Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A7 F28 I0 R1
|
140 |
172.9 |
3477528 |
97.9% |
3404499 |
226.2 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
freq |
annotation |
gene |
description |
| RA |
NC_000913 |
3,731,688 |
C→A |
12.8% |
Q187K (CAA→AAA) |
xylF → |
D‑xylose transporter subunit |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | NC_000913 | 3,731,688 | 0 | C | A | 12.8%
| 489.0
/ 8.7
| 173 | Q187K (CAA→AAA) | xylF | D‑xylose transporter subunit |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (80/66); new base A (2/23); total (82/91) |
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 6.93e-06 |
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.07e-01 |
Only 100 of 178 total aligned reads displayed.
TAAAGTATTAGCTTACGACCGTATGATTAACGATGCGGATATCGATTTTTATATTTCTTTCGATAACGAAAAAGTCGGTGAACTGCAGGCAAAAGCCCTGGTCGATATTGTTCCGCAAGGTAATTACTTCCTGATGGGCGGCTCGCCGGTAGATAACAACGCCAAGCTGTTCCG‑CGCCGGACAAATGAAAGTGTTAAAACCTT‑ACGTTGATT‑CCG‑GAAAAATTAAA‑GTCGTTGGTGACCAATG‑G‑GTTGATGGCTGGTTACCGGAAAA‑CGCA‑TTGAAAATTATGGAAAAC‑GCGCTAACCGCCAATAATAACAAAATTGATGCTGTAGTTGCCTCAAACGATGCCACCGCAGGTGGGGCAATTCAGGCATTAAGCGCGCAAGGTTTATCAGGGAAAGTAGCAATCTCCGGCCAGGATGCGGATCTCGCAGGTATTAAACGTATTGCTGCCGGTACGCAAACTATGACGGTGTATA > NC_000913/3731450‑3731922
|
tAAAGTATTAGCTTACGACCGTATGATTAACGATGCGGATATCGATTTTTATATTTCTTTCGATAACGAAAAAGTCGGTGAACTGCAGGCAAAAGCCCTGGTCGATATTGTTCCGCAAGGTAATTACTTCCTGATGGGCGGCTCGCCGGTAGATAACAACGCCAAGCTGTTCCG‑CGCCGGACAAATGAAAGTGTTAAAACCTT‑ACGTTGATT‑CCG‑GAAAAATTAAA‑GTCGTTGGTGAcc > 2:63893/1‑239 (MQ=255)
tAAAGTATTAGCTTACGACCGTATGATTAACGATGCGGATATCGATTTTTATATTTCTTTCGATAACGAAAAAGTCGGTGAACTGCAGGCAAAAGCCCTGGTCGATATTGTTCCGCAAGGTAATTACTTCCTGATGGGCGGCTCGCCGGTAGATAACAACGCCAAGCTGTTCCG‑CGCCGGACAAATGAAAGTGTTAAAACCTT‑ACGTTGATT‑CCG‑GAAAAATTAAA‑GTCGTTGGTGAcc > 2:1448062/1‑239 (MQ=255)
aaaGTATTAGCTTACGACCGTATGATTAACGATGCGGATATCGATTTTTATATTTCTTTCGATAACGAAAAAGTCGGTGAACTGCAGGCAAAAGCCCTGGTCGATATTGTTCCGCAAGGTAATTACTTCCTGATGGGCGGCTCGCCGGTAGATAACAACGCCAAGCTGTTCCG‑CGCCGGACAAATGAAAGTGTTAAAACCTT‑ACGTTGATT‑CCG‑GAAAAATTAAA‑GTCGTTGGTGACCa < 2:834270/239‑1 (MQ=255)
aaGTATTAGCTTACGACCGTATGATTAACGATGCGGATATCGATTTTTATATTTCTTTCGATAACGAAAAAGTCGGTGAACTGCAGGCAAAAGCCCTGGTCGATATTGTTCCGCAAGGTAATTACTTCCTGATGGGCGGCTCGCCGGTAGATAACAACGCCAAGCTGTTCCG‑CGCCGGACAAATGAAAGTGTTAAAACCTT‑ACGTTGATT‑CCG‑GAAAAATTAAA‑GTCGTTGGTGACCaa < 2:936119/239‑1 (MQ=255)
ttAGCTTACGACCGTATGATTAACGATGCGGATATCGATTTTTATATTTCTTTCGATAACGAAAAAGTCGGTGAACTGCAGGCAAAAGCCCTGGTCGATATTGTTCCGCAAGGTAATTACTTCCTGATGGGCGGCTCGCCGGTAGATAACAACGCCAAGCTGTTCCG‑CGCCGGACAAATGCAAGTGTTAAAACCTT‑ACGTTGATT‑CCG‑GAAACATTAAA‑GTCGTTGGTGAccctgta > 1:303230/1‑232 (MQ=255)
ttAGCTTACGACCGTATGATTAACGATGCGGATATCGATTTTTATATTTCTTTCGATAACGAAAAAGTCGGTGAACTGCAGGCAAAAGCCCTGGTCGATATTGTTCCGCAAGGTAATTACTTCCTGATGGGCGGCTCGCCGGTAGATAACAACGCCAAGCTGTTCCG‑CGCCGGACAAATGACAGTGTTAAAACCTT‑ACGTTCATT‑CCG‑GAACATTTAAA‑GTCGCTGGTGACCAATG‑G‑Gt > 1:484762/1‑239 (MQ=255)
ttACGACCGTATGATTAACGATGCGGATATCGATTTTTATATTTCTTTCGATAACGAAAAAGTCGGTGAACTGCAGGCAAAAGCCCTGGTCGATATTGTTCCGCAAGGTAATTACTTCCTGATGGGCGGCTCGCCGGTAGATAACAACGCCAAGCTGTTCCG‑CGCCGGACAAATGAAAGTGTTAAAACCTT‑ACGTTGATT‑CCG‑GAAAAATTAAA‑GTCGTTGGTGACCAATG‑G‑GTTGa < 2:1614804/237‑1 (MQ=255)
cGACCGTATGATTAACGATGCGGATATCGATTTTTATATTTCTTTCGATAACGAAAAAGTCGGTGAACTGCAGGCAAAAGCCCTGGTCGATATTGTTCCGCAAGGTAATTACTTCCTGATGGGCGGCTCGCCGGTAGATAACAACGCCAAGCTGTTCCG‑CGCCGGACAAATGAAAGTGTTAAAACCTT‑ACGTTGATT‑CCG‑GAAAAATTAAA‑GTCGTTGGTGACCAATG‑G‑GTTGATg > 1:1633001/1‑236 (MQ=255)
cGACCGTATGATTAACGATGCGGATATCGATTTTTATATTTCTTTCGATAACGAAAAAGTCGGTGAACTGCAGGCAAAAGCCCTGGTCGATATTGTTCCGCAAGGTAATTACTTCCTGATGGGCGGCTCGCCGGTAGATAACAACGCCAAGCTGTTCCG‑CGCCGGACAAATGAAAGTGTTAAAACCTT‑ACGTTGATT‑CCG‑GAAAAATTAAA‑GTCGTTGGTGACCAATG‑G‑GTTGATg > 2:964491/1‑236 (MQ=255)
cGACCGTATGATTAACGATGCGGATATCGATTTTTATATTTCTTTCGATAACGAAAAAGTCGGTGAACTGCAGGCAAAAGCCCTGGTCGATATTGTTCCGCAAGGTAATTACTTCCTGATGGGCGGCTCGCCGGTAGATAACAACGCCAAGCTGTTCCG‑CGCCGGACAAATGAAAGTGTTAAAACCTT‑ACGTTGATT‑CCG‑GAAAAATTAAA‑GTCGTTGGTGACCAATG‑G‑GTTGATg > 1:1371905/1‑236 (MQ=255)
cGACCGTATGATTAACGATGCGGATATCGATTTTTATATTTCTTTCGATAACGAAAAAGTCGGTGAACTGCAGGCAAAAGCCCTGGTCGATATTGTTCCGCAAGGTAATTACTTCCTGATGGGCGGCTCGCCGGTAGATAACAACGCCAAGCTGTTCCG‑CGCCGGACAAATGAAAGTGTTAAAACCTT‑ACGTTGATT‑CCG‑GAAAAATTAAA‑GTCGTTGGTGACCAATG‑G‑GTTGATg > 2:1505364/1‑236 (MQ=255)
gACCGTATGATTAACGATGCGGATATCGATTTTTATATTTCTTTCGATAACGAAAAAGTCGGTGAACTGCAGGCCAAAGCATTGGTCGATATTGTTCAGCAAGGTAATTCCTTCCTGATGGGCGGCTCGCCGGTAGATACCAAAGCCAAGCTGTTCCG‑CGCCGGACAAATGAAAGTGTTAAACACTT‑ACGTTGATT‑CCG‑GAAAAATTAAT‑GTCGTTGGTCACCACTG‑T‑GTTGATGGCTg > 1:923546/1‑239 (MQ=255)
ccGTATGATTAACGATGCGGATATCGATTGTTATATTTCTTTCGATAACGAAAAAGACGGTGAACTGCAGGCAAAAGCCCTGGTCGATATTGTTCCGCAAGGTAATTACTTCCTGATGGGCGGCTCGCCGGTAGATAACAACGCCAAGCTGTTCCG‑CGCAGGACAAATGAAAGTGTTAAAACCTT‑ACGTTGATT‑CCG‑GAAAAATTAAA‑GTCGTTGGTGACCAATG‑G‑GTTGATGGCTGGt < 2:398398/239‑1 (MQ=255)
ccGTATGAATAACGATGCGGATATCGATTTTTATATTTCTTTCGATAACGAAAAAGTCGGTGAACTGCAGGCAAAAGCCCTGGTCGATATTGTTCCGCAAGGTAATTACTTCCTGATGGGCGGCTCGCCGGTAGATAACAACGCCAAGCTGTTCCG‑CGCCGGACAAATGAAAGTGTTAAAACCTT‑ACGTTGATT‑CCG‑GAAAAATTAAA‑GTCGTTGGTGACCAATG‑G‑GTTGATGGCTgg < 1:512834/238‑1 (MQ=255)
tATGATTAACGATGCGGATATCGATTTTTATATTTCTTTCGATAACGTAATAGTCGGAGAACTGCAGGCAAAAGCCCTGGTCGATATTGATCCGCAAGGTAATTACTTCCTGATGGGCGGCTCGCCGGTAGATAACAACGCCAAGCTGTTCCT‑CGCCGGACAAATGAAAGTGTTAAAACCTT‑ACGTTGATT‑CCG‑GAAAAATTAAA‑GTCGTTGGTGACCAATG‑G‑GTTGATGGCTGGTTa > 1:263616/1‑238 (MQ=255)
tATGATTAACGATGCGGATATCGATTTTTATATTTCTTTCGATAACGAAAAAGTCGGTGAACTGCAGGCAAAAGCCCTGGTCGATATTGTTCCGCAAGGTAATTACTTCCTGATGGGCGGCTCGCCGGTAGATAACAACGCCAAGCTGTTCCG‑CGCCGGACAAATGAAAGTGTTAAAACCTT‑ACGTTGATT‑CCG‑GAAAAATTAAA‑GTCGTTGGTGACCAATG‑G‑GTTGATGGCTGGTTa > 1:1619096/1‑238 (MQ=255)
tATGATTAACGATGCGGATATCGATTTTTATATTTCTTTCGATAACGAAAAAGTCGGTGAACTGCAGGCAAAAGCCCTGGTCGATATTGTTCCGCAAGGTAATTACTTCCTGATGGGCGGCTCGCCGGTAGATAACAACGCCAAGCTGTTCCG‑CGCCGGACAAATGAAAGTGTTAAAACCTT‑ACGTTGATT‑CCG‑GAAAAATTAAA‑GTCGTTGGTGACCAATG‑G‑GTTGATGGCTGGTTa > 2:790642/1‑238 (MQ=255)
tATGATTAACGATGCGGATATCGATTTTTATATTTCTTTCGATAACGAAAAAGTCGGTGAACTGCAGGCAAAAGCCCTGGTCGATATTGTTCCGCAAGGTAATTACTTCCTGATGGGCGGCTCGCCGGTAGATAACAACGCCAAGCTGTTCCG‑CGCCGGACAAATGAAAGTGTTAAAACCTT‑ACGTTGATT‑CCG‑GAAAAATTAAA‑GTCGTTGGTGACCAATG‑G‑GTTGATGGCTGGTTa > 1:685761/1‑238 (MQ=255)
tATGATTAACGATGCGGATATCGATTTTTATATTTCTTTCGATAACGAAAAAGTCGGTGAACTGCAGGCAAAAGCCCTGGTCGATATTGTTCCGCAAGGTAATTACTTCCTGATGGGCGGCTCGCCGGTAGATAACAACGCCAAGCTGTTCCG‑CGCCGGACAAATGAAAGTGTTAAAACCTT‑ACGTTGACT‑CCG‑GCAAAATTAAA‑GTCGTTGGTGACCAATG‑G‑GTTGATGGCTGGTTa > 2:1399535/1‑238 (MQ=255)
aaCGATGCGGATATCGATTTTTATATTTCTTTCGATAACGAAAAAGTCGGTGAACTGCAGGCAAAAGCCCTGGTCGATATTGTTCCGCAAGGTAATTACTTCCTGATGGGCGGCTCGCCGGTAGATAACAACGCCAAGCTGTTCCG‑CGCCGGACAAATGAAAGTGTTAAAACCTT‑ACGTTGATT‑CCG‑GAAAAATTAAA‑GTCGTTGGTGACCAATG‑G‑GTTGATGGCTGGTTACCGGaaaa < 2:997881/239‑1 (MQ=255)
aaCGATGCGGATATCGATTTTTATATTTCTTTCGATAACGAAAAAGTCGGTGAACTGCAGGCAAAAGCCCTGGTCGATATTGTTCCGCAAGGTAATTACTTCCTGATGGGCGGCTCGCCGGTAGATAACAACGCCAAGCTGTTCCG‑CGCCGGACAAATGAAAGTGTTAAAACCTT‑ACGTTGATT‑CCG‑GAAAAATTAAA‑GTCGTTGGTGACCAATG‑G‑GTTGATGGCTGGTTACCGGaaa > 1:811658/1‑238 (MQ=255)
cGATGCGGATATCGTTTTTTATATTTCTTTCGATAACGAAAAAGTCGGTGAACTGCAGGCAAAAGCCCTGGTCGATATTGTTCCGCAAGGTAATTACTTCCTGATGGGCGGCTCGCCGGTAGATAACAACGCCAAGCTGTTCCG‑CGCCGGACAAATGAAAGTGTTAAAACCTT‑ACGTTGATT‑CCG‑GAAAAATTAAA‑GTCGTGGGTGACCTATG‑G‑GTTGATAGCTGGTTACCGGAATA‑c > 1:256477/1‑238 (MQ=255)
cGATGCGGATATCGATTTTTATATTTCTTTCGATAACGAAAAAGTCGGTGAACTGCAGGCAAAAGCCCTGGTCGATATTGTTCCGCAAGGTAATTACTTCCTGATGGGCGGCTCGCCGGTAGATAACAACGCCAAGCTGTTCCG‑CGCCGGACAAATGAAAGTGTTAAAACCTT‑ACGTTGATT‑CCG‑GAAAAATTAAA‑GTCGTTGGTGACCAATG‑G‑GTTGATGGCTGGTTACCGGAAAA‑c > 2:211241/1‑238 (MQ=255)
aTGCGGATATCGATTTTTATATTTCTTTCGATAACGAAAAAGTAGGTGAACTGCAGGCAAAAGCCCTGGTCGATATTGTTCCGCAAGGTAATTACTTCCTGATGGGCGGCTCGCCGGTAGATAACAACGCCAAGCTGTTCCG‑CGCCGGACAAATGAAAGTGTTAAAACCTT‑ACGTTGATT‑CCG‑GAAAAATTCAA‑GTCGTTGGTGACCAATG‑G‑GTTGATGGCTGGTTACCGGAAAA‑CGCa > 1:1245112/1‑239 (MQ=255)
tGCGGATATCGATTTTTATATTTCTTTCGATAACGAAAAAGTCGGTGAACTGCAGGCAAAAGCCCTGGTCGATATTGTTCCGCAAGGTAATTACTTCCTGATGGGCGGCTCGCCGGTAGATAACAACGCCAAGCTGTTCCG‑CGCCGGACAAATGAAAGTGTTAAAACCTT‑ACGTTGATT‑CCG‑GAAAAATTAAA‑GTCGTTGGTGACCAATG‑G‑GTTGATGGCTGGTTACCGGAAAA‑CGCA‑t > 2:1262142/1‑239 (MQ=255)
cGGATATCGATTTTTATATTTCTTTCGATAACGAAAAAGTCGGTGAACTGCAGGCAAAAGCCCTGGTCGATATTGTTCCGCAAGGTAATTACTTCCTGATGGGCGGCTCGCCGGTAGATAACAACGCCAAGCTGTTCCG‑CGCCGGACAAATGAAAGTGTTAAAACCTT‑ACGTTGATT‑CCG‑GAAAAATTAAA‑GTCGTTGGTGACCAATG‑G‑GTTGATGGCTGGTTACCGGAAAA‑CGCA‑TTg > 2:1551190/1‑239 (MQ=255)
cGGATATCGATTTTTATATTTCTTTCGATAACGAAAAAGTCGGTGAACTGCAGGCAAAAGCCCTGGTCGATATTGTTCCGCAAGGTAATTACTTCCTGATGGGCGGCTCGCCGGTAGATAACAACGCCAAGCTGTTCCG‑CGCCGGACAAATGAAAGTGTTAAAACCTT‑ACGTTGATT‑CCG‑GAAAAATTAAA‑GTCGTTGGTGACCAATG‑G‑GTTGATGGCTGGTTACCGGAAAA‑CGCA‑TTg > 2:1224766/1‑239 (MQ=255)
cGGATATCGATTTTTATATTTCTTTCGATAACGAAAAAGTCGGTGAACTGCAGGCAAAAGCCCTGGTCGATATTGTTCCGCAAGGTAATTACTTCCTGATGGGCGGCTCGCCGGTAGATAACAACGCCAAGCTGTTCCG‑CGCCGGACAAATGAAAGTGTTAAAACCTT‑ACGTTGATT‑CCG‑GAAAAATTAAA‑GTCGTTGGTGACCAATG‑G‑GTTGATGGCCGGTTACCGGAAAA‑CGCA‑TTg > 1:143806/1‑239 (MQ=255)
ggATATCGATTTTTATATTTCTTTCGATAACGAAAAAGTCGGTGAACTGCAGGCAAAAGCCCTGGTCGATATTGTTCCGCAAGGTAATTACTTCCTGATGGGCGGCTCGCCGGTAGATAACAACGCCAAGCTGTTCCG‑CGCCGGACAAATGAAAGTGTTAAAACCTT‑ACGTTGATT‑CCG‑GAAAAATTAAA‑GTCGTTGGTGACCAATG‑G‑GTTGATGGCTGGTTACCGGAAAA‑CGCA‑TTGa < 2:1617940/239‑1 (MQ=255)
ggATATCGATTTTTATATTTCTTTCGATAACGAAAAAGTCGGTGAACTGCAGGCAAAAGCCCTGGTCGATATTGTTCCGCAAGGTAATTACTTCCTGATGGGCGGCTCGCCGGTAGATAACAACGCCAAGCTGTTCCG‑CGCCGGACAAATGAAAGTGTTAAAACCTT‑ACGTTGATT‑CCG‑GAAAAATTAAA‑GTCGTTGGTGACCAATG‑G‑GTTGATGGCTGGTTACCGGAAAA‑CGCA‑TTGa < 2:693983/239‑1 (MQ=255)
tttATATTTCTTTCGATAACGAAAAAGTCGGTGAACTGCAGGCAAAAGCCCTGGTCGATATTGTTCCGCAAGGTAATTACTTCCTGATGGGCGGCTCGCCGGTAGATAACAACGCCAAGCTGTTCCG‑CGCCGGACAAATGAAAGTGTTAAAACCTT‑ACGTTGATT‑CCG‑GAAAAATTAAA‑GTCGTTGGTGACCAATG‑G‑GTTGATGGCTGGTTACCGGAAAA‑CGCA‑TTGAAAATTATGGaa < 1:964491/239‑1 (MQ=255)
ttATATTTCTTTCGATAACGAAAAAGTCGGTGAACTGCAGGCAAAAGCCCTGGCCGATATTGTTCCGCAAGGTAATTACTTCCTGATGGGCGGCTCGCCGGTAGATAACAACGCCAAGCTGTTCCG‑CGCCGGACAAATGAACGTGTTAAAACCTT‑ACGTTGCTT‑CCG‑GAAAAATTAAA‑GTCGTTGGTGACCAATG‑G‑GTTGATGGCTGGTTACCGGAAAA‑CGCA‑TTGAACATTATGGaca > 1:463652/1‑237 (MQ=255)
tatTTCTTTCGATAACGAAAAAGTCGGTGAACTGCAGGCAAAAGCCCTGGTCGATATTGTACCGCAAGGTAATTACTTCCTGATGGGCGGCTCGCCGGTAGATAACAACGCCAAGCTGTTCCG‑CGCCGGACAAATGAAAGTGTTAAAACCTT‑ACGTTGATT‑CCG‑GAAAAATTAAA‑GTCGTTGGTGACCAATG‑G‑GTTGATGGCTGGTTACCGGAAAA‑CGCA‑TTGAAAATTATGGAAAAc > 2:601544/1‑238 (MQ=255)
ctttcGATAACGAAAAAGTCGGTGAACTGCAGGCAAAAGCCCTGGTCGATATTGTTCCGCAAGGTAATTACTTCCTGATGGGCGGCTCGCCGGTAGATAACAACGCCAAGCTGTTCCG‑CGCCGGACAAATGAAAGTGTTAAAACCTT‑ACGTTGATT‑CCG‑GAAAAATTAAA‑GTCGTTGGTGACCAATG‑G‑GTTGATGGCTGGTTACCGGAAAA‑CGCA‑TTGAAAATTATGGAAAAC‑GCGCTa > 2:1575985/1‑239 (MQ=255)
cGAAAAAGTCGGTGAACTGCAGGCAAAAGCCCTGGTCGATATTGTTCCGCAAGGTAATTACTTCCTGATGGGCGGCTCGCCGGTAGATAACAACGCCAAGCTGTTCCG‑CGCCGGACAAATGAAAGTGTTAAAACCTT‑ACGTTGATT‑CCG‑GAAAAATTAAA‑GTCGTTGGTGACCAATG‑G‑GTTGATGGCTGGTTACCGGAAAA‑CGCA‑TTGAAAATTATGGAAAAA‑GAGCTAACCGACaata > 1:39299/1‑239 (MQ=255)
aaaGTCGGTGAACTGCAGGAAAAAGCCCGGGTCGATATTGTTCCGCAAGGAAATTACTTCCTGATGGGCGGCTCGCCGGTAGAAAACAACGCCAAGCTGTCCCG‑CGCCGGAAAAATGAAAGTGTAAAAACCTT‑ACGTTGATC‑CCG‑AAAAAATTAAA‑GTCGTTGGGGACCAATG‑G‑GTTGAGGGCTGGTTCCCGAAAAA‑CGCA‑TTAAAAATTATGAAAAAC‑GCGCTAACCGCCAAtaataa < 2:630991/239‑1 (MQ=255)
cAAAGGCCCGGGTCGATATTGTCCCGCAAGTTAATTACTTCTGGAGGGGCGGCCCGCCGTAAAAAAACACCGCCAAGCTGTCCCG‑CGCCGGAAAAATGAAAGTGTAAAAACCTT‑AGGTTGATT‑CCG‑AAAAAATAAAA‑GTCGTTGGTGACCAAGG‑G‑GTTGATGGCTGGTTACCGAAAAA‑CGCA‑TTGAAAATTATGGAAACC‑GCGCTAACCGCCAATAATAACAAAATTGATGCTGTAGt < 1:86523/238‑1 (MQ=255)
tGGTCGATATTGTTCCGCAAGGTAATTACTTCCTGATGGGCGGCTCGCCGGTAGATAACAACGCCAAGCTGTTCCG‑CGCCGGACAAATGAAAGTGTTAAAACCTT‑ACGTTGATT‑CCG‑GAAAAATTAAA‑GTCGTTGGTGACCAATG‑G‑GTTGATGGCTGGTTACCGGAAAA‑CGCA‑TTGAAAATTATGGAAAAC‑GCGCTAACCGCCAATAATAACAAAATTGATGCTGTAGTTGCCTCAAAc > 1:1229211/1‑239 (MQ=255)
cGATATTGTTCCGCAAGGTAATTACTTCCTGAGGGGCGGCTCGCCGGTAGATAACAACGCAAAGCTGTTCCG‑CGCCGGAAAAATGAAAGTGTTAAAACCTT‑ACGTTGATT‑CCG‑AAAAAATTAAA‑GTCGTTGGTGACCAAGG‑G‑GTTGATGGCTGGTTACCGAAAAA‑CGCA‑TTGAAAATTATGGAAAAC‑GCGCTAACCGCCAATAATAACAAAATTGATGCTGTAGTTGCCTCAAACGATg < 2:1117709/239‑1 (MQ=255)
ccGCAAGGTAATTACTTCCGGATGGGCGGCTCGCCGGTAGATAACACCGCAAAGCTGTCCCG‑CGCCGGAAAAATGAAAGTTTTAAACCCTT‑ACGTTGATT‑CCG‑GAAAAATTAAA‑GTCGTGGGTGACCAATG‑G‑GTTGAGGGCTGGTTACCGGAAAA‑CGCA‑TTGAAAATTATGGAAAAC‑GCGCTAACCGCCAATAATAACAAAATTGATGCTGTAGTTGCCTCAAACGATGCCACCGCAgg < 2:1335826/239‑1 (MQ=255)
ccGAAAGGTAATTACTTCCTGATGGGCGGCTCGCCGGTAGATAACAACGCCAAGCTTTTCCG‑CGCCGGACAAAAGAAAGTGTTAAAACCTT‑ACGTTGATT‑CCG‑AAAAAATTAAA‑GTCGTTGGTGACCAATG‑G‑GTTGATGGCTGGTTACCGAAAAA‑CGCA‑TTGAAAATTATGGAAACC‑GCGCTAACCGCCAATAATAACAAAATTGATGCTGTAGTTGCCTCAAACGATGCCACCGCAgg < 2:22459/239‑1 (MQ=255)
cAAGGTAATTACTTCCTGATGGGCGGCTCGCCGGTAGATAACAACGCCAAGCTGTTCCG‑CGCCGGACAAATGAAAGTGTTAAAACCTT‑ACGTTGATT‑CCG‑GAAAAATTAAA‑GTCGTTGGTGACCAATG‑G‑GTTGATGGCTGGTTACCGGAAAA‑CGCA‑TTGAAAATTATGGAAAAC‑GCGCTAACCGCCAATAATAACAAAATTGATGCTGTAGTTGCCTCAAACGATGCCACCGCAGGTgg > 1:783093/1‑239 (MQ=255)
cAAGGTAATTACTTCCTGATGGGCGGCTCGCCGGTAGATAACAACGCCAAGCTGTTCCG‑CGCCGGACAAATGAAAGTGTTAAAACCTT‑ACGTTGATT‑CCG‑GAAAAATTAAA‑GTCGTTGGTGACCAATG‑G‑GTTGATGGCTGGTTACCGGAAAA‑CGCA‑TTGAAAATTATGGAAAAC‑GCGCTAACCGCCAATAATAACAAAATTGATGCTGTAGTTGCCTCAAACGATGCCACCGCAGGTgg > 1:1355514/1‑239 (MQ=255)
cAAGGTAATTACTTCCTGATGGGCGGCTCGCCGGTAGATAACAACGCCAAGCTGTTCCG‑CGCCGGACAAATGAAAGTGTTAAAACCTT‑ACGTTGATT‑CCG‑GAAAAATTAAA‑GTCGTTGGTGACCAATG‑G‑GTTGATGGCTGGTTACCGGAAAA‑CGCA‑TTGAAAATTATGGAAAAC‑GCGCTAACCGCCAATAATAACAAAATTGATGCTGTAGTTGCCTCAAACGATGCCACCGCAGGTgg > 2:343727/1‑239 (MQ=255)
cAAGGTAATTACTTCCTGATGGGCGGCTCGCCGGTAGATAACAACGCCAAGCTGTTCCG‑CGCCGGACAAATGAAAGTGTTAAAACCTT‑ACGTTGATT‑CCG‑GAAAAATTAAA‑GTCGTTGGTGACCAATG‑G‑GTTGATGGCTGGTTACCGGAAAA‑CGCA‑TTGAAAATTATGGAAAAC‑GCGCTAACCGCCAATAATAACAAAATTGATGCTGTAGTTGCCTCAAACGATGCCACCGCAGGTgg > 2:23966/1‑239 (MQ=255)
cAAGGTAATTACTTCCTGATGGGCGGCTCGCCGGTAGATAACAACGCCAAGCTGTTCCG‑CGCCGGACAAATGAAAGTGTTAAAACCTT‑ACGTTGATT‑CCG‑GAAAAATTAAA‑GTCGTTGGTGACCAATG‑G‑GTTGATGGCTGGTTACCGGAAAA‑CGCA‑TTGAAAATTATGGAAAAC‑GCGCTAACCGCCAATAATAACAAAATTGATGCTGTAGTTGCCTCAAACGATGCCACCGCAGGTgg > 2:892067/1‑239 (MQ=255)
cAAGGTAATTACTTCCTGATGGGCGGCTCGCCGGTAGATAACAACGCCAAGCTGTTCCG‑CGCCGGACAAATGAAAGTGTTAAAACCTT‑ACGTTGATT‑CCG‑GAAAAATTAAA‑GTCGTTGGTGACCAATG‑G‑GTTGATGGCTGGTTACCGGAAAA‑CGCA‑TTGAAAATTATGGAAAAC‑GCGCTAACCGCCAATAATAACAAAATTGATGCTGTAGTTGCCTCAAACGATGCCACCGCAGGTgg > 2:1313662/1‑239 (MQ=255)
cAAGGTAATTACTTCCTGATGGGCGGCTCGCCGGTAGATAACAACGCCAAGCTGTTCCG‑CGCCGGACAAATGAAAGTGTTAAAACCTT‑ACGTTGATT‑CCG‑GAAAAATTAAA‑GTCGTTGGTGACCAATG‑G‑GTTGATGGCTGGTTACCGGAAAA‑CGCA‑TTGAAAATTATGGAAAAC‑GCGCTAACCGCCAATAATAACAAAATTGATGCTGTAGTTGCCTCAAACGATGCCACCGCAGGCgg > 2:460013/1‑239 (MQ=255)
cAAGGTAATTACTTCCTGATGGGCGGCTCGCCGGTAGATAACAACGCCAAGCTGTTCCG‑CGCCGGACAAATGAAAGTGTTAAAACCTT‑ACGTTGATT‑CCG‑GAAAAATTAAA‑GTCGTTGGTGACCAATG‑G‑GTTGATGGCTGGTTACCGGAAAA‑CGCA‑TTGAAAATTATGGAAAAC‑GCGCTAACCGCCAATAATAACAAAATTGATGCTGTAGTTGACTCAAACGATGCCACCGCAGGTgg > 2:1001271/1‑239 (MQ=255)
aaGGTAATTACTCCCGGATGGGGGGCCCGCCGGTAAATAAAAAC‑CCAATGCGTTCCGCCGCCGAAAAAATAAAAGTTTAAAACCCTT‑CCGTTGATT‑CCG‑GAAAAATAAAA‑GTCGTTGGTGACCAAGG‑G‑GTTGAGGGCTGGTTACGGAAAAA‑CGCA‑TTGAAATTTATGGAAACC‑GCGCTAACCGCCAATAATAACAAAATTGATGCTGTAGTTGCCTCAAACGATGCCACCGCAGGTggg < 1:1199833/239‑1 (MQ=255)
tgtACTGCCTGAGGGTCGGCGCGCCGGTAGATAACAGCGCCAAGCTGTTCCG‑CGCGGGACAAATAAAAGTGTTAAACCCTT‑ACTTTTATT‑CCG‑AAAAAATTAAA‑GTCGTTGGTGCCAAAGG‑G‑TTTGATGGTGGTTTACCGAAAAA‑AGAA‑TTAAAAATTATGAAAACC‑GCGCTAACCGCCAATAATAACAAAATTGATGCTGTAGTTGCCTCAAACGATGCCACCGCAGGTGGGGCAAtt < 1:1193120/237‑1 (MQ=255)
atgaCTGCCTGATGCGCAGTCCGCCGGAACAAACCAACGCCAAGCTGTTCCG‑CGCCGGAAAAATGAAAGTGATAAAACCTT‑AC‑TTGTTTAACA‑AAAAAATTAAA‑GTCGTGGGTGACCAATG‑G‑TTGGATAGCTGTTTACCAAAAAA‑CGTA‑TTGAAAATTATGAAAACC‑GGGAAAACCGCCAATAATAACAAAATTGATGCTGTAGTTGCCTCAAACGATGCCACCGCAGGTGGGGCAAtt < 1:1001271/236‑1 (MQ=255)
ttACTTCCTGATGGGCGGCTCGCCGGTAGATAACAACGCCAAGCTGTTCCG‑CGCCGGACAAATGAAAGTGTTAAAACCTT‑ACGTTGATT‑CCG‑GAAAAATTAAA‑GTCGTTGGTGACCAATG‑G‑GTTGATGGCTGGTTACCGGAAAA‑CGCA‑TTGAAAATTATGGAAAAC‑GCGCTAACCGCCAATAATAACAAAATTGATGCTGTAGTTGCCTCAAACGATGCCACCGCAGGTGGGCGAATTc > 2:352499/1‑239 (MQ=255)
tACGTCCTGATGGGCGGTTCGCCGGTAGATAACAACGCCAAGCTGTTTCG‑CGCCGGACAAATGAAAGTGTTAAAACCTT‑ACTTTGATT‑CCG‑GAAAAATTAAA‑GTCGTTGGTGACAAATG‑G‑GTTGATGGCTGGTTACCGGTAAA‑CGCA‑TTGAAAATTATGGAAAAC‑GAGCTAACCGCCACTAATAACAAAATTGACGCGGTAGTTGACTCAAACGATGCCACCGCAGGTGGCGCAATTCa > 1:1685062/1‑239 (MQ=255)
tCCTGATGGGCGGCTCGCCGGTAGATAACAACGCCAAGCTGTTCCG‑CGCCGGACAAATGAAAGTGTTAAAACCTT‑ACGTTGATT‑CCG‑GAAAAATTAAA‑GTCGTTGGTGACCAATG‑G‑GTTGATGGCTGGTTACCGGAAAA‑CGCA‑TTGAAAATTATGGAAACC‑GCGCTAACCGCCAATAATAACAAAATTGATGCTGTAGTTGCCTCAAACGATGCCACCGCAGGTGGGGCAATTCAGGCa > 2:811080/1‑239 (MQ=255)
tCCTGATGGGCGGCTCGCCGGTAGATAACAACGCCAAGCTGTTCCG‑CGCCGGACAAATGAAAGTGTTAAAACCTT‑ACGTTGATT‑CCG‑GAAAAATTAAA‑GTCGTTGGTGACCAATG‑G‑GTTGATGGCTGGTTACCGGAAAA‑CGCA‑TTGAAAATTATGGAAAAC‑GCGCTAACCGCCAATAATAACAAAATTGATGCTGTAGTTGCCTCAAACGATGCCACCGCAGGTGGGGCAATTCAGGCa > 2:1070400/1‑239 (MQ=255)
ccTGATGGGCGGCTCGCCGGTAGATAACAACGCCAAGCTGTTCCG‑CGCCGGACAAATGAAAGTGTTAAAACCTT‑ACGTTGATT‑CCG‑GAAAAATTAAA‑GTCGTTGGTGACCAATG‑G‑GTTGa < 2:310270/120‑1 (MQ=255)
ccTGATGGGCGGCTCGCCGGTAGATAACAACGCCAAGCTGTTCCG‑CGCCGGACAAATGAAAGTGTTAAAACCTT‑ACGTTGATT‑CCG‑GAAAAATTAAA‑GTCGTTGGTGACCAATG‑G‑GTTGATGGCTGGTTACCGGAAAA‑CGCA‑TTGCAAATTATGGAAAAC‑GCGCTAACCGCCAATAATAACAAAATTGATGCTGTAGTTGCCTCAAACGATGCCCCCGCAGGTGGGGCAATTCAGGCAt > 2:1198922/1‑239 (MQ=255)
ccTGATGGGCGGCTCGCCGGTAGATAACAACGCCAAGCTGTTCCG‑CGCCGGACAAATGAAAGTGTTAAAACCTT‑ACGTTGATT‑CCG‑GAAAAATTAAA‑GTCGTTGGTGACCAATG‑G‑GTTGATGGCTGGTTACCGGAAAA‑CGCA‑TTGAAAATTATGGAAAAC‑GCGCTAACCGCCAATAATAACAAAATTGATGCTGTAGTTGCCTCAAACGATGCCACCGCAGGTGGGGCAATTCAGGCAt > 2:1328460/1‑239 (MQ=255)
ggccTCGCCGGGAGATAACAACACCAGGCTGTTCCG‑CGCCGGAAAAAGGAAAGTGTAAAACCGTT‑ACGTTGTTT‑CGG‑AAAAAATAAAA‑GTCGTTGGTGACAAATG‑G‑GGTGAGGGCTGTTTCCCGAAAAA‑CACA‑TTAAAAATTATGAAAAGC‑GCGCTAACCGCCAATAATAACAAAATTGATGCTGTAGTTGCCTCAAACGATGCCACCGCAGGTGGGGCAATTCAGGCATTAAgcgcg < 1:63893/235‑1 (MQ=255)
gcTCGCCGGGAGATAACAACGCCAAGCTTTTCCG‑CGCCGGAAAAATGAAAGTGTTAAAACTTG‑ACGTTTATT‑CCG‑AAAAAATTAAA‑GTCGTTGGTGACCAAGG‑G‑GTTGATGGCTGGTTACGGAAAAA‑CGCA‑TTAAAAATTATGGAAACC‑GCGCTAACCGCCAATAATAACAAAATTGATGCTGTAGTTGCCTCAAACGATGCCACCGCAGGTGGGGCAATTCAGGCATTAAGCGCGCa < 1:1262142/238‑1 (MQ=255)
aaTAACAACGCCAAGCTGTTCCG‑CGCCGGACAAATGAAAGTGTTAAAACCTT‑ACGTTGATT‑CCG‑AAAAAATTAAA‑GTCGTTGGTGACCAATG‑G‑GTGGAGGGCTGGTTACCGAAAAA‑CGCA‑TTGAAAATTATGGAAAAC‑GCGCTAACCGCCAATAATAACAAAATTGATGCTGTAGTTGCCTCAAACGATGCCACCGCAGGTGGGGCAATTCAGGCATTAAGCGCGCAAGGTTTATCAgg < 2:1371905/238‑1 (MQ=255)
aTAACAACGCCAAGCTGTTCCG‑CGCCGGACAAATGAAAGTGTTAAAACCTT‑ACGTTGATT‑CCG‑GAAAAATTAAA‑GTCGTTGGTGACCAATG‑G‑GTTGATGGCTGGTTACCGGAAAA‑CGCA‑TTGAAAATTATGGAAAAC‑GCGCTAACCGCCAATAATAACAAAATTGATGCTGTAGTTGCCTCAAACGATGCCACCGCAGGTGGGGCAATTCAGGCATTAAGCGCGCAAGGTTTATCAggg > 2:1064219/1‑239 (MQ=255)
taccaacGCAAAGTTGTCCCG‑AGCCGGAAAAATGAAAGTGTAAAAACCTT‑ACGTTGATT‑CCG‑AAAAAATTAAA‑GTCGTTGGTGACAAAGG‑G‑GTGGATGGCGGGTTACCGAAAAA‑CGCA‑TTAAAAATTATGAAAAAC‑GCGCAAACCGCCAATAATAACAAAATTGATGCTGTAGTTGCCTCAAACGATGCCACCGCAGGTGGGGCAATTCAGGCATTAAGCGCGCAAGGTTTATCAGGGa < 2:1166113/236‑1 (MQ=255)
tAACAACGCCAAGCTGTTCCG‑CGCCGGAAAAAGAAAAGTGTTAAAACCTT‑ACGTTGATC‑CCG‑AAAAAATTAAA‑GTCGTTGGTGACAAATG‑G‑GTTGATGGCTGGTTACCGAAAAA‑CGCA‑TTGAAAATTATGGAAAAC‑GCGCTAACCGCCAATAATAACAAAATTGATGCTGTAGTTGCCTCAAACGATGCCACCGCAGGTGGGGCAATTCAGGCATTAAGCGCGCAAGGTTTATCAGGGa < 2:728836/239‑1 (MQ=255)
tAACAACGCCAAGCTGTTCCG‑CGACGGACAAAGGAAAGTGTTAAAACCTT‑ACGTTGATT‑CCG‑GAAAAATAAAA‑GTCGTTGGTGACCAAGG‑G‑GTTGATGGCGGGTTACCGAAAAA‑CGAA‑TTAAAAATTAGGAAAAGC‑GCGCTAACCGCCAATAATAACAAAATTGATGCTGTAGTTGCCTCAAACGATGCCACCGCAGGTGGGGCAATTCAGGCATTAAGCGCGCAAGGTTTATCAgg < 2:143806/237‑1 (MQ=255)
gtgtaaaagaaacaggtcccG‑CGCCGAAAAAATGAAAGTGTAAAAACCTT‑ACGTTGATT‑CCG‑AAAAAATAAAA‑GTCGTTGGTGACAAATG‑G‑TTTGATGGCTGGTTCCCGAAAAA‑CGCA‑TTAAAAATTAGGGAAAAC‑GCGCTAACCGCCAATAATAACAAAATTGATGCTGTAGTTGCCTCAAACGATGCCACCGCAGGTGGGGCAATTCAGGCATTAAGCGCGCAAGGTTTATCAGGGa < 1:705594/221‑1 (MQ=255)
aaacaacGCAAAGCTGTCCCG‑CGCCGGAAAAATGAAAGTGTTAAACCCTT‑ACGTTGATT‑CCG‑AAAAAATTAAA‑GTCTTTGGTGACCAAGG‑G‑GTTGATGGCTGGTTACCGGAAAA‑CGCA‑TTAAAAATTATGGAAAAC‑GCGCTAACCGCCAATAATAACAAAATTGATGCTGTAGTTGCCTCAAACGATGCCACCGCAGGTGGGGCAATTCAGGCATTAAGCGCGCAAGGTTTATCAGGGa < 2:1631299/238‑1 (MQ=255)
ggcAAGCTGTTCCG‑CGCCGGAAAAATGAAAGTGTAAAAACCTT‑ACGTTGATT‑CCG‑AAAAAATTAAA‑GTCGTTGGTGACAAATG‑G‑GTTGATGGCTGTTTACCGGAAAA‑CGCA‑TTGAAAATTATGGAAAAC‑GCGCTAACCGCCAATAATAACAAAATTGATGCTGTAGTTGCCTCAAACGATGCCACCGCAGGTGGGGCAATTCAGGCATTAAGCGCGCAAGGTTTATCAGGGAAAGTAGc < 1:601544/237‑1 (MQ=255)
ccAAGCTGTTCCG‑CGCCGGACAAATGAAAGTGTTAAAACCTT‑ACGTTGATT‑CCG‑GAAAAATTAAA‑GTCGTTGGTGACCAATG‑G‑GTTGATGGCTGGTTACCGGAAAA‑CGCA‑TTGAAAATTATGGAAAAC‑GCGCTAACCGCCAATAATAACAAAATTGATGCTGTAGTTGCCTCAAACGATGCCACCGCAGGTGGGGCAATTCAGGCATTAAGCGCGCAAGGTTTATCAGGGAAAGTAGCa > 2:1120855/1‑239 (MQ=255)
cccG‑CGCCGAAAAAAGGAGAGTTTTAAAACTGT‑TAGTGAAGG‑CAG‑GAAAATTTAAA‑GTGGTGGGACAGTAATG‑G‑TTACATGGCTGGTTACAGAAAAA‑CTAA‑TTGAAAATTATGAAAAAC‑CCCCTATCCGCCAATAATAACAAAATTGATGCTGTAGTTGCCTCAAACGATGCCACCGCAGGTGGGGCAATTCAGGCATTAAGCGCGCAAGGTTTATCAGGGAAAGTAGCAATCTCCGGc < 1:159251/238‑1 (MQ=255)
aCAAAGTAAAGTGTTAAAACCTA‑CCGTGGATT‑CGA‑AAAAAATAAAA‑GTCGTGGGTG‑CCAAGGTG‑TTTGATGGTGGGTAACCGAAAAC‑CGAA‑TGAAAAATTGTGGAAGAC‑GCGCAAACCGCCAATAATAACAAAATTGATGCTGTAGTTGCCTCAAACGATGCCACCGCAGGTGGGGCAATTCAGGCATTAAGCGCGCAAGGTTTATCAGGGAAAGTAGCAATCTCCGGCCAGGATGCg < 1:460013/238‑1 (MQ=255)
aTGAAAGTGTTAAAACCTT‑ACGTTGATT‑CCG‑GAAAAATTAAA‑GTCGTTGGTGACCAATG‑G‑GTTGATGGCTGGTTACCGGAAAA‑CGCA‑TTGAAAATTATGGAAAAC‑GCGCTAACCGCCAATAATAACAAAATTGATGCTGTAGTTGCCTCAAACGATGCCACCGCAGGTGGGGCAATTCAGGCATTAAGCGCGCAAGGTTTATCAGGGAAAGTAGCAATCTCCGGCCAGGATGCGGAtc > 1:233843/1‑238 (MQ=255)
aaaagataaaaaCTTT‑GCTTTGTTT‑CCG‑GAAAAATCAAA‑TTTGTTGGTGAGAAAT‑‑G‑GTTGAAGGTTTTTTTCCCGAAAACCGCA‑TTG‑AAATTGAGGAAAACGGCGGCAACCGCCAATAATAACAAAATTGATGCTGTAGTTGCCTCAAACGATGCCACCGCAGGTGGGGCAATTCAGGCATTAAGCGCGCAAGGTTTATCAGGGAAAGTAGCAATCTCCGGCCAGGATGCGGATCTCg < 1:1399535/230‑1 (MQ=255)
aaaGTGTTAACACCTT‑ACG‑TGTGT‑CCGAGAAAAATTAAC‑GTCGTTGGTGCACAAGG‑GTGTTG‑TGGCGGGTTCCAGAAAAA‑CCAA‑TTAAAAATTAGGGAAAAC‑GCCATACCCGCCAATAATAACAAAATTGATGCTGTAGTTGCCTCAAACGATGCCACCGCAGGTGGGGCAATTCAGGCATTAAGCGCGCAAGGTTTATCAGGGAAAGTAGCAATCTCCGGCCAGGATGCGGATCTCGc < 1:55201/239‑1 (MQ=255)
aaaGTGTAAAACCCTT‑GCGTTGATT‑CCG‑AAAAAATTAAA‑GTGGTTGGTGACCAAGG‑G‑GTTGAGGGCGGGTTACCGAAAAA‑CGCA‑TTAAAAATTATGGAAAAC‑GCTCTAACCGCCAATAATAACAAAATTGATGCTGTAGTTGCCTCAAACGATGCCACCGCAGGTGGGGCAATTCAGGCATTAAGCGCGCAAGGTTTATCAGGGAAAGTAGCAATCTCCGGCCAGGATGCGGATCTCGc < 2:1245112/239‑1 (MQ=255)
aaGAGTTAAAGTCTTAACGTTAATA‑CGG‑AAAAAATGAAA‑GTTGTTGGTGACAAAGG‑G‑GTTTATGGTTGGTAGCCGAAAAA‑TGCA‑TTAAAAATTAGGGAAAAC‑GCTCTATCCGCCAATAATAACAAAATTGATGCTGTAGTTGCCTCAAACGATGCCACCGCAGGTGGGGCAATTCAGGCATTAAGCGCGCAAGGTTTATCAGGGAAAGTAGCAATCTCCGGCCAGGATGCGGATCTCGc < 2:923546/239‑1 (MQ=255)
aGTGTTAAAACCTT‑ACGTTGATT‑CCG‑GAAAAATTAAA‑GTCGTTGGTGACCAATG‑G‑GTTGATGGCTGGTTACCGGAAAA‑CGCA‑TTGAAAATTATGGAAAAC‑GCGCTAACCGCCAATAATAACAAAATTGATGCTGTAGTTGCCTCAAACGATGCCACCGCAGGTGGGGCAATTCAGGCATTAAGCGCGCAAGGTTTATCAGGGAAAGTAGCAATCTCCGGCCAGGATGCGGATCTCGCAg > 2:1584414/1‑239 (MQ=255)
ttAAAACCTT‑ACGTTGATT‑CCG‑GAAAAATTAAA‑GTCGTTGGTGACCAATG‑G‑GTTGATGGCTGGTTACCGGAAAA‑CGCA‑TTGAAAATTATGGAAAAC‑GCGCTAACCGCCAATAATAACAAAATTGATGCTGTAGTTGCCTCAAACGATGCCACCGCAGGTGGGGCAATTCAGGCATTAAGCGCGCAAGGTTTATCAGGGAAAGTAGCAATCTCCGGCCAGGATGCGGATCTCGCAGGTAt > 1:958093/1‑239 (MQ=255)
t‑ACGTTGATT‑CCG‑GAAAAATTAAA‑GTCGTTGGTGACCAATG‑G‑GTTGATGGCTGGTTACCGGAAAA‑CGCA‑TTGAAAATTATGGAAAAC‑GCGCTAACCGCCAATAATAACAAAATTGATGCTGTAGTTGCCTCAAACGATGCCACCGCAGGTGGGGCAATTCAGGCATTAAGCGCGCAAGGTTTATCAGGGAAAGTAGCAATCTCCGGCCAGGATGCGGATCTCGCAGGTATTAAACGTAt > 2:516223/1‑239 (MQ=255)
aTT‑CCG‑AAAAAATTAAA‑GGCGTGGGTGACCAAGG‑G‑GTTGATGGCTGGTTCCGGGAAAA‑CGCA‑TTGAAAATTAGGAAAAGC‑GCGCTAACCGCCAATAATAACAAAATTGATGCTGTAGTTGCCTCAAACGATGCCACCGCAGGTGGGGCAATTCAGGCATTAAGCGCGCAAGGTTTATCAGGGAAAGTAGCAATCTCCGGCCAGGATGCGGATCTCGCAGGTATTAAACGTATTGCTGcc < 2:1613225/239‑1 (MQ=255)
tt‑CCG‑GAAAAATTAAA‑GTCGTTGGTGACCAATG‑G‑GTTGATGGCTGGTTACCGGAAAA‑CGCA‑TTGAAAATTATGGAAAAC‑GCGCTAACCGCCAATAATAACAAAATTGATGCTGTAGTTGCCTCAAACGATGCCACCGCAGGTGGGGCAATTCAGGCATTAAGCGCGCAAGGTTTATCAGGGAAAGTAGCAATCTCCGGCCAGGATGCGGATCTCGCAGGTATTAAACGTATTGCTGCCg > 1:204840/1‑239 (MQ=255)
t‑CCG‑GAAAAATTAAA‑GTCGTTGGTGACCAATG‑G‑GTTGATGGCTGGTTACCGGAAAA‑CGCA‑TTGAAAATTATGGAAAAC‑GCGCTAACCGCCAATAATAACAAAATTGATGCTGTAGTTGCCTCAAACGATGCCACCGCAGGTGGGGCAATTCAGGCATTAAGCGCGCAAGGTTTATCAGGGAAAGTAGCAATCTCCGGCCAGGATGCGGATCTCGCAGGTATTAAACGTATTGCTGCCgg > 2:82245/1‑239 (MQ=255)
ttccaaaaaaaTAAAA‑GCGTTTGGTTACCATTG‑G‑TTTGTTGGCTGGTTACGGGAAAA‑CGCA‑TTGAAATTTATGAAAAAC‑GCCCTAACCGCCAATAATAACAAAATTGATGCTGTAGTTGCCTCAAACGATGCCACCGCAGGTGGGGCAATTCAGGCATTAAGCGCGCAAGGTTTATCAGGGAAAGTAGCAATCTCCGGCCAGGATGCGGATCTCGCAGGTATTAAACGTATTGCTGcc < 2:274208/232‑1 (MQ=255)
aaaaaTTAAA‑GTCGTGGGTGTCAAGTG‑G‑GTTGATGGCGGGTTACCGAAAAA‑CACA‑TTAAAAATTATGAAAAAC‑CCGCAAACCGCCAATAATAACAAAATTGATGCTGTAGTTGCCTCAAACGATGCCACCGCAGGTGGGGCAATTCAGGCATTAAGCGCGCAAGGTTTATCAGGGAAAGTAGCAATCTCCGGCCAGGATGCGGATCTCGCAGGTATTAAACGTATTGCTGCCGGTACg < 1:1313662/238‑1 (MQ=255)
aaaaaTAAAA‑GTCGGTGGTGACTAATG‑T‑TTTGGTGGTTGTTTACCGTAAAA‑GTCA‑TTTAAAATTAGGGAAAAC‑GCATCAACCGCCAATAATAACAAAATTGATGCTGTAGTTGCCTCAAACGATGCCGCCGCAGGTGGGGCAATTCAGGCATTAAGCGCGCAAGGTTTATCAGGGAAAGTAGCAATCTCCGGCCAGGATGCGGATCGCGCAGGTATTAAACGTATTGCTGCCGGTACg < 2:118115/238‑1 (MQ=255)
aaaaTTAAA‑GTTTTGGGGCACCAGTG‑G‑GTTGATGCGTGGATGCTGAAAAA‑CAAA‑TTGAAATTTAGGGAAACC‑CAGCAAACCGCCAATAATAACAAAATTGATGCTGTAGTTGCCTCAAACGATGCCACCGCAGGTGGGGCAATTCAGGCATTAAGCGCGCAAGGTTTATCAGGGAAAGTAGCAATCTCCGGCCAGGATGCGGATCTCGCAGGTATTAAACGTATTGCTGCCGGTACGCa < 1:1551190/239‑1 (MQ=255)
aaaaTAAAT‑GTGGTTGTGGA‑CAATG‑G‑GGTGACCGCGGGGTACCTGAAAA‑AGGATTTAAAAATTATGAAAACG‑GGGTTAACCGCCAATAATAACAAAATTGATGCTGTAGTTGCCTCAAACGATGCCACCGCAGGTGGGGCAATTCAGGCATTAAGCGCGCAAGGTTTATCAGGGAAAGTAGCAATCTCCGGCCAGGATGCGGATCTCGCAGGTATTAAACGTATTGCTGCCGGTACGCa < 1:1122098/239‑1 (MQ=255)
aaaaTAAAA‑GTTGTTGGTAACAAATG‑G‑GTTGATGGATGTTTACCGAAAAA‑CGCA‑TTGAAAATTATGAAAACC‑GCGCAAACCGCCAATAATAACAAAATTGATGCTGTAGTTGCCTCAAACGATGCCACCGCAGGTGGGGCAATTCAGGCATTAAGCGCGCAAGGTTTATCAGGGAAAGTAGCAATCTCCGGCCAGGATGCGGATCTCGCAGGTATTAAACGTATTGCTGCCGGTACGCa < 1:1443260/239‑1 (MQ=255)
aaaTTAAAGGTCGTGGGTGCCAAATG‑G‑GTTGATGGCGGGTTACCGAAAAA‑CCAC‑TTAAAAATAAGGAAAAAC‑GTGCAAACCGCCAATAATAACAAAATTGATGCTGTAGTTGCCTCAAACGATGCCACCGCAGGTGGGGCAATTCAGGCATTAAGCGCGCAAGGTTTATCAGGGAAAGTAGCAATCTCCGGCCAGGATGCGGATCTCGCAGGTATTAAACGTATTGCTGCCGGTACGCa < 1:1450202/239‑1 (MQ=255)
tCGTTGGTGAACAGTG‑G‑GTTGATGGCTGTTTACGAGAAAA‑CGCT‑TTGAAAATAAAGGAAAAC‑GCGATAACCGCCAATAATAACAAAATTGATGCTGTAGTTGCCTCAAACGATGCCACCGCAGGTGGGGCAATTCAGGCATTAAGCGCGCAAGGTTTATCAGGGAAAGTAGCAATCTCCGGCCAGGATGCGGATCTCGCAGGTATTAAACGTATTGCTGCCGGTACGCAAACTATGACg < 2:1685062/239‑1 (MQ=255)
tggtGGTGACAAATG‑G‑GTTGAGGGATGTTTACCGAAAAA‑CTCA‑TTGAAAATTATGAAAAAC‑CCCCTAACCGCCAATAATAACAAAATTGATGCTGTAGTTGCCTCAAACGATGCCACCGCAGGTGGGGCAATTCAGGCATTAAGCGCGCAAGGTTTATCAGGGAAAGTAGCAATCTCCGGCCAGGATGCGGATCTCGCAGGTATTAAACGTATTGCTGCCGGTACGCAAACTATGACg < 1:1703440/235‑1 (MQ=255)
cgtgtgttaCCAAGG‑G‑GTTAATGGCAGGTCACCAAAAAA‑AGCA‑TAGAAAATTATGGAAACC‑GCTATAACCGCCAATAATAACAAAATTGATGCTGTAGTTGCCTCAAACGATGCCACCGCAGGTGGGGCAATTCAGGCATTAAGCGCGCAAGGTTTATCAGGGAAAGTAGCAATCTCCGGCCAGGATGCGGATCTCGCAGGTATTAAACGTATTGCTGCCGGTACGCAAACTATGACg < 1:1578234/230‑1 (MQ=255)
cgtggggaaCCATTG‑G‑TTGGATGGATGGTCACCGAAAAA‑CGCA‑TGAAAAAGTATGGAAACC‑GCGCAAACCGCCAATAATAACAAAATTGATGCTGTAGTTGCCTCAAACGATGCCACCGCAGGTGGGGCAATTCAGGCATTAAGCGCGCAAGGTTTATCAGGGAAAGTAGCAATCTCCGGCCAGGATGCGGATCTCGCAGGTATTAAACGTATTGCTGCCGGTACGCAAACTATGACg < 1:590241/230‑1 (MQ=255)
cGTTGGTGACCAAGG‑G‑GTTGAGGGCTGGTTACCGAAAAA‑CGAA‑TTAAAAATTATGGAAAAC‑GCGCAACCCGCCAATAATAACAAAATTGATGCTGTAGTTGCCTCAAACGATGCCACCGCAGGTGGGGCAATTCAGGCATTAAGCGCGCAAGGTTTATCAGGGAAAGTAGCAATCTCCGGCCAGGATGCGGATCTCGCAGGTATTAAACGTATTGCTGCCGGTACGCAAACTATGACg < 1:1120855/238‑1 (MQ=255)
cGTTGGTGACAAAGG‑G‑GTTGATGGCTGTTTCCCGAAAAA‑CGAA‑TTAAAAATTATGAAAACC‑GCGCTAACCGCCAATAATAACAAAATTGATGCTGTAGTTGCCTCAAACGATGCCACCGCAGGTGGGGCAATTCAGGCATTAAGCGCGCAAGGTTTATCAGGGAAAGTAGCAATCTCCGGCCAGGATGCGGATCTCGCAGGTATTAAACGTATTGCTGCCGGTACGCAAACTATGAc < 2:1558122/237‑1 (MQ=255)
cGTGGGTGACCAAGG‑G‑GTTGATGGTTGGTTACCGAAAAA‑CACA‑TTGAAATTTATGGAAAAC‑GCGCTAACCGCCAATAATAACAAAATTGATGCTGTAGTTGCCTCAAACGATGCCACCGCAGGTGGGGCAATTCAGGCATTAAGCGCGCAAGGTTTATCAGGGAAAGTAGCAATCTCCGGCCAGGATGCGGATCTCGCAGGTATTAAACGTATTGCTGCCGGTACGCAAACTATGACg < 1:1505364/238‑1 (MQ=255)
gttgggtgccAAGG‑G‑GTTTAGGGGTGGTTTCAGGAAAACCGAA‑TTAAAAATTAGGAAAACC‑GCACAAACCGCCAATAATAACAAAATTGATGCTGTAGTTGCCTCAAACGATGCCACCGCAGGTGGGGCAATTCAGGCATTAAGCGCGCAAGGTTTATCAGGGAAAGTAGCAATCTCCGGCCAGGATGCGGATCTCGCAGGTATTAAACGTATTGCTGCCGGTACGCAAACTATGACg < 1:343727/230‑1 (MQ=255)
agACCAAGG‑G‑TTTGCTGGCTGGTTACGGGAAAA‑CGCA‑TTGAAAATTATGGAAAAC‑GCGCTAACCGCCAATAATAACAAAATTGATGCTGTAGTTGCCTCAAACGATGCCACCGCAGGTGGGGCAATTCAGGCATTAAGCGCGCAAGGTTTATCAGGGAAAGTAGCAATCTCCGGCCAGGATGCGGATCTCGCAGGTATTAAACGTATTGCTGCCGGTACGCAAACTATGACGGTGtat < 2:1442405/237‑1 (MQ=255)
gACAAATG‑G‑GTTGATGGCTGGTTACGAGAAAA‑CGCA‑TTAAAAATTAGGGAAAAC‑GCGCTAACCGCCAATAATAACAAAATTGATGCTGTAGTTGCCTCAAACGATGCCACCGCAGGTGGGGCAATTCAGGCATTAAGCGCGCAAGGTTTATCAGGGAAAGTAGCAATCTCCGGCCAGGATGCGGATCTCGCAGGTATTAAACGTATTGCTGCCGGTACGCAAACTATGACGGTGtata < 1:1064219/238‑1 (MQ=255)
|
TAAAGTATTAGCTTACGACCGTATGATTAACGATGCGGATATCGATTTTTATATTTCTTTCGATAACGAAAAAGTCGGTGAACTGCAGGCAAAAGCCCTGGTCGATATTGTTCCGCAAGGTAATTACTTCCTGATGGGCGGCTCGCCGGTAGATAACAACGCCAAGCTGTTCCG‑CGCCGGACAAATGAAAGTGTTAAAACCTT‑ACGTTGATT‑CCG‑GAAAAATTAAA‑GTCGTTGGTGACCAATG‑G‑GTTGATGGCTGGTTACCGGAAAA‑CGCA‑TTGAAAATTATGGAAAAC‑GCGCTAACCGCCAATAATAACAAAATTGATGCTGTAGTTGCCTCAAACGATGCCACCGCAGGTGGGGCAATTCAGGCATTAAGCGCGCAAGGTTTATCAGGGAAAGTAGCAATCTCCGGCCAGGATGCGGATCTCGCAGGTATTAAACGTATTGCTGCCGGTACGCAAACTATGACGGTGTATA > NC_000913/3731450‑3731922
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 13 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
N/A
