Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A4 F84 I10 R1
|
267 |
426.1 |
13521957 |
97.0% |
13116298 |
150.5 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
NC_000913 |
4,407,045 |
C→T |
A131V (GCT→GTT) |
rnr → |
exoribonuclease R, RNase R |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | NC_000913 | 4,407,045 | 0 | C | T | 96.5%
| 1411.9
/ 26.3
| 428 | A131V (GCT→GTT) | rnr | exoribonuclease R, RNase R |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (6/9); new base T (213/198); total (219/209) |
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 4.36e-01 |
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 5.07e-01 |
Only 100 of 430 total aligned reads displayed.
GCCTCGACCTGGTGAAAGGTACCGTTATTGGCCACCGTGATGGCTACGGCTTTCTGCGGGTTGAAGGGCGTAAAGATGATTTGTATCTCTCCAGCGAGCAGATGAAAACCTGCATTCATGGCGATCAGGTGCTGGCTCAGCCGCTGGGTGCTGACCGTAAAGGTCGTCGTGAAGCGCGTATTGTCCGCGTACTGGTGCCAAAAACCAGCCAGATTGTTGGTCGCTACTTTACCGAAGCGGGCGTCGGCTTTGTGGTTCCTGACGACAGCCGTCTGAGCTTCGATATCTTAATCCCGCC > NC_000913/4406895‑4407192
|
cGACCTGGTGAAAGGTACCGTTATTGGCCACCGTGATGTCTACGGCTTGCTGCGGGTTGAAGGGCGTAAAGTTGATTTGTATCTCTCCAGCGAGCAGATGAAAACATGCATTCATGGCGATCAGGTGCTGGCTCAGCCGCTGGGTGTTGAc < 4:1325966/151‑1 (MQ=255)
cGACCTGGTGAAAGGTACCGTTATTGGCCACCGTGATGGCTACGGCTTTCTGCGGGTTGAAGGGCGTAAAGATGATTTGTATCTCTCCAGCGAGCAGATGAAAACCTGCATTCATGGCGATCAGGTGCTGGCTCAGCCGCTGGGTGTTGa < 2:478781/150‑1 (MQ=255)
gACCTGGTGAAAGGTACCGTTATTGGCCACCGTGATGGCTACGGCTTTCTGCGGGTTGAAGGGCGTAAAGATGATTTGTATCTCTCCAGCGAGCAGATGAAAACCTGCATTCATGGCGATCAGGTGCTGGCTCAGCCGCTGGGTGTTGAcc > 5:939466/1‑151 (MQ=255)
aCCTGTTGAAAGGTAGCGTTATTGGCCACGGTGATGGCTACGGCTTTCTGCGGGTTGAAGGGCGGAAAGATGATTTGTATCTCTCCAGCGAGCAGATGTAAACCTGCATTCATGGCGATCAGGTGCTGGCTCAGCCGCTGGGTGTTGACCg < 3:970668/151‑1 (MQ=255)
cTGGTGAAACGTACCGTTATTGGCCACCGTGATGGCTACGGCTTTCTGCGGGTTGAAGGGCGTAAAGATGATTTGTATCTCTCCAGCGAGCAGATGAAAACCTGCATTCATGGCGATCAGGTGCTGGCTCAGCCGCTGGGTGTTGACCGt > 6:691134/1‑150 (MQ=255)
gTGAAAGGTACCGTTATTGGCCACCGTGATGGCTACGGCTTTCTGCGGGTTGAAGGGCGTAAAGATGATTTGTATCTCTCCAGCGAGCAGATGAAAACCTGCATTCATGGCGATCAGGTGCTGGCTCAGCCGCTGGGTGTTGACCGTAAAg < 6:1303517/151‑1 (MQ=255)
tGAAAGGTACCGTTATTGGCCACCGTGATGGCTACGGCTTTCTGCGGGTTGAAGGGCGTAAAGATGATTTGTATCTCTCCAGCGAGCAGATGAAAACCTGCATTCATGGCGATCAGGTGCTGGCTCAGCCGCTGGGTGTTGACCGTAAAgg > 1:1460324/1‑151 (MQ=255)
gAAAGGTACCGTTATTGGCCACCGTGATGGCTACGGCTTTCTGCGGGTTGAAGGGCGTAAAGATGATTTGTATCTCTCCAGCGAGCAGATGAAAACCTGCATTCATGGCGATCAGGTGCTGGCTCAGCCGCTGGGTGTTGACCGTAAAGgt < 5:1541298/151‑1 (MQ=255)
aaaGGTACCGTTATTGGCCACCGTGATGGCTACGGCTTTCTGCGGGTTGAAGGGCGTAAAGATGATTTGTATCTCTCCAGCGAGCAGATGAAAACCTGCATTCATGGCGATCAGGTGCTGGCTCAGCCGCTGGGTGTTGACCGTAAAGgtc < 8:1606228/151‑1 (MQ=255)
aaaGGTACCGTTATTGGCCACCGTGATGGCTACGGCTTTCTGCGGGTTGAAGGGCGTAAAGATGATTTGTATCTCTCCAGCGAGCAGATGAAAACCTGCATTCATGGCGATCAGGTGCTGGCTCAGCCGCTGCGTGTTGACCGTAAAGgtc > 8:1213274/1‑151 (MQ=255)
aGGTACCGTTATTGGCCACCGTGATGGCTACGGCTTTCTGCGGGTTGAAGGGCGTAAAGATGATTTGTATCTCTCCAGCGAGCAGATGAAAACCTGCATTCATGGCGATCAGGTGCTGGCTCAGCCGCTGGGTGCTGACCGTAAAGgtcgt < 5:30562/151‑1 (MQ=255)
ggTACCGTTATTGGCCACCGTGATGGCTACGGCTTTCTGCGGGTTGAAGGGCGTAAAGATGATTTGTATCTCTCCAGCGAGCAGATGAAAACCTGCATTCATGGCGATCAGGTGCTGGCTCAGCCGCTGGGTGTTGACCGTAAAGgtcgtc > 6:1374650/1‑151 (MQ=255)
ggTACCGTTATTGGCCACCGTGATGGCTACGGCTTTCTGCGGGTTGAAGGGCGTAAAGATGATTTGTATCTCTCCAGCGAGCAGATGAAAACCTGCATTCATGGCGATCAGGTGCTGGCTCAGCCGCTGGGTGTTGACCGTAAAGgtcgtc < 5:857952/151‑1 (MQ=255)
gTACCGTTATTGGCCACCGTGATGGCTACGGCTTTCTGCGGGTTGAAGGGCGTAAAGATGATTTGTATCTCTCCAGCGAGCAGATGAAAACCTGCATTCATGGCGATCAGGTGCTGGCTCAGCCGCTGGGTGTTGACCGTAAAGGtcgtcg < 5:1176166/151‑1 (MQ=255)
tACCGTTATTGGCCACCGTGATGGCTACGGCTTTCTGCGGGTTGAAGGGCGTAAAGATGATTTGTATCTCTCCAGCGAGCAGATGAAAACCTGCATTCATGGCGATCAGGTGCTGGCTCAGCCGCTGGGTGTTGACCGTAAAGGTcgtcgt > 3:166592/1‑151 (MQ=255)
aCCGTTATTGGCCACCGTGATGGCTACGGCTTTCTGCGGGTTGAAGGGCGTAAAGATGATTTGTATCTCTCCAGCGAGCAGATGAAAACCTGCATTCATGGCGATCAGGTGCTGGCTCAGCCGCTGGGTGTTGACCGTAAAGGTCGTCGTg < 3:1168884/151‑1 (MQ=255)
cGTTATTGGCCACCGTGATGGCTACGGCTTTCTGCGGGTTGAAGGGCGTAAAGATGATTTGTATCTCTCCAGCGAGCAGATGAAAACCTGCATTCATGGCGATCAGGTGCTGGCTCAGCCGCTGGGTGTTGACCGTAAAGGTCGTCGTGa > 5:167397/1‑150 (MQ=255)
aTTGGCCACCGTGATGGCTACGGCTTTCTGCGGGTTGAAGGGCGTAAAGATGATTTGTATCTCTCCAGCGAGCAGATGAAAACCTGCATTCATGGGGATCAGGTGCTGGCTCAGCCGCTGGGTGTTGACCGTAAAGGTCGTCGTGAAgcgc > 2:1621603/1‑151 (MQ=255)
tGGCCACCGTGATGGCTACGGCTTTCTGCGGGTTGAAGGGCGTAAAGATGATTTGTATCTCTCCAGCGAGCAGATGAAAACCTGCATTCATGGCGATCAGGTGCTGGCTCAGCCGCTGGGTGTTGACCGTAAAGGTCGTCGTGAAGCGCGt > 1:1356249/1‑151 (MQ=255)
ccACCGTGATGGCTACGGCTTTCTGCGGGTTGAAGGGCGTAAAGATGATTTGTATCTCTCCAGCGAGCAGATGAAAACCTGCATTCATGGCGATCAGGTGCTGGCTCAGCCGCTGGGTGTTGACCGTAAAGGTCGTCGTGAAGCGCGTAtt > 4:485534/1‑151 (MQ=255)
cACCGTGATGGCTACGGGTTTCTGCGGGTTGAAGGGCGTAAAGATGATTTGTATATCTCCAGCGAGCAGATGAAAACCTGCATTCATGGCGATCAGGTGCTGGCTCAGCCGCTGGGTGTTGACCGTAAAGGTCGTCGTGAAGCGCGGAttt > 2:716771/1‑150 (MQ=255)
cACCGTGATGGCTACGGCTTTCTGCGGGTTGAAGGGCGTAAAGATGATTTGTATCTCTCCAGCGAGCAGATGAAAACCTGCATTCATGGCGATCAGGTGCTGGCTCAGCCGCTGGGTGTTGACCGTAAAGGTCGTCGTGAAGCGCGTATTg < 3:1508506/151‑1 (MQ=255)
gttGGCTACGGCTTTCTGCGGGTTGAAGGGCGTAATGATGTTTGGTATCTGTCCAGTGAGCAGCTGTAAACCTGCATTCTTGGCGAGCAGGTGCTGGCGCAGCCGCTGGGGGTGGTCCGTCAAGGTCGTCGTGATGCGCGTTTTGTCcgcg < 4:239320/149‑1 (MQ=255)
ggCTACGGCTTTCTGCGGGTTGAAGGGCGTAAAGATGATTTGTATCTCTCCAGCGAGCAGATGAAAACCTGCATTCATGGCGATCAGGTGCTGGCTCAGCCGCTGGGTGTTGACCGTAAAGGTCGTCGTGAAGCGCGTATTGTCCGCGTAc < 3:109891/151‑1 (MQ=255)
cGGCTTTCTGCGGGTTGAAGGGCGTAAAGATGATTTGTATCTCTCCAGCGAGCAGATGAAAACCTGCATTCATGGCGATCAGGTGCTGGCTCAGCCGCTGGGTGTTGACCGTAAAGGTCGTCGTGAAGCGCGTATTGTCCGCGTACTGGTg < 3:799450/151‑1 (MQ=255)
ggCTTTCTGCGGGTTGAAGGGCGTAAAGATGATTTGTATCTCTCCAGCGAGCAGATGAAAACCTGCATTCATGGCGATCAGGTGCTGGCTCAGCCGCTGGGTGTTGACCGTAAAGGTCGTCGTGAAGCGCGTATTGTCCGCGTACTGGTGc > 5:1416204/1‑151 (MQ=255)
cTTTCTGCGGGTTGAAGGGCGTAAAGATGATTTGTATCTCTCCAGCGAGCAGATGAAAACCTGCATTCATGGCGATCAGGTGCTGGCTCAGCCGCTGGGTGTTGACCGTAAAGGTCGTCGTGAAGCGCGTATTGTCCGCGTACTGGTGcc > 5:617370/1‑150 (MQ=255)
cTTTCTGCGGGTTGAAGGGCGTAAAGATGATTTGTATCTCTCCAGCGAGCAGATGAAAACCTGCATTCATGGCGATCAGGTGCTGGCTCAGCCGCTGGGTGTTGACCGTAAAGGTCGTCGTGAAGCGCGTATTGTCCGCGTACTGGTGcc > 7:371098/1‑150 (MQ=255)
ttCTGCGGGTTGAAGGGCGTAAAGATGATTTGTATCTCTCCAGCGAGCAGATGAAAACCTGCATTCATGGCGATCAGGTGCTGGCTCAGCCGCTGGGTGTTGACCGTAAAGGTCGTCGTGAAGCGCGTATTGTCCGCGTACTGGTGCCaa > 7:835849/1‑150 (MQ=255)
cTGCGGGTTGAAGGGCGTAAAGATGATTTGTATCTCTCCAGCGAGCAGATGAAAACCTGCATTCATGGCGATCAGGTGCTGGCTCAGCCGCTGGGTGTTGACCGTAAAGGTCGTCGTGAAGCGCGTATTGTCCGCGTACTGGTGCCaaaa > 6:1119337/1‑150 (MQ=255)
gggTTGAAGGGCGTAAAGATGATTTGTATCTCTCCAGCGAGCAGATGAAAACCTGCATTCATGGCGATCAGGTGCTGGCTCAGCCGCTGGGTGTTGACCGTAAAGGTCGTCGTGAAGCGCGTATTGTCCGCGTACTGGTGCCAAAAAcc > 2:1315382/1‑149 (MQ=255)
gggTTGAAGGGCGTAAAGATGATTTGTATCTCTCCAGCGAGCAGATGAAAACCTGCATTCATGGCGATCAGGTGCTGGCTCAGCCGCTGGGTGTTGACCGTAAAGGTCGTCGTGAAGCGCGTATTGTCCGCGTACTGGTGCCAAAAAcc > 8:422171/1‑149 (MQ=255)
gAATGGCGTAAAGATGATTTGTATCTCTCCAGCGAGCAGATGAAAACCTGCATTCATGGCGATCAGGTGCTGGCTCAGCCGCTGGGTGTTGACCGTAAAGGTCGTCGTGAAGCGCGTATTGTCCGCGTACTGGTGCCAAAAACCAGCCAGa < 1:1042087/151‑1 (MQ=255)
gAAGGGCGTAAAGATGATTTGTATCTCTCCAGCGAGCAGATGAAAACCTGCATTCATGGCGATCAGGTGCTGGCTCAGCCGCTGGGTGTTGACCGTAAAGGTCGTCGTGAAGCGCGTATTGTCCGCGTACTGGTGCCAAAAAccagccag < 1:1674411/150‑1 (MQ=255)
gAAGGGCGTAAAGATGATTTGTATCTCTCCAGCGAGCAGATGAAAACCTGCATTCATGGCGATCAGGTGCTGGCTCAGCCGCTGGGTGTTGACCGTAAAGGTCGTCGTGAAGCGCGTATTGTCCGCGTACTGGTGCCAAAAAccagcc > 2:587428/1‑148 (MQ=255)
gAAGGGCGTAAAGATGATTTGTATCTCTCCAGCGAGCAGATGAAAACCTGCATTCATGGCGATCAGGTGCTGGCTCAGCCGCTGGGTGTTGACCGTAAAGGTCGTCGTGAAGCGCGTATTGTCCGCGTACTGGTGCCAAAAACCAGCCAGa < 7:164643/151‑1 (MQ=255)
aaGGGCGTAAAGATGATTTGTATCTCTCCAGCGAGCAGATGAAAACCTGCATTCATGGCGATCAGGTGCTGGCTCAGCCGCTGGGTGTTGACCGTAAAGGTCGTCGTGAAGCGCGTATTGTCCGCGTACTGGTGCCAAAAAccagcc > 1:582880/1‑147 (MQ=255)
aGGGCGTAAAGATGATTTGTATCTCTCCAGCGAGCAGATGAAAACCTGCATTCATGGCGATCAGGTGCTGGCTCAGCCGCTGGGTGTTGACCGTAAAGGTCGTCGTGAAGCGCGTATTGTCCGCGTACTGGTGCCAAAAACCAGCCAGAtt < 3:832598/151‑1 (MQ=255)
gggCGTAAAGATGATTTGTATCTCTCCAGCGAGCAGATGAAAACCTGCATTCATGGCGATCAGGTGCTGGCTCAGCCGCTGGGTGTTGACCGTAAAGGTCGTCGTGAAGCGCGTATTGTCCGCGTACTGGTGCCAAAAACCAGCCAGAttg > 2:1213223/1‑151 (MQ=255)
cGTAAAGATGATTTGTATCTCTCCAGCGAGCAGATGAAAACCTGCATTCATGGCGATCAGGTGCTGGCTCAGCCGCTGGGTGTTGACCGTAAAGGTCGTCGTGAAGCGCGTATTGTCCGCGTACTGGTGCCAAAAACCAGCCAGAttgttg > 3:1436180/1‑151 (MQ=255)
aaaGATGATTTGTATCTCTCGAGCGAGCAGATGAAAACCTGCATTCATGGCGATCAGGTGCTGGCTCAGCCGCTGGGTGTTGACCGTAAAGGTCGTCGTGAAGCGCGTATTGTCCGCGTACTGGTGCCAAAAACCAGCCAGATTGTTGGt < 1:699951/150‑1 (MQ=255)
aaGATGATTTGTATCTCTCCAGCGAGCAGATGAAAACCTGCATTCATGGCGATCAGGTGCTGGCTCAGCCGCTGGGTGTTGACCGTAAAGGTCGTCGTGAAGCGCGTATTGTCCGCGTACTGGTGCCAAAAACCAGCCAGATTGTTGGTCg > 7:1039853/1‑151 (MQ=255)
aaGATGATTTGTATCTCTCCAGCGAGCAGATGAAAACCTGCATTCATGGCGATCAGGTGCTGGCTCAGCCGCTGGGTGTTGACCGTAAAGGTCGTCGTGAAGCGCGTATTGTCCGCGTACTGGTGCCAAAAACCAGCCAGATTGTTGGTCg > 3:472099/1‑151 (MQ=255)
gatgatTTGTATCTCTCCAGCGAGCAGATGAAAACCTGCATTCATGGCGATCAGGTGCTGGCTCAGCCGCTGGGTGTTGACCGTAAAGGTCGTCGTGAAGCGCGTATTGTCCGCGTACTGGTGCCAAAAACCAGCCAGATTGTTGGTCGCt > 2:914141/1‑151 (MQ=255)
atgatTTGTATCTCTCCAGCGAGCAGATGAAAACCTGCATTCATGGCGATCAGGTGCTGGCTCAGCCGCTGGGTGTTGACCGTAAAGGTCGTCGTGAAGCGCGTATTGTCCGCGTACTGGTGCCAAAAACCAGCCAGATTGTTGGTCGCTa < 4:762436/151‑1 (MQ=255)
atgatTTGTATCTCTCCAGCGAGCAGATGAAAACCTGCATTCATGGCGATCAGGTGCTGGCTCAGCCGCTGGGTGTTGACCGTAAAGGTCGTCGTGAAGCGCGTATTGTCCGCGTACTGGTGCCAAAAACCAGCCAGATTGTTGGTCGCTa < 3:505231/151‑1 (MQ=255)
atTTGTATCTCTCCAGCGAGCAGATGAAAACCTGCATTCATGGCGATCAGGTGCTGGCTCAGCCGCTGGGTGTTGACCGTAAAGGTCGTCGTGAAGCGCGTATTGTCCGCGTACTGGTGCCAAAAACCAGCCAGATTGTTGGTCGCTACtt > 2:378607/1‑151 (MQ=255)
atTTGTATCTCTCCAGCGAGCAGATGAAAACCTGCATTCATGGCGATCAGGTGCTGGCTCAGCCGCTGGGTGTTGACCGTAAAGGTCGTCGTGAAGCGCGTATTGTCCGCGTACTGGTGCCAAAAACCAGCCAGATTGTTGGTCGCTACt < 6:417899/150‑1 (MQ=255)
ttGTATCTCTCCAGCGAGCAGATGAAAACCTGCATTCATGGCGATCAGGTGCTGGCTCAGCCGCTGGGTGTTGACCGTAAAGGTCGTCGTGAAGCGCGTATTGTCCGCGTACTGGTGCCAAAAACCAGCCAGATTGTTGGTCGCTACttt < 4:906428/150‑1 (MQ=255)
ttGTATCTCTCCAGCGAGCAGATGAAAACCTGCATTCATGGCGATCAGGTGCTGGCTCAGCCGCTGGGTGTTGACCGTAAAGGTCGTCGTGAAGCGCGTATTGTCCGCGTACTGGTGCCAAAAACCAGCCAGATTGTTGGTCGCTACttt < 8:1634248/150‑1 (MQ=255)
tGTATCTCTCCAGCGAGCAGATGAAAACCTGCATTCATGGCGATCAGGTGCTGGCTCAGCCGCTGGGTGTTGACCGTAAAGGTCGTCGTGAAGCGCGTATTGTCCGCGTACTGGTGCCAAAAACCAGCCAGATTGTTGGTCGCTACTTTAc > 4:1448368/1‑151 (MQ=255)
tATCTCTCCAGCGAGCAGATGAAAACCTGCATTCATGGCGATCAGGTGCTGGCTCAGCCGCTGGGTGTTGAGCGTAAAGGTCGTCGTGAAGCGCGTATTGTCCGCGTACTGGTGCCAAAAACCAGCCAGATTGTTGGTCGCTACTTTAccc > 5:431243/1‑150 (MQ=255)
tATCTCTCCAGCGAGCAGATGAAAACCTGCATTCATGGCGATCAGGTGCTGGCTCAGCCGCTGGGTGTTGACCGTAAAGGTCGTCGTGAAGCGCGTATTGTCCGCGTACTGGTGCCAAAAACCAGCCAGATTGTTGGTCGCTACTTTACCg > 8:874147/1‑151 (MQ=255)
aTCTCTCCAGCGAGCAGATGAAAACCTGCATTCATGGCGATCAGGTGCTGGCTCAGCCGCTGGGTGTTGACCGTAAAGGTCGTCGTGAAGCGCGTATTGTCCGCGTACTGGTGCCAAAAACCAGGCAGATTGTTGGTCGCTACTTTACCg < 8:249478/150‑1 (MQ=255)
aTCTCTCCAGCGAGCAGATGAAAACCTGCATTCATGGCGATCAGGTGCTGGCTCAGCCGCTGGGTGTTGACCGTAAAGGTCGTCGTGAAGCGCGTATTGTCCGCGTACTGGTGCCAAAAACCAGCCAGATTGTTGGTCGCTACTTTACCg > 8:1319671/1‑150 (MQ=255)
aTCTCTCCAGCGAGCAGATGAAAACCTGCATTCATGGCGATCAGGTGCTGGCTCAGCCGCTGGGTGTTGACCGTAAAGGTCGTCGTGAAGCGCGTATTGTCCGCGTACTGGTGCCAAAAACCAGCCAGATTGTTGGTCGCTACTTTACCg < 6:1667774/150‑1 (MQ=255)
aTCTCTCCAGCGAGCAGATGAAAACCTGCATTCATGGCGATCAGGTGCTGGCTCAGCCGCTGGGTGTTGACCGTAAAGGTCGTCGTGAAGCGCGTATTGTCCGCGTACTGGTGCCAAAAACCAGCCAGATTGTTGGTCGCTACTTTACCg > 1:1211189/1‑150 (MQ=255)
tctcCAGCGAGCAGATGAAAACCTGCATTCATGGCGATCAGGTGCTGGCTCAGCCGCTGGGTGTTGACCGTAAAGGTCGTCGTGAAGCGCGTATTGTCCGCGTACTGGTGCCAAAAACCAGCGAGATTGTTGGTCGCTACTTTACCGAAGc > 4:1646880/1‑151 (MQ=255)
ctcCAGCGAGCAGATGAAAACCTGCATTCATGGCGATCAGGTGCTGGCTCAGCCGCTGGGTGTTGACCGTAAAGGTCGTCGTGAAGCGCGTATTGTCCGCGTACTGGTGCCAAAAACCAGCCAGATTGTTGGTCGCTACTTTACCGa < 4:999003/147‑1 (MQ=255)
tcCAGCGAGCAGATGAAAACCTGCATTCATGGCGATCAGGTGCTGGCTCAGCCGCTGGGTGTTGACCGTAAAGGTCGTCGTGAAGCGCGTATTGTCCGCGTACTGGTGCCAAAAACCAGCCAGATTGTTGGTCGCTACTTTACCGAAGCgg > 4:1150963/1‑151 (MQ=255)
ccAGCGAGCAGATGAAAACCTGCATTCATGGCGATCAGGTGCTGGCTCAGCCGCTGGGTGTTGACCGTAAAGGTCGTCGTGAAGCGCGTATTGTCCGCGTACTGGTGCCAAAAACCAGCCAGATTGTTGGTCGCTACTTTACCGAAGCgg < 3:682242/150‑1 (MQ=255)
ccAGCGAGCAGATGAAAACCTGCATTCATGGCGATCAGGTGCTGGCTCAGCCGCTGGGTGTTGACCGTAAAGGTCGTCGTGAAGCGCGTATTGTCCGCGTACTGGTGCCAAAAACCAGCCAGATTGTTGGTCGCTACTTTACCGAAGCg < 7:975355/149‑1 (MQ=255)
ccAGCGAGCAGATGAAAACCTGCATTCATGGCGATCAGGTGCTGGCTCAGCCGCTGGGTGTTGACCGTAAAGGTCGTCGTGAAGCGCGTATTGTCCGCGTACTGGTGCCAAAAACCAGCCAGATTGTTGGTCGCTACTTTACCGAAGCg < 1:1526671/149‑1 (MQ=255)
ccAGCGAGCAGATGAAAACCTGCATTCATGGCGATCAGGTGCTGGCTCAGCCGCTGGGTGTTGACCGTAAAGGTCGTCGTGAAGCGCGTATTGTCAGCGAACTGGTGCCAAAAACCAGCCAGATTGTTGGTCGCTACTTTACCGAAGCggg > 8:1577510/1‑151 (MQ=255)
cAGCGAGCAGATGAAAACCTGCATTCATGGCGATCAGGTGCTGGCTCAGCCGCTGGGTGTTGACCGTAAAGGTCGTCGTGAAGCGCGTATTGTCCGCGTACTGGTGCCAAAAACCAGCCAGATTGTTGGTCGCTACTTTACCGAAGCGGGc > 8:811941/1‑151 (MQ=255)
aGCGAGCAGATGAAAACCTGCATTCATGGCGATCAGGTGCTGGCTCAGCCGCTGGGTGTTGACCGTAAAGGTCGTCGTGAAGCGCGTATTGTCCGCGTACTGGTGCCAAAAACCAGCCAGATTGTTGGTCGCTACTTTACCGAAGCGGGCg > 5:529646/1‑151 (MQ=255)
gCGAGCAGATGAAAACCTGCATTCATGGCGATCAGGTGCTGGCTCAGCCGCTGGGTGTTGTCCGTAAAGGTCGTCGTGAAGCGCGTATTGTCCGCGTACTGGTGCCAAAAACCAGCTAGATTGTTGGTCGCTACTTTACCGAAGCGGGCGt < 3:261407/151‑1 (MQ=255)
cGAGCAGATGAAAACCTGCATTCATGGCGATCAGGTGCTGGCTCAGCCGCTGGGTGCTGACCGTAAAGGTCGTCGTGAAGCGCGTATTGTCCGCGTACTGGTGCCAAAAACCAGCCAGATTGTTGGTCGCTACTTTACCGAAGCGGGCGTc < 8:688359/151‑1 (MQ=255)
gAGCAGATGAAAACCTGCATTCATGGCGATCAGGTGCTGGCTCAGCCGCTGGGTGTTGACCGTAAAGGTCGTCGTGAAGCGCGTATTGTCCGCGTACTGGTGCCAAAAACCAGCCAGATTGTTGGTCGCTACTTTACCGAAGCGGGCGTCg > 6:453849/1‑151 (MQ=255)
aGATGAAAACCTGCATTCATGGCGATCAGGTGCTGGCTCAGCCGCTGGGTGTTGACCGTAAAGGTCGTCGTGAAGCGCGTATTGTCCGCGTACTGGTGCCAAAAACCAGCCAGATTGTTGGTCGCTACTTTACCGAAGCGGGCGTCggggt > 6:917158/1‑148 (MQ=255)
aTGAAAACCTGCATTCATGGCGATCAGGTGCTGGCTCAGCCGCTGGGTGTTGACCGTAAAGGTCGTCGTGAAGCGCGTATTGTCCGCGTACTGGTGCCAAAAACCAGCCAGATTGTTGGTCGCTACTTTACCGAAGCGGGCGTCGGCTTtg < 2:1060379/151‑1 (MQ=255)
aTGAAAACCTGCATTCATGGCGATCAGGTGCTGGCTCAGCCGCTGGGTGTTGACCGTAAAGGTCGTCGTGAAGCGCGTATTGTCCGCGTACTGGTGCCAAAAACCAGCCAGATTGTTGGTCGCTACTTTACCGAAGCGGGCGTCGGCTTtg > 5:702144/1‑151 (MQ=255)
gAAAACCTGCATTCATGGCGATCAGGTGCTGGCTCAGCCGCTGGGTGTTGACCGTAAAGGTCGTCGTGAAGCGCGTATTGTCCGCGTACTGGTGCCAAAAACCAGCCAGATTGTTGGTCGCTACTTTACCGAAGCGGGCGTCGGCTTtgtg > 4:677134/1‑151 (MQ=255)
aaaCCTGCATTCATGGCGATCAGGTGCTGGCTCAGCCGCTGGGTGTTGACCGTAAAGGTCGTCGTGAAGCGCGTATTGTCCGCGTACTGGTGCCAAAAACCAGCCAGATTGTTGGTCGCTACTTTACCGAAGCGGGCGTCGGCTTTGTGGt < 6:83319/151‑1 (MQ=255)
cccTGCAGTCATGGCGATCAGGTGCTGGCGCAGCCGCTGGGTGTTGACCGTAAAGGGCGTCGTGAAGCGCGTATTGTCCGCGTACTGGTGCCAAAAACCAGCCAGATTGGTGGTCGCTACTTTACCGAAGCGGGCGGCGGCTTTGTGGTTc < 7:1205949/150‑1 (MQ=255)
aCCTGCATTCATGGCGATCAGGTGCTGGCTCAGCCGCTGGGTGTTGACCGTAAAGGTCGTCGTGAAGCGCGTATTGTCCGCGTACTGGTGCCAAAAACCAGCCAGATTGTTGGTCGCTACTTTACCGAAGCGGGCGTCGGCTTTGTGGTTc > 8:1067157/1‑151 (MQ=255)
aCCTGCATTCATGGCGATCAGGTGCTGGCTCAGCCGCTGGGTGTTGACCGTAAAGGTCGTCGTGAAGCGCGTATTGTCCGCGTACTGGTGCCAAAAACCAGCCAGATTGTTGGTCGCTACTTTACCGAAGCGGGCGTCGGCTTTGTGGTTc > 2:1504443/1‑151 (MQ=255)
aCCTGCATTCATGGCGATCAGGTGCTGGCTCAGCCGCTGGGTGTTGACCGTAAAGGTCGTCGTGAAGCGCGTATTGTCCGCGTACTGGTGCCAAAAACCAGCCAGATTGTTGGTCGCTACTTTACCGAAGCGGGCGTCGGCTTTGTGGTTc > 7:1086359/1‑151 (MQ=255)
aCCTGCATTCATGGCGATCAGGTGCTGGCTCAGCCGCTGGGTGCTGACCGTAAAGGTCGTCGTGAAGCGCGTATTGTCCGCGTACTGGTGCCAAAAACCAGCCAGATTGTTGGTCGCTACTTTACCGAAGCGGGCGTCGGCTTTGTGGTTc < 5:778067/151‑1 (MQ=255)
tGCATTCATGGCGATCAGGTGCTGGCTAAGCCGCTGGGTGTTGACCGTAAAGGTCGTCGTGAAGCGCGTATTGTCCGCGTACTGGTGCC‑AAAACCAGCCAGATTGTTGGTCGCTACTTTACCGAAGCGGGCGTCGGCTTTGTGGTTCCTg > 5:686133/1‑150 (MQ=255)
cATGGCGATCAGGTGCTGGCTCAGCCGCTGGGTGCTGACCGTAAAGGTCGTCGTGAAGCGCGTATTGTCCGCGTACTGGTGCCAAAAACCAGCCAGATTGTTGGTCGCTACTTTACCGAAGCGGGCGTCGGCTTTGTGGTTCCTGACGACa < 1:844205/151‑1 (MQ=255)
gCGATCAGGTGCTGGCTCAGCCGCTGGGTGTTGACCGTAAAGGTCGTCGTGAAGCGCGTATTGTCCGCGTACTGGTGCCAAAAACCAGCCAGATTGTTGGTCGCTACTTTACCGAAGCGGGCGTCGGCTTTGTGGTGCCTGACGACAGCCg < 1:960156/151‑1 (MQ=255)
cGATCAGGTGCTGGCTCAGCCGCTGGGTGTTGACCGTAAAGGTCGTCGTGAAGCGCGTATTGTCCGCGTACTGGTGCCAAAAACCAGCCAGATTGTTGGTCGCTACTTTACCGAAGCGGGCGTCGGCTTTGTGGTTCCTGACGACAGCCGt < 5:135479/151‑1 (MQ=255)
cGATCAGGTGCTGGCTCAGCCGCTGGGTGTTGACCGTAAAGGTCGTCGTGAAGCGCGTATTGTCCGCGTACTGGTGCCAAAAACCAGCCAGATTGTTGGTCGCTACTTTACCGAAGCGGGCGTCGGCTTTGTGGTTCCTGACGACAGCCGt < 5:808325/151‑1 (MQ=255)
gATCAGGTGCTGGCTCAGCCGCTGGGTGTTGACCGTAAAGGTCGTCGTGAAGCGCGTATTGTCCGCGTACTGGTGCCAAAAACCAGCCAGATTGTTGGTCGCTACTTTACCGAAGCGGGCGTCGGCTTTGTGGTTCCTGACGACAGCCGTc > 3:1550561/1‑151 (MQ=255)
gATCAGGTGCTGGCTCAGCCGCTGGGTGTTGACCGTAAAGGTCGTCGTGAAGCGCGTATTGTCCGCGTACTGGTGCCAAAAACCAGCCAGATTGTTGGTCGCTACTTTACCGAAGCGGGCGTCGGCTTTGTGGTTCATGACGACAGCCGTc < 7:1461965/151‑1 (MQ=255)
cAGGTGCTGGCTCAGCCGCTGGGTGTTGACCGTAAAGGTCGTCGTGAAGCGCGTATTGTCCGCGTACTGGTGCCAAAAACCAGCCAGATTGTTGGTCGCTACTTTACCGAAGCGGGCGTCGGCTTTGTGGTTCCTGACGACAGCCGTCTg > 1:1106173/1‑150 (MQ=255)
cAGGTGCTGGCTCAGCCGCTGGGTGTTGACCGTAAAGGTCGTCGTGAAGCGCGTATTGTCCGCGTACTGGTGCCAAAAACCAGCCAGATTGTTGGTCGCTACTTTACCGAAGCGGGCGTCGGCTTTGTGGTTCCTGACGACAGCCGTCTg > 7:1341694/1‑150 (MQ=255)
aGGTGCTGGCTCAGGCGCTGGGTGTTGACCGTAAAGGTCGTCGTGAAGCGCGTATTGTCCTCGTACTGGTGCGAAAAACCAGCCAGATTGTTGGTCGCTACTTTACCGAAGCGGGCGTCGGCTTTGTGGTTCCTGACGACAGCCGTCTGAg < 1:490129/151‑1 (MQ=255)
gTGCTGGCTCAGCCGCTGGGTGTTGAACTAAAAGGTCGTCGTGAAGATAGTATTGTCCGCGTACTGGTGCCAAAAACCGGCCAGATTGTTGGTCGCTACTTTACCGAAGCGGGCGTCGGCTTTGTGGTTCCTGACGCCAGCCGTCTGAGCt > 4:1110140/1‑151 (MQ=255)
tGCTGGCTCAGCCGCTGGGTGTTGACCGTAAAGGTCGTCGTGAAGCGCGTATTGTCCGCGTACTGGTGCCAAAAACCAGCCAGATTGTTGGTCGCTACTTTACCGAAGCGGGCGTCGGCTTTGTGGTTCCTGACGACAGCCGTCTGAGCtt > 1:1274088/1‑151 (MQ=255)
gCTGGCTCAGCCGCTGGGTGCTGACCGTAAAGGTCGTCGTGAAGCGCGTATTGTCCGCGTACTGGTGCCAAAAACCAGCCAGATTGTTGGTCGCTACTTTACCGAAGCGGGCGTCGGCTTTGTGGTTCCTGACGACAGCCGTCTGAGCtt < 3:1321386/150‑1 (MQ=255)
cTGGCTCAGCCGCTGGGTGTTGACCGTAAAGGTCGTCGTGAAGCGCGTATTGTCCGCGTACTGGTGCCAAAAACCAGCCAGATTGTTGGTCGCTACTTTACCGAAGCGGGCGTCGGCTTTGTGGTTCCTGACGACAGCCGTCTGAGCTTCg > 5:348628/1‑151 (MQ=255)
ggCTCAGCCGCTGGGTGTTGACCGTAAAGGTCGTCGTGAAGCGCGTATTGTCCGCGTACTGGTGCCAAAAACCAGCCAGATTGTTGGTCGCTACTTTACCGAAGCGGGCGTCGGCTTTGTGGTTCCTGACGACAGCCGTCTGAGCTTCGat > 5:1371562/1‑151 (MQ=255)
gCTCAGCCGCTGGGTGTTGACCGTAAAGGTCGTCGTGAAGCGCGTATTGTCCGCGTACTGGTGCCAAAAACCAGCCAGATTGTTGGTCGCTACTTTACCGAAGCGGGCGTCGGCTTTGTGGTTCCTGACGACAGCCGTCTGAGCTTCGat > 3:1028664/1‑150 (MQ=255)
atCAGCCGCTGGGTGTAGACCTTAAAGTTAGACGTGAAGCGCGTATTGTCCGCGTACTGTGGCCAAAAACCAGCCAGATTGTTGGTCGCTACTTTACCGAAGCGGGCGTGTGCTTTGTGGTTCCTCACTACATCCGTCTGAGCTTCGatat < 6:148785/150‑1 (MQ=255)
cAGCCGCTGGGTGTTGACCGTAAAGGTCGTCGTGAAGCGCGTATTGTCCGCGTACTGGTGCCAAAAACCAGCCAGATTGTTGGTCGCTACTTTACCGAAGCGGGCGTCGGCTTTGTGGTTCCTGACGACCGCCGTCTGAGCTTCGATATCt > 8:363352/1‑151 (MQ=255)
aGCCGCTGGGTGTTGACCGTAAAGGTCGTCGTGAAGCGCGTATTGTCCGCGTACTGGTGCCAAAAACCAGCCAGATTGTTGGTCGCTACTTTACCGAAGCGGGCGTCGGCTTTGTGGTTCCTGACGACAGCCGTCTGAGCTTCGATATCtt > 8:619334/1‑151 (MQ=255)
cGCTGGGTGTTGACCGTAAAGGTCGTCGTGAAGCGCGTATTGTCCGCGTACTGGTGCCAAAAACCAGCCAGATTGTTGGTCGCTACTTTACCGAAGCGGGCGTCGGCTTTGTGGTTCCTGACGACAGCCGTCTGAGCTTCGATATCTTAAt > 7:512734/1‑151 (MQ=255)
cGCTGGGTGTTGACCGTAAAGGTCGTCGGGAAGCGCGTATTGTCCGCGTACTGGTGCCAAAAACCAGCCAGATTGTTGGTCGCTACTTTACCGAAGCGGGCGTCGGCTTTGTGGTTCCTGACGACAGCCGTCTGAGCTTCGATATCTTAAt < 6:1205603/151‑1 (MQ=255)
|
GCCTCGACCTGGTGAAAGGTACCGTTATTGGCCACCGTGATGGCTACGGCTTTCTGCGGGTTGAAGGGCGTAAAGATGATTTGTATCTCTCCAGCGAGCAGATGAAAACCTGCATTCATGGCGATCAGGTGCTGGCTCAGCCGCTGGGTGCTGACCGTAAAGGTCGTCGTGAAGCGCGTATTGTCCGCGTACTGGTGCCAAAAACCAGCCAGATTGTTGGTCGCTACTTTACCGAAGCGGGCGTCGGCTTTGTGGTTCCTGACGACAGCCGTCTGAGCTTCGATATCTTAATCCCGCC > NC_000913/4406895‑4407192
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
N/A
