Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A12 F91 I8 R1
|
12 |
457.5 |
14260847 |
98.7% |
14075455 |
150.5 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| JC |
NC_000913 |
1,673,557 |
Δ120 bp |
intergenic (‑56/‑237) |
mdtJ ← / → tqsA |
multidrug efflux system transporter/pheromone AI‑2 transporter |
|
| |
seq id |
position |
reads (cov) |
reads (cov) |
score |
skew |
freq |
annotation |
gene |
product |
| * |
? |
NC_000913 |
= 1673556 | 1 (0.000) | 444 (0.990) |
227/296 |
0.0 |
99.8% |
intergenic (‑55/‑357) |
mdtJ/tqsA |
multidrug efflux system transporter/pheromone AI‑2 transporter |
| ? | NC_000913 |
1673677 = |
1 (0.000) | intergenic (‑176/‑236) |
mdtJ/tqsA |
multidrug efflux system transporter/pheromone AI‑2 transporter |
Only 100 of 452 total aligned reads displayed.
CGCCATTTCCCTCACTGACGCTCGCCCATTTCATTGACAGCGTACCGGTAATTTCTGTAGCAATAGCCAGACCTAATAAAATCCAATAAATATACATTGTCCTTCTCCTGCAAGAGAATTATTTTAATTTTCGCTTAATTCAGCGAAACCAA‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > NC_000913/1673405‑1673556
‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑aaTGTAGAAAATAACGTCCTGAACAAATTGTCCATAATATTACAATTATCCGCAGTGTTGCTTCTCGTCATCGCGGATGATAATTGTCCTCGGTAGTTGAACACGCCTGATTTGTATCATAGCTTAAGAATTAACTCAAAATATTTTCACTT > NC_000913/1673677‑1673826
GCCATTTCCCTCACTGACGCTCGCCCATTTCATTGACAGCGTACCGGTAATTTCTGTAGCAATAGCCAGACCTAATAAAATCCAATAAATATACATTGTCCTTCTCCTGCAAGAGAATTATTTTAATTTTCGCTTAATTCAGCGAAACCA > 3:1227078/1‑150
GCCATTTCCCTCACTGACGCTCGCCCATTTCATTGACAGCGTACCGGTAATTTCTGTAGCAATAGCCAGACCTAATAAAATCCAATAAATATACATTGTCCTTCTCCTGCAAGAGAATTATTTTAATTTTCGCTTAATTCAGCGAAACCA > 6:893601/1‑150
CATTTCCCTCACTGACGCTCGCCCATTTCATTGACAGCGTACCGGTAATTTCTGTAGCAATAGCCAGACCTAATAAAATCCAATAAATATAAATTGTCCTTCTCCTGCAAGAGAATTATTTTAATTTTCGCTTAATTCAGCGAAACCAATt > 4:1213143/1‑150
ATTTCCCTCACTGACGCTCGCCCATTTCATTGACAGCGTACCGGTAATTTCTGTAGCAATAGCCAGACCTAATAAAATCCAATAAATATACATTGTCCTTCTCCTGCAAGAGAATTATTTTAATTTTCGCTTAATTCAGCGAAACCAATGT < 7:146967/151‑1
TTCCCTCACTGACGCTCGCCCATTTCATTGACAGCGTACCGGTAATTTCTGTAGCAATAGCCAGACCTAATAAAATCCAATAAATATACATTGTCCTTCTCCTGCAAGAGAATTATTTTAATTTTCGCTTAATTCAGCGAAACCAATGT > 6:557335/1‑149
CCCTCACTGACGCTCGCCCATTTCGTTGACAGCGTACCGGTAATTTCTGTAGCAATAGCCAGACCTAATAAAATCCAATAAATATACATTGTCCTTCTCCTGCAAGAGAATTATTTTAATTTTCGCTGAATTCAGCGAAACCAATGTAGA > 3:708050/1‑150
CCTCACTGACGCTCGCCCATTTCATTGACATCGTACCGGTAATTTCTGTAGCAATAGCCAGACCTAATAAAATCCAATAAATATACATTGTCCTTCTCCTGCAAGAGAATTATTTTAATTTTCGCTTAATTCAGCGAAACCAATGTAGAAA < 7:233588/151‑1
CCTCACTGACGCTCGCCCATTTCATTGACAGCGTACCGGTAATTTCTGTAGCAATAGCCAGACCTAATAAAATCCAATAAATATACATTGTCCTTCTCCTGCAAGAGAATTATTTTAATTTTCGCTTAATTCAGCGAAACCAATGTAGAA > 6:1231081/1‑150
CTCACTGACGCTCGCCCATTTCATTGACAGCGTACCGGTAATTTCTGTAGCAATAGCCAGACCTAATAAAATCCAATAAATATACATTGTCCTTCTCCTGCAAGAGAATTATTTTAATTTTCGCTTAATTCAGCGAAACCAATCTAGAAA > 2:1241175/1‑150
ACTGACGCTCGCCCATTTCATTGACAGCGTACCGGTAATTTCTGTAGCAATAGCCAGACCTAATAAAATCCAATAAATATACATTGTCCTTCTCCTGCAAGAGAATTATTTTAATTTTCGCTTAATTCAGCGAAACCAATGTAGAAAATAA < 3:372421/151‑1
CGCTCGCCCATTTCATTGACAGCGTACCGGTAATTTCTGTAGCAATAGCCAGACCTAATAAAATCCAATAAATATACATTGTCCTTCTCCTGCAAGAGAATTATTTTAATTTTCGCTTAATTCAGCGAAACCAATGTAGAAAATAACGTCC > 3:1765720/1‑151
GCTCGCCCATTTCATTGACAGCGTACCGGTAATTTCTGTAGCAATAGCCAGACCTAATAAAATCCAATAAATATACATTGTCCTTCTCCTGCAAGAGAATTATTTTAATTTTCGCTTAATTCAGCGAAACCAATGTAGAAAATAACGTCCT > 3:1188410/1‑151
GCTCGCCCATTTCATTGACAGCGTACCGGTAATTTCTGTAGCAATAGCCAGACCTAATAAAATCCAATAAATATACATTGTCCTTCTCCTGCAAGAGAATTATTTTAATTTTCGCTTAATTCAGCGAAACCAATGTAGAAAATAACGTCCT > 8:820306/1‑151
TCGCCCATTTCATTGACAGCGTACCGGTAATTTCTGTAGCAATAGCCAGACCTAATAAAATCCAATAAATATACATTGTCCTTCTCCTGCAAGAGAATTATTTTAATTTTCGCTTAATTCAGCGAAACCAATGTAGAAAATAACGTCCTG > 2:1705303/1‑150
TCGCCCATTTCATTGACAGCGTACCGGTAATTTCTGTAGCAATAGCCAGACCTAATAAAATCCAATAAATATACATTGTCCTTCTCCTGCAAGAGAATTATTTTAATTTTCGCTTAATTCAGCGAAACCAATGTAGAAAATAACGTCCTG > 1:1177000/1‑150
GCCCATTTCATTGACAGCGTACCGGTAATTTCTGTAGCAATAGCCAGACCTAATAAAATCCAATAAATATACATTGTCCTTCTCCTGCAAGAGAATTATTTTAATTTTCGCTTAATTCAGCGAAACCAATGTAGAAAATAACGTCCTGAAC > 5:519402/1‑151
GCCCATTTCATTGACAGCGTACCGGTAATTTCTGTAGCAATAGCCAGACCTAATAAAATCCAATAAATATACATTGTCCTTCTCCTGCAAGAGAATTATTTTAATTTTCGCTTAATTCAGCGAAACCAATGTAGAAAATAACGTCCTGAAC > 7:508881/1‑151
ATTTCATTGACAGCGTACCGGTAATTTCTGTAGCAATAGCCAGACCTAATAAAATCCAATAAATATACATTGTCCTTCTCCTGCAAGAGAATTATTTTAATTTTCGCTTAATTCAGCGAAACCAATGTAGAAAATAACGTCCTGAACAAAT > 5:1645049/1‑151
GACAGCGTACCGGTAATTTCTGTAGCAATAGCCAGACCTAATAAAATCCAATAAATATACATTGTCCTTCTCCTGCAAGAGAATTATTTTAATTTTCGCTTAATTCAGCGAAACCAATGTAGAAAATAACGTCCTGAACAAATTGTCCAT < 3:47510/150‑1
ACAGCGTACCGGTAATTTCTGTAGCAATAGCCAGACCTAATAAAATCCAATAAATATACATTGTCCTTCTCCTGCAAGAGAATTATTTTAATTTTCGCTTAATTCAGCGAAACCAATGTAGAAAATAACGTCCTGAACAAATTGTCCATA > 1:22197/1‑150
AGCGTACCGGTAATTTCTGTAGCAATAGCCAGACCTAATAAAATCCAATAAATATACATTGTCCTTCTCCTGCAAGAGAATTATTTTAATTTTCGCTTAATTCAGCGAAACCAATGTAGAAAATAACGTCCTGAACAAATTGTCCATAAT > 5:1454791/1‑150
AGCGTACCGGTAATTTCTGTACCAATAGCCAGACCTAATAAAATCCAATAAATATACATTGTCCTTCTCCTGCAAGAGAATTATTTTAATTTTCGCTTAATTCACCGAAACCAATGTAGAAAATAACGTCCTGAACAAATTGTCCATAATA < 5:962994/151‑1
CGTACCGGTAATTTCTGTAGCAATAGCCAGACCTAATAAAATCCAATAAATATACATTGTCCTTCTCCTGCAAGAGAATTATTTTAATTTTCGCTTAATTCAGCGAAACCAATGTAGAAAATAACGTCCTGAACAAATTGTCCATAATATT < 2:535716/151‑1
GTACCGGTAATTTCTGTAGCAATAGCCAGACCTAATAAAATCCAATAAATATACATTGTCCTTCTCCTGCAAGAGAATTATTTTAATTTTCGCTTAATTCAGCGAAACCAATGTAGAAAATAACGTCCTGAACAAATTGTCCATAATATTA < 4:152033/151‑1
ACCGGTAATTTCTGTAGCAATAGCCAGACCTAATAAAATCCAATAAATATACATTGTCCTTCTCCTGCAAGAGAATTATTTTAATTTTCGCTTAATTCAGCGAAACCAATGTAGAAAATAACGTCCTGAACAAATTGTCCATAATATTAC < 8:1733856/150‑1
CGGTAATTTCTGTAGCAATAGCCAGACCTAATAAAATCCAATAAATATACATTGTCCTTCTCCTGCAAGAGAATTATTTTAATTTTCGCTTAATTCAGCGAAACCAATGTAGAAAATAACGTCCTGAACAAATTGTCCATAATATTACAAT < 4:851611/151‑1
GGTAATTTCTGTAGCAATAGCCAGACCTAATAAAATCCAATAAATATACATTGTCCTTCTCCTGCAAGAGAATTATTTTAATTTTCGCTTAATTCAGCGAAACCAATGTAGAAAATAACGTCCTGAACAAATTGTCCATAATATTACAATT < 6:431635/151‑1
GGTAATTTCTGTAGCAATAGCCAGACCTAATAAAATCCAATAAATATACATTGTCCTTCTCCTGCAAGAGAATTATTTTAATTTTCGCTTAATTCAGCGAAACCAATGTAGAAAATAACGTCCTGAACAAATTGTCCATAATATTACAATT < 6:231905/151‑1
AATTTCTGTAGCAATAGCCAGACCTAATAAAATCCAATAAATATACATTGTCCTTCTCCTGCAAGAGAATTATTTTAATTTTCGCTTAATTCAGCGAAACCAATGTAGAAAATAACGTCCTGAACAAATTGTCCATAATATTACAATTATC > 8:666003/1‑151
ATTTCTGTAGCAATAGCCAGACCTAATAAAATCCAATAAATATACATTGTCCTTCTCCTGCAAGAGAATTATTTTAATTTTCGCTTAATTCAGCGAAACCAATGTAGAAAATAACGTCCTGAACAAATTGTCCATAATATTACAATTATCC < 7:461161/151‑1
TTCTGTAGCAATAGCCAGACCTAATAAAATCCAATAAATATACATTGTCCTTCTCCTGCAAGAGAATTATTTTAATTTTCGCTTAATTCAGCGAAACCAATGTAGAAAATAACGTCCTGAACAAATTGTCCATAATATTACAATTATCCG < 8:1637067/150‑1
TGTAGCAATAGCCAGACCTAATAAAATCCAATAAATATACATTGTCCTTCTCCTGCAAGAGAATTATTTTAATTTTCGCTTAATTCAGCGAAACAAATGTAGAAAATAACGTCCTGAACAAATTGTCCATAATATTACAATTATCCGCAGT > 8:465805/1‑151
GTAGCAATAGCCAGACCTAATAAAATCCAATAAATATACATTGTCCTTCTCCTGCAAGAGAATTATTTTAATTTTCGCTTAATTCAGCGAAACCAATGTAGAAAATAACGTCCTGAACAAATTGTCCATAATATTACGATTATCCGCAGTG < 6:1036395/151‑1
TAGCAATAGCCAGACCTAATAAAATCCAATAAATATACATTGTCCTTCTCCTGCAAGAGAATTATTTTAATTTTCGCTTAATTCAGCGAAACCAATGTAGAAAATAACGTCCTGAACAAATTGTCCATAATATTACAATTATCCGCAGTGT > 1:818979/1‑151
AGCAATAGCCAGACCTAATAAAATCCAATAAATATACATTGTCCTTCTCCTGCAAGAGTATTATTTTAATTTTCGCTTAATTCAGCGAAACCAATGTAGAAAATAACGTCCTGAACAAATTGTCCATAATATTACAATTATCCGCAGTGTg < 5:292149/151‑2
AGCAATAGCCAGACCTAATAAAATCCAATAAATATACATTGTCCTTCTCCTGCAAGAGAATTATTTTAATTTTCGCTTAATTCAGCGAAACCAATGTAGAAAATAACGTCCTGAACAAATTGTCCATAATATTACAATTATCCGCAGTGT < 4:92889/150‑1
AGCAATAGCCAGACCTAATAAAATCCAATAAATATACATTGTCCTTCTCCTGCAAGAGAATTATTTTAATTTTCGCTTAATTCAGCGAAACCAATGTAGAAAATAACGTCCTGAACAAATTGTCCATAATATTACAATTATCCGCAGTGT < 6:1794790/150‑1
CAATAGCCAGACCTAATAAAATCCAATAAATATACATTGTCCTTCTCCTGCAAGAGAATTATTTTAATTTTCGCTTAATTCAGCGAAACCAATGTAGAAAATAACGTCCTGAACAAATTGTCCATAATATTACAATTATCCGCAGTGTTGC > 1:960207/1‑151
CAATAGCCAGACCTAATAAAATCCAATAAATATACATTGTCCTTCTCCTGCAAGAGAATTATTTTAATTTTCGCTTAATTCAGCGAAACCAATGTAGAAAATAACGTCCTGAACAAATTGTCCATAATATTACAATTATCCGCAGTGTTGC < 6:1485274/151‑1
AATAGCCAGACCTAATAAAATCCAATAAATATACATTGTCCTTCTCCTGCAAGAGAATTATTTTAATTTTCGCTTAATTCAGCGAAACCAATGTAGAAAATAACGTCCTGAACAAATTGTCCATAATATTACAATTATCCGCAGTGTTGCT > 1:1022361/1‑151
TAGCCAGACCTAATAAAATCCAATAAATATACATTGTCCTTCTCCTGCAAGAGAATTATTTTAATTTTCGCTTAATTCAGCGAAACCAATGTAGAAAATAACGTCCTGAACAAATTGTCCATAATATTACAATTATCCGCAGTGTTGCTTC > 5:224134/1‑151
AGCCAGACCTAATAAAATCCAATAAATATACATTGTCCTTCTCCTGCAAGAGAATTATTTTAATTTTCGCTTAATTCAGCGAAACCAATGTAGAAAATAACGTCCTGAACAAATTGTCCATAATATTACAATTATCCGCAGTGTTGCTTCT > 1:1659030/1‑151
GCCAGACCTAATAAAATCCAATAAATATACATTGTCCTTCTCCTGCAAGAGAATTATTTTAATTTTCGCTTAATTCAGCGAAACCAATCTAGAAAATAACGTCCTGAACAAATTGTCCATAATATTACAATTATCCGCAGTGTTGCTTCTC < 5:1751638/151‑1
CAGACCTAATAAAATCCAATAAATATACATTGTCCTTCTCCTGCAAGAGAATTATTTTAATTTTCGCTTAATTCAGCGAAACCAATGTAGAAAATAACGTCCTGAACAAATTGTCCATAATATTACAATTATCCGCAGTGTTGCTTCTCGT > 7:1784551/1‑151
CAGACCTAATAAAATCCAATAAATATACATTGTCCTTCTCCTGCAAGAGAATTATTTTAATTTTCGCTTAATTCAGCGAAACCAATGTAGAAAATAACGTCCTGAACAAATTGTCCATAATATTACAATTATCCGCAGTGTTGCTTCTCGT < 2:847469/151‑1
ACCTAATAAAATCCAATAAATATACATTGTCCTTCTCCTGCAAGAGAATTATTTTAATTTTCGCTTAATTCAGCGAAACCAATGTAGAAAATAACGTCCTGAACAAATTGTCCATAATATTACAATTATCCGCAGTGTTGCTTCTCGTCAT > 8:1264980/1‑151
AATAAAATCCAATAAATATACATTGTCCTTCTCCTGCAAGAGAATTATTTTAATTTTCGCTTAATTCAGCGAAACCAATGTAGAAAATAACGTCCTGAACAAATTGTCCATAATATTACAATTATCCGCAGTGTTGCTTCTCGTCATCGCG > 1:1723926/1‑151
AATAAAATCCAATAAATATACATTGTCCTTCTCCTGCAAGAGAATTATTTTAATTTTCGCTTAATTCAGCGAAACCAATGTAGAAAATAACGTCCTGAACAAATTGTCCATAATATTACAATTATCCGCAGTGTTGCTTCTCGTCATCGCG > 4:55144/1‑151
TAAAATCCAATAAATATACATTGTCCTTCTCCTGCAAGAGAATTATTTTAATTTTCGCTTAATTCAGCGAAACCAATGTAGAAAATAACGTCCTGAACAAATTGTCCATAATATTACAATTATCCGCAGTGTTGCTTCTCGTCATCGCGG > 5:1165668/1‑150
AAAATCCAATAAATATACATTGTCCTTCTCCTGCAAGAGAATTATTTTAATTTTCGCTTAATTCAGCGAAACCAATGTAGAAAATAACGTCCTGAACAAATTGTCCATAATATTACAATTATCCGCAGTGTTGCTTCTCGTCATCGCGGA < 3:1024949/150‑1
CAATAAATATACATTGTCCTTCTCCTGCAAGAGAATTATTTTAATTTTCGCTTAATTCAGCGAAACCAATGTAGAAAATAACGTCCTGAACAAATTGTCCATAATATTACAATTATCCGCAGTGTTGCTTCTCGTCATCGCGGATGATAAT < 6:805255/151‑1
AATAAATATACATTGTCCTTCTCCTGCAAGAGAATTATTTTAATTTTCGCTTAATTCAGCGAAACCAATGTAGAAAATAACGTCCTGAACAAATTGTCCATAATATTACAATTATCCGCAGTGTTGCTTCTCGTCATCGCGGATGATAATT > 7:646756/1‑151
ATAAATATACATTGTCCTTCTCCTGCAAGAGAATTATTTTAATTTTCGCTTAATTCAGCGAAACCAATGTAGAAAATAACGTCCTGAACAAATTGTCCATAATATTACAATTATCCGCAGTGTTGCTTCTCGTCATCGCGGATGATAATTG > 2:367780/1‑151
TAAATATACATTGTCCTTCTCCTGCAAGAGAATTATTTTAATTTTCGCTTAATTCAGCGAAACCAATGTAGAAAATAACGTCCTGAACAAATTGTCCATAATATTACAATTATCCGCAGTGTTGCTTCTCGTCATCGCGGATGATAATTGT > 3:1647615/1‑151
TAAATATACATTGTCCTTCTCCTGCAAGAGAATTATTTTAATTTTCGCTTAATTCAGCGAAACCAATGTAGAAAATAACGTCCTGAACAAATTGTCCATAATATTACAATTATCCGCAGTGTTGCTTCTCGTCATCGCGGATGATAATTGT > 5:718613/1‑151
AATATACATTGTCCTTCTCCTGCAAGAGAATTATTTTAATTTTCGCTTAATTCAGCGAAACCAATGTAGAAAATAACGTCCTGAACAAATTGTCCATAATATTACAATTATCCGCAGTGTTGCTTCTCGTCATCGCGGATGATAATTGTCC > 5:785517/1‑151
AATATACATTGTCCTTCTCCTGCAAGAGAATTATTTTAATTTTCGCTTAATTCAGCGAAACCAATGTAGAAAATAACGTCCTGAACAAATTGTCCATAATATTACAATTATCCGCAGTGTTGCTTCTCGTCATCGCGGATGATAATTGTCC < 4:704989/151‑1
attTACATAGTCCTTCTGGTGCAAGATAATTATTTTAATTTTCGCTTAATTCAGCGATAACAATCTAGATAATAACGTCCTGAACATATTGTACATAATATAACAATTATCCGCAGTGTTGCTTCTCGTCATCGCGGTTGATAATTGTagt < 7:1735023/148‑4
ATACATTGTCCTTCTCCTGCAAGAGAATTATTTTAATTTTCGCTTAATTCAGCGAAACCAATGTAGAAAATAACGTCCTGAACAAATTGTGCTTAATATTACAATTATCCGCAGTGTTGCTTCTCGTCATCGCTGATGATAATTGTCCTCG > 3:995779/1‑151
ATACATTGTCCTTCTCCTGCAAGAGAATTATTTTAATTTTCGCTTAATTCAGCGAAACCAATGTAGAAAATAACGTCCTGAACAAATTGTCCATAATATTACAATTATCCGCAGTGTTGCTTCTCGTCATCGCGGATGATAATTGTCCTCG > 4:105905/1‑151
ACATTGTCCTTCTCCTGCAAGAGAATTATTTTAATTTTCGCTTAATTCAGCGAAACCAATGTAGAAAATAACGTCCTGAACAAATTGTCCATAATATTACAATTATCCGCAGTGTTGCTTCTCGTCATCGCGGATGATAATTGTCCTCGGT > 7:848966/1‑151
ACATTGTCCTTCTCCTGCAAGAGAATTATTTTAATTTTCGCTTAATTCAGCGAAACCAATGTAGAAAATAACGTCCTGAACAAATTGTCCATAATATTACAATTATCCGCAGTGTTGCTTCTCGTCATCGCGGATGATAATTGTCCTCGG < 8:145500/150‑1
CATTGTCCTTCTCCTGCAAGAGAATTATTTTAATTTTCGCTTAATTCAGCGAAACCAATGTAGAAAATAACGTCCTGAACAAATTGTCCATAATATTACAATTATCCGCAGTGTTGCTTCTCGTCATCGCGGATGATAATTGTCCTCGGT > 1:444713/1‑150
GTCCTTCTCCTGCAAGAGAATTATTTTAATTTTCGCTTAATTCAGCGAAACCAATGTAGAAAATAACGTCCTGAACAAATTGTCCATAATATTACAATTATCCGCAGTGTTGCTTCTCGTCATCGCGGATGATAATTGTCCTCGGTAGTT < 8:1356605/150‑1
GTCCTCCTCCTGCAAGAGAATTATTTTAATTTTCGCTTAATTCAGCGAAACCAATGTAGAAAATAACGTCCTGAACAAATTGTCCATAATATTACAATTATCCGCAGTGTTGCTTCTCGTCATCGCGGATGATAATTGTCCTCGGTAGTTG < 5:369077/151‑1
CTTCTCCTGCAAGAGAATTATTTTAATTTTCGCTTAATTCAGCGAAACCAATGTAGAAAATGACGTCCTGAACAAATTGTCCATAATATTACAATTATCCGCAGTGTTGCTTCTCGTCATCGCGGATGATAATTGTCCTCGGTAGTTGAAC > 4:114879/1‑151
TCTCCTGCAAGAGAATTATTTTAATTTTCGCTTAATTCAGCGAAACCAATGTAGAAAATAACGTCCTGAACAAATTGTCCATAATATTACAATTATCCGCAGTGTTGCTTCTCGTCATCGCGGATGATAATTGTCCTCGGTAGTTGAAC < 7:1179454/149‑1
TCTCCTGCAAGAGAATTATTTTAATTTTCGCTTAATTCAGCGAAACCAATGTAGAAAATAACGTCCTGAACAAATTGTCCATAATATTACAATTATCCGCAGTGTTGCTTCTCGTCATCGCGGATGATAATTGTCCTCGGTAGTTGAAC < 6:1157229/149‑1
TGCAAGAGAATTATTTTAATTTTCGCTTAATTCAGCGAAACCAATGTAGAAAATAACGTCCTGAACAAATTGTCCATAATATTACAATTATCCGCAGTGTTGCTTCTCGTCATCGCGGATGATAATTGTCCTCGGTAGTTGAACACGCCTG > 1:608685/1‑151
GAGAATTATTTTAATTTTCGCTTAATTCAGCGAAACCAATGTAGAAAATAACGTCCTGAACAAATTGTCCATAATATTACAATTATCCGCAGTGTTGCTTCTCGTCATCGCGGATGATAATTGTCCTCGGTAGTTGAACACGCCTGATTTG > 3:1486300/1‑151
AGAATTATTTTAATTTTCGCTTAATTCAGCGAAACCAATGTAGAAAATAACGTCCTGAACAAATTGTCCATAATATTACAATTATCCGCAGTGTTGCTTCTCGTCATCGCGGATGATAATTGTCCTCGGTAGTTGAACACGCCTGATTTGT < 5:1258365/151‑1
AGAATTATTTTAATTTTCGCTTAATTCAGCGAAACCAATGTAGAAAATAACGTCCTGAACAAATTGTCCATAATATTACAATTATCCGCAGTGTTGCTTCTCGTCATCGCGGATGATAATTGTCCTCGGTAGTTGAACACGCCTGATTTGT < 1:1507983/151‑1
TATTTTAATTTTCGCTTAATTCAGCGAAACCAATGTAGAAAATAACGTCCTGAACAAATTGTCCATAATATTACAATTATCCGCAGTGTTGCTTCTCGTCATCGCGGATGATAATTGTCCTCGGTAGTTGAACACGCCTGATTTGTATCAT > 6:1575568/1‑151
TATTTTAATTTTCGCTTAATTCAGCGAAACCAATGTAGAAAATAACGTCCTGAACAAATTGTCCATAATATTAAAATTATCCGCAGTTTTGCTTATCGTCATCGAGGATGATAATTGTCCTCGGTAGTTGAACACGCCTGATTTGTATCAT > 7:784726/1‑151
TTTAATTTTCGCTTAATTCAGCGAAACCAATGTAGAAAATAACGTCCTGAACAAATTGTCCATAATATTACAATTATCCGCAGTGTTGCTTCTCGTCATCGCGGATGATAATTGTCCTCGGTAGTTGAACACGCCTGATTTGTATCATAG < 1:1388863/150‑1
TTTAATTTTCGCTTAATTCAGCGAAACCAATGTAGAAAATAACGTCCTGAACAAATTGTCCATAATATTACAATTATCCGCAGTGTTGCTTCTCGTCATCGCGGATGATAATTGTCCTCGGTAGTTGAACACGCCTGATTTGTATCATAG < 8:30016/150‑1
AATTTTCGCTTAATTCAGCGAAACCAATGTAGAAAATAACGTCCTGAACAAATTGTCCATAATATTACAATTATCCGCAGTGTTGCTTCTCGTCATCGCGGATGATAATTGTCCTCGGTAGTTGAACACGCCTGATTTGTATCATAGCTTA < 1:1077770/151‑1
AATTTTCGCTTAATTCAGCGAAACCAATGTAGAAAATAACGTCCTGAACAAATTGTCCATAATATTACAATTATCCGCAGTGTTGCTTCTCGTCATCGCGGATGATAATTGTCCTCGGTAGTTGAACACGCCTGATTTGTATCATAGCTT < 2:676758/150‑1
AATTTTCGCTTAATTCAGCGAAACCAATGTAGAAAATAACGTCCTGAACAAATTGTCCATAATATTACAATTATCCGCAGTGTTGCTTCTCGTCATCGCGGATGATAATTGTCCTCGGTAGTTGAACACGCCTGATTTGTATCATAGCTT < 3:214557/150‑1
ATTTTCGCTTAATTCAGCGAAACCAATGTAGAAAATAACGTCCTGAACAAATTGTCCATAATATTACAATTATCCGCAGTGTTGCTTCTCGTCATCGCGGATGATAATTGTCCTCGGTAGTTGAACACGCCTGATTTGTATGATAGCTTA > 4:1735898/1‑150
TTTTCGCTTAATTCAGCGAAACCAATGTAGAAAATAACGTCATGAACAAATTGTCCATAATATTACAATTATCCGCAGTGTTGCTTCTCGTCATCGCGGATGATAATTGTCATCGGTAGTTGAAGACGAGTGATTTGTATCATAGCTTA > 2:239967/1‑149
TTTCGCTTAATTCAGCGAAACCAATGTAGAAAATAACGTCCTGAACAAATTGTCCATAATATTACAATTATCCGCAGTGTTGCTTCTCGTCATCGCGGATGATAATTGTCCTCGGTAGTTGAACACGCCTGATTTGTATCATAGCTTAAG < 2:1079038/150‑1
TTTCGCTTAATTCAGCGAAACCAATGTAGAAAATAACGTCCTGAACAAATTGTCCATAATATTACAATTATCCGCAGTGTTGCTTCTCGTCATCGCGGATGATAATTGTCCTCGGTAGTTGAACACGCCTGATTTGTATCATAGCTTAAG < 6:751469/150‑1
TTCGCTTAATTCAGCGAAACCAATGTAGAAAATAACGTCCTGAACAAATTGTCCATAATATTACAATTATCCGCAGTGTTGCTTCTCGTCATCGCGGATGATAATTGTCCTCGGTAGTTGAACCCGCCTGATTTGTATCATAGCATAAGA > 4:293479/1‑150
TTCGCTTAATTCAGCGAAACCAATGTAGAAAATAACGTCCTGAACAAATTGTCCATAATATTACAATTATCCGCAGTGTTGCTTCTCGTCATCGCGGATGATAATTGTCCTCGGTAGTTGAACACGCCTGATTTGTATCATAGCTTAAGA < 2:1412983/150‑1
CGCTTAATTCAGCGAAACCAATGTAGAAAATAACGTCCTGAACAAATTGTCCATAATATTACAATTATCCGCAGTGTTGCTTCTCGTCATCGCGGATGATAATTGTCCTCGGTAGTTGAACACGCCTGATTTGTATCATAGCTTAAGAATT < 8:1002393/151‑1
GCTTAATTCAGCGAAACCAATGTAGAAAATAACGTCCTGAACAAATTGTCCATAATATTACAATTATCCGCAGTGTTGCTTCTCGTCATCGCGGATGATAATTGTCCTCGGTAGTTGAACACGCCTGATTTGTATCATAGCTTAAGAATTA < 3:578040/151‑1
TTAATTCAGCGAAACCAATGTAGAAAATAACGTCCTGAACAAATTGTCCATAATATTACAATTATCCGCAGTGTTGCTTCTCGTCATCGCGGATGATAATTGTCCTCGGTAGTTGAACACGCCTGATTTGTATCATAGCTTAAGAATTAAC > 8:229753/1‑151
TAATTCAGCGAAACCAATGTAGAAAATAACGTCCTGAACAAATTGTCCATAATATTACAATTATCCGCAGTGTTGCTTCTCGTCATCGCGGATGATAATTGTCCTCGGTAGTTGAACACGCCTGATTTGTATCATAGCTTAAGAATTAACT > 3:89314/1‑151
AATTCAGCGAAACCAATGTAGAAAATAACGTCCTGAACAAATTGTCCATAATATTACAATTATCCGCAGTGTTGCTTCTCGTCATCGCGGATGATAATTGTCCTCGGTAGTTGAACACGCCTGATTTGTATCATAGCTTAAGAATTAACTC < 1:1262834/151‑1
ATTCAGCGAAACCAATGTAGAAAATAACGTCCTGAACAAATTGTCCATAATATTACAATTATCCGCAGTGTTGCTTCTCGTCATCGCGGATGATAATTGTCCTCGGTAGTTGAACACGCCTGATTTGTATCATAGCTTAAGAATTAACTCA < 1:479733/151‑1
ATTCAGCGAAACCAATGTAGAAAATAACGTCCTGAACAAATTGTCCATAATATTACAATTATCCGCAGTGTTGCTTCTCGTCATCGCGGATGATAATTGTCCTCGGTAGTTGAACACGCCTGATTTGTATCATAGCTTAAGAATTAACTC > 8:1506778/1‑150
ATTCAGCGAAACCAATGTAGAAAATAACGTCCTGAACAAATTGTCCATAATATTACAA‑TATCCGCAGTGTTGCTTCTCGTCATCGCGGATGATAATTGTCCTCGGTAGTTGAACACGCCTGATTTGTATCATAGCTTAAGAATTAACTCAA < 4:1337891/151‑1
TCAGCGAAACCAATGTAGAAAATAACGTCCTGAACAAATTGTCCATAATATTACAATTATCCGCAGTGTTGCTTCTCGTCATCGCGGATGATAATTGTCCTCGGTAGTTGAACACGCCTGATTTGTATCATAGCTTAAGAATTAACTCAA < 7:1031988/150‑1
CAGCGAAACCAATGTAGAAAATAACGTCCTGAACAAATTGTCCATAATATTACAATTATCCGCAGTGTTGCTTCTCGTCATCGCGGATGATAATTGTCCTCGGTAGTTGAACACGCCTGATTTGTATCATAGCTTAAGAATTAACTCAAA < 5:824030/150‑1
AGCGAAACCAATGTAGAAAATAACGTCCTGAACAAATTGTCCATAATATTACAATTATCCGCAGTGTTGCTTCTCGTCATCGCGGATGATAATTGTCCTCGGTAGTTGAACACGCCTGATTTGTATCATAGCTTAAGAATTAACTCAAAAT > 3:1354040/1‑151
GCGAAACCAATGTAGAAAATAACGTCCTGAACAAATTGTCCATAATATTACAATTATCCGCAGTGTTGCTTCTCGTCATCGCGGATGATAATTGTCCTCGGTAGTTGAACACGCCTGATTTGTATCATAGCTTAAGAATTAACTCAAAAT > 1:291730/1‑150
GAAACCAATGTAGAAAATAACGTCCTGAACAAATTGTCCATAATATTACAATTATCCGCAGTGTTGCTTCTCGTCATCGCGGATGATAATTGTCCTCGGTAGTTGAACACGCCTGATTTGTATCATAGCTTAAGAATTAACTCAAAATATT > 2:958528/1‑151
AAACCAATGTAGAAAATAACGTCCTGAACAAATTGTCCATAATATTACAATTATCCGCAGTGTTGCTTCTCGTCATCGCGGATGATAATTGTCCTCGGTAGTTGAACACGCCTGATTTGTATCATAGCTTAAGAATTACCTCAAAATATTT > 2:431199/1‑151
AACCAATGTAGAAAATAACGTCCTGAACAAATTGTCCATAATATTACAATTATCCGCAGTGTTGCTTCTCGTCATCGCGGATGATAATTGTCCTCGGTAGTTGAACACGCCTGATTTGTATCATAGCTTAAGAATTAACTCAAAATATTTT > 4:430191/1‑151
CGCCATTTCCCTCACTGACGCTCGCCCATTTCATTGACAGCGTACCGGTAATTTCTGTAGCAATAGCCAGACCTAATAAAATCCAATAAATATACATTGTCCTTCTCCTGCAAGAGAATTATTTTAATTTTCGCTTAATTCAGCGAAACCAA‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > NC_000913/1673405‑1673556
‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑aaTGTAGAAAATAACGTCCTGAACAAATTGTCCATAATATTACAATTATCCGCAGTGTTGCTTCTCGTCATCGCGGATGATAATTGTCCTCGGTAGTTGAACACGCCTGATTTGTATCATAGCTTAAGAATTAACTCAAAATATTTTCACTT > NC_000913/1673677‑1673826
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
|---|
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |
GATK/CNVnator alignment
N/A
