Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A5 F28 I0 R1
|
92 |
125.0 |
2504412 |
98.2% |
2459332 |
226.8 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
freq |
annotation |
gene |
description |
| RA |
NC_000913 |
1,143,829 |
A→C |
94.5% |
L180R (CTG→CGG) |
rne ← |
endoribonuclease, RNA‑binding protein,RNA degradosome binding protein |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | NC_000913 | 1,143,829 | 0 | A | C | 94.5%
| 348.9
/ 5.6
| 106 | L180R (CTG→CGG) | rne | endoribonuclease, RNA‑binding protein,RNA degradosome binding protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (3/3); new base C (49/51); total (52/54) |
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 |
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
Only 100 of 106 total aligned reads displayed.
TTTGATTTTGCTGCTGAAATCCGGGCGACCTAATGCAGCGATATGCTGACGTGCCAGTTCGAGCACTTTCGGGTTATCGATAAGGATTTCGCCGATGTCCTGACGTAAGTAATCGCGGAATGCGCGAACGATTACGTTGCTCTCCTGATGAATCAGGAACGGGGCCGGGCGGCTTTCAGCGGCTTTTTTGATGGCTTCCCAGTGTTTCAGACGGAAGCTTAAATCCCATTGCAGCGCCTCAGCAGATTTGCCGACGCCAGCGGTGCGCACGATAAGCCCCATGCCTTCCGGCAGTTCAAGGCTTGCCAGTGCTTCTTTTAATTCGGTACGGTCGTCGCCTTCGATACGGCGAGAAATGCCACCCGCGCGCGGGTTGTTCGGCATCAGAACCAGATAGCTACCCGCCAGACTGATAAAGGTGGTTAATGCCGCGCCTTTGTTGCCGCGCTCTTCTTTATCGATCTGA > NC_000913/1143597‑1144062
|
tttGATTTTGCTGCTGAAATCCGGGCGACCTAATGCAGCGATATGCTGACGTGCCAGTTCGAGCACTTTCGGGTTATCGATAAGGATTTCGCCGATGTCCTGACGTAAGTAATCGCGGAATGCGCGAACGATTACGTTGCTCTCCTGATGAATCAGGAACGGGGCCGGGCGGCTTTCAGCGGCTTTTTTGATGGCTTCCCAGTGTTTCAGACGGAAGCTTAAATCCCATTGCCGCGcc > 1:1003914/1‑238 (MQ=255)
tttGATTTTGCTGCTGAAATCCGGGCGACCTAATGCAGCGATATGCTGACGTGCCAGTTCGAGCACTTTCGGGTTATCGATAAGGATTTCGCCGATGTCCTGACGTAAGTAATCGCGGAATGCGCGAACGATTACGTTGCTCTCCTGATGAATCAGGAACGGGGCCGGGCGGCTTTCAGCGGCTTTTTTGATGGCTTCCCAGTGTTTCAGACGGAAGCTTAAATCCCATTGCCGCGcc > 1:527926/1‑238 (MQ=255)
ttGATTTTGCTGCTGAAATCCGGGCGACCTAATGCAGCGATATGCTGACGTGCCAGTTCGAGCACTTTCGGGTTATCGATAAGGATTTCGCCGATGTCCTGACGTAAGTAATCGCGGAATGCGCGAACGATTACGTTGCTCTCCTGATGAATCAGGAACGGGGCCGGGCGGCTTTCAGCGGCTTTTTTGATGGCTTCCCAGTGTTTCAGACGGAAGCTTAAATCCCATTGCCGCGCCTc < 2:90506/239‑1 (MQ=255)
ttttGCTGCTGAAATCCGGGCGACCTAATGCAGCGATATGCTGACGTGCCAGTTCGAGCACTTTCGGGTTATCGATAAGGATTTCGCCGATGTCCTGACGTAAGTAATCGCGGAATGCGCGAACGATTACGTTGCTCTCCTGATGAATCAGGAACGGGGCCGGGCGGCTTTCAGCGGCTTTTTTGATGGCTTCCCAGTGTTTCAGACGGAAGCTTAAATCCCATTGCCGCGCCTcagca > 1:942023/1‑239 (MQ=255)
ctgctgAAATCCGTGCGACCTAATGCAGCGATATGCTGATGTGCCAGTTCGAGCACTTTCGGGTTATCGATAAGGATTTCGCCGATGTCCTGACGTAAGTAATCGCGGAATGCGCGAACGATTACGTTGCTCTCCTGATGAATCAGGAACGGGGCCGGGCGGCTTTCAGCGGCTTTTTTGATGGCTTCCCAGTGTTTCAGACGGAAGCTTAAATCCCATTGCAGCGCCTCAGCAGAttt > 2:190522/1‑239 (MQ=255)
ctgctgAAATCCGGGCGACCTAATGCAGCGATATGCTGACGTGCCAGTTCGAGCACTTTCGGGTTATCGATAAGGATTTCGCCGATGTCCTGACGTAAGTAATCGCGGAATGCGCGAACGATTACGTTGCTCTCCTGATGAATCAGGAACGGGGCCGGGCGGCTTTCAGCGGCTTTTTTGATGGCTTCCCAGTGTTTCAGACGGAAGCTTAAATCCCATTGCCGCGCCTCAGCAGAttt > 1:549074/1‑239 (MQ=255)
ggCGACCTAATGCAGCGATATGCTGACGTGCCAGTTCGAGCACTTTCGGGTTATCGATAAGGATTTCGCCGATGTCCTGACGTAAGTAATCGCGGAATGCGCGAACGATTACGTTGCTCTCCTGATGAATCAGGAACGGGGCCGGGCGGCTTTCAGCGGCTTTTTTGATGGCTTCCCAGTGTTTCAGACGGAAGCTTAAATCCCATTGCCGCGCCTCAGCAGATTTGCCGACGCCAGCg > 2:874151/1‑239 (MQ=255)
gCGACCTAATGCAGCGATATGCTGACGTGCCAGTTCGAGCACTTTCGGGTTATCGATAAGGATTTCGCCGATGTCCTGACGTAAGTAATCGCGGAATGCGCGAACGATTACGTTGCTCTCCTGATGAATCAGGAACGGGGCCGGGCGGCTTTCAGCGGCTTTTTTGATGGCTTCCCAGTGTTTCAGACGGAAGCTTAAATCCCATTGCCGCGCCTCAGCAGATTTGCCGACGCCAGCg < 1:1123095/238‑1 (MQ=255)
ccTAATGCAGCGATATGCTGACGTGCCAGTTCGAGCACTTTCGGGTTATCGATAAGGATTTCGCCGATGTCCTGACGTAAGTAATCGCGGAATGCGCGAACGATTACGTTGCTCTCCTGATGAATCAGGAACGGGGCCGGGCGGCTTTCAGCGGCTTTTTTGATGGCTTCCCAGTGTTTCAGACGGAAGCTTAAATCCCATTGCCGCGCCTCAGCAGATTTGCCGACGCCAGCGGTgcg < 1:874151/239‑1 (MQ=255)
ccTAATGCAGCGATATGCTGACGTGCCAGTTCGAGCACTTTCGGGTTATCGATAAGGATTTCGCCGATGTCCTGACGTAAGTAATCGCGGAATGCGCGAACGATTACGTTGCTCTCCTGATGAATCAGGAACGGGGCCGGGCGGCTTTCAGCGGCTTTTTTGATGGCTTCCCAGTGTTTCAGACGGAAGCTTAAATCCCATTGCCGCGCCTCAGCAGATTTGCCGACGCCAGCGGTgcg < 2:373770/239‑1 (MQ=255)
ccTAATGCAGCGATATGCTGACGTGCCAGTTCGAGCACTTTCGGGTTATCGATAAGGATTTCGCCGATGTCCTGACGTAAGTAAGCGCGGAATGCGCGAACGATTACGTTGCTCTCCTGATGAATCAGGAACGGGGCCGGGCGGCTTTCAGCGGCTTTTTTGATGGCTTCCCAGTGTTTCAGACGGAAGCTTAAATCCCATTGCCGCGCCTCAGCAGATTTGCCGACGCCAGCGGTgcg < 1:505529/239‑1 (MQ=255)
gCAGCGATATGCTGACGTGCCAGTTCGAGCACTTTCGGGTTATCGATAAGGATTTCGCCGATGTCCTGACGTAAGTAATCGCGGAATGCGCGAACGATTACGTTGCTCTCCTGATGAATCAGGAACGGGGCCGGGCGGCTTTCAGCGGCTTTTTTGATGGCTTCCCAGTGTTTCAGACGGAAGCTTAAATCCCATTGCCGCGCCTCAGCAGATTTGCCGACGCCAGCGGTGCGCACGAt < 1:721528/239‑1 (MQ=255)
gCAGCGATATGCTGACGTGCCAGTTCGAGCACTTTCGGGTTATCGATAAGGATTTCGCCGATGTCCTGACGTAAGTAATCGCGGAATGCGCGAACGATTACGTTGCTCTCCTGATGAATCAGGAACGGGGCCGGGCGGCTTTCAGCGGCTTTTTTGATGGCTTCCCAGTGTTTCAGACGGAAGCTTAAATCCCATTGCCGCGCCTCAGCAGATTTGCCGACGCCAGCGGTGCGCACGAt < 1:531918/239‑1 (MQ=255)
gCAGCGATATGCTGACGTGCCAGGTCGAGCACTTTCGGGTTATCGATGAGGATTTCGCCGATGTCCTGACGTAAGTAATCGCGGAATGCGCGAACGATTACGTTGCTCTCCTGATGAATCAGGAACGGGGCCGGGCGGCTTTCAGCGGCTTTTTTGATGGCTTCCCAGTGTTTCAGACGGAAGCTTAAATCCCATTGCCGCGCCTCAGCAGATTTGCCGACGCCAGCGGTGCGCACGAt < 2:889612/239‑1 (MQ=255)
cGATATGCTGACGTGCCAGTTCGAGCACTTTCGGGTTATCGATAAGGATTTCGCCGATGTCCTGACGTAGGTAATCGCGGAATGCGCGAACGATTACGTTGCTCTCCTGATGAATCAGGAACGGGGCCGGGCGGCTTTCAGCGGATTTTTTGATGGCTTACCAGTGTGTCAGACGGAAGCTTAAATCCCATTGCCGCGCCTCAGCAGATTTGCCGACGACAGCGGTGCGCACGATacg > 2:668060/1‑236 (MQ=255)
cGATATGCTGACGTGCCAGTTCGAGCACTTTCGGGTTATCGATAAGGATTTCGCCGATGTCCTGACGTAAGTAATCGCGGAATGCGCGAACGATTACGTTGCTCTCCTGATGAATCAGGAACGGGGCCGGGCGGCTTTCAGCGGCTTTTTTGATGGCTTCCCAGTGTTTCAGACGGAAGCTTAAATCCCATTGCCGCGCCTCAGCAGCTTTGCCGACGCCAGCGGTGCGCACGATAAg > 1:1246669/1‑238 (MQ=255)
cGATATGCTGACGTGCCAGTTCGAGCACTTTCGGGTTATCGATAAGGATTTCGCCGATGTCCTGACGTAAGTAATCGCGGAATGCGCGAACGATTACGTTGCTCTCCTGATGAATCAGGAACGGGGCCGGGCGGCTTTCAGCGGCTTTTTTGATGGCTTCCCAGTGTTTCAGACGGAAGCTTAAATCCCATTGCCGCGCCTCAGCAGATTTGCCGACGCCAGCGGTGCGCACGAt > 1:223093/1‑235 (MQ=255)
cGATATGCTGACGTGCCAGTTCGAGCACTTTCGGGTTATCGATAAGGATTTCGCCGATGTCCTGACGTAAGTAATCGCGGAATGCGCGAACGATTACGTTGCTCTCCTGATGAATCAGGAACGGGGCCGGGCGGCTTTCAGCGGCTTTTTTGATGGCTTCCCAGTGTTTCAGACGGAAGCTTAAATCCCATTGCCGCGCCTCAGCAGATTTGCCGACGCCAGCGGTGCGCACGAt < 2:223093/235‑1 (MQ=255)
cGATATGCTGACGTGCCAGTTCGAGCACTTTCGGGTTATCGATAAGGATTTCGCCGATGTCCTGACGTAAGTAATCGCGGAATGCGCGAACGATTACGTTGCTCTCCTGATGAATCAGGAACGGGGCCGGGCGGCTTTCAGCGGCTTTTTTGATGGCTTCCCAGTGTTTCAGACGGAAGCTTAAATCCCATTGCCGCGCCTCAGCAGATTTGCCGACGCCAGCGGTGCGCACGATAAg > 2:372363/1‑238 (MQ=255)
cGATATGCTGACGTGCCAGTTCGAGCACTTTCGGGTTATCGATAAGGATTTCGCCGATGTCCTGACGTAAGTAATCGCGGAATGCGCGAACGATTACGTTGCTCTCCTGATGAATCAGGAACGGGGCCGGGCGGCTTTCAGCGGCTTTTTTGATGGCTTCCCAGTGTTTCAGACGGAAGCTTAAATCCCATTGCCGCGCCTCAGCAGATTTGCCGACGCCAGCGGTGCGCACGATAAg > 1:886046/1‑238 (MQ=255)
cGATATGCTGACGTGCCAGTTCGAGCACTTTCGGGTTATCGATAAGGATTTCGCCGATGTCCTGACGTAAGTAATCGCGGAATGCGCGAACGATTACGTTGCTCTCCTGATGAATCAGGAACGGGGCCGGGCGGCTTTCAGCGGCTTTTTTGATGGCTTCCCAGTGTTTCAGACGGAAGCTTAAATCCCATTGCCGCGCCTCAGCAGATTTGCCGACGCCAGCGGTGCGCACGATAAg > 1:506844/1‑238 (MQ=255)
cGATATGCTGACGTGCCAGTTCGAGCACTTTCGGGTTATCGATAAGGATTTCGCCGATGTCCTGACGTAAGTAATCGCGGAATGCGCGAACGATTACGTTGCTCTCCTGATGAATCAGGAACGGGGCCGGGCGGCTTTCAGCGGCTTTTTTGATGGCTTCCCAGTGTTTCAGACGGAAGCTTAAATCCCATTGCCGCGCCTCAGCAGATTTGCCGACGCCAGCGGTGCGCACGATAAg > 2:777571/1‑238 (MQ=255)
atatGCTGACGTGCCAGTTCGAGCACTTTCGGGTTATCGATAAGGATTTCGCCGATGTCCTGACGTAAGTAATCGCGGAATGCGCGAACGATTACGTTGCTCTCCTGATGAATCAGGAACGGGGCCGGGCGGCTTTCAGCGGCTTTTTTGATGGCTTCCCAGTGTTTCAGACGGAAGCTTAAATCCCATTGCCGCGCCTCAGCAGATTTGCCGACGCCAGCGGTGCGCACGATAAGcc > 1:843848/1‑238 (MQ=255)
atGCTGACGTGCCAGTTCGAGCACTTTCGGGTTATCGATAAGGATTTCGCCGATGTCCTGACGTAAGTAATCGCGGAATGCGCGAACGATTACGTTGCTCTCCTGATGAATCAGGAACGGGGCCGGGCGGCTTTCAGCGGCTTTTTTGATGGCTTCCCAGTGTTTCAGACGGAAGCTTAAATCCCATTGCCGCGCCTCAGCAGATTTGCCGACGCCAGCGGTGCGCACGATAAGCCCCa < 2:1119179/239‑1 (MQ=255)
atGCTGACGTGCCAGTTCGAGCACTTTCGGGTTATCGATAAGGATTTCGCCGATGTCCTGACGTAAGTAATCGCGGAATGCGCGAACGATTACGTTGCTCTCCTGATGAATCAGGAACGGGGCCGGGCGGCTTTCAGCGGCTTTTTTGATGGCTTCCCAGTGTTTCAGACGGAAGCTTAAATCCCATTGCCGCGCCTCAGCAGATTTGCCGACGCCAGCGGTGCGCACGATAAGCCCCa < 1:30108/239‑1 (MQ=255)
atGCTGACGTGCCAGTTCGAGCACTTTCGGGTTATCGATAAGGATTTCGCCGATGTCCTGACGTAAGTAATCGCGGAATGCGCGAACGATTACGTTGCTCTCCTGATGAATCAGGAACGGGGCCGGGCGGCTTTCAGCGGCTTTTTTGATGGCTTCCCAGTGTTTCAGACGGAAGCTTAAATCCCATTGCCGCGCCTCAGCAGATTTGCCGACGCCAGCGGTGCGCACGATAAGCCCCa < 2:1003914/239‑1 (MQ=255)
gCCAGTTCGAGCACTTTCGGGTTATCGATAAGGATTTCGCCTATGTCCTGACGTAAGTAAGCGCGGAATGCGCGAACGATTACGTTGCTCTCCTGATGAATCAGGAACGGGGCCGGGCGGCTTTCAGCGGCTTTGTTGATGGCTTCCCAGTGTTTCAGACGGAAGCTTAAATCCCATTGCCGCGCCTCAGCAGATTTGCCGACGCCAGCGGTGCGCACGATAAGCCCCATGCCTTCCgg < 1:1168885/239‑1 (MQ=255)
gCCAGTTCGAGCACTTTCGGGTTATCGATAAGGATTTCGCCGATGTCCTGACGTAAGTAATCGCGGAATGCGCGAACGATTACGTTGCTCTCCTGATGAATCAGGAACGGGGCCGGGCGGCTTTCAGCGGCTTTTTTGATGGCTTCCCAGTGTTTCAGACGGAAGCTTAAATCCCATTGCCGCGCCTCAGCAGATTTGCCGACGCCAGCGGTGCGCACGATAAGCCCCATGCCTTCCgg < 1:1243862/239‑1 (MQ=255)
gCCAGTTCGAGCACTTTCGGGTTATCGATAAGGATTTCGCCGATGTCCTGACGTAAGTAATCGCGGAATGCGCGAACGATTACGTTGCTCTCCTGATGAATCAGGAACGGGGCCGGGCGGCTTTCAGCGGCTTTTTTGATGGCTTCCCAGTGTTTCAGACGGAAGCTTAAATCCCATTGCCGCGCCTCAGCAGATTTGCCGACGCCAGCGGTGCGCACGATAAGCCCCATGCCTTCCgg < 1:1109549/239‑1 (MQ=255)
ccAGTTCGAGCACTTTCGGGTTATCGATAAGGATTTCGCCGATGTCCTGACGTAAGTAATCGCGGAATGCGCGAACGATTACGTTGCTCTCCTGATGAATCAGGAACGGGGCCGGGCGGCTTTCAGCGGCTTTTTTGATGGCTTCCCAGTGTTTCAGACGGAAGCTTAAATCCCATTGCCGCGCCTCAGCAGATTTGCCGACGCCAGCGGTGCGCACGATAAGCCCCATGCCTTCCgg < 2:871777/238‑1 (MQ=255)
ccAGTTCGAGCACTTTCGGGTTATCGATAAGGATTTCGCCGATGTCCTGACGTAAGTAATCGCGGAATGCGCGAACGATTACGTTGCTCTCCTGATGAATCAGGAACGGGGCCGGGCGGCTTTCAGCGGCTTTTTTGATGGCTTCCCAGTGTTTCAGACGGAAGCTTAAATCCCATTGCCGCGCCTCAGCAGATTTGCCGACGCCAGCGGTGCGCACGATAAGCCCCATGCCTTCCGGc > 2:226034/1‑239 (MQ=255)
ccAGTTCGAGCACTTTCGGGTTATCGATAAGGATTTCGCCGATGTCCTGACGTAAGTAATCGCGGAATGCGCGAACGATTACGTTGCTCTCCTGATGAATCAGGAACGGGGCCGGGCGGCTTTCAGCGGCTTTTTTGATGGCTTCCCAGTGTTTCAGACGGAAGCTTAAATCCCATTGCCGCGCCTCAGCAGATTTGCCGACGCCAGCGGTGCGCACGATAAGCCCCATGCCTTCCGGc > 1:876947/1‑239 (MQ=255)
ccAGTTCGAGCACTTTCGGGTTATCGATAAGGATTTCGCCGATGTCCTGACGTAAGTAATCGCGGAATGCGCGAACGATTACGTTGCTCTCCTGATGAATCAGGAACGGGGCCGGGCGGCTTTCAGCGGCTTTTTTGATGGCTTCCCAGTGTTTCAGACGGAAGCTTAAATCCCATTGCCGCGCCTCAGCAGATTTGCCGACGCCAGCGGTGCGCACGATAAGCCCCATGCCTTCCGGc > 2:292762/1‑239 (MQ=255)
ccAGTTCGAGCACTTTCGGGTTAGCGATAAGGATTTCGCCGATGTCCTGACGTAAGTAATCGCGGAATGCGCGAACGATTACGTTGCTCTCCTGATGAATCAGGAACGGGGCCGGGCGGCTTTCAGCGGCTTTTTTGATGGCTTCCCAGTGTTTCAGACGGAAGCTTAAATCCCATTGCCGCGCCTCAGCAGATTTGCCGACGCCAGCGGTGCGCACGATAAGCCCCATGCCTTCCgg < 2:204092/238‑1 (MQ=255)
tCGAGAACTTTCGGGTTATCGATAAGGATTTCGCCGATGTCCTGTCCTAAGTAATCGCGGAATGCGCAACCGATTACGTTGCTCTCCTGATGGATCAGGAGCGGGTCCGGGCGTCTTTCAGCGTCTTTTTTGACGGCTTCACAGTGTTTCAGACGGAAGCTTAAATCCCATTGCCGCGCCTCAGCAGATTTGCCGCCGACAGCGGTGCGCCCGATACGCAACATGACTCCCGGAAGtt < 2:839742/238‑1 (MQ=255)
aGCACTTTCGGGTTATCGATAAGGATTTCGCCGATGTCCTGACGTAAGTAATCGCGGAATGCGCGAACGATTACGTTGCTCTCCTGATGAATCAGGAACGGGGCCGGGCGGCTTTCAGCGGCTTTTTTGATGGCTTCCCAGTGTTTCAGACGGAAGCTTAAATCCCATTGCCGCGCCTCAGCAGATTTGCCGACGCCAGCGGTGCGCACGATAAGCCCCATGCCTTCCGGCAGTTCAAg > 1:283912/1‑239 (MQ=255)
ttCGGGTTATCGATAAGGATTTCGCCGATGTCCTGACGTAAGTAATCGCGGAATGCGCGAACGATTACGTTGCTCTCCTGATGAATCAGGAACGGGGCCGGGCGGCTTTCAGCGGCTTTTTTGATGGCTTCCCAGTGTTTCAGACGGAAGCTTAAATCCCATTGCCGCGCCTCAGCAGATTTGCCGACGCCAGCGGTGCGCACGATAAGCCCCATGCCTTCCGGCAGTTCAAGGCTTg > 2:549479/1‑238 (MQ=255)
ttCGGGTTATCGATAAGGATTTCGCCGATGTCCTGACGTAAGTAATCGCGGAATGCGCGAACGATTACGTTGCTCTCCTGATGAATCAGGAACGGGGCCGGGCGGCTTTCAGCGGCTTTTTTGATGGCTTCCCAGTGTTTCAGACGGAAGCTTAAATCCCATTGCCGCGCCTCAGCAGATTTGCCGACGCCAGCGGTGCGCACGATAAGCCCCATGCCTTCCGGCAGTTCAAGGCTTGc < 2:935416/239‑1 (MQ=255)
tATCGATAAGGATTTCGCCGATGTCCTGACGTAAGTAATCGCGGAATGCGCGAACGATTACGTTGCTCTCCTGATGAATCAGGAACGGGGCCGGGCGGCTTTCAGCGGCTTTTTTGATGGCTTCCCAGTGTTTCAGACGGAAGCTTAAATCCCATTGCCGCGCCTCAGCAGATTTGCCGACGCCAGCGGTGCGCACGATAAGCCCCATGCCTTCCGGCAGTTCAAGGCTTGCCAGTGct < 1:478904/239‑1 (MQ=255)
aTCGATAAGGATTTCGCCGATGTCCTGACGTAAGTAATCGCGGAATGCGCGAACGATTACGTTGCTCTCCTGATGAATCAGGAACGGGGCCGGGCGGCTTTCAGCGGCTTTTTTGATGGCTTCCCAGTGTTTCAGACGGAAGCTTAAATCCCATTGCCGCGCCTCAGCAGATTTGCCGACCCCAGCGGTGCGCACGCTAAGCCCCATGCCTTCCGGCACTTCAAGGCTTGCCAGTGct > 2:823772/1‑238 (MQ=255)
tCGATAAGGATTTCGCCGATGTCCTGACGTAAGTAATCGCGGAATGCGCGAACGATTACGTTGCTCTCCTGATGAATCAGGAACGGGGCCGGGCGGCTTTCAGCGGCTTTTTTGATGGCTTCCCAGTGTTTCAGACGGAAGCTTAAATCCCATTGCCGCGCCTCAGCAGATTTGCCGACGCCAGCGGTGCGCACGATAAGCCCCATGCCTTCCGGCAGTTCAAGGCTTGCCAGTGct > 2:478904/1‑237 (MQ=255)
tCGATAAGGATTTCGCCGATGTCCTGACGTAAGTAATCGCGGAATGCGCGAACGATTACGTTGCTCTCCTGATGAATCAGGAACGGGGCCGGGCGGCTTTCAGCGGCTTTTTTGATGGCTTCCCAGTGTTTCAGACGGAAGCTTAAATCCCATTGCCGCGCCTCAGCAGATTTGCCGACGCCAGCGGTGCGCACGATAAGCCCCATGCCTTCCGGCAGTTCAAGGCTTGCCAGTGct > 1:609187/1‑237 (MQ=255)
agttCGCCGATGGCCTTACGTAAGTAATCGCGGAATGCGCGAACGATTACGTTGCTCTCCTGATGAATCAGGAACGGGGCCGGGCGGCTTTCAGCGGCTTTTTTGATGGCTTCCCAGTGTTTCAGACGGAAGCTTAAATCCCATTGCCGCGCCTCAGCAGATTTGCCGACGCCAGCGGTGCGCACGATAAGCCCCATGCCTTCCGGCAGTTCAAGGCTTGCCAGTGCTTCTTTTAAtt < 2:1127438/236‑1 (MQ=255)
tCGCCGATGTCCTGACGTAAGTAATCGCGGAATGCGCGAACGATTACGTTGCTCTCCTGATGAATCAGGAACGGGGCCGGGCGGCTTTCAGCGGCTTTTTTGATGGCTTCCCAGTGTTTCAGACGGAAGCTTAAATCCCATTGCCGCGCCTCAGCAGATTTGCCGACGCCAGCGGTGCGCACGATAAGCCCCATGCCTTCCGGCAGTTCAAGGCTTGCCAGTGCTTCTTTTAATTCGGt > 1:540318/1‑239 (MQ=255)
cGCCGATGTCCTGACGTAAGTAATCGCGGAATGCGCGAACGATTACGTTGCTCTCCTGATGAATCAGGAACGGGGCCGGGCGGCTTTCAGCGGCTTTTTTGATGGCTTCCCAGTGTTTCAGACGGAAGCTTAAATCCCATTGCCGCGCCTCAGCAGATTTGCCGACGCCAGCGGTGCGCACGATAAGCCCCATGCCTTCCGGCAGTTCAAGGCTTGCCAGTGCTTCTTTTAATTCGGTa < 2:549074/239‑1 (MQ=255)
aTGTCCTGACGTAAGTAATCGCGGAATGCGCGAACGATTACGTTGCTCTCCTGATGAATCAGGAACGGGGCCGGGCGGCTTTCAGCGGCTTTTTTGATGGCTTCCCAGTGTTTCAGACGGAAGCTTAAATCCCATTGCCGCGCCTCAGCAGATTTGCCGACGCCAGCGGTGCGCACGATAAGCCCCATGCCTTCCGGCAGTTCAAGGCTTGCCAGTGCTTCTTTTAATTCGGTACGgtc > 1:627372/1‑239 (MQ=255)
aTGTCCTGACGTAAGTAATCGCGGAATGCGCGAACGATTACGTTGCTCTCCTGATGAATCAGGAACGGGGCCGGGCGGCTTTCAGCGGCTTTTTTGATGGCTTCCCAGTGTTTCAGACGGAAGCTTAAATCCCATTGCCGCGCCTCAGCAGATTTGCCGACGCCAGCGGTGCGCACGATAAGCCCCATGCCTTCCGGCAGTTCAAGGCTTGCCAGTGCTTCTTTTAATTCGGTACGgtc > 1:195964/1‑239 (MQ=255)
aTGTCCTGACGTAAGTAATCGCGGAATGCGCGAACGATTACGTTGCTCTCCTGATGAATCAGGAACGGGGCCGGGCGGCTTTCAGCGGCTTTTTTGATGGCTTCCCAGTGTTTCAGACGGAAGCTTAAATCCCATTGCCGCGCCTCAGCAGATTTGCCGACGCCAGCGGTGCGCAAGATAAGCCCCATGCCTTCCGGCAGTTCAAGGCTTGCCAGTGCTTCTTTTAATTCGGTACGgtc > 2:369301/1‑239 (MQ=255)
tGTCCTGACGTAAGTAATCGCGGAATGCGCGAACGATTACGTTGCTCTCCTGATGAATCAGGAACGGGGCCGGGCGGCTTTCAGCGGCTTTTTTGATGGCTTCCCAGTGTTTCAGACGGAAGCTTAAATCCCATTGCCGCGCCTCAGCAGATTTGCCGACGCCAGCGGTGCGCACGATAAGCCCCATGCCTTCCGGCAGTTCAAGGCTTGCCAGTGCTTCTTTTAATTCGGTACGgtcg < 2:518453/239‑1 (MQ=255)
tGTCCTGACGTAAGTAATCGCGGAATGCGCGAACGATTACGTTGCTCTCCTGATGAATCAGGAACGGGGCCGGGCGGCTTTCAGCGGCTTTTTTGATGGCTTCCCAGTGTTTCAGACGGAAGCTTAAATCCCATTGCCGCGCCTCAGCAGATTTGCCGACGCCAGCGGTGCGCACGATAAGCCCCATGCCTTCCGGCAGTTCAAGGCTTGCCAGTGCTTCTTTTAATTCGGTACGgtcg > 2:218336/1‑239 (MQ=255)
tGTCCTGACGTAAGTAATCGCGGAATGCGCGAACGATTACGTTGCTCTCCTGATGAATCAGGAACGGGGCCGGGCGGCTTTCAGCGGCTTTTTTGATGGCTTCCCAGTGTTTCAGACGGAAGCTTAAATCCCATTGCCGCGCCTCAGCAGATTTGCCGACGCCAGCGGTGCGCACGATAAGCCCCATGCCTTCCGGCAGTTCAAGGCTTGCCAGTGCTTCTTTTAATTCGGCACGgtcg > 2:1024404/1‑239 (MQ=255)
aagtaaTCGCGGAATGCGCGAACGATTACGTTGCTCTCCTGATGAATCAGGAACGGGGCCGGGCGGCTTTCAGCGGCTTTTTTGATGGCTTCCCAGTGTTTCAGACGGAAGCTTAAATCCCATTGCCGCGCCTCAGCAGATTTGCCGACGCCAGCGGTGCGCACGATAAGCCCCATGCCTTCCGGCAGTTCAAGGCTTGCCAGTGCTTCTTTTAATTCGGTACGGTCGTCGCCTTCGa < 1:1243647/238‑1 (MQ=255)
agtaaTCGCGGAATGCGCGAACGATTACGTTGCTCTCCTGATGAATCAGGAACGGGGCCGGGCGGCTTTCAGCGGCTTTTTTGATGGCTTCCCAGTGTTTCAGACGGAAGCTTAAATCCCATTGCCGCGCCTCAGCAGATTTGCCGCCGCCAGCGGTGCGCACGATAAGCCCCATGCCTTCCGGCAGTTCAAGGCTTGCCAGTGCTTCTTTTAATTCGGTACGGTCGTCGCCTTCGAt > 1:638516/1‑238 (MQ=255)
agtaaTCGCGGAATGCGCGAACGATTACGTTGCTCTCCTGATGAATCAGGAACGGGGCCGGGCGGCTTTCAGCGGCTTTTTTGATGGCTTCCCAGTGTTTCAGACGGAAGCTTAAATCCCATTGCCGCGCCTCAGCAGATTTGCCGACGCCAGCGGTGCGCACGATAAGCCCCATGCCTTCCGGCAGTTCAAGGCTTGCCAGTGCTTCTTTTATTTCGGTACGGTCGTCGCCTTCGAt > 2:61001/1‑238 (MQ=255)
agtaaTCGCGGAATGCGCGAACGATTACGTTGCTCTCCTGATGAATCAGGAACGGGGCCGGGCGGCTTTCAGCGGCTTTTTTGATGGCTTCCCAGTGTTTCAGACGGAAGCTTAAATCCCATTGCCGCGCCTCAGCAGATTTGCCGACGCCAGCGGTGCGCACGATAAGCCCCATGCCTTCCGGCAGTTCAAGGCTTGCCAGTGCTTCTTTTAATTCGGTACGGTCGTCGCCTTCGAt > 1:103207/1‑238 (MQ=255)
aaTCGCGGAATGCGCGAACGATTACGTTGCTCTCCTGATGAATCAGGAACGGGGCCGGGCGGCTTTCAGCGGCTTTTTTGATGGCTTCCCAGTGTTTCAGACGGAAGCTTAAATCCCATTGCAGCGCCTCAGCAGATTTGCCGACGCCAGCGGTGCGCACGATAAGCCCCATGCCTTCCGGCAGTTCAAGGCTTGCCAGTGCTTCTTTTAATTCGGTACGGTCGTCGCCTTCGATACg < 1:190522/238‑1 (MQ=255)
tCGCGGAATGCGCGAACGATTACGTTGCTCTCCTGATGAATCAGGAACGGGGCCGGGCGGCTTTCAGCGGCTTTTTTGATGGCTTCCCAGTGTTTCAGACGGAAGCTTAAATCCCATTGCCGCGCCTCAGCAGATTTGCCGACGCCAGCGGTGCGCACGATAAGCCCCATGCCTTCCGGCAGTTCAAGGCTTGCCAGTGCTTCTTTTAATTCGGTACGGTCGTCGCCTTCGATACGGCg > 2:1127031/1‑239 (MQ=255)
tCGCGGAATGCGCGAACGATTACGTTGCTCTCCTGATGAATCAGGAACGGGGCCGGGCGGCTTTCAGCGGCTTTTTTGATGGCTTCCCAGTGTTTCAGACGGAAGCTTAAATCCCATTGCAGCGCCTCAGCAGATTTGCCGACGCCAGCGGTGCGCACGATAAGCCCCATGCCTTCCGGCAGTTCAAGGCTTGCCAGTGCTTCTTTTAATTCGGTACGGTCGTCGCCTTCGATACGGCg > 1:1048529/1‑239 (MQ=255)
gAATGCGCGAACGATTACGTTGCTCTCCTGATGAATCAGGAACGGGGCCGGGCGGCTTTCAGCGGCTTTTTTGATGGCTTCCCAGTGTTTCAGACGGAAGCTTAAATCCCATTGCCGCGCCTCAGCAGATTTGCCGACGCCAGCGGTGCGCACGATAAGCCCCATGCCTTCCGGCAGTTCAAGGCTTGCCAGTGCTTCTTTTAATTCGGTACGGTCGTCGCCTTCGATACGGCGAGaaa > 2:248210/1‑239 (MQ=255)
aaCGATTACGTTGCTCTCCTGATGAATCAGGAACGGGGCCGGGCGGCTTTCAGCGGCTTTTTTGATGGCTTCCCAGTGTTTCAGACGGAAGCTTAAATCCCATTGCCGCGCCTCAGCAGATTTGCCGACGCCAGCGGTGCGCACGATAAGCCCCCTGCCTTCCGGCAGTTCAAGGCTTGCCAGTGCTTCTTTTAATTCGGTGCGGTCTTCCCCTTCGATACGGCGGGAAATGcccccc > 2:1227555/1‑238 (MQ=255)
ctctCCTGATGAATCAGGAACGGGGCCGGGCGGCTTTCAGCGGCTTTTTTGATGGCTTCCCAGTGTTTCAGACGGAAGCTTAAATCCCATTGCCGCGCCTCAGCAGATTTGCCGACGCCAGCGGTGCGCACGATAAGCCCCATGCCTTCCGGCAGTTCAAGGCTTGCCAGTGCTTCTTTTAATTCGGTACGGTCGTCGCCTTCGATACGGCGAGAAATGCCACCCGCGCGCGGgttgt > 1:963033/1‑238 (MQ=255)
ctctCCTGATGAATCAGGAACGGGGCCGGGCGGCTTTCAGCGGCTTTTTTGATGGCTTCCCAGTGTTTCAGACGGAAGCTTAAATCCCATTGCCGCGCCTCAGCAGATTTGCCGACGCCAGCGGTGCGCACGATAAGCCCCATGCCTTCCGGCAGTTCAAGGCTTGCCAGTGCTTCTTTTAATTCGGTACGGTCGTCGCCTTCGATACGGCGAGAAATGCCACCCGCGCGCGGgttgt > 1:138868/1‑238 (MQ=255)
ctcCTGATGAATCAGGAACGGGGCCGGGCGGCTTTCAGCGGCTTTTTTGATGGCTTCCCAGTGTTTCAGACGGAAGCTTAAATCCCATTGCCGCGCCTCAGCAGATTTGCCGACGCCAGCGGTGCGCACGATAAGCCCCATGCCTTCCGGCAGTTCAAGGCTTGCCAGTGCTTCTTTTAATTCGGTACGGTCGTCGCCTTCGATACGGCGAGAAATGCCACCCGCGCGCGGGTTGTTCg > 2:708039/1‑239 (MQ=255)
tgatgaATCAGGAACGGGGCCGGGCGGCTTTCAGCGGCTTTTTTGATGGCTTCCCAGTGTTTCAGACGGAAGCTTAAATCCCATTGCCGCGCCTCAGCAGATTTGCCGACGCCAGCGGTGCGCACGATAAGCCCCATGCCTTCCGGCAGTTCAAGGCTTGCCAGTGCTTCTTTTAATTCGGTACGGTCGTCGCCTTCGATACGGCGAGAAATGCCACCCGCGCGCGGGTTGTTCGGCAt < 1:1130733/239‑1 (MQ=255)
tgatgaATCAGGAACGGGGCCGGGCGGCTTTCAGCGGCTTTTTTGATGGCTTCCCAGTGTTTCAGACGGAAGCTTAAATCCCATTGCCGCGCCTCAGCAGATTTGCCGACGCCAGCGGTGCGCACGATAAGCCCCATGCCTTCCGGCAGTTCAAGGCTTGCCAGTGCTTCTTTTAATTCGGTACGGTCGTCGCCTTCGATACGGCGAGAAATGCCACCCGCGCGCGGGTTGTTCGGCAt < 1:1114406/239‑1 (MQ=255)
tgatgaATCAGGAACGGGGCCGGGCGGCTTTCAGCGGCTTTTTTGATGGCTTCCCAGTGTTTCAGACGGAAGCTTAAATCCCATTGCCGCGCCTCAGCAGATTTGCCGACGCCAGCGGTGCGCACGATAAGCCCCATGCCTTCCGGCAGTTCAAGGCTTGCCAGTGCTTCTTTTAATTCGGTACGGTCGTCGCCTTCGATACGGCGAGAAATGCCACCCGCGCGCGGGTTGTTCGGCAt < 1:882045/239‑1 (MQ=255)
gatgaATCAGGAACGGGGCCGGGCGGCTTTCAGCGGCTTTTTTGATGGCTTCCCAGTGTTTCAGACGGAAGCGTAAATCCCATTGCCGCGCCTCAGCAGATTTGCCGACGCCAGCGGTGCGCACGATAAGCCCCATGCCTTCCGGCAGTTCAAGGCTTGCCAGTGCTTCTTTTAATTCGGTACGGTCGTCGCCTTCGATACGGCGAGAAATGCCACCCGCGCGCGGGTTGTTCGGCAt < 2:881193/238‑1 (MQ=255)
tCAGGAACGGGGCCGGGCGGCTTTCAGCGGCTTTTTTGATGGCTTCCCAGTGTTTCAGACGGAAGCTTAAATCCCATTGCCGCGCCTCAGCAGATTTGCCGACGCCAGCGGTGCGCACGATAAGCCCCATGCCTTCCGGCAGTTCAAGGCTTGCCAGTGCTTCTTTTAATTCGGTACGGTCGTCGCCTTCGATACGGCGAGAAATGCCACCCGCGGGCGGGTTGTTCGGCATCaagacc > 2:893447/1‑234 (MQ=255)
tCAGGAACGGGGCCGGGCGGCTTTCAGCGGCTTTTTTGATGGCTTCCCAGTGTTTCAGACGGAAGCTTAAATCCCATTGCCGCGCCTCAGCAGATTTGCCGACGCCAGCGGTGCGCACGATAAGCCCCATGCCTTCCGGCAGTTCAAGGCTTGCCAGTGCTTCTTTTAATTCGGTACGGTCGTCGCCTTCGATACGGCGAGAAATGCCACCCGCGCGCGGGTTGTTCGGCATCAGAAcc > 2:535088/1‑239 (MQ=255)
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aGGAACGGGGCCGGGCGGCTTTCAGCGGCTTTTTTGATGGCTTCCCAGTGTTTCAGACGGAAGCTTAAATCCCATTGCCGCGCCTCAGCAGATTTGCCGACGCCAGCGGTGCGCACGATAAGCCCCATGCCTTCCGGCAGTTCAAGGCTTGCCAGTGCTTCTTTTAATTCGGTACGGTCGTCGCCTTCGATACGGCGAGAAATGCCACCCGCGCGCGGGTTGTTCGGCATCAGAACCAg > 1:1201524/1‑239 (MQ=255)
gggCGGCTTTCAGCGGCTTTTTTGATGGCTTCCCAGTGTTTCAGACGGAAGCTTAAATCCCATTGCCGCGCCTCAGCAGATTTGCCGACGCCAGCGGTGCGCACGATAAGCCCCATGCCTTCCGGCAGTTCAAGGCTTGCCAGTGCTTCTTTTAATTCGGTACGGTCGTCGCCTTCGATACGGCGAGAAATGCCACCCGCGCGCGGGTTGTTCGGCATCAGAACCAGATAGCTACCCGc < 1:372363/239‑1 (MQ=255)
ggcggcTTTCAGCGGCTTTTTTGATGGCTTCCCAGTGTTTCAGACGGAAGCTTAAATCCCATTGCCGCGCCTCAGCAGATTTGCCGACGCCAGCGGTGCGCACGATAAGCCCCATGCCTTCCGGCAGTTCAAGGCTTGCCAGTGCTTCTTTTAATTCGGTACGGTCGTCGCCTTCGATACGGCGAGAAATGCCCCCCGCGCGCGGGTTGTTCGGCATCAGAACCAGATAGCTACCCGc > 2:171189/1‑238 (MQ=255)
ggcTTTCAGCGGCTTTTTTGATGGCTTCCCAGTGTTTCAGACGGAAGCTTAAATCCCATTGCCGCGCCTCAGCAGATTTGCCGACGCCAGCGGTGCGCACGATAAGCCCCATGCCTTCCGGCAGTTCAAGGCTTGCCAGTGCTTCTTTTAATTCGGTACGGTCGTCGCCTTCGATACGGCGAGAAATGCCACCCGCGCGCGGGTTGTTCGGCATCAGAACCAGATAGCTACCCGCCAg < 1:777571/238‑1 (MQ=255)
ggcTTTCAGCGGCTTTTTTGATGGCTTCCCAGTGTTGCAGACGGAAGCTTAAACCCCATTGCAGCGCCTCAGCAGATTTGCCGACGCCAGCGGTGCGCACGATAAGCCCCATGCCTTCCGGCAGTTCAAGGCTTGCCAGTGCTTCTTTTAATTCGGTACGGTCGTCGCCTTCGATACGGCGAGAAATGCCACCCGCGCGCGGGTTGTTCGGCATCAGAACCAGATAGCTCCCCGCCAg < 2:849432/238‑1 (MQ=255)
gcTTTCAGCGGCTTTTTTGATGGCTTCCCAGTGTTTCAGACGGAAGCTTAAATCCCATTGCCGCGCCTCAGCAGATTTGCCGACGCCAGCGGTGCGCACGATAAGCCCCATGCCTTCCGGCAGTTCAAGGCTTGCCAGTGCTTCTTTTAATTCGGTACGGTCGTCGCCTTCGATACGGCGAGAAATGCCACCCGCGCGCGGGTTGTTCGGCATCAGAACCAGATAGCTACCCGCCAGa < 1:218336/238‑1 (MQ=255)
gcTTTCAGCGGCTTTTTTGATGGCTTCCCAGTGTTTCAGACGGAAGCTTAAATCCCATTGCCGCGCCTCAGCAGATTTGCCGACGCCAGCGGTGCGCACGATAAGCCCCATGCCTTCCGGCAGTTCAAGGCTTGCCAGTGCTTCTTTTAATTCGGTACGGTCGTCGCCTTCGATACGGCGAGAAATGCCACCCGCGCGCGGGTTGTTCGGCATCAGAACCAGATAGCTACCCGCCAGa < 1:248210/238‑1 (MQ=255)
cTTTCAGCGGCTTTTTTGATGGCTTCCCAGTGTTTCAGACGGAAGCTTAAATCCCATTGCCGCGCCTCAGCAGATTTGCTGTCGCCAGCGGTGCGCACGATAAGCCCCATGCCTTCCGGCAGTTCAAGGCTTGCCAGTGCTTCTTTTAATTCGGTACGGTCGACGCCTTCGATACGGCGAGAAAATCCACCCTCGCGCGGGTTGTTCGGCACAACAACCAGATACCTCCCCGCCAg > 2:526619/1‑236 (MQ=255)
ggCTTTTTTGATGGCTTCCCAGTGTTTCAGACGGAAGCTTAAATCCCATTGCCGCGCCTCAGCAGATTTGCCGACGCCAGCGGTGCGCACGATAAGCCCCATGCCTTCCGGCAGTTCAAGGCTTGCCAGTGCTTCTTTTAATTCGGTACGGTCGTCGCCTTCGATACGGCGAGAAATGCCACCCGCGCGCGGGTTGTTCGGCATCAGAACCAGATAGCTACCCGCCAGACTGATAAAg < 2:1201524/238‑1 (MQ=255)
ggCTTTTTTGATGGCTTCCCAGTGTTTCAGACGGAAGCTTAAATCCCATTGCCGCGCCTCAGCAGATTTGCCGACGCCAGCGGTGCGCACGATAAGCCCCATGCCTTCCGGCAGTTCAAGGCTGGCCAGTGCTTCTTTTAATTCGGTACGGTCGTCGCCTTCGATACGGCGAGAAATGCCACCCGCGCGCGGGTTGTTCGGCATCAGAACCAGATAGCTACCCGCCAGACTGATAAAg < 2:527926/238‑1 (MQ=255)
ggCTTTTTTGATGGCTTCCCAGTGTTTCAGACGGAAGCTTAAATCCCATTGCCGCGCCTCAGCAGATTGGCCGACGCCAGCGGTGCGCACGATAAGCCCCATGCCTTCCGGCAGTTCAAGGCTTGCCAGTGCTTCTTTTAATTCGGTACGGTCGTCGCCTTCGATACGGCGAGAAATGCCACCCGCGCGCGGGTTGTTCGGCATCAGAACCAGATAGCTACCCGCCAGACTGATAAAg < 1:1047445/238‑1 (MQ=255)
cTTTTTTGATGGCTTCCCAGTGTTTCAGACGGAAGCTTAAATCCCATTGCCGCGCCTCAGCAGATTTGCCGACGCCAGCGGTGCGCACGATAAGCCCCATGCCTTCCGGCAGTTCAAGGCTTGCCAGTGCTTCTTTTAATTCGGTACGGTCGTCGCCTTCGATACGGCGAGAAATGCCACCCGCGCGCGGGTTGTTCGGCATCAGAACCAGATAGCTACCCGCCAGACTGATAAAggtg > 2:340665/1‑239 (MQ=255)
ttCCCAGTGTTTCAGACGGAAGCTTAAATCCCATTGCCGCGCCTCAGCAGATTTGCCGACGCCAGCGGTGCGCACGATAAGCCCCATGCCTTCCGGCAGTTCAAGGCTTGCCAGTGCTTCTTTTAATTCGGTACGGTCGTCGCCTTCGATACGGCGAGAAATGCCACCCGCGCGCGGGTTGTTCGGCATCAGAACCAGATAGCTACCCGCCAGACTGATAAAGGTGGTTAATGCcgcg > 1:254433/1‑238 (MQ=255)
ttCCCAGTGTTTCAGACGGAAGCTTAAATCCCATTGCCGCGCCTCAGCAGATTTGCCGACGCCAGCGGTGCGCACGATAAGCCCCATGCCTTCCGGCAGTTCAAGGCTTGCCAGTGCTTCTTTTAATTCGGTACGGTCGTCGCCTTCGATACGGCGAGAAATGCCACCCGCGCGCGGGTTGTTCGGCATCAGAACCAGATAGCTACCCGCCAGACTGATAAAGGTGGTTAATGCCgcgc < 2:1059482/239‑1 (MQ=255)
tCCCAGTGTTTCAGTCGGAAGCTTAAATCCCATTGCCGCGCCTCAGCAGATTTGCCGACGCCAGCGGTGCGCACGATAAGCCCCCTCCCTTCCGGCAGTTCAAGGCTTGCCAGTGCTTCTTTTAATTCGGTACGGCCGTCGCCTTCGATACGGCGTGAAAGCACACCCGCACCGGGGTTGGTCGGCATCAGAACCAGATAGCTTCCCGCCAGCATGCTCAAGGCGGCTAATgcggcg > 2:828390/1‑237 (MQ=255)
ttCAGACGGAAGCTTAAATCCCATTGCCGCGCCTCAGCAGATTTGCCGACGCCAGCGGTGCGCACGATAAGCCCCATGCCTTCCGGCAGTTCAAGGCTTGCCAGTGCTTCTTTTAATTCGGTACGGTCGTCGCCTTCGATACGGCGAGAAATGCCACCCGCGCGCGGGTTGTTCGGCATCAGAACCAGATAGCTACCCGCCAGACTGATAAAGGTGGTTAATGCCGCGCCTTTGTTGcc < 1:503967/239‑1 (MQ=255)
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aggCTTAAACCCCGTTGCCGCCCCCCAGCAGATTTGCCGACGCCAGCGGTGCGCACGATAAGCCCCATGCCTTCCGGCAGTTCAAGGCTTGCCAGTGCTTCTTTTAATTCGGTACGGTCGTCGCCTTCGATACGGCGAGAAATGCCACCCGCGCGCGGGTTGTTCGGCATCAGAACCAGATAGCTACCCGCCAGACTGATAAAGGTGGTTAATGCCGCGCCTTTGTTGCCGCGCtctt < 2:65281/236‑1 (MQ=255)
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ttAAATCCCATTGCCGCGCCTCAGCAGATTTGCCGACGCCAGCGGTGCGCACGATAAGCCCCATGCCTTCCGGCAGTTCAAGGCTTGCCAGTGCTTCTTTTAATTCGGTACGGTCGTCGCCTTCGATACGGCGAGAAATGCCACCCGCGCGCGGGTTGTTCGGCATCAGAACCAGATAGCTACCCGCCAGACTGATAAAGGTGGTTAATGCCGCGCCTTTGTTGCCGCGCTCTTCTTTa < 1:535088/239‑1 (MQ=255)
ttAAATCCCATTGCCGCGCCTCAGCAGATTTGCCGACGCCAGCGGTGCGCACGATAAGCCCCATGCCTTCCGGCAGTTCAAGGCTTGCCAGTGCTTCTTTTAATTCGGTACGGTCGTCGCCTTCGATACGGCGAGAAATGCCACCCGCGCGCGGGTTGTTCGGCATCAGAACCAGATAGCTACCCGCCAGACTGATAAAGGTGGTTAATGCCGCGCCTTTGTTGCCGCGCTCTTCTTTa < 1:171189/239‑1 (MQ=255)
ttAAATCCCATTGCCCCGCCTCAGCAGTTTTGCCGCAGCCAGCGGTGCACACGATAAGCCCCATGCCTCCCGGCAGTTCAAGGCTTGCCAGTCCTTCTTTTAATTCGGTACGGTCGGCGCCTTCGATACGGCGAGAAATGCCACCCGCGCGCGGGTTGTTGGGCATCAGAACCAGATAGCTACCCGCCAGACTGATAAAGGTGGTTAATGCCGCGCCTTTGTTGCCGCGCTCTTCTTTa < 2:843848/239‑1 (MQ=255)
ttAAATCCCATGGCCGCGCCTCAGCAGATTTGCCGACGCCAGCGGTGCGCACGATAAGCCCCATGCCTTCCGGCAGTTCAAGGCTTGCCAGTGCTTCTTTTAATTCGGTACGGTCGTCGCCTTCGATACGGCGAGAAATGCCCCCCGCGCGCGGGTTGTTCGGCATCAGAACCAGATAGCTACCCGCCAGACTGATAAAGGTGGTTAATGCCGCGCCTTTGTTGCCGCGCTCTTCTTTa < 2:484369/239‑1 (MQ=255)
tcaaaTCCCATTGCCGCGCCGCAGCAGATTTGCCGCCGCCGGCGGTGCGCACGATAAGCCCCAGGCCTTCCGGCAGTTCAAGGCTTGCCAGTGCTTTTTTTAATACGGTACGGTCGTCGCCTTCGATACGGCGAGAAATGCCACCCGCGCGCGGTTTGTTCGGCATCAGAACCAGATAGCTTCCCGCCAGACTGATAAAGGTGTTTAATGCCGCGCCTTTGTTGCCGCGCTCTTCTTTa < 2:254433/237‑1 (MQ=255)
taaaaTCCCACTGCCGCGCCTCGGCAGATTTTCCGAGGCCGGCGGTGCGCACGATAAGCCCCATGCTTTCCGGCAGTTCAAGGCTTGCCAGTGCTTCTTTTAATTCGGTACGGTCGTCGCCTTCGATACGGCGAGAAATGCCACCCGCGCGCGGGTTGTTCGGCATCAGACCCAGATAGCTACCCGCCAGACTGATAAAGGTGGTTAATGCCGCGCCTTTGTTGCCGCGCTCTTCTTTa < 2:347641/237‑1 (MQ=255)
tcctcttGCCGCGCCACAGCAGATTTGCCGACGCCAACGGTGCGCCCGATAAGCTCCTTGCCCTCCGGCAGTTCAAGGCTTGCCAGTGCTTCTTTTAATTCGGTACGGTCGTCGCCTTCGATACGGCGAGAAATGCCACCCGCGCGCGGGTTGTTCGGCACCAGAACCAGATAGCTCCCCGCCAGACTGATAAAGGTGGTTAATGCCGCGCCTTTGTTGCCGCGCTCTTCTTTATCGAt < 2:138868/234‑1 (MQ=255)
tCCCATTTCCGCGCCTCAGCCGATTTGCCGACGCCCGCGGTCCGCACGATAAGCCCCGTGCCTTCCGGCAGTTCAAGGCTTGCCAGTGCTTCTTTTAATTCGGTACGGTCGTCGCCTTCGATACGGCGAGAAATGCCACCCGCGCGCGGGTTGTTCGGCATCAGAACCAGATAGCTACCCGCCAGACTGATAAAGGTGGTTAATGCCGCGCCTTTGTTGCCGCGCTCTTCTTTATCGAt < 2:609187/239‑1 (MQ=255)
tCCCATTGCCGCGCCTCAGCAGATTTGCCGACGCCAGCGGTGCGCACGATAAGCCCCATGCCTTCCGGCAGTTCAAGGCTTGCCAGTGCTTCTTTTAATTCGGTACGGTCGTCGCCTTCGATACGGCGAGAAATGCCACCCGCGCGCGGGTTGTTCGGCATCAGAACCAGATAGCTACCCGCCAGACTGATAAAGGTGGTTAATGCCGCGCCTTTGTTGCCGCGCTCTTCTTTATCGAt < 1:549479/239‑1 (MQ=255)
cATTGCCGCGCCTCAGCAGATTTGCCGACGCCAGCGGTGCGCACGATAAGCCCCATGCCTTCCGGCAGTTCAAGGCTTGCCAGTGCTTCTTTTAATTCGGTACGGTCGTCGCCTTCGATACGGCGAGAAATGCCACCCGCGCGCGGGTTGTTCGGCATCAGAACCAGATAGCTACCCGCCAGACTGATAAAGGTGGGTAATGCCGCGCCTTTGTTGCCGCGCTCTTCTTTATCGATCTg > 2:1178811/1‑239 (MQ=255)
ttGCAGCGCCTCAGCAGATTTGCCGACGCCAGCGGTGCGCACGATAAGCCCCATGCCTTCCGGCAGTTCAAGGCTTGCCAGTGCTTCTTTTAATTCGGTACGGTCGTCGCCTTCGATACGGCGAGAAATGCCACCCGCGCGCGGGTTGTTCGGCATCAGAACCAGATAGCTACCCGCCAGACTGATAAAGGTGGTTAATGc > 2:210558/1‑201 (MQ=255)
|
TTTGATTTTGCTGCTGAAATCCGGGCGACCTAATGCAGCGATATGCTGACGTGCCAGTTCGAGCACTTTCGGGTTATCGATAAGGATTTCGCCGATGTCCTGACGTAAGTAATCGCGGAATGCGCGAACGATTACGTTGCTCTCCTGATGAATCAGGAACGGGGCCGGGCGGCTTTCAGCGGCTTTTTTGATGGCTTCCCAGTGTTTCAGACGGAAGCTTAAATCCCATTGCAGCGCCTCAGCAGATTTGCCGACGCCAGCGGTGCGCACGATAAGCCCCATGCCTTCCGGCAGTTCAAGGCTTGCCAGTGCTTCTTTTAATTCGGTACGGTCGTCGCCTTCGATACGGCGAGAAATGCCACCCGCGCGCGGGTTGTTCGGCATCAGAACCAGATAGCTACCCGCCAGACTGATAAAGGTGGTTAATGCCGCGCCTTTGTTGCCGCGCTCTTCTTTATCGATCTGA > NC_000913/1143597‑1144062
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
N/A
