Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A4 F9 I0 R1
|
260 |
102.5 |
2178490 |
93.2% |
2030352 |
226.0 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
freq |
annotation |
gene |
description |
| RA |
NC_000913 |
3,852,875 |
T→G |
13.2% |
intergenic (‑92/+14) |
ilvB ← / ← ivbL |
acetolactate synthase 2 large subunit/ilvB operon leader peptide |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | NC_000913 | 3,852,875 | 0 | T | G | 13.2%
| 241.5
/ 2.1
| 109 | intergenic (‑92/+14) | ilvB/ivbL | acetolactate synthase 2 large subunit/ilvB operon leader peptide |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (29/59); new base G (19/2); total (48/61) |
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 2.25e-06 |
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
Only 100 of 113 total aligned reads displayed.
TTTGGCTTAAGGCATCGTAAACAGGCAGGATAGAACCGCCCGGAATGCCTGTCACAATCTTAATGCCCTGCTGTTCCAGGAAATGAACGATAAATTCTGCGCCGGTAAAGCGCTT‑ACGCGTCGATGTTGTGCCCGAACTTGCCATGCTCCAGTCCTTTTCTTCTGGGCCGACTTTCCGGGAGGTGCTTAAACGAAAAACCCCGCCCGGTTTGCGCCGGCGGGGTTTTGGAATC‑GTGTGTTGTTCCAGTCCCTACGGCGCATTGCCGACGACCACCACCACAC‑GCACGACGACCACTGCGGCGGATGGCGCAGTTG‑GTAGTAGTTTTGCGTTGAGCATGGAAGTAGTCAT‑TGGGGACCTTGTTGGTTTTGTGTTTAACAATATTTATACAAGCACAGC‑TTTACAGGGGAGACAATGGAAAATTTTTCAGCAAGGGAAAATTGAGGGGTTGATCACGTTTTGTACTGAATTGCAGA > NC_000913/3852639‑3853112
|
ttttgtttAAGGCACGGTAAATGGGAAGGGAGGAACCGCCCCGAATTGCTGTCACAATGTTAATGCCCGGCTGTTCCAGAAAATGAAAGATAAATTTCGCGCCGGTAAAGCGCTT‑ACGCTTGGATGTTGTGCCCGAACTTGCCATGCTCCAGTCCTTTTCTTCTGGGCCGACTTTCCGGGAGGTGCTTAAACGAAAAACCCCGCCCGGTTTGCGCCGGCGGGGTTTTGGAATC‑gtgtgt < 2:854829/233‑1 (MQ=255)
ttGGCTTAAGGCATCGTAAACAGGCAGGATAGAACCGCCCGGAATGCCTGTCACAATCTTAATGCCCTGCTGTTCCAGGAAATGAACGATAAATTCTGCGCCGGTAAAGCGCTT‑ACGCGTCGATGTTGTGCCCGAACTTGCCATGCTCCAGTCCTTTTCTTCTGGGCCGACTTTCCGGGAGGAGCTTAAACGAAAAACCCCGCCCGGTTTTCGCCGACGGGGTTTTGGACTC‑gggttat > 1:59920/1‑236 (MQ=255)
tGGCTTAAGGCATCGTAAACAGGCAGGATAGAACCGCCCGGAATGCCTGTCACAATCTTAATGCCCTGCTGTTCCAGGAAATGAACGATAAATTCTGCGCCGGTAAAGCGCTT‑ACGCGTCGATGTTGTGCCCGAACTTGCCATGCTCCAGTCCTTTTCTTCTGGGCCGACTTTCCGGGAGGGGCTTAAACGAAAAACCCCGCCCGGTTTGCGCCGGCGGGGTTTTGGAATC‑GTGtgttg > 1:285873/1‑239 (MQ=255)
tcTTAAGGCATCGTAAACTGGCAGGAAAGAACCGCCCGGAATGCCTGTCACAATCTTAATTCCCTGCTTTTCCAGGAAATGAACGATAAATTCTGCGCCGGTAAAGCGCTT‑ACGCGTCGATGTTGTGCCCGAACTTGCCATGCTCCAGTCCTTTTCTTCTGGGCCGACTTTCCGGGAGGTGCTTAAACGAAAAACCCCGCCCGGTTTGCGCCGGCGGGGTTTTGGAATC‑GTGTgttgtt < 1:114570/238‑1 (MQ=255)
aGGCATCGTAAACAGGCAGGATAGAACCGCCCGGAATGCCTGTCACAATCTTAATGCCCTGCTGTTCCAGGAAATGAACGATAAATTCTGCGCCGGTAAAGCGCTT‑ACGCGTCGATGTTGTGCCCGAACTTGCCATGCTCCAGTCCTTTTCTTCTGGGCCGACTTTCCGGGCGGTGCTTACACGAAAAACCCCGCCCGGTTTGCGCCGGCGGGGGTTTGGACAC‑GGTTGTTGGTcccg > 1:317182/1‑236 (MQ=255)
aGGCAACGTAAACAGGCAGGAAAGAACCGCCCGGAATGCCTGGCCCAATCTTAATGCCCTGCTGTTCCAGGAAATGAACGATAAATTCTGCGCCGGTAAAGCGCTT‑ACGCGTCGATGTTGTGCCCGAACTTGCCATGCTCCAGTCCTTTTCTTCTGGGCCGACTTGCCGGGAGGTGCTTAAACGAAAAACCCCGCCCGGTTTGCGCCGGCGGGGTTTTGGAATC‑GTGTGTTGTTCCAGt < 1:96631/239‑1 (MQ=255)
tCGTAAACAGGCAGGATAGAACCGCCCGGAATGCCTGTCACAATCTTAATGCCCTGCTGTTCCAGGAAATGAACGATAAATTCTGCGCCGGTAAAGCGCTT‑ACGCGTCGATGTTGTGCCCGAACTTGCCATGCTCCAGTCCTTTTCTTCTGGGCCGCCTTTCCGGGAGGTGCTTAAACGAAAAACCCCGCCCGGTTTGCGCCGGCGGGGGTTTGGAAAC‑GGGGGTTGTTCCAGTcacaa > 2:268933/1‑235 (MQ=255)
tCGTAAACAGGCAGGATAGAACCGCCCGGAATGCCTGTCACAATCTTAATGCCCTGCTGTTCCAGGAAATGAACGATAAATTCTGCGCCGGTAAAGCGCTT‑ACGCGTCGATGTTGTGCCCGAACTTGCCATGCTCCAGTCCTTTTCTTCTGGGCCGACTTTCCGGGAGGTGCTTAAACGAAAAACCCCGCCCGGGTTGCGCCCGCGGGGGTTTGGGATC‑GTGGGATGTTCCCGccccc > 2:65360/1‑237 (MQ=255)
cGTAAACAGGCAGGATAGAACCGCCCGGAATGCCTGTCACAATCTTAATGCCCTGCTGTTCCAGGAAATGGACGATAAATTCTGCGCCGGTAAAGCGCTT‑ACGCGTCGATGTTGTGCCCGAACTTGCCATGCTCCAGTCCTTTTCTTCTGGGCCGACTTTCCGGGAGGTGCTTAAACGAAAAACCCCGCCCGGTTTGCCCCGGCGGGGGTTTGGAAAC‑GGGTGGTGTTCCCGGccccaa > 2:427079/1‑236 (MQ=255)
cGTAAACAGGCAGGATAGAACCGCCCGGAATGCCTGTCACAATCTTAATGCCCTGCTGTTCCAGGAAATGAACGATAAATTCTGCGCCGGTAAAGCGCTT‑ACGCGTCGATGTTGTGCCCGAACTTGCCCTGCTCCAGTCCTTTTCTTCTGGTCCGCCTTTCCGGGAGGTGCTTAACCGAAAACCCCCCCCCGGTTTGCGCCGGCGGGGGTTTGGAATC‑AGGTGTGGTTCCACGCCCtgg > 2:506216/1‑237 (MQ=255)
cGTAAACAGGCAGGATAGAACCGCCCGGAATGCCTGTCACAATCTTAATGCCCTGCTGTTCCAGGAAATGAACGATAAATTCTGCGCCGGTAAAGCGCTT‑ACGCGTCGATGTTGTGCCCGAACTTGCCATGCTCCAGTCCTTTTCTTCTGGGCCGACTTTCCGGGAGGTGCTTAAACGAAAAACCCCGCCCGGTTTGCGCCGGCGGGGGTTTGGAAGC‑GTGGGTTGTTCCAGTCCCtta > 1:877545/1‑237 (MQ=255)
cGTAAACAGGCAGGATAGAACCGCCCGGAATGCCTGTCACAATCTTAATGCCCTGCTGTTCCAGGAAATGAACGATAAATTCTGCGCCGGTAAAGCGCTT‑ACGCGTCGATGTTGTGCCCGAACTTGCCATGCTCCAGTCCTTTTCTTCTGGGCCGACTTTCCGGGAGGTGCTTAAA‑ATAAAACCCCCCCCGGTTTCGCCCGGCGGGGGTTTGGAAAC‑GGGGGGTTTTCCACTccccccg > 2:1035905/1‑235 (MQ=255)
ttaaggAACAGCCCGGAATGCCGGTCACAATCTTAATGCCCTGCTGTTCCAGGAAAGTAACGATAAATTCTGCGCCGGTAAAGCGCTT‑CCGCGTCGATGTTGTGCCCGAACTTGCCATGCTCCAGTCCTTTTCTTCTGGGCCGACTTTCCGGGAGGTGCTTAAACGAAAAACCCCGCCCGGTTTGCGCCGGCGGGGTTTTGGAATC‑GTGTGTTGTTCCAGTCCCTACGGCGCATTGCcg < 2:954272/234‑1 (MQ=255)
gATAGAACCGCCCGGAATGCCTGTCACAATCTTAATGCCCTGCTGTTCCAGGAAATGAACGATAAATTCTGCGCCGGTAAAGCGCTT‑ACGCGTCGATGTTGTGCCCGAACTTGCCATGCTCCAGTCCTTTTCTTCTGGGCCGACTTTCCGGGAGGTGCTTAAACGAAAAACCCCGCCCGGTTTGCGCCGGCGGGGTTTTGGAATC‑GTGTGTTGTTCCa < 1:701821/218‑1 (MQ=255)
tAGACCCGCCCGGAATGCCTTTCACAATCTTAATGCCCTTGTTGTCCAGGAAATGAACGATAAATTCTGCGCCGGTAAAGCGCTT‑ACGCGTCGATGTTGTGCCCGAACTTGCCATGCTCCAGTCCTTTTCTTCTGGGCCGACTTTCCGGGAGGTGCTTAAACGAAAAACCCCGCCCGGTTTGCGCCGGCGGGGTTTTGGAATC‑GTGTGTTGTTCCAGTCCCTACGGCGCATTGCcgac < 2:660406/238‑1 (MQ=255)
tAGAACCGCCCGGAATGCCTGTCACAATCTTAATGCCCTGCTGTTCCAGGAAATGAACGATAAATTCTGCGCCGGTAAAGCGCTT‑ACGCGTCGATGTTGTGCCCGAACTTGCCATGCTCCAGTCCTTTTCTTCTGGGCCGACTTTCCGGGAGGTGCTTAAACGAAAAACCCCGCCCGGTTTGCGCCGGCGGGGTTTTGGAATC‑GTGTGTTGTTCCAGTCCCTACGGCGCATTGCcgacg < 1:56160/239‑1 (MQ=255)
ccccccGGAATGCCTGTCAAAATCTTAATGCCCTGCTGTTCCAGGAAATGAACGATAAATTCTGCGCCGGTAAAGCGCTT‑ACGCGTCGATGTTGTGCCCGAACTTGCCATGCTCCAGTCCTTTTCTTCTGGGCCGACTTTCCGGGAGGTGCTTAAACGAAAAACCCCGCCCGGTTTGCGCCGGCGGGGTTTTGGAATC‑GTGTGTTGTTCCAGTCCCTACGGCGCATTGCCGACGaccac < 1:15914/236‑1 (MQ=255)
cccGGAATGCCTGTCACAATCTTAATGCCCTGCTGTTCCAGGAAATGAACGATAAATTCTGCGCCGGTAAAGCGCTT‑ACGCGTCGATGTTGTGCCCGAACTTGCCATGCTCCAGTCCTTTTCTTCTGGGCCGACTTTCCGGGAGGTGCTTAAACGAAAAACCCCGCCCGGTTTGCGCCGGCGGGGTTTTGGGATC‑TTTGGTTGTTCCAGTCCCTACGGCGCATTGCCGACGaccccca > 1:490955/1‑238 (MQ=255)
cccGGAATGCCTGTCACAATCTTAATGCCCTGCTGTTCCAGGAAATGAACGATAAATTCTGCGCCGGTAAAGCGCTT‑ACGCGTCGATGTTGTGCCCGAACTTGCCATGCTCCAGTCCTTTTCTTCTGGGCCGACTTTCCGGGAGGTGCTTAAACGAAAAACCCCGCCCGGTTTGCGCCGGCGGGGTTTTGGAATT‑GTGTGTTGTTCCAGTCCCTCCGGCGCGTTGCcgcggacacccac > 2:1041661/1‑228 (MQ=255)
cccGGAATGCCTGTCACAATCTTAATGCCCTGCTGTTCCAGGAAATGAACGATAAATTCTGCGCCGGTAAAGCGCTT‑ACGCGTCGATGTTGTGCCCGAACTTGCCATGCTCCAGTCCTTTTCTTCTGGGCCGACTTTCCGGGAGGTGCTTAAACGAAAAACCCCGCCCGGTTTGCGCCGGCGGGGTTTTGGAAAC‑TGGGGTTTGTCCAGCCCCCAAGGGGCCTGGCCGGGGaccaccac > 2:400460/1‑239 (MQ=255)
cccGGAATGCCTGTCACAATCTTAATGCCCTGCTGTTCCAGGAAATGAACGATAAATTCTGCGCCGGTAAAGCGCTT‑ACGCGTCGATGTTGTGCCCGAACTTGCCATGCTCCAGTCCTTTTCTTCTGGGCCGACTTTCCGGGAGGTGCTTAAACGAAAAACCCCGCCCGGTTTGCGCCGGCGGGGGTTTGGAATC‑GGGGGTTGTTCCACTCCCTCCGGCGCATTGCCGACGgccaccc > 2:1068629/1‑237 (MQ=255)
cccGGAATGCCTGTCACAATCTTAATGCCCTGCTGTTCCAGGAAATGAACGATAAATTCTGCGCCGGTAAAGCGCTT‑ACGCGTCGATGTTGTGCCCGAACTTGCCATGCTCCAGTCCTTTTCTTCTGGGCCGACTTTCCGGGAGGTGCTTAAACGAAAAACCCCGCCCGGTTTGCGCCGGCGGGGGTTTGGAATA‑GTGGGTTTTTCCAGGCCCTACGgccgggtccttttacacacctt > 2:701821/1‑219 (MQ=255)
cccGGAATGCCTGTCACAATCTTAATGCCCTGCTGTTCCAGGAAATGAACGATAAATTCTGCGCCGGTAAAGCGCTT‑ACGCGTCGATGTTGTGCCCGAACTTGCCATGCTCCAGTCCTTTTCTTCTGGGCCGACTTTCCGGGAGGGGCTTAAACGAAAAACCCCGCCCGGTTTGCGCCGGCGGGGGTTTGGAATC‑GTGGGTTGTTCCACTCCCTCCGGCGCATTGCCGACGccaacca > 2:660865/1‑238 (MQ=255)
tGCCTGTCCCAATTTTAATGCCCTGTTGTTCCAGGAAATGAACGATAAATTCTGCGCCGGTAAAGCTCTT‑ACGCGTCGATGTTGTGCCCGAACTTGCCATGCTCCAGTCCTTTTCTTCTGGGCCGACTTTCCGGGAGGTGCTTAAACGAAAAACCCCGCCCGGTTTGCGCCGGCGGGGTTTTGGAATC‑GTGTGTTGTTCCAGTCCCTACGGCGCATTGCCGACGACCACCACCAcac‑gc < 2:785375/239‑1 (MQ=255)
ccTGTCACAATCTTAATGCCCTGCTGTTCCAGGAAATGAACGATAAATTCTGCGCCGGTAAAGCGCTT‑ACGCGTCGATGTTGTGCCCGAACTTGCCATGCTCCAGTCCTTTTCTTCTGGGCCGACTTTCCGGGAGGTGCTTAAACGAAAAACCCCGCCCGGTTTGCGCCGGCGGGGTTTTGGAATCGGTGGTTTGTCCCA‑TCCCTACGGGGCCTTGCCGGCGGCccccaccaccccca > 2:1013623/1‑233 (MQ=255)
tGTCACAATCTTAATGCCCTGCTGTTCCAGGAAATGAACGATAAATTCTGCGCCGGTAAAGCGCTT‑ACGCGTCGATGTTGTGCCCGAACTTGCCATGCTCCAGTCCTTTTCTTCTGGGCCGCCTTTCCGGGAGGTGCTTAAACGAAAAACCCCGCCCGGGTTGCGCCGCCGGGGTTTTGGAAAC‑CGGTGGTGGTCCAGTCCCTACGGCGCATTTCCGACGaccaccccctgtctctctt > 1:954272/1‑229 (MQ=255)
tGTCACAATCTTAATGCCCTGCTGTTCCAGGAAATGAACGATAAATTCTGCGCCGGTAAAGCGCTT‑ACGCGTCGATGTTGTGCCCGAACTTGCCATGCTCCAGTCCTTTTCTTCTGGGCCGACTTTCCGGGAGGTGCTTAAACGAAAAACCCCGCCCGGTTTGCGCCGGCGGGGTTTTGGAATC‑GTGGGTTGTTCCAGCCCCTCCTGCGGATGGCCGCCAAcccccaccaaccgcccgg > 2:363133/1‑230 (MQ=255)
tCACAATCTTAATGCCCTGCTGTTCCAGGAAATGAACGATAAATTCTGCGCCGGTAAAGCGCTT‑ACGCATCGATGATGTGCCCGAACTTGCCATGCTCCAGTCCTTTTCTTCTGGGCCGACTTTCCGGGAGGTGCTTAAACG‑ACAACCCCGCCCGGTTTTCGCCGGCGGGGTTTTGGAATC‑GTGTGTTGTTCCAGTCCCTTCGGCGCATTGCCGTCGCCCACCACCCCAC‑GCacgccg > 1:136617/1‑238 (MQ=255)
acaATCTTAATGCCCTGCTGTTCCAGGAAATGAACGATAAATTCTGCGCCGGTAAAGCGCTT‑ACGCGTCGATGTTGTGCCCGAACTTGCCATGCTCCAGTCCTTTTCTTCTGGGCCGACTTTCCGGGAGGTGCTTAAACGAAAAACCCCGCCCGGTTTGCGCCGGCGGGGTTTTGGAATC‑GTGTGTTGTTCCAGTCCCTACGGCGCATTGCCGACGACCACCACCACAC‑GCAcgacga > 1:623575/1‑238 (MQ=255)
tCTTAATGCCCTGCTTTTCCAGGAAATGAACGATAAATTCTGCGCCGGTAAAGCGCTT‑ACGCGTCGATGTTGTGCCCGAACTTGCCATGCTCCAGTCCTTTTCTTCTGGGCCGACTTTCCGGGAGGTGCTTAAACGAAAAACCCCGCCCGGTTTGCGCCGGCGGGGTTTTGGAATC‑GTGTGTTGTTCCAGTCCCTa > 1:841046/1‑196 (MQ=255)
tCTTAATGCCCTGCTGTTCCAGGAAATGAACGATAAATTCTGCGCCGGTAAAGCGCTT‑ACGCGTCGATGTTGTGCCCGAACTTGCCATGCTCCAGTCCTTTTCTTCTGGGCCGACTTTCCGGGAGGTGCTTAAACGAAAAACCCCGCCCGGTTTGCGCCGGCGGGGCTTTGGAATC‑GTGTGTTGTTCCAGTCCCTACGGCGCATTTCCGACGACCACCACCCCAC‑GCACGACGACCAc > 1:292217/1‑238 (MQ=255)
aaTGCCCTGCTGTTCCAGGAAATGAACGATAAATTCTGCGCCGGTAAAGCGCTT‑ACGCGTCGATGTTGTGCCCGAACTTGCCATGCTCCAGTCCTTTTCTTCTGGGCCGACTTTCCGGGAGGTGCTTAAACGAAAAACCCCGCCCGGTTTGCGCCGGCGGGGGTTTGGAATC‑GTGGGTTGTTCCCGTCCCTCCGGGCCATTGCCGACGACCACCCCCACCC‑GCACGACGTCCACTgcgg > 1:490262/1‑239 (MQ=255)
ctgctgTTCCAGGAAATGAACGATAAATTCTGCGCCGGTAAAGCGCTT‑ACGCGTCGATGTTGTGCCCGAACTTGCCATGCTCCAGTCCTTTTCTTCTGGGCCGACTTTCCGGGAGGGGCTTAAACGAAAAACCCCGCCCGGTTTGCGCCGGCGGGGGTTTGGGATC‑GTGGGTTGTTCCAGTCCCTCCGGCCACTTGCCGGCGCCCACCACC‑CACAGCACCGCGACCCCCGcggcggcgg > 2:167105/1‑236 (MQ=255)
tgctgTTCCAGGAAATGAACGATAAATTCTGCGCCGGTAAAGCGCTT‑ACGCGTCGATGTTGTGCCCGAACTTGCCATGCTCCAGTCCTTTTCTTCTGGGCCGACTTTCCGGGAGGTGCTTAAACGAAAAACCCCGCCCGGTTTGCGCCGGCGGGGGTTTGGAATC‑GTGTGTTGTTCCAGTCCCTACGGCGCATTGCCGACGACCACCACCCCAC‑CCACGCCGACCACTGCGGCGGATgg > 1:1032336/1‑239 (MQ=255)
ctgTTCCAGGAAATGGACGATAAAGTCTGCGCCGGTAAAGCGCTT‑ACGCGTCGATGTTGTGCCCGAACTTGCCATGCTCCAGTCCTTTTCTTCTGGGCCGACTTTCCGGGAGGTGCTTAAACGAAAAACCCCGCCCGGTTTGCGCCGGCGGGGTTTTGGAATC‑GTGTGTTGTTCCAGTCCCTACGGCGCATTGCCGACGACCACCACCACAC‑GCACGACGACCACTGCGGCGGATGgcg < 1:65360/239‑1 (MQ=255)
tggtCCGGGAAAGGAACGATAAATTCTGCGCCGGTAAAGCGCTT‑ACTGTTCGATGTTGTGCCCGAACTTGCCATTCTCCAGTCCTTTTCTTCTGGGCCGACTTTCCGGGAGGTGCTTAAACGAAAAACCCCGCCCGGTTTGCGCCGGCGGGGTTTTGGAATC‑GTGTGTTGTTCCAGTCCCTACGGCGCATTGCCGACGACCACCACCACAC‑GCATGACGACCACTGCGGCGGATGgcg < 2:4373/235‑1 (MQ=255)
tgTTCCAGGAAATGAACGATAAATTCTGCGCCGGTAAAGCTCTT‑ACGCGTCGATGTTGGGCCCGAACTTGCCATGCGCCAGTCCTTTTCTTCTGGGCCGACTTTCCGGGAGGTGCTTAAACGAAAAACCCCGCCCGGTTTGCGCCGGCGGGGTTTTGGAAAC‑GTGTGTTGTTCCAGTCCCTACGGCGCATTGCCGACGACCACCACCACAC‑GCACGACGACCACTGCGGCGGATGgcg < 1:100740/238‑1 (MQ=255)
gTTCCAGGAAATGAACGATAAATTCTGCGCCGGTAAAGCGCTT‑ACGCGTCGATGTTGTGCCCGAACTTGCCATGCTCCAGTCCTTTTCTTCTGGGCCGACTTTCCGGGAGGTGCTTAAACGAAAAACCCCGCCCGGTTTGCGCCGGCGGGGTTTTGGAATC‑GTGTGTTGTTCCAGTCCCTACGGCGCATTGCCGACGACCACCACCACAC‑GCACGACGACCACTGCGGCGGATGGCGCa < 1:268933/239‑1 (MQ=255)
tttcAGGAAATGAACGATAAATTCTGCGCCGGTAAAGCGCTT‑ACGCGTCGATGTTGGGCCCGAACTTGCCATGCTCCAGTCCTTTTCTTCTGGGCCGACTTTCCGGGAGGTGCTTAAACGAAAAACCCCGCCCGGTTTGCGCCGGCGGGGTTTTGGAATC‑GTGTGTTGTTCCAGTCCCTACGGCGCATTGCCGACGACCACCACCACAC‑GCACGACGACCACTGCGGCGGATGGCGCAg < 1:363133/236‑1 (MQ=255)
ccAGGAAATGAACGATAAATTCTGCGCCGGTAAAGCGCTT‑ACGCGTCGATGTTGTGCCCGAACTTGCCATGCTCCAGTCCTTTTCTTCTGGGCCGACTTTCCGGGAGGTGCTTAAACGAAAAACCCCGCCCGGTTTGCGCCGGCGGGGTTTTGGAATC‑GTGGGTTGGTCCAGTCCCTCCCGCGCATTGCCGCCGACCCCCACCACCC‑GCCACACGACCCCTCcggcggggagggcagat > 2:25346/1‑228 (MQ=255)
ccAGGAAATGAACGATAAATTCTGCGCCGGTAAAGCGCTT‑ACGCGTCGATGTTGTGCCCGAACTTGCCATGCTCCAGTCCTTTTCTTCTGGGCCGACTTTCCGGGAGGTGCTTAAACGAAAAACCCCGCCCGGTTTGCGCCGGCGGGGTTTTGGAATC‑GGGTGTTGTTCCAGGCCCTACGGGGCATTGCCGACGACACCCACCACAC‑CCACGACGACCACTGCGGCGGATGGCGCAgat > 1:1043110/1‑237 (MQ=255)
aGGAAATGAACGATAAATTCTGCGCCGGTAAAGCGCTT‑ACGCGTCGATGTTGTGCCCGAACTTGCCATGCTCCAGTCCTTTTCTTCTGGGCCGACTTTCCGGGAGGTGCTTAAACGAAAAACCCCGCCCGGTTTGCGCCGGCGGGGTTTTGGAATC‑GGTTGTTGTTCCAGTCCCTACGGCGCATTGCCGACGGACACCACCCAAC‑GCACGACGACCCCTGCGGCGGCTGGCGCatgtgg > 1:308346/1‑234 (MQ=255)
tGAACGATAAATTCTGCGCCGGTAAAGCGCTT‑ACGCGTCGATGTTGTGCCCGAACTTGCCATGCTCCAGTCCTTTTCTTCTGGGCCGACTTTCCGGGAGGTGCTTAAACGAAAAACCCCGCCCGGTTTGCGCCGGCGGGGGTTTTGAATC‑GTGTGTTGTTCCAGTCCCTACGGCGCATTGCCGACGACCACCACCACAC‑CCCCGCCGACCACTGCGGCGGATGGCGCAGTTG‑Ggagaag > 1:172734/1‑239 (MQ=255)
aCGATAAATTCTGCGCCGGTAAAGCGCTT‑ACGCGTCGATGTTGTGCCCGAACTTGCCATGCTCCAGTCCTTTTCTTCTGGGCCGACTTTCCGGGAGGTGCTTAAACGAAAAACCCCGCCCGGTTTGCGCCGGCGGGGTTTTGGAATC‑GTGTGTTGTTCCCGTCCCTCCGGCGCATTGCCGCCGCCCACCACCACCC‑CCCCGCCGACCACCGCGGCGGGTGGCGCAGGTG‑GGAGAAGttt > 2:577929/1‑239 (MQ=255)
tAAATTTGGCCCCGGTAAAGCGCTTCCCGCGCAGTTG‑TGTGCCCGGACTGGCCATGCTCCAGTCCTTTTCCTCTGGGGCGACTTTCCGGGAGGTGGTTAAACGAAAAACCCCGCCCGGTTTGCGCCGGCGGGGTTTTGGAATC‑GGGTGTTGTTCCAGTCCCTACGGCGCATTGCCGACGGCCACCACCACAC‑GCACGACGACCACTGCGGCGGATGGCGCAGTTG‑GTAGTAGTTTTGCg < 2:317182/239‑1 (MQ=255)
tAAATTGTGCGCGGTTAAAGCCCTT‑CCGCGTCGATGTTGGGCCCGAACTTGCCCTGCTCCAGTCCTTTTCTTCTGGGCCGCCTTTCCGGGAGGTGCTTAAACGAAAAACCCCGCCCGGTTTGCGCCGGCGGTGTTTTGGAATC‑GTGTGTTGTTCCAGTCCCTACGGCGCATTGCCGACGACCACCACCACAC‑GCACGACGACCACTGCGGCGGATGGCGCAGTTG‑GTAGTAGTTTTGCg < 2:292217/239‑1 (MQ=255)
tAAATTCCGGCCCGGTAAAGCGCTT‑ACGCGTGGATGGTGTGCCTGAACTTGCCAGGCTCCAGTCCTTTTCTTCTGGGCCGACTTTCCGGGAGGTGCTTAAACGAAAAACCCCGCCCGGTTTGCGCCGGCGGGGTTTTGGAATC‑GTGTGTTGTTCCAGTCCCTACGGCGCATTGCCGACGACCACCACCACAC‑GCACGACGACCACTGCGGCGGATGGCGCAGTTG‑GTAGTAGTTTTGCg < 1:1013623/239‑1 (MQ=255)
aaaaTTCCGCCCCGGTAAAGCGCTT‑ACGGGTCGATGTTGTGCCCGAACTTGCCATGCTCCAGTCCGTTTCTTCTGGGCCGACTTTCCGGGAGGTGCTTAAACGAAAAACCCCGCCCGGTTTGCGCCGGCGGGGTTTTGGAATC‑GTGTGTTGTTCCAGTCCCTACGGCGCATTGCCGACGACCACCACCACAC‑GCACGACGACCACTGCGGCGGATGGCGCAGTTG‑GTAGTAGTTTTGCg < 1:400460/238‑1 (MQ=255)
aaTTCTGCCCCGGTAAAGCGCTT‑ACGCGTTGATGTTGTGCCCGAACTTGCCATGCTCCAGTCCTTTTCTTCTGGGCCGACTTTCCGGGAGGTGCTTAAACGAAAAACCCCGCCCGGTTTGCGCCGGCGGGGTTTTGGAATC‑GTGTGTTGTTCCAGTCCCTACGGCGCATTGCCGACGACCACCACCACAC‑GCACGACGACCACTGCGGCGGATGGCGCAGTTG‑GTAGTAGTTTTGCGtt < 1:341381/239‑1 (MQ=255)
ccgcgcCGGTAAAGGGCTT‑ACGGGTCGATGGTGTGCCCGAACTTGCCATGCTCCAGTCCTTTTCTTCTGGGCCGACTTTCCGGGAGGTGCTTAAACG‑AAAACCCCGCCCGGTTTGCGCCGGCGGGGTTTTGGAATC‑GTGTGTTGTTCCAGTCCCTACGGCGCATTGCCGACGACCACCACCACAC‑GCACGACGACCACTGCGGCGGATGGCGCAGTTG‑GTAGTAGTTTTGCGTTGAGCa < 1:1035905/237‑1 (MQ=255)
tGCGGCGGTAAAGCGCTT‑ACGCGTCGATGTTGTGCCCGAACTTGCCATGCTCCAGGCCTTTTCTTCTGGGCCGACTTTCCGGGAGGTGCTTAAACGAAAAACCCCGCCCGGTTTGCGCCGGCGGGGTTTTGGAATC‑GTGTGTTGTTCCAGTCCCTACGGCGCATTGCCGACGACCACCACCACAC‑GCACGACGACCACTGCGGCGGATGGCGCAGTTG‑GTAGTAGTTTTGCGTTGAGCa < 1:450251/239‑1 (MQ=255)
cgcgcCGGTAAAGCGCTT‑ACGCGTCGATTTTGGTCCCGAACTTGCCATGCTCCAGTCCTTTTCTTCGGGGCCGACTTTCCGGGAGGTGCTTAAACGAAAAACCCCGCCCGGTTTGCGCCGGCGGGGTTTTGGAATC‑GTGTGTTGTTCCAGTCCCTACGGCGCATTGCCGACGACCACCACCACAC‑GCACGACGACCACTGCGGCGGATGGCGCAGTTG‑GTAGTAGTTTTGCGTTGAGCa < 1:244794/238‑1 (MQ=255)
aaGCGTTT‑ACGCGGCGATGTTGTGCCCGAACTTGGCATGCCCCAGGTCTTTTCTTCTGGGCCGACTTTCCGGGAGGTGCTTAAACGAAAAACCCCGCCCGGTTTGCGCCGGCGGGGTTTTGGAATC‑GTGTGTTGTTCCAGTCCCTACGGCGCATTGCCGACGACCACCACCACAC‑GCACGACGACCACTGCGGCGGATGGCGCAGTTG‑GTAGTAGTTTTGCGTTGAGCATGGAagtagt < 1:1047719/239‑1 (MQ=255)
t‑ACGCGTCGATGTTGTGCCCGAACTTGCCATGCTCCAGTCCTTTTCTTCTGGGGCGACTTTCCGGGAGGTGCTTAAACGAAAAACCCCGCCCGGTTTGCGCCGGCGGGGTTTTGGAATC‑GTGTGTTGTTCCAGTCCCTACGGCGCATTGCCGACGACCACCTCCACAC‑GCACGACGACCACTGCGGCGGATGGCGCAGTTG‑GTAGTAGTTTTGCGTTGAGCATGGAAGTAGTCAT‑Tggg < 1:67616/239‑1 (MQ=255)
t‑ACGCGTCGATGTTGTGCCCGAACTTGCCATGCTCCAGTCCTTTTCTTCTGGGCCGACTTTCCGGGAGGTGCTTAAACGAAAAACCCCGCCCGGTTTGCGCCGGCGGGGTTTTGGAATC‑GGGGGTTGTTCCAGTCCCTACGGCGCATTGCCGACGACCACCACCACAC‑GCACGACGACCACTGCGGCGGATGGGGCCGTTG‑GAGGTAGGTTTTCGTTGGGCATGGAAGTAGTCAT‑Tggg > 1:865929/1‑239 (MQ=255)
tCGATGTTGTGCCCGAACTTGCCATGCTCCAGTCCTTTTCTTCTGGGCCGACTTTCCGGGAGGTGCTTAAACGAAAAACCCCGCCCGGTTTGCGCCGGCGGGGGTTTGGAATC‑GTGTGTTGTTCCAGTCCCTACGGCGCATTGCCGACGACCACCACCACCC‑GCACGACGGCCCCCGCGGCGGGTGGCGCGGGTG‑GGAGGAGGTTTGCGGTGGGccggggaggaggacttgggggg > 2:794713/1‑215 (MQ=255)
ggaaaagagaccggCCATGCTCCAGTCCTTTTCTTCTGGGCCGACTTTCCGGGAGGTGGTTAAACGAAAAACCCCGCCCGGTTTGCGCCGGCGGGGTTTTGGAATC‑GTGTGTTGTTCCAGTCCCTACGGCGCATTGCCGACGACCACCACCACAC‑GCACGACGACCACTGCGGCGGATGGCGCAGTTG‑GTAGTAGTTTTGCGTTGAGCATGGAAGTAGTCAT‑TGGGGACCTTGTTGGtt < 1:152762/226‑1 (MQ=255)
gAACTTGCCATGCTCCAGTCCTTTTCTTCTGGGCCGACTTTCCGGGAGGTGCTTAAACGAAAAACCCCGCCCGGTTTGCGCCGGCGGGGTTTTGGAATC‑GTGTGTTGTTCCAGTCCCTACGGCGCATTGCCGCCGACCACCACCACCC‑GCACGACGACCCCTGCGGCGCGTGGGGCGGCTG‑GTGGGGGGTTTTCGTGTGGCAAGGGAGGAGACATGTGGGGCCCTTGGTGGtttgtggt > 2:551394/1‑234 (MQ=255)
aCTTGCCATGCTCCAGTCCTTTTCTTCTGGGCCGACTTTCCGGGAGGGGCTTAAACGAAAAACCCCGCCCGGTTTGCGCCGGCGGGGGTTTGGAATC‑GTGTGTTGTTCCCGTCCCTACGGCGCATTGCCGACGACCACCACCCACC‑GCCCGACGACCCCTGCGGCGGATGGCGCAGGTGTGGCGAAGTTTT‑CGTTGAGCATAGGAGGAGTCAT‑TGGGGGCCGTGTTGGTTTTGTttttt > 2:890925/1‑238 (MQ=255)
ttGCCCTTCTCCGGTCCTTTTCTTCTGGGCCGACTTTCCGGGAGGTGCTTAAACTAAAAACCCCGCCCGGTTTGCGCCGGCGGGGTTTTGGAATC‑GTGTGTTGTTCCAGTCCCTACGGCGCATTGCCGACGACCACCACCACAC‑GCACGACGACCACTGCGGCGGATGGCGCAGTTG‑GTAGTAGTTTTGCGTTGAGCATGGAAGTAGTCAT‑TGGGGACCTTGTTGGTTTTGTGTTTAAc < 2:865929/239‑1 (MQ=255)
ttGCCATGTCCCATTCCTTTTCTTCGGGGCCGACTTTCCGGGAGGTGCTTAAACGAAAAACCCCGCCCGGTTTGCGCCGGCGGGGTTTTGGAATC‑GTGTGTTGTTCCAGTCCCTACGGCGCATTGCCGACGACCACCACCACAC‑GCACGACGACCACTGCGGCGGATGGCGCAGTTG‑GTAGTAGTTTTGCGTTGAGCATGGAAGTAGTCAT‑TGGGGACCTTGTTGGTTTTGTGTTTAAc < 1:1078769/239‑1 (MQ=255)
ttGCCATGCTCCAGTCCTTTGCCTCTGGGCCGACTTTCCGGGAGTTGCTTAAACGAAAATCCCCGCCCGGTTTGCGCCGGCGGGGTTTTGGAATC‑GTGTGTTGTTCCAGTCCCTACGGCGCATTGCCGACGACCACCACCACAC‑GCACGACGACCACTGCGGCGGATGGCGCAGTTG‑GTAGTAGTTTTGCGTTGAGCATGGAAGTAGTCAT‑TGGGGACCTTGTTGGTTTTGTGTTTAAc < 1:327749/239‑1 (MQ=255)
ttGCCATGCTCCAGTCCGTTTCCTCGGGGCCGACTTTCCGGGAGGTGCTTAAACGAAAAACCCCGCCCGGTTTGCGCCGGCGGGGTTTTGGAATC‑GTGTGTTGTTCCAGTCCCTACGGCGCATTGCCGACGACCACCACCACAC‑GCACGACGACCACTGCGGCGGATGGCGCAGTTG‑GTAGTAGTTTTGCGTTGAGCATGGAAGTAGTCAT‑TGGGGACCTTGTTGGTTTTGTGTTTAAc < 1:720391/239‑1 (MQ=255)
ttGCCATGCTCCAGGCCTTTTCTTGCGGGCCGACTTTCCGGGGGGTGCTTAAACGAAAAACCCCGCCCGGTTTGCGCCGGCGGGGTTTTGGAATC‑GTGTGTTGTTCCAGGCCCTACGGCGCATTGCCGACGACCACCACCACAC‑GCACGACGACCACTGCGGCGGATGGCGCAGTTG‑GTAGTAGTTTTGCGTTGAGCATGGAAGTAGTCAT‑TGGGGACCTTGTTGGTTTTGTGTTTAAc < 1:401697/239‑1 (MQ=255)
ctGCCCTGCGCCAGTCCTTTTCTTCGGGGCCGACTTTGCGGGGGGTGCTTAAACGAAAAACCCCGCCCGGGTTGCGCCGGCGGGGTTTTGGAATC‑GTGTGTTGTTCCAGTCCCTACGGCGCATTGCCGACGACCACCACCACAC‑GCACGACGACCACTGCGGCGGATGGCGCAGTTG‑GTAGTAGTTTTGCGTTGAGCATGGAAGTAGTCAT‑TGGGGACCTTGTTGGTTTTGTGTTTAAc < 2:877545/238‑1 (MQ=255)
tGCTCCAGTCCTTTTCTTCTGGGCCGACTTTCCGGGAGGTGCTTAAACGAAAAACCCCGCCCGGTTTGCGCCGGCGGGGTTTTGGAATC‑GTGTGTTGTTCCAGTCCCTACGGCGCATTGCCGACGACCACCACCACAC‑GCACGACGACCACTGCGGCGGATGGCGCAGTTG‑GTAGTAGTTTTGCGTTGAGCATGGAAGTAGTCAT‑TGGGGACCTTGTTGGTTTTGTGTTTAACAATAtt < 1:427079/239‑1 (MQ=255)
cTCCAGTCCTTTTCTTCTGGGCCGACTTTCCGGGAGGTGCTTAAACGAAAAACCCCGCCCGGTTTGCGCCGGCGGGGTTTTGGAATC‑GTGTGTTGTTCCAGTCCCTACGGCGCATTGCCGACGCCCACCCCCACCC‑GCACGACGCCCCCTCCGGCGGGTGGGGCAGTTG‑GTCGTAGTTTTTCGTTGAGCATGGAGAGAGGCAT‑TGGGGGCCTTTTTGGGTTTTGGTTTAAAAAAATTta > 2:681827/1‑239 (MQ=255)
gTCCTTTTTCTTGGGGCCGGCTTGCCGGGGGGGGTTTAAACG‑AAAACCCCGCCCGGTTTGCGCCGGCGGGGTTGTGGAAGC‑GGGGGTTGTTCCAGTGCCTGCGGCGCATTGCCGACGAGCGCCCCCACAC‑GCACGACGACCACTGCGGCGGATGGCGCAGTTG‑GTAGTAGTTTTGCGTTGAGCATGGAAGTAGTCAT‑TGGGGACCTTGTTGGTTTTGTGTTTAACAATATTTATACAAg < 2:136617/239‑1 (MQ=255)
gTCCTTTTCTTCTGGGCCGACTTTCCGGGAGGTGCTTAAACGAAAAACCCCGCCCGGTTTGCGCCGGCGGGGTTTTGGAATC‑GTGTGTTGTTCCAGTCCCTACGGCGCATTGCCGACGACCCCCACCACAC‑GCACGCCGACCACTGCGGCGGATGGGGCAGTTG‑GTAGTAGTTTTGCGTTGGGCATGGAAGTGTGCAT‑TGGGGACCTTGTTGGTTTTTTGTTTAAAAAAATTTTTACaa > 2:626139/1‑239 (MQ=255)
gTCCTTTTCTTCTGGGCCGACTTTCCGGGAGGTGCTTAAACGAAAAACCCCGCCCGGTTTGCGCCGGCGGGGTTTTGGAATC‑GTGTGTTGTTCCAGTCCCTACGGCGCATTGCCGACGACCACCACCACAC‑GCACGACGACCACGGCGGCGGGTGGCGCCGGTG‑GGAGGAGGTTTGGGTTGGGGCTGGAAGGTGGCCT‑TGGGGGCCTTGTTGGGTTTGGGTTTTAccttgtctttataa > 2:152762/1‑226 (MQ=255)
tttttCTTTTGGGCCGGTTTTCCGGGAGGTGCTTAAACGAAAACCCCCGCCCGGTTTGCGCCGGCGGGGTTTTGGACTC‑GTGTTGTGTTCCAGTCCCTTCGGCGCATTGCCGACGACCACCTCCACAC‑GCACGACGACCACTGCGGCGGATGGCGCAGTTG‑GTAGTAGTTTTGCGTTGAGCATGGAAGTAGTCAT‑TGGGGACCTTGTTGGTTTTGTGTTTAACAATATTTATACAAGca < 2:59920/238‑1 (MQ=255)
cttttcttttGGGCCCGCTTTCCGGGGGGTGCTTAAACGAAAAACCCCGCCCGGTTTGCGCCGGCGGGGTTTTGGAATC‑GGGTGTTGTTCCAGTCCCTACGGCGCATTGCCGACGACCACCACCACAC‑GCACGACGACCACTGCGGCGGATGGCGCAGTTG‑GTAGTAGTTTTGCGTTGAGCATGGAAGTAGTCAT‑TGGGGACCTTGTTGGTTTTGTGTTTAACAATATTTATACAAGca < 2:1032336/239‑1 (MQ=255)
cTTTTTCTCGGGGCCGCCTTTCCGGGGGGTGCTTAAACGAAAAACCCCGCCCGGTTTGCGCCGGCGGGGTTTTGGAATC‑GGGTGTTGTTCCAGGCCCTACGGCGCATTGCCGACGACCACCACCACAC‑GCACGACGACCACTGCGGCGGATGGCGCAGTTG‑GTAGTAGTTTTGCGTTGAGCATGGAAGTAGTCAT‑TGGGGACCTTGTTGGTTTTGTGTTTAACAATATTTATACAAGca < 1:1003283/239‑1 (MQ=255)
cTTTTCTTCTGGGCCGACTTTCCGGGGGGTGCTTAAACGAAAAACCCCGCCCGGTTTGCGCCGGCGGGGTTTTGGAATC‑GTGTGTTGTTCCAGTCCCTACGGCGCATTGCCGACGACCACCACCACAC‑GCACGACGACCACTGCGGCGGATGGCGCAGTTG‑GTAGTAGTTTTGCGTTGAGCATGGAAGTAGTCAT‑TGGGGACCTTGTTGGTTTTGTGTTTAACAATATTTATACAAGca < 1:642908/239‑1 (MQ=255)
cTTTTCTTCTGGGCCGACTTTCCGGGAGGTGCTTAAACGAAAAACCCCGCCCGGTTTGCGCCGGCGGGGTTTTGGAATC‑GTGTGTTGTTCCAGTCCCTACGGCGCATTGCCGACGACCACCACCACAC‑GCACGACGACCACTGCGGCGGATGGCGCAGTTG‑GTAGTAGTTTTGCGTTGAGCATGGAAGTAGTCAT‑TGGGGACCTTGTTGGTTTTGTGTTTAACAATATTTATACAAGca < 1:626139/239‑1 (MQ=255)
cTTTTCTTCTGGGCCGACTTGCCGGGAGGTGCTTAAACGAAAAACCCCGCCCGGTTTGCGCCGGCGGGGTTTTGGAATC‑GTGTGTTGTTCCAGTCCCTACGGCGCATTGCCGACGACCACCACCACAC‑GCACGACGACCACTGCGGCGGATGGCGCAGTTG‑GTAGTAGTTTTGCGTTGAGCATGGAAGTAGTCAT‑TGGGGACCTTGTTGGTTTTGTGTTTAACAATATTTATACAAGca < 1:166585/239‑1 (MQ=255)
ttttCTTCGGGGCCGACTTTCCGGGAGGTTCTTAAACTAAAAACCCCGCCCGGTTTGGCCCGGCGGGGTTTGGGAATC‑GGGTGTTGGTCCAGTCCCTACGGCGCATTGCCGACGACCACCACCACCC‑GCACGACGACCACTGCGGCGGATGGCGCAGTTG‑GTAGTAGTTTTGCGTTGAGCATGGAAGTAGTCAT‑TGGGGACCTTGTTGGTTTTGTGTTTAACAATATTTATACAAGcac < 2:490262/239‑1 (MQ=255)
ttcttcTGGGCCGGTTTTCCGGGAGGTGCTTAAACGAAAACCCCCGCCCGGTTTGCGCCGGCGGGGTTTTGGAATC‑GGGTGTTGTTCCAGGCCCTACGGCGCATTGCCGACGACCACCACCACAC‑GCACGACGACCACTGCGGCGGATGGCGCAGTTG‑GTAGTAGTTTTGCGTTGAGCATGGAAGTAGTCAT‑TGGGGACCTTGTTGGTTTTGTGTTTAACAATATTTATACAAGCACAg < 1:121393/239‑1 (MQ=255)
ttcttcTGGGCCGACTTTCCGGGAGGTGCTTAAACGAAAAACCCCGCCCGGTTTGCGCCGGCGGGGTTTTGGAATC‑GTGTGTTGTTCCAGTCCCTACGgcg < 1:889079/101‑1 (MQ=255)
ttcttcTGGGCCGACTTTCCGGGAGGTGCTTAAACGAAAAACCCCGCCCGGTTTGCGCCGGCGGGGTTTTGGAATC‑GTGTGTTGTTCCAGTCCCTACGgcg > 2:889079/1‑101 (MQ=255)
ttcttcTGGGCCGACTTTCCGGGAGGTGCTTAAACGAAAAACCCCGCCCGGTTTGCGCCGGCGGGGTTTTGGAATC‑GTGTGTTGTTCCAGTCCCTACGGCGCATTGCCGACGACCACCACCACAC‑GCACGACGACCACTGCGGCGGATGGCGCAGTTG‑GTAGTAGTTTTGCGTTGAGCATGGAAGTAGTCAT‑TGGGGACCTTGTTGGTTTTGTGTTTAACAATATTTATACAAGCACAg < 1:551394/239‑1 (MQ=255)
cctctGGGCCGCTTTTCCGGGGGTTGCTTAAACGAAAACCCCCGCCCGGTTGGCGCCGGGGGGGTTTTTGAATC‑GGGTTTTGTTCCAGTCCCTACGGCGCATTGCCGACGACCACCACCACAC‑GCACGACGACCACTGCGGCGGATGGCGCAGTTG‑GTAGTAGTTTTGCGTTGAGCATGGAAGTAGTCAT‑TGGGGACCTTGTTGGTTTTGTGTTTAACAATATTTATACAAGCACAGC‑t < 2:1043110/237‑1 (MQ=255)
gggCCGACTTTCCGGGAGGTGCTTAAACGAAAAACCCCGCCCGGTTTGCGCCGGCGGGGGTTTGGAATC‑GTGTGTTGTTCCAGTCCCTACGGCGCATTGCCGACGACCACCACCACAC‑GCACGACGACCACTGCGGCGGGTGGGGGCGTTG‑GTAGTGGGTTTTCGGTGGGCCTGGAGAGAGGCAT‑TGGGGACCTTGTTGGGTTTGTGTTTTACAAAATTTTAAAAAACACAGC‑GTTACa > 2:801503/1‑239 (MQ=255)
aCTTTCCGGGAGGTGCTTAAACGAAAAACCCCGCCCGGTTTGCGCCGGCGGGGTTTTGGAATC‑GTGTGTTGTTCCAGTCCCTACGGCGCATTGCCGACGACCACCACCACAC‑GCACGACGACCACTGCGGCGGATTGGGCCGTTG‑GGAGGAGGTTTTCGTTGAGCATGGTAGGAGGCAT‑TTGGGAGCTTGTTGGTTTTTTGTTTTAAAATATTTTTACAAACACAGC‑TTTTCAaggggg > 2:8744/1‑237 (MQ=255)
aCTTTCCGGGAGGTGCTTAAACGAAAAACCCCGCCCGGTTTGCGCCGGCGGGGTTTTGGAATC‑GTGTGTTGTTCCAGTCCCGACGGCGCATTGCCGACGACCACCACCACAC‑GCACGACGACCACTGCGGCGGATGGCGCAGTTG‑GTAGTAGTTTTGCGTTGAGCATGGAAGGAGGCAT‑TGGGGACCTTGTTGGTTTTGTGTTTAACAATATTTATACAAGCACCGC‑TTTACAggggtg > 1:648491/1‑237 (MQ=255)
aCTTTCCGGGAGGTGCTTAAACGAAAAACCCCGCCCGGTTTGCGCCGGCGGGGTTTTGGAATC‑GTGGGTTGTTCCAGTCCCTACGGCGCATTGCCGACGCCCAACACCACAC‑GCACGACGACCACTGCGGCGGGTGGCGCAGTTG‑GGAGTAGTTTTGCGTTTGGCATGGGAGTAGTCCT‑TGGGGACCTTGTTGGTTTTTTGTTTAACAATATTTATACAAGCCACGC‑TTTTAAgggggg > 2:213454/1‑237 (MQ=255)
cTTTCCGGGAGGTGCTTAAACGAAAACCCCCGCCCGGTTTGCGCCGGCGGGGTTTTGGAATC‑GTGTGTTGTTCCAGTCCCTACGGCGCATTGCCGACGACCACCACCACAC‑GCACGACGACCACTGCGGCGGATGGCGCAGTTG‑GTAGTAGTTTTGCGTTGAGCATGGAAGTAGTCAT‑TGGGGACCTTGTTGGTTTTGTGTTTAACAATAtt < 1:740652/212‑1 (MQ=255)
tttCCGGGGGGTGCTTAAACGAAAAACCCCGCCCGGTTTGCGCCGGCGGGGTTTTGGAATC‑GTGTGTTGTTCCAGTCCCTACGGCGCATTGCCGACGACCACCACCACAC‑GCACGACGACCACTGCGGCGGATGGCGCAGTTG‑GTAGTAGTTTTGCGTTGAGCATGGAAGTAGTCAT‑TGGGGACCTTGTTGGTTTTGTGTTTAACAATATTTATACAAGCACAGC‑TTTACAGGGgaga < 1:1041661/238‑1 (MQ=255)
ggtgttttAAACGAAAAACCCCGCCCGGTTTGGGCCGGGGGGGTTTTGGAATC‑GTGTTTTGTTCCAGTCCCTACGGCGCATTGCCGACGACCACCACCACAC‑GCACGACGACCACTGCGGCGGATGGCGCAGTTG‑GTAGTAGTTTTGCGTTGAGCATGGAAGTAGTCAT‑TGGGGACCTTGTTGGTTTTGTGTTTAACAATATTTATACAAGCACAGC‑TTTACAGGGGAGACAATGGaa < 2:182008/232‑1 (MQ=255)
gTGCTTAAACGAAAAACCCCGCCCGGTTTGCGCCGGCGGGGTTTTGGAATC‑GTGTGTTGTTCCAGTCCCTACGGCGCATTGCCGACGACCACCACCACAC‑GCACGACGACCCCTGCGGCGGGTGGCGCAGTTG‑GCAGGAATTTTGCGTGGGGCCTGGAAGTAGTCCT‑TGGGGGCCTTCTTGGTTTTTGGTTTTACCAAATTTATAAAAGCAAAGC‑TTTAACGGGGGGAAAAAGGaaaaa > 2:164007/1‑238 (MQ=255)
gTGCTTAAACGAAAAACCCCGCCCGGTTTGCGCCGGCGGGGTTTTGGAATC‑GTGTGTTGTTCCAGTCCCTACGGCGCATTGCCGACGACCACCACCACAC‑GCACGACGACCACTGCGGCGGATTGCGCAGTTG‑GTAGTGGTTTTTCGGTGAGCATGGAAGTAGTCAT‑TTGGGGCCTTGTTGGGTTTTGGGTTAACAATATTTATACAAGCAAAACTTTTACGGGGGA‑AAAATGGaaaaa > 2:568772/1‑238 (MQ=255)
aaCCCCGGCCGGTTTGCGCCGGCGGGGTTTTGGAATC‑GTGTGTTGTTCGAGTCCCGACGGCGCATTGCCGACGACCACCACCACAC‑GCCCGACGACCACTGCGGCGGATGGCGCAGTTG‑GTAGTAGTTTTGCGTTGAGCATGGAAGTAGTCAT‑TGGGGACCTTGTTGGTTTTGTGTTTAACAATATTTATACAAGCACAGC‑TTTACAGGGGAGACAATGGAAAATTTTTCAGCAAGGGa < 1:506216/239‑1 (MQ=255)
aCCCCGCCCGGTTTGCGCCGGCGGGGTTTTGGAATC‑GTGTGGTGTTCCAGTCCCTACGGCCCATTGCCGACGACCACCACCACAC‑GCACGACGACCACTGCGGCGGATGGCGCAGTTG‑GTAGTAGTTTTGCGTTGAGCATGGAAGTAGTCAT‑TGGGGACCTTGTTGGTTTTGTGTTTAACAATATTTATACAAGCACAGC‑TTTACAGGGGAGACAATGGAAAATTTTTCAGCAAGGGaa < 1:801503/239‑1 (MQ=255)
ccgGTTTGCGCCGGCGGGGTTTTGGAATC‑GTGTGTTGTTCCAGTCCCTACGGCGCATTGCCGACGACCACCACCACAC‑GCACGACGACCACTGCGGCGGATGGCGCAGTTG‑GTAGTAGTTTTGCGTTGAGCATGGAAGTAGTCAT‑TGGGGACCTTGTTGGTTTTGTGTTTAACAATATTTATACAAGCACAGC‑TTTACAGGGGAGACAATGGAAAATTTTTCAGCAAGGGAAAATTGAg < 1:577929/239‑1 (MQ=255)
tttGCGCCGGCGGGGTTTTGGAATC‑GTGGGTTGTTCCAGTCCCTACGGCGCATTGCCGACGACCACCACCACAC‑GCACGACGACCACTGCGGCGGATGGCGCAGTTG‑GGAGGAGTTTTGCGTTGGGCCTGGAAGTAGTCAT‑TGGGGACCTTGTTGGTTTTGTGTTTTACAATATTTATAAAAGCACAGC‑TTTACAGGGGAGACAATGGAAAATTTTTCAACAAAGGAAAAATGAggggg > 2:529111/1‑238 (MQ=255)
gttGCGGCGGCGGGGGTTTGGAATC‑GTGTGTTGTTCCAGTCCCTACGGCGCATTGCCGACGACCACCACCACAC‑GCACGACGACCACTGCGGCGGATGGCGCAGTTG‑GTAGTAGTTTTGCGTTGAGCATGGAAGTAGTCAT‑TGGGGACCTTGTTGGTTTTGTGTTTAACAATATTTATACAAGCACAGC‑TTTACAGGGGAGACAATGGAAAATTTTTCAGCAAGGTAAAATTGAgggg < 1:777850/237‑1 (MQ=255)
ccGGCGGGGTTTTGGAATC‑GTGTGTTGTTCCAGTCCCTACGGCGCATTGCCGACGACCCCCACCACAC‑GCACGACGACCACTGCGGCGGATGGCGCAGTTG‑GTAGTAGTTTTGCGTTGAGCATGGAAGTAGTCAT‑TGGGGACCTTGTTGGTTTTGTGTTTAACAATATTTATACAAGCACAGC‑TTTACAGGGGAGACAATGGAAAATTTTTCAGCAAGGGAAAATTGAGGGGTTGATc < 1:794713/238‑1 (MQ=255)
tttGGCATC‑GTGTTTTGTTCCCGTCCCTACGGGGCATTGCCGACGACCACCAACACAC‑GCACGGCGACCACTGCGGCGGATGGCGCAGTTG‑GTAGTAGTTTTGCGTTGAGCATGGAAGTAGTCAT‑TGGGGACCTTGTTGGTTTTGTGTTTAACAATATTTATACAAGCACAGC‑TTTACAGGGGAGACAATGGAAAATTTTTCAGCAAGGGAAAATTGAGGGGTTGATCACGTTTTGTa < 2:623575/238‑1 (MQ=255)
tttGGAATC‑GGTTTTTGTTCCAGTCCCTTCGGGGCATTGCCGACGACCCCCACCACAC‑GGACGACGACCAATGCGGCGGATGGCGCAGTTG‑GTAGTAGTTTTGCGTTGAGCATGGAAGTAGTCAT‑TGGGGACCTTGTTGGTTTTGTGTTTAACAATATTTATACAAGCACAGC‑TTTACAGGGGAGACAATGGAAAATTTTTCAGCAAGGGAAAATTGAGGGGTTGATCACGTTTTGTa < 2:100166/238‑1 (MQ=255)
gtgtTGTTCCAGTCCCTACGGCGCATTGCCGACGACCACCACCACAC‑GGACGACGACCACTGCGGCGGATGGCGCAGTTG‑GTAGTAGTTTTGCGTTGAGCATGGAAGTAGTCAT‑TGGGGACCTTGTTGGTTTTGTGTTTAACAATATTTATACAAGCACAGC‑TTTACAGGGGAGACAATGGAAAATTTTTCAGCAAGGGAAAATTGAGGGGTTGATCACGTTTTGTACTGAATTGCAGa < 1:529111/239‑1 (MQ=255)
|
TTTGGCTTAAGGCATCGTAAACAGGCAGGATAGAACCGCCCGGAATGCCTGTCACAATCTTAATGCCCTGCTGTTCCAGGAAATGAACGATAAATTCTGCGCCGGTAAAGCGCTT‑ACGCGTCGATGTTGTGCCCGAACTTGCCATGCTCCAGTCCTTTTCTTCTGGGCCGACTTTCCGGGAGGTGCTTAAACGAAAAACCCCGCCCGGTTTGCGCCGGCGGGGTTTTGGAATC‑GTGTGTTGTTCCAGTCCCTACGGCGCATTGCCGACGACCACCACCACAC‑GCACGACGACCACTGCGGCGGATGGCGCAGTTG‑GTAGTAGTTTTGCGTTGAGCATGGAAGTAGTCAT‑TGGGGACCTTGTTGGTTTTGTGTTTAACAATATTTATACAAGCACAGC‑TTTACAGGGGAGACAATGGAAAATTTTTCAGCAAGGGAAAATTGAGGGGTTGATCACGTTTTGTACTGAATTGCAGA > NC_000913/3852639‑3853112
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 13 ≤ ATCG/ATCG < 26 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
N/A
