Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A4 F9 I0 R1
|
260 |
102.5 |
2178490 |
93.2% |
2030352 |
226.0 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
freq |
annotation |
gene |
description |
| RA |
NC_000913 |
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C→G |
14.7% |
R418G (CGT→GGT) |
mdtF → |
anaerobic multidrug efflux transporter, ArcA‑regulated |
|
| |
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position |
ref |
new |
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reads |
annotation |
genes |
product |
| * | NC_000913 | 3,661,664 | 0 | C | G | 14.7%
| 210.0
/ 4.2
| 87 | R418G (CGT→GGT) | mdtF | anaerobic multidrug efflux transporter, ArcA‑regulated |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (40/32); new base G (9/6); total (49/38) |
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 7.84e-01 |
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
AAGTTTTCAAAACACTGGTTGAGGCTATCATCCTAGTCTTCCTGGTCATGTATCTGTTTT‑TGCAGAATTTCCGTGCCACAATCATCCCGACGATTGCCG‑TACCGGTGGTTATTCTCGGGACGTTTGCGATCTTGTCGGCGGTCGGTTTCACCATCAACACGTTGACTATGTTCGGGATGGTGCTGGCGATAGGGTTACTGGTGGATGACGCCATCGTGGTGGTGGAGAACGTCGAGCGTGTCATTGCGGAAGAT‑AAGCTACC‑GCCGAAGGAAGCGACGCATAAATCGATGGGG‑CAGATCCAACGTGCGCTGGTCGGTATTGCCGTTGTTCTTTCCGCAGTGTTTATGCCGATGGCCTTTATGAGCGGTGCAACCGGGGAGATCTACCGCCAGTTCTCCATCACGCTGATCTCCTCCATGCTGCTTTCAGTATTTGTGGCAATGAGCCTGACCCCTGCCCTGTGCGCCACCAT > NC_000913/3661428‑3661899
|
aaGTTTTCAAAACCCTGGTTGAGGCTATCATCCTAGTCTTCCTGGTCATGTATCTGTTTT‑TGCAGAATTTCCGTGCCACAATCATCCCGACGATTGCCG‑TACCGGTGGTTATTCTCGGGACGTTTGCGATCTTGTCGGCGGTCGGTTTCACCATCAACACGTTGACTATGTTCGGGATGGTGCTGGCGATAGGGTTACTGGTGGATGACGCCATCGTGGTGGTGGAGAACGTCGAGCg < 1:8560/238‑1 (MQ=255)
tttCAAAATTCTGGTTGAGGGCTTGTACCTATTCTTCCGGGGTATTTTGCTGTTTG‑TGGAAAACTTCCGGTCATCACACATCCGGTCGATTGCCGATACC‑GTGGTGAGTCTAGGGACGTTTGCGATCTTGTGGGTGGGCGGTTGCAACATCAACACGTTTACTATGTTCGGGATGGTGCTGGCGATAGGTTTACTTGTGGAAGACTCCAGCGTGGTGGTGGAGAACTTCGAGCatgacg < 2:194745/239‑4 (MQ=255)
tttAAAAACCTTGGGTGAGGCTTTCATCCATGGCTTCCTTGGCATGTGTCTGTTTTGTGC‑GAATTTCCGGGCCACAATCATCCCGACGATTGCCG‑TACCGGTGGTTATTCTCGGGACGTTTGCGATCTTGTCGGCGGTCGGTTTCACCATCAACACGTTGACTATGTTCGGGATGGTGCTGGCGATAGGGTTACTGGTGGATGACGCCATCGTGGTGGTGGAGAACGTCGAGCGTGTCa < 2:9146/239‑1 (MQ=255)
taaacctcTGGTTTGGGTTTTCACCCTATTTTTCCGTGTCATGTATCTGTTTT‑GGCAGAATTTCCGTGCCACAATCATCCCGACGATTGCCG‑TACCGGTGGTTATTCTCGGGACGTTTGCGATCTTGTCGGCGGTCGGTTTCACCATCAACACGTGGACTATGTTCGGGATGGTGCTGGCGATAGGGTTACTGGTGGATGACGCCATCGTGGTGGTGGAGAACGTCGAGCGTGTCATTg < 2:434074/232‑1 (MQ=38)
aaaCCCTGGTTGAGGTTTTCCTCCCTGTTTTCGTGGGTATGGTTCTGTTTG‑TGCAGAATTTCCGTGCCCAAATCATCCCGACGATTGGCG‑TACCGGTGGTTATTCGCGGGACGTTTGCGGTCTTGTCGGCGGTCGGTTTCACCATCAACACGTTGACTATGTTCGGGATGGTGCTGGCGATAGGGTTACTGGTGGATGACGCCATCGTGGTGGTGGAGAACGTCGAGCGTGTCATTGCg < 2:989807/239‑1 (MQ=37)
acTGGTTGAGGCTATCATCCTAGTCTTCCTGGTCATGTATCTGTTTT‑TGCAGAATTTCCGTGCCACAATCATCCCGACGATTGCCG‑TACCGGTGGTTATTCTCGGGACGTTTGCGATCTTGTCGGCGGTCGGTTTCACCATCAACACGTTGACTCTGTTCGGGATGGTGCTGGCGATAGGGTTACTGGTGGATTACGCCATCGTGGGGGTGGTGAAAGTCGGGCGGGTACTTGCGGGAg > 1:952875/1‑239 (MQ=255)
tGGTTGAGGCTATCATCCTAGTCTTCCTGGTCATGTATCTGTTTT‑TGCAGAATTTCCGTGCCACAATCATCCCGACGATTGCCG‑TACCGGTGGTTATTCTCGGGACGTTTGCGATCTTGTCGGCGGTCGGTTTCACCATCAACACGTTGACTATGTTCGGGATGGTGCTGGCGATAGGGTTACTGGGGGATGACGCCATCGTGGGGGGGGGGAACGTCGGGCGGGTCATTTGGGAGGAt > 1:148455/1‑239 (MQ=255)
ggCTATCATCCTAGTCTTCCTGGTCATGTATCTGTTTT‑TGCAGAATTTCCGTGCCACAATCATCCCGACGATTGCCG‑TACCGGTGGTTATTCTCGGGACGTTTGCGATCTTGTCGGCGGTCGGTTTCACCATCAACACGTTGACTATGTTCGGGATGGTGCTGGCGTTAGGGTTACTGGGGGATGCAGCCATCCTGGTGGTGGGGAACGTCGAGGGGGTCATTGGGGAAGAT‑AAGCTa > 1:90159/1‑238 (MQ=255)
ggCTATCATCCTAGTCTTCCTGGTCATGTATCTGTTTT‑TGCAGAATTTCCGTGCCACAATCATCCCGACGATTGCCG‑TACCGGTGGTTATTCTCGGGACGTTTGCGATCTTGTCGGCGGTCGGTTTCACCATCAACACGTTGACTATGTTCGGGATGGGGCTGGCGGTAGGGTTACTGGTGGATGACGCCATCGGGGTGGGGGGGAACGGCGGGGGGGTCATTGCGGAAGAT‑AAGCTa > 1:590110/1‑238 (MQ=255)
ggCTATCATCCTAGTCTTCCTGGTCATGTATCTGTTTT‑TGCAGAATTTCCGTGCCACAATCATCCCGACGATTGCCG‑TACCGGTGGTTATTCTCGGGACGTTTGCGATCTTGTCGGCGGTCGGGTTCACCATCAACACGTTGACTATGTTCGGGATGGTGCTGGCGGTAGGGTTACTGGTGGATGACGCCCTCGTGGGGGGGGGGGAGGGCGAGGGGGTCATTGCGGAAGaa‑aaaccac > 2:1041376/1‑234 (MQ=255)
ggCTATCATCCTAGTCTTCCTGGTCATGTATCTGTTTT‑TGCAGAATTTCCGTGCCACAATCATCCCGACGATTGCCG‑TACCGGTGGTTATTCTCGGGACGTTTGCGATCTTGTCGGCGGTCGGGTTCACCATCAACACGTTGACTATGTTCGGGAGGGTGCTGGCGATAGGGTTACTGGGGGATGACGCCATCGTGGTGGTGGGGAACGTCGAGGGTGTCATTGCGGAAGGT‑AAGCTa > 1:796058/1‑238 (MQ=255)
tcatcCTAGTCTTCCTGGTCATGTATCTGTTTT‑TGCAGAATTTCCGTGCCACAATCATCCCGACGATTGCCG‑TACCGGTGGTTATTCTCGGGACGTTTGCGATCTTGTCGGCGGTCGGTTTCACCATCAACACGTTGACTATGTTCGGGATGGTGCTGGCGATGGGGTTACTGGTGGATGACGCCATCGTGGTGGGGGGGAACGTCGGGCGTGTCATTGCGGAAGAT‑AAGCTAcc‑gccc > 1:498230/1‑238 (MQ=255)
ccTGGTCATGTATCTGTTTT‑TGCAGAATTTCCGTGCCACAATCATCCCGACGATTGCCG‑TACCGGTGGTTATTCTCGGGACGTTTGCGATCTTGTCGGCGGTCGGTTTTACCATCAACACGTTGACTATGTTCGGGGTGGGGCTGGCGTGAGGGTTTCTGGGGGGTGAGCCCCTCGTGGGGGTGGGGAACGTCGAGGGGGGCCATGCGGAAGAT‑aaagaaacccccacagaaaggaaga > 2:226876/1‑216 (MQ=255)
ccTGGTCATGTATCTGTTTT‑TGCAGAATTTCCGTGCCACAATCATCCCGACGATTGCCG‑TACCGGTGGTTATTCTCGGGACGTTTGCGATCTTGTCGGCGGTCGGTTTCACCATCAACACGTTTACTATGTTCGGGATGGGGCTGGCGATCGGGGTACTGGTGGATGACCCCCTCGTGGGGTGGGAGAACGTCGCGCGGGGCCTTTCGGGAGGT‑AAACTTCC‑CCCcaaggaaggcggcc > 1:593189/1‑233 (MQ=255)
ttgtattttttttttttt‑tGCGAATTTTCCGGGCCCCAATCACCCCGGAGATTGCCG‑TCCCGGGGGTTATTCTCGGGACGTTTGGGATCTTGTCGGCGGTCGGTTTCCCCATCAACACGTTGACTATGTTCGGGATGGTGCTGGCGATAGGGTTACTGGTGGATGACGCCAGCGTGGTGGTGGAGAACGTCGAGCGTGTCATTGCGGAAGAT‑AAGCTACC‑GCCGAAGGAAGCGACGCAt < 2:108152/225‑1 (MQ=255)
cATGTATCTGTTTT‑TGCAGAATTTCCGTGCCACAATCATCCCGACGATTGCCG‑TACCGGTGGTTATTCTCGGGACGTTTGCGATCTTGTCGGCGGTCGGTTTCACCATCAACACGTTGACTATGTTCGGGATGGTGCTGGCGATAGGGTTACTGGTGGATGACGCCATCGTGGTGGGGGGGAACGTCGAGGGGGTCATTGCGGAAGAT‑AAGCTACC‑GCCGAAGGAAACGACGCATAAAt > 1:108152/1‑239 (MQ=255)
tGTATCTGTTTT‑TGCAGAATTTCCGTGCCACAATCATCCCGACGATTGCCG‑TACCGGTGGTTATTCTCGGGACGTTTGCGATCTTGTCGGCGGTCGGTTTTACCATCAACACGGTGGCTTTGTTCGGGATGGTGCTGGCGATCGGGGTACTGGTGGGTGACGCCCTCGTGGTGGTGGGGAACGTCGAGCGGGTCATTTCGGGAGAT‑AAACGAAC‑GCCGAAGGAAAGGAAGCACaaaaag > 2:258982/1‑236 (MQ=255)
gTATCTGTTTT‑TGCAGAATTTCCGTGCCACAATCATCCCGACGATTGCCG‑TACCGGTGGTTATTCTCGGGACGTTTACGATCTTGTCGGCGGTCGGTTTCACCATCAACACGATGACTATGTTCGGGATGGGGCTGGCGGTAGGGTTACTGGTGGATGACGCCATCGTGGGGGTGGAGAACGTCGAGCGTGGACTTGCGGAAGAT‑AAGCTACC‑GCCGAAGGGAGCGACGCATAAATCGa > 1:146049/1‑239 (MQ=255)
tATGTGTTTT‑TGCAGAATTTCAGTGCCACATTCATGCCGGCGTGTGGCG‑TGCCGGTGGTTATGCTCGGGACGTTGGCGATTTTGCCGGGGGTCGGTTTCACCATCAAGACGTTGACTATGTTCGGGATGGGGCTGGCGATAGGGTTACTGGTGGATGACGCCATCGTGGTGGTGGAGAACGTCGGGCGTGTCATTGCGGAAGAT‑AAGCTACC‑GCCGAAGGAAGCGACGCATAAATCGAt < 2:291427/239‑1 (MQ=255)
tATCTGTTTT‑TGCAGAATTTCCGTGCCACAATCATCCCGACGATTGCCG‑TACCGGTGGTTATTCTCGGGACGTTTGCGATCTTGTCGGCGGTCGGGTTCACCATCCACAAGTTTACTATGTTCGGGGTGGGGCCGGCGGTAGGGGTACTGGGGGATGAAGCCAACGGGGGGGGGGGGAAAGCGGGGGGGGTCCTTGGGGGAGAG‑AAAGTACCGGGGGAAGGAAGGGACGCAaaaacaag > 2:251392/1‑235 (MQ=255)
tATCTGTTTT‑TGCAGAATTTCCGTGCCACAATCACCCCGGCGATTGCCG‑TACCGGTGGTTATTCTCGGGACGTTTGCGATCTTGTCGGCGGTCGGTTTCACCATCAACACGTTGACTATGTTCGGGATGGTGCTGGCGATAGGGTTACTGGTGGATGACGCCATCGTGGTGGTGGAGAACGTCGAGCGTGTCATTGCGGAAGAT‑AAGCTACC‑GCCGAAGGAAGCGACGCATAAATCGAt < 1:597364/239‑1 (MQ=255)
tGTTTT‑TGCAGAATTTCCGTGCCACAATCATCCCGACGATTGCCG‑TACCGGTGGTTATTCTCGGGACGTTTGCGATCTTGTCGGCGGTCGGTTTCACCATCAACACGTTGACTATGTTCGGGATGGTGCTGGCGATAGGGTTACTGGTGGATGACGCCATCGTGGTGGTGGGGAACGTCGAGGGTGTCATTGCGG‑AGATAAAGCTACC‑CCCGCAGGAAGCGGCGCATAAAtttgtctct > 1:667258/1‑231 (MQ=39)
ttttt‑tGCAGAATTTCCGGGCCACAATCATCCCGACGCTTTCCG‑TACCGGTGGTTATTCTCGGGACGTTTGCGATCTTGTCGGCGGTCGGTTTCACCATCAACACGTTGACTATGTTCGGGATGGTGCTGGCGATAGGGTTACTGGTGGATGACGCCATCGTGGTGGTGGAGAACGTCGAGCGTGTCATTGCGGAAGGT‑AAGCTACC‑GCCGAAGGAAGCGACGCATAAATCGATGGGG‑c < 1:809692/238‑1 (MQ=255)
gTTTT‑TGCAGAATTTCCGTGCCACAATCATCCCGACGATTGCCG‑TACCGGTGGTTATTCTCGGGACGTTTGCGATCTTGTCGGCGGGCGGTTTCACCATCAACACGTTGGCTTTGTTCGGGATGGTGCTGGGGATAGGGGTACTGGTGGATGACGCCCTCGGGGGGGGGGGGGACGGCGGGGGGGGCATTGCGGGAGATAAAGTCACC‑G‑CGAAGGAAGCGGGCCAAAAAACAATggggg > 2:597384/1‑238 (MQ=255)
ttggaaaaTTTCCGTGCCACATTTATCCCGACGTTTGGCG‑TACGTGTGGTTATTCTCGGGACGTTTGCGATCTTGTGGGCGGTCGGTTTCCCCATCAACACGTTGACTATGTTCGGGATGGTGCTGGCGATAGGGTTAATGGTGGATGACGCCATCGTGGTGGTGGAGAACGTCGAGCGTGTCATTGCGGAAGAT‑AAGCTACC‑GCCGAAGGAAGCGACGCATAAATCGATGGGG‑CAGAt < 2:1023858/233‑1 (MQ=39)
ccG‑TACCGGTGGTTATTCTCGGGACGTTTGCGATCTTGTCGGCGGTCGGGTTCACCATCAACACGTTGACTATTTTCGGGATGGTGCTGGCGATAGGGTTACTGGTGGATGACGCCATCGTGGGGGTGGGGAACGTCGAGCGTGTCATTGCGGAAGAT‑AAGCTACC‑GCCGAAGGAAGCGACGCATAAATCGATGGGG‑CAGAGCCAACGTGCGCTGGGCGGGATTTCCGTTGGTCTTTc > 1:636018/1‑238 (MQ=255)
g‑TACCGGTGGTTCTCCTCGGGACGTTGGCGATCTTGTCGGCGGTCGGTTTCACCAGCAACACGTTGACTATGTTCGGGATGGGGCTGGCGATAGGGTTACTGGTGGATGACGCCATCGTGGTGGTGGAGAACGTCGAGCGTGTCATTGCGGAAGAT‑AAGCTACC‑GCCGAAGGAAGCGACGCATAAATCGATGGGG‑CAGATCCAACGTGCGCTGGTCGGTATTGCCGTTGTTCTTTCCGc < 1:143656/239‑1 (MQ=255)
g‑TACCGGTGGTTATTCTCGGGACGTTTGCGATCTTGTCGGCGGTCGGTTTCACCATCAACACGTTGACTATGTTCGGGATGGTGCTGGCGATAGGGTTACTGGTGGATGACGCCATCGTGGTGGTGGAGAACGTCGAGCGTGTCATTGCGGAAGAT‑AAGCTACC‑GCCGAAGGAAGCGACGCATAAATCGATGGGG‑CAGATCCAACGTGCGCTGGTCGGTATTGCCGTTGTTCTTTCCGc < 1:258982/239‑1 (MQ=255)
tccggggtttttttcgggggtgTTTGGGTTGTTGGCGGGGGGCGGTTTCCCCATCAACACGGTGACTATGTTCGGGATGGGGCGGGCGATAGGGTTACTGGGGGATGACGCCATCGTGGTGGTGGAGAACGTCGAGCGTGTCATTGCGGAAGAT‑AAGCTACC‑GCCGAAGGAAGCGACGCATAAATCGATGGGG‑CAGATCCAACGTGCGCTGGTCGGTATTGCCGTTGTTCTTTCCGCAg < 2:590110/218‑1 (MQ=255)
ggtTATTCTCGGGACGTTTGCGATCTTGTCGGCGGTCGGTTTCACCATCAACACGTTGACTATGTTCGGGGTGGTGCTGGCGATAGGGTTACTGGTGGATGACGCCATCGTGGGGGGGGAGAACGTCGGGCGGGGCATTGCGGAAGAT‑AAACTACC‑GCCGAAGGAAGCGACCCATAAATCGATGGGGCCAGA‑CCAACCGGCGCGGGACGGGAATAGCGTTGtttttttccccgggtttt > 2:221426/1‑227 (MQ=255)
tttcGGGACGTTTGCGTTCTTGTCGGCGGTCGGTTTCCCCATCAACCGGTTGACTATGTTCGGGATGGTGCTGGCGATAGGGTTACGGGTGGATGACGCCATCGTGGTGGTGGAGAACGTCGAGCGTGTCATTGCGGAAGAT‑AAGCTACC‑GCCGAAGGAAGCGACGCATAAATCGATGGGG‑CAGATCCAACGTGCGCTGGTCGGTATTGCCGTTGTTCTTTCCGCAGTGTTTATGCCGa < 2:206391/237‑1 (MQ=255)
ttgcggggggttttggtttttGTCGGCGTGGTGTTTCCACATCAACGCGTTGGCTATGTTCGGGATGGGGCGGGCGATAGGGTTACTGGTGGATGACGCCATCGTGGTGGTGGAGAACGTCGAGCGTGTCATTGCGGAAGAT‑AAGCTACC‑GCCGAAGGAAGCGACGCATAAATCGATGGGG‑CAGATCCAACGTGCGCTGGTCGGTATTGCCGTTGTTCTTTCCGCAGTGTTTATGCCGa < 2:90159/220‑1 (MQ=255)
tctgGGGACTTTTGCGATCTGGGCGGCTGTCTGTTTCCCCATCAACACGTTGACTATGTTCGGGATGGTGCTGGCTATAGGGTTACTGGTGGATTACGCCATCGTGGTGGTGGAGAACGTCGAGCGTTTCATTGCGGAAGAT‑AAGCTACC‑GCCGAAGGAAGCGACGCATAAATCGATGGGG‑CAGATCCAACGTGCGCTGGTCGGTATTGCCGTTGTTCTTTCCGCAGTGTTTATGCCGa < 1:26685/239‑1 (MQ=255)
tctcGGGACGTTTGCGATTTTGGCGGCGGTCGGTTTCACCATCAACACGTTGACTATGTTCGGGATGGTGCTGGCGATAGGGTTACTGGTGGATGACGCCATCGTGGTGGTGGAGAACGTCGAGCGTGTCATTGCGGAAGAT‑AAGCTACC‑GCCGAAGGAAGCGACGCATAAATCGATGGGG‑CAGATCCAACGTGCGCTGGTCGGTATTGCCGTTGTTCTTTCCGCAGTGTTTATGCCGa < 1:226876/239‑1 (MQ=255)
ccGGGACGGTTGGGGTCTTGTCGGGGGTCGGTTTACCCATCAACCCGTTGACTTTGTTCGGGATGGTGCTGGCGATAGGGTTACTGGTGGATGACGCCATCGTGGTGGTGGAGAACGTCGAGCGTGTCATTGCGGAAGAT‑AAGCTACC‑GCCGAAGGAAGCGACGCATAAATCGATGGGG‑CAGATCCAACGTGCGCTGGTCGGTATTGCCGTTGTTCTTTCCGCAGTGTTTATGCCGATg < 1:251392/238‑1 (MQ=39)
cGGGACGTGTGGGATTTTTGCGGGGGGCGGTTTCACCATCAACACGTTGACTATGTTCGGGATGGTGCTGGCGATAGGGTTACTGGTGGATGACGCCATCGTGGTGGTGGAGAACGTCGAGCGTGTCATTGCGGAAGAT‑AAGCTACC‑GCCGAAGGAAGCGACGCATAAATCGATGGGG‑CAGATCCAACGTGCGCTGGTCGGTATTGCCGTTGTTCTTTCCGCAGTGTTTATGCCGATgg < 1:12236/239‑1 (MQ=255)
ggACGTTTGCGATCTTGTCGGCGGTCGGTTTCACCATCAACACGTTGACTATGTTCGGGATGGTGCGGGCGATAGGGTTACTGGTGGATGACGCCATCGTGGTGGTGGGGAACGTCGCGCGGGTCATTGGGGAAGAT‑AAGCTACC‑GCCGAAGGAAAGGACGCGTAAATATATGGGG‑AGGAACCCACCGGCGCTGGTGGGTGTGTCGGTAGTTATTTCCGCAggggttctagcggagg > 2:112498/1‑222 (MQ=255)
ggcGTTTGCGATTTTGGCGGCGGTCGGTTTCACCATCAACACGTTGACGGTGTTCGGGATGGTGCTGGGGATAGGGTTACTGGTGGATGACGCCATCGTGGTGGTGGAGAACGTCGAGCGTGTCATTGCGGAAGAT‑AAGCTACC‑GCCGAAGGAAGCGACGCATAAATCGATGGGG‑CAGATCCAACGTGCGCTGGTCGGTATTGCCGTTGTTCTTTCCGCAGTGTTTATGCCGATGGcc < 1:623384/236‑1 (MQ=255)
ttGCGATCTTGTCGGCGGTCGGTTTCACCATCAACACGTTGACTATGTTCGGGATGGTGCTGGCGATAGGGTTACTGGTGGATGACGCCATCGTGGTGGTGGAGAACGTCGAGCGTGTCATTGCGGAAGAT‑AAGCTACC‑GCCGAAGGAAGCGACGCATAAATCGATgggg < 1:347527/170‑1 (MQ=255)
tGCGATCTTGTCGGCGGTCGGTTTCACCATCAACACGTTGACTATGTTCGGGATGGTGCTGGCGATAGGGTTACTGGTGGATGACGCCATCGTGGGGGTGGAGAACGTCGAGCGTGTCATTGCGGAAGAT‑AAGCTACC‑GCCGAAGGAAGCGACGCATAAATCGATGGGG‑CAGATCCAACGTGCGCTGGTCGGGATTGCCGTTGTTCTTTCCGCAAGGTTTAGGCCGATGGCCTTTATGa > 1:261742/1‑239 (MQ=255)
ggggttttGTCCGCGGTCGGTTTCACCTACAACACGTTGACGAGGTTCGGGATGGTGCTGGCGATAGGGTTACTGGTGGATGACGCCATCGTGGTGGTGGAGAACGTCGGGCGTGTCATTGCGGAAGAT‑AAGCTACC‑GCCGAAGGAAGCGACGCATAAATCGATGGGG‑CAGATCCAACGTGCGCTGGTCGGTATTGCCGTTGTTCTTTCCGCAGTGTTTATGCCGATGGCCTTTATGAg < 1:376592/233‑1 (MQ=39)
gtCTTGTCGGGGGTCGTTTTCCCCTTCACCATGTTGATTTGTTTGGGGGTGGTGCTGGCGATAGGGTTACTGGTGGATGACGCCATCGTGGTGGTGGAGAACGTCGGGCGTGTCATTGCGGAAGAT‑AAGCTACC‑GCCGAAGGAAGCGACGCATAAATCGATGGGG‑CAGATCCAACGTGCGCTGGTCGGTATTGCCGTTGTTCTTTCCGCAGTGTTTATGCCGATGGCCTTTATGAGCgg < 2:489752/238‑1 (MQ=255)
cTTGGCGGCGGTCGGTTTCACCAGCAACACGGTGACTAGGTTCGGGATGGTGCTGGCGATAGGGTTACTGGTGGATGACGCCATCGTGGTGGTGGAGAACGTCGAGCGTGTCATTGCGGAAGAT‑AAGCTACC‑GCCGAAGGAAGCGACGCATAAATCGATGGGG‑CAGATCCAACGTGCGCTGGTCGGTATTGCCGTTGTTCTTTCCGCAGTGTTTATGCCGATGGCCTTTATGAGCGGTg < 1:1034850/239‑1 (MQ=255)
ttGTCGGCGGTCGGTTTCACCATCAAAACGTTGACTATGTTCGGGATGGTGCTGGCGATAGGGTTACTGGTGGATGAAGCCATCGTGGTGGGGGGGAACGTCGGGCGGGTCATTGCGGAAGAT‑AAGCTACC‑GCCGAAGGGAGCGACGCATAAAACGATGGGG‑CAGAGCCAAAGGGCGCTGGTGGGGTGTGCCGTGGTTTTTTTCCGAGGGTTGTGGCCGAGGGCCTTTTTGGGCGGGGc > 2:888788/1‑239 (MQ=255)
tcggtTTCACCATCAACACGTTGACTATGTTCGGGGTGGTGCTGGCGGTAGGGTTACTGGTGGGTGACGCCCTCGTGGGGGGGGAGAACGTCGAGCGGGTCATTGCGGAAGAT‑AAGCTACC‑GCCGGAGGAAGCGACGCCTAAATCGTTTGGG‑CGAATCCCACGGGCGCTGGGGGGGTATGCCGGTGTTTTTTCCCCAGGGTTTATTCCCATGGCCTTTTTTAGGGGGGCAACCGGGgag > 2:65332/1‑239 (MQ=255)
aaCACGTTGACTATGTTCGGGATGGTGCTGGCGATAGGGTTACTGGTGGATGACGCCATCGTGGTGGTGGAGAACGTCGAGCGTGTCATTGCGGAAGAT‑AAGCTACC‑GCCGAAGGAAGCGACGCATAAATCGATGGGG‑CAGATCCAACGTGCGCTGGTCGGTATTCCCGTTGTTCTTTCCGCAGTGTTTTTGCCGATGGCCTTTATGAGCGGGGCAACCGGGGGGATCAACCGCCAGt > 2:589152/1‑238 (MQ=255)
ttGACTATGTTCGGGATGGTGCTGGCGATAGGGTTACTGGTGGATGACGCCATCGTGGTGGTGGAGAACGTCGAGCGTGTCATTGCGGAAGAT‑AAGCTACC‑GCCGAAGGAAGCGACGCATAAATCGATGGGG‑CAGATCCAACGTGCGCTGGTCGGTATTGCCGTTGTTCTTTCCGCAGTGTTTATGCCGATGGCCTTTATGAGCGGGGCAACCGGGGAGATCTACCGCCAGTTTTCCa > 1:973672/1‑238 (MQ=255)
cttagggtggggtgggTGCTGGCAATGGGGTTACGGGTGGATGACGCCATGGGGGGGGTGGAGAACGGCGGGCGTGTCATTGCGGAAGAT‑AAGCTACC‑GCCGAAGGAAGCGACGCATAAATCGATGGGG‑CAGATCCAACGTGCGCTGGTCGGTATTGCCGTTGTTCTTTCCGCAGTGTTTATGCCGATGGCCTTTATGAGCGGTGCAACCGGGGAGATCTACCGCCAGtt < 1:209432/216‑1 (MQ=255)
ttCGGGATGGTGCTGGCGATAGGGTTACTGGTGGATGACGCCATCGTGGTGGTGGAGAACGTCGAGCGTGTCATTGCGGAAGAT‑AAGCTACC‑GCCGAAGGAAGCGACGCATAAATCGATGGGG‑CAGATCCAACGTGCGCTGGTCGGTATTGCCGTTGTTCTTTCCGc > 1:157812/1‑167 (MQ=255)
ttCGGGATGGTGCTGGCGATAGGGTTACTGGTGGATGACGCCATCGTGGTGGTGGAGAACGTCGAGCGTGTCATTGCGGAAGAT‑AAGCTACC‑GCCGAAGGAAGCGACGCATAAATCGATGGGG‑CAGATCCAACGTGCGCTGGTCGGTATTGCCGTTGTTCTTTCCGc < 2:157812/167‑1 (MQ=255)
ggATGGTGCTGGCGATAGGGTTACTGGTGGATGACGCCATCGTGGTGGTGGAGAACGTCGAGCGTGTCATTGCGGAAGAT‑AAGCTACC‑GCCGAAGGAAGCGACGCATAAATCGATGGGG‑CAGATCCAACGTGCGCTGGTCGGTATTGCCGTTGTTCTTTCCGCAGTGTTTATGCCGTTGGCCTTTATGAGCGGTGCAACCGGGGAGATTTACCGCCGGTTCTCCATCAcccctgtccct > 2:209432/1‑229 (MQ=255)
ggATGGTGCTGGCGATAGGGTTACTGGTGGATGACGCCATCGTGGTGGTGGAGAACGTCGAGCGTGTCATTGCGGAAGAT‑AAGCTACC‑GCCGAAGGAAGCGACGCATAAATCGATGGGG‑CAGATCCAACGTGCGCTGGTCGGTATTGCCGTTGTTCTTTCCGCAGTGTTTATGCCGATGGCCTTTATACGCGTGGCAACCGGGGAGATCCACCGCCAATTGTCCATCACCCTGGTctcc > 2:456962/1‑239 (MQ=39)
ggTGCTGGCGATAGGGTTACTGGTGGATGACGCCATCGTGGTGGTGGAGAACGTCGAGCGTGTCATTGCGGAAGAT‑AAGCTACC‑GCCGAAGGAAGCGACGCTTAAATCGCTGGGG‑CAGATCCAACGTCGTCGGGTCGGGATTGCCGTTGTTCTTTCCGCAGTGTTAATGCCGATGGCCTTAATGAGCGGTCAACCCGGGGAGATCTACCGCAAGTTTCCCATCACGCTGACttcctc > 2:244816/1‑237 (MQ=255)
ggTGCTGGCGATAGGGTTACTGGTGGATGACGCCATCGTGGTGGTGGAGAACGTCGAGCGTGTCATTGCGGAAGAT‑AAGCTACC‑GCCGAAGGAAGCGACGCATAAATCGATGGGG‑CAGATCCAACGTGCGCTGGTCGGTATTGCCGTTGTTCTTTCCGCAGTGTTTATGCCGAGGGCCTTTATGCGCGTGGCAACCGGGGAGATCTACCGCCAGTTCTCCATCACGCTGATCTCCTCCa > 1:640506/1‑239 (MQ=255)
tGCTGGCGATCGGGTTACTGGTGGATGACGCCATCGTGGTGGTGGAGAACGTCGAGCGTGTCATTGCGGAAGAT‑AAGCTACC‑GCCGAAGGAAGCGACGCATAAATCGATGGGG‑CAGATCCAACGTGCGCTGGTCGGTCTTGACGTTGTTCTTTCCGCCGTGTTTATGCCGATGGCCTTTATGAGCGGTGCAACGTGGGACATCTACCGCACGTTCTCCTCCACGCTGATCtcctccct > 2:700162/1‑236 (MQ=255)
tGCTGGCGATAGGGTTACTGGTGGATGACGCCATCGTGGTGGTGGAGAACGTCGAGCGTGTCATTGCGGAAGAT‑AAGCTACC‑GCCGAAGGAAGCGAAGCATAAATCGATGGGG‑CAGATCCAACGTGCGCTGGTCGGTATTCCCGTTGTTCTTTCCCCAGGGTTTATGCCGATGGCCTTTATGGTCGGTGCCACCGGGGGAGTATACCGCCCGTTACCCCTCACCCCGATCTCCCCCagg > 2:564517/1‑237 (MQ=255)
gcgggCGATGGGGTTCCGGGTGGATGACGCCATCGTGGCGGGGGAAAACGTGGGGCGTTTCATTGCGGAAGAT‑AAGCTACC‑GCCGAAGGAAGCGACGCATAAATCGAGGGGG‑CAGATCCAAGGTGCGCTGGTCGGTATTGCCGTTGTTCTTTCCGCAGTGTTTATGCCGATGGCCTTTATGAGCGGTGCAACCGGGGAGATCTACCGCCAGTTCTCCATCACGCTGATCTCCTCCAtg < 1:726452/235‑1 (MQ=255)
ggCGATAGGGTTACTGGTGGATGACGCCATCGTGGTGGTGGAGAACGTCGAGCGTGTCATTGCGGAAGAT‑AAGCTACC‑GCCGAAGGAAGCGACGCATAAATCGATGGGG‑CAGATCCAACGTGCGCTGGTCGGTATTGCCGTTGTTCTTTCCGCAGTGTTTATGCCGTTGGCCTTTATGAGCGGTGCAACCGGGGAGGTCACACGCCAGTTTTCCACCCCCCGAATCTCCTCCAggcg > 2:378371/1‑236 (MQ=255)
cGATGGGGTTACGGGTGGATGCCGCCATGGGGGGGGTGGAGAACGTCGAGGGTGTCATTGCGGAAGAT‑AAGCTACC‑GCCGAAGGAAGCGACGCATAAATCGGTGGGG‑CAGATCCAACGTGCGCTGGTCGGTATTGCCGTTGTTCTTTCCGCAGTGTTTATGCCGATGGCCTTTATGAGCGGTGCAACCGGGGAGATCTACCGCCAGTTCTCCATCACGCTGATCTCCTCCATgctgct < 1:221426/238‑1 (MQ=255)
aGGGTTACTGGTGGATGACGCCATCGTGGTGGTGGAGAACGTCGAGCGTGTCATTGCGGAAGAT‑AAGCTACC‑GCCGAAGGAAGCGACGCATAAATCGATGGGG‑CAGATCCACCGTGCGCTGGTCGGTATTGCCGTTGTTCTTTCCGCAGTGTTTATGCCGATGGCCTTTATGAGCGGTGCACCCGGGGAGATCTACCGCCAGTTCTCCATCACGCTGATCTCCTCCATGCGGCTTTCat > 1:238918/1‑238 (MQ=255)
ggTTACTGGTGGATGACGCCATCGTGGTGGTGGAGAACGTCGAGCGTGTCATTGCGGAAGAT‑AAGCTACC‑GCCGAAGGAAGCGACGCATAAATCGATGGGG‑CAGATCCAACGTGCGCTGGTCGGTATTGCCGTTGTTCTTTCCGCAGTGTTTATGCCGa < 1:202728/159‑1 (MQ=255)
cgggtgggtgACGCAATCGGGGGGGTGGAAACCGTCGAGGGTGTCATGGCGGAAGAT‑AAGCTACC‑GCCGAAGGAAGGGACGCATAAATCGATGGGG‑CAGATCCAACGGGCGCTGGTCGGTATTGCCGTTGTTCTTTCCGCAGTGTTTATGCCGATGGCCTTTATGAGCGGTGCAACCGGGGAGATCTACCGCCAGTTCTCCATCACGCTGATCTCCTCCATGCTGCTTTCAGTATTtgt < 1:65332/237‑1 (MQ=255)
ggtgtccccctttgtgtggggggAGACCGTGGGGGGTTTCATGGGGGAGAAT‑AAGCTCCC‑GCCGAAGGAGGCGACGATTAAATCGAGGGGG‑CAGATCCAACGTGCGCTGGTCGGTATTGCCGTTGTTCTTTCCGGAGTGTTTATGCCGATGGCCTTTATGAGCGGTGCAACCGGGGAGATCTACCGCCAGTTCTCCATCACGCTGATCTCCTCCATGCTGCTTTCAGTATTTGTGGCaa < 2:636018/218‑1 (MQ=255)
ggATGACGCCATCGTGGTGGTGGAGAACGTCGAGCGTGTCATTGCGGAAGAT‑AAGCTACC‑GCCGAAGGAAGCGACGCATAAATCGAt < 1:809721/87‑1 (MQ=255)
ggATGACGCCATCGTGGTGGTGGAGAACGTCGAGCGTGTCATTGCGGAAGAT‑AAGCTACC‑GCCGAAGGAAGCGACGCATAAATCGAt > 2:809721/1‑87 (MQ=255)
ggATGACGCCATCGTGGTGGTGGAGAACGTCGAGCGTGTCATTGCGGAAGAT‑AAGCTACC‑GCCGAAGGAAGCGACGCATAAATCGATGGGG‑CAGATCCAACGTGCGCTGGTCGGTATTGCCGTTGTTCTTTCCGCAGTGTTTATGCCGCTGGCCTTTATGAGCGGTGCAACCGGGGAGATCTACCGCCAGTTCTCCATCACGCTGGTCTCCTCCATGCTGCTTTCGGTATTTTGGGCaa > 1:345970/1‑239 (MQ=255)
ggATGACGCCATCGTGGTGGTGGAGAACGTCGAGCGTGTCATTGCGGAAGAT‑AAGCTACC‑GCCGAAGGAAGCGACGCATAAATCGATGGGG‑CAGATCCAACGTGCGCTGGTCGGTATTGCCGTTGTTCTTTCCGCAGTGTTTATGCCGATGGCCTTTATGAGCGGTGCAACCGGGGGGATCTACCGCCAGTTCTCCATCACGCTGATCTCCTCCATGCTGCTTTCAGTATTTTTGGCaa > 1:393910/1‑239 (MQ=255)
ggATGACGCCATCGTGGTGGTGGAGAACGTCGAGCGTGTCATTGCGGAAGAT‑AAGCTACC‑GCCGAAGGAAGCGACGCATAAATCGATGGGG‑CAGATCCAACGTGCGCTGGTCGGTATTGCCGTTGTTCTTTCCGCAGTGTTTATGCCGATGGCCTTTATGAGCGGTGCAACCGGGGAGATCTACCGCCAGTTCTCCATCACGCTGATCTCCTCCATGCTGCTTTCAGTATTTGTGGCaa > 1:98565/1‑239 (MQ=255)
ggATGACGCCATCGTGGTGGTGGAGAACGTCGAGCGTGTCATTGCGGAAGAT‑AAGCTACC‑GCCGAAGGAAGCGACGCATAAATCGATGGGG‑CAGATCCAACGTGCGCTGGTCGGTATTGCCGTTGTTCTTTCCGCAGTGTTTATGCCGATGCCCTTTATGAGCGGTGCAACCGGGGAGATCTACCGCCCGTTCCCCATCCCGCTGATCGCCCCCCACCTGCTTTACGTAGTTGTGGCaa > 2:639031/1‑239 (MQ=255)
gATGACGCCATCGTGGTGGTGGAGAACGTCGAGCGTGTCATTGCGGAAGAT‑AAGCTACC‑GCCGAAGGAAGCGACGCATAAATCGATGGGG‑CAGATCCAACGTGCGCTGGTCGGTATTGCCGTTGTTCTTTCCGCAGTGTTTATGCCGATGGCCTTTATGAGCGGGGCAACCGGGGAGATCTACCGCCAGTTCTCCATCACGCTGATCTCCTCCATGCTGCTTTCAGTATTTGTGGCAAt > 1:83824/1‑239 (MQ=255)
ttgccGCCATCGGGGTGGGGGAAACGGTCGGGGGTTCCATTGGGGAAGTA‑AAGCTACC‑GCCGAAGGAAGCGACGCATAAATCGATGGGG‑CAGATCCAACGTGCGCTGGTCGGTATTGCCGTTGTTCTTTCCGCAGTGTTTATGCCGATGGCCTTTATGAGCGGTGCAACCGGGGAGATCTACCGCCAGTTCTCCATCACGCTGATCTCCTCCATGCTGCTTTCAGTATTTGTGGCAAt < 1:589152/234‑1 (MQ=255)
cGCCATCGTGGTGGTGGAGAACGTCGAGCGTGTCATTGCGGAAGAT‑AAGCTCCC‑GCCGAAGGACGCGACGCATAACTCGATGGGG‑CAGATCCAACGTGCGCTGGTCGGTATTGCCGTTGTTCTTTCCGCAGTGTTTATGCCGATGGCCTTTATGAGCGGGGCAACCGGGGAGATCTACCGCCAGTTCTCCATCACGCTGATCTCCTCCACTCTGCTTTCCGTATTTGTGGCACTGAGca > 2:101710/1‑238 (MQ=255)
cGCCATCGTGGTGGTGGAGAACGTCGAGCGTGTCATTGCGGAAGAT‑AAGCTACC‑GCCGAAGGAAGCGACGCATAAATCGATGGGG‑CAGATCCAACGTGCGCTGGTCGGTATTGCCGTTGTTCTTTCCGCAGTGTTTATGCCGATGGCCTTTATGAGCGGTGCAACCGGGTAGATCTACCGCCAGTTCTCCATCACGCTGAGCTCTTCCAGGCTGCTTTCCGTATTTTGGGCaactgtct > 1:282194/1‑233 (MQ=255)
cGCCATCGTGGTGGTGGAGAACGTCGAGCGTGTCATTGCGGAAGAT‑AAGCTACC‑GCCGAAGGAAGCGACGCATAAATCGATGGGG‑CAGATCCAACGTGCGCTGGTCGGTATTGCCGTTGTTCTTTCCGCAGTGTTTATGCCGATGGCCTTTATGAGCGGTGCAACCGGGGAGATCTACCGCCAGTCCTCCATCACGCTGATCTCCTCCATGCTGCTTTCAGTATTTGTGGCAATGAGcc > 1:285692/1‑239 (MQ=255)
cccATGGTGGTGGTGGAGAACGTCGGGCGTGTCATTGCGAAAGAT‑AAGCTACC‑GCCGAAGGAAGCGACGCATAAATCGATGGGG‑CAGATCCAACGTGCGCTGGTCGGTATTGCCGTTGTTCTTTCCGCAGTGTTTATGCCGATGGCCTTTATGAGCGGTGCAACCGGGGAGATCTACCGCCAGTTCTCCATCACGCTGATCTCCTCCATGCTGCTTTCAGTATTTGTGGCAATGAGCCt < 1:195895/238‑1 (MQ=255)
cccATGGTGGGGGTGGAGACCGTCGAGCGTGTCATGGCGGAAGAG‑AAGCTACC‑GCGGAAGGAAGCGACGCATAAATCGATGGGG‑CAGATCCAACGTGCGCTGGTCGGTATTGCCGTTGTTCTTTCCGCAGTGTTTATGCCGATGGCCTTTATGAGCGGTGCAACCGGGGAGATCTACCGCCAGTTCTCCATCACGCTGATCTCCTCCATGCTGCTTTCAGTATTTGTGGCAATGAGCCt < 1:564517/238‑1 (MQ=255)
ccATCGTGGTGGTGGAGAACGTCGAGCGTGTCATTGCGGAAGAT‑AAGCTACC‑GCCGAAGGAAGCGACGCATAAATCGATGGGG‑CAGATCCAACGTGCGCTGGTCGGTATTGCCGTTGTTCTTTCCGCAGTGTTTATGCCGATGGCCTTTATGAGCGGGGGAACCTGGGGGATCTACCGCCAGTTACCCATCACGCTGATTTCCTCCATGCTGCTTTCAGTATTTGTGGCAATAAGCCt > 1:1049237/1‑238 (MQ=255)
caatgtgggtgtgggAGACGGTCGGGGGTGTCATGGCGGAAGAT‑AGGCTACC‑GCCGAAGGAAGCGACGCATAAAGCGATGGGG‑CAGATCCAACGGGCGCTGGTCGGTATTGCCGTTTTTCTTTCCGCAGTGTTTATGCCGATGGCCTTTATGAGCGGTGCAACCGGGGAGATCTACCGCCAGTTCTCCATCACGCTGATCTCCTCCATGCTGCTTTCAGTATTTGTGGCAATGAGCCt < 1:379836/225‑1 (MQ=255)
cATCGTGGTGGTGGAGAACGTCGAGCGTGTCATTGCGGAAGAT‑AAGCTACC‑GCCGAAGGAAGCGACGCATAAATCGATGGGG‑CAGATCCAACGTGCGCTGGTCGGTATTGCCGTTGTTCTTTCCCCCGGGTTTATGCCGATGGCCTTTATGAGCGGTGCAACCGGGGGGATTTACCGCCCGTTTTCCATCACCCTTATCCCCCCCACGCTGCTTTCAGTATTTTGGGCAATCAGccgg > 2:331427/1‑236 (MQ=255)
gtggtggAGAACGTCGAGCGTGTCATTGCGGAAGAT‑AAGCTACC‑GCCGAAGGAAGCGACGCATAAATCGATGGGG‑CAGATCCAACGTGCGCTGGTCGGTATTGCCGTTGTTCTTTCCGCAGTGTTTATGCCGATGGCCTTTATGAGCGGTGCAACCGGGGAGATCTACCGCCAGTTCTCCATCACGCTGAtctc > 1:198584/1‑194 (MQ=255)
ggtggAGAACGTCAGGGGGTTCATTGGGGAAGAT‑AGCCTCCC‑GCCGAAGGAAGCGACGCATAAATCGATGGGG‑CAGATCCAACGTGCGCTGGTCGGTATTGCCGTTGTTCTTTCCGCAGTGTTTATGCCGATGGCCTTTATGAGCGGTGCAACCGGGGAGATCTACCGCCAGTTCTCCATCACGCTGATCTCCTCCATGCTGCTTTCAGTATTTGTGGCAATGAGCCTGACccctgcc < 1:717586/238‑1 (MQ=255)
gtggAGAACGTCGAGCGTGTCATTGCGGAAGAT‑AAGCTACC‑GCCGAAGGAAGCGACGCATAAATCGATGGGG‑CAGATCCAACGTGCGCTGGTCGGTATTGCCGTTGTTCTTTCCGCAGTGTTTATGCCGATGGCCTTTATGAGCGGTGCAACCGGGGAGATCTACCGCCAGTTCTCCATCCCCCCGATCTCCTCCATCCTGATTTCCGTATTTGGGGCAATGAGCCTGACccctgc > 2:901280/1‑236 (MQ=255)
tggAGAACGTCGAGCGTGTCATTGCGGAAGAT‑AAGCTACC‑GCCGAAGGAAGCGACGCATAAATCGATgggg < 2:868372/71‑1 (MQ=255)
tggAGAACGTCGAGCGTGTCATTGCGGAAGAT‑AAGCTACC‑GCCGAAGGAAGCGACGCATAAATCGATgggg > 1:868372/1‑71 (MQ=255)
agaACGTCGAGCGTGTCATTGCGGAAGAT‑AAGCTACC‑GCCGAAGAAAGCGACGCCTAAATCGATGGGG‑CCGCTCCAACGTGCGCTGGTCGGTATTGCCGTTGTTCTTTCCGCAGCGTTTCTGCCGATGGCCTTCATGAGCGGTGCACCCGGGGAGATCTACCACCCGTTCACCCTCACGCTGATTTTCCCCCCGCCGCTTTCAGTATTTGTGCCACTAAACTTCACccccgcccaagc > 2:247373/1‑234 (MQ=255)
tCGAGCGTGTCATTGCGGAAGAT‑AAGCTACC‑GCCGAAGGAAGCGACGCATAAATCGATGGGG‑CAGATCCAACGTGCGCTGGTCGGTATTGCCGTTGTTCTTTCCGCAGTGTTTATGCCGATGGCCTTTATGAGCGGTGCAACCGGGGAGATCTACCGCCAGTTCTCACTCACGCTGATCTCCTCCATGCTGCTTTCAGTATTTGTGGCAATGAGCCTGACccctgcccttggggccccc > 2:772494/1‑229 (MQ=255)
aGCGTGTCATTGCGGAAGAT‑AAGCTACC‑GCCGAAGGAAGCGACGCATAAATCGATGGGG‑CAGATCCAACGTGCGCTGGTCGGTATTGCCGTTGTTCTTTCCGCAGTGTTTATGCCGATGGCCTTTATGAGCGGTGCAACCGGGGAGATCTACCGCCAGTTCTCCATCACGCTGATCTCTTCCATGCTGCTTTCAGAATTTTTGGCAATGAGCCTGACCCCTGCCCTTTGCGccacctg > 1:658637/1‑236 (MQ=255)
|
AAGTTTTCAAAACACTGGTTGAGGCTATCATCCTAGTCTTCCTGGTCATGTATCTGTTTT‑TGCAGAATTTCCGTGCCACAATCATCCCGACGATTGCCG‑TACCGGTGGTTATTCTCGGGACGTTTGCGATCTTGTCGGCGGTCGGTTTCACCATCAACACGTTGACTATGTTCGGGATGGTGCTGGCGATAGGGTTACTGGTGGATGACGCCATCGTGGTGGTGGAGAACGTCGAGCGTGTCATTGCGGAAGAT‑AAGCTACC‑GCCGAAGGAAGCGACGCATAAATCGATGGGG‑CAGATCCAACGTGCGCTGGTCGGTATTGCCGTTGTTCTTTCCGCAGTGTTTATGCCGATGGCCTTTATGAGCGGTGCAACCGGGGAGATCTACCGCCAGTTCTCCATCACGCTGATCTCCTCCATGCTGCTTTCAGTATTTGTGGCAATGAGCCTGACCCCTGCCCTGTGCGCCACCAT > NC_000913/3661428‑3661899
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 13 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
N/A
