Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A4 F9 I0 R1
|
260 |
102.5 |
2178490 |
93.2% |
2030352 |
226.0 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
freq |
annotation |
gene |
description |
| RA |
NC_000913 |
3,826,834 |
T→G |
15.4% |
G542G (GGT→GGG) |
recG → |
ATP‑dependent DNA helicase |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | NC_000913 | 3,826,834 | 0 | T | G | 15.4%
| 296.0
/ 2.5
| 125 | G542G (GGT→GGG) | recG | ATP‑dependent DNA helicase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (26/71); new base G (23/2); total (52/73) |
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 2.39e-09 |
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
Only 100 of 125 total aligned reads displayed.
GATACCCGCCGTACCGACATCATTGACCGCGTGCACCACGCCTGCATAACTGAAGGTCGTCAGGCATACTGGGTTTGTACGTTGATTGAAGAGTCGGAATTGCTGGAAGCGCAGGCGGCGGAAGCTACCTGGGAAGAGTTGAAACTGGCGCTACCAGAGTTGAACGTTGGCCTGGTACACGGGCGGATGAAACCTGCCGAGAAACAGGCGGTGATGGCGTCG‑TTTAAACAAGGTGA‑GCTACA‑CCTGCTGGTTGCCACAACCGTTATTGAAGTCGGCGTTGATGTGCCTAACGCCAGTCTGATGATTATCGAAAACCCGGAGCGTCTGGGTCTGGCGCAGTTACACCAGCTGCGCGGGCGCGTAGGTCGT‑GGCGCGGTGGCTTCTCACTGCGTGCTGCTCT‑ACAAAACGCCGC‑TTTCTAAAACGGCGCAAATTCGCCTGCAAGTGCTGCGCGACAGTAACGACGGTTTTGT > NC_000913/3826601‑3827070
|
ccccccccccGTACCGACATCTTGGCCCGCGTGACCCACGCCGGCATACCTGAAGGTCGTCAGGCGTGCGGGGTTTGTACGTTGATTGAAGAGTCGGAATTGCTGGAAGCGCAGGCGGCGGAAGCTACCTGGGAAGAGTTGAAACTGGCGCTACCAGAGTTGAACGTTGGCCTGGTACACGGGCGGATGAAACCTGCCGAGAAACAGGCGGTGATGGCGTCG‑TTTAAACAAGGTGA‑GCt < 2:940724/235‑1 (MQ=255)
ccgccgTACCGACATCATTGACCGCGTGCACCACGCCTGCATAACTGAAGGTCGTCAGGCATACTGGGTTTGTACGTTGATTGAAGAGTCGGAATTGCTGGAAGCGCAGGCGGCGGAAGCTACCTGGGAAGAGTTGCAACTGGCGCTACCAGAGTTGAACGTTGGCCTGGTACACGGGCGGATGAAACCTGCCGGGAAACAGGCGGGGCTGGCGTCG‑GTTTAACAAGGTGG‑GCttccc > 1:847200/1‑234 (MQ=255)
ccgccgTACCGACATCATTGACCGCGTGCACCACGCCTGCATAACTGAAGGTCGTCAGGCATACTGGGTTTGTACGTTGATTGAAGAGTCGGAATTGCTGGAAGCGCAGGCGGCGGAAGCTACCTGGGAAGAGTTGAAACTGGCGCTACCAGAGTTGAACGTTGGCCTGGTACACGGGCGGATGAAACCTGCCGAGAAACAGCCGGTGATGGCGTCG‑TTTAAACAAAGGGA‑GCTaca‑c > 1:743145/1‑238 (MQ=255)
gccgTACCGACATCATTGACCGCGTGCACCACGCCTGCATAACTGAAGGTCGTCAGGCATACTGGGTTTGTACGTTGATTGAAGAGTCGGAATTGCTGGAAGCGCAGGCGGCGGAAGCTACCTGGGAAGAGTTGAAACTGGCGCTACCAGAGTTGAACGTTGGCCTGGTACACGGGCGGATGAAACCTGCCGAGAAAAAGGCGGGGGGTGCGTGG‑GTTAGACAAAGGGA‑GCTacaaccg > 2:1028741/1‑235 (MQ=255)
gtccccaCATCATTTACCGCGGGCCCCCCGCTTGGAATAATGAAGGTCTGACGGTATGTGGGGTTTGTGCGGTGATGGAAGAGTCGGAATGGCTGGAAGCGCAGGCGGCGGAAGCTACCGGGGAAGAGTTGAAACTGGCGCTACCGGAGTTGACCGTTGGCCTGGTACACGGGCGGATGAACCCTGCCGAGAAACAGGCGGTGATGGCGTCG‑TTTAAACAAGGTGA‑GCTACA‑Cctgctg < 2:441752/233‑1 (MQ=255)
tACCGACATCATTGACCGCGTGCACCACGCCTGCATAACTGAAGGTCGTCAGGCATACTGGGTTTGTACGTTGATTGAAGAGTCGGAATTGCTGGAAGCGCAGGCGGCGGAAGCTACCTGGGAAGAGTTGAAACTGGCGCTACCAGAGTTGAACGTTGGCCTGGTACACGGGCGGATGAAACCTGCCGAGAAACAGGGGGTGATGGGGTCG‑TTTTAACAAAGGGT‑GCTACA‑CCTGCggg > 1:85084/1‑239 (MQ=255)
cccGACAGCATTGACCTCGTGCATCATGCTTGGATAGCGGAGAGTCGTCAGGCTGATGGGGTTTGGACGTTGATTGAAGCGGCGGTATGGCTGGAAGTGCAGGGGGCGGAAGCTACCTGGGAAGAGTTGAAACTGGCGCTACCAGAGTGGAACGTTGGCTGGGTACACGGGCGGATGAAACCTGCCGAGAAACAGGCGGTTATGGCGTCG‑TTTAAACAAGGTGA‑GCTAAA‑CCTGCTGGt < 2:680950/238‑1 (MQ=255)
gACATCATTGACCGCGTGCACCACGCCTGCATAACTGAAGGTCGTCAGGCATACTGGGTTTGTACGTTGATTGAAGAGTCGGAATTGCTGGAAGCGCAGGCGGCGGAAGCTACCTGGGAAGAGTTGAAACTGGCGCTACCAGAGTTGAACGTTGGCCTGGTACACGGGCGGATGAAACCGGCCGGGAAACAGGCGGGGAGGGGGGCG‑GTTAAACAAAGTgggagcaaactgcggggtgc > 1:1026365/1‑220 (MQ=255)
aCATCATTGACCGCGTGCACCACGCCTGCATAACTGAAGGTCGTCAGGCATACTGGGTTTGTACGTTGATTGAAGAGTCGGAATTGCTGGAAGCGCAGGCGGCGGAAGCTACCTGGGAAGAGTTGAAACTGGCGCTACCAGAGTTGAACGTTGGCCTGGTACACGGGCGGATGAAACCTGCCGAGAAACAGGCGGTGATGGCGTCG‑TTTAAACAAGGTGA‑GCTCCA‑ACTCCTGGTTGcc > 1:98072/1‑239 (MQ=255)
tatatTGGCGGCTTGCACCGCGGCTGCATAACTGGAGGGCGTCGGGCATGCTGGGTTTGTAAGTTGATTGAAGAGTCGGAATTGCTGGGAGCGAGGGCGGCGGAAGCTACCTGGGAAGAGTTGAAACTGGCGCTACCAGAGTTGAACGTTGGCCTGGTACACGGGCGGATGAAACCTGCCGAGAAACAGGCGGTGATGGCGTCG‑TTTAAACAAGGTGA‑GCTACA‑CCTGCTGGTTGCcac < 2:902308/236‑1 (MQ=255)
atcatTGACCGGGTGCACCGCGGCGGCATAAGTGAAGGTCGTCAGGCATACTGGGTTTGTACGTGGATTGAAGAGGCGGAATTGCTGGAAGCGCAGGCGGCGGAAGCTACCTGGGAAGAGTTGAAACGGGCGCTACCAGAGTTGAACGTTGGCCTGGTACACGGGCGGATGAAACCTGCCGAGAAACAGGCGGTGATGGCGTCG‑TTTAAACAAGGTGA‑GCTACA‑CCTGCTGGTTGCcac < 1:503142/239‑1 (MQ=255)
atcatTGACCGCGTGCACCACGCCTGCATAACTGAAGGTCGTCAGGCATACTGGGTTTGTACGTTGATTGAAGAGTCGGAATTGCTGGAAGCGCAGGCGGCGGAAGCTACCTGGGCAGAGTTGAAACTGGCGCTACCAGAGTTGAACGTTGGCCTGGGACACGGGGGGATGAAACCTGCCGAGAAACAGGGGGGGATAGGTGCT‑TTTAAAAAAGGGGA‑GCtcaacaccccggtggcgcc > 2:795308/1‑221 (MQ=255)
tcagTGACCGCGTGCACCACGGCTGCATAACTGAAGGTCGTCAGGCATACTGGGTTTGTACGTTGATTGAAGAGTCGGAATTGCTGGAAGCGCAGGCGGCGGAAGCTACCTGGGAAGAGTTGAAACTGGCGCTACCAGAGTTGAACGTTGGCCTGGTACACGGGCGGATGAAACCTGCCGAGAAACAGGCGGTGATGGCGTCG‑TTTAAACAAGGTGA‑GCTACA‑CCTGCTGGTTGCcac < 1:366418/238‑1 (MQ=255)
tGACCGCGTGCACCACGCCTGCATAACTGAAGGTCGTCAGGCATACTGGGTTTGTACGTTGATTGAAGAGTCGGAATTGCTGGAAGCGCAGGCGGCGGAAGCTACCTGGGAAGAGTTGAAACTGGCGCCACCAGAGTTGAACGTTGGCCTGGTACACGGGCGGATGAAACCTGCCGAGAAACAGGCGGGGCGGGGGTGG‑TTTAAAAAAGGTGG‑GGCACA‑CCGCCCGGGTGCGACAACCg > 2:733614/1‑239 (MQ=255)
cgcgTGCACCACGCCTGCATAACTGAAGGTCGTCAGGCATACTGGGTTTGTACGTTGATTGAAGAGTCGGAATTGCTGGAAGCGCAGGCGGCGGAAGCTACCTGGGAAGAGTTGAAACTGGCGCTACCAGAGTTGAACGTTGGCCTGGTACACGGGCGGATGAAACCTGCCGAGAAACAGGCGGTGATGGCCTCG‑TTTAAACCAGGTGA‑GCTACA‑CCTCCTGGTTGCcacccgtccctt > 1:73496/1‑230 (MQ=255)
gcgTGCACCACGCCTGCATAACTGAAGGTCGTCAGGCATACTGGGTTTGTACGTTGATTGAAGAGTCGGAATTGCTGGAAGCGCAGGCGGCGGAAGCTACCTGGGGAGAGTTGAAACTGGCGCTACCAGAGTTGGACGATGGCCTGGTACCCGGGCGGATGGAACCTGCCGAGAAACAGGGGGGGATGGCCTGG‑CTTCAAAAAGGGGA‑GCAACA‑CCAGCCGGGTGGcaacaacgtaatt > 2:727087/1‑228 (MQ=255)
tGCACCACGCCTGCATAACTGAAGGTCGTCAGGCATACTGGGTTTGTACGTTGATTGAAGAGTCGGAATTGCTGGAAGCGCAGGCGGCGGAAGCTACCTGGGAAGAGTTGAAACTGGCGCTACCAGAGTTGAACGTTGGCCTGGTACACGGGCGGATGAAACCTGCCGAGAACCAGGCGGGGATGGGGGCG‑TTTTAACAAGGGGG‑GCTAAC‑CCTGCTGGTTGCCACAAACggtttttaa > 1:575345/1‑231 (MQ=255)
ccccccGCCTGCATAACTGAAGGTCGGCAGGCATACTGGGTTTGTACGTTGATTGAAGAGTCGGAATTGCTGGAAGCGCAGGCGGCGGAAGCTACCTGGGAAGAGTTGAAACTGGCGCTACCAGAGTTGAACGTTGGCCTGGTACACGGGCGGATGAAACCTGCCGAGAAACAGGCGGTGATGGCGTCG‑TTTAAACAAGGTGA‑GCTACA‑CCTGCTGGTTGCCACAACCGTTATTGAAGt < 1:299156/234‑1 (MQ=255)
ccccccGCCTGCATAACCGAAGGGCGCCAGGCATACTGGGTTTGGACGTTGATTGAAGAGGCGGAATTGCTGGAAGCGCAGGCGGCGGAAGCTACCTGGGAAGAGGTGAAACTGGCGCTACCAGAGTTGAACGTTGGCCTGGTACACGGGCGGATGAAACCTGCCGAGAAACAGGCGGTGATGGCGTCG‑TTTAAACAAGGTGA‑GCTACA‑CCTGCTGGTTGCCACAACCGTTATTGAAGt < 2:847200/234‑1 (MQ=255)
ccccgcccTGCAAAAATGAAGGGTGTCAGGGATTGTGGGTTTGGCCGTTGATTGAAGGGTCGGAATTGCTGGAAGGGCAGGCGGCGGAAGCTACCTGGGAAGAGTTGAAACTGGCGCTACCAGAGTTGAACGTTGGCCTGGTACACGGGCGGATGAAACCTGCCGAGAAACAGGCGGTGATGGCGTCG‑TTTAAACAAGGTGA‑GCTACA‑CCTGCTGGTTGCCACAACCGTTATTGAAGt < 2:897181/232‑1 (MQ=255)
accccGCATGCATAACTGAAGGTCGGCAGGCATACTGGGTTTGTACGGTGATTGAAGAGTCGGAATTGGTGGAAGCGGAGGCGGCGGAACCTACCTGGGAAGAGTTGAAACTGGCGCTACCAGAGTTGAACGTTGGCCTGGTACACGGGCGGATGAAACCTGCCGAGAAACAGGCGGTGATGGCGTCG‑TTTAAACAAGGTGA‑GCTACA‑CCTGCTGGTTGCCACAACCGTTATTGAAGt < 1:902016/238‑1 (MQ=255)
accacGCCTGCATAACTGAAGGTCGGCAGGCATACTGGGTTTGTACGTTGATTGAAGAGTCGGAATTGCTGGAAGCGCAGGCGGCGGAAGCTACCTGGGAAGAGTTGAAACTGGCGCTACCAGAGTTGAACGTTGGCCTGGTACACGGGCGGATGAAACCTGCCGAGAAACAGGCGGTGATGGCGTCG‑TTTAAACAAGGTGA‑GCTACA‑CCTGCTGGTTGCCACAAc < 1:375098/226‑1 (MQ=255)
ccTGCATAACTGAAGGTCGTCAGGCATACTGGGTTTGTACGTTGATTGAAGAGTCGGAATTGCTGGAAGCGCAGGCGGCGGAAGCTACCTGGGAAGAGTTGAAACTGGCGCTACCAGAGTTGAACGTTGGCCTGGTACACGGGCGGATGAAACCTGCCGAGAAACAGGCGGTGATGGCGTCG‑TTTAAACAAGGGGG‑GCCTAA‑ACTGCGGGTTGCCACAACCGGTTTTGAAGTCgggggt > 1:897181/1‑235 (MQ=255)
tGCATAACTGAAGGTCGTCAGGCATACTGGGTTTGTACGTTGATTGAAGAGTCGGAATTGCTGGAAGCGCAGGCGGCGGAAGCTACCTGGGAAGAGTTGAAACTGGCGCTACCAGAGTTGAACGTTGGCCTGGTACACGGGCGGATGAAACCTGCCGAGAAACAGGCGGTGGTGGGGTCG‑TTTCAAAAAGGGTG‑GCTACA‑CCCGCCGGGTTCCACCACCCGTATTgtaatccggggttt > 2:835137/1‑226 (MQ=255)
gCATAACTGAAGGTCGGCAGGCATACTGGGTTGGTACGTTGATGGAAGAGTCGGAATTGCTGGAAGCGCAGGCGGCGGAAGCTACCTGGGAAGAGTTGAAACTGGCGCTACCAGAGTTGAACGTTGGCCTGGTACACGGGCGGATGAAACCTGCCGAGAAACAGGCGGTGATGGCGTCG‑TTTAAACAAGGTGA‑GCTACA‑CCTGCTGGTTGCCACAACCGTTATTGAAGTCGGCGTTGAt < 1:835137/239‑1 (MQ=255)
cATAACTGAAGGTCGTCAGGCATACTGGGTTTGTACGTTGATTGAAGAGTCGGAATTGCTGGAAGCGCAGGCGGCGGAAGCTACCTGGGAAGAGTTGAAACTGGCGCTACCAGAGTTGAACGTTGGCCTGGTACACGGGCGGATGAAACCTGCCGAGAAACAGGGGGCGATGGCGTCG‑GTTAAACAAAGTGG‑GCTACA‑CCCTCTGGTTGCCACAACCGTTTTTTGAGTCGGGGTTGAtg > 1:62320/1‑239 (MQ=255)
aaTACCTGAAGGGCGTCGGGCTTCTTGGGTTTGTCCGTGGATGGAAGAGTCGGAATTGCGGGAAGCGCAGGCGGCGGAAGCTACCTGGGAAGAGTTGAAACTGGCGCTACCAGAGTTGAACGTTGGCCTGGTACACGGGCGGATGAAACCTGCCGAGAAACAGGCGGTGATGGCGTCG‑TTTAAACAAGGTGA‑GCTACA‑CCTGCTGGTTGCCACAACCGTTATTGAAGTCGGCGTTGAtg < 2:743145/238‑1 (MQ=255)
cagaCTGAAGGGCGTGAGGCATACTGGGTTTGTACGTTGATTGAAGAGGCGGAATTGCTGGAAGCGCAGGCGGCGGAAGCTACCTGGGAAGAGTTGAAACTGGCGCTACCAGAGTTGAACGTTGGCCTGGTACACGGGCGGATGAAACCTGCCGAGAAACAGGCGGTGATGGCGTCG‑TTTAAACAAGGTGA‑GCTACA‑CCTGCTGGTTGCCACAACCGTTATTGAAGTCGGCGTTGAtg < 1:336715/235‑1 (MQ=255)
gAAGGTCGTCAGGCATACTGGGTTTGTACGTTGATTGAAGAGTCGGAATTGCTGGAAGCGCAGGCGGCGGAAGCTACCTGGGAAGAGTTGAAACTGGCGCTACCAGAGTTGAACGTTGGCCTGGTACACGGGCGGCTGAAACCTGCCGAGAAACAGGCGGTGATGGCGGCG‑GTTAAACAAGGCGA‑GCTAAA‑CCTGCTGGTTGCCCCAAACGTTATTTAAGCCGGCGTTggttggccca > 1:330739/1‑229 (MQ=255)
ggTCGTCAGGCATACTGGGTTTGTACGTTGATTGAAGAGTCGGAATTGCTGGAAGCGCAGGCGGCGGAAGCTACCTGGGAAGAGTTGAAACTGGCGCTACCAGAGTTGAACGTTGGCCTGGTACACGGGCGGATGAAACCTGCCGAGAAACAGGCGGTGATGGCGTCG‑TTTAAAAAAGGTGA‑GCTACA‑CCCGCTGGGTGCCACAACCGGTATTTAAATCGGCGTTGGTGTGCCTAACg > 1:876662/1‑238 (MQ=255)
gtcgtcAGGCTTATTGGGTTTGTTGGTTGATTTAAGGGTAGGAATTTGTGGAAGCGCAGGCGGGGGAAGCTACCGGGGAAAGGTTGAAACTGGCGCTACCAGAGTTGAACGTTGGCCTGGTACACGGGCGGATGAAACCTGCCGAGAAACAGGCGGTGATGGCGTCG‑TTTAAACAAGGTGA‑GCTACA‑CCTGCTGGTTGCCACAACCGTTATTGAAGTCGGCGTTGATGTGCCTAACg < 2:1045507/237‑1 (MQ=255)
ttttcAGGCATTTGGGGTTGTTACGTTGATTGAAGAGTCGGAATTGCTGGAAGCGCAGGCGGCGGAAGCTACCTGGGAAGAGTTGAAACTGGCGCTACCAGAGTTGAACGTTGGCCTGGTACACGGGCGGATGAAACCTGCCGAGAAACAGGCGGTGATGGCGTCG‑TTTGAACAAGGTGA‑GCTACA‑CCTGCTGGTTGCCACAACCGTTATTGAAGTCGGCGTTGATGTGCCTAACGc < 2:680213/234‑1 (MQ=255)
tcgtcAGGCATACTGGGTTTGTAAGTTGATTGAAGAGTCGGAATGGCTGGAAGCGCAGGCGGCGGAAGCTACCTGGGAAGAGTTGAAACTGGCGCTACCAGAGTTGAACGTTGGCCTGGTACACGGGCGGATGAACCCTGCCGAGAAACAGGCGGTGATGGCGTCG‑TTTAAACAAGGTGA‑GCTACT‑CCTGCTGGTTGCCACAACCGTTATTGAAGTCGGCGTTGATGTGCCTAACGc < 1:144552/237‑1 (MQ=255)
cgtcAGGCATACTGGGTTTGTACGTTGATTGAAGAGTCGGAATTGCTGGAAGCGCAGGCGGCGGAAGCTACCTGGGAAGAGTTGAAACTGGCGCTACCAGAGTTGCACGTTGGCCTGGTACACGGGCGGATGAAACCTGCCGAGGAACAGGCGGGGATGGCGTCC‑TTTTAAAAAGGGGA‑GTTAAA‑CACGCCGGCTTCCACAACCCGTTTTCTAGTCGGCGTTTGTTTGCCCAACCCCAg > 2:707855/1‑239 (MQ=255)
cgtcAGGCATACTGGGTTTGTACGTTGATTGAAGAGTCGGAATTGCTGGAAGCGCAGGCGGCGGAAGCTACCTGGGAAGAGTTGAAACTGGCGCTACCAGAGTTGAACGTTGGCCTGGTACACGGGCGGATGAAACCTGCCGAGAAACAGGCGGTGGTGGCGTCG‑TTTTAACAAGGGGA‑GCTACA‑CCTGCTGGTTTCCACAACCGTTTTTGAAGTCGGCGTTGATGTGTCCAACGcccg > 1:740865/1‑237 (MQ=255)
tcAGGCATACTGGGTTTGTACGTTGATTGAAGAGTCGGAATTGCTGGAAGCGCAGGCGGCGGAAGCTACCTGGGAAGAGTTGAAACTGGCGCTACCAGAGTTGAACGTTGGCCTGGTACACGGGCGGATGAAACCTGCCGAGAAACAGGCGGTGATGGCGTCG‑TTTAAACAAGGTGA‑GCt > 1:565754/1‑180 (MQ=255)
tcAGGCATACTGGGTTTGTACGTTGATTGAAGAGTCGGAATTGCTGGAAGCGCAGGCGGCGGAAGCTACCTGGGAAGAGTTGAAACTGGCGCTACCAGAGTTGAACGTTGGCCTGGTACACGGGCGGATGAAACCTGCCGAGAAACAGGCGGTGATGGCGTCG‑TTTAAACAAGGTGA‑GCt < 2:565754/180‑1 (MQ=255)
tcAGGCATACTGGGTTTGTACGTTGATTGAAGAGTCGGAATTGCTGGAAGCGCAGGCGGCGGAAGCTACCTGGGAAGAGTTGAAACTGGCGCTACCAGAGTTGAACGTTGGCCTGGTACACGGGCGGATGAAACCTGCCGAGAAACAGGCGGGGAGGGGGGCG‑TTTAAACAAGGGGA‑GTTACACCCGGCGGGTTG‑CACAACCCGTTTTGAAATCgggggggagtggcccaaagccagtc > 2:439509/1‑216 (MQ=255)
cGTTGATTGAAGAGTCGGAATTGGTGGAAGCGAAGGCGGCGGAAGCTTCCTGGGAAGAGTTGAAACTGGCGCTACCAGAGTTGAACGTTGGCCTGGTACACGGGCGGATGAAACCTGCCGAGAAACAGGCGGTGATGGCGTCG‑TTTAAACAAGGTGA‑GCTACA‑CCTGCTGGTTGCCACAACCGTTATTGAAGTCGGCGTTGATGTGCCTAACGCCAGTCTGATGATTATCGAAAACCCg < 1:1062107/239‑1 (MQ=255)
ttggttgaAGGGTCGGAATTGCTGGAAGCGGAGGCGGCGGAAGCTACCTGGGAAGAGTTGAAACTGGCGCTACCAGAGTGGAACGTTGGCCTGGTACACGGGCGGATGAAACCTGCCGAGAAACAGGCGGTGATGGCGTCG‑TTTAAACAAGGTGA‑GCTACA‑CCTGCTGGTTGCCACAACCGTTATTGAAGTCGGCGTTGATGTGCCTAACGCCAGTCTGATGATTATCGAAAACCCgg < 1:749688/238‑1 (MQ=255)
ttgattgaAGAGTCGGAATTGCTGGAAGCGCAGGCGGCGGAAGCTACCTGGGAAGAGTTGAAACTGGCGCTACCAGAGTTGAACGTTGGCCTGGTACACGGGCGGATGAAACCTGCCGAGAAACAGGCGGTGATGGCGGCG‑TTTAACCAAGGTGG‑GGTCCA‑CCCCCTGGGTGCCACAACCGTTTTTTAAGACGGGGTGGATGGGGCTAACGCCAGTCGCATAGTTAACGAAAAACCggg > 2:98370/1‑238 (MQ=255)
gaAGAGTCGGAATTGCTGGAAGCGCAGGCGGCGGAAGCTACCTGGGAAGAGTTGAAACTGGCGCTACCAGAGTTGAACGTTGGCCTGGTACACGGGCGGATGAAACCTGCCGAGAAACAGGCGGTGATGGCGTCG‑TTTAAACAAGGGGA‑GCTACA‑CCTGCTGGTTGCCCCAACCGGTATTTAAGTCGGCGTTGATGTGCCTAACGCCAGACTGCTGATTTTCCAAAACCCGGGGCg > 1:86277/1‑236 (MQ=255)
gttggAATTGCTGGAAGGGCAGGGGGCGGAGGTTACCTGGGAAGAGTTGAAACTGGCGCTACCAGAGTTGAACGTTGGCCTGGTACACGGGCGGATGAAACCTGCCGAGAAACAGGCGGTGATGGCGTCG‑TTTAAACAAGGTGA‑GCTACA‑CCTGCTGGTTGCCACAAACGTTATTGAAGTCGGCGTTGATGTGCCTAACGCCAGTCTGATGATTATCGAAAACCCGGAGCgtctgggt < 1:257495/235‑1 (MQ=255)
gTCGGAATTGTGGGAAGCCGCGGGGGGGGAAGGTACCGGGGAAGAGTTGAAACTGGCGCTACCAGAGTTGAACGTTGGCCTGGGACACGGGCGGATGAACCCTGCCGAGAAACAGGCGGTGATGGCGTCG‑TTTAAACAAGGTGA‑GCTACA‑CCTGCTGGTTGCCACAACCGTTATTGAAGTCGGCGTTGATGTGCCTAACGCCAGTCTGATGATTATCGAAAACCCGGAGCgtctgggt < 2:740865/238‑1 (MQ=255)
tCGGAATTGCTGGAAGCGCAGGCGGCGGAAGCTACCTGGGAAGAGTTGAAACTGGCGCTACCAGAGTTGAACGTTGGCCTGGTACACGGGCGGATGAAACCTGCCGAGAAACAGGCGGTGATGGCGTCG‑TTTTAACAAAGGGA‑GCTACA‑CCACCCGGGTGCCACAACCGGTATTTAAGTCGGCGGTGATGTGGCTAACCCCAGGCTGGTGGTTTTCTAAAAACCgggagggctgggggc > 2:11578/1‑226 (MQ=255)
gatttGCTGGAAGCGGGGGCGGCGGAAGCTCCCTGGGAAGAGTTGAAACGGGCTCTCCCAGAGTTGAACGTTGGCCTGGTACACGGGCGGATGAAACCTGCCGAGAAACAGGCGGTGATGGCGTCG‑TTTAAACAAGGTGA‑GCTACA‑CCCGCTGGTTGCCACAACCGTTATTGAAGTCGGCGTTGATGTGCCTAACGCCAGTCTGATGATTATCGAAAACCCGGAGCgtctgggtctgg < 2:876662/235‑1 (MQ=255)
aaTTGTTGGAGGGGAGGGCGGGGGAAGCTCCCTGGGAAGGGTTAAAACTGGGGCGACCAGGGTTGAACGTTGGCCTGGTACACGGGCGGATGAACCCTGCCGAGAAGCAGGCGGTGATGGCGTCG‑TTTAAACAAGGTGA‑GCTACA‑CCTGCTGGTTGCCACAACCGTTATTGAAGTCGGCGTTGATGTGCCTAACGCCAGTCTGATGATTATCGAAAACCCGGAGCGTCTGGGTCTGgc < 2:85084/238‑1 (MQ=255)
aaTTGGTGGAAGCGGGGGCGGGGGAAGCTCCCTGGAAAGGGTTGAAACTGGCGCTACCAGAGTTGAACTTTGGCCGGGTACACGGGCGGATGAAACCTGCCGAGAAACAGGCGGTGATGGCGTCG‑TTTAAACAAGGTGA‑GCTACA‑CCTGCTGGTTGCCACAACCGTTATTGAAGTCGGCGTTGATGTGCCTAACGCCAGTCTGATGATTATCGAAAACCCGGAGCGTCTGGGTCTGgc < 2:575345/238‑1 (MQ=255)
aaTTGGGGGGAGCGGAGGGGGCGGAAGCCTCCGGGGAAGGGGTGAAACTGGCGCTACCAGGGTTGAACGTTGGCCTGGTACAGGGGCGGATGAAACCTGCCGGGAAACAGGCGGTGATGGCGTCG‑TTTAAACAAGGTGA‑GCTACA‑CCTGCTGGTTGCCACAACCGTTATTGAAGTCGGCGTTGATGTGCCTAACGCCAGTCTGATGATTATCGAAAACCCGGAGCGTCTGGGTCTGgc < 2:912293/238‑1 (MQ=255)
atgtcTGGAAGCGCAGGGGGCGGAAGCGACCGGGGAAGGGTTGAAACTGGCGCTACCAGAGGTGAACGTTGGCCGGGGACACGGGCGGATGAAACCTGCCGAGAAACAGGCGGTGATGGCGTCT‑TTTAAACAAGGTGA‑GCTACA‑CCTGCTGGTTGCCACAACCGTTATTGAAGTCGGCGTTGATGTGCCTAACGCCAGTCTGATGATTATCGAAAACCCGGAGCGTCTGGGTCTGgcg < 2:210311/234‑1 (MQ=255)
ttGCTGGAAGCGCAGGCGGCGGAAGCTACCTGGGAAGAGTTGAAACTGGCGCTACCAGAGTTGAACGTTGGCCTGGTACACGGGCGGATGAAACCTGCCGAGAAACAGGCGGTGATGGCGTCG‑TTTAAACAAGGTGA‑GCTACA‑CCTGCTGGTTGCCACAACCGTTATTGAAGTCGGCGTTGATGTGCCTAACGCCAGTCTGATGATTATCGAAAACCCGGAGCGTCTGGGTCTGGCGCa < 1:795308/239‑1 (MQ=255)
ttGCGGGAAGCGCAGGCGGGGGAAGCTACCTGGGAAGAGTTGAAACTGGCGCTACCAGAGTTGAACGTTGGCCTGGTACACGGGCGGATGAAACCTGCCGAGAAACAGGCGGTGATGGCGTCG‑TTTAAACAAGGTGA‑GCTACA‑CCTGCTGGTTGCCACAACCGTTATTGAAGTCGGCGTTGATGTGCCTAACGCCAGTCTGATGATTATCGAAAACCCGGAGCGTCTGGGTCTGGCGCa < 1:98370/239‑1 (MQ=255)
gCTGGAAGCGCAGGCGGCGGAAGCTACCTGGGAAGAGTTGAAACTGGCGCTACCAGAGTTGAACGTTGGCCTGGTACACGGGCGGATGAAACCTGCCGAGAAACAGGCGGTGATGGCGTCG‑TTTAAACAAGGGGA‑GCTACA‑CCTGCTGGTTGCCACAACCGTTATTGAAGTCGGCGGTGATGTGCCTAACGCCCGTCTGGTGATTATCGAAAACCCGGAGGGGCTGGGGCTGGCGCAGt > 1:138475/1‑239 (MQ=255)
aGCGCAGGCGGCGGAAGCTACCTGGGAAGAGTTGAAACTGGCGCTACCAGAGTTGAACGTTGGCCTGGTACACGGGCGGATGAAACCTGCCGAGAACCAGGCGGGGATGGCGTCG‑TTTAAACCAGGGGAGGCCAC‑‑CCCGCTGGGTGCCACCACCGTTATTTGAGTCGGCGTTGTTGTGCCTAACACCAGCTTTATGGTTTTATAAAACCCGGGGCGTCTGGGGCTTGCGCGGTTAAAcc > 2:944514/1‑239 (MQ=255)
gggggAAGCTACCTGGGAAGGTGTGAAACGGGCGCTACCAGAGTTGAACGTTGGCCTGGTACCCGGGCGGATGAAACCTGCCGAGAAACAGGCGGTGATGGCGTCG‑TTTAAACAAGGTGA‑GCTACA‑CCTGCTGGTTGCCACAACCGTTATTGAAGTCGGCGTTGATGTGCCTAACGCCAGTCTGATGATTATCGAAAACCCGGAGCGTCTGGGTCTGGCGCAGTTACACCAGCTGcgcg < 2:664846/236‑1 (MQ=255)
ggcggAACCTACCTGGGAAAAGTTGAAACTGGCGCTACCAGATTTGAACGTTGGCCTGGTACACGGGCGGATGAAACCTGCCGAGAAACAGGCGGTGATGGCGTCG‑TTTAAACAAGGTGA‑GCTACA‑CCTGCTGGTTGCCACAACCGTTATTGAAGTCGGCGTTGATGTGCCTAACGCCAGTCTGATGATTATCGAAAACCCGGAGCGTCTGGGTCTGGCGCAGTTACACCAGCTgcgc < 1:1086711/238‑1 (MQ=255)
ggggaaggttacggggAAGAGTTGAAACTGGCGCTACCAGAGTTGAACGTTGGCCTGGTACACGGGCGGATGAAACCTGCCGAGAAACAGGCGGTGATGGCGTCG‑TTTAAACAAGGTGA‑GCTACA‑CCTGCTGGTTGCCACAACCGTTATTGAAGTCGGCGTTGATGTGCCTAACGCCAGTCTGATGATTATCGAAAACCCGGAGCGTCTGGGTCTGGCGCAGTTACACCAGCTGcgcg < 1:974267/225‑1 (MQ=255)
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|
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|
| Alignment Legend |
|---|
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Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
N/A
