Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A4 F84 I10 R1
|
267 |
426.1 |
13521957 |
97.0% |
13116298 |
150.5 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
NC_000913 |
2,732,992 |
G→A |
I394I (ATC→ATT) |
clpB ← |
protein disaggregation chaperone |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | NC_000913 | 2,732,992 | 0 | G | A | 97.0%
| 1262.3
/ 16.5
| 374 | I394I (ATC→ATT) | clpB | protein disaggregation chaperone |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (5/6); new base A (184/177); total (190/184) |
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 7.68e-01 |
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.80e-01 |
Only 100 of 384 total aligned reads displayed.
GCATATCCAGACGTTTTTTACTGGCTTCATCAGACTCTTTCATTAACGCCTGTTGTTCCAGTTTGAGCTGGATGATACGACGATCGAGTCGGTCGAGTTCTTCTGGTTTTGAGTCAATCTGCATACGAATGCTGGATGCTGCTTCATCGATCAGGTCGATGGCTTTATCCGGCAGCTGACGGTCAGCAATGTAGCGATGAGACAACGTCGCCGCTGCAACAATTGCCGGGTCAGTAATTTGCACATGGTGGTGCAATTCGTAACGTTCTTTCAGGCCACGCAGAATCGCAATGGTA > NC_000913/2732844‑2733139
|
gCATATCCAGACGTTTTTTACTGGCTTCATCAGACTCTTTCATTAACGCCTGTTGTTCCAGTTTGAGCTGGATGATACGACGATCGAGTCGGTCGAGTTCTTCTGGTTTTGAGTCAATCTGCATACGAATGCTGGATGCTGCTTCATCAAt < 7:1669146/151‑1 (MQ=255)
tatCCAGACGTTTTTTACTGGCTTCATCAGACTCTTTCATTAACGCCTGTTGTTCCAGTTTGAGCTGGATGATACGACGATCGAGTCGGTCGAGTTCTTCTGGTTTTGAGTCAATCTGCATACGAATGCTGGATGCTGCTTCATCAATc > 8:824841/1‑149 (MQ=255)
ccAGAGGTTTTTTACTGGCTTCATCAGACTCTTTCATTAACGCCTGTTGTTCCAGTTTGAGCTGGATGATACGACGATCGAGTCGGTCGAGTTCTTCTGGTTTTGAGTCAATCTGCATACGAATGCTGGATGCTGCTTCATCAATCAGGTc < 5:698128/151‑1 (MQ=255)
cAGACGTTTTTTACTGGCTTCATCAGACTCTTTCATTAACGCCTGTTGTTCCAGTTTGAGCTGGATGATACGACGATCGAGTCGGTCGAGTTCTTCTGGTTTTGAGTCAATCTGCATACGAATGCTGGATGCTGCTTCATCAATCAGGTCg < 8:1323249/151‑1 (MQ=255)
cAGACGTTTTTTACTGGCTTCATCAGACTCTTTCATTAACGCCTGTTGTTCCAGTTTGAGCTGGATGATACGACGATCGAGTCGGTCGAGTTCTTCTGGTTTTGAGTCAATCTGCATACGAATGCTGGATGCTGCTTCATCAATCAGGTCg < 6:848643/151‑1 (MQ=255)
gACGTTTTTTACTGGCTTCATCAGACTCTTTCATTAACGCCTGTTGTTCCAGTTTGAGCTGGATGATACGACGATCGAGTCGGTCGAGTTCTTCTGGTTTTGAGTCAATCTGCATACGAATGCTGGATGCTGCTTCATCAATCAGGTCGAt > 3:1397113/1‑151 (MQ=255)
ccGTTTTTTACTGGCTTCATCAGACTCTTTCATTAACGCCTGTTGTTCCAGTTTGAGCTGGATGATACGACGATCGAGTCGGTCGAGTTCTTCTGGTTTTGAGTCAATCTGCATACGAATGCTGGATGCTGCTTCATCGATCAGGTCGATg < 3:376975/150‑1 (MQ=255)
ttttACTGGCTTCATCAGACTCTTTCATTAACGCCTGTTGTTCCAGTTTGAGCTGGATGATACGACGATCGAGTCGGTCGAGTTCTTCTGGTTTTGAGTCAATCTGCATACGAATGCTGGATGCTGCTTCATCAATCAGGTCGATGGCttt > 5:522774/1‑151 (MQ=255)
tttACTGGCTTCATCAGACTCTTTCATTAACGCCTGTTGTTCCAGTTTGAGCTGGATGATACGACGATCGAGTCGGTCGAGTTCTTCTGGTTTTGAGTCAATCTGCATACGAATGCTGGATGCTGCTTCATCAATAAGGTCGATGGCttt > 1:1031981/1‑150 (MQ=255)
tACTGGCTTCATCAGACTCTTTCATTAACGCCTGTTGTTCCAGTTTGAGCTGGATGATACGACGATCGAGTCGGTCGAGTTCTTCTGGTTTTGAGTCAATCTGCATACGAATGCTGGATGCTGCTTCATCAATCAGGTCGATGGCTTTAt < 7:1333497/150‑1 (MQ=255)
tACTGGCTTCATCAGACTCTTTCATTAACGCCTGTTGTTCCAGTTTGAGCTGGATGATACGACGATCGAGTCGGTCGAGTTCTTCTGGTTTTGAGTCAATCTGCATACGAATGCTGGATGCTGCTTCATCAATCAGGTCGATGGCTTTATc > 5:1036493/1‑151 (MQ=255)
aCTGGCTTCATCAGACTCTTTCATTAACGCCTGTTGTTCCAGTTTGAGCTGGATGATACGACGATCGAGTCGGTCGAGTTCTTCTGGTTTTGAGTCAATCTGCATACGAATGCTGGATGCTGCTTCATCGATCAGGTCGATGGCTTTATcc > 3:1525840/1‑151 (MQ=255)
aCTGGCTTCATCAGACTCTTTCATTAACGCCTGTTGTTCCAGTTTGAGCTGGATGATACGACGATCGAGTCGGTCGAGTTCTTCTGGTTTTGAGTCAATCTGCATACGAATGCTGGATGCTGCTTCATCGATCAGGTCGATGGCTTTATcc > 2:1155482/1‑151 (MQ=255)
aCTGGCTTCATCAGACTCTTTCATTAACGCCTGTTGTTCCAGTTTGAGCTGGATGATACGACGATCGAGTCGGTCGAGTTCTTCTGGTTTTGAGTCAATCTGCATACGAATGCTGGATGCTGCTTCATCAATCAGGTCGATGGCTTTATcc < 7:1074442/151‑1 (MQ=255)
tGGCTTCATCAGACTCTTTCATTAACGCCTGTTGTTCCAGTTTGAGCTGGATGATACGACGATCGAGTCGGTCGAGTTCTTCTGGTTTTGAGTCAATCTGCATACGAATGCTGGATGCTGCTTCATCAATCAGGTCGATGGCTTTATCCgg > 1:1137973/1‑151 (MQ=255)
tcatcaGACTCTTTCATTAAGGCCTGTTGTTCCAGTTTGAGCTGGATGATACGACGATCGAGTCGGTCGAGTTCTTCTGGTTTTGAGTCAATCTGCATACGAATGCTGGATGCTGCTTCATCAATCAGGTCGATGGCTTTATCCGGCAGc < 7:14249/150‑1 (MQ=255)
tcatcaGACTCTTTCATTAACGCCTGTTGTTCCAGTTTGAGCTGGATGATACGACGATCGAGTCGGTCGAGTTCTTCTGGTTTTGAGTCAATCTGCATACGAATGCTGGATGCTGCTTCATCAATCAGGTCGATGGCTTTATCCGGCAg < 5:1264478/149‑1 (MQ=255)
catcaGACTCTTTCATTAACGCCTGTTGTTCCAGTTTGAGCTGGATGATACGACGATCGAGTCGGTCGAGTTCTTCTGGTTTTGAGTCAATCTGCATACGAATGCTGGATGCTGCTTCATCAATCAGGTCGATGGCTTTATCCGGCAGCt < 8:298140/150‑1 (MQ=255)
catcaGACTCTTTCATTAACGCCTGTTGTTCCAGTTTGAGCTGGATGATACGACGATCGAGTCGGTCGAGTTCTTCTGGTTTTGAGTCAATCTGCATACGAATGCTGGATGCTGCTTCATCAATCAGGTCGATGGCTTTATACGGCAGCTg > 1:633907/1‑151 (MQ=255)
aatcaGACTCTTTCATTAACGCCTGTTGTTCCAGTTTGAGCTGGATGATACGACGATCGAGTCGGTCGAGTTCTTCTGGTTTTGAGTCAATCTGCATACGAATGCTGGATGCTGCTTCATCAATCAGGTCGATGGCTTTATCCGGCAGCTg < 2:424979/150‑1 (MQ=255)
gtctctTTCATTAACGCCTGTTGTTCCAGTTTGAGCTGGATGATACGACGATCTAGTCGGTCGAGTTCTTCTGGTTTTGTGTCAATCTGCATACGAATGCTGGATGCTGCTTCATCAATCAGGTCGATGGCTTTATCCGGCAGCTGACGGt < 5:776611/149‑1 (MQ=255)
gACTCTTTCATTAACGCCTGTTGTTCCAGTTTGAGCTGGATGATACGACGATCGAGTCGGTCGAGTTCTTCTGGTTTTGAGTCAATCTGCATACGAATGCTGGATGCTGCTTCATCAATCAGGTCGATGGCTTTATCCGGCAGCTGACGGt > 4:915575/1‑151 (MQ=255)
gACTCTTTCATTAACGCCTGTTGTTCCAGTTTGAGCTGGATGATACGACGATCGAGTCGGTCGAGTTCTTCTGGTTTTGAGTCAATCTGCATACGAATGCTGGATGCTGCTTCATCAATCAGGTCGATGGCTTTATCCGGCAGCTGACGGt < 1:698365/151‑1 (MQ=255)
tctTTCATTAACGCCTGTTGTTCCAGTTTGAGCTGGATGATACGACGATCGAGTCGGTCGAGTTCTTCTGGTTTTGAGTCAATCTGCATACGAATGCTGGATGCTGCTTCATCAATCAGGTCGATGGCTTTATCCGGCAGCTGACGGTc > 2:268646/1‑149 (MQ=255)
ctTTCATTAACGCCTGTTGTTCCAGTTTGAGCTGGATGATACGACGATCGAGTCGGTCGAGTTCTTCTGGTTTTGAGTCAATCTGCATACGAATGCTGGATGCTGCTTCATCAATCAGGTCGATGGCTTTATCCGGCAGCTGACGGTCa < 5:11095/149‑1 (MQ=255)
ttCATTAACGCCTGTTGTTCCAGTTTGAGCTGGATGATACGACGATCGAGTCGGTCGAGTTCTTCTGGTTTTGAGTCAATCTGCATACGAATGCTGGATGCTGCTTCATCAATCAGGTCGATGGCTTTATCCGGCAGCTGACGGTCAGc < 8:59684/149‑1 (MQ=255)
ttAACGCCTGTTGTTCCAGTTTGAGCTGGATGATACGACGATCGAGTCGGTCGAGTTCTTCTGGTTTTGAGTCAATCTGCATACGAATGCTGGATGCTGCTTCATCAATCAGGTCGATGGCTTTATCCGGCAGCTGACGGTCAGCAATGt > 7:1632214/1‑150 (MQ=255)
tAACGCCTGTTGTTCCAGTTTGAGCTGGATGATACGACGATCGAGTCGGTCGAGTTCTTCTGGTTTTGAGTCAATCTGCATACGAATGCTGGATGCTGCTTCATCAATCAGGTCGATGGCTTTATCCGGCAGCTGACGGTCAGCAATGTa < 8:713757/150‑1 (MQ=255)
aaCGCCTGTTGTTCCAGTTTGAGCTGGATGATACGACGATCGAGTCGGTCGAGTTCTTCTGGTTTTGAGTCAATCTGCATACGAATGCTGGATGCTGCTTCATCAATCAGGTCGATGGCTTTATCCGGCAGCTGACGGTCAGCAATGTAg < 3:452502/150‑1 (MQ=255)
gCCTGTTGTTCCAGTTTGAGCTGGATGATACGACGATCGAGTCGGTCGAGTTCTTCTGGTTTTGAGTCAATCTGCATACGAATGCTGGATGCTGCTTCATCAATCAGGTCGATGGCTTTATCCGGCAGCTGACGGTCAGCAATGTAGCGAt > 5:1594392/1‑151 (MQ=255)
cTGTTGTTCCAGTTTGAGCTGGATGATACGACGATCGAGTCGGTCGAGTTCTTCTGGTTTTGAGTCAATCTGCATACGAATGCTGGATGCTGCTTCATCAATCAGGTCGATGGCTTTATCCGGCAGCTGACGGTCAGCAATGTAGCGATg > 4:463967/1‑150 (MQ=255)
tgttgtTCCAGTTTGAGCTGGATGATACGACGATCGAGTCGGTCGAGTTCTTCTGGTTTTGAGTCAATCTGCATACGAATGCTGGATGCTGCTTCATCAATAAGGTCGATGGCTTTATCCGGCAGCTGACGGTCAGCAATGTAGCGATg > 5:421914/1‑149 (MQ=255)
gttgttCCAGTTTGAGCTGGATGATACGACGATCGAGTCGGTCGAGTTCTTCTGGTTTTGAGTCAATCTGCATACGAATGCTGGATGCTGCTTCATCAATCAGGTCGATGGCTTTATCCGGCAGCTGACGGTCAGCAATGTAGCGATgag < 3:866288/150‑1 (MQ=255)
gttCCAGTTTGAGCTGGATGATACGACGATCGAGTCGGTCGAGTTCTTCTGGTTTTGAGTCAATCTGCATACGAATGCTGGATGCTGCTTCATCAATCAGGTCGATGGCTTTATCCGGCAGCTGACGGTCAGCAATGTAGCGATGAGACaa < 5:1495649/151‑1 (MQ=255)
ccAGTTNGAGCTGGATGATACGACGATCGAGTCGGTCGAGTTCTTCTGGTTTTGAGTCNATCTGCNTACGAATGCTGGATGCTGCTTCATCAATCAGGTCGATGGCTTTATCCGGCAGCTGACGGTCAGCAATGTAGCGATGAGACAACGt < 6:331021/151‑1 (MQ=255)
cAGTTTGAGCTGGATGATACGACGATCGAGTCGGTCGAGTTCTTCTGGTTTTGAGTCAATCTGCATACGAATGCTGGATGCTGCTTCATCAATCAGGTCGATGGCTTTATCCGGCAGCTGACGGTCAGCAATGTAGCGATGAGACAACGTc < 3:269480/151‑1 (MQ=255)
cAGTTTGAGCTGGATGATACGACGATCGAGTCGGTCGAGTTCTTCTGGTTTTGAGTCAATCTGCATACGAATGCTGGATGCTGCTTCATCAATCAGGTCGATGGCTTTATCCGGCAGCTGACGGTCAGCAATGTAGCGATGAGACAACGTc < 2:859521/151‑1 (MQ=255)
cAGTTTGAGCTGGATGATACGACGATCGAGTCGGTCGAGTTCTTCTGGTTTTGAGTCAATCTGCATACGAATGCTGGATGCTGCTTCATCAATCAGGTCGATGGCTTTATCCGGCAGCTGACGGTCAGCAATGTAGCGATGAGACAACGTc < 6:612467/151‑1 (MQ=255)
ttttGAGCTGGATGATACGACGATCGAGTCGGTCGAGTTCTTCTGGTTTTGAGTCAATCTGCATACGAATGCTGGATGCTGCTTCATCAATCAGGTCGATGGCTTTATCCGGCAGCTGACGGTCAGCAATGTAGCGATGAGACAACGTc < 4:697423/148‑1 (MQ=255)
ttGAGCTGGATGATACGACGATCGAGTCGGTCGAGTTCTTCTGGTTTTGAGTCAATCTGCATACGAATGCTGGATGCTGCTTCATCAATCAGGTCGATGGCTTTATCCGGCAGCTGACGGTCAGCAATGTAGCGATGAGACAACGTcgcc < 7:1543827/150‑1 (MQ=255)
ttGAGCTGGATGATACGACGATCGAGTCGGTCGAGTTCTTCTGGTTTTGAGTCAATCTGCATACGAATGCTGGATGCTGCTTCATCAATCAGGTCGATGGCTTTATACGGCAGCTGACGGTCAGCAATGTAGCCATGAGACAACGTccccg > 7:459129/1‑151 (MQ=255)
ttGAGCTGGATGATACGACGATCGAGTCGGTCGAGTGCTTCTGGTTTTGAGTCAATCTGCATACGAATGCTGGATGCTGCTTCATCAATCAGGGCGATGGCTTTATCCGGCAGCTGACGGTCAGCAATGTAGCGATGAGACAACGTcgcc < 2:1587011/150‑1 (MQ=255)
gAGCTGGATGATACGACGATCGAGTCGGTCGAGTTCTTCTGGTTTTGAGTCAATCTGCATACGAATGCTGGATGCTGCTTCATCAATCAGGTCGATGGCTTTATCCGGCAGCTGACGGTCAGCAATGTAGCGATGAGACAACGTCGCCGCt < 3:109177/151‑1 (MQ=255)
gAGCTGGATGATACGACGATCGAGTCGGTCGAGTTCTTCTGGTTTTGAGTCAATCTGCATACGAATGCTGGATGCTGCTTCATCAATCAGGTCGATGGCTTTATCCGGCAGCTGACGGTCAGCAATGTAGCGATGAGACAACGTCGCCGCt < 2:365778/151‑1 (MQ=255)
ggATGATACGACGATCGAGTCGGTCGAGTTCTTCTGGTTTTGAGTCAATCTGCATACGAATGCTGGATGCTGCTTCATCAATCAGGTCGATGGCTTTATCCGGCAGCTGACGGTCAGCAATGTAGCGATGAGACAACGTCGCCGCTGcaa < 1:345687/150‑1 (MQ=255)
gatgatAATAGGATCTAGTCGGTCGAGTTCTTCTTGTTTTGAGTCAATCTGCATACGAATGCTGGATGCTGCTTCATCAATCAGGTCGATTGCTTTATCCGGCAGCTGACGGTCTGCAATGTAGCGATGAGACAACGTCGACGCTGgaac < 6:1383725/150‑1 (MQ=255)
acgacgATCGAGTCGGTCGAGTTCTTCTGGTTTTGAGTCAATCTGCATACGAATGCTGGATGCTGCTTCATCAATCAGGTCGATGGCTTTATCCGGCAGCTGACGGTCAGCAATGTAGCGATGAGACAACGTCGCCGCTGCAACAATTGcc < 7:1031008/151‑1 (MQ=255)
acgaTCGAGTCGGTCGAGTTCTTCTGGTTTTGAGTCAATCTGCATACGAATGCTGGATGCTGCTTCATCAATCAGGTGGATGGCTTTTTCCGGCAGCTGACGGTCAGCAATGTAGCGATGAGACAACGTCGCCGCTGCAACAATTGCCggg < 8:369483/151‑1 (MQ=255)
cgaTCGAGTCGGTCGAGTTCTTCTGGTTTTGAGTCAATCTGCATACGAATGCTGGATGCTGCTTCATCAATCAGGTCGATGGCTTTATCCGGCAGCTGACGGTCAGCAATGTAGCGATGAGACAACGTCGCCGCTGCAACAATTGCCGGGt > 4:1344944/1‑151 (MQ=255)
gaTCGAGTCGGTCGAGTTCTTCTGGTTTTGAGTCAATCTGCATACGAATGCTGGATGCTGCTTCATCAATCAGGTCGATGGCTTTATCCGGCAGCTGACGGTCAGCAATGTAGCGATGAGACAACGTCGCCGCTGCAACAATTGCCGGGTc > 3:1595862/1‑151 (MQ=255)
aTCGAGTCGGTCGAGTTCTTCTGGTTTTGAGTCAATCTGCATACGAATGCTGGATGCTGCTTCATCAATCAGGTCGATGGCTTTATCCGGCAGCTGACGGTCAGCAATGTAGCGATGAGACAACGTCGCCGCTGCAACAATTGCCggggc > 6:360419/1‑148 (MQ=255)
cGAGTCGGTCGAGTTCTTCTGGTTTTGAGTCAATCTGCATACGAATGCTGGATGCTGCTTCATCAATCAGGTCGATGGCTTTATCCGGCAGCTGACGGTCAGCAATGTAGCGATGAGACAACGTCGCCGCTGCAACAATTGCCGGGTCAg < 2:1299419/150‑1 (MQ=255)
gAGTCGGTCGAGTTCTTCTGGTTTTGAGTCAATCTGCATACGAATGCTGGATGCTGCTTCATCAATCAGGTCGATGGCTTTATCCGGCAGCTGACGGTCAGCAATGTAGCGATGAGACAACGTCGCCGCTGCAACAATTGCCGGGTCAGt > 6:1211083/1‑150 (MQ=255)
gAGTCGGTCGAGTTCTTCTGGTTTTGAGTCAATCTGCATACGAATGCTGGATGCTGCTTCATCAATCAGGTCGATGGCTTTATCCGGCAGCTGACGGTCAGCAATGTAGCGATGAGACAACGTCGCCGCTGCAACAATTGCCGGGTCAGTa < 1:1085086/151‑1 (MQ=255)
gtcggtcgAGTTCTTCTGGTTTTGAGTCAATCTGCATACGAATGCTGGATGCTGCTTCATCAATCAGGTCGATGGCTTTATCCGGCAGCTGACGGTCAGCAATGTAGCGATGAGACAACGTCGCCGCTGCAACAATTGCCGGGTCAGTAAt > 5:1653566/1‑151 (MQ=255)
tcggtcgAGTTCTTCTGGTTTTGAGTCAATCTGCATACGAATGCTGGATGCTGCTTCATCAATCAGGTCGATGGCTTTATCCGGCAGCTGACGGTCAGCAATGTAGCGATGAGACAACGTCGCCGCTGCAACAATTGCCGGGTCAGTAAtt > 4:603364/1‑151 (MQ=255)
ggttcgAGTTCTTCTGGTTTTTATTCATTCTGGATACGAATGGTGGATGCTGGTTCATCAATCAGGGCGATGGCTTTATCCGGCAGCTTACGGTCTGCAATGTAGCGATGAGACAACTTCGGATCTGCAACAATTGCCGGGTCAGTAAttt < 4:373504/148‑1 (MQ=255)
gggtcgAGTTCTTCTGGTTTTGAGTCAATCTGCATACGAATGCTGGATGCTGCTTGATCAATCAGGTCGATGGCTTTATCCGGCAGCTGACGGTCAGCAATGTAGCGATGAGACAACGTCGCCGCTGCAACAATTGCCGGGTCAGTAAttt < 4:1025883/150‑1 (MQ=255)
cggtcgAGTTCTTCTGGTTTTGAGTCAATCTGCATACGAATGCTGGATGCTGCTTCATCAATCAGGTCGATGGCTTTATCCGGCAGCTGACGGTCAGCAATGTAGCGATGAGACAACGTCGCCGCTGCAACAATTGCCGGGTCAGTAAttt > 7:913005/1‑151 (MQ=255)
cggtcgAGTTCTTCTGGTTTTGAGTCAATCTGCATACGAATGCTGGATGCTGCTTCATCAATCAGGTCGATGGCTTTATCCGGCAGCTGACGGTCAGCAATGTAGCGATGAGACAACGTCGCCGCTGCAACAATTGCCGGGTCAGTAAtt < 2:1264017/150‑1 (MQ=255)
ggtcgAGTTCTTCTGGTTTTGAGTCAATCTGCATACGAATGCTGGATGCTGCTTCATCAATCAGGTCGATGGCTTTATCCGGCAGCTGACGGTCAGCAATGTAGCGATGAGACAACGTCGCCGCTGCAACAATTGCCGGGTCAGTAATTTg < 6:1515259/151‑1 (MQ=255)
cgAGTTCTTCTGGTTTTGAGTCAATCTGCATACGAATGCTGGATGCTGCTTCATCAATCAGGTCGATGGCTTTATCCGGCAGCTGACGGTCAGCAATGTAGCGATGAGACAACGTCGCCGCTGCAACAATTGCCGGGTCAGTAATTTGca < 1:126376/150‑1 (MQ=255)
cgAGTTCTTCTGGTTTTGAGTCAATCTGCATACGAATGCTGGATGCTGCTTCATCAATCAGGTCGATGGCTTTATCCGGCAGCTGACGGTCAGCAATGTAGCGATGAGACAACGTCGCCGCTGCAACAATTGCCGGGTCAGTAATTTGca < 7:757315/150‑1 (MQ=255)
aGTTCTTCTGGTTTTGAGTCAATCTGCATACGAATGCTGGATGCTGCTTCATCAATCAGGTCGATGGCTTTATCCGGCAGCTGACGGTCAGCAATGTAGCGATGAGACAACGTCGCCGCTGCAACAATTGCCGGGTCAGTAATTTGCACAt > 2:165327/1‑151 (MQ=255)
gTTCTTCTGGTTTTGTGTCAATCTGCATACGAATGCTGGATGCTGCTTCATCAATCAGGTCGATGGCTTTATCCGGCAGCTGACGGTCAGCAATGTAGCGATGAGACAACGTCGCCGCTGCAACAATTGCCGGGTCAGTAATTTGCACAtg > 8:450790/1‑151 (MQ=255)
tcttctGGTTTTGAGTCAATCTGCATACGAATGCTGGATGCTGCTTCATCAATCAGGTCGATGGCTTTATCCGGCAGCTGACGGTCAGCAATGTAGCGATGAGACAACGTCGCCGCTGCAACAATTGCCGGGTCAGTAATTTGCACAtggt > 1:1672317/1‑151 (MQ=255)
tctGGTTTTGAGTCAATCTGCATACGAATGCTGGATGCTGCTTCATCAATCAGGTCGATGGCTTTATCCGGCAGCTGACGGTCAGCAATGTAGCGATGAGACAACGTCGCCGCTGCAACAATTGCCGGGTCAGTAATTTGCACATggtggt > 1:1381072/1‑151 (MQ=255)
tGGTTTTGAGTCAATCTGCATACGAATGCTGGATGCTGCTTCATCAATCAGGTCGATGGCTTTATCCGGCAGCTGACGGTCAGCAATGTAGCGATGAGACAACGTCGCCGCTGCAACAATTGCCGGGTCAGTAATTTGCACATGGTGGTGc > 8:1153138/1‑151 (MQ=255)
ggTTTTGAGTCAATCTGCATACGAATGCTGGATGCTGCTTCATCAATCAGGTCGATGGCTTTATCCGGCAGCTGACGGTCAGCAATGTAGCGATGAGACAACGTCGCCGCTGCAACAATTGCCGGGTCAGTAATTTGCACATGgtggtg < 2:1517759/149‑1 (MQ=255)
ggTTTTGAGTCAATCTGCATACGAATGCTGGATGCTGCTTCATCAATCAGGTCGATGGCTTTATCCGGCAGCTGACGGTCAGCAATGTAGCGATGAGACAACGTCGCCGCTGCAACAATTGCCGGGTCAGTAATTTGCACATGgtggtg < 8:1561816/149‑1 (MQ=255)
ggTTTTGAGTCAATCTGCATACGAATGCTGGATGCTGCTTCATCAATCAGGTCGATGGCTTTATCCGGCAGCTGACGGTCAGCAATGTAGCGATGAGACAACGTCGCCGCTGCAACAATTGCCGGGTCAGTAATTTGCACATGGTGGTGc > 5:960159/1‑150 (MQ=255)
ggTTTTGAGTCAATCTGCATACGAATGCTGGATGCTGCTTCATCAATCAGGTCGATGGCTTTATCCGGCAGCTGACGGTCAGCAATGTAGCGATGAGACAACGTCGCCGCTGCAACAATTGCCGGGTCAGTAATTTGCACATGGTGGTGc < 1:805553/150‑1 (MQ=255)
ttttGAGTCAATCTGCATACGAATGCTGGATGCTGCTTCATCAATCAGGTCGATGGCTTTATCCGGCAGCTGACGGTCAGCAATGTAGCGATGAGACAACGTCGCCGCTGCAACAATTGCCGGGTCAGTAATTTGCACATGGTGGTGCAAt > 5:207481/1‑151 (MQ=255)
tttGAGTCAATCTGCATACGAATGCTGGATGCTGCTTCATCAATCAGGTCGATGGCTTTATCCGGCAGCTGACGGTCAGCAATGTAGCGATGAGACAACGTCGCCGCTGCAACAATTGCCGGGTCAGTAATTTGCACATGGTGGTGCAAtt > 2:795265/1‑151 (MQ=255)
tttGAGTCAATCTGCATACGAATGCTGGATGCTGCTTCATCAATCAGGTCGATGGCTTTATCCGGCAGCTGACGGTCAGCAATGTAGCGATGAGACAACGTCGCCGCTGCAACAATTGCCGGGTCAGTAATTTGCACATGGTGGTGCAAt < 8:1387147/150‑1 (MQ=255)
ttGAGTCAATCTGCATACGAATGCTGGATGCTGCTTCATCAATCAGGTCGATGGCTTTATCCGGCAGCTGACGGTCAGCAATGTAGCGATGAGACAACGTCGCCGCTGCAACAATTGCCGGGTCAGTAATTTGCACATGGTGGTGCAAtt < 3:1216103/150‑1 (MQ=255)
gAGTCAATCTGCATACGAATGCTGGATGCTGCTTCATCAATCAGGTCGATGGCTTTATCCGGCAGCTGACGGTCAGCAATGTAGCGATGAGACAACGTCGCCGCTGCAACAATTGCCGGGTCAGTAATTTGCACATGGTGGTGCAATTCGt > 2:950671/1‑151 (MQ=255)
gAGTCAATCTGCATACGAATGCTGGATGCTGCTTCATCAATCAGGTCGATCGCTTTATCCGGCAGCTGACGGTCAGCAATGTAGCGATGAGACAACGTCGCCGCTGCAACAATTGCCGGGTCAGTAATTTGCACATGGTGGTGCAATTCGt > 4:1118487/1‑151 (MQ=255)
gTCAATCTGCATACGAATGCTGGATGCTGCTTCATCAATCAGGTCGATGGCTTTATCCGGCAGCTGACGGTCAGCAATGTAGCGATGAGACAACGTCGCCGCTGCAACAATTGCCGGGTCAGTAATTTGCACATGGTGGTGCAATTCGTa > 4:1225362/1‑150 (MQ=255)
gCATACGAATGCTGGATGCTGCTTCATCAATCAGGTCGATGGCTTTATCCGGCAGCTGACGGTCAGCAATGTAGCGATGAGACAACGTCGCCGCTGCAACAATTGCCGGGTCAGTAATTTGCACATGGTGGTGCAATTCGTAACGtt < 1:56434/147‑1 (MQ=255)
gCATACGAATGCTGGATGCTGCTTCATCAATCAGGTCGATGGCTTTATCCGGCAGCTGACGGTCAGCAATGTAGCGATGAGACAACGTCGCCGCTGCAACAATTGCCGGGTCAGTAATTTGCACATGGTGGTGCAATTCGTAACGTTc < 4:154965/148‑1 (MQ=255)
gCATACGAATGCTGGATGCTGCTTCATCAATCAGGTCGATGGCTTTATCCGGCAGCTGACGGTCAGCAATGTAGCGATGAGACAACGTCGCCGCTGCAACAATTGCCGGGTCAGTAATTTGCACATGGTGGTGCAATTCGTAACGTTCt < 3:623298/149‑1 (MQ=255)
cGAATGCTGGATGCTGCTTCATCAATCAGGTCGATGGCTTTATCCGGCAGCTGACGGTCAGCAATGTAGCGATGAGACAACGTCGCCGCTGCAACAATTGCCGGGTCAGTAATTTGCACATGGTGGTGCAATTCGTAACGTTCTTTCAGGc < 6:1126631/151‑1 (MQ=255)
aTGCTGGATGCTGCTTCATCAATCAGGTCGATGGCTTTATCCGGCAGCTGACGGTCAGCAATGTAGCGATGAGACAACGTCGCCGCTGCAACAATTGCCGGGTCAGTAATTTGCACATGGTGGTGCAATTCGTAACGTTCTTTCAGGCCAc > 5:1203901/1‑151 (MQ=255)
gCTGGATGCTGCTTCATCAATCAGGTCGATGGCTTTATCCGGCAGCTGACGGTCAGCAATGTAGCGATGAGACAACGTCGCCGCTGCAACAATTGCCGGGTCAGTAATTTGCACATGGTGGTGCAATTCGTAACGTTCTTTCAGGCCACGc > 4:721539/1‑151 (MQ=255)
cTGGATGCTGCTTCATCAATCAGGTCGATGGCTTTATCCGGCAGCTGACGGTCAGCAATGTAGCGATGAGACAACGTCGCCGCTGCAACAATTGCCGGGTCAGTAATTTGCACATGGTGGTGCAATTCGTAACGTTCTTTCAGGCCACGc > 7:375052/1‑150 (MQ=255)
cTGGATGCTGCTTCATCAATCAGGTCGATGGCTTTATCCGGCAGCTGACGGTCAGCAATGTAGCGATGAGACAACGTCGCCGCTGCAACAATTGCCGGGTCAGTAATTTGCACATGGTGGTGCAATTCGTAACGTTCTTTCAGGCAACGc > 1:476532/1‑150 (MQ=255)
tGGATGCTGCTTCATCAATCAGGTCGATGGCTTTATCCGGCAGCTGACGGTCAGCAATGTAGCGATGAGACAACGTCGCCGCTGCAACAATTGCCGGGTCAGTAATTTGCACATGGTGGTGCAATTCGTAACGTTCTTTCAGGCCACGc > 5:50594/1‑149 (MQ=255)
tGGATGCTGCTTCATCAATCAGGTCGATGGCTTTATCCGGCAGCTGACGGTCAGCAATGTAGCGATGAGACAACGTCGCCGCTGCAACAATTGCCGGGTCAGTAATTTGCACATGGTGGTGCAATTCGTAACGTTCTTTCAGGCCACGc > 3:1289729/1‑149 (MQ=255)
ggATGCTGCTTCATCAATCAGGTCGATGGCTTTATCCGGCAGCTGACGGTCAGCAATGTAGCGATGAGACAACGTCGCCGCTGCAACAATTGCCGGGTCAGTAATTTGCACATGGTGGTGCAATTCGTAACGTTCTTTCAGGCCACGCa < 6:407193/149‑1 (MQ=255)
aTGCTGCTTCATCAATCAGGTCGATGGCTTTATCCGGCAGCTGACGGTCAGCAATGTAGCGATGAGACAACGTCGCCGCTGCAACAATTGCCGGGTCAGTAATTTGCACATGGTGGTGCAATTCGTAACGTTCTTTCAGGCCACGCAGAAt < 1:1449874/151‑1 (MQ=255)
gctTCATCAATCAGGTCGATGGCTTTATCCGGCAGCTGACGGTCAGCAATGTAGCGATGAGACAACGTCGCCGCTGCAACAATTGCCGGGTCAGTAATTTGCACATGGTGGTGCAATTCGTAACGTTCTTTCAGGCCACGCAGAATCGc < 5:632565/149‑1 (MQ=255)
gctTCATCAATCAGGTCGATGGCTTTATCCGGCAGCTGACGGTCAGCAATGTAGCGATGAGACAACGTCGCCGCTGCAACAATTGCCGGGTCAGTAATTTGCACATGGTGGTGCAATTCGTAACGTTCTTTCAGGCCACGCAGAATCGc < 5:819630/149‑1 (MQ=255)
gctTCATCAATCAGGTCGATGGCTTTATCCGGCAGCTGACGGTCAGCAATGTAGCGATGAGACAACGTCGCCGCTGCAACAATTGCCGGGTCAGTAATTTGCACATGGTGGTGCAATTCGTAACGTTCTTTCAGGCCACGCAGAATCGCaa < 8:873630/151‑1 (MQ=255)
ttCATCAATCAGGTCGATGGCTTTATCCGGCAGCTGACGGTCAGCAATGTAGCGATGAGACAACGTCGCCGCTGCAACAATTGCCGGGTCAGTAATTTGCACATGGTGGTGCAATTCGTAACGTTCTTTCAGGCCACGCAGAATCGCAATg > 2:558808/1‑151 (MQ=255)
tcatcaATCAGGTCGATGGCTTTATCCGGCAGCTGACGGTCAGCAATGTAGCGATGAGACAACGTCGCCGCTGCAACAATTGCCGGGTCAGTAATTTGCACATGGTGGTGCAATTCGTAACGTTCTTTCAGGCCACGCAGAATCGCAAt < 7:600643/149‑1 (MQ=255)
tcatcaATCAGGTCGATGGCTTGATCCGGCTGCTGACGGTCAGCAATGTAGCGATGAGACAACGTCGCCGCTGCAACAATTGCCGGGTCAGTAATTTGCACATGGTGGTGCAATTCGTAACGTTCTTTCAGGCCACGCAGAATCGCaacg < 4:1400442/150‑3 (MQ=255)
cATCAATCAGGTCGATGGCTTTATCCGGCAGCTGACGGTCAGCAATGTAGCGATGAGACAACGTCGCCGCTGCAACAATTGCCGGGTCAGTAATTTGCACATGGTGGTGCAATTCGTAACGTTCTTTCAGGCCACGCAGAATCGCAATgg < 4:228452/150‑1 (MQ=255)
atcaatcaGGTCGATGGCTTTATCCGGCAGCTGACGGTCAGCAATGTAGCGATGAGACAACGTCGCCGCTGCAACAATTGCCGGGTCAGTAATTTGCACATGGTGGTGCAATTCGTAACGTTCTTTCAGGCCACGCAGAATCGCAATGGt > 8:1670404/1‑150 (MQ=255)
atcaatcaGGTCGATGGCTTTATCCGGCAGCTGACGGTCAGCAATGTAGCGATGAGACAACGTCGCCGCTGCAACAATTGCCGGGTCAGTAATTTGCACATGGTGGTGCAATTCGTAACGTTCTTTCAGGCCACGCAGAATCGCAATGGTa < 1:1528394/151‑1 (MQ=255)
|
GCATATCCAGACGTTTTTTACTGGCTTCATCAGACTCTTTCATTAACGCCTGTTGTTCCAGTTTGAGCTGGATGATACGACGATCGAGTCGGTCGAGTTCTTCTGGTTTTGAGTCAATCTGCATACGAATGCTGGATGCTGCTTCATCGATCAGGTCGATGGCTTTATCCGGCAGCTGACGGTCAGCAATGTAGCGATGAGACAACGTCGCCGCTGCAACAATTGCCGGGTCAGTAATTTGCACATGGTGGTGCAATTCGTAACGTTCTTTCAGGCCACGCAGAATCGCAATGGTA > NC_000913/2732844‑2733139
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
N/A
