Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A3 F9 I0 R1
|
113 |
83.2 |
1840812 |
91.6% |
1686183 |
224.4 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
freq |
annotation |
gene |
description |
| RA |
NC_000913 |
1,158,048 |
A→C |
24.6% |
P60P (CCA→CCC) |
ptsG → |
fused glucose‑specific PTS enzymes: IIB component/IIC component |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | NC_000913 | 1,158,048 | 0 | A | C | 24.6%
| 51.4
/ 3.4
| 43 | P60P (CCA→CCC) | ptsG | fused glucose‑specific PTS enzymes: IIB component/IIC component |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (13/18); new base C (10/2); total (23/20) |
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.93e-02 |
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
TGAGAACGTAAAAAAAGCACCCATACTCAGGAGCACTCTCAATTATGTTTAAGAATGCATTTGCTAACCTGCAAAAGGTCGGTAAATCGCTGATGCTGCCGGTATCCGTACTGCCTATCGCAGGTATTCTGCTGGGCGTCGGTTCCGCGAATTTCAGCTGGCTGCCCGCCGTTGTATCGCATGTTATGGCAGAAGCAGGCGGTTCCGTCTTTGC‑AAACA‑TGCCACTGATTTTTGCGATCGGTGTCGCCCTCGGCTTTACC‑AATAACGATGGCGTATCCGCGCTGG‑CCGCAGTTGTTGCCTATGGCAT‑CATGGTTAAAAC‑CATGGCCGTGGTTGCGCCACTGGTACTGCATTTACCTGCTGAAGAAATCGCCTCTAAACACCTGGCGGATACTGGCGTACTCGGAGGGATTATCTCCGGTGCGATCGCAGCGTACATGTTTAACCGTTTCTA > NC_000913/1157825‑1158275
|
tgaaaaaaaaaaaaaaGCCCCCATTCTGAGGAACATTCCAAATTTTTTTTAAAAATTAATTTGTCAACGTGAAAAGGGGGGATAAATCGCTGAGGCGGCGGGTACCCGTCCTGCTTACCGCGGGTTTTCTGCGGGGGGTCGGTTCCGGAAATTTCAGCGGGTTCCCCGCCGTTGTATCGCATGTTATGGCAGAAGCAGGCGGTTCCGTCTTTGC‑AAACA‑TGCCACTGATTTTTGCGAt < 2:866685/229‑1 (MQ=255)
aaCGTAAAAAAAGCACCCATACTCAGGAGCACTCTCAATTATGTTTAAGAATGCATTTGCTAACCTGCAAAAGGTCGGTAAATCGCTGATGCTGCCGGTATCCGTACTGCCTATCGCAGGTATTCTGCTGGGCGTCGGTTCCGCGAATTTCAGCTGGCTGCCCGCCGTTGTATCGCATGTTATGGCAGAAGCAGGCGGGTCCGCCTTTGC‑AAACC‑TGCCCCCGATTTTTTCGTTCGgtg > 1:134557/1‑239 (MQ=255)
tAAAAAAAGCACCCATACTCAGGAGCACTCTCAATTATGTTTAAGAATGCATTTGCTAACCTGCAAAAGGTCGGTAAATCGCTGATGCTGCCGGTATCCGTACTGCCTATCGCAGGTATTCTGCTGGGCGTCGGTTCCGCGAATTTCAGCTGGCTGCCCGCCGTTGTATCGCATGTTATGGCAGAAGCAGGCGGTTCCGTCTTTTC‑AAACA‑AGCCACTGATTTTTGCgcttgggtttg > 1:740922/1‑228 (MQ=255)
aaaaaaaGCACCCATACTCAGGAGCACTCTCAATTATGTTTAAGAATGCATTTGCTAACCTGCAAAAGGTCGGTAAATCGCTGATGCTGCCGGTATCCGTACTGCCTATCGCAGGTATTCTGCTGGGCGTCGGTTCCGCGAATTTCAGCTGGCTGCCCGCCGTTGTATCGCATGTTATGGCAGAAGCAGGCGGTTCCCGCCTTGCAAAACT‑TGCCACCGATTTTTGCGTTCGgttggg > 1:866685/1‑234 (MQ=255)
aaaaaaGCACCCATACTCAGGAGCTCTCTCAATTATGTTTAAGAATGCATTTGCTAACCTGCAAAAGGTCGGTAAATCGCTGATGCGGCCGGTATCCGTACGGCCTATCGCAGGTATTCGGCTGGGCGTCGGTTCCGCGAATTTCAGCTGGCTGCCCGCCGTTGTATCGCATGTTATGGCAGAAGCAGGCGGTTCCGTCTTTGC‑AAACA‑TGCCACTGATTTTTGCGATCGGTGTCGccc < 1:552378/239‑1 (MQ=255)
acatattcTCAGGAGCCCTTTCAATTATTTTTAAGAATGCTTTTGCTAACCGACAAAGGTGTGGTAAATCGCGGATGCTGCCGGTATCCGTGCGGCCTGGCGCAGGTATTCTGCTGGGCGGCGGTTCCGCGAATTTCAGCGGGCTGCCCGCCGTTGTATCGCATGTTATGGCAGAAGCAGGCGGTTCCGTCTTTGC‑AAACA‑TGCCACTGATTTTTGCGATCGGTGTCGCCCTCGGCtt < 2:213927/231‑1 (MQ=255)
gAGCACTCTCAATTATGTTTAAGAATGCATTTGCTAACCTGCAAAAGGTCGGTAAATCGCTGATGCTGCCGGTATCCGTACTGCCTATCGCAGGTATTCTGCTGGGCGTCGGTTCCGCGAATTTCAGCTGGCTGCCCGCCGTTGTATCGCATGTTCTGCCAGAAGCCGGCGGGTTCGTCTTTGC‑AAACA‑TACCCATGCTTTTTTGGATCGGTGTGGcccccccgctttcccaaaca > 2:173989/1‑219 (MQ=255)
cACTCTCAATTATGTTTAAGAATGCATTTGCTAACCTGCAAAAGGTCGGTAAATCGCTGATGCTGCCGGTATCCGTACTGCCTATCGCAGGTATTCTGCTGGGCGTCGGTTCCGCGAATTTCAGCTGGCTGCCCGCCGTTGTATCGCATGTTATGTCAGAAGCAGGCGGTTCCGTCTTTTC‑AAACA‑TGCACCTGATTTTTGCGGTCGGGGTCGCCCTCGGCTTTTCC‑CATAAcagaggg > 1:746552/1‑233 (MQ=255)
cACTCTCAATTATGTTTAAGAATGCATTTGCTAACCTGCAAAAGGTCGGTAAATCGCTGATGCTGCCGGTATCCGTACTGCCTATCGCAGGTATTCTGCTGGGCGTCGGTTCCGCGAATTTCAGCTGGCTGCCCGCCGTTGTATCGCATGTTATGGCAGAAGCAGGCGGTTCCGGCTTTGC‑CAACA‑TGCCACTGATTTTTTCGATCGGTGTCGCCCCCGGCTTTACC‑AATAAccctgtg > 1:213927/1‑233 (MQ=255)
cACTCTCAATTATGTTTAAGAATGCATTTGCTAACCTGCAAAAGGTCGGTAAATCGCTGATGCTGCCGGTATCCGTACTGCCTATCGCAGGTATTCTGCTGGGCGTCGGTTCCGCGAATTTCAGCTGGCTGCCCGCCGTTGTATCGCATGTTATGGCAGAAGCAGGCGGTTCCGCCTTTGC‑AAAAA‑TGCCCCTGATTTTTGCGATCGGGGTTGCCCTCGGGTTTACc‑aacaaactaggg > 1:799535/1‑232 (MQ=255)
cACTCTCAATTATGTTTAAGAATGCATTTGCTAACCTGCAAAAGGTCGGTAAATCGCTGATGCTGCCGGTATCCGTACTGCCTATCGCAGGTATTCTGCTGGGCGTCGGTTCCGCGAATTTCAGCTGGCTGCCCGCCGTTGTATCGCATGTTATGGCAGAAGCAGGCGGGTCCGCCTTTTC‑AAAAC‑TGCCCCCCCTTTTTGTGGTCGGCGTTGCCCGCCGGTTTaaaaaaaaaaagggg > 2:848056/1‑225 (MQ=255)
tctcAATTATGTTTAAGAATGCATTTGCTAACCTGCAAAAGGTCGGTAAATCGCTGATGCTGCCGGTATCCGTACTGCCTATCGCAGGTATTCTGCTGGGCGTCGGTTCCGCGAATTTCAGCTGGCTGCCCGCCGTTGTATCGCATGTTATGGCAGAAGCAGGCGGTTCCGCCTTTGC‑AAACC‑TGCCACTGATTTTTTCGGTCGGCGTCGCCCCCGGCTTTACC‑CATACCCATTGCgg > 1:803053/1‑237 (MQ=255)
aaTTATGTTTAAGAATGCATTTGCTAACCTGCAAAAGGTCGGTAAATCGCTGATGCTGCCGGTATCCGTACTGCCTATCGCAGGTATTCTGCTGGGCGTCGGTTCCGCGAATTTCAGCTGGCTGCCCGCCGTTGTATCGCATGTTATGGCAGAAGCAGGCGGTTCCGTCTTTTC‑CAAAA‑TGCCCCTGATTTTTTCGATCGGGGTGGCCCCCGGCCTTTCC‑CAAAACACTGGCGTATcc > 1:789545/1‑238 (MQ=255)
aaTTATGTTTAAGAATGCATTTGCTAACCTGCAAAAGGTCGGTAAATCGCTGATGCTGCCGGTATCCGTACTGCCTATCGCAGGTATTCTGCTGGGCGTCGGTTCCGCGAATTTCAGCTGGCTGCCCGCCGTTGTATCGCATGTTATGGCAGAAGCAGGCGGTGCCGTCTTTTG‑AAACA‑TGCCACTGGTTTTTTGGACTGGTGTTGCCCTCCGCTTTCGC‑AACAACGACGGCGTAAcc > 1:560864/1‑238 (MQ=255)
ttAAGAATGCATTTGCTAACCTGCAAAAGGTCGGTAAATCGCTGATGCTGCCGGTATCCGTACTGCCTATCGCAGGTATTCTGCTGGGCGTCGGTTCCGCGAATTTCAGCTGGCTGCCCGCCGTTGTATCGCATGTTATGGCAGAAGCAGGCGGTTCCCCTTTTGC‑AAACA‑TGCCACTGATTTTTTGGATCCGTGTCGCCCTCCGCTTTACC‑CAAAAACAAGGCGCATCGCCGCTggg > 1:10280/1‑237 (MQ=255)
aaGAATGCATTTGCTAACCTGCAAAAGGTCGGTAAATCGCTGATGCTGCCGGTATCCGTACTGCCTATCGCAGGTATTCTGCTGGGCGTCGGTTCCGCGAATTTCAGCTGGCTGCCCGCCGTTGTATCGCATGTTATGGCAGAAGCAGGCGGTTCCGTCTTTGC‑CAAAA‑TGCCACTGATTTTTTCGGTCGGTGTCGCCCCCGGGCTTTCC‑AATAACgcacgttccttatacacctccc > 1:280439/1‑217 (MQ=255)
tggcttggCTCACCTGAAAAAGGGCGGTAAATCGCGGAGCCGGCCGGTTCCGGTACGGCCTACCGCAGTTATTCTGCTGGGGGTCGGTTCCGCGAATTTCAGCGGGTTGCCCGCCGTTGTATCGCATGTTATGGCAGAAGCAGGCGGTTCCGTCTTTGC‑AAACA‑TGCCACTGATTTTTGCGATCGGTGTCGCCCTCGGCTTTACC‑AATAACGATGGCGTATCCGCGCTGG‑CCGCAgttg < 1:349002/232‑1 (MQ=255)
tCGGTAAATCGCTGATGCTGCCGGTATCCGTACTGCCTATCGCAGGTATTCTGCTGGGCGTCGGTTCCGCGAATTTCAGCTGGCTGCCCGCCGTTGTATCGCATGTTATGGCAGACGCAGGCGGTTCCGTCTTTTG‑AACCA‑TGCCCCCTATTTTTTCGATCGGTGTCTCCCCCGGGTTTTCCAAATAAC‑ATGGCGGTTCCCCCCTGG‑CCCGCGTTGTTGCCCATGGcac‑caaaggtaaa > 2:377695/1‑231 (MQ=255)
tCGGTAAATCGCTGATGCTGCCGGTATCCGTACTGCCTATCGCAGGTATTCTGCTGGGCGTCGGTTCCGCAAATTTCAGCTGGCTGCCCGCCGTTGTATCGCATGTTATGGCAGAAGCAGGCGGTTCCGTCTTTGC‑AAACC‑TGCCACTGATTTTTGCGATCGGTGGCACCCTCCGCTTTAAC‑AAAAACGATTGCGTATCCGCGCTGG‑CCGCAGTTGTTGCCTATGGccacaatggtaaa > 2:344604/1‑227 (MQ=255)
aTGCTGCCGGTATCCGTACTGCCTATCGCAGGTATTCTGCTGGGCGTCGGTTCCGCGAATTTCAGCTGGCTGCCCGCCGTTGTATCGCATGTTATGGCAGAAGCAGGCGGTTTCCTCTTTGC‑AAAAA‑TTCCCCTGGTTTTTTCGGTTGGTGGTGCCCCCGGCTTTTCC‑CATAAACAAGGCGTTTCCCCCCCTG‑CCGCCGTTTTTGCCCTTGGCCT‑CCTGGGTaaaaaccaggcccgggg > 2:700269/1‑226 (MQ=255)
tgcCGGTCTCCGTTCTGCCTAGCCCAGGATTTCTTCTGGGCGCCGGTTCCGGGAATTTCAGGTGGCTCCCCTCCGTTGTACCGCATGTTATGGCAGAAGCAGGCGGTTCCGTCTTTGC‑AAACA‑TGCCACTGATTTTTGCGATCGGTGTCGCCCTCGGCTTTACC‑AATAACGATGGCGTATCCGCGCTGG‑CCGCAGTTGTTGCCTATGGCAT‑CATGGTTAAAAC‑CATGGCCGTGGTTgc < 1:464256/238‑1 (MQ=255)
ccGTTCTGCCTATCGCGTGTATTCTGCTGGGCGTGGGTTCCGCGAATTTCAGCTGGCTGCCCGCCGTTGTATCGCATGTTATGGCAGAAGCAGGCGGTTCCGTCTTTGC‑AAACA‑TGCCACTGATTTTTGCGATCGGTGTCGCCCTCGGCTTTACC‑AATAACGATGGCGTATCCGCGCTGG‑CCGCAGTTGTTGCCTATGGCAT‑CATGGTTAAAAC‑CATGGCCGTGGTTGCGCCACTGGTa < 1:700269/239‑1 (MQ=255)
gTACTTCCTATCGGAGTTTTTCTGTGGGGCGTCGGTTCCGGGAATTTCAGTTGGCTGCCCGCCGTTGTATCGCATGTTATGGCAGAAGCAGGCGGTTCCGTCTTTGC‑AAACA‑TGCCACTGATTTTTGCGATCGGTGTCGCCCTCGGCTTTACC‑AATAACGATGGCGTATCCGCGCTGG‑CCGCAGTTGTTGCCTATGGCAT‑CATGGTTAAAAC‑CATGGCCGTGGTTGCGCCACTGGTACt < 1:330596/239‑1 (MQ=255)
tACTGCCTATCGCAGGTATTCTGCTGGGCGTCGGTTCCGCGAATTTCAGCTGGCTGCCCGCCGTTGTATCGCATGTTATGGCAGAAGCAGGCGGGTCCGTCTTTGC‑CAAAA‑TGCCACCGATTTTTTGGATCGGTGGCGCCCCCCGCTTTACC‑CATAAAGATGGCGGATCCGCTGTGG‑CCGCCGGTGTTGCCTTAGGCAA‑CAATGTTTAAAC‑AAAGGCCggggggtggcgacggggacgg > 2:451864/1‑222 (MQ=255)
ccTATCGCAGGTATTCTGCTGGGCGTCGGTTCCGCGAATTTCAGCTGGCTGCCCGCCGTTGTATCGCATGTTATGGCAGAAGCAGGCGGTTCCGGCTTTGC‑CAACA‑TGCCACTGATTTTTTCGATCCGCGTTGCCCTCGGCCTTACC‑CATAACGCTGTCCGTTCCCCGCTGG‑CCGCCGGTGTGGCCCAAGGCCT‑TCCGGTTTAAAC‑CCTGGCCCTGGTTGCGCCACTCGTGCCGCCttt > 2:510563/1‑239 (MQ=255)
aTCGCAGGTATTCTGCTGGGCGTCGGTTCCGCGAATTTCAGCTGGCTGCCCGCCGTTGTATCGCATGTTATGGCAGAAGCAGGCGGTTCCCGCTTTGC‑AAAAA‑TTCCCCTGATTTTTGGGATTGGGGTCGCCCCCGGCTTTTCC‑AATAACACAGGCGTATCCCCCCCGG‑CCGCAGTGTGTGCCCACGGCCT‑CAGCGGTAAAACACTTGGCCGGGTTGGCCCCAcggtcagtcattttc > 2:781566/1‑224 (MQ=255)
ttgcgggggggctgTTCCGAGAATTGCAGTGGGTTGCCCGCCGTTGTATCGCATGTTAGGGCAGAAGGAGGCGGTTCCGTCTTTGC‑AAACA‑TGCCACTGATTTTTGCGATCGGTGTCGCCCTCGGCTTTACC‑AATAACGATGGCGTATCCGCGCTGG‑CCGCAGTTGTTGCCTATGGCAT‑CATGGTTAAAAC‑CATGGCCGTGGTTGCGCCACTGGTACTGCATTTACCTGCTGAAGAAAt < 2:696336/226‑1 (MQ=255)
cGTCGGTTCCGCGAATTTCAGCTGGCTGCCCGCCGTTGTATCGCATGTTATGGCAGAAGCAGGCGGTTCCGTCTTTGC‑AAACA‑TGCCACTGGTTTTTTCGATCGGTGTCGCCCTCGGCTTTTCC‑AATAACGATGGCGTATCCGCGCTGG‑CCGCCGTTGTTGCCCATGGCAT‑CATGGTTAAAAA‑CATGGCCGTGGTTGCGCCCCTGGTACTGCATTTACCACCTGAAGAAATCGCctctt > 1:14969/1‑238 (MQ=255)
cGGTTCCGCGAATTTCAGCTGGCTGCCCGCCGTTGTATCGCATGTTATGGCAGAAGCAGGCGGTTCCGCCTTTGC‑AAACA‑TACCAATGATTTTTTCCATCGGAGTCGCCCCCGCCTTTTCC‑CATAACGCTCGCGTATCCGCCCTGGCCCCCAGTGTTTGCC‑AAGGCAT‑CATGCGTAAAAA‑CACGGCCCGGCGCGCGCCACCGGTACTGCATTTcccctctacagaaactcactctaaac > 2:380074/1‑216 (MQ=255)
ttCAGCTGGCTGCCCGCCGTTGTATCGCATGTTATGGCAGAAGCAGGCGGTTCCGGCTTTTG‑AAAAA‑TGCCACTGATTTTTGCGATCGGGGTCGCCCTCGGCTTTACC‑AATAAAGAAGGCCGATCCGCGCCGG‑CCGCCGTTGGTGCCTACTGCATGCAGGTTTAAAAC‑C‑TGGGCGGGGGTGCCCCCCCGGGGACGCATTTTCCTTCGGAAAAAAGCACCCCCAAAAACCCCGCGGAtca > 2:94206/1‑237 (MQ=255)
ggggtgCCCCCCGTTGTATCGCATGTTATGGCAGAAGCGGGCGGTTCCGTCTTTGC‑AAACA‑TGCCACTGATTTTTGCGAACGGTGGCGCCCTCGGCTTTACC‑AATAACGATGGCGTATCCGCGCTGG‑CCGCAGTTGTTGCCTATGGCAT‑CATGGTTAAAAC‑CATGGCCGTGGTTGCGCCACTGGTACTGCATTTACCTGCTGAAGAAATCGCCTCTAAACACCTGGCGGATACTGGCg < 1:510563/234‑1 (MQ=255)
gCCCGCCGTTGTTCCGCATTTTATGGCAGAAGCAGGCGGTTCCGTCTTTGC‑AAACA‑TGCCACTGATTTTTGCGATCGGTGTCGCCCTCGGCTTTACC‑AATAACGATGGCGTATCCGCGCTGG‑CCGCAGTTGTTGCCTATGGCAT‑CATGGTTAAAAC‑CATGGCCGTGGTTGCGCCACTGGTACTGCATTTACCTGCTGAAGAAATCGCCTCTAAACACCTGGCGGATACTGGCGTACTCg < 1:393333/239‑1 (MQ=255)
ccgccgTTGTATCGCATTTTATGGCAGAAGCAGGCGGTTCCGTCTTTGC‑AAACA‑TGCCACTGATTTTTGCGATCGGTGTCGCCCTCGGCTTTACC‑AATAACGATGGCGTATCCGCGCTGG‑CCGCAGTTGTTGCCTATGGCAT‑CATGGTTAAAAC‑CATGGCCGTGGTTGCGCCACTGGTACTGCATTTACCTGCTGAAGAAATCGCCTCTAAACACCTGGCGGATACTGGCGTACTCgg < 1:399586/238‑1 (MQ=255)
cATGTTATGGCAGAAGCAGGCGGTTCCGTCTTTGC‑AAACA‑TGCCCCTGATTTTTTCGATCGGTGTCGCCCTCGGCTTTACC‑AATAACGATGGCGGATCCCCGCTGG‑CCGCAGGTGTTGCCTATGGCAT‑CATGGGTAAAAC‑CATGGCCGTGGTTTCGCCCCCTGTACTGCATTTACCTGCTGAAGAAAACGCCTCTTAACACCTTGCGGATACTGGCGGACTCgggggggatttttcccg > 1:705041/1‑228 (MQ=255)
gTTATGGCAGAAGCAGGCGGTTCCGTCTTTGC‑AAACA‑TGCCACTGATTTTTGCGATCGGTGTCGCCCTCGGCTTTACC‑AATAACGATGGCGTATCCGCGCTGG‑CCGCAGTTGTTGCCTATGGCAT‑CATGGTTAAAAC‑CATGGCCGTGGTTGCGCCACTGGTACTGCATTTAcc < 1:531536/173‑1 (MQ=255)
ggcgaaagtgggCGGTCCCGTCTTTGC‑AAACA‑TGCCACTGATTTTTGCGATCGGTGTCGCCCTCGGCTTTACC‑AATAACGATGGCGTATCCGCGCTGG‑CCGCAGTTGTTGCCTATGGCAT‑CATGGTTAAAAC‑CATGGCCGTGGTTGCGCCACTGGTACTGCATTTACCTGCTGAAGAAATCGCCTCTAAACACCTGGCGGATACTGGCGTACTCGGAGGGATTATCTCCGGTGCGATCg < 2:705041/229‑1 (MQ=255)
tgcaagaagggggggtctcgtttttC‑AAACACTGCCACGGGTTTGTGCGACCGGTGTGGCCCTCGGTTTTACC‑AATAACGTTGGCGTATCCGCGGTGG‑ACTCAGTTGTTGCCTATGGCAT‑CATGGTTAAAAC‑CATGGCCGGGGTTGCGCCACTGGTACTGCATTTACCTGCTGAAGAAATCGCCTCTAAACGCCTGGCGGATACTGGCGTACTCGGAGGGATTATCTCCGGTGCGATCg < 2:708308/218‑1 (MQ=255)
caagacgcgCGGTTCCGTCTTTGC‑AAACA‑TGCACCTTATTTTTGCGTGCGGTGGCGCCCTCGGCTTTACC‑AATAACGGTGGCGTATCCGCGCTGG‑CCGCAGTTGTTGCCTATGGCAT‑CATGGTTAAAAC‑CATGGCCGTGGTTGAGCCACTGGTACTGCATTTACCTGCTGAAGAAATCGCCTCTAAACACCTGGCGGATACTGGCGTACTCGGAGGGATTATCTCCGGTGCGATCGCa < 2:560864/230‑1 (MQ=255)
aGGCGGTTCCGTCTTTGC‑AAACA‑GGCCACTGATTTTTGCGATCGGTGTCGCCCTCGGCTTTACC‑AATAACGATGGCGTATCCGCGCTGG‑CCGCAGTTGTTGCCTATGGCAT‑CATGGTTAAAAC‑CATGGCCGTGGTTGCGCCACTGGTACTGCATTTACCTGCTGAAGAAATCGCCTCTAAACACCTGGCGGATACTGGCGTACTCGGAGGGATTATCTCCGGTGCGATCGCAGCGTa < 1:872664/237‑1 (MQ=255)
tCCTTCTTTTG‑AAACA‑TTGCCCTGAGTTTTTGGATCGGGGGCGCCCTCGGGTTTCCC‑ATGAACGATGGCGTGCCCGCGCTGG‑CCGCAGGTGTTGCCTAGGGCAT‑CATGGTTAAAAC‑CAGGGCCGTGGTTGCGCCTCGGGTACTGCATTTACCGGCTGAAGAAATCGCCTCTAAACACCTGGCGGATACTGGCGTACTCGGAGGGATTATCTCCGGTGCGAACGCAGCGTACATGTTTa < 2:563407/238‑1 (MQ=255)
tGC‑AAACA‑TGCCATTGATTTTTGGGGTGGGTTGCCCCCTCGGCTTTACC‑AATAACGATGGCGTATCCGCGCTGG‑CCGCAGTTGTTGCCTATGGCAT‑CATGGTTAAAAC‑CATGGCCGTGGTTGCGCCACTGGTACTGCATTTACCTGCTGAAGAAATCGCCTCTAAACACCTGGCGGATACTGGCGTACTCGGAGGGATTATCTCCGGTGCGATCGCAGCGTACATGTTTAACCGTTTCt < 2:803053/239‑1 (MQ=255)
gC‑AAGCA‑TGCCACGGATTGTTGCGATCGGGGTCGCCCTCGGCTTTACC‑AATAACGATGGCGTACCCGCGCTGG‑CCGCAGTTGTTGCCTATGGCAT‑CATGGTTAAAAC‑CATGGCCGTGGTTGCGCCACTGGTACTGCATTTACCTGCTGAAGAAATCGCCTCTAAACACCTGGCGGATACTGGCGTACTCGGAGGGATTATCTCCGGTGCGATCGCAGCGTACATGTTTAACCGTTTCTa < 1:377695/239‑1 (MQ=255)
gC‑AAACA‑TGCCACTGATTTTTGCGATCGGTGTCGCCCTCGGCTTTACC‑AATAACGATGGCGTATCCGCGCTGG‑CCGCAGTTGTTGCCTATGGCAT‑CATGGTTAAAAC‑CATGGCCGTGGTTGCGCCACTGGTACTGCATTTACCTGCTGAAGAAATCGCCTCTAAACACCTGGCGGATACTGGCGTACTCGGAGGGATTATCTCCGGTGCGATCGCAGCGTACATGTTTAACCGTTTCTa < 1:94206/239‑1 (MQ=255)
|
TGAGAACGTAAAAAAAGCACCCATACTCAGGAGCACTCTCAATTATGTTTAAGAATGCATTTGCTAACCTGCAAAAGGTCGGTAAATCGCTGATGCTGCCGGTATCCGTACTGCCTATCGCAGGTATTCTGCTGGGCGTCGGTTCCGCGAATTTCAGCTGGCTGCCCGCCGTTGTATCGCATGTTATGGCAGAAGCAGGCGGTTCCGTCTTTGC‑AAACA‑TGCCACTGATTTTTGCGATCGGTGTCGCCCTCGGCTTTACC‑AATAACGATGGCGTATCCGCGCTGG‑CCGCAGTTGTTGCCTATGGCAT‑CATGGTTAAAAC‑CATGGCCGTGGTTGCGCCACTGGTACTGCATTTACCTGCTGAAGAAATCGCCTCTAAACACCTGGCGGATACTGGCGTACTCGGAGGGATTATCTCCGGTGCGATCGCAGCGTACATGTTTAACCGTTTCTA > NC_000913/1157825‑1158275
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 13 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
N/A
