Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A4 F84 I10 R1
|
267 |
426.1 |
13521957 |
97.0% |
13116298 |
150.5 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
NC_000913 |
3,270,497 |
C→T |
intergenic (+895/+128) |
yhaC → / ← garK |
pentapetide repeats‑related protein/glycerate kinase I |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | NC_000913 | 3,270,497 | 0 | C | T | 97.5%
| 1235.3
/ 10.7
| 369 | intergenic (+895/+128) | yhaC/garK | pentapetide repeats‑related protein/glycerate kinase I |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (5/4); new base T (192/165); total (198/171) |
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 |
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.96e-01 |
Only 100 of 369 total aligned reads displayed.
CCGGGTGGAGTTTACCGTGCCACGGACTGTTACCAGCCGCGCGGTGCGCTCTTACCGCACCCTTTCACCCTTACCTGATCCCGCTTGCGCGGGCCATCGGCGGTTTGCTCTCTGTTGCACTGGTCGTGGGTTTCCCCCCCAGGC‑GTTACCTGGCACCCTGCCCTATGGAGCCCGGACTTTCCTCCCCTCCGCCCGTCTCCCCCGAAGAGGACGACGACGAAGCGGCGACTGTCTGGTCAGCTTCGGCGCGCAGTATAGAGGGTTTGCGCGCCCTTGTCACCCCGCGTTGCGCATTC > NC_000913/3270349‑3270644
|
ccGGGTGGAGTTTACCGTGCCACGGACTGTTACCAGCCGCGCGGTGCGCTCTTACCGCACCCTTTCACCCTTACCTGATCCCGCTTGCGCGGGCCATCGGCGGTTTGCTCTCTGTTGCACTGGTCGTGGGTTTCCCCCCCAGGC‑GTTATCt > 6:1143170/1‑151 (MQ=255)
ccGGGTGCAGTTTACCGTGCCACGGACTGTTACCAGCCGCGCGGTGCGCTCTTACCGCACCCTTTCACCCTTACCTGATCCCGCTTGCGCGGGCCATCGGCGGTTTGCTCTCTGTTGCACTGGTCGTCGGTTTCCCCCCCAGGC‑GTTATCt > 4:1230964/1‑151 (MQ=255)
cGGGTGGAGTTTACCGTGCCACGGACTGTTACCAGCCGCGCGGTGCGCTCTTACCGCACCCTTTCACCCTTACCTGATCCCGCTTGCGCGGGCCATCGGCGGTTTGCTGTCTGTTGCCCTGGTCGTGGGTTTCCCCCCCCGGC‑GGTATCTg > 5:55010/1‑151 (MQ=255)
cGGGTGGAGTTTACCGTGCCACGGACTGTTACCAGCCGCGCGGTGCGCTCTTACCGCACCCTTTCACCCTTACCTGATCCCGCTTGCGCGGGCCATCGGCGGTTTGCTCTCTGTTGCACTGGTCGTGGGTTTCCCCCCCAGGC‑GTTATCTg < 5:1665648/151‑1 (MQ=255)
ggAGTTTACCGTGCCACGGACTGTTACCAGCCGCGCGGTGCGCTCTTACCGCACCCTTTCACCCTTACCTGATCCCGCTTGCGCGGGCCATCGGCGGTTTGCTCTCTGTTGCACTGGTCGTGGGTTTCCCCCCCAGGC‑GTTATCTGGCAc < 7:356571/150‑1 (MQ=255)
tttACCGTGCCACGGACTGTTACCAGCCGCGCGGTGCGCTCTTACCGCACCCTTTCACCCTTACCTGATCCCGCTTGCGCGGGCCATCGGCGGTTTGCTCTCTGTTGCACTGGTCGTGGGTTTCCCCCCCAGGC‑GTTATCTGGCACCCTGc > 7:1277008/1‑151 (MQ=255)
aCCGTGCCACGGACTGTTACCAGCCGCGCGGTGCGCTCTTACCGCACCCTTTCACCCTTACCTGATCCCGCTTGCGCGGGCCATCGGCGGTTTGCTCTCTGTTGCACTGGTCGTGGGTTTCCCCCCCAGGC‑GTTATCTGGCACCCTGCCCt < 3:1204828/151‑1 (MQ=255)
aCCGTGCCACGGACTGTTACCAGCCGCGCGGTGCGCTCTTACCGCACCCTTTCACCCTTACCTGATCCCGCTTGCGCGGGCCATCGGCGGTTTGCTCTCTGTTGCACTGGTCGTGGGTTTCCCCCCCAGGC‑GTTATCTGGCACCCTGCCCt < 6:350800/151‑1 (MQ=255)
ccGTGCCACGGACTGTTACCAGCCGCGCGGTGCGCTCTTACCGCACCCTTTCACCCTTACCTGATCCCGCTTGCGCGGGCCATCGGCGGTTTGCTCTCTGTTGCACTGGTCGTGGGTTTCCCCCCCAGGC‑GTTATCTGGCCCCCTGcccg > 3:262848/1‑149 (MQ=255)
cGTGCCACGGACTGTTACCAGCCGCGCGGTGCGCTCTTACCGCACCCTTTCACCCTTACCTGATCCCGCTTGCGCGGGCCATCGGCGGTTTGCTCTCTGTTGCACTGGTCGTGGGTTTCCCCCCCAGGC‑GTTATCTGGCACCCTGCCCTAt > 8:895319/1‑151 (MQ=255)
gTGCCACGGACTGTTACCAGCCGCGCGGTGCGCTCTTACCGCACCCTTTCACCCTTACCTGATCCCGCTTGCGCGGGCCATCGGCGGTTTGCTCTCTGTTGCACTGGTCGTGGGTTTGCCCCCCAGGC‑GTTATCTGGCACCCTGCCCTAtt > 2:1401299/1‑150 (MQ=255)
gTGCCACGGACTGTTACCAGCCGCGCGGTGCGCTCTTACCGCACCCTTTCACCCTTACCTGATCCCGCTTGCGCGGGCCATCGGCGGTTTGCTCTCTGTTGCACTGGGCGTGGGTTTCCCCCCCAGGC‑GTTATCTGGCACCCTGCCCTATg < 8:1666012/151‑1 (MQ=255)
gCCACGGACTGTTACCAGCCTCGCGGTGCGCTCTTACCGCACCCTTTCACCCTTACCTGATCCCGCTTGCGCGGGCCATCGGCGGTTTGCTCTCTGTTGCACTGGTCGTGGGTTTCCCCCCCAGGC‑GTTATCTGGCACCCTGCCCTATgg < 1:794575/150‑1 (MQ=255)
gCCACGGACTGTTACCAGCCGCGCGGTGCGCTCTTACCGCACCCTTTCACCCTTACCTGATCCCGCTTGCGCGGGCCATCGGCGGTTTGCTCTCTGTTGCACTGGTCGTGGGTTTCCCCCCCAGGC‑GTTATCTGGCACCCTGCCCTATgg > 4:237113/1‑150 (MQ=255)
ccACGGACTGTTACCAGCCGCGCGGTGCGCTCTTACCGCACCCTTTCACCCTTACCTGATCCCGCTTGCGCGGGCCATCGGCGGTTTGCTCTCTGTTGCACTGGTCGTGGGTTTCCCCCCCAGGC‑GTTATCTGGCACCCTGCCCAATgg > 1:1404711/1‑149 (MQ=255)
cACGGACTGTTACCAGCCGCGCGGTGCGCTCTTACCGCACCCTTTCACCCTTACCTGATCCCGCTTGCGCGGGCCATCGGCGGTTTGCTCTCTGTTGCACTGGTCGTGGGTTTCCCCCCCAGGC‑GTTATCTGGCACCCTGCCCTATGGAga < 8:263635/151‑2 (MQ=255)
cACGGACTGTTACCAGCCGCGCGGTGCGCTCTTACCGCACCCTTTCACCCTTACCTGATCCCGCTTGCGCGGGCCATCGGCGGTTTGCTCTCTGTTGCACTGGTCGTGGGTTTCCCCCCCAGGC‑GTTATCTGGCACCCTGCCCTATGGAGc > 4:879541/1‑151 (MQ=255)
aCGGACTGTTACCAGCCGCGCGGTGCGCTCTTACCGCACCCGTTCACCCTTACCTGATCCCGCTTGCGCGGGCCATCGGCGGTTTGCTCTCTGTTGCACTGGTCGTGGGTTTCCCCCCCAGGC‑GTTATCTGGCACCCTGCCCTATGGAGcc < 4:1146801/151‑1 (MQ=255)
cGGACTGTTACAAGCCGCGCGGTGCGCTCTTACCGCACCCTTTCACCCTTACCTGATCCCGCTTGCGCGGGCCATCGGCGGTTTGCTCTCTGTTGCACTGGTCGTGGGTTTCCCCCCCAGGC‑GTTATCTGGCCCCCTGCCCTATGGAGccc > 4:329080/1‑151 (MQ=255)
ggACTGTTACCAGCCGCGCGGTGCGCTCTTACCGCACCCTTTCACCCTTACCTGATCCCGCTTGCGCGGGCCATCGGCGGTTTGCTCTCTGTTGCACTGGTCGTGGGTTTCCCCCCCAGGC‑GTTATCTGGCACCCTGCCCTATGGAGCCCg > 8:631887/1‑151 (MQ=255)
gACTGTTACCAGCCGCGCGGTGCGCTCTTACCGCACCCTTTCACCCTTACCTGATCCCGCTTGCGCGGGCCATCGGCGGTTTGCTCTCTGTTGCACTGGTCGTGGGTTTCCCCCCCAGGC‑GTTATCTGGCACCCTGCCCTATGGAGCCCgg > 8:727595/1‑151 (MQ=255)
gACTCTTACCAGCCGCGCGGTGCGCTCTTACCGCACCCTTTCACCCTTACCTGATCCCGCTTGCGCGGGCCATCGGCGGTTTGCTCTCTGTTGCACTGGTCGTGGGTTTCGCCCCCAGGC‑GTTATCTGGCACCCAGCCCTATGGAGCCCgg > 6:1350027/1‑151 (MQ=255)
aCTGTTACCAGCCGCGCGGTGCGCTCTTACCGCACCCTTTCACCCTTACCTGATCCCGCTTGCGCGGGCCATCGGCGGTTTGCTCTCTGTTGCACTGGTCGTGGGTTTCCCCCCCAGGC‑GTTATCTGGCACCCTGCCCTATGGAGCCCggc > 5:467818/1‑150 (MQ=255)
cTGTTACCAGCCGCGCGGTGCGCTCTTACCGCACCCTTTCACCCTTACCTGATCCCGCTTGCGCGGGCCATCGGCGGTGTGCTCTCTGTTGCACTGGTCGTGGGTTTCCCCCCCAGGC‑GTTATCTGGCACCCTGCCCTATGGAGCCCGGAc > 1:222147/1‑151 (MQ=255)
ttACCAGCCGCGCGGTGCGCTCTTACCGCACCCTTTCACCCTTACCTGATCCCGCTTGCGCGGGCCATCGGCGGTTTGCTCTCTGTTGCACTGGTCGTGGGTTTCCCCCCCAGGC‑GTTATCTGGCCCCCTGCCCTATGGAGCCCGGCCttt > 4:713516/1‑151 (MQ=255)
ttACCAGCCGCGCGGTGCGCTCTTACCGCACCCTTTCACCCTTACCTGATCCCGCTTGCGCGGGCCATCGGCGGTTTGCTCTCTGTTGCACTGGTCGTGGGTTTCCCCCCCAGGC‑GTTATCTGGCACCCAGCCCGATGGAGCCCCGACgtt > 1:1055676/1‑151 (MQ=255)
ccAGCCGCGCGGTGCGCTCTTACCGCACCCTTTCACCCTTACCTGATCCCGCTTGCGCGGGCCATCGGCGGTTTGCTCTCTGTTGCACTGGTCGTGGGTTTCCCCCCCAGGC‑GTTATCTGGCACCCTGCCCTATGGAGCCCGGACTTtcct > 4:794963/1‑151 (MQ=255)
ccGCGCGGTGCGCTCTTACCGCACCCTTTCACCCTTACCTGATCCCGCTTGCGCGGGCCATCGGCGGTTTGCTCTCTGTTGCACTGGTCGTGGGTTTCCCCCCCAGGC‑GTTATCTGGCACCCTGCCCTATGGAGCCCGGACTTTcctcccc < 6:1015531/151‑1 (MQ=255)
gcggcgCGCTCTTACCGCACCCTTTCACCCTTACCTGATCCCGCTTGCGCGGGCCATCGGCGGTTTGCTCTCTGTTGCACTGGTCGTGGGTTTCCCCCCCAGGC‑GTTATCTGGCACCCTGCCCTATGGAGCCCGGACTTTcctcccctccc > 2:770234/1‑150 (MQ=255)
gcgGTGCGCTCTTACCGCACCCTTTCACCCTTACCTGATCCCGCTTGCGCGGGCCATCGGCGGTTTGCTCTCTGTTGCACTGGTCGTGGGTTTCCCCCCCAGGC‑GTTATCTGGCACCCTGCCCTATGGAGCCCGGACTTTcctcccctccc > 2:223174/1‑150 (MQ=255)
gcgGTGCGCTCTTACCGCACCCTTTCACCCTTACCTGATCCCGCTTGCGCGGGCCATCGGCGGTTTGCTCTCTGTTGCACTGGTCGTGGGTTTCCCCCCCAGGC‑GTTATCTGGCACCCTGCCCTATGGAGCCCGGACTTTCCTCCCCTCCg < 6:479845/151‑1 (MQ=255)
ggggcgcTCTTACCGCACCCTTTCACCCTTACCTGATCCCGCTTGCGCGGGCCATCGGCGGTTTGCTCTCTGTTGCACTGGTCGTGGGTTTCCCCCCCAGGC‑GTTATCTGGCACCCTGCCCTATGGAGCCCGGACTTTCCTCCCCTCCGcc < 6:168345/148‑1 (MQ=255)
gTGCGCTCTTACCGCACCCTTTCACCCTTACCTGATCCCGCTTGCGCGGGCCATCGGCGGTTTGCTCTCTGTTGCACTGGTCGTGGGTTTCCCCCCCAGGC‑GTTATCTGGCACCCTGCCCTATGGAACCCGGACTTTCCTCCCCTCCGccc < 4:577724/151‑1 (MQ=255)
gcgcTCTTACCGCACCCTTTCACCCTTACCTGATCCCGCTTGCGCGGGCCATCGGCGGTTTGCTCTCTGTTGCACTGGTCGTGGGTTTCCCCCCCAGGC‑GTTATCTGGCACCCTGCCCTATGGAGCCCGGACTTTCCTCCCCTCCGCCCgg > 6:891398/1‑150 (MQ=255)
gcgcTCTTACCGCACCCTTTCACCCTTACCTGATCCCGCTTGCGCGGGCCATCGGCGGTTTGCTCTCTGTTGCACTGGTCGTGGGTTTCCCCCCCAGGC‑GTTATCTGGCACCCTGCCCTATGGAGCCCGGACTTTCCTCCCCTCCGCCCGt < 3:58359/151‑1 (MQ=255)
gcgcTCTTACCGCACCCTTTCACCCTTACCTGATCCCGCTTGCGCGGGCCATCGGCGGTTTGCTCTCTGTTGCACTGGTCGTGGGTTTCCCCCCCAGGC‑GTTATCTGGCACCCTGCCCTATGGAGCCCGGACTTTCCTCCCCTCCGCCCGt > 2:372249/1‑151 (MQ=255)
gcgcTCTTACCGCACCCTTTCACCCTTACCTGATCCCGCTCGCGCGGGCCATCGGCGGTTTGCTCTCTGTTGCACTGGTCGTGGGTTTCCCCCCCAGGC‑GTTATCTGGCACCCTGCCCTATGGAGCCCGGACTTTCCTCCCCTCCGCCCg < 5:1348555/150‑1 (MQ=255)
ctctTACCGCACCCTTTCACCCTTACCTGATCCCGCTTGCGCGGGCCATCGGCGGTTTGCTCTCTGTTGCACTGGTCGTGGGTTTCCCCCCCAGGC‑GTTATCTGGCACCCTGCCCTATGGAGCCCGGACTTTCCTCCCCTCCGCCCGtctc > 6:967154/1‑151 (MQ=255)
gctTACCGCACCCTTTCACCCTTACCTGATCCCGCTTGCGCGGGCCATCGGCGGTTTGCTCTCTGTTGCACTGGTCGTGGGTTTCCCCCCCAGGC‑GTTATCTGGCACCCTGCCCTATGGAGCCCGGACTTTCCTCCCCTCCGCCCGTCTcc < 2:644024/150‑1 (MQ=255)
ctTACCGCACCCTTTCACCCTTACCTGATCCCGCTTGCGCGGGCCATCGGCGGTTTGCTCTCTGTTGCACTGGTCGTGGGTTTCCCCCCCAGGC‑GTTATCTGGCACCCTGCCCTATGGAGCCCGGACTTTCCTCCCCTCCGCCCGtctc < 5:1056543/149‑1 (MQ=255)
aCCGCACCCTTTCACCCTTACCTGATCCCGCTTGCGCGGGCCATCGGCGGTTTGCTCTCTGTTGCACTGGTCGTGGGTTTCCCCCCCAGGC‑GTTATCTGGCACCCTGCCCTATGGAGCCCGGACTTTCCTCCCCTCCGCCCGTCTcccccc > 7:81067/1‑150 (MQ=255)
aCCGCACCCTTTCACCCTTACCTGATCCCGCTTGCGCGGGCCATCGGCGGTTTGCTCTCTGTTGCACTGGTCGTGGGTTTCCCCCCCAGGC‑GTTATCTGGCACCCTGCCCTATGGAGCCCGGACTTTCCTCCCCTCCGCCCGTCTCCCCCg < 5:1228739/151‑1 (MQ=255)
tttCACCCTTACCTGATCCCGCTTGCGCGGGCCATCGGCGGTTTGCTCTCTGTTGCACTGGTCGTGGGTTTACCCCCCACGCGGTTAATTGG‑ACCCAGCCCGATTGCGCCCGGGCGTTACTCCCCACCCCCCCTCGaccccccacacgccc > 5:1490521/1‑141 (MQ=255)
ttCACCCTTACCTGATCCCGCTTGCGCGGGCCATCGGCGGTTTGCTCTCTGTTGCACTGGTCGTGGGTTTCCCCCCCAGGC‑GTTATCTGGCACCCTGCCCTATGGAGCCCGGACTTTCCTCCCCTCCGCCCGTCTCCCCCGAAGAGgac < 3:832681/149‑1 (MQ=255)
aCCCTTACCTGATCCCGCTTGCGCGGGCCATCGGCGGTTTGCTCTCTGTTGCACTGGTCGTGGGTTTGACCCCCACGG‑GTTATATGGCCCCCTACCCCATGGGCCCCCGACGTTACGAACCACCGCCCCGCGCCCCCGCACAGgaccccgc > 5:347964/1‑146 (MQ=255)
aCCCTTACCTGATCCCGCTTGCGCGGGCCATCGGCGGTTTGCTCTCTGTTGCACTGGTCGTGGGTTTCCCCCCCAGGC‑GTTATCTGGCACCCTGCCCTATGGAGCCCGGACTTTCCTCCCCTCCGCCCGTCTCCCCCGAAGAGgacgacgc > 7:326524/1‑150 (MQ=255)
aCCCTTACCTGATCCCGCTTGCGCGGGCCATCGGCGGTTTGCTCTCTGTTGCACTGGTCGTGGGTTTCCCCCCCAGGC‑GTTATCTGGCACCCTGCCCTATGGAGCCCGGACTTTCCTCCCCTCCGCCCGTCTCCCCCGAAGAGgacgacga < 1:1485551/151‑1 (MQ=255)
cccTTACCTGATCCCGCTTGCGCGGGCCATCGGCGGTTTGCTCTCTGTTGCACTGGTCGTGGGTTTCCCCCCCAGGC‑GTTATCTGGCACCCTGCCCTATGGAGCCCGGCCTTTCCTCCCCTCCGCCCGTCTCCCCCGAAGAGgacgacgac > 8:1553863/1‑151 (MQ=255)
cTTACCTGATCCCGCTTGCGCGGGCCATCGGCGGTTTGCTCTCTGTTGCACTGGTCGTGGGTTTCCCCCCCAGGC‑GTTATCTGGCCCCCTGCCCTATGGAGCCCGGACTTTCCTCCCCTCCGCCCGTCTCCCCCGAAGAGGacgacgacg > 6:142931/1‑150 (MQ=255)
ttACCTGATCCCGCTTGCGCGGGCCCTCGGCGGTTTGCTCTCTGTTGCACTGGTCGTGGGTTTGCCCCCCCGGG‑GGTGTCTGGGACCCGGCCCGTTGGGGCCCGGGGGTGACGCCCCGCCCCCCGGCCCCCCCGAagccggcgcaccgcc > 5:1595735/1‑137 (MQ=255)
tACCTTATCCCGCTTGCGCGGGCCATCGGCGGTTTGCTCTCTGTTGAACTGGTCGTGGGTGTCCCCCCCAGGC‑GTTATCTGGCACCCTGCCCTATGGAGCCCGGAATTTCCTCCCCTCCGCCCGTCT‑CCCCGAAGAGGACGACGACTaa < 6:1287514/149‑1 (MQ=255)
tACCTGATCCCGCTTGCGCGGGCCATCGGCGGTTTGCTCTCTGTTGCACTGGTCGTGGGTTTCCCCCCCAGGC‑GTTATCTGGCACCCTGCCCTATGGAGCCCGGCCTTTCCTACCCTCCGCCCGTCTCCCCCGAAGAGGACGACGACGaac > 3:142927/1‑150 (MQ=255)
tACCTGATCCCGCTTGCGCGGGCCATCGGCGGTTTGCTCTCTGTTGCACTGGTCGTGGGTTTCCCCCCCAGGC‑GTTATCTGGCACCCTGCCCTATGGAGCCCGGACTTTCCTCCCCTCCGCCCGTCTCCCCCGAAGAGG‑CGACGACGAAg < 7:893371/150‑1 (MQ=255)
aCCTGATCCCGCTTGCGCGGGCCATCGGCGGTTTGCTCTCTGTTGCACTGGTCGTGGGTTTCCCCCCCAGGC‑GTTATGTGGCACCCTGGCCTATGGAGCCCGGACTTTCCTCCCCTCCGCCCGTCTCCCCCGAAGAGGACGACGCCGAAgc > 4:387040/1‑151 (MQ=255)
tGATCCCGCTTGCGCGGGCCATCGGCGGTTTGCTCTCTGTTGCACTGGTCGTGGGTTTCCCCCCCAGGC‑GTTATCTGGCACCCTGCCCTATGGAGCCCGGACTTTCCTCCCCTCCGCCCGTCTCCCCCGAAGAGGACGACGACGAAgcggc > 2:93998/1‑151 (MQ=255)
gATCCCGCTTGCGCGGGCCATCGGCGGTTTGCTCTCTGTTGCACTGGTCGTGGGTTTCCCCCCCAGGC‑GTTATCTGGCACCCTGCCCTATGGAGCCCGGACTTTCCTCCCCTCCGCCCGTCTCCCCCGAAGAGGACGACGACGAAgcggcg < 4:1315391/151‑1 (MQ=255)
cccGCTTGCGCGGGCCATCGGCGGTTTGCTCTCTGTTGCACTGGTCGTGGGTTTCCCCCCCAGGC‑GTTACCTGGCACCCTGCCCTATGGAGCCCGGACTTTCCTCCCCTCCGCCCGTCTCCCCCGAAGAGGACGACGACGAAGCGGCGACt < 1:1441727/151‑1 (MQ=255)
cccGCTTGCGCGGGCCATCGGCGGTTTGCTCTCTGTTGCACTGGGCGTGGGTTTCCCCCCCAGGC‑GTTATCTGGCACCCTGCCCTATGGAGCCCGGACTTTCCTCCCCTCCGCCCGTCTCCCCCGAAGAGGACGACGACGAAGCGGCGACt < 4:173850/151‑1 (MQ=255)
ccGCTTGCGCGGGCCATCGGCGGTTTGCTCTCTGTTGCACTGGTCGTGGGTTTCCCCCCCAGGC‑GTTATATGGCACCCTGCCCTATGGAGCCCGGACTTTCCTCCCCTCCCCCCCTCTCCCCCGAAGAGGACGACGACGAACCGGCGCCTg > 8:1143144/1‑151 (MQ=255)
ccGCTTGCGCGGGCCATCGGCGGTTTGCTCTCTGTTGCACTGGTCGTGGGTTTCCCCCCCAGGC‑GTTACCTGGCACCCTGCCCTATGGAGCCCGGACTTTCCTCCCCTCCGCCCGTCTCCCCCGAAGAGGACGACGACGAAGCGGCGACTg < 7:431562/151‑1 (MQ=255)
tccgcgGGCCATCGGCGGCTTGCTCTCTGTTGCACTGGTCGTGGGCTTCCCCCCCAGGC‑GTTACCTGGCACCCTGCCCTATGGAGCCCGGACTTTCCTCCCCTCCGCCCGTCTCCCCCGAAGAGGACGACGACGAAGCGGCGACTGTca < 2:1164174/147‑2 (MQ=255)
gcgGGCCATCGGCGGTTTGCTCTCTGTTGCACTGGTCGTGGGTTTCCCCTCCAGGC‑GTTATCTGGCACCCTGCCCTATGGAGCCCGGACTTTCCTCCCCTCCGCCCGTCTCCCCCGAAGAGGACGACGCCGAAGCGGCGCCTGTCTGGTc > 5:176344/1‑150 (MQ=255)
gcgGGCCATCGGCGGTTTGCTCTCTGTTGCACTGGTCGTGGGTTTCCCCCCCAGGC‑GTTATCTGGCACCCTGCCCTATGGAGCCCGGACTTTCCTCCCCTCCGCCCGTCTCCCCCGAAGAGGACGACGACGAAGCGGCGACTGTCTGGTCa < 3:687707/151‑1 (MQ=255)
cgGGCCATCGGCGGTTTGCTCTCTGTTGCACTGGTCGTGGGTTTCCCCCCCAGGC‑GTTATCTGGCACCCTGCCCTATGGAGCCCGGCCTTTCCTCCCCTCCGCCCGTCTCCCCCGAAGAGGACGACGACGAAGCGGCGCCTGTCTGGTc > 7:277821/1‑149 (MQ=255)
cgGGCCATCGGCGGTTTGCTCTCTGTTGCACTGGTCGTGGGTTTCCCCCCCAGGC‑GTTATCTGGCACCCTGCCCTATGGAGCCCGGACTTTCCTCCCCTCCGCCCGTCTCCCCCGAAGAGGACGACGACGAAGCGGCGACTGTCTGGTCAg < 3:801905/151‑1 (MQ=255)
gggCCATCGGCGGTTTGCTCTCTGTTGCACTGGTCGTGGGTTTCCCCCCCAGGC‑GTTATCTGGCACCCTGCCCTATGGAGCCCGGACTTTCCTCCCCTCCGCCCGTCTCCCCCGAAGAGGACGACGACGAAGCGGCGACTGTCTGGTCAGc > 3:1138692/1‑151 (MQ=255)
gCCATCGGCGGTTTGCGCTCTGTTGCACTGGTCGTGGGTTTCCCCCCCAGGC‑GTTATCTGGCACCCTGCCCTATGGAGCCCGGACTTTCCTCCCCTCCGCCCGTCTCCCCCGAAGAGGACGACGACGAAGCGGCGACTGTCTGGTCAGCtt < 1:284847/151‑1 (MQ=255)
ccATCGGCGGTTTGCTCTCTGTTGCACTGGTCGTGGGTTTCCCCCCCAGGC‑GTTATCTGGCACCCTGCCCTATGGAGCCCGGACTTTCCTCCCCTCCGCCCGTCTCCCCCGAAGAGGACGACGACGAAGCGGCGACTGTCTGGTCAGCTTc < 2:45792/151‑1 (MQ=255)
cggcggTTTGCTCTCTGTTGCACTGGTCGTGGGGTTCCCCCCCAGGC‑GTTATCTGGCACCCTGCCCTATGGAGCCCGGACTTTCCTCCCCTCCGCCCGTCTCCCCCGAAGAGGACGACGACGAAGCGGCGACTGTCTGGTCAGCTTCGgc < 5:75896/150‑1 (MQ=255)
ttGCTCTCTGTTGCACTGGTCGTGGGTTTCCCCCCCAGGC‑GTTATCTGGCACCCTGCCCTATGGAGCCCGGACTTTCCTCCCCTCCGCCCGTCTCCCCCGAAGAGGACGACGACGAAGCGGCGACTGTCTGGTCAGCTTCGGCGCGCAGt < 1:358463/150‑1 (MQ=255)
ttGCTCTCTGTTGCACTGGTCGTGGGTTTCCCCCCCAGGC‑GTTATCTGGCACCCTGCCCTATGGAGCCCGGACTTTCCTCCCCTCCGCCCGTCTCCCCCGAAGAGGACGACGACGAAGCGGCGACTGTCTGGTCAGCTTCGGCGCGCAGt < 1:54905/150‑1 (MQ=255)
tGCTCTCTGTTGCACTGGTCGTGGGTTTCCCCCCCAGGC‑GTTATCTGGCACCCTGCCCTATGGAGCCCGGACTTTCCTCCCCTCCGCCCGTCTCCCCCGAAGAGGACGACGACGAAGCGGCGACTGTCTGGTCAGCTTCGGCGCGCAGta < 5:70823/150‑1 (MQ=255)
gCTCTCTGTTGCACTGGTCGTGGGTTTCCCCCCCAGGC‑GTTATCTGGCACCCTGCCCTATGGAGCCCGGACTTTCCTCCCCTCCGCCCGTCTCCCCCGAAGAGGACGACGACGAAGCGGCGACTGTCTGGTCAGCTTCGGCGCGCAGtat > 8:1635054/1‑150 (MQ=255)
tctctGTTGCACTGGTCGTGGGTTTCCCCCCCAGGC‑GTTATCTGGCACCCTGCCCTATGGAGCCCGGACTTTCCTCCCCTCCGCCCGTCTCCCCCGAAGACGACGACGACGAAGCGGCGACTGTCTGGTCAGCTTCGGCGCGCAGtat > 8:572025/1‑148 (MQ=255)
ctctGTTGCACTGGTCGTGGGTTTCCCCCCCAGGC‑GTTATCTGGCACCCTGCCCTATGGAGCCCGGACTTTCCTCCCCTCCGCCCGTCTCCCCCGAAGAGGACGACGACGAAGCGGCGACTGTCTGGTCAGCTTCGGCGCGCAGTATag < 5:1446010/149‑1 (MQ=255)
ctGTTGCACTGGTCGTGGGTTTCCCCCCCAGGC‑GTTATCTGGCACCCTGCCCTATGGAGCCCGGACTTTCCTCCCCTCCGCCCGTCTCCCCCGAAGAGGACGACGACGAAGCGGCGACTGTCTGGTCAGCTTCGGCGCGCAGTATaga < 6:122828/148‑1 (MQ=255)
gTTGCACTGGGAGTGGGTTTCCCCCCCAGTC‑GTTATCTGGCAGCCTGCCCTATGGAGCCCGGACTTTGCTCCGCTCCGCCCGTCTCACCCGAAGAGGACGACGACGAAGCGGCGACTGTCTGGTCAGCTTCGGCTCGCAGTATAGAgg < 4:159390/148‑1 (MQ=255)
tGCACTGGTCGTGGGTGTCCCCCCCAGGC‑GTTATCTGGCACCCTGCCCTATGGAGCCCGGACTTTCCTCCCCTCCGCCCGTCTCCCCCGAAGAGGACGACGACGAAGCGGCGACTGTCTGGTCAGCTTCGGCGCGCAGTATAGAGGGttt < 5:885154/150‑1 (MQ=255)
cACTGGTCGTGGGTTTCCCCCCCAGGC‑GTTATCTGGCACCCTGCCCTATGGAGCCCGGACTTTCCTCCCCTCCGCCCGTCTCCCCCGAAGAGGACGACGACGAAGCGGCGCCTGTCTGGTCAGCTTCGGCGCGCAGTATAGAGGGTTTgcg > 7:715177/1‑151 (MQ=255)
cACTGGTCGTGGGGTTCCCCCCCAGGC‑GTTATCTGGCACCCTGCCCTATGGAGCCCGGACTTTCCTCCCCTCCGCCCGTCTCCCCCGAAGAGGACGACGACGAAGCGGCGACTGTCTGGTCAGCTTCGGCGCGCAGTATAGAGGGTTTgcg < 3:1348738/151‑1 (MQ=255)
ggTCGTGGGTTTCCCCCCCAGGC‑GTTATCTGGCACCCTGCCCTATGGAGCCCGGACTTTCCTCCCCTCCGCCCGTCTCCCCCGAAGAGGACGACGACGAAGCGGCGACTGTCTGGTCAGCTTCGGCGCGCAGTATAGAGGGTTTgcgcg < 1:1228222/149‑1 (MQ=255)
cgtgcgtgTCCCCCCCAGGC‑GTTATCTGCCACCCTGCCCTATGGAGCCCGGACTTTCCTCCCCTCCGCCCGTCTCCCCCGAAGAGGACGACGACGAAGCGGCGACTGTCTGGTCAGCTTCGGCGCGCAGTATAGAGGGTTTGCGCGCCCt < 6:256244/150‑1 (MQ=255)
cGTGGGTTTCCCCCCCAGGC‑GTTATCTGGCACCCTGCCCTATGGAGCCCGGACTTTCCTCCCCTCCGCCCGTCTCCCCCGAAGAGGACGACGCCGAAGCGGCGACGGTCTGGTCAGCTTCGGCGCGCAGGATAGAGGGTTTGCGCGGCCtt > 8:1202224/1‑151 (MQ=255)
gggTTTCCCCCCCAGGC‑GTTATCTGGCACCCTGCCCTATGGAGCCCGGACTTTCCTCCCCTCCGCCCGTCTCCCCCGAAGAGGACGACGACGAAGCGGCGACTGTCTGGTCAGCTTCGGCGCGCAGTATAGAGGGTTTGCGCGCCCTTGTc < 7:983675/151‑1 (MQ=255)
ggTTTCCCCCCCAGGC‑GTTATCTGGCACCCTGCCCTATGGAGCCCGGACTTTCCTCCCCTCCGCCCGTCTCCCCCGAAGAGGACGACGACGAAGCGGCGACTGTCTGGTCAGCTTCGGCGCGCAGTATAGAGGGTTTGCGCGCCCTTGTCa < 6:1552842/151‑1 (MQ=255)
ttCCCCCCCAGGC‑GTTATCTGGCACCCTGCCCTATGGAGCCCGGACTTTCCTCCCCTCCGCCCGTCTCCCCCGAAGAGGACGACGACGAAGCGGCGACTGTCTGGTCAGCTTCGGCGCGCACTATAGAGGGTTTGCGCGCCCTTGTCAccc > 1:1602194/1‑151 (MQ=255)
cccccccAGGC‑GTTATCTGGCACCCTGCCCTATGGAGCCCGGACTTTCCTCCCCTCCGCCCGTCTCCCCCGAAGAGGACGACGACGAAGCGGCGACTGTCTGGTCAGCTTCGGCGCGCAGTATAGAGGGTTTGCGCGCCCTTGTCAcccc < 4:1535775/150‑1 (MQ=255)
cccccccAGGC‑GTTATCTGGCACCCTGCCCTATGGAGCCCGGACTTTCCTCCCCTCCGCCCGTCTCCCCCGAAGAGGACGACGACGAAGCGGCGACTGTCTGGTCAGCTTCGGCGCGCAGTATAGAGGGTTTGCGCGCCCTTGTCAcccc < 3:1634807/150‑1 (MQ=255)
cccccAGGC‑GTTATCTGGCACCCTGCCCTATGGAGCCCGGACTTTCCTCCCCTCCGCCCGTCTCCCCCGAAGAGGACGACGACGAAGCGGCGACTGTCTGGTCAGCTTCGGCGCGCAGTATAGAGGGTTTGCGCGCCCTTGTCACCCcgcg > 2:1045118/1‑151 (MQ=255)
cccccAGGC‑GTTATCTGGCACCCTGCCCTATGGAGCCCGGACTTTCCTCCCCTCCGCCCGTCTCCCCCGAAGAGGACGACGACGAAGCGGCGACTGTCTGGTCAGCTTCGGCGCGCAGTATAGAGGGTTTGCGCGCCCTTGTCACCCcgcg > 7:1081871/1‑151 (MQ=255)
ccccAGGC‑GTTATCTGGCACCCTGCCCTATGGAGCCCGGACTTTCCTCCCCTCCGCCCGTCTCCCCCGAAGAGGACGACGACGAAGCGGCGACTGTCTGGTCAGCTTCGGCGCGCAGTATAGAGGGTTTGCGCGCCCTTGTCACCCCGCGt < 3:361464/151‑1 (MQ=255)
cccAGGC‑GTTATCTGGCACCCTGCCCTATGGAGCCCGGACTTTCCTCCCCTCCGCCCGTCTCCCCCGAAGAGGACGACGACGAAGCGGCGACTGTCTGGTCAGCTTCGGCGCGCAGTATAGAGGGTTTGCGCGCCCTTGTCACCCCGCGtt < 7:605112/151‑1 (MQ=255)
cccAGGC‑GTTATCTGGCACCCTGCCCTATGGAGCCCGGACTTTCCTCCCCTCCGCCCGTCTCCCCCGAAGAGGACGACGACGAAGCGGCGACTGTCTGGTCAGCTTCGGCGCGCAGTATAGAGGGTTTGCGCGCCCTTGTCACCCCGCGtt < 2:1567346/151‑1 (MQ=255)
cccAGGC‑GGTATCTGGCACCCTGCCCTATCGAGCCCGGACTTTCGTCCGCTCGGCCCGTCTCCCCCGAAGAGGACGACGACGAAGCGGCGACTGTCTGGTCAGCTTCGGCGCGCAGTATAGAGGGTTTGCGCGCCCTTGTCACCCCGCGtt < 7:179357/151‑1 (MQ=255)
ccAGGC‑GTTATCTGGCACCCTGCCCTATGGAGCCCGGACTTTCCTCCCCTCCGCCCGTCTCCCCCGAAGAGGACGACGACGAAGCGGCGACTGTCTGGTCAGCTTCGGCGCGCAGTATAGAGGGTTTGCGCGCCCTTGTCACCCCGCGTTg > 7:1545774/1‑151 (MQ=255)
cAGGC‑GTTATCTGGCACCCTGCCCTATGGAGCCCGGACTTTCCTCCCCTCCGCCCGTCTCCCCCGAAGAGGACGACGACGAAGCGGCGACTGTCTGGTCAGCTTCGGCGCGCAGTATAGAGGGTTTGCGCGCCCTTGTCACCCCGCGTTgc > 3:957086/1‑151 (MQ=255)
cAGGC‑GTTATCTGGCACCCTGCCCTATGGAGCCCGGACTTTCCTCCCCTCCGCCCGTCTCCCCCGAAGAGGACGACGACGAAGCGGCGACTGTCTGGTCAGCTTCGGCGCGCAGTATAGAGGGTTTGCGCGCCCTTGTCACCCCGCGTTgc < 1:633992/151‑1 (MQ=255)
ggC‑GTTATCTGGCACCCTGCCCTATGGAGCCCGGACTTTCCTCCCCTCCGCCCGTCTCCCCCGAAGAGGACGACGACGAAGCGGCGACTGTCTGGTCAGCTTCGGCGCGCAGTATAGAGGGTTTGCGCGCCCTTGTCACCCCGCGTTgcgc < 2:852549/151‑1 (MQ=255)
c‑GTTATCTGGCACCCTGCCCTATGGAGCCCGGACTTTCCTCCCCTCCGCCCGTCTCCCCCGAAGAGGACGACGACGAAGCGGCGACTGTCTGGTCAGCTTCGGCGCGCAGTATAGAGGGTTTGCGCGCCCTTGTCACCCCGCGTTGCGCa > 6:220662/1‑150 (MQ=255)
c‑GTTATCTGGAACCCTGCCCTATGGAGACCCGACTTTCCTCCCCTCCGCCCGTCTCCCCCGAAGAGGACGACCACGAAGCGGCCACTGTCTGGTCAGCTTCGGCGCGCAGAATAGAGGGTTTGCGCGCCCTTGTCACCCCGCGTTGCCCa > 6:641732/1‑150 (MQ=255)
|
CCGGGTGGAGTTTACCGTGCCACGGACTGTTACCAGCCGCGCGGTGCGCTCTTACCGCACCCTTTCACCCTTACCTGATCCCGCTTGCGCGGGCCATCGGCGGTTTGCTCTCTGTTGCACTGGTCGTGGGTTTCCCCCCCAGGC‑GTTACCTGGCACCCTGCCCTATGGAGCCCGGACTTTCCTCCCCTCCGCCCGTCTCCCCCGAAGAGGACGACGACGAAGCGGCGACTGTCTGGTCAGCTTCGGCGCGCAGTATAGAGGGTTTGCGCGCCCTTGTCACCCCGCGTTGCGCATTC > NC_000913/3270349‑3270644
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
N/A
