Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A4 F84 I10 R1
|
267 |
426.1 |
13521957 |
97.0% |
13116298 |
150.5 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
NC_000913 |
4,553,671 |
C→T |
F257F (TTC→TTT) |
uxuB → |
D‑mannonate oxidoreductase, NAD‑dependent |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | NC_000913 | 4,553,671 | 0 | C | T | 95.5%
| 1365.7
/ 33.9
| 421 | F257F (TTC→TTT) | uxuB | D‑mannonate oxidoreductase, NAD‑dependent |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (11/8); new base T (203/197); total (215/206) |
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 6.41e-01 |
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
Only 100 of 421 total aligned reads displayed.
CGCAGCTGGCGGCATGGATTGAAGAAAATGTCACCTTCCCGTGCACCATGGTTGACCGCATCGTTCCGGCGGCGACGCCAGAAACCTTACAGGAAATTGCTGACCAGCTGGGTGTTTACGACCCGTGCGCCATTGCCTGCGAACCGTTCCGTCAGTGGGTGATTGAAGATAACTTCGTTAATGGTCGCCCGGATTGGGATAAAGTGGGCGCACAGTTCGTTGCAGACGTTGTGCCGTTCGAAATGATGAAGCTGCGTATGCTGAACGGCAGCCACTCTTTTCTGGCGTACCTCGGT > NC_000913/4553523‑4553818
|
gCTGGCGGCATGGATTGAAGAAAATGTCACCTTCCCGTGCACCATGGTTGACCGCATCGTTCCGGCGGCGACGCCAGAAACCTTACAGGAAATTGCTGACCAGCTGGGTGTTTACGACCCGTGCGCCATTGCCTGCGAACCGTTTCGTc > 3:1178427/1‑149 (MQ=255)
ggcggcATGGATTGAAGAAAATGTCACCTTCCCGTGCACCATGGTTGACCGCATCGTTCCGGCGGCGACGCCAGAAACCTTACAGGAAATTGCTGACCAGCTGGGTGTTTACGACCCGTGCGCCATTGCCTGCGAACCGTTTCGTCAGt < 8:19007/149‑1 (MQ=255)
gcATGGATTGAAGAAAATGTCACCTTCCCGTGCACCATGGTTGACCGCATCGTTCCGGCGGCGACGCCAGAAACCTTACAGGAAATTGCTGACCAGCTGGGTGTTTACGACCCGTGCGCCATTGCCTGCGAACCGTTTCGTCAGTGGGTGa < 3:690016/151‑1 (MQ=255)
tGAAGAAAATGTCACCTTCCCGTGCACCATGGTTGACCGCATCGTTCCGGCGGCGACGCCAGAAACCTTACAGGAAATTGCTGACCAGCTGGGTGTTTACGACCCGTGCGCCATTGCCTGCGAACCGTTTCGTCAGTGGGTGATTGa > 1:1501848/1‑147 (MQ=255)
tGAAGAAAATGTCACCTTCCCGTGCACCATGGTTGACCGCATCGTTCCGGCGGCGACGCCAGAAACCTTACAGGAAATTGCTGACCAGCTGGGTGTTTACGACCCGTGCGCCATTGCCTGCGAACCGTTTCGTCAGTGGGTGATTGa > 2:1011582/1‑147 (MQ=255)
gaagaaAATGTCACCTTCCCGTGCACCATGGTTGACCGCATCGTTCCGGCGGCGACGCCAGAAACCTTACAGGAAATTGCTGACCAGCTGGGTGTTTACGACCCGTGCGCCATTGCCTGCGAACCGTTTCGTCAGTGGGTGATTGAAGAt < 8:942682/150‑1 (MQ=255)
aaaTGTCACCTTCCCGTGCACCATGGTTGACCGCATCGTTCCGGCGGCGACGCCAGAAACCTTACAGGAAATTGCTGACCAGCTGGGTGTTTACGACCCGTGCGCCATTGCCTGCGAACCGTTTCGTCAGTGGGTGATTGAAGATAACTTc > 6:1006669/1‑151 (MQ=255)
aaaTGTCACCTTCCCGTGCACCATGGTTGACCGCATCGTTCCGGCGGCGACGCCAGAAACCTTACAGGAAATTGCTGACCAGCTGGGTGTTTACGACCCGTGCGCCATTGCCTGCGAACCGTTTCGTCAGTGGGTGATTGAAGATAACTTc > 4:426892/1‑151 (MQ=255)
aaaTGTCACCTTCCCGTGCACCATGGTTGACCGCATCGTTCCGGCGGCGACGCCAGAAACCTTACAGGAAATTGCTGACCAGCTGGGTGTTTACGACCCGTGCGCCATTGCCTGCGAACCGTTTCGTCAGTGGGTGATTGAAGATAACTTc < 3:1095680/151‑1 (MQ=255)
aaTGTCACCTTCCCGTGCACCATGGTTGACCGCATCGTTCCGGCGGCGACGCCAGAAACCTTACAGGAAATTGCTGACCAGCTGGGTGTTTACGACCCGTGCGCCATTGCCTGCGAACCGTTTCGTCAGTGGGTGATTGAAGATAACTTCg > 1:1193258/1‑151 (MQ=255)
gTCACCTTCCCGTGCACCATGGTTGACCGCATCGTTCCGGCGGCGACGCCAGAAACCTTACAGGAAATTGCTGACCAGCTGGGTGTTTACGACCCGTGCGCCATTGCCTGCGAACCGTTTCGTCAGTGGGTGATTGAAGATAACTTCGTTa < 8:1064758/151‑1 (MQ=255)
cACCTTCCCGTGCACCATGGTTGACCGCATCGTTCCGGCGGCGACGCCAGAAACCTTACAGGAAATTGCTGACCAGCTGGGTGTTTACGACCCGTGCGCCATTGCCTGCGAACCGTTTCGTCAGTGGGTGATTGAAGATAACTTCGTTAAt < 3:284818/151‑1 (MQ=255)
cACCTTCCCGTGCACCATGGTTGACCGCATCGTTCCGGCGGCGACGCCAGAAACCTTACAGGAAATTGCTGACCAGCTGGGTGTTTACGACCCGTGCGCCATTGCCTGCGAACCGTTTCGTCAGTGGGTGATTGAAGATAACTTCGTTAAt < 2:755215/151‑1 (MQ=255)
aCCTTCCCGTGCACCATGGTTGACCGCATCGTTCCGGCGGCGACGCCAGAAACCTTACAGGAAATTGCTGACCAGCTGGGTGTTTACGACCCGTGCGCCATTGCCTGCGAACCGTTTCGTCAGTGGGTGATTGAAGATAACTTCGTTAATg < 4:175016/151‑1 (MQ=255)
ccTTCCCGTGCACCATGGTTGACCGCATCGTTCCGGCGGCGACGCCAGAAACCTTACAGGAAATTGCTGACCAGCTGGGTGTTTACGACCCGTGCGCCATTGCCTGCGAACCGTTTCGTCAGTGGGTGATTGAAGATAACTTCGTTAATgg < 8:688838/151‑1 (MQ=255)
cTTCCCGTGCACCATGGTTGACCGCATCGTTCCGGCGGCGACGCCAGAAACCTTACAGGAAATTGCTGACCAGCTGGGTGTTTACGACCCGTGCGCCATTGCCTGCGAACCGTTTCGTCAGTGGGTGATTGAAGATAACTTCGTTAATGGt > 4:833293/1‑151 (MQ=255)
taccGTGCACCATGGTTGACCGCATCGTTCCGGCGGCGACGCCAGAAACCTTACAGGAAATTGCTGACCAGCTGGGTGTTTACGACCCGTGAGCCATTGCCTGCGAACCGTTACCTCAGTGGGTGATTGAAGATAACTTCGTTAATGGTCg > 1:205964/3‑151 (MQ=255)
cccGTGCACCATGGTTGACCGCATCGTTCCGGCGGCGACGCCAGAAACCTTACAGGAAATTGCTGACCAGCTGGGTGTTTACGACCCGTGCGCCATTGCCTGCGAACCGTTTCGTCAGTGGGTGATTGAAGATAACTTCGTTAATGGTCGc > 7:239661/1‑151 (MQ=255)
ccGTGCACCATGGTTGACCGCATCGTTCCGGCGGCGACGCCAGAAACCTTACAGGAAATTGCTGACCAGCTGGGTGTTTACGACCCGTGCGCCATTGCCTGCGAACCGTTTCGTCAGTGGGTGATTGAAGATAACTTCGTTAATGGTCGcc > 2:1625593/1‑151 (MQ=255)
ccGTGCACCATGGTTGACCGCATCGTTCCGGCGGCGACGCCAGAAACCTTACAGGAAATTGCTGACCAGCTGGGTGTTTACGACCCGTGCGCCATTGCCTGCGAACCGTTTCGTCAGTGGGTGATTGAAGATAACTTCGTTAATGGTCGcc > 7:827995/1‑151 (MQ=255)
gTGCACCATGGTTGACCGCATCGTTCCGGCGGCGACGCCAGAAACCTTACAGGAAATTGCTGACCAGCTGGGTGTTTACGACCCGTGCGCCATTGCCTGCGAACCGTTTCGTCAGTGTGTGATTGAAGATAACTTCGTTAATGGTCGCCCg < 2:6356/151‑1 (MQ=255)
tGCACCATGGTTGACCGCATCGTTCCGGCGGCGACGCCAGAAACCTTACAGGAAATTGCTGACCAGCTGGGTGTTTACGACCCGTGCGCCATTGCCTGCGAACCGTTTCGTCAGTGGGTGATTGAAGATAAGTTCGTTAATGGTCGCCCgg > 6:152395/1‑151 (MQ=255)
tGCACCATGGTTGACCGCATCGTTCCGGCGGCGACGCCAGAAACCTTACAGGAAATTGCTGACCAGCTGGGTGTTTACGACCCGTGCGCCATTGCCTGCGAACCGTTTCGTCAGTGGGTGATTGAAGATAACTTCGTTAATGGTCGCCCgg > 1:127535/1‑151 (MQ=255)
gCACCATGGTTGACCGCATCGTTCCGGCGGCGACGCCAGAAACCTTACAGGAAATTGCTGACCAGCTGGGTGTTTACGACCCGTGCGCCATTGCCTGCGAACCGTTCCGTCAGTGGGTGATTGAAGATAACTTCGTTAATGGTCGCCCgta < 5:1383433/151‑3 (MQ=255)
cACCATGGTTGACCGCATCGTTCCGGCGGCGACGCCAGAAACCTTACAGGAAATTGCTGACCAGCTGGGTGTTTACGACCCGTGCGCCATTGCCTGCGCACCGTTTCGTCAGTGGGTGATTGAAGATAACTTCGTTAATGGTCGCCCGGAt > 6:341110/1‑151 (MQ=255)
cACCATGGTTGACCGCATCGTTCCGGCGGCGACGCCAGAAACCTTACAGGAAATTGCTGACCAGCTGGGTGTTTACGACCCGTGCGCCATTGCCTGCGAACCGTTTCGTCAGTGGGTGATTGAAGATAACTTCGTTAATGGTCGCCCGGAt > 5:1083624/1‑151 (MQ=255)
cACCATGGTTGACCGCATCGTTCCGGCGGCGACGCCAGAAACCTTACAGGAAATTGCTGACCAGCTGGGTGTTTACGACCCGTGCGCCATTGCCTGCGAACCGTTTCGTCAGTGGGTGATTGAAGATAACTTCGTTAATGGTCGCCCGGAt < 4:1524596/151‑1 (MQ=255)
cACCATGGTTGACCGCATCGTTCCGGCGGCGACGCCAGAAACCTTACAGGAAATTGCTGACCAGCTGGGTGTTTACGACCCGTGCGCCATTGCCTGCGAACCGTTTCGTCAGTGGGTGATTGAAGATAACTTCGTTAATGGTCGCCCGGAt < 5:485332/151‑1 (MQ=255)
aCCATGGTTGACCGCATCGTTCCGGCGGCGACGCCAGAAACCTTACAGGAAATTGCTGACCAGCTGGGTGTTTACGACCCGTGCGCCATTGCCTGCGAACCGTTTCGTCAGTGGGTGATTGAAGATAACTTCGTTAATGGTCGCCCGGAtt < 1:440088/151‑1 (MQ=255)
aCCATGGTTGACCGCATCGTTCCGGCGGCGACGCCAGAAACCTTACAGGAAATTGCTGACCAGCTGGGTGTTTACGACCCGTGCGCCATTGCCTGCGAACCGTTTCGTCAGTGGGTGATTGAAGATAACTTCGTTAATGGTCGCCCGGAtt < 3:1276495/151‑1 (MQ=255)
cATGGTTGACCGCATCGTTCCGGCGGCGACGCCAGAAACCTTACAGGAAATTGCTGACCAGCTGGGTGTTTACGACCCGTGCGCCATTGCCTGCGAACCGTTTCGTCAGTGGGTGATTGAAGATAACTTCGTTAATGGTCGCCCGGATTgg > 4:34363/1‑151 (MQ=255)
ggTTGACCGCATCGTTCCGGCGGCGACGCCAGAAACCTTACAGGAAATTGGTGACCAGCTGGGTGTTTACGACCCGTGCGCCATTGCCTGCGAACCGTTTCGTCAGTGGGTGATTGAAGATAACTTCGTTAATGGTCGCCCGGATTGGGAt < 7:962409/151‑1 (MQ=255)
ggTTGACCGCATCGTTCCGGCGGCGACGCCAGAAACCTTACAGGAAATTGCTGACCAGCTGGGTGTTTACGACCCGTGCGCCATTGCCTGCGAACCGTTTCGTCAGTGGGTGATTGAAGATAACTTCGTTAATGGTCGCCCGGATTGGGAt > 6:1609040/1‑151 (MQ=255)
ggTTGACCGCATCGTTCCGGCGGCGACGCCAGAAACCTTACAGGAAATTGCTGACCAGCTGGGTGTTTACGACCCGTGCGCCATTGCCTGCGAACCGTTTCGTCAGTGGGTGATTGAAGATAACTTCGTTAATGGTCGCCCGGATTGGGAt < 4:1120762/151‑1 (MQ=255)
cATCGTTCCGGCGGCGACGCCAGAAACCTTCCAGGAAATTGCTGACCAGCTGGGTGTTTACGACCCGTGCGCCATTGCCTGCGAACCGTTTCGTCAGTGGGTGATTGAAGATAACTTCGTTAATGGTCGCCCGGATTGGGATAAAGTGGgc < 2:1448284/151‑1 (MQ=255)
aTCGTTCCGGCGGCGACGCCAGAAACCTTACAGGAAATTGCTGACCAGCTGGGTGTTTACGACCCGTGCGCCATTGCCTGCGAACCGTTTCGTCAGTGGGTGATTGAAGATAACTTCGTTAATGGTCGCCCGGATTGGGATAAAGTGGgcg > 1:30556/1‑151 (MQ=255)
aTCGTTCCGGCGGCGACGCCAGAAACCTTACAGGAAATTGCTGACCAGCTGGGTGTTTACGACCCGTGCGCCATTGCCTGCGAACCGTTTCGTCAGTGGGTGATTGAAGATAACTTCGTTAATGGTCGCCCGGATTGGGATAAAGTGGgcg < 2:502863/151‑1 (MQ=255)
cGTTCCGGCGGCGACGCCAGAAACCTTACAGGAAATTGCTGACCAGCTGGGTGTTTACGACCCGTGCGCCATTGCCTGCGAACCGTTTCGTCAGTGGGTGATTGAAGATAACTTCGTTAATGGTCGCCCGGATTGGGATAAAGTGGgcgc > 8:453844/1‑150 (MQ=255)
ccGGCGGCGACGCCAGAAACCTTACAGGAAATTGCTGACCAGCTGGGTGTTTACGACCCGTGCGCCATTGCCTGCGAACCGTTTCGTCAGTGGGTGATTGAAGATAACTTCGTTAATGGTCGCCCGGATTGGGATAAAGTGGGCGCACAg < 2:27160/150‑1 (MQ=255)
ccGGCGGCGACGCCAGAAACCTTACAGGAAATTGCTGACCAGCTGGGTGTTTACGACCCGTGCGCCATTGCCTGCGAACCGTTTCGTCAGTGGGTGATTGAAGATAACTTCGTTAATGGTCGCCCGGATTGGGATAAAGTGGGCGCACAg < 8:861304/150‑1 (MQ=255)
ggcggcGACGCCAGAAACCTTACAGGAAATTGCTGACCAGCTGGGTGTTTACGACCCGTGCGCCATTGCCTGCGAACCGTTTCGTCAGTGGGTGATTGAAGATAACTTCGTTAATGGTCGCCCGGATTGGGATAAAGTGGGCGCACAGTTc > 7:127961/1‑151 (MQ=255)
ggcggcGACGCCAGAAACCTTACAGGAAATTGCTGACCAGCTGGGTGTTTACGACCCGTGCGCCATTGCCTGCGAACCGTTTCGTCAGTGGGTGATTGAAGATAACTTCGTTAATGGTCGCCCGGATTGGGATAAAGTGGGCGCACAGTTc < 7:1214321/151‑1 (MQ=255)
gcggcgACGCCAGAAACCTTACAGGAAATTGCTGACCAGCTGGGTGTTTACGACCCGTGCGCCATTGCCTGCGAACCGTTTCGTCAGTGGGTGATTGAAGATAACTTCGTTAATGGTCGCCCGGATTGGGATAAAGTGGGCGCACAGTTCg < 7:533456/151‑1 (MQ=255)
cggcgACGCCAGAAACCTTACAGGAAATTGCTGACCAGCTGGGTGTTTACGACCCGTGCGCCATTGCCTGCGAACCGTTTCGTCAGTGGGTGATTGAAGATAACTTCGTTAATGGTCGCCCGGATTGGGATAAAGTGGGCGCACAGTTCGt < 4:709610/151‑1 (MQ=255)
ggcgACGCCAGAAACCTTACAGGAAATTGCTGACCAGCTGGGTGTTTACGACCCGTGCGCCATTGCCTGCGAACCGTTTCGTCAGTGGGTGATTGAAGATAACTTCGTTAATGGTCGCCCGGATTGGGATAAAGTGGGCGCACAGTTCGtt > 1:746671/1‑151 (MQ=255)
aCGCCAGAAACCTTACAGGAAATTGCTGACCAGCTGGGTGTTTACGACCCGTGCGCCATTGCCTGCGAACCGTTTCGTCAGTGGGTGATTGAAGATAACTTCGTTAATGGTCGCCCGGATTGGGATAAAGTGGGCGCACAGTTCGTTGc > 3:1538490/1‑149 (MQ=255)
aGAAACCTTACAGGAAATTGCTGACCAGCTGGGTGTTTACGACCCGTGCGCCATTGCCTGCGAACCGTTTCGTCAGTGGGTGATTGAAGATAACTTCGTTAATGGTCGCCCGGATTGGGATAAAGTGGGCGCACAGTTCGTTGCAGACGtt > 4:938176/1‑151 (MQ=255)
aGAAACCTTACAGGAAATTGCTGACCAGCTGGGTGTTTACGACCCGTGCGCCATTGCCTGCGAACCGTTTCGTCAGTGGGTGATTGAAGATAACTTCGTTAATGGTCGCCCGGATTGGGATAAAGTGGGCGCACAGTTCGTTGCAGACGtt < 5:697250/151‑1 (MQ=255)
aGAAACCTTACAGGAAATTGCTGACCAGCTGGGTGTTTACGACCCGTGCGCCATTGCCTGCGAACCGTTTCGTCAGTGGGTGATTGAAGATAACTTCGTTAATGGTCGCCCGGATTGGGATAAAGTGGGCGCACAGTTCGTTGCAGACGtt < 2:1092353/151‑1 (MQ=255)
aaaCCTTACAGGAAATTGCTGACCAGCTGGGTGTTTACGACCCGTGCGCCATTGCCTGCGAACCGTTTCGTCAGTGGGTGATTGAAGATAACTTCGTTAATGGTCGCCCGGATTGGGATAAAGTGGGCGCACAGTTCGTTGCAGACGTtgt < 5:1630099/151‑1 (MQ=255)
ccTTACAGGAAATTGCTGACCAGCTGGGTGTTTACGACCCGTGCGCCATTGCCTGCGAACCGTTTCGTCAGTGGGTGATTGAAGATAACTTCGTTAATGGTCGCCCGGATTGGGATAAAGTGGGCGCACAGTTCGTTGCAGACGTTGTGcc > 8:1012903/1‑151 (MQ=255)
tACAGGAAATTGCTGACCAGCTGGGTGTTTACGACCCGTGCGCCATTGCCTGCGAACCGTTTCGTCAGTGGGTGATTGAAGATAACTTCGTTAATGGTCGCCCGGATTGGGATAAAGTGGGCGCACAGTTCGTTGCAGACGTTGTGCCGt < 8:760269/150‑1 (MQ=255)
tACAGGAAATTGCTGACCAGCTGGGTGTTTACGACCCGTGCGCCATTGCCTGCGAACCGTTTCGTCAGTGGGTGATTGAAGATAACTTCGTTAATGGTCGCCCGGATTGGGATAAAGTGGGCGCACAGTTCGTTGCAGACGTTGTGCCGt < 2:216087/150‑1 (MQ=255)
aCAGGAAATTGCTGACCAGCTGGGTGTTTACGACCCGTGCGCCATTGCCTGCGAACCGTTTCGTCAGTGGGTGATTGAAGATAACTTCGTTAATGGTCGCCCGGATTGGGATAAAGTGGGCGCACAGTTCGTTGCAGACGTTGTGCCGtt < 2:1557041/150‑1 (MQ=255)
aCAGGAAATTGCTGACCAGCTGGGTGTTTACGACCCGTGCGCCATTGCCTGCGAACCGTTTCGTCAGTGGGTGATTGAAGATAACTTCGTTAATGGTCGCCCGGATTGGGATAAAGTGGGCGCACAGTTCGTTGCAGACGTTGTGCCGTTc < 4:1596118/151‑1 (MQ=255)
aCAGGAAATTGCTGACCAGCTGGGTGTTTACGACCCGTGCGCCATTGCCTGCGAACCGTTTCGTCAGTGGGTGATTGAAGATAACTTCGTTAATGGTCGCCCGGATTGGGATAAAGTGGGCGCACAGTTCGTTGCAGACGTTGTGCCGTTc > 4:1353150/1‑151 (MQ=255)
cAGGAAATTGCTGACCAGCTGGGTGTTTACGACCCGTGCGCCATTGCCTGCGAACCGTTTCGTCAGTGGGTGATTGAAGATAACTTCGTTAATGGTCGCCCGGATTGGGATAAAGTGGGCGCACAGTTCGTTGCAGACGTTGTGCCGTTCg > 5:1171823/1‑151 (MQ=255)
aGGAAATTGCTGACCAGCTGGGTGTTTACGACCCGTGCGCCATTGCCTGCGAACCGTTTCGTCAGTGGGTGATTGAAGATAACTTCGTTAATGGTCGCTCGGATTGGGATAAAGTGGGCGCACAGTTCCTTGCAGACGTTGTGCCGTTCGa < 6:1444653/151‑1 (MQ=255)
aGGAAATTGCTGACCAGCTGGGTGTTTACGACCCGTGCGCCATTGCCTGCGAACCGTTTCGTCAGTGGGTGATTGAAGATAACTTCGTTAATGGTCGCCCGGATTGGGATAAAGTGGGCGCACAGTTCGTTGCAGACGTTGTGCCGTTCg > 5:577172/1‑150 (MQ=255)
gAAATTGCTGACCAGCTGGGTGTTTACGACCCGTGCGCCATTGCCTGCGAACCGTTTCGTCAGTGGGTGATTGAAGATAACTTCGTTAATGGTCGCCCGGATTGGGATAAAGTGGGCGCACAGTTCGTTGCAGACGTTGTGCCGTTCGaaa < 1:695738/151‑1 (MQ=255)
aaaTTGCTGACCAGCTGGGTGTTTACGACCCGTGCGCCATTGCCTGCGAACCGTTTCGTCAGTGGGTGATTGAAGATAACTTCGTTAATGGTCGCCCGGATTGGGATAAAGTGGGCGCACAGTTCGTTGCAGACGTTGTGCCGTTCGAAat < 5:92007/151‑1 (MQ=255)
aaTTGCTGACCAGCTGGGTGTTTACGACCCGTGCGCCATTGCCTGCGAACCGTTTCGTCAGTGGGTGATTGAAGATAACTTCGTTAATGGTCGCCCGGATTGGGATAAAGTGGGCGCACAGTTCGTTGCAGACGTTGTGCCGTTCGAAatg > 2:1319833/1‑151 (MQ=255)
tGACCAGCTGGGTGTTCACGACCCGTGCGCCATTGCCTGCGAACCGTTTCGTCAGTGGGTGATTGAAGATAACTTCGTTAATGGTCGCCCGGATTGGGATAAAGTGGGCGCACAGTTCGTTGCAGACGTTGTGCCGTTCGAAAtgatga > 6:675539/1‑149 (MQ=255)
gACCAGCTGGGTGTTTACGACCCGTGCGCCATTGCCTGCGAACCGTTTCGTCAGTGGGTGATTGAAGATAACTTCGTTAATGGTCGCCCGGATTGGGATAAAGTGGGCGCACAGTTCGTTGCAGACGTTGTGCCGTTCGAAATGATGAAGc > 6:634966/1‑151 (MQ=255)
gACCAGCTGGGTGTTTACGACCCGTGCGCCATTGCCTGCGAACCGTTCCGTCAGTGGGTGATTGAAGATAACTTCGTTAATGGTCGCCCGGATTGGGATAAAGTGGGCGCACAGTTCGTTGCAGACGTTGTGCCGTTCGAAATGATGaa < 1:1033572/149‑1 (MQ=255)
aCCAGCTGGGTGTTTACGACCCGTGCGCCATTGCCTGCGAACCGTTTCGTCAGTGGGTGATTGAAGATAACTTCGTTAATGGTCGCCCGGATTGGGATAAAGTGGGCGCACAGTTCGTTGCAGACGTTGTGCCGTTCGAAATGATGAAGCt > 8:153306/1‑151 (MQ=255)
ccAGCTGGGTGTTTACGACCCGTGCGCCATTGCCTGCGAACCGTTTCGTCAGTGGGTGATTGAAGATAACTTCGTTAATGGTCGCCCGGATTGGGATAAAGTGGGCGCACAGTTCGTTGCAGACGTTGTGCCGTTCGAAATGATGAAGCTg > 1:507760/1‑151 (MQ=255)
ggggGTTTACGTCCCGTGCGCCATTGCCTGCGAACCGTTTCGTCAGTGTGTGATTGAAGCTACCTTCGGTAATGGTCGCCCGGATTGGGATAAAGTGGGCGCACAGTTCGTTGCAGACGTTGTGCCGTTCGAAATGATGAAGCTGCGTAt < 2:367709/150‑1 (MQ=255)
gggTGTTTACGACCCGTGCGCCATTGCCGGCGAACCGTTTCGTCAGTGGGTGATTGAAGATAACTTCGTTAATGGTCGCCCGGATTGGGATAAAGTGGGCGCACAGTTCGTTGCAGACGTTGTGCCGTTCGAAATGATGAAGCTGCGTATg < 7:1020316/151‑1 (MQ=255)
gtTTACGACCCGTGCGCCATTGCCTGCGAACCGTTTCGTCAGTGGGTGATTGAAGATAACTTCGTTAATGGTCGCCCGGATTGGGATAAAGTGGGCGCACAGTTCGTTGCAGACGTTGTGCCGTTCGAAATGATGAAGCTGCGTATGCTg < 1:893895/150‑1 (MQ=255)
tttACGACCCGTGCGCCATTGCCTGCGAACCGTTTCGTCAGTGGGTGATTGAAGATAACTTCGTTAATGGTCGCCCGGATTGGGATAAAGTGGGCGCACAGTTCGTTGCAGACGTTGTGCCGTTCGAAATGATGAAGCTGCGTATGCTGa > 3:900635/1‑150 (MQ=255)
tttACGACCCGTGCGCCATTGCCTGCGAACCGTTCCGTCAGTGGGTGATTGAAGATAACTTCGTTAATGGTCGCCCGGATTGGGATAAAGTGGGCGCACAGTTCGTTGCAGACGTTGTGCCGTTCGAAATGATGAAGCTGCGTATGCtta > 5:832568/1‑148 (MQ=255)
tACGACCGGTGCGCCATTGCCTGCGAACCGTTTCGTCAGTGGGTGATTGAAGATAACTTCGTTAATGGTCGCCCGGATTGGGATAAAGTGGGCGCACAGTTCGTTGCAGACGTTGTGCCGTTCGAAATGATGAAGCTGCGTATGCTGAAc < 7:761669/150‑1 (MQ=255)
tACGACCCGTGCGCCATTGCCTGCGAACCGTTTCGTCAGTGGGTGATTGAAGATAACTTCGTTAATGGTCGCGCGGATTGGGATAAAGTGGGGGCACAGTTCGTTGCAGACGTTGTGCCGTTCGAAATGATGAAGCTGCGTATGCTGaagg > 7:1524372/1‑149 (MQ=255)
cGACCCGTGCGCCATTGCCTGCGAACCGTTTCGTCAGTGGGTGATTGAAGATAACTTCGTTAATGGTAGCCCGGATTGGGATAAAGTGGGCGCACAGTTCGTTGAAGACGTTGTGCCGTTCGAAATGATGAAGCTGCGTATGCTGAACGGc > 7:354377/1‑151 (MQ=255)
cccGTGCGCCATTGCCTGCGAACCGTTTCGTCAGTGGGTGATTGAAGATAACTTCGTTAATGGTCGCCCGGATTGGGATAAAGTGGGCGCACAGTTCGTTGCAGACGTTGTGCCGTTCGAAATGATGAAGCTGCGTATGCTGAACGGCAGc > 5:242575/1‑151 (MQ=255)
cGTGCGCCATTGCCTGCGAACCGTTTCGTCAGTGGGTGATTGAAGATAACTTCGTTAATGGTCGCCCGGATTGGGATAAAGTGGGCGCACAGTTCGTTGCAGACGTTGTGCCGTTCGAAATGATGAAGCTGCGTATGCTGAACGGCAGCCa < 6:248491/151‑1 (MQ=255)
gTGCGCCATTGCCTGCGAACCGTTTCGTCAGTGGGTGATTGAAGATAACTTCGTTAATGGTCGCCCGGATTGGGATAAAGTGGGCGCACAGTTCGTTGCAGACGTTGTGCCGTTCGAAATGATGAAGCTGCGTATGCTGAACGGCAGCCAc > 3:196216/1‑151 (MQ=255)
gTGCGCCATTGCCTGCGAACCGTTTCGTCAGTGGGTGATTGAAGATAACTTCGTTAATGGTCGCCCGGATTGGGATAAAGTGGGCGCACAGTTCGTTGCAGACGTTGTGCCGTTCGAAATGATGAAGCTGCGTATGCTGAACGGCAGCCAc > 8:1369831/1‑151 (MQ=255)
cgcCATTGCCTGCGAACCGTTTCGTCAGTGGGTGATTGAAGATAACTTCGTTAATGGTCGCCCGGATTGGGATAAAGTGGGCGCACAGTTCGTTGCAGACGTTGTGCCGTTCGAAATGATGAAGCTGCGTATGCTGAACGGCAGCCActct > 6:1117715/1‑151 (MQ=255)
cATTGCCTGCGAACCGTTTCGTCAGTGGGTGATTGAAGATAACTTCGTTAATGGTCGCCCGGATTGGGATAAAGTGGGCGCACAGTTCGTTGCAGACGTTGTGCCGTTCGAAATGAGGAAGCTGCGTATGCTGAACGGCAGCCACTCtttt < 4:1072442/151‑1 (MQ=255)
aTTGCCTGCGAACCGTTTCGTCAGTGGGTGATTGAAGATAACTTCGTTAATGGTCGCCCGGATTGGGATAAAGTGGGAGCACAGTTCGTTGCAGACGTTGTGCCGTTCGAAATGATGAAGCTGCGTATGCTGCACGGCAGCCACTCttttg > 8:282285/1‑150 (MQ=255)
tGCCTGCGAACCGTTTCGTAAGTCGGTGATTGAAGATAACTTCGTTAATGGTCGCCCGGATTGGCATAAAGTCGGCGCACACTTCGTTGCAGACGTTGTGCAGAACGAAATGATGAAGCTGCGTATGCTGAACGGCAGCCACTCATTACt > 6:834095/1‑150 (MQ=255)
gCCTGCGAACCGTTTCGTCAGTGGGTGATTGAAGATAACTTCGTTAATGGTCGCCCGGATTGGGATAAAGTGGGCGCACAGTTCGTTGCAGACGTTGTGCCGTTCGAAATGATGAAGCTGCGTATGCTGAACGGCAGCCACTCTTTTCTgg < 4:664858/151‑1 (MQ=255)
gCCTGCGAACCGTTTCGTCAGTGGGTGATTGAAGATAACTTCGTTAATGGTCGCCCGGATTGGGATAAAGTGGGCGCACAGTTCGTTGCAGACGTTGTGCCGTTCGAAATGATGAAGCTGCGTATGCTGAACGGCAGCCACTCTTTTCTgg > 2:838853/1‑151 (MQ=255)
gCCTGCGAACCGTTTCGTCAGTGGGTGATTGAAGATAACTTCGTTAATGGTCGCCCGGATTGGGATAAAGTGGGCGCACAGTTCGTTGCAGACGTTGTGCCGTTCGAAATGATGAAGCTGCGTATGCTGAACGGCAGCCACTCTTTTCTgg < 5:33494/151‑1 (MQ=255)
gCCTGCGAACCGTTTCGTCAGTGGGTGATTGAAGATAACTTCGTTAATGGTCGCCCGGATTGGGATAAAGTGGGCGCACAGTTCGTTGCAGACGTTGTGCCGTTCGAAATGATGAAGCTGCGTATGCTGAACGGCAGCCACTCTTTTCTg < 2:1184398/150‑1 (MQ=255)
gCCTGCGAACCGTTTCGTCAGTGGGTGATTGAAGATAACTTCGTTAATGGTCGCCCGGATTGGGATAAAGTGGGCGCACAGTTCGTTGCAGACGTTGTGCCGTTCGAAATGATGAAGCTGCGTATGCTGAACGGCAGCCACTCTTTTCTg < 6:454193/150‑1 (MQ=255)
ccTGCGAACCGTTTCGTCAGTGGGTGATTGAAGATAACTTCGTTAATGGTCGCCCGGATTGGGATAAAGTGGGCGCACAGTTCGTTGCAGACGTTGTGCCGTTCGAAATGATGAAGCTGCGTATGCTGAACGGCAGCCACTCTTTTCTGGc < 5:1316141/151‑1 (MQ=255)
cTGCGAACCGTTTCGTCAGTGGGTGATTGAAGATAACTTCGTTAATGGTCGCCCGGATTGGGATAAAGTGGGCGCACAGTTCGTTGCAGACGTTGTGCCGTTCGAAATGATGAAGCTGCGTATGCTGAACGGCAGCCACTCTTTTCTGGCg > 1:1315478/1‑151 (MQ=255)
tGCGAACCGTTTCGTCAGTGGGTGAATGAAGATAACTTCGTTAATGGTCGCCCGGATTGGGATAAAGTGGGCGCACAGTTCGTTGCAGACGTTGTGCCGTTCGAAATGATGAAGCTGCGTATGCTGAACGGCAGCCACTCTTTTCTGGCGt > 5:1679016/1‑151 (MQ=255)
gCGAACCGTTTCGTCAGTGGGTGATTGAAGATAACTTCGTTAATGGTCGCCCGGATTGGGATAAAGTGGGCGCACAGTTCGTTGCAGACGTTGTGCCGTTCGAAATGATGAAGCTGCGTATGCTGAACGGCAGCCACTCTTTTCTGGCGt > 3:472902/1‑150 (MQ=255)
gCGAACCGTTTCGTCAGTGGGTGATTGAAGATAACTTCGTTAATGGTCGCCCGGATTGGGATAAAGTGGGCGCACAGTTCGTTGCAGACGTTGTGCCGTTCGAAATGATGAAGCTGCGTATGCTGAACGGCAGCCACTCTTTTCTGGCGt < 2:412786/150‑1 (MQ=255)
gCGAACCGTTTCGTCAGTGGGTGATTGAAGATAACTTCGTTAATGGTCGCCCGGATTGGGATAAAGTGGGCGCACAGTTCGTTGCAGACGTTGTGCCGTTCGAAATGATGAAGCTGCGTATGCTGAACGGCAGCCACTCTTTTCTGGCGt < 4:979606/150‑1 (MQ=255)
aaCCGTTTCCTCAGTGGGTGATTGAAGATAACTTAGTTAATGGTCGCCCGGATTGGGATAAAGTGGGCGCACAGTTCGTTGCAGACGTTGTGCCGTTAGAAATGATGAAGCTGCGTATGCTGAACCGCAGCCACTCTTTTATggattaact > 5:1528093/1‑144 (MQ=255)
aCCGTTTCGTCAGTGGGTGATTGAAGATAACTTCGTTAATGGTCGCCCGGATTGGGATAAAGTGGGCGCACAGTTCGTTGCAGACGTTGTGCCGTTCGAAATGATGAAGCTGCGTATGCTGAACGGCAGCCACTCTTTTCTGGCGTACCTc < 7:159677/151‑1 (MQ=255)
ccGTTTCGTCAGTGGGTGATTGAAGATAACTTCGTTAATGGTCGCCCGGATTGGGATAAAGTGGGCGCACAGTTCGTTGCAGACGTTGTGCCGTTCGAAATGATGAAGCTGCGTATGCTGAACGGCAGCCACTCTTTTCTGGCGTACCTCg < 7:1346933/151‑1 (MQ=255)
ccGTTCCGTCAGTGGGTGATTGAAGATAACTTCGTTAATGGTCGCCCGGATTGGGATAAAGTGGGCGCACAGTTCGTTGCAGACGTTGTGCCGTTCGAAATGATGAAGCTGCGTATGCTGAACGGCAGCCACTCTTTTCTGGCGTACCTCg < 7:1424586/151‑1 (MQ=255)
gTTTCGTCAGTGGGTGATTGAAGATAACTTCGTTAATGGTCGCCCGGATTGGGATAAAGTGGGCGCACAGTTCGTTGCAGACGTTGTGCCGTTCGAAATGATGAAGCTGCGTATGCTGAACGGCAGCCACTCTTTTCTGGCGTACCTCGGt > 3:765383/1‑151 (MQ=255)
gTTTCGTCAGTGGGTGATTGAAGATAACTTCGTTAATGGTCGCCCGGATTGGGATAAAGTGGGCGCACAGTTCGTTGCAGACGTTGTGCCGTTCGAAATGATGAAGCTGCGTATGCTGAACGGCAGCCACTCTTTTCTGGCGTACCTCGGt < 4:1421311/151‑1 (MQ=255)
|
CGCAGCTGGCGGCATGGATTGAAGAAAATGTCACCTTCCCGTGCACCATGGTTGACCGCATCGTTCCGGCGGCGACGCCAGAAACCTTACAGGAAATTGCTGACCAGCTGGGTGTTTACGACCCGTGCGCCATTGCCTGCGAACCGTTCCGTCAGTGGGTGATTGAAGATAACTTCGTTAATGGTCGCCCGGATTGGGATAAAGTGGGCGCACAGTTCGTTGCAGACGTTGTGCCGTTCGAAATGATGAAGCTGCGTATGCTGAACGGCAGCCACTCTTTTCTGGCGTACCTCGGT > NC_000913/4553523‑4553818
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
N/A
