Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A8 F17 I0 R1
|
115 |
121.7 |
2441348 |
96.4% |
2353459 |
231.2 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
freq |
annotation |
gene |
description |
| RA |
NC_000913 |
4,394,335 |
T→G |
16.3% |
V90G (GTC→GGC) |
nnr → |
bifunctional NAD(P)H‑hydrate repair enzyme, C‑terminal domain ADP‑dependent (S)‑NAD(P)H‑hydrate dehydratase and N‑terminal domain NAD(P)H‑hydrate epimerase |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | NC_000913 | 4,394,335 | 0 | T | G | 16.3%
| 241.5
/ 4.0
| 108 | V90G (GTC→GGC) | nnr | bifunctional NAD(P)H‑hydrate repair enzyme, C‑terminal domain ADP‑dependent (S)‑NAD(P)H‑hydrate dehydratase and N‑terminal domain NAD(P)H‑hydrate epimerase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (34/50); new base G (20/2); total (56/52) |
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 2.10e-05 |
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
Only 100 of 108 total aligned reads displayed.
TACCACACACCGTCTGGTACGCCGACGATATCCGCCGCGGAGAACGCGAGGCGGCAGATGTGCTGGGGCTCACACTCTATGAGCTGATGCTTCGCGCTGGCGAGGCCGCATTCCAGGTGTGTCGTTCGGCGTATCCTGACGCCCGCCACTGGCTGGTGCTGTGCGGTCATGGTAATAACGGCGGCGATGGCTACGTGGTCGCGCGACTGGCCAAAGCGGTCGGCATTGAGGT‑CACGTTGTTGGCCCAGGAGAGCGACAAACCGTTGCCGGAAGAGGCCGCGCTGGCACGCGAAGCATGGTTAAACGCGGGTGGCGAGATCCATGCTTCGAATATTGTCTGGCCCGAATCGGTAGATCTGATTGTT‑GATGCGCTGCTCGGT‑ACC‑GGTTTGCGGCAAGCGCCCCGCGAATCCATTAGCCAGTTAATCGACCACGCTAATTCCCATCCTGCGCCGATTGTGGCGGTTG > NC_000913/4394104‑4394568
|
taCCACACACCGTCTGGTACGCCGACGATATCCGCCGCGGAGAACGCGAGGCGGCAGATGTGCTGGGGCTCACACTCTATGAGCTGATGCTTCGCGCTGGCGAGGCCGCATTCCAGGTGTGTCGTTCGGCGTATCCTGACGCCCGCCACTGGCTGGTGCTGTGCGGTCATGGTAATAACGGCGGCGGTGGCTACGTGGTCGCGCGACTGGCCAAAGCGGTCGGCATTGAGGT‑CACgttg > 1:127325/1‑239 (MQ=255)
cacacCGTCTGGTACGCCGACGATATCCGCCGCGGAGAACGCGAGGCGGCAGATGTGCTGGGGCTCACACTCTATGAGCTGATGCTTCGCGCTGGCGAGGCCGCATTCCAGGTGTGTCGTTCGGCGTATCCTGACGCCCGCCACTGGCTGGTGCTGTGCGGTCATGGTAATAACGGCGGCGATGGCTACGTGGTCGCGCGGCTGGGCAAAGCGGGCGGCATTGAGGT‑CACGTTGTTgg > 1:497787/1‑238 (MQ=255)
cacacCGTCTGGTACGCCGACGATATCCGCCGCGGAGAACGCGAGGCGGCAGATGTGCTGGGGCTCACACTCTATGAGCTGATGCTTCGCGCTGGCGAGGCCGCATTCCAGGTGTGTCGTTCGGCGTATCCTGACGCCCGCCACTGGCTGGTGCTGTGCGGTCATGGTAATAACGGCGGCGATGGCTACCTGGTCGGGGCGCCGGGCAAAGCGGGCGGCAATGGGGTGCAC‑TTGTTgg > 2:1111596/1‑238 (MQ=255)
cacacCGTCTGGTACGCCGACGATATCCGCCGCGGAGAACGCGAGGCGGCAGATGTGCTGGGGCTCACACTCTATGAGCTGATGCTTCGCGCTGGCGAGGCCGCATTCCAGGTGTGTCGTTCGGCGTATCCTGACGCCCGCCACTGGCTGGTGCTGTGCGGTCATGGGAATAACGGCGGCCAGCGCCACCTCGGCGCCCGGCGGGCCTAAGCGGCTGGCGTTGAGGG‑CCCGGTGTTgg > 2:513346/1‑238 (MQ=255)
acCGTCTGGTACGCCGACGATATCCGCCGCGGAGAACGCGAGGCGGCAGATGTGCTGGGGCTTACACTCTATGAGCTGATGCTTCGCGCTGGCGAGGCCGCATTCCAGGTGTGTCGTTCGGCGTATCCTGACGCCCGCCACTGGCTGGTGCTGTGCGGTCATGGTAATAACGGCGGCCGTGGGCACGTGGGTGCGGGGCTGGCCGAAACGGGCGGGCGTGAGGG‑CACGTTGTTGGgccc > 2:954836/1‑238 (MQ=255)
acCGTCTGGTACGCCGACGATATCCGCCGCGGAGAACGCGAGGCGGCAGATGTGCTGGGGCTCACACTCTATGAGCTGATGCTTCGCGCTGGCGAGGCCGCATTCCAGGTGTGTCGTTCGGCGTATCCTGACGCCCGCCACTGGCTGGTGCTGTGCGGTCATGGTAATAACGGCGGGCATGGCTACGTGGTCCCGCGACTGCCCAAATCGGTCGGGCTTGCGGG‑CAcagatattgccca > 2:727950/1‑227 (MQ=255)
acCGTCTGGTACGCCGACGATATCCGCCGCGGAGAACGCGAGGCGGCAGATGTGCTGGGGCTCACACTCTATGAGCTGATGCTTCGCGCTGGCGAGGCCGCATTCCAGGTGTGTCGTTCGGCGTATCCTGACGCCCGCCACTGGCTGGTGCTGTGCGGTCATGGTAATAACGGCGGCGGTGGCTACGTGGTCGCGCGACTGGCCAAAGCGGTCGGCATTGGGGG‑CACGTTGTTGGCCCa > 1:817166/1‑239 (MQ=255)
cGTCTGGTACGCCGACGATATCCGCCGCGGAGAACGCGAGGCGGCAGATGTGCTGGGGCTCACACTCTATGAGCTGATGCTTCGCGCTGGCGAGGCCGCATTCCAGGTGTGTCGTTCGGCGTATCCTGACGCCCGCCACTGGCTGGTGCTGTGCGGTCATGGTAATAACGGCGGTGATGGGCACCTGGTCGCGGGCATGGCCAAAGAGGTCGGCACTGTGGT‑CAGCTCGTTAGCCCAgg > 2:879152/1‑239 (MQ=255)
tCTGGTACGCCGACGATATCCGCCGCGGAGAACGCGAGGCGGCAGATGTGCTGGGGCTCACACTCTATGAGCTGATGCTTCGCGCTGGCGAGGCCGCATTCCAGGTGTGTCGTTCGGCGTATCCTGACGCCCGCCACTGGCTGGTGCTGTGCGGTCATGGTAATAACGGCGGCGATGGCTACGTGGTCGCGCGACTGGCCAAAGCGGGCGGGCTTGAGGT‑CACGTTGTTGGCCCAGgag > 1:716328/1‑239 (MQ=255)
tCTGGTACGCCGACGATATCCGCCGCGGAGAACGCGAGGCGGCAGATGTGCTGGGGCTCACACTCTATGAGCTGATGCTTCGCGCTGGCGAGGCCGCATTCCAGGTGTGTCGTTCGGCGTATCCTGACGCCCGCCACTGGCTGGTGCTGTGCGGTCATGGTAATAACGGCGGCGATGGCTACGTGGTCGCGCGACTGGCCAAAGCGGGCGGCATTGAGGT‑CACGTTGTTGGGCCAGgag > 1:731976/1‑239 (MQ=255)
tCTGGTACGCCGACGATATCCGCCGCGGAGAACGCGAGGCGGCAGATGTGCTGGGGCTCACACTCTATGAGCTGATGCTTCGCGCTGGCGAGGCCGCATTCCAGGTGTGTCGTTCGGCGTATCCTGACGCCCGCCACTGGCTGGTGCTGTGCGGTCATGGTAATAACGGCGGCGATGGCTACGTGGGCGCGCGGCTGGCCAAAACGGGCGGCGTTGGGGG‑CACGTTGTTTGCCCCGgag > 1:1056183/1‑239 (MQ=255)
tCTGGTACGCCGACGATATCCGCCGCGGAGAACGCGAGGCGGCAGATGTGCTGGGGCTCACACTCTATGAGCTGATGCTTCGCGCTGGCGAGGCCGCATTCCAGGTGTGTCGTTCGGCGTATCCTGACGCCCGCCACTGGCTGGTGCTGTGCGGTCATGGTAATAACGGCGGCGATGGCTACGTGGGCGCGCGCCTGGCCAAAGCGGGCGGCCTTGAGGA‑CCCGTTGTTGGCCCAGgag > 1:737784/1‑239 (MQ=255)
tCTGGTACGCCGACGATATCCGCCGCGGAGAACGCGAGGCGGCAGATGTGCTGGGGCTCACACTCTATGAGCTGATGCTTCGCGCTGGCGAGGCCGCATTCCAGGTGTGTCGTTCGGCGTATCCTGACGCCCGCCACTGGCTGGTGCTGTGCGGTCATGGTAATAACGGCGGCGATGGCCACGGGGTCGCGCGGCTGGCCCAAGCGGCCGGCATTGAGGG‑CACGTTGTTGGCCCAGgag > 1:793542/1‑239 (MQ=255)
tCTGGTACGCCGACGATATCCGCCGCGGAGAACGCGAGGCGGCAGATGTGCTGGGGCTCACACTCTATGAGCTGATGCTTCGCGCTGGCGAGGCCGCATTCCAGGTGCGTCGTTCGGCGTATCCTGACGCCCGCCACTGGCTGGTGCTGTGCGGTCATGGTAATAACGGCGGCGCAGGCCACGTGGGCGCGCGACTGGGCGAACGCGTGCGCGTTGACGT‑CCAGCTGTTGGCCCCgggg > 2:248059/1‑237 (MQ=255)
cTGGTACGCCGACGATATCCGCCGCGGAGAACGCGAGGCGGCAGATGTGCTGGGGCTCACACTCTATGAGCTGATGCTTCGCGCTGGCGAGGCCGCATTCCAGGTGTGTCGTTCGGCGTATCCTGACGCCCGCCACTGGCTGGTGCTGTGCGGTCATGGGAATAACGGCGGCGGCGGCCACCGGGTAGCGCGGCTGGCGAAAACGGGCGGGATTGAGGG‑GACGTTGTTGGCCCAGgaag > 2:843093/1‑237 (MQ=255)
cgacgaTATCCGCCGCGGAGAACGCGAGGCGGCAGATGTGCTGGGGCTCACACTCTATGAGCTGATGCTTCGCGCTGGCGAGGCCGCATTCCAGGTGTGTCGTTCGGCGTATCCTGACGCCCGCCACTGGCTGGTGCTGTGCGGTCATGGTAATAACGGCGGCGATGGCTACGTGGTCGCGCGACTGGCCAAAGCGGTCGGCATTGAGGT‑CACGTTGTTGGCCCAGGAGAGCGACaca > 1:1135056/1‑236 (MQ=255)
cgcgGAGAACGCGAGGCGGCAGATGTGCTGGGGCTCACACTCTATGAGCTGATGCTTCGCGCTGGCGAGGCCGCATTCCAGGTGTGTCGTTCGGCGTATCCTGACGCCCGCCACTGGCTGGTGCTGTGCGGTCATGGTAATAACGGCGGCGGTGGCTACGTGGTCGCGCGACTGGCCAAAACGGGCGGCCTTGAGGT‑CACGTTGTTGGCCCCGGGGGGCGACAAAACGGTGCCGGAaga > 1:941141/1‑239 (MQ=255)
cgGAGAACGCGAGGCGGCAGATGTGCTGGGGCTCACACTCTATGAGCTGATGCTTCGCGCTGGCGAGGCCGCATTCCAGGTGTGTCGTTCGGCGTATCCTGACGCCCGCCACTGGCTGGTGCTGTGCGGTCATGGTAATAACGGCGGCGATGGCTACGTGGTCGCGCGACTGGCCAAAGCGGTCTGCATTGAGGT‑CACGTTGTTGGCCCAGGAGCGCGACAAACCGATGCCGGAagag > 1:944773/1‑238 (MQ=255)
gcggcAGATGTGCTGGGGCTCACACTCTATGAGCTGATGCTTCGCGCTGGCGAGGCCGCATTCCAGGTGTGTCGTTCGGCGTATCCTGACGCCCGCCACTGGCTGGTGCTGTGCGGTCATGGTAATAACGGCGGCGCTGGCTACGTGGTCGCGCGGCTGGGCAAAACGGGCGGCATTGAGGG‑CCCGTTGTTGGCCCCGGGGAGCGACAAACCGTTGCCGGAAGAGGCCGCGCTGGccc > 2:1075088/1‑236 (MQ=255)
cggcAGGTGGGCGGGCGCTCACACTCGGTGATCTGATGCCCCGCGCGGGAGGGGCCGCGTGCCGGGTGTGCCGTCGGGCGTACCCCGGCGCCCGCCACTGGCTGGTGCTGTGCGGTCATGGTAATAACGGCGGCGATGGCTACGTGGTCGCGCGACTGGCCAAAGCGGTCGGCATTGAGGT‑CACGTTGTTGGCCCAGGAGAGCGACAAACCGTTGCCGGAAGAGGCCGCGCTGGCAcg < 2:828601/238‑1 (MQ=255)
ggtgttgtgtgggggCTCGCGCTCTAGGGGCTGATGCTGCGCGCGGGCGGGGGCGGATTCGGGTGGTGTCGTGGGGCGTAGCGGGGCGCCCGCCACTGGCTGGTGCTGTGCGGTCATGGTAATAACGGCGGCGATGGCTACGTGGTCGCGCGACTGGCCAAAGCGGTCGGCATTGAGGT‑CACGTTGTTGGCCCAGGAGAGCGACAAACCGTTGCCGGAAGAGGCCGCGCTGGCAcgcg < 2:229867/227‑1 (MQ=255)
gcggATGTGCGGGGGCTCACCCTCTAGGGGCTGATGCTGCGGGCGGGCGAGGCCGCATTCCAGGTGTGTCGTTCGGCGTATCCTGCCGCCCGCCACTGGCTGGTGCTGTGCGGTCATGGTAATAACGGCGGCGATGGCTACGTGGTCGCGCGACTGGCCAAAGCGGTCGGCATTGAGGT‑CACGTTGTTGGCCCAGGAGAGCGACAAACCGTTGCCGGAAGAGGCCGCGCTGGCAcgcg < 1:965425/235‑1 (MQ=255)
tgtgCTGGGGCTCACCCTCTATGGGCTGATCCTTCGCGCTGGCGGGGCCGCATTCCAGGTGTGTCGTTCGGCGTATCCTGACGCCCGCCACTGGCTGGTGCTGTGCGGTCATGGTAATAACGGCGGCGATGGCTACGTGGTCGCGCGACTGGCCAAAGCGGTCGGCATTGAGGT‑CACGTTGTTGGCCCAGGAGAGCGACAAACCGTTGCCGGAAGAGGCCGCGCTGGCACGCGAAGCa < 1:917151/238‑1 (MQ=255)
tGGGGCTCACACTCTATGAGCTGATGCTTCGCGCTGGCGAGGCCGCATTCCAGGTGTGTCGTTCGGCGTATCCTGACGCCCGCCACTGGCTGGTGCTGTGCGGTCATGGTAATAACGGCGGCGATGGCTACGTGGTCGCGCGACTGGCCAAAGCGGTCGGCATTGAGGT‑CACGTTGTTGGCCCAGGAGAGCGACAAACCGt > 1:184087/1‑201 (MQ=255)
tGGGGCTCACACTCTATGAGCTGATGCTTCGCGCTGGCGAGGCCGCATTCCAGGTGTGTCGTTCGGCGTATCCTGACGCCCGCCACTGGCTGGTGCTGTGCGGTCATGGTAATAACGGCGGCGATGGCTACGTGGTCGCGCGACTGGCCAAAGCGGTCGGCATTGAGGT‑CACGTTGTTGGCCCAGGAGAGCGACAAACCGt < 2:184087/201‑1 (MQ=255)
ggggCTCACACTCTATGAGCTGATGCTTCGCGCTGGCGAGGCCGCATTCCAGGTGTGTCGTTCGGCGTATCCTGACGCCCGCCACTGGCTGGTGCTGTGCGGTCATGGTAATAACGGCGGCGGCGGCTACGGGGGCGCGCGGCTGGCCAAAGCGGGCGGCATTGAGGG‑CACGTTGTTGGCCCCGGGGAGGGACACACCGTTGCCGGGAGAGGCCGCGCTGGCACGCGagaggtgggtaa > 2:917151/1‑228 (MQ=255)
cacaCTCTATGAGCTGATGCTTCGCGCTGGCGAGGCCGCATTCCAGGTGTGTCGTTCGGCGTATCCTGACGCCCGCCACTGGCTGGTGCTGTGCGGTCATGGTAATAACGGCGGCGATGGCTACGTGGTCGCGCGACTGGCCAAAGCGGTCGGCATTGAGGT‑CACGTTGTTGGCCCAGGAGAGCGACAAACCGTTGCCGGAAGAGGCCGCGCTGGCACGCGCAGCATGGTTAAACGCgg > 1:75863/1‑239 (MQ=255)
cacaCTCTATGAGCTGATGCTTCGCGCTGGCGAGGCCGCATTCCAGGTGTGTCGTTCGGCGTATCCTGACGCCCGCCACTGGCTGGTGCTGTGCGGTCATGGGAATAACGGCGGCGCTGGCTACGTGGTCGCGCGACTGGCCCAAGCGGTCGGCAGTGAGGT‑CACGGTGTTGGGCCACGAGAGCGACAAACCGTTGCCGGAAGGGGCCGCGCTGGGCCGCGGAGCCTGGGTGAACCCgg > 2:534567/1‑239 (MQ=255)
tcttgggtcTGTTGTTTCGCGCTGGCGAGGCCGCATCCCGGGTGTGTCGTTCGGCGTACCCTGCCGCCCGCCACTGGCTGGTGCTGTGCGGTCATGGTAATAACGGCGGCGATGGCTACGTGGTCGCGCGACTGGCCAAAGCGGTCGGCATTGAGGT‑CACGTTGTTGGCCCAGGAGAGCGACAAACCGTTGCCGGAAGAGGCCGCGCTGGCACGCGAAGCATGGTTAAACGCGGGTGGc < 1:918043/231‑1 (MQ=255)
tataAGCTGATGCTTCGCGCTGGCGAGGCCGCATTCCAGGTGTGTCGTTCGGCGTATCCTGACGCCCGCCACTGGCTGGTGCTGAGCGGTCATGGTAATAACGGCTGCGATGGCTGCCTGGCACGGCGGATGGCCAAAAAGGGCGGGCTTGGGGG‑AACGTGGGTGGTCCAGGAGAGCGGCAAAACGCTGCCAGACAGGGCCCCACTGGCGTGGGACGGATCGTCAAACGCGGGGGGGga > 2:787974/1‑239 (MQ=255)
ctggtgttccgggcTGGCGGGGCCGCTTTCCGGGTGTGTCGTGCGGGGTATCCGGGCGCCCGCCACTGGCTGGTGCTGTGCGGTCATGGTAATAACGGCGGCGATGGCTACGTGGTCGCGCGACTGGCCAAAGCGGTCGGCATTGAGGT‑CACGTTGTTGGCCCAGGAGAGCGACAAACCGTTGCCGGAAGAGGCCGCGCTGGCACGCGAAGCATGGTTAAACGCGGGTGGCGAGATcc < 1:1111596/226‑1 (MQ=255)
tGATGCTTCGCGCTGGCGAGGCCGCATTCCAGGTGTGTCGTTCGGCGTATCCGGACGCCCGCCACTGGCTGGTGCTGTGCGGTCATGGTAATAACGGCGGCGATGGCTACGTGGTCGCGCGACTGGCCAAAGCGGTCGGCATTGAGGT‑CACGTTGTTGGCCCAGGAGAGCGACAAACCGTTGCCGGAAGAGGCCGCGCTGGCACGCGAAGCATGGTTAAACGCGGGTGGCGAGATCCa < 1:422045/238‑1 (MQ=255)
gATGCTTCGCGCTGGCGAGGCCGCATTCCAGGTGTGTCGTTCGGCGTATCCTGACGCCCGCCACTGGCTGGTGCTGTGCGGTCATGGTAATAACGGCGGCGGTGGCTACGTGGGCGCGCGGCTGGCCCAAGCGGGCGGCACTGAGGG‑CACCTTGTTGGCCCCGGAGAGCGGCCAACCCTTTCCCGAAGGGGCCCGGCCGGGACGCGGAGCCTGGGTAAAAACGGGGGGGGAGATccccg > 2:957119/1‑236 (MQ=255)
gATGCTTCGCGCTGGCGAGGCCGCATTCCAGGTGTGTCGTTCGGCGTATCCTGACGCCCGCCACTGGCTGGTGCTGTGCGGTCATGGGAATAACGGCGGCCCTGGCTACGCGGTCGCGCGGCTGGGCAACGCGGTCGGCATTTAGGG‑CACGGTGTTGGCCCCGGGGAGGGACCACCCCCGTCCGGAGGAGGCGCCGCTCGGGCGCGACGCCCGGGTAAACGCGGGTGGCGAGGGCCAt > 2:1199455/1‑238 (MQ=255)
tGCTTCGCGCTGGCGAGGCCGCATTCCAGGTGTGTCGTTCGGCGTATCCTGACGCCCGCCACTGGCTGGTGCTGTGCGGTCATGGTAATAACGGCGGCGATTGCCACCTGGGCGCGCGGCTGGCCCAAACGGGCGGCATTGAGGG‑CACGTTGTTTGGCCCGGGGGGCGACAAACCGGTGCCCGGCGAGGCCGCCCTTGCCCCCGAAGCATGGGTAAAACCGGGGGGCgaggtgcccg > 2:422045/1‑230 (MQ=255)
gCTTCGCGCTGGGGAGGCCGCATTCCAGGTGTGTCGTCCGGCGTTTCCTGACGCCCGCCACTGGCTGGTGCTGTGCGGTCATGGTAATAACGGCGGCGATGGCTACGTGGTCGCGCGACTGGCCAAAGCGGTCGGCATTGAGGT‑CACGTTGTTGGCCCAGGAGAGCGACAAACCGTTGCCGGAAGAGGCCGCGCTGGCACGCGAAGCATGGTTAAACGCGGGTGGCGAGATCCATGCtt < 1:818559/239‑1 (MQ=255)
ccgcgcgGGGGAGGCCGCATTCCGGGTGTGTCGTTCGGCGTATCCTGCCGCCCGCCACTGGCTGGTGCTGTGCGGTCATGGTAATAACGGCGGCGATGGCTACGTGGTCGCGCGACTGGCCAAAGCGGTCGGCATTGAGGT‑CACGTTGTTGGCCCAGGAGAGCGACAAACCGTTGCCGGAAGAGGCCGCGCTGGCACGCGAAGCATGGTTAAACGCGGGTGGCGAGATCCATGCTTCGa < 1:237489/238‑1 (MQ=255)
gCATGCCAGGTGTTTGGTCGGGGGTACCTTGGCGCCCGCCACTGGCTGGTGCTGTGCGGTCATGGTAATAACGGCGGCGATGGCTACGTGGTCGCGCGACTGGCCAAAGCGGTCGGCATTGAGGT‑CACGTTGTTGGCCCAGGAGAGCGACAAACCGTTGCCGGAAGAGGCCGCGCTGGCACGCGAAGCATGGTTAAACGCGGGTGGCGAGATCCATGCTTCGAATATTGTCTGGCCCGa < 1:248059/239‑1 (MQ=255)
aTTCCAGGTGTGTCGTGCGCCGTATCCGGGCCCCCGCCACTGGCTGGTGCTGTGCGGTCATGGTAATAACGGCGGCGATGGCTACGTGGTCGCGCGACTGGCCAAAGCGGTCGGCATTGAGGT‑CACGTTGTTGGCCCAGGAGAGCGACAAACCGTTGCCGGAAGAGGCCGCGCTGGCACGCGAAGCATGGTTAAACGCGGGTGGCGAGATCCATGCTTCGAATATTGTCTGGCCCGAAt < 1:954836/239‑1 (MQ=255)
ccgggTGGGTCGTTCGGCGTATCCTGACGCCCGCCACTGGCTGGTGCTGTGCGGTCATGGTAATAACGGCGGCGATGGCTACGTGGTCGCGCGACTGGCCAAAGCGGTCGGCATTGAGGT‑CACGTTGTTGGCCCAGGAGAGCGACAAACCGTTGCCGGAAGAGGCCGCGCTGGCACGCGAAGCATGGTTAAACGCGGGTGGCGAGATCCATGCTTCGAATATTGTCTGGCCCGAATCgg < 1:657050/236‑1 (MQ=255)
ggggTGTGTCGTGCGGCGTGTCCGGCCCCCCGGCACTGGCTGGTGCTGTGCGGTCATGGTAATAACGGCGGCGATGGCTACGTGGTCGCGCGACTGGCCAAAGCGGTCGGCATTGAGGT‑CACGTTGTTGGCCCAGGAGAGCGACAAACCGTTGCCGGAAGAGGCCGCGCTGGCACGCGAAGCATGGTTAAACGCGGGTGGCGAGATCCATGCTTCGAATATTGTCTGGCCCGAATCgg < 2:497787/236‑1 (MQ=255)
gggggttCGTCCGGCGTCTCCTGCCGCCCGCCACTGGCTGGTGCTGTGCGGTCATGGTAATAACGGCGGCGATGGCTACGTGGTCGCGCGACTGGCCAAAGCGGTCGGCATTGAGGT‑CACGTTGTTGGCCCAGGAGAGCGACAAACCGTTGCCGGAAGAGGCCGCGCTGGCACGCGAAGCATGGTTAAACGCGGGTGGCGAGATCCATGCTTCGAATATTGTCTGGCCCGAATCGGTa < 2:704246/232‑1 (MQ=255)
gtgtctggcagggTATCGTGGCGCCCGCCACTGGCTGGTGCTGTGCGGTCATGGTAATAACGGCGGCGATGGCTACGTGGTCGCGCGACTGGCCAAAGCGGTCGGCATTGAGGT‑CACGTTGTTGGCCCAGGAGAGCGACAAACCGTTGCCGGAAGAGGCCGCGCTGGCACGCGAAGCATGGTTAAACGCGGGTGGCGAGATCCATGCTTCGAATATTGTCTGGCCCGAATCGGTAGAt < 1:640822/226‑1 (MQ=255)
gtgtCGTGGGGCGTAGCCTGGCCCCCGCCACTGGCTGGTGCTGTGCGGTCATGGTAATAACGGCGGCGATGGCTACGTGGTCGCGCGACTGGCCAAAGCGGTCGGCATTGAGGT‑CACGTTGTTGGCCCAGGAGAGCGACAAACCGTTGCCGGAAGAGGCCGCGCTGGCACGCGAAGCATGGTTAAACGCGGGTGGCGAGATCCATGCTTCGAATATTGTCTGGCCCGAATCGGTAGAt < 1:727950/238‑1 (MQ=255)
tCGTTCGGCGTATCCTGACGCCCGCCACTGGCTGGTGCTGTGCGGTCATGGTAATAACGGCGGCGATGGCTACGTGGGCGCGCGACTGGCCAAAGCGGTCGGCATTGAGGT‑CACGTTGTTGGCCCAGGAGAGCGACAAACCGTTGCCGGAAGAGGCCGCGCTGGCACGCGAAGCATGGGTAAACGCGGGTGGCGAGATCCATGCTTCGAATATTGTCTGGCCCGAATCGGTAGATCTGa > 1:918421/1‑239 (MQ=255)
cggtgggcggtagccgcccccggccGCTGGCTGGGGCCGCGAGGTCATGGTAAGAACGGCGGCGATGGGCACGTGGTCGGGCGGCTGGCAAAATCGGTTGGCATTGGGGT‑CACGTTGTTGGACCAGGAAAGCGACAATCCGTTGGCGGAAGAGGCCGCGCTGGCTAGCGAAGCATGGTTAAGCGCGGGTGGCGAGATCCATGCTTCGAATATTGTCTGGCTCGGGTCGGTAGATCTGAt < 2:688956/217‑1 (MQ=255)
gggcggctgctccgggcgcccgccACTGGCTGGTGCTGTGCGGTCATGGTAATAACGGCGGCGATGGCTACGTGGTCGCGCGACTGGCCAAAGCGGTCGGCATTGAGGT‑CACGTTGTTGGCCCAGGAGAGCGACAAACCGTTGCCGGAAGAGGCCGCGCTGGCACGCGAAGCATGGTTAAACGCGGGTGGCGAGATCCATGCTTCGAATATTGTCTGGCCCGAATCGGTAGATCTGAt < 2:79815/222‑1 (MQ=255)
gTTCGGCGTATCCTGACGCCCGCCACTGGCTGGTGCTGTGCGGTCATGGTAATAACGGCGGCGGTGGCTGCGTGGTCGCGCGGCTGGCCAAAGCGGGCGGCATTGAGGT‑CCCGTTGTTGGCCCCGGGGGGCGACAAACCGGTGCCGGGAGGGGCCGCGCTGGCACGCGCAGCATGGGAAAACGCGGGTGGCGAGGTCCCTGCCTCCGATATTGGCTGGCCCGAATCGGTGGATCTGAtt > 2:438489/1‑239 (MQ=255)
cGTATCCTGACGCCCGCCACTGGCTGGTGCTGTGCGGTCATGGTAATAACGGCGGCGATGGCTACGTGGTCGCGCGACTGGCCAAAGCGGTCGGCATTGAGGT‑CACGTTGTTGGCCCAGGAGAGCGACAAACCGTTGCCGGAAGAGGCCGCGCTGGCACGCGAAGCATGGTTAAACGCGGGTGGCGAGATCCATGCTTCGAATATTGTCTGGCCCGAATCGGTAGATCTGATTGTT‑GAt > 1:5054/1‑239 (MQ=255)
gtacccggcgccccgccACTGGCTGGTGCTGTGCGGTCATGGTAATAACGGCGGCGATGGCTACGTGGTCGCGCGACTGGCCAAAGCGGTCGGCATTGAGGT‑CACGTTGTTGGCCCAGGAGAGCGACAAACCGTTGCCGGAAGAGGCCGCGCTGGCACGCGAAGCATGGTTAAACGCGGGTGGCGAGATCCATGCTTCGAATATTGTCTGGCCCGAATCGGTAGATCTGATTGTT‑GATg < 1:585956/228‑1 (MQ=255)
ttgcccgggcgccgccgCTGGCTGGTGCTGTGCGGTCATGGTAATAACGGCGGCGATGGCTACGTGGTCGCGCGACTGGCCAAAGCGGTCGGCATTGAGGT‑CACGTTGTTGGCCCAGGAGAGCGACAAACCGTTGCCGGAAGAGGCCGCGCTGGCACGCGAAGCATGGTTAAACGCGGGTGGCGAGATCCATGCTTCGAATATTGTCTGGCCCGAATCGGTAGATCTGATTGTT‑GATg < 2:197440/227‑1 (MQ=255)
tctcgtgccgcccgccACTGGCTGGTGCTGTGCGGTCATGGTAATAACGGCGGCGATGGCTACGTGGTCGCGCGACTGGCCAAAGCGGTCGGCATTGAGGT‑CACGTTGTTGGCCCAGGAGAGCGACAAACCGTTGCCGGAAGAGGCCGCGCTGGCACGCGAAGCATGGTTAAACGCGGGTGGCGAGATCCATGCTTCGAATATTGTCTGGCCCGAATCGGTAGATCTGATTGTT‑GATg < 2:941141/230‑1 (MQ=255)
ttCCTGACGCCCGCCACTGGCTGGTGCTGTGCGGTCATGGTAATAACGGCGGCGATGGCTACGTGGTCGCGCGACTGGCCAAAGCGGTCGGCATTGAGGT‑CACGTTGTTGGCCCAGGAGAGCGACAAACCGTTGCCGGAAGAGGCCGCGCTGGCACGCGAAGCATGGTTAAACGCGGGTGGCGAGATCCATGCTTCGAATATTGTCTGGCCCGAATCGGTAGATCTGATTGTT‑GATgcg < 1:300861/238‑1 (MQ=255)
atccgcgcgcccgccACTGGCTGGTGCTGTGCGGTCATGGTAATAGCGGCGGCGATGGCTACGTGGTCGCGCGACTGGCCAAAGCGGTCGGCATTGAGGT‑CACGTTGTTGGCCCAGGAGAGCGACAAACCGTTGCCGGAAGAGGCCGCGCTGGCACGCGAAGCATGGTTAAACGCGGGTGGCGAGATCCATGCTTCGAATATTGTCTGGCCCGAATCGGTAGATCTGATTGTT‑GATgcg < 1:1209865/232‑1 (MQ=255)
cTGCCGCCCGCCACTGGCTGGTGCTGTGCGGTCATGGTAATAACGGCGTCGATGGCTGCGTGGTCGCGCGACTGGCCAAAGCGGTCGGCATTGAGGT‑CACGTTGTTGGCCCAGGAGAGCGACAACCCGTTGCCGGAAGAGGCCGCGCTGGCATGCGAAGCATGGTTAAACGCGGGTGGCGAGATCCATGCTTCGAATATTGTCTGGCCCGAATCGGTATATCTGATTGTT‑GATGCgctg < 2:795135/239‑1 (MQ=255)
tGACGCCCGCCACTGGCTGGTGCTGTGCGGTCATGGGAATAACGGCGGCCGTGGCCACGTGGTCGCGCGACTGGCCCAAGCGGTCGGCATTGAGGT‑CACGTTGTTGGCCCAGGAGAGCGACAAAACCTTGCCGGGAGAGGCCGCGCTGGCCCGCGGAGACTGGTGAAACGCGGGTGGGGAGATCCATGCTTCGGATATTTGCTGGCCCGAGTCGGGCGATCTGATTGTT‑GATGGgctc > 2:732666/1‑237 (MQ=255)
gcgcccgccACTGGCTGGTGCTGTGCGGTCATGGTAATAACGGCGGCGATGGCTACGTGGTCGCGCGACTGGCCAAAGCGGTCGGCATTGAGGT‑CACGTTGTTGGCCCAGGAGAGCGACAAACCGTTGCCGGAAGAGGCCGCGCTGGCACGCGAAGCATGGTTAAACGCGGGTGGCGAGATCCATGCTTCGAATATTGTCTGGCCCGAATCGGTAGATCTGATTGTT‑GATGCgctgct < 1:451554/237‑1 (MQ=255)
ccgcccgccACTGGCTGGTGCTGTGCGGTCATGGTAATAACGGCGGCGATGGCTACGTGGTCGCGCGACTGGCCAAAGCGGTCGGCATTGAGGT‑CACGTTGTTGGCCCAGGAGAGCGACAAACCGTTGCCGGAAGAGGCCGCGCTGGCACGCGAAGCATGGTTAAACGCGGGTGGCGAGATCCATGCTTCGAATATTGTCTGGCCCGAATCGGTAGATCTGATTGTT‑GATGCgctgct < 2:1072938/237‑1 (MQ=255)
ccccccgccTCTGGCTGGTGCTGTGCGGTCATGGTAATAACGGCGGCGATGGCTACGTGGTCGCGCGACTGGCCAAAGCGGTCGGCATTGAGGT‑CACGTTGTTGGCCCAGGAGAGCGACAAACCGTTGCCGGAAGAGGCCGCGCTGGCACGCGAAGCATGGTTAAACGCGGGTGGCGAGATCCATGCTTCGAATATTGTCTGGCCCGAATCGGTAGATCTGATTGTT‑GATGCgctgct < 2:455682/235‑1 (MQ=255)
aCGCCCGCCACTGGCTGGTGCTGTGCGGTCATGGTAATAACGGCGGCGGTGGCTACGTGGGCGCGCGGCTTGCCAAAGCGGGCGGCATTGGGGG‑CACGGTGTTGGCCCCGGAGAGCGACAAACCGTTGCCGGAAGAGGCCGCGCTGGCACGCGAAGCACGGTTAAACGCGGGGGGCGAGATCCATGCCTCGCAAATTGTCTGGCCCGACACGGTAGATCGGGTTGTT‑GGTGCGGTGCTc > 2:367067/1‑239 (MQ=255)
cgccACTGGCTGGTGCTGTGCGGTCATGGTAATAACGGCGGCGATGGCTACGTGGTCGCGCGACTGGCCAAAGCGGTCGGCATTGAGGT‑CACGTTGTTGGCCCAGGAGAGCGACAAACCGTTGCCGGAAGAGGCCGCGCTGGCACGCGAAGCATGGTTAAACGCGGGTGGCGAGATCCATGCTTCGAATATTGTCTGGCCCGAATCGGTAGATCTGATTGTT‑GATGCGCTGCTCGGT‑Ac < 1:196047/239‑1 (MQ=255)
tGCTGTGCGGTCATGGTAATAACGGCGGCGATGGCTACGTGGTCGCGCGGCTGGCCAAAGCGGTCGGCATTGAGGG‑CACGTTGTTGGCCCCGGAGAGCGACAAACCGGTGCCGGAAGAGGCCGCGCTGGCCCGCGAAGCATGGGTAAACGCGGGGGGCGGGATCCATGCTTCGAAGATTGTCTGGCCCGAATCGGGAGATCTGGTTGTT‑GATGCGCTGGTCGGT‑ACC‑GGGTTGCgggcc > 2:128266/1‑236 (MQ=255)
tGCTGTGCGGTCATGGTAATAACGGCGGCGATGGCTACGTGGTCGCGCGACTGGCCAAAGAGGTCGGCATTGAGGG‑CACGTTGTTGGGCCCGGAGAGCGACAAACCGGTGCCGGGAGAGGGCGGGCTGGCACGCGAAGACTGGGTAAAAGCGGGGGGGGAGAACCATGCTTCGAATATTGTCTGGCCCGAATCGGGAGATCTGATTGGT‑GATGCGCTGCTCGAG‑ACC‑gggtgtcagcaa > 2:1093868/1‑229 (MQ=255)
tgCGGTCATGGTAATAACGGCGGCGATGGCTACGTGGTCGCGCGACTGGCCAAAGCGGTCGGCCTTGAGGT‑CACGTTGTTGGCCCAGGAGAGCGACAAACCGGTGCCGGAAGAGGCCGCGCTGGCACGCGCAGCAAGGGTAAACGCGGGGGGCGAGAACCCAGCTTCGAAGATTGGCTGGCCCGAAACGGGAGGTCCGGTTGTTGGTTGCGC‑GCTCGGTCACC‑GCTTTG‑GGCAAggcc > 2:535533/1‑235 (MQ=255)
tCATGGTAATAACGGCGGCGATGGCTACGTGGTGGCGCGACTGGCCAAAGCGGTCGGCATTGAGGT‑AACGTTGTTGGCCCAGGAGAGCGACAAACCGTTGCCGGAAGAGGCCGCGCTGGCACGCGCAGCATGGGTAAACGCGGGGGGGGAGATCCCTGCTTCGAATATCGTCGGGCCCGAATCGGGAGAACTGGTTGTT‑GATGCGGCGCTCGGG‑ACC‑GGTTTGCCGCAAGCGcccccgc > 2:4283/1‑236 (MQ=255)
cATGGTAATAACGGCGGCGATGGCTACGTGGTCGCGCGACTGGCCAAAGCGGTCGGCATTGAGGT‑CACGTTGTTGGCCCAGGAGAGCGACAAACCGTTGCCGGAAGAGGCCGCGCTGGCACGCGAAGCATGGTTAAACGCGGGTGGCGAGATCCATGCTTCGAATATTGTCTGGCCCGAATCGGTAGATCTGATTGTT‑GATGCGCTGCTCGGT‑ACC‑GGTTTGCGGCAAGCGCCCCGCGa < 1:265158/239‑1 (MQ=255)
aTGGTAATAACGGCGGCGATGGCTACGTGGTCGCGCGACTGGCCAAAGCGGTCGGCATTGAGGT‑CACGTTGTTGGCCCAGGAGAGCGACAAACCGTTGCCGGAAGAGGCCGCGCTGGCACGCGAAGCATGGTTAAACGCGGGTGGCGAGATCCATGCTTCGAATATTGTCTGGCCCGAATCGGTAGATCTGATTGTT‑GATGCGCTGCTCGGT‑ACC‑GGTTTGCGGCAAGCGCCCCGCGa < 2:731976/238‑1 (MQ=255)
aTGGTAAGAACGGCGGCGAGGGCTACGTGGTCGCGCGGCTGGCAAAAGGGGGCGGCATTGAGGG‑CACGTTGTTGGCCCAGGAGAGCGACAAACCGTTGCCGGAAGAGGCCGCGCTGGCACGCGAAGCATGGTTAAACGCGGGTGGCGAGATCCATGCTTCGAATATTGTCTGGCCCGAATCGGTAGATCTGATTGTT‑GATGCGCTGCTCGGT‑ACC‑GGTTTGCGGCAAGCGCCCCGCGa < 1:490157/238‑1 (MQ=255)
ataaCGGCGGCGATGGCTACGTGGTCGCGCGACTGGCCAAAGCGGTCGGCATTGAGGT‑CACGTTGTTGGCCCAGGAGAGCGACAAACCGTTGCCGGAAGAGGCCGCGCTGGCCCGCGAAGCATGGTTAAACGCGGGTGGCGAGATCCATGCTTCGAATATTGTCTGGCCCGAATCGGTAGATCTGATTGTT‑GATGCGCTGCTCGGT‑ACC‑GGTTTGCGGCAAGCGCCCCGCGAATCCAtt > 1:430398/1‑239 (MQ=255)
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aaCGGCGGCGATGGCTACGTGGTCGCGCGACTGGCCAAAGCGGTCGGCATTGAGGT‑CACGTTGTTGGCCCAGGAGAGCGACAAACCGTTGCCGGAAGAGGCCGCGCTGGCACGCGAAGCATGGTTAAACGCGGGTGGCGAGATCCATGCTTCGAATATTGTCTGGCCCGAATCGGTAGATCTGATTGTT‑GATgcg < 1:180490/195‑1 (MQ=255)
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cggcgATGGCTACGTGGGCGCGCGACTGGCCAAAGCGGGCGGCATTGAGGT‑CACGTTGTTGGCCCAGGAGAGCGCCAAACCGTTGCCGGAAGAGGCCGCGCTGGCACGCGGAGCATGGTTAAACGCGGGTGGCGAGATCCCTGCGTCGAATATTGGATGGCCCGGATCGGGAGATCTGGTTGTT‑GATGCGCTGCTCGTG‑ACCGGGTTTGGGGC‑AGCGTCCCGCGAATCCCTTAGCCAgg > 2:692576/1‑238 (MQ=255)
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ggcgATGGCTACGTGGTCGCGCGACTGGCCAAAGCGGTCGGCATTGAGGT‑CACGTTGTTGGCCCAGGAGAGCGACAAACCGTTGCCGGAAGAGGCCGCGCTGGCACGCGAAGCATGGTTAAACGCGGGTGGCGAGATCCATGCTTCGAATATTGTCTGGCCCGAATCGGTAGATCTGATTGTT‑GATGCGCTGCTCGGT‑ACC‑GGTTTGCGGCAAGCGCCCCGCGAATCCATTAGcc > 1:976199/1‑235 (MQ=255)
ctgcGTGGTCGCGCGACTGGCCAAAGCGGTCGGCAGTGAGGT‑CACGTTGTTGGCCCAGGAGAGCGACAAACCGTTGCCGGAAGAGGCCGCGCTGGCACGCGAAGCATGGTTAAACGCGGGTGGCGAGATCCATGCTTCGAATATTGTCTGGCCCGAACCGGTAGAGCTGATTGTT‑GATGCGCTGCTCGGT‑ACC‑GGTTTGCGGCAAGCGCCCCGCGAATCCATTAGCCAGTTAATCGAc < 2:414205/235‑1 (MQ=255)
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cTACGTGGTCGCGCGACTGGCCAAAGCGGTCGGCATTGAGGT‑CACGTTGTTGGCCCAGGAGAGCGACAAACCGTTGCCGGAAGAGGCCGCGCTGGCACGCGAAGCATGGTTAAACGCGGGTGGCGAGATCCATGCTTCGAATATTGTCTGGCCCGAATCGGTAGATCTGATTGTT‑GATGCGCTGCTCGGT‑ACC‑GGTTTGCGGCAAGCGCCCCGCGAATCCATTAGCCAGTTAATCGAc < 1:1024824/238‑1 (MQ=255)
cTACGTGGTCGCGCGACTGGCCAAAGCGGTCGGCATTGAGGT‑CACGTTGTTGGCCCAGGAGAGCGACAAACCGTTGCCGGAAGAGGCCGCGCTGGCACGCGAAGCATGGTTAAACGCGGGTGGCGAGATCCATGCTTCGAATATTGTCTGGCCCGAATCGGTAGATCTGATTGTT‑GATGCGCTGCTCGGT‑ACC‑GGTTTGCGGCAAGCGCCCCGCGAATCCATTAGCCAGTTAATCGAc < 1:991928/238‑1 (MQ=255)
cTACGTGGTCGCGCGACTGGCCAAAGCGGTCGGCATGGAGGT‑CACGTTGTTGGCCCAGGAGAGCGACAAACCGTTGCCGGAAGAGGCCGCGCTGGCACGCGAAGCATGGTTAAACGCGGGTGGCGAGATCCATGCTTCGAATATTGTCTGGCCCGAATCGGTAGATCTGATTGTT‑GATGCGCTGCTCGGT‑ACC‑GGTTTGCGGCAAGCGCCCCGCGAATCCATTAGCCAGTTAATCGAc < 1:534190/238‑1 (MQ=255)
tGGTCGCGCGACTGGCCAAAGCTGTCGGCATTGAGGT‑CGCGTTGGTGGCCCAGGAGAGCGACAAACCGTTGCCGGAAGAGGCCGCGCTGGCACGCGAAGCATGGTTAAACGCGGGTGGCGAGATCCATGCTTCGAATATTGTCTGGCCCGAATCGGTAGATCTGATTGTT‑GATGCGCTGCTCGGT‑ACC‑GGTTTGCGGCAAGCGCCCCGCGAATCCATTAGCCAGTTAATCGACCACGCt < 2:432117/239‑1 (MQ=255)
ggTCGCGCGACTGGCCAAAGCGGTCGGCATTGAGGT‑CACGTTGTTGGCCCAGGAGAGCGACAAACCGTTGCCGGAAGAGGCCGCGCTGGCACGCGAAGCATGGTTAAACGCGGGTGGCGAGATCCATGCTTCGAATATTGTCTGGCCCGAATCGGTAGATCTGATTGTT‑GATGCGCTGCTCGGT‑ACC‑GGTTTGCGGCAAGCGCCCCGCGAATCCATTAGCCAGTTAATCGACCACGCt < 1:879152/238‑1 (MQ=255)
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ggTCGCGCGACTGGCCAAAGCGGTCGGCATTGAGGT‑CACGTTGTTGGCCCAGGAGAGCGACAAACCGTTGCCGGAAGAGGCCGCGCTGGCACGCGAAGCATGGTTAAACGCGGGTGGCGAGATCCATGCTTCGAATATTGTCTGGCCCGAATCGGTAGATCTGATTGTT‑GATGCGCTGCTCGGT‑ACC‑GGTTTGCGGCAAGCGCCCCGCGAATCCATTAGCCAGTTAATCGACCACGCt < 1:768932/238‑1 (MQ=255)
ggTCGCGCGACTGGCCAAAGCGGTCGGCATTGAGGT‑CACGTTGTTGGCCCAGGAGAGCGACAAACCGTTGCCGGAAGAGGCCGCGCTGGCACGCGAAGCATGGTTAAACGCGGGTGGCGAGATCCATGCTTCGAATATTGTCTGGCCCGAATCGGTAGATCTGATTGTT‑GATGCGCTGCTCGGT‑ACC‑GGTTTGCGGCAAGCGCCCCGCGAATCCATTAGCCAGTTAATCGACCACGCt < 2:5054/238‑1 (MQ=255)
ggTCGCGCGACGGGCCAAAGCGGTCGGCATTGAGGT‑CACGTTGTTGGCCCAGGAGAGCGACAAACCGTTGCCGGAAGAGGCCGCGCTGGCACGCGAAGCATGGTTAAACGCGGGTGGCGAGATCCATGCTTCGAATATTGTCTGGCCCGAATCGGTAGATCTGATTGTT‑GATGCGCTGCTCGGT‑ACC‑GGTTTGCGGCAAGCGCCCCGCGAATCCATTAGCCAGTTAATCGACCACGCt < 1:896365/238‑1 (MQ=255)
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cgcgACTGGCCAAAGCGGTCGGCATTGAGGT‑CACGTTGTTGGCCCAGGAGAGCGACAAACCGTTGCCGGAAGAGGCCGCGCTGGCACGCGAAGCATGGTTAAACGCGGGTGGCGAGATCCATGCTTCGAATATTGTCTGGCCCGAATCGGTAGATCTGATTGTT‑GATGCGCTGCTCGGT‑ACC‑GGTTTGCGGCAAGCGCCCCGCGAATCCATTAGCCAGTTAATCGACCACGCTAATTc > 1:909269/1‑238 (MQ=255)
aGCGGTCGGCATTGAGGT‑CACGTTGTTGGCCCAGGAGAGCGACAAACCGTTGCCGGAAGAGGCCGCGCTGGCACGCGAAGCATGGTTAAACGCGGGTGGCGAGATCCATGCTTCGAATATTGTCTGGCCCGAATCGGTAGATCTGATTGTT‑GATGCGCTGCTCGGT‑ACC‑GGTTTGCGGCAAGCGCCCCGCGAATCCATTAGCCAGTTAATCGAc < 1:276561/214‑1 (MQ=255)
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tGAGGT‑CACGTTGTTGGCCCAGGAGAGCGACAAACCGTTGCCGGAAGAGGCCGCGCTGGCACGCGAAGCATGGTTAAACGCGGGTGGCGAGATCCATGCTTCGAATATTGTCTGGCCCGAATCGGTAGATCTGATTGTT‑GATGCGCTGCTCGGT‑ACC‑GGTTTGCGGCAAGCGCCCCGCGAATCCATTAGCCAGTTAATCGACCACGCTAATTCCCATCCTGCGCCGATTGTGGCGGtgt > 1:1021289/1‑237 (MQ=255)
|
TACCACACACCGTCTGGTACGCCGACGATATCCGCCGCGGAGAACGCGAGGCGGCAGATGTGCTGGGGCTCACACTCTATGAGCTGATGCTTCGCGCTGGCGAGGCCGCATTCCAGGTGTGTCGTTCGGCGTATCCTGACGCCCGCCACTGGCTGGTGCTGTGCGGTCATGGTAATAACGGCGGCGATGGCTACGTGGTCGCGCGACTGGCCAAAGCGGTCGGCATTGAGGT‑CACGTTGTTGGCCCAGGAGAGCGACAAACCGTTGCCGGAAGAGGCCGCGCTGGCACGCGAAGCATGGTTAAACGCGGGTGGCGAGATCCATGCTTCGAATATTGTCTGGCCCGAATCGGTAGATCTGATTGTT‑GATGCGCTGCTCGGT‑ACC‑GGTTTGCGGCAAGCGCCCCGCGAATCCATTAGCCAGTTAATCGACCACGCTAATTCCCATCCTGCGCCGATTGTGGCGGTTG > NC_000913/4394104‑4394568
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 13 ≤ ATCG/ATCG < 26 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
N/A
