Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A6 F27 I0 R1
|
120 |
139.6 |
2835800 |
98.5% |
2793263 |
226.7 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
freq |
annotation |
gene |
description |
| RA |
NC_000913 |
3,745,034 |
A→T |
16.1% |
I78F (ATT→TTT) |
yiaN → |
2,3‑diketo‑L‑gulonate TRAP transporter large permease protein |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | NC_000913 | 3,745,034 | 0 | A | T | 16.1%
| 215.3
/ 10.8
| 124 | I78F (ATT→TTT) | yiaN | 2,3‑diketo‑L‑gulonate TRAP transporter large permease protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (37/51); new base T (3/16); total (54/70) |
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 3.76e-02 |
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
Only 100 of 125 total aligned reads displayed.
TTAATCATGGCTGTGCTGATTTTTCTGGGCTGTCTGTTGGGTGGTATTGCTATCGGTTTGCCTATTGCCTGGGCACTGTTGTTGTGCGGGGCGGCGTTAATGTTCTGGCTGGACATGTTTGATGTCCAGATCATGGCACAAACGCTGGTGAACGGAGCCGATAGCTTCTCCCTGCT‑GGCGATTCCGTTCTTTGTGCTGGCGGGTGAAATCATG‑AATGCGGGCGGCTTGTCAAAACGCATTGTTGACCTGCCGA‑TG‑AAACTGGTGGGG‑CATAAACCAGGCGGGCTGGGCTACGTCGGCGTGCT‑GGCAGCTATGATTATGGCGAGCCTTTCTGGTTCTGCCGTTGCGGATACCG‑CCGCCGTTGCCGCTCTACTGGTGCCGATGATGCGCAGCGCCAACTATCCGGTCAACCGGGCGGCGGGGCTGATTGCCTCTGGCGGCATTATCGCGCCAATTATTCCCCCTTCCATTCCGTT > NC_000913/3744797‑3745269
|
ttAATCATGGCTGTGCTGATTTTTCTGGGCTGTCTGTTGGGTGGTATTGCTATCGGTTTGCCTATTGCCTGGGCACTGTTGTTGTGCGGGGCGGCGTTAATGTTCTGGCTGGACATGTTTGATGTCCAGATCATGGCACAAACGCTGGTGAACGGAGCCGATAGCTTCTCCCTGCT‑GGCGATTCCGTTCTTTGTGCTGGCGGGTGAAATCATG‑AATGCGGGGCGCTTGTTAAAACGCAt > 1:1074730/1‑239 (MQ=255)
tGGCTGTGCTGATTTTTCTGGGCTGTCTGTTGGGTGGTATTGCTATCGGTTTGCCTATTGCCTGGGCACTGTTGTTGTGCGGGGCGGCGTTAATGTTCTGGCTGGACATGTTTGATGTCCAGATCATGGCACAAACGCTGGTGAACGGAGCCGATAGCTTCTCCCTGCT‑GGCGATTCCGTTCTTTGTGCTGGCGGGTGAAATCATG‑GATGCGGGCGGCTTGTCCAAACGCAttttttc > 1:1358390/1‑236 (MQ=255)
tGGCTGTGCTGATTTTTCTGGGCTGTCTGTTGGGTGGTATTGCTATCGGTTTGCCTATTGCCTGGGCACTGTTGTTGTGCGGGGCGGCGTTAATGTTCTGGCTGGACATGTTTGATGTCCAGATCATGGCACAAACGCTGGTGAACGGAGCCGATAGCTTCTCCCTGCT‑GGCGATTCCGTTCTTTGTGCTGGCGGGTGAAATCATG‑CATGCGGGGGGCTTGTCAAAAAGCAttgttgg > 1:804762/1‑237 (MQ=255)
tGGCTGTGCTGATTTTTCTGGGCTGTCTGTTGGGTGGTATTGCTATCGGTTTGCCTATTGCCTGGGCACTGTTGTTGTGCGGGGCGGCGTTAATGTTCTGGCTGGACATGTTTGATGTCCAGATCATGGCACAAACGCTGGTGAACGGAGCCGATAGCTTCTCCCTGCT‑GGCGATTCCGTTCTTTGTGCTGGCGGGTGAAATCATG‑AATGCGGGCGGGTTGTGAAAAAGGAttgttta > 1:952287/1‑236 (MQ=255)
tGGCTGTGCTGATTTTTCTGGGCTGTCTGTTGGGTGGTATTGCTATCGGTTTGCCTATTGCCTGGGCACTGTTGTTGTGCGGGGCGGCGTTAATGTTCTGGCTGGACATGTTTGATGTCCAGATCATGGCACAAACGCTGGTGAACGGAGCCGATAGCTTCTCCCTGCT‑GGCGATTCCGTTCTTTGTGCTGGCGGGGGGAATAATG‑TAAGTGGGCGGCTTGTCCAAAAGGATTGTTGa > 1:1069171/1‑238 (MQ=255)
tGGCTGTGCTGATTTTTCTGGGCTGTCTGTTGGGTGGTATTGCTATCGGTTTGCCTATTGCCTGGGCACTGTTGTTGTGCGGGGCGGCGTTAATGTTCTGGCTGGACATGTTTGATGTCCAGATCATGGCACAAACGCTGGTGAACGGAGCCGATAGCTTCTCCCTGCT‑GGCGATTCCGTTCTTTGTGCTGGCGGGGGAAATCATG‑AATGCGGGCGGCTTGTCAAAACGCCTTGTTGa > 1:79358/1‑238 (MQ=255)
gCTGTGCTGATTTTTCTGGGCTGTCTGTTGGGTGGTATTGCTATCGGTTTGCCTATTGCCTGGGCACTGTTGTTGTGCGGGGCGGCGTTAATGTTCTGGCTGGACATGTTTGATGTCCAGATCATGGCACAAACGCTGGTGAACGGAGCCGATAGCTTCTCCCTGCT‑GGCGATTCCGTTCTTTGTGCTGGCGGGTGCAATCATG‑AATGCGGGCGGCTTGTCAAAACGCCttgttgt > 1:1188863/1‑235 (MQ=255)
gCTGTGCTGATTTTTCTGGGCTGTCTGTTGGGTGGTATTGCTATCGGTTTGCCTATTGCCTGGGCACTGTTGTTGTGCGGGGCGGCGTTAATGTTCTGGCTGGACATGTTTGATGTCCAGATCATGGCACAAACGCTGGTGAACGGAGCCGATAGCTTCTCCCTGCT‑GGCGATTCCGTTCTTTGTGCTGGCGGGGGAAAACCTG‑AATGCGGGGGGGTTGTCAAAAAGCCatgtttgcct > 2:1379382/1‑234 (MQ=255)
cTGTGCTGATTTGTCTGGGCTGTCTGTTGGGTGGTATTGCTATCGGTTTGCCTATTGCCTGGGCACTGTTGTTGTGCGGGGCGGCGTTAATGTTCTGGCTGGACATGTTTGATGTCCAGATCATGGCACAAACGCTGGTGAACGGAGCCGATAGCTTCTCCCTGCT‑GGCGATTCCGTTCTTTGTGCTGGCGGGTGAAATCATG‑AATGCGGGCGGCTTGTCAAAACGCATTGTTGACCt < 1:705074/238‑1 (MQ=255)
tgCTGATTTTTCTGGGCTGTCTGTTGGGTGGTATTGCTATCGGTTTGCCTATTGCCTGGGCACTGTTGTTGTGCGGGGCGGCGTTAATGTTCTGGCTGGACATGTTTGATGTCCAGATCATGGCACAAACGCTGGTGAACGGAGCCGATAGCTTCTCCCTGCT‑GGCGATTCCGTTGTTTGTGCTGGCGGGGGAAATCTTT‑ACTGCGGGCGGCCTGGCTAAACCCAGTGTTtgcctgcc > 2:64615/1‑238 (MQ=255)
tgCTGATTTTTCTGGGCTGTCTGTTGGGTGGTATTGCTATCGGTTTGCCTATTGCCTGGGCACTGTTGTTGTGCGGGGCGGCGTTAATGTTCTGGCTGGACATGTTTGATGTCCAGATCATGGCACAAACGCTGGTGAACGGAGCCGATAGCTTCTCCCTGCT‑GGCGATTCCGTTCTTTTTGCTGGCGGGTGGAATCACG‑GATGCGGGGGGGCTGTCCAAACGCATTGTTGACCTTCCg > 1:799799/1‑239 (MQ=255)
tgCTGATTTTTCTGGGCTGTCTGTTGGGTGGTATTGCTATCGGTTTGCCTATTGCCTGGGCACTGTTGTTGTGCGGGGCGGCGTTAATGTTCTGGCTGGACATGTTTGATGTCCAGATCATGGCACAAACGCTGGTGAACGGAGCCGATAGCTTCTCCCTGCT‑GGCGATTCCGTTCTTTGTGCTGGCGGGTGTAATCATG‑AATGCGGGGGGCCTGTTCAAACGCCTTGTTGACccgccg > 2:744557/1‑239 (MQ=255)
tgCTGATTTTTCTGGGCTGTCTGTTGGGTGGTATTGCTATCGGTTTGCCTATTGCCTGGGCACTGTTGTTGTGCGGGGCGGCGTTAATGTTCTGGCTGGACATGTTTGATGTCCAGATCATGGCACAAACGCTGGTGAACGGAGCCGATAGCTTCTCCCTGCT‑GGCGATTCCGTTCTTTGTGCTGGCGGGTGGAATCATG‑AATGCGGGCGGCTTTTTGAAACGCAttgttgcgccgccg > 1:1270524/1‑231 (MQ=255)
tgCTGATTTTTCTGGGCTGTCTGTTGGGTGGTATTGCTATCGGTTTGCCTATTGCCTGGGCACTGTTGTTGTGCGGGGCGGCGTTAATGTTCTGGCTGGACATGTTTGATGTCCAGATCATGGCACAAACGCTGGTGAACGGAGCCGATAGCTTCTCCCTGCT‑GGCGATTCCGTTCTTTGTGCTGGCGGGGGGAAACATG‑CAAGCGGGCGGGTTGTCAAAACGCATTGTTGACCTGCCg > 1:1994/1‑239 (MQ=255)
gCTGATTTTTCTGGGCTGTCTGTTGGGTGGTATTGCTATCGGTTTGCCTATTGCCTGGGCACTGTTGTTGTGCGGGGCGGCGTTAATGTTCTGGCTGGACATGTTTGATGTCCAGATCATGGCACAAACGCTGGTGAACGGAGCCGATAGCTTCTCCCTGCT‑GGCGATTCCGTTCTTTGTGCTGGCGGGTGAAATCATG‑AAGGCGGGCGGCCTGTCCAAACGCCTTGTTGTCCTGCCGa > 1:1205010/1‑239 (MQ=255)
aTTTTTCTGGGCTGTCTGTTGGGTGGTATTGCTATCGGTTTGCCTATTGCCTGGGCACTGTTGTTGTGCGGGGCGGCGTTAATGTTCTGGCTGGACATGTTTGATGTCCAGATCATGGCACAAACGCTGGTGAACGGAGCCGATAGCTTCTCCCTGCT‑GGCGATTCCGTTCTTTGTGCTGGCGGGTGAAATCATG‑AATGCGGGCGGCTTGTCAAAACGCATTTTTTGCCTGCCCA‑TG‑aa > 1:1339963/1‑239 (MQ=255)
aTTTTTCTGGGCTGTCTGTTGGGTGGTATTGCTATCGGTTTGCCTATTGCCTGGGCACTGTTGTTGTGCGGGGCGGCGTTAATGTTCTGGCTGGACATGTTTGATGTCCAGATCATGGCACAAACGCTGGTGAACGGAGCCGATAGCTTCTCCCTGCT‑GGCGATTCCGTTCTTTGCGCTGGCGGGGTGAATCCTG‑AATGGGGGGGGGTTGTTCAAACGCATTGTTGAGCTGCCgtggaa > 2:730862/1‑234 (MQ=255)
tttttCTGGGCTGTCTGTTGGGTGGTATTGCTATCGGTTTGCCTATTGCCTGGGCACTGTTGTTGTGCGGGGCGGCGTTAATGTTCTGGCTGGACATGTTTGATGTCCAGATCATGGCACAAACGCTGGTGAACGGAGCCGATAGCTTCTCCCTGCT‑GGCGATTCCGTTCTTTGTGCTGGCGGGTGAAATCATG‑AATGCGGGCGGCTTGTCAAAACGCATTGTTGACCTGCCGA‑TG‑aaa < 1:999583/239‑1 (MQ=255)
cTGGGCTGTCTGTTGGGTGGTATTGCTATCGGTTTGCCTATTGCTTGGGCACTGTTGTTGTGCGGGGCGGCGTTAATGTTCTGGCTGGACATGTTTGATGTCCAGATCATGGCACAAACGCTGGTGAACGGAGCCGATAGCTTCTCCCTGCT‑GGCGATTCCGTTCTTTGTGCTGGCGGGTGAAATCATG‑AATGCGGGCGGCTTGTCAAAACGCATTGTTGACCTGCCGA‑TG‑AAACtggt < 1:21623/239‑1 (MQ=255)
cTGGGCTGCTTGTTGGGTGGTATTGCTATCGTTTTGCCTATTGCCTGGGCACTGTTGTTGTGCGGGGCGGCGTTAATGTTCTGGCTGGACAGGTTTGATGTCCAGATCATGGCACAAACGCTGGTGAACGGAGCCGATAGCTTCTCCCTGCT‑GGCGATTCCGTTCTTTGTGCTGGCGGGTGAAATCATG‑AATGCGGGCGGCTTGTCAAAACGCATTGTTGACCGGCCGA‑TG‑AAACtggt < 1:508143/239‑1 (MQ=255)
tgttggtTGGGTGGTATTGCTATCGGTTTGCCTATGGCCGGGGCACTGTTGTTGTGCGGGGCGGCGTTAATGTTCTGGCTGGACATGTTTGATGTCCAGATCATGGCACAAACGCTGGTGAACGGAGCCGATAGCTTCTCCCTGCT‑GGCGATTCCGTTCTTTGTGCTGGCGGGTGAAATCATG‑AAGGCGGGCGGTTTGTCAAAACGCATTGTTGACCTGCCGA‑TG‑AAACTGGTGGGG‑Ca < 2:125994/234‑1 (MQ=255)
tctgtTGGGTGGTATTGCTATCGGTTTGCCTATTGCCTGGGCACTGTTGTTGTGCGGGGCGGCGTTAATGTTCTGGCTGGACATGTTTGATGTCCAGATCATGGCACAAACGCTGGTGAACGGAGCCGATAGCTTCTCCCTGCT‑GGCGATTCCGTTCTTTGTGCTGGCGGGTGAAATCATG‑AATGGGGGAGGCTTGTCAATAAGCCTTGGTGGGCCGCCGA‑TGCAAACggggggggagt > 1:1308813/1‑236 (MQ=255)
gtgtgGGGGGGTGTTGGTATGGGTTTGCCTATTGCCGGGGCATTGTTGTGGTGCGGGGGGGCGTTAAGGTTCTGGCTGGACAGGTTTGAGGTCCAGATCAGGGCAAAAACGTTGGGGAACGGGGCCGATAGCTTCTCCCGGCG‑GGCGATTCCGTTCTTTGTGCTGGGGGGGGAAATCATG‑AATGGGGGCGGCTTGTAAAAACGCATTGTTGACCTGCCGA‑TG‑AAACTGGTGGGG‑CATaa < 2:586223/238‑1 (MQ=255)
gggTGGTATTGCTATCGGTTTGCCTATTGCCTGGGCACTGTTGTTGTGCGGGGCGGCGTTAATGTTCTGGCTGGACATGTTTGATGTCCAGATCATGGCACAAACGCTGGTGAACGGAGCCGATAGCTTCTCCCTGCT‑GGCGATTCCGTTCTTTGTGCTGGCGGGGGGAATAATG‑AATGCGGGCGGGCTGTCAAAAAGCATTGGTGACCTGCCGAGTG‑AAA‑TGGGGGGG‑CATaaaaaca > 2:306724/1‑235 (MQ=255)
gtggtATTGCTATCGGTTTGCCTATTGCCTGGGCACTGTTGTTGTGCGGGGCGGCGTTAATGTTCTGGCTGGACATGTTTGATGTCCAGATCATGGCACAAACGCTGGTGAACGGAGCCGATAGCTTCTCCCTGCT‑GGCGATTCCGTTCTTTGTGCTGGCGGGTGAAATCATG‑AATGCGGGCGGTTTGTCAAAACGCATTGTTGACCTGCCGA‑TG‑AAACTGGTGGGG‑CATAAACCAgg < 2:1265651/238‑1 (MQ=255)
gtggtATTGCTAGCGTTTTGCCTATTGCCTGGGCACTGTTGTTGTGCGGGGCGGCGTTAATGTTCTGGCTGGTCATGTTTGATGTCCAGATCATGGCACAAACGCTGGTGAACGGAGCCGATAGCTTCTCCCTGCT‑GGCGATTCCGTTCTTTGTGCTGGCGGGTGAAATCATG‑AATGCGGGCGGCTTGTCAAAACGCATTGTTGACCTGCCGA‑TG‑AAACTGGTGGGG‑CATAAACCAgg < 1:1379382/238‑1 (MQ=255)
ggtATTGCTATCGGTTTGCCTATTGCCTGGGCACTGTTGTTGTGCGGGGCGGCGTTAATGTTCTGGCTGGACATGTTTGATGTCCAGATCATGGCACAAACGCTGGTGAACGGAGCCGATAGCTTCTCCCTGCT‑GGCGATTCCGTTCTTTGTGCTGGCGGGGGAAATCCTG‑AATGGGGGCGGGTTGTCCAAAAGCCATGTTGGCCCGCCGA‑TG‑GAACAGGGGGGG‑CATCAAcccagccg > 2:715294/1‑233 (MQ=255)
tagtGCTCTCGTTTTGCCTTTTGCCGGGGCACTGTTGTTGGGCGGGGCGGCGTTAATGTTCTGGCTGGACATTTTTGATGTCCAGATCATGGCACAAGCGGTGGTGAACGGAGCCGATAGCTTCTCCCTGCT‑GGCGATTCCGTTTTTTTTGCTGGCGGGTGAAATCATG‑AATGCGGGCGGCTTGTCAAACCGCATTGTTGCCCTGCCGA‑TG‑AAACTGGTGGGG‑CATAAACCAGGCggg < 2:175836/235‑1 (MQ=255)
tttccaaTCGGTTTGCCTATTGCCGGGGCACTGTTGTGGGTGGGGGGGGCGTAAATGTTCTGGCTGGACATGTTTGATGTCCAGATCATGGCACAAACGCTGGGGAACGGAGCCGATAGCTTCTCCCTGCT‑GGCGATTCCTTTCTTTGTGCTGGCGGGTGAAATCAGG‑AATGCGGGCGGCTTGTCAAAACGCATTGTTGACCTGCCGA‑TG‑AAACTGGTGGGG‑CATAAACCAGGCgggc < 2:1014506/232‑1 (MQ=255)
aTTGTTAGCGGTTTGCCTATTGCCTGGGCATGGTTGTGGGGGGGGGGGGCGTTAATGTTCTGGCTGGACATGTTTGATGTCCAGATCAGGGCACAAACGTTGGTGAACGGAGCCGATAGCTTCTCCCTGCT‑GGCGATTCCGTTCTTTGTGCTGGCGGGTGAAATCATG‑AATGCGGGCGGCTTGTCAAAACGCATTGTTGACCTGCCGA‑TG‑AAACTGGTGGGG‑CATAAACCAGGCgggct < 2:1069171/239‑1 (MQ=255)
ttGCTATCGGTTTGCCTATTGCCTGGGCACTGTTGTTGTGCGGGGCGGCGTTAATGTTCTGGCTGGACATGTTTGATGTCCAGATCATGGCACAAACGCTGGTGAACGGAGCCGATAGCTTCTCCCTGCT‑GGCGATTCCGTTCTTTGTGCTGGCGGGGGAAATCATG‑AATGCGGGGGGCTTGTCAAAACGCATTGTTGACCTGCCGA‑TG‑AAACTGGTGGGG‑GATAAACCAGGCgggggg > 1:257657/1‑236 (MQ=255)
ggTTTGCCTATTGCCTGGGCACTGTTGTTGTGCGGGGCGGCGTTAATGTTCTGGCTGGACATGTTTGATGTCCAGATCATGGCACAAACGCTGGTGAACGGAGCCGATAGCTTCTCCCTGCT‑GGCGATTCCGTTCTTTGTGCTGGCGGGTGGAATCATG‑AATGCGGGCGGGCTGTCAAAACGCCTTGTTGGCCTGCCGG‑TT‑GAACTGGGGGGG‑CCTAAACCAGGCCGGCTGGGCTACg > 1:421878/1‑238 (MQ=255)
ggTTTGCCTATTGCCTGGGCACTGTTGTTGTGCGGGGCGGCGTTAATGTTCTGGCTGGACATGTTTGATGTCCAGATCATGGCACAAACGCTGGTGAACGGAGCCGATAGCTTCTCCCTGCT‑GGCGATTCCGTTCTTTGTGCTGGCGGGGGAAATCATG‑AATGCGGGCGGCTTGTCAAAAAGCATTGTTGGCCTGCCGG‑TT‑GAACTGGGGGGG‑CATAAAACCGGCGGGCTGGGCTACg > 1:919087/1‑238 (MQ=255)
gCCTATTGCCTGGGCACTGTTGTTGTGCGGGGCGGCGTTAATGTTCTGGCTGGACATGTTTGATGTCCAGATCATGGCACAAACGCTGGTGAACGGAGCCGATAGCTTCTCCCTGCT‑GGCGATTCCGTTCTTTGTGCTGGCGGGTGAAATCATG‑AATGCGGGCGGCTTGTCAAAAAGCATTGTTTTCCTTCCGA‑TG‑AAACTGGTGGGG‑CATAAACCCAGCGGGCTTGGCTACGTCGGCg > 1:915535/1‑239 (MQ=255)
ccTATTGCCTGGGCACTGTTGTTGTGCGGGGCGGCGTTAATGTTCTGGCTGGACATGTTTGATGTCCAGATCATGGCACAAACGCTGGTGAACGGAGCCGATAGCTTCTCCCTGCT‑GGCGATTCCGTTCTTTGTGCTGGCGGGGGGAATCATG‑AATGCGGGCGGCTTGTCAAAACGCCTTGTTTTCCTGCCGA‑TT‑GAACTGGTGGGG‑CCTTAACCAGGCggggtggggcccctccggcg > 2:717734/1‑227 (MQ=255)
ctatggcgggggctttgttgttgtGCGGGTTGGTGTTAATGTGTTGGTTGGACATGTTCGATTTCCAGTTCGTGGCACAAAGGCTGGTGATCGGGGCGGGTAGCTTCTCCTGGCT‑GGCGATGCTGTTTTTTGTGCTGGCGGGTGAAATCATG‑AATGCGCGCGCTTTTTCAAAACGCATGGTTGTCCTGCCGA‑TG‑AAACTGGTGGGG‑CATAAACCAGGCGGGCTGGGCTACGTCGGCGTg < 2:195401/224‑1 (MQ=255)
tgctggggCACTGTTGTTGTGTGGGGGGGGTTTAATTTTCTGGCTGGACATGTTTGTGTTCCAGATCATGGCAAAATCGCTGTTGAACGGGGCCGTAAGCTTCTCCCTGCT‑GGCGATTCCGTTCTTTGTGCTGGCGGGTGAAATCATG‑AATGCGGGCGGCTTGTCAAACCGCATTTTTGCCCTGCCGA‑TG‑AAACTGGTGGGG‑CATAAACCAGGCGGGCTGGGCTACGTCGGCGTGCT‑gg < 2:617182/234‑1 (MQ=255)
tGCCTGGTCCCTGTTGTGTTGCGGGGCGGCGTTAATGTTCTGGCTGGACATGTTTGATGTCCAGATCATGGCACAAACGCTGGGGAACGGAGCCGATAGCTTCTCCCTGCT‑GGCGATTCCGTTCTTTGTGCTGGCGGGTGAAATCATG‑AATGCGGGCGGCTTGTCAAAACGCATTGTTGCCCTGCCGA‑TG‑AAACTGGTGGGG‑CATAAACCAGGCGGGCTGGGCTACGTCGGCGTGCT‑gg < 1:1270350/239‑1 (MQ=255)
gcccggggCTCTGTTGTTGTGGGGGGGGGGTTTAATGTTCTGGCTGGACATGTTTAATGCCCAGATCATGGCACAAACGCTGGTGAGCGGAGCCGATAGCTTCTCCCTGCT‑GGCGATTCCGTTCTTTGTGCTGGCGGGTGAAATCAGG‑AATGCGGGGGGTTTGTCAAAACGCATTGTTGACCTGCCGA‑TG‑AAACTGGTGGGG‑CATAAACCAGGCGGGCTGGGCTACGTCGGCGTGCT‑gg < 2:309316/234‑1 (MQ=255)
tgggttcTGTTTTTGTGCGGGGCGGCGTTAATGTTCTGGCGGTGCATGTTTGATGTCAAGATCATGGCACAACCGCTGGTGACCGGAGCAGATAGCTTCGCCCTGCT‑GGCGATTCCGTTCTTTGGTCGGGCGGGGGAAATCATG‑ATTGCGGGCGGCTTGTAAAAACGCATTGTTGACCTGCCGA‑TG‑AAACTGGTGGGG‑CATAAACCAGGCGGGCTGGGCTACGTCGGCGTGCT‑GGCAGc < 2:648143/233‑1 (MQ=255)
gggCACTGTTGTTGTGCGGGGCGGCGTTAATGTTCTGGCTGGACATGTTTGATGTCCAGATCATGGCACAAACGCTGGTGAACGGAGCCGATAGCTTCTCCCTGCT‑GGCGATTCCGTTCTTTGTGCTGGCGGGGGGAATCATG‑AATGCGGGCGGCCTGTCAAAACGCATTGTTTGCCTTCCGG‑TG‑AAACTGGGGGGG‑CATAAACCAGGCGGGGGGGGGTCCGTCCGCGGGCC‑gggcg > 2:1251531/1‑234 (MQ=255)
ggCACTGTTGTTGTGCGGGGCGGTGTTAATGTTCTGGCTGGACATGTTGGATGTCCAGATCATGGCACAAACGCTGGTGAACGGAGCCGATAGCTTCCCCCTGCG‑GGCGATTCCGTTCTTTGTGCTGGCGGGTGAAATCATG‑AAGGCGGGCGGCTTGTCAAAACGCATTGTTGACCTGCCGA‑TG‑AAACTGGTGGGG‑CATAAACCAGGCGGGCTGGGCTACGTCGGCGTGCT‑GGCAGCt < 1:554343/238‑1 (MQ=255)
ggCACTGTTGTTGTGCGGGGCGGCGTTAATGTTCTGGCTGGACATGTTTGATGTCCAGATCATGGCACAAACGCTGGTGAACGGAGCCGATAGCTTCTCCCTGCT‑GGCGATTCCGTTCTTTGTGCTGGCGGGTGAAATCATG‑AATGCGGGCGGCTTGTCAAAACGCCTTGTTGACCTGCCGA‑TG‑AAACTGGTGGGG‑GATAAACCAGGCGGGCTGGGGTACGTCGGCGGGGT‑GGCAGCTa > 1:917505/1‑239 (MQ=255)
ggCACTGTTGTTGTGCGGGGCGGCGTTAATGTTCTGGCTGGACATGTTTAATGTCCAGATCATGGCACAAACGCTGGTGAACGGAGCCGATAGCTTCTCCCTGCT‑GGCGATTCCGTTCTTTGTGCTGGCGGGGGAAATCATG‑AATGCGGGGGGCTTGTCCAAACGCCTTGTTGACCTGCCCG‑TG‑AAACTTGTGGGG‑CATAAACCAGGCGGGCTGGGGCTCGTCGGGCGGCT‑GGCAGcca > 1:309316/1‑237 (MQ=255)
cACTGTTGTTGTGCGGGGCGGCGTTAATGTTCTGGCTGGACATGTTTGATGTCCAGATCATGGCACAAACGCTGGTGAACGGAGCCGATAGCTTCTCCCTGCT‑GGCGATTCCGTTCTTTGTGCTGGCGGGTGAAATCATG‑AATGCGGGCGGCTTGTCAAAACGCATTGTTGACCTGCCGA‑TG‑AAACTGGTGGGG‑CATAAACCAGGCGGGCTGGGCTACGTCGGCGTGCT‑GGCAGCTa < 1:890669/237‑1 (MQ=255)
ttgttgttggGGGGGGCGGGGTTAATTTTCTGGCTGGACGGGTTTGATTGCCAGATCATGGCAAAAACGGTGGTGAACGGGGCCGATAGCTTCTCCCGGCT‑GGCGATTCCTTTCTTTGTGCTGGCGGGTGAAATCATG‑AAGGCGGGCGGCTTGTCAAAACGCATTGTTGACCTGCCGA‑TG‑AAACTGGTGGGG‑CATAAACCAGGCGGGCTGGGCTACGTCGGCGTGCT‑GGCAGCTATGAt < 2:818/238‑1 (MQ=255)
gttgttgtGCGGGGCGGCGTTAATGCTCTGGCTGGACATGTTTGATGTCCAGATCATGGCACAAACGCTGGTGAACGGAGCCGATAGCTTCTCCCTGCT‑GGCGATTCCGTTCTTTGTGCTGGCGGGGGGGATCCTG‑AATACGCGCGGCCTGTTCAAAAGCCCTTTTGACCTGCCCA‑CT‑GAACCGGGGGGG‑CATAAACCAGGCTGGGTGGGCTCCGGGCGCGTGCT‑GGTAGCTaatcatt > 2:1039007/1‑233 (MQ=255)
tttttgtGGGGGGCGGGTTTAATGTTCTGGCGGGACATGTTTGATGTCCAGATCATGGCAAAAACGCTGGTGAACGGGGCCGATAGCTTCTCCCGGCT‑GGCGATTCCGTTCTTTGTGCGGGCGGGTGAAATCATG‑AATGCGGGCGGCTTGTCAAAACGCATTGTTGACCTGCCGA‑TG‑AAACTGGTGGGG‑CATAAACCAGGCGGGCTGGGCTACGTCGGCGTGCT‑gg < 2:1118793/223‑1 (MQ=255)
ttgtggtGCGGGGCGGCGTTAATGTTCTGGTTGGACAGGTTTGATGTCCAGATCATGGCACAAACGCTGGTGAACGGGGCCGATAGCTTCTCCCTGCT‑GGCGATTCCGTTCTTTGTGCTGGCGGGTGAAATCATG‑AATGCGGGCGGCTTGTCAAAACGCATTGTTGACCTGCCGA‑TG‑AAACTGGTGGGG‑CATAAACCAGGCGGGCTGGGCTACGTCGGCGTGCT‑gg < 1:312811/226‑1 (MQ=255)
ttgtGCGGGGCGGCGTTAATGTTCTGGCTGGACATGTTTGATGTCCAGATCATGGCACAAACGCTGGTGAACGGAGCCGATAGCTTCTCCCTGCT‑GGCGATTCCGTTCTTTGTGCTGGCGGGGGGAATCATGAAATCGGGGCGGCTTTTCAAACGGCTTTGTTG‑CCCGCCGA‑TG‑GAAATGGGGGGGCCATAAACATGGGGGGCGGGGCTACGTCggggggtgggcagtttggatattgc > 2:676088/1‑216 (MQ=255)
tgtgCGGGGGGGCGTTATTGTTCTGGCGGGACATGTTGGAGGTCCAGATCAGGGCACAAACGCTGGTGAACGGGGCGGATAGCTTCCCCCGGCT‑GGCGATTCCGTTTTTTGGGCTGGGGGGTAAAATCATG‑AATGCGGGCGGCTTGTAAAAACGCATTGTTGCCCTGCCGA‑TG‑AAACTGGTGGGG‑CATAAACCAGGCGGGCTGGGCTACGTCGGCGTGCT‑GGCAGCTATGATTATGGCg < 2:952287/239‑1 (MQ=255)
tgtgCGGGGCGGCGTTAATGTTCTGGCTGGACATGTTTGATGTCCAGATCATGGCACAAACGCTGGTGAACGGAGCCGATAGCTTCTCCCTGCT‑GGCGATTCCGTTCTTTGTGCTGGCGGGTGAAATCATG‑AATGCGGGCGGCTTGTCAAAACGCATTGTTGACCTGCCGA‑TG‑AAACTGGTGGGG‑CATAAACCAGGCGGGCTGGGCTACGTCGGCGTGCT‑GGCAGCTATGATTATGGCg < 1:306724/239‑1 (MQ=255)
gCGGGGCGGCGTTAATGTTCTGGCTGGACATGTTTGATGTCCAGATCATGGCACAAACGCTGGTGAACGGAGCCGATAGCTTCCCCCTGCT‑GGCGATTCCGTTCTTTGTGCTGGCGGGTGAAATCATG‑AATGCGGGCGGCTTGTCAAAACGCATTGTTGACCTGCCGA‑TG‑AAACTGGTGGGG‑CATAAACCAGGCGGGCTGGGCTACGTCGGCGTGCT‑GGCAGCTATGATTATGGCGAg < 1:43512/238‑1 (MQ=255)
gggCGGCGTTAATGTTCTGGCTGGACATGTTTGATGTCCAGATCATGGCACAAACGCTGGTGAACGGAGCCGATAGCTTCTCCCTGCT‑GGCGATTCCGTTCTTTGTGCTGGCGGGTGAAATCATG‑AATGCGGGCGGCTTGTCAAAACGCATTGTTGACCTGCCGC‑TG‑AAACTGGTGGGG‑CATAAACCAGGCGGGCTGGGGTACGTCGGCGTGCC‑GGCAGCCTTGGTTATTGCGGGCCtt > 1:64646/1‑239 (MQ=255)
gggCGGCGTTAATGTTCTGGCTGGACATGTTTGATGTCCAGATCATGGCACAAACGCTGGTGAACGGAGCCGATAGCTTCTCCCTGCT‑GGCGATTCCGTTCTTTGTGCTGGCGGGGGAAATCATG‑AATGGGGGCGGCTTGTCAAAAAGCAATGTTGGACTGCCGA‑TG‑AAAATGGGGGGG‑GATAAACCAGGCCGGCTGGGGTACGGCGGGGGGCC‑GGCAGGTATGATTTTgtttcttctt > 2:312811/1‑230 (MQ=255)
gggCGGCGTTAATGTTCTGGCTGGACATGTTTGATGTCCAGATCATGGCACAAACGCTGGTGAACGGAGCCGATAGCTTCTCCCTGCT‑GGCGATTCCGTTCTTTGTGCTGGCGGGGGAAATCATG‑AATGCGGGCGGCTTGTCAAAACGCCTTGTTTACCTGCCGA‑TG‑AAACTGGGGGGG‑CATAAACCAGGCGGGCCGGGGTACGCCGGCGGGCT‑GGCAGCTATGATTATGGGGGGCCtt > 1:971090/1‑239 (MQ=255)
gtggcgTAATTGTTGGGGCTGGCTTTGTTGTATGTCCAGACTTGGGCCCAAACTCTGGTTAGCGGGCCCTATCGCTTTCCCCGGCG‑GGCGTTTCCTTTTTTTGTGCTGGCGGGTGAAATCATG‑AAGGCGGGCGGCTTGTCAAAACGCATTGTTGACCTGCCGA‑TG‑AAACTGGTGGGG‑CATAAACCAGGCGGGCTGGGCTACGTCGGCGTGCT‑GGCAGCTATGATTATGGCGAGCCttt < 2:113401/236‑1 (MQ=255)
ggggcgTTAATGTTCTGGCTGGACATGTTTGATGCCCAGATCAGGGCACAAACGTTGGTGAGCGGAGCCGAGAGCTTCCCCCTGCT‑GGCGATTCCGTTCTTTGTGCTGGCGGGTAAAATCATG‑AATGCGGGGGGCTTGTCAAACCGCATTGTGGACCTGCCGA‑TG‑AAACTGGTGGGG‑CATAAACCAGGCGGGCTGGACTACGTCGGCGTGCT‑GGCAGCTATGATTATGGCGAGCCttt < 2:915535/236‑1 (MQ=255)
gcggcgTTAATGTTCTGGCTGGACATGTTTGATGTCCAGATCATGGCACAAACGCTGGTGAACGGAGCCGATAGCTTCTCCCTGCT‑GGCGATTCCGTTCTTTGTGCTGGCGGGTGAAATCATG‑AATGCGGGCGGCTTGTCAAAACGCATTGTTGACCTGCCGA‑TG‑AAACTGGTGGGG‑CATAAACCAGGCGGGCTGGGCTACGTCGGCGTGCT‑GGCAGCTATGATTATGGCGAGCCttt < 1:477832/238‑1 (MQ=255)
ttggggagggactttggtGATGTCCAAATTATGGCAAAAACGCGGGTGAGGGAGGCCGATAGCTGCTCCCGGGG‑GGCGATACCTGTCTTTGTGCGGGGGGGTAAAATCATG‑AATGCGGGGGTCTTGTAAAAACGCATTGTTGACCTGCCGA‑TG‑AAACTGGTGGGG‑CATAAACCAGGCGGGCTGGGCTACGTCGGCGTGCT‑GGCAGCTATGATTATGGCGAGCCTTTCTGGTTCTGCCg < 2:1192836/221‑1 (MQ=255)
tggACATGTTTGAGGTCCATATCATGGCACAAACGCTGGTGAACGGGGCCGATGGCTTCTCCCTGCT‑GGCGATTCCGTTCTTTGTGCTGGCGGGTGAAATCATG‑AATGCGGGCGGCTTGTCAAAACGCATTGTTGACCTGCCGA‑TG‑AAACTGGTGGGG‑CATAAACCAGGCGGGCTGGGCTACGTCGGCGTGCT‑GGCAGCTATGATTATGGCGAGCCTTTCTGGTTCTGCCGTTGCGGa < 2:1188863/238‑1 (MQ=255)
gATGTCCAGTGTAGGGCACAAGCGCTGTGGAAGGGAGCCGATATCTTCTCCCTGGT‑GGCGTTTCCGTTTTTTGTGCTGGCGGGTGAAATCATG‑AATGCGGGGGGCTTTCCAAAACGCTTTGTTGCCCTGCCGA‑TG‑AAACTGGTGGGG‑CATAAACCAGGCGGGCTGGGCTACGTCGGCGTGCT‑GGCAGCTATGATTATGGCGAGCCTTTCTGGTTCTGCCGTTGCGGATACCG‑CCGCCGt < 2:1184729/239‑1 (MQ=255)
gTCCAGATCAGGGCACAAACGCTGGTGAACGGGGCCTATACCTTCCCCTTGTT‑GGCGTTCCCGTTCTTTGTGCGGGCGTGGAAAACCATG‑AATGGGGGGGGTTTGTAAAACCGTTTTGTTGCCCTGCCGA‑TG‑AAACTGGTGGGG‑CATAAACCAGGCGGGCTGGGCTACGTCGGCGTGCT‑GGCAGCTATGATTATGGCGAGCCTTTCTGGTTCTGCCGTTGCGGATACCG‑CCGCCGTTGc < 2:1127604/239‑1 (MQ=255)
tCATGGCACAAACGCTGGTGAACGGAGCCGATAGCTTCTCCCTGCT‑GGCGATTCCGTTCTTTGTGCTGGCGGGTGAAATCATG‑AAGGCGGGCGGCTTGTCAAAACGCATTGTTGACCTGCCGA‑TG‑AAACTGGTGGGG‑CATAAACCAGGCGGGCTGGGCTACGTCGGCGTGCT‑GGCAGCTATGATTATGGCGAGCCTTTCTGGTTCTGCCGTTGCGGATACCG‑CCGCCGTTGCCGCTCTa < 1:371823/239‑1 (MQ=255)
ggCACAAACGCTGGTGAACGGAGCCGATAGCTTCTCCCTGCT‑GGCGATTCCGTTCTTTGTGCTGGCGGGTGGAATCATT‑AATGCGGGCGGCTTGTCAAAACGCATTGTTTGCCTGCCGA‑TG‑AAACTGGTGGGG‑GATAAACCAGGCGGGGTGGGCCACGTCGGCGGGCC‑TGCAGATATTATTATTGGGGGCCCTTTTTGGTCTGGCGCTGCGCGGACCC‑ACGCCGCTGccccccctctgg > 2:620017/1‑229 (MQ=255)
ggCACAAACGCTGGTGAACGGAGCCGATAGCTTCTCCCTGCT‑GGCGATTCCGTTCTTTGTGCTGGCGGGTGGAATCATG‑AATGCGGGCGGCTTGTTAAAACGCATTGTTTGCCTGCCCA‑TG‑AAACTGGGGGGG‑CGTAAACCAGGCGGGGTGGGCCACGTCCGGGGGCTGGGGGGCATTGATATTGGGGGGCCTTTTTGGTTTTGCCGTTG‑GGGTACCC‑CCCGCGTTTCCGcccctctgt > 2:96180/1‑231 (MQ=255)
ggCACAAACGCTGGTGAACGGAGCCGATAGCTTCTCCCTGCT‑GGCGATTCCGTTCTTTGTGCTGGCGGGGGAAATCATG‑AATGCGGGCGGCTTGTCAAAACGCATTGTTGACCCGCCGA‑TG‑AAACTGGTGGGG‑GATAAACCAGGCGGGCGGGGCTACGGCGGCGTGCT‑GGGCGGTATTATTTTGGGGGGGCTTTTTGGGTTTGGCCTTGCGGGTACCGCCCCCCTTTGCCGCCCTACTg > 2:1226874/1‑239 (MQ=255)
acaAACTGTGGTGAGGGGAGCTGATAGTGTCTCCCGGTT‑GTCTGTTCCGTTCTTTGTGCTGGCGGGTAAAATCATG‑ATGGCGGCCGGATTGAAAATACGATTTGTTGACCTGCCGA‑TG‑AAACTGGTGGGG‑CATAATCCAGGCGGGCTGGGCTACGTCGGCGTGCT‑GGCAGCTATGATTATGGCGAGCCTTTCTGGTTCTGCCGTTGCGGATACCG‑CCGCCGTTGCCGCTCTACTGGTGc < 2:1308813/239‑1 (MQ=255)
acaAACGCTGGTGAACGGAGCCGATAGCTTCTCCCTGCT‑GGCGATTCCGTTCTTTGTGCTGGCGGGTGAAATCATG‑AATGCGGGCGGCTTGTCAAACCGCATTGTTGCCCTGCCGA‑TG‑AAACTGGTGGGG‑CATAAACCAGGCGGGCTGGGCTACGTCGGCGTGCT‑GGCAGCTATGATTATGGCGAGCCTTTCTGGTTCTGCCGTTGCGGATACCG‑CCGCCGTTGCCGCTCTACTGGTGc < 1:96180/239‑1 (MQ=255)
aaaagcGCTGTTGAAGGGGGCCGATAGCTTCTCCCTGCG‑GGCGTTTCCGTTTTTTGTGCTGGCGGTTGAAATCATG‑AATGCGGGCGGTTTGTCAAAACGCATTGTTAACCTGCCGA‑TG‑AAACTGGTGGGG‑CATAAACCAGGCGGGCTGGGCTACGTCGGCGTGCT‑GGCAGCTATGATTATGGCGAGCCTTTCTGGTTCTGCCGTTGCGGATACCG‑CCGCCGTTGCCGCTCTACTGGTGc < 1:1283954/234‑1 (MQ=255)
ggaccGGAGCCGATACTTTCGCCC‑GCTGGGCTGTTCCGTTTTTTGGGTTGGCGGGTGAAATCAGG‑AAGGGGGGGGGCTTGTCAAACCGCATTGTTGACCTGCCGA‑TG‑AAACTGGTGGGG‑CATAAACCAGGCGGGCTGGGCTACGTCGGCGTGCT‑GGCAGCTATGATTATGGCGAGCCTTTCTGGTTCTGCCGTTGCGGATACCG‑CCGCCGTTGCCGCTCTACTGGTGCCGATGATgcg < 2:299745/234‑1 (MQ=255)
gacgggggCCGAGAGTTTCTCCCGGCT‑GGCTATTCCGTTTTTTGTGCTGGCGGGTAAAATCATG‑AAGGCGGGGGGTTTGTAAAACCGCTTTGTTGACCTGCCGA‑TG‑AAACTGGTGGGG‑CATAAACCAGGCGGGCTGGGCTACGTCGGCGTGCT‑GGCAGCTATGATTATGGCGAGCCTTTCTGGTTCTGCCGTTGCGGATACCG‑CCGCCGTTGCCGCTCTACTGGTGCCGATGATgcgc < 2:1339963/231‑1 (MQ=255)
gAACGGAGCCGATAGCTTCTCCCTGCT‑GGCGATTCCGTTCTTTGTGCTGGCGGGTGAAATCATG‑AAGGCGGGCGGTTTGTCAAAACGCTTTGTTGACCTGCCGA‑TG‑AAACTGGTGGGG‑CATAAACCAGGCGGGCTGGGCTACGTCGGCGTGCT‑GGCAGCTATGATTATGGCGAGCCTTTCTGGTTCTGCCGTTGCGGATACCG‑CCGCCGTTGCCGCTCTACTGGTGCCGATGATgcgc < 1:1197873/238‑1 (MQ=255)
cctagaGCTTCTCCCTGCT‑GGCGATTCCGTTTTTTGTGCTGGCGGGTGAAACCATG‑AATGCGGGCGGCTTGTCAAAACGCATTGTTGACCTGCCGA‑TG‑AAACTGGTGGGG‑CATAAACCAGGCGGGCTGGGCTACGTCGGCGTGCT‑GGCAGCTATGATTATGGCGAGCCTTTCTGGTTCTGCCGTTGCGGATACCG‑CCGCCGTTGCCGCTCTACTGGTGCCGATGATGCGCAGCGCCaa < 1:992534/233‑1 (MQ=255)
cgatgctttctcgtgtct‑gGGGTTTCCGTTTTTTGTGCTGGGGGTGGAATTAAGG‑AAGGGGGGGGGTTGGTAAAAAGGCTTTTTTGCCCTGCCGA‑TG‑AAACTGGTGGGG‑CATAAACCAGGCGGGCTGGGCTACGTCGGCGTGCT‑GGCAGCTATGATTATGGCGAGCCTTTCTGGTTCTGCCGTTGCGGATACCG‑CCGCCGTTGCCGCTCTACTGGTGCCGATGATGCGCAGCGCCAACt < 2:669123/223‑1 (MQ=255)
ctgtgggCGATTCCGTTCTTTGCGCTGGCGGGTGAAACCATG‑AATGCGGGCGGCTTGCCAAAGCGCATTGTTGACCTGCCGA‑TG‑AAACTGGTGGGG‑CATAAACCGGGCGGGCTGGGCTACGTCGGCGTGCT‑GGCAGCTATGATTATGGCGAGCCTTTCTGGTTCTGCCGTTGCGGATACCG‑CCGCCGTTGCCGCTCTACTGGTGCCGATGATGCGCAGCGCCAACTATCCGGTCAACCg < 1:730862/234‑1 (MQ=255)
ct‑gGCGATTCCGTTCTTTGTGCTGGCGGGTGGAATCATG‑AATGCGGGCGGCTTTTCAAAAAGCATTGTTGACCTGCCGA‑TG‑AAACTGGTGGGG‑CCTAAAACAGGCGGGCGGGGCTACGTCGGCGGGCG‑GGGGGCTATGATTATGGCGGGCCTTTCTGGTTCTTCCGGTGCGGGGACCG‑CCGCCCTTGCCGCCCCACTTGGGGCGCGGATGGGCAGGGCCCACCATCCCGGCAACCGggc > 2:434134/1‑239 (MQ=255)
ct‑gGCGATTCCGTTCTTTGTGCTGGCGGGTGAAATCATT‑AATGCGGGCGGCGTTTCCAAACGCCTTTTTTACCTGCCGG‑TG‑AAACTGGTGGGG‑CCTAAACCAGGCGGGCTGGGCTACGTCCGCGTGCT‑GGGCGCTATGATTTTGGCGGGGCCTTTTTGTTTTGCCGTTTCGGGGACCC‑CCGCCGTTTGCCCTCTCATGGTGCCGCTGCTGCGCcgcggcccccattcgtgccacccggc > 2:656024/1‑217 (MQ=255)
ggCGTTTCCGTTGTTTGGGCGGGGGGGGAAAACCAGG‑AATGCGGGGGGTTTGCAAAACCGCTTTGTGGCCCTGCCGA‑TG‑AAACTGGTGGGG‑CATAAACCAGGCGGGCTGGGCTACGTCGGCGTGCT‑GGCAGCTATGATTATGGCGAGCCTTTCTGGTTCTGCCGTTGCGGATACCG‑CCGCCGTTGCCGCTCTACTGGTGCCGATGATGCGCAGCGCCAACTATCCGGTCAACCGggcg < 2:257657/238‑1 (MQ=255)
cTTTGTGCTGGCGGGTGAAATCAGG‑AATGCGGGCGGCTTGTCAAAACGCATTGTTGACCTGCCGA‑TG‑AAACTGGTGGGG‑CATAAACCAGGCGGGCTGGGCTACGTCGGCGTGCT‑GGCAGCTATGATTATGGCGAGCCTTTCTGGTTCTGCCGTTGCGGATACCG‑CCGCCGt < 1:3055/171‑1 (MQ=255)
gtGGGGGGAGAAAGAAGG‑AAGGGGGGTGGTTTGTCAAAGCGCATGGTTGACCTGCGGA‑TG‑AAACTGGTGGGG‑CATAAACCAGGCGGGCTGGGCTACGTCGGCGTGCT‑GGCAGCTTTGATTATGGCGAGCCTTTCTGGTTCTGCCGTTGCGGATACCG‑CCGCCGTTGCCGCTCTACTGGTGCCGATGATGCGCAGCGCCAACTATCCGGTCAACCGGGcggcggtatccgcaacggcag < 1:715294/237‑16 (MQ=255)
agtcaagaaaTGCGGGGGGTTTGAAAAAAGCCTTTTTGGCCCTGCCGA‑TG‑AAACTGGTGGGG‑CATAAACCAGGCGGGCTGGGCTACGTCGGCGTGCT‑GGCAGCTATGATTATGGCGAGCTTTTCTGGTTCTGCCGTTGCGGATACCG‑CCGCCGTTGCCGCTCTACTGGTGCCGATGATGCGCAGCGCCAACTATCCGGTCAACCGGGCGGCGGGGCTGATTGCCTCTGGCGGCATTa < 2:1086471/229‑1 (MQ=255)
aTG‑AATGCGGGCGGCTTGTCAAAACGCATTGTTGACCTGCCGA‑TG‑AAACTGGTGGGG‑CATAAACCAGGCGGGCTGGGCTACGTCGGCGTGCT‑GGCAGCTATGATTATGGCGAGCCTTTCTGGTTCTGCCGTTGCGGATACCG‑CCGCCGTTGCCGCTCTACTGGTGCCGATGATGCGCAGCGCCAACTATCCGGTCAACCGGGCGGCGGGGCTGATTGCCTCTGGCGGCATTATCGCGcc < 1:799474/239‑1 (MQ=255)
aTG‑AATGCGGGCGGCTTGTAAAAACCCTTTGTTGACCTGCCGA‑TG‑AAACTGGTGGGG‑CATAAACCAGGCGGGCTGGGCTACGTCGGCGTGCT‑GGCAGCTATGATTATGGCGAGCCTTTCTGGTTCTGCCGTTGCGGATACCG‑CCGCCGTTGCCGCTCTACTGGTGCCGATGATGCGCAGCGCCAACTATCCGGTCAACCGGGCGGCGGGGCTGATTGCCTCTGGCGGCATTATCGCGcc < 1:1041658/239‑1 (MQ=255)
g‑AATGCGGGCGGCTTGTCAAAACGCATTGTTGACCTGCCGA‑TG‑AAACTGGTGGGG‑CATAAACCAGGCGGGCTGGGCTACGTCGGCGTGCT‑GGCAGCTATGATTATGGCGAGCCTTTCTGGTTCTGCCGTTGCGGATACCG‑CCGCCGTTGCCGCTCTACTGGTGCCGATGATGCGCAGCGCCAACTATCCGGTCAACCGGGCGGCGGGGCTGATTGCCTCTGGCGGCATTATCGCGCCaa > 1:455895/1‑239 (MQ=255)
agtGCGGGGGGCTTGTCAAAGCGCGTTGGTGCCCTGCCGA‑TG‑AAACTGGTGGGG‑CATAAACCAGGCGGGCTGGGCTACGTCGGCGTGCT‑GGCAGCGATGATTATGGCGAGCCTTTCTGGTTCTGCCGTTGCGGATACCG‑CCGCCGTTGCCGCTCTACTGGTGCCGATGATGCGCAGCGCCAACTATCCGGTCAACCGGGCGGCGGGGCTGATTGCCTCTGGCGGCATTATCGCGcc < 1:717734/234‑1 (MQ=255)
tGCGGGCGGCTTGTCAAAACGCATTGTTGACCTGCCGA‑TG‑AAACTGGTGGGG‑CATAAACCAGGCGGGCTGGGCTACGTCGGCGTGCT‑GGCAGCTATGATTATGGCGAGCCTTTCTGGTTCTGCCGTTGCGGATACCG‑CCGCCGTTGCCGCTCTACTGGTGCCGATGATGCGCAGCGCCAACTATCCGGTCAACCGGGCGGCGGGGCTGATTGCCTCTGGCGGCCTTCTCGCGCCAatta > 1:246583/1‑239 (MQ=255)
gcggggggCTTGTCAAAACGCATTTTTGACCTGCCGA‑TG‑AAACTGGTGGGG‑CATAAACCAGGCGGGCTGGGCTACGTCGGCGTGCT‑GGCAGCTATGATTATGGCGAGCCTTTCTGGTTCTGCCGTTGCAGATACCG‑CCGCCGTTGCCGCTCTACTGGTGCCGATGATGCGCAGCGCCAACTATCCGGTCAACCGGGCGGCGGGGCTGATTGCCTCTGGCGGCATTATCGCGCCaa < 1:467266/235‑1 (MQ=255)
gggcggCTGGGCAAAACGCAGTGTTGCCCTGCCGA‑TG‑AAACTGGTGGGG‑CATAAACCAGGCGGGCTGGGCTACGTCGGCGTGCT‑GGCAGCTATGATTATGGCGAGCCTTTCTGGTTCTGCCGTTGCGGATACCG‑CCGCCGTTGCCGCTCTACTGGTGCCGATGATGCGCAGCGCCAACTATCCGGTCAACCGGGCGGCGGGGCTGATTGCCTCTGGCGGCATTATCGCGCCAattatt < 1:656024/238‑1 (MQ=255)
ggcggcTTGTCAAAACGCATTGTTGACCTGCCGA‑TG‑AAACTGGTGGGG‑CATAAACCAGGCGGGCTGGGCTACGTCGGCGTGCT‑GGCAGCTATGATTATGGCGAGCCTTTCTGGTTCTGCCGTTGCGGATACCG‑CCGCCGTTGCCGCTCTACTGGTGCCGCTGATGCGCAGCGCCAACTATCCGGTCAACCGGGCGGCGGGGCTGATTGCCTCTGGCGGCATTATCGCGCCAat > 1:1086471/1‑233 (MQ=255)
ggggtttgaaaaagccaaTTTTTGCCCTGCCGA‑TG‑AAACTGGTGGGG‑CATAAACCAGGCGGGCTGGGCTACGTCGGCGTGCT‑GGCAGCTATGATTATGGCGAGCCTTTCTGGTTCTGCCGTTGCGGATACCG‑CCGCCGTTGCCGCTCTACTGGTGCCGATGATGCGCAGCGCCAACTATCCGGTCAACCGGGCGGCGGGGCTGATTGCCTCTGGCGGCATTATCGCGCCAATTATTcc < 1:64615/221‑1 (MQ=255)
ggggcTTGACAAACCGCATTTTGGCCCTGCCGA‑TG‑AAACTGGTGGGG‑CATAAACCAGGCGGGCTGGGTTACGTCGGCGTGCT‑GGCAGCTAGGATTATGGCGAGCCTTTCTGGTTCTGCCGTTGCGGATACCG‑CCGCCGTTGCCGCTCTACTGGTGCCGATGATGCGCAGCGCCAACTATCCGGTCAACCGGGCGGCGGGGCTGATTGCCTCTGGCGGCATTATCGCGCCAATTATTcc < 2:1359657/236‑1 (MQ=255)
gcggtTTGTAAAAACGCTTGGTGGCCCTGCCGA‑TG‑AAACTGGTGGGG‑CATAACCCAGGCGGGCTGGGCTACGTCGGCGTGCT‑GGCAGCTATGATTATGGCGAGCCTTTCTGGTTCTGCCGTTGCGGATACCG‑CCGCCGTTGCCGCTCTACTGGTGCCGATGATGCGCAGCGCCAACTATCCGGTCAACCGGGCGGCGGGGCTGATTGCCTCTGGCGGCATTATCGCGCCAATTATTcc < 2:541628/238‑1 (MQ=255)
gcggcTTGTCAAAACGCATTGTTGACCTGCCGA‑TG‑AAACTGGTGGGG‑CATAAACCAGGCGGGCTGGGCTACGTCGGCGTGCT‑GGCAGCTATGATTATGGCGAGCCTTTCTGGTTCTGCCGTTGCGGATACCG‑CCGCCGTTGCCGCTCTACTGGTGCCGATGATGCGCAGCGCCAACTATCCGGTCAACCGGGCGGCGGGGCTGATTGCCTCTGGCGGCATTATCGCGCCAATTATTcc > 1:140330/1‑238 (MQ=255)
gcggcTTGGAAAAACGCGTGGTTGCCCTGCCGA‑TG‑AAACTGGTGGGG‑CATAAACCAGGCGGGCTGGGCTACGTCGGCGTGCT‑GGCAGCTATGATTATGGCGAGCCTTTCTGGTTCTGCCGTTGCGGATACCG‑CCGCCGTTGCCGCTCTACTGGTGCCGATGATGCGCAGCGCCAACTATCCGGTCAACCGGGCGGCGGGGCTGATTGCCTCTGGCGGCATTATCGCGCCAATTATTcc < 2:421878/238‑1 (MQ=255)
cTTGTCAAAACGCATTGTTGACCTGCCGA‑TG‑AAACTGGTGGGG‑CATAAACCAGGCGGGCTGGGCTACGTCGGCGTGCT‑GGCAGCTATGATTATGGCGAGCCTTTCTGGTTCTGCCGTTGCGGATACCG‑CCGCCGTTGCCGCTCTACTGGTGCCGATGATGCGCAGCGCCCACTATCCGGTCAACCGGGGGGCGGGGCTGGATGCCTCTGGCGGCCTTTTCGCGCCAATTTTTTCCCCt > 2:1353426/1‑238 (MQ=255)
ttGTCAAAACGCATTGTTGACCTGCCGA‑TG‑AAACTGGTGGGG‑CATAAACCAGGCGGGCTGGGCTACGTCGGCGTGCT‑GGCAGCTATGATTATGGCGAGCCTTTCTGGTTCTGCCGTTGCGGATACCG‑CCGCCGTTGCCGCTCTACTGGTGCCGGTGATGCGCAGCGCCAACTATCCGGTCAACCGGGCGGCGGGGCTGATTGCCTCTGGCGGCATTATCGCGCCAATTATTCCCCCtt > 2:405224/1‑238 (MQ=255)
aaacCGCTTTTTTGACCTGCCGA‑TG‑AAACTGGTGGGG‑CATAAACCAGGCGGGCTGGGCTACGTCGGCGTGCT‑GGCAGCTATGATTATGGCGAGCCTTTCTGGTTCTGCCGTTGCGGATACCG‑CCGCCGTTGCCGCTCTACTGGTGCCGATGATGCGCAGCGCCAACTATCCGGTCAACCGGGCGGCGGGGCTGATTGCCTCTGGCGGCATTATCGCGCCAATTATTCCCCCTTCCATTc < 1:434134/239‑1 (MQ=255)
aaaaCGCATTGCTGACCTGCCGA‑TG‑AAACTGGTGGGG‑CATAAACCAGGCGGGCTGGGCTACGTCGGCGTGCT‑GGCAGCTATGATTATGGCGAGCCTTTCTGGTTCTGCCGTTGCGGATACCG‑CCGCCGTTGCCGCTCTACTGGTGCCGATGATGCGCAGCGCCAACTATCCGGTCAGCCGGGCGGCGGGGCTGATTGCCTCTGGCGGCATTATCGCGCCAATTATTCCCCCTTCCATTc < 1:113639/239‑1 (MQ=255)
cGCATTGTTGACCTGCCGA‑TG‑AAACTGGTGGGG‑CATAAACCAGGCGGGCTGGGCTACGTCGGCGTGCT‑GGCAGCTATGATTATGGCGAGCCTTTCTGGTTCTGCCGTTGCGGATACCG‑CCGCCGTTGCCGCTCTACTGGGGCCGATGATGCGCAGCGCCAACTATCCGGTCAACCGGGCGGCGGGGCTGATTGGCTCTGGCGGCATTATCGCGCCCATTTTTCCCCCTTCCATTCCGtt > 2:1217436/1‑239 (MQ=255)
|
TTAATCATGGCTGTGCTGATTTTTCTGGGCTGTCTGTTGGGTGGTATTGCTATCGGTTTGCCTATTGCCTGGGCACTGTTGTTGTGCGGGGCGGCGTTAATGTTCTGGCTGGACATGTTTGATGTCCAGATCATGGCACAAACGCTGGTGAACGGAGCCGATAGCTTCTCCCTGCT‑GGCGATTCCGTTCTTTGTGCTGGCGGGTGAAATCATG‑AATGCGGGCGGCTTGTCAAAACGCATTGTTGACCTGCCGA‑TG‑AAACTGGTGGGG‑CATAAACCAGGCGGGCTGGGCTACGTCGGCGTGCT‑GGCAGCTATGATTATGGCGAGCCTTTCTGGTTCTGCCGTTGCGGATACCG‑CCGCCGTTGCCGCTCTACTGGTGCCGATGATGCGCAGCGCCAACTATCCGGTCAACCGGGCGGCGGGGCTGATTGCCTCTGGCGGCATTATCGCGCCAATTATTCCCCCTTCCATTCCGTT > NC_000913/3744797‑3745269
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 13 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
N/A
