAACTTTTCACACCCTCTCAGCATGCAGTCGTTGATGAGAAAGGGTTATTACGGAAATTAACTTCCGAATATAAAGTGACATTATGGTAATTGAATATTGGCTTTCCAATAATGCAGGAGGAAGTGTTACAGCTa < 2:786269/151‑1 (MQ=255)
acacTGATTTAGTTTAATTTTTCACACCCTCTCAGCATGCAGTCGTTGATGAGAAAGGGTTATTACGGAAATTAACTTCCGAATATAAAGTGACATTATGGTAATTGAATATTGGCTTTCCAATAATGCAGGAGGAAGTGTTACAGCTAAc < 6:1390261/151‑1 (MQ=255)
cacTGATTTAGTTTAATTTTTCACACCCTCTCAGCATGCAGTCGTTGATGAGAAAGGGTTATTACGGAAATTAACTTCCGAATATAAAGTGACATTATGGTAATTGAATATTGGCTTTCCAATAATGCAGGAGGAAGTGTTACAGCTAACg < 1:174878/151‑1 (MQ=255)
cacTGATTTAGTTTAATTTTTCACACCCTCTCAGCATGCAGTCGTTGATGAGAAAGGGTTATTACGGAAATTAACTTCCGAATATAAAGTGACATTATGGTAATTGAATATTGGCTTTCCAATAATGCAGGAGGAAGTGTTACAGCTAACg < 6:1005351/151‑1 (MQ=255)
cacTGATTTAGTTTAATTTTTCACACCCTCTCAGCATGCAGTCGTTGATGAGAAAGGGTTATTACGGAAATTAACTTCCGAATATAAAGTGACATTATGGTAATTGAATATTGGCTTTCCAATAATGCAGGAGGAAGTGTTACAGCTAACg > 8:452472/1‑151 (MQ=255)
acTGATTTAGTTTAATTTTTCACACCCTCTCAGCATGCAGTCGTTGATGAGAAAGGGTTATTACGGAAATTAACTTCCGAATATAAAGTGACATTATGGTAATTGAATATTGGCTTTCCAATAATGCAGGAGGAAGTGTTACAGCTAACgg > 5:465630/1‑151 (MQ=255)
acTGATTTAGTTTAATTTTTCACACCCTCTCAGCATGCAGTCGTTGATGAGAAAGGGTTATTACGGAAATTAACTTCCGAATATAAAGTGACATTATGGTAATTGAATATTGGCTTTCCAATAATGCAGGAGGAAGTGTTACAGCTAACgg < 2:1258046/151‑1 (MQ=255)
acTGATTTAGTTTAATTTTTCACACCCTCTCAGCATGCAGTCGTTGATGAGAAAGGGTTATTACCGAAATTAACTTCCGAATATAAAGTGACATTATGGTAATTGAATATTGGCTATCAAATAATGCAGGAGGAAGTGTTACAGCTAActg > 1:908490/1‑149 (MQ=255)
ttAGTTTAATTTTTCACACCCTCTCAGCATGCAGTCGTTGATGAGAAAGGGTTATTACGGAAATTAACTTCCGAATATAAAGTGACATTATGGTAATTGAATATTGGCTTTCCAATAATGCAGGAGGAAGTGTTACAGCTAACGGAATAGc > 1:69819/1‑151 (MQ=255)
gTTTAATTTTTCACACCCTCTCAGCATGCAGACGTTGATGAGAAAGGGTTATTACGGAAATTAACTTCCGAATATAAAGTGACAATATGCTAATTGAATATTCGCTTTCCAAAAATCCAGGAGGAAGTGTTACAGCTAACCGAATAGCAgg > 1:1476946/1‑151 (MQ=255)
tttAATTTTTCACACCCTCTCAGCATGCAGTCGTTGATGAGAAAGGGTTATTACGGAAATTAACTTCCGAATATAAAGTGACATTATGGTAATTGAATATTGGCTTTCCAATAATGCAGGAGGAAGTGTTACAGCTAACGGAATAGCAGGc > 4:1338618/1‑151 (MQ=255)
ttAATTTTTCACACCCTCTCAGCATGCAGTCGTTGATGAGAAAGGGTTATTACGGAAATTAACTTCCGAATATAAAGTGACATTATGGTAATTGAATATTGGCTTTCCAATAATGCAGGAGGAAGTGTTACAGCTAACGGAATAGCAGGc > 3:706064/1‑150 (MQ=255)
ttttCACACCCTCTCAGCATGCAGTCGTTGATGAGAAAGGGTTATTACGGAAATTAACTTCCGAATATAAAGTGACATTATGGTAATTGAATATTGGCTTTCCAATAATGCAGGAGGAAGTGTTACAGCTAACGGAATAGCAGGCAAGAt > 7:1333043/1‑150 (MQ=255)
tttCACACCCTCTCAGCATGCAGTCGTTGATGAGAAAGGGTTATTACGGAAAATAACTTCCGAATATAAAGTGACATTATGGTAATTGAATATTGGCTTTCCAATAATGCAGGAGGAAGTGTTACAGCTAACGGAATAGCAGGCAAGATa > 8:322750/1‑150 (MQ=255)
tCACACCCTCTCAGCATGCAGTCGTTGATGAGAAAGGGTTATTACGGAAATTAACTTCCGAATATAAAGTGACATTATGGTAATTGAATATTGGCTTTCCAATAATGCAGGAGGAAGTGTTACAGCTAACGGAATAGCAGGCAAGATAAc < 8:1310998/150‑1 (MQ=255)
cacaCCCTCTCAGCATGCAGTCGTTGATGAGAAAGGGTTATTACGGAAATTAACTTCCGAATATAAAGTGACATTATGGTAATTGAATATTGGCTTTCCAATAATGCAGGAGGAAGTGTTACAGCTAACGGAATAGCAGGCAAGATAACa < 3:1299984/150‑1 (MQ=255)
cacaCCCTCTCAGCATGCAGTCGTTGATGAGAAAGGGTTATTACGGAAATTAACTTCCGAATATAAAGTGACATTATGGTAATTGAATATTGGCTTTCCAATAATGCAGGAGGAAGTGTTACAGCTAACGGAATAGCAGGCAAGATAACa < 1:1286434/150‑1 (MQ=255)
acacCCTCTCAGCATGCAGTCGTTGATGAGAAAGGGTTATTACGGAAATTAACTTCCGAATATAAAGTGACATTATGGTAATTGAATATTGGCTTTCCAATAATGCAGGAGGAAGTGTTACAGCTAACGGAATAGCAGGCAAGATAACAAt > 7:694632/1‑151 (MQ=255)
acacCCTCTCAGCATGCAGTCGTTGATGAGAAAGGGTTATTACGGAAATTAACTTCCGAATATAAAGTGACATTATGGTAATTGAATATTGGCTTTCCAATAATGCAGGAGGAAGTGTTACAGCTAACGGAATAGCAGGCAAGATAACAAt < 5:1118591/151‑1 (MQ=255)
cacCCTCTCAGCATGCAGTCGTTGATGAGAAAGGGTTATTACGGAAATTAACTTCCGAATATAAAGTGACATTATGGTAATTGAATATTGGCTTTCCAATAATGCAGGAGGAAGTGTTACAGCTAACGGAATAGCAGGCAAGATAACAAtt < 2:1304262/151‑1 (MQ=255)
cacCCTCTCAGCATGCAGTCGTTGATGAGAAAGGGTTATTACGGAAATTAACTTCCGAATATAAAGTGACATTATGGTAATTGAATATTGGCTTTCCAATAATGCAGGAGGAAGTGTTACAGCTAACGGAATAGCAGGCAAGATAACAAt > 2:37571/1‑150 (MQ=255)
acCCTCTCAGCATGCAGTCGTTGATGAGAAAGGGTTATTACGGAAATTAACTTCCGAATATAAAGTGACATTATGGTAATTGAATATTGGCTTTCCAATAATGCAGGAGGAAGTGTTACAGCTAACGGAATAGCAGGCAAGATAACAATTc < 7:317600/151‑1 (MQ=255)
acCCTCTCAGCATGCAGTCGTTGATGAGAAAGGGTTATTACGGAAATTAACTTCCGAATATAAAGTGACATTATGGTAATTGAATATTGGCATTCCAATAATGCAGCAGGAACTGTTACAGCTAACGGAATAGAAGGCAAGATAACAATTc > 6:784707/1‑151 (MQ=255)
cccTCTCAGCATGCAGTCGTTGATGAGAAAGGGTTATTACGGAAATTAACTTCCGAATATAAAGTGACATTATGGTAATTGAATATTGGCTTTCCAATAATGCAGGAGGAAGTGTTACAGCTAACGGAATAGCAGGCAAGATAACAATTCg > 1:1012692/1‑151 (MQ=255)
cccTATCAGCATGCAGTCGTTGATGAGAAAGGGTTATTACGGAAATTAACTTCCGAATATAAAGTGACATTATGGTAATTGAATATTGGCTTTCCAATAATGCAGGAGGAAGTGTTACAGCTAACGGAATAGCAGGCAAGATAACAATTCg < 6:553211/151‑1 (MQ=255)
ccTCTCAGCATGCAGTCGTTGATGAGAAAGGGTTATTACGGAAATTAACTTCCGAATATAAAGTGACATTATGGTATTTGAATATTGGCTTTCCAATAATGCAGGAGGAAGTGTTACAGCTAACGGAATAGCAGGCAAGATAACAATTCgg > 1:319519/1‑151 (MQ=255)
cAGCATGCAGTCGTTGATGAGAAAGGGTTATTACGGAAATTAACTTCCGAATATAAGGTGACATTATGGTAATTGAATATTGGCTTTCCAATAATGCAGGAGGAAGTGTTACAGCTAACGGAATAGCAGGCAAGATAACAATTCGGTAAtt < 8:559621/151‑1 (MQ=255)
cAGCATGCAGTCGTTGATGAGAAAGGGTTATTACGGAAATTAACTTCCGAATATAAAGTGACATTATGGTAATTGAATATTGGCTTTCCAATAATGCAGGAGGAAGTGTTACAGCTAACGGAATAGCAGGCAAGATAACAATTCGGTaa < 2:1045422/149‑1 (MQ=255)
cAGCATGCAGTCGTTGATGAGAAAGGGTTATTACGGAAATTAACTTCCGAATATAAAGTGACATTATGGTAATTGAATATTGGCTTTCCAATAATGCAGGAGGAAGTGTTACAGCTAACGGAATAGCAGGCAAGATAACAATTCGGTa < 5:869216/148‑1 (MQ=255)
gCATGCAGTCGTTGATGAGAAAGGGTTATTACGGAAATTAACTTCCGAATATAAAGTGACATTATGGTAATTGAATATTGGCTTTCCAATAATGCAGGAGGAAGTGTTACAGCTAACGGAATAGCAGGCAAGATAACAATTCGGTAATTgg < 6:1081396/151‑1 (MQ=255)
gCATGCAGTCGTTGATGAGAAAGGGTTATTACGGAAATTAACTTCCGAATATAAAGTGACATTATGGTAATTGAATATTGGCTTTCCAATAATGCAGGAGGAAGTGTTACAGCTAACGGAATAGCAGGCAAGATAACAATTCGGTAATTgg < 4:1468/151‑1 (MQ=255)
ccATGCAGTCGTTGATGAGAAAGGGTTATTACGGAAATTAACTTCCGAATATAAAGTGACATTATGGTAATTGAATATTGGCTTTCCAATAATGCAGGAGGAAGTGTTACAGCTAACGGAATAGCAGGCAAGATAACAATTCGGTAATTgg < 1:1517016/150‑1 (MQ=255)
cAGTCGTTGATGAGAAAGGGTTATTACGGAAATTAACTTCCGAATATAAAGTGACATTATGGTAATTGAATATTGGCTTTCCAATAATGCAGGAGGAAGTGTTACAGCTAACGGAATAGCAGGCAAGATAACAATTCGGTAATTGGCTAtt < 6:1243348/151‑1 (MQ=255)
cAGTCGTTGATGAGAAAGGGTTATTACGGAAATTAACTTCCGAATATAAAGTGACATTATGGTAATTGAATATTGGCTTTCCAATAATGCAGGAGGAAGTGTTACAGCTAACGGAATAGCAGGCAAGATAACAATTCGGTAATTGGCTAtt < 2:256970/151‑1 (MQ=255)
aGTCGTTGATGAGAAAGGGTTATTACGGAAATTAACTTCCGAATATAAAGTGACATTATGGTAATTGAATATTGGCTTTCCAATAATGCAGGAGGAAGTGTTACAGCTAACGGAATAGCAGGCAAGATAACAATTCGGTAATTGGCTAttt < 7:1552043/151‑1 (MQ=255)
gTCGTTGATGAGAAAGGGTTATTACGGAAATTAACTTCCGAATATAAGGTGACATTATGGTAATTGAATATTGGCTTTCCAATAATGCAGGAGGAAGTGTTACAGCTAACGGAATAGCAGGCAAGATAACAATTCGGTAATTGGCTAtttt < 5:780358/151‑1 (MQ=255)
gggtgttgaGAAAGTGTTATTACGGAAATTAACTTCCGAATTTAAAGTGACATTATGGTAATTGAATATTGGCTTTCCTATAATGCAGGAGGAAGTGTTACAGCTAACGGAATAGCAGGCAAGATTACAATTCGGTAATTGGCTATTTTTa < 8:236184/145‑1 (MQ=255)
cGTTGATGATAAAGGGTTATTACGGAAATTAACTTCC‑AATATAAAGTGACATTATGGTAATTGAATATTGGCTTTCCAATAATGCAGGAGGAAGTGTTACAGCTAACGGAATAGCAGGCAAGATAACAATTCGGTAATTGGCTATTTTTa < 5:1059219/150‑1 (MQ=255)
gagaAAGGGTTATTACGGAAATTAACTTCCTAATATAAAGTGACATTATGGTAATTGAATATTGGCTTTCCAATAATGCAGGAGGAAGTGTTACAGCTAACGGAATAGCAGGCAAGATAACAATTCGGTAATTGGCTATTTTTAAGAATta < 8:1379860/151‑1 (MQ=255)
gagaAAGGGTTATTACGGAAATTAACTTCCGAATATAAAGTGACATTATGGTAATTGAATATTGGCTTTCCAATAATGCAGGAGGAAGTGTTACAGCTAACGGAATAGCAGGCAAGATAACAATTCGGTAATTGGCTATTTTTAAGAAtt < 6:895857/150‑1 (MQ=255)
agaAAGGGTTATTACGGAAATTAACTTCCGAATATAAAGTGACATTATGGTAATTGAATATTGGCTTTCCAATAATGCAGGAGGAAGTGTTACAGCTAACGGAATAGCAGGCAAGATAACAATTCGGTAATTGGCTATTTTTAAGAATtat < 5:1484244/151‑1 (MQ=255)
gaAAGGGTTATTACGGAAATTAACTTCCGAATATAAAGTGACATTATGGTAATTGAATATTGGCTTTCCAATAATGCAGGAGGAAGTGTTACAGCTAACGGAATAGCAGGCAAGATAACAATTCGGTAATTGGCTATTTTTAAGAATtat > 8:688937/1‑150 (MQ=255)
aaGGGTTATTACGGAAATTAACTTCCGAATATAAAGTGACATTATGGTAATTGAATATTGGCTTTCCAATAATGCAGGAGGAAGTGTTACAGCTAACGGAATAGCAGGCATGATAACAATTCGGTAATTGGCTATTTTTAAGAATTATAtt > 7:510648/1‑151 (MQ=255)
aaGGGTTATTACGGAAATTAACTTCCGAATATAAAGTGACATTATGGTAATTGAATATTGGCTTTCCAATAATGCAGGAGGAAGTGTTACAGCTAACGGAATAGCAGGCAAGATAACAATTCGGTAATTGGCTATTTTTAAGAATTATAtt > 6:690476/1‑151 (MQ=255)
aGGGTTATTACGGAAATTAACTTCCGAATATAAAGTGACATTATGGTAATTGAATATTGGCTTTCCAATAATGCAGGAGGAAGTGTTACAGCTAACGGAATAGCAGGCAAGATAACAATTCGGTAATTGGCTATTTTTAAGAATTATAtt > 3:114195/1‑150 (MQ=255)
gggTTATTACGGAAATTAACTTCCGAATATAAAGTGACATTATGGTAATTGAATATTGGCTTTCCAATAATGCAGGAGGAAGTGTTACAGCTAACGGAATAGCAGGCAAGATAACAATTCGGTAATTGGCTATTTTTAAGAATTATATTaa < 2:87548/151‑1 (MQ=255)
gTTATTACGGAAATTAACTTCCGAATATAAAGTGACATTATGGTAATTGAATATTGGCTTTCCAATAATGCAGGAGGAAGTGTTACAGCTAACGGAATAGCAGGCAAGATAACAATTCGGTAATTGGCTATTTTTAAGAATTATATTAAgt < 5:715924/151‑1 (MQ=255)
attaCGGAAATTAACTTCCGAATATAAAGTGACATTATGGTAATTGAATATTGGCTTTCCAATAATGCAGGAGGAAGTGTTACAGCTAACGGAATAGCAGGCAAGATAACAATTCGGTAATTGGCTATTTTTAAGAATTATATTAAgtgt < 5:571724/150‑1 (MQ=255)
aCGGAAATTAACTTCCGAATATAAAGTGACATTATGGTAATTGAATATTGGCTTTCCAATAATGCAGGAGGAAGTGTTACAGCTAACGGAATAGCAGGCAAGATAACAATTCGGTAATTGGCTATTTTTAAGAATTATATTAAGTGTCAtt > 7:1113756/1‑151 (MQ=255)
aCGGAAATTAACTTCCGAATATAAAGTGACATTATGGTAATTGAATATTGGCTTTCCAATAATGCAGGAGGAAGTGTTACAGCTAACGGAATAGCAGGCAAGATAACAATTCGGTAATTGGCTATTTTTAAGAATTATATTAAGTGTCAt < 3:1393064/150‑1 (MQ=255)
ggAAATTAACTTCCGAATATAAAGTGACATTATGGTAATTGAATATTGGCTTTCCAATAATGCAGGAGGAAGTGTTACAGCTAACGGAATAGCAGGCAAGATAACAATTCGGTAATTGGCTATTTTTAAGAATTATATTAAGTGTCATTc > 2:1494384/1‑150 (MQ=255)
ggAAATTAACTTCCGAATATAAAGTGACATTATGGTAATTGAATATTGGCTTTCCAATAATGCAGGAGGAAGTGTTACAGCTAACGGAATAGCAGGCAAGATAACAATTCGGTAATTGGCTATTTTTAAGAATTATATTAAGTGTCATTc > 1:459347/1‑150 (MQ=255)
gAAATTAACTTCCGAATATAAAGTGACATTATGGTAATTGAATATTGGCTTTCCAATAATGCAGGAGGAAGTGTTACAGCTAACGGAATAGCAGGCAAGATAACAATTCGGTAATTGGCTATTTTTAAGAATTATATTAAGTGTCATTCa > 4:540902/1‑150 (MQ=255)
aaaTTAACTTCCGAATATAAAGTGACATTATGGTAATTGAATATTGGCTTTCCAATAATGCAGGAGGAAGTGTTACAGCTAACGGAATAGCAGGCAAGATAACAATTCGGTAATTGGCTATTTTTAAGAATTATATTAAGTGTCATTCAat > 3:274099/1‑151 (MQ=255)
aaaTTAACTTCCGAATATAAAGTGACATTATGGTAATTGAATATTGGCTTTCCAATAATGCAGGAGGAAGTGTTACAGCTAACGGAATAGCAGGCAAGATAACAATTCGGTAATTGGCTATTTTTAAGAATTATATTAAGTGTCATTCAat > 2:1121188/1‑151 (MQ=255)
aCTTCCGAATATAAAGTGACATTATGGTAATTGAATATTGGCTTTCCAATAATGCAGGAGGAAGTGTTACAGCTAACGGAATAGCAGGCAAGATAACAATTCGGTAATTGGCTATTTTTAAGAATTATATTAAGTGTCATTCAATATGGtt < 7:807476/151‑1 (MQ=255)
aCTTCCGAATATAAAGTGACATTATGGTAATTGAATATTGGCTTTCCAATAATGCAGGAGGAAGTGTTACAGCTAACGGAATAGCAGGCAAGATAACAATTCGGTAATTGGCTATTTTTAAGAATTATATTAAGTGTCATTCAATATGGt < 3:1536456/150‑1 (MQ=255)
cTTCCGAATATAAGGTGACATTATGGTAATTGAATATTGGCTTTCCAATAATGCAGGAGGAAGTGTTACAGCTAACGGAATAGCAGGCAAGATAACAATTCGGTAATTGGCTATTTTTAAGAATTATATTAAGTGTCATTCAATATGGttt > 1:1624380/1‑151 (MQ=255)
tCCGAATATAAAGTGACATTATGGTAATTGAATATTGGCTTTCCAATAATGCAGGAGGAAGTGTTACAGCTAACGGAATAGCAGGCAAGATAACAATTCGGTAATTGGCTATTTTTAAGAATTATATTAAGTGTCATTCAATATGGtttt < 5:620932/150‑1 (MQ=255)
ccGAATATAAAGTGACATTATGGTAATTGAATATTGGCTTTCCAATAATGCAGGAGGAAGTGTTACAGCTAACGGAATAGCAGGCAAGATAACAATTCGGTAATTGGCTATTTTTAAGAATTATATTAAGTGTCATTCAATATGGTTTTTa < 3:570284/151‑1 (MQ=255)
aaTATAAAGTGACATTATGGTAATTGAATATTGGCTTTCCAATAATGCAGGAGGAAGTGTTACAGCTAACGGAATAGCAGGCAAGATAACAATTCGGTAATTGGCTATTTTTAAGAATTATATTAAGTGTCATTCAATATGGTTTTTAgg > 4:791340/1‑150 (MQ=255)
atatAAGGTGACATTATGGTAATTGAATATTGGCTTTCCAATAATGCAGGAGGAAGTGTTACAGCTAACGGAATAGCAGGCAAGATAACAATTCGGTAATTGGCTATTTTTAAGAATTATATTAAGTGTCATTCTATATGGTTTTTAgg > 4:372749/1‑149 (MQ=255)
atatAAAGTGACATTATGGTAATTGAATATTGGCTTTCCAATAATGCAGGAGGAAGTGTTACAGCTAACGGAATAGCAGGCAAGATAACAATTCGGTAATTGGCTATTTTTAAGAATTATATTAAGTGTCATTCAATATGGTTTTTAgg > 6:1495873/1‑149 (MQ=255)
atatAAAGTGACATTATGGTAATTGAATATTGGCTTTCCAATAATGCAGGAGGAAGTGTTACAGCTAACGGAATAGCAGGCAAGATAACAATTCGGTAATTGGCTATTTTTAAGAATTATATTAAGTGTCATTCAATATGGTTTTTAGGAg < 6:399915/151‑1 (MQ=255)
tataAAGTGACATTATGGTAATTGAATATTGGCTTTCCAATAATGCAGGAGGAAGTGTTACAGCTAACGGAATAGCAGGCAAGATAACAATTCGGTAATTGGCTATTTTTAAGAATTATATTAAGTGTCATTCAATATGGTTTTTAGGAGt > 1:521021/1‑151 (MQ=255)
ataAAGTGACATTATGGTAATTGAATATTGGCTTTCCAATAATGCAGGAGGAAGTGTTACAGCTAACGGAATAGCAGGCAAGATAACAATTCGGTAATTGGCTATTTTTAAGAATTATATTAAGTGTCATTCAATATGGTTTTTAGGAGt < 5:1601249/150‑1 (MQ=255)
taAAGTGACATTATGGTAATTGAATATTGGCTTTCCAATAATGCAGGAGGAAGTGTTACAGCTAACGGAATAGCAGGCAAGATAACAATTCGGTAATTGGCTATTTTTAAGAATTATATTAAGTGTCATTCAATATGGTTTTTAGGAGttt > 5:1329451/1‑151 (MQ=255)
|
TTCAGACTGGTCTTTCAGGCATCCAGACACGCTACCGCCCCTGGCTTTTTAGCTACCAATACACTGATTTAGTTTAATTTTTCACACCCTCTCAGCATGCAGTCGTTGATGAGAAAGGGTTATTACGGAAATTAACTTCCGAATATAAGGTGACATTATGGTAATTGAATATTGGCTTTCCAATAATGCAGGAGGAAGTGTTACAGCTAACGGAATAGCAGGCAAGATAACAATTCGGTAATTGGCTATTTTTAAGAATTATATTAAGTGTCATTCAATATGGTTTTTAGGAGTTT > NC_000913/2137395‑2137690
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
N/A
