Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A3 F17 I0 R1
|
155 |
84.1 |
1797446 |
90.9% |
1633878 |
230.3 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
freq |
annotation |
gene |
description |
| RA |
NC_000913 |
3,850,795 |
G→T |
15.1% |
intergenic (‑70/+6) |
uhpA ← / ← ilvN |
response regulator in two‑component regulatory system wtih UhpB/acetolactate synthase 1 small subunit |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | NC_000913 | 3,850,795 | 0 | G | T | 15.1%
| 191.0
/ 6.0
| 80 | intergenic (‑70/+6) | uhpA/ilvN | response regulator in two‑component regulatory system wtih UhpB/acetolactate synthase 1 small subunit |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (22/44); new base T (11/3); total (33/47) |
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 2.58e-03 |
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
ATCGCAAATACACACCTGCACACCGCGCCCCGGCAG‑CCCCGCCAGCGCCTCGCGCCCCGAACCAAACTCGGCAACTACCTGCAAATCAGGTTCCAGCCCCAGCAGCTGCGCAAAGCCGGAGCGGACGATGAGGTGATCGTCTATAAGGGCAACGGTGATCATGGTCTTGTCCTGGC‑GGGTAAAAAAAATACGCGCTTAC‑CTTAACGATAAGCGCGATGTTGTTCAAGCCTTGAGCGGTTACTGAAAAAACACCGCGATCTTGTTAAACATCGTCGGATCGGAC‑TGATTACGCTGCACTTTCACGACATCTTCCAGCTTATCGATTTGGCTTATCATCTGCTCCAGACGCTGGTC‑GTCATTGACCAGTAGCCAGATATGGCTTTTGTCGCTGTCCTGAATCGGCAGACAAAGAATGCCTTCAACGTT‑AAAAGCGC‑GGCGGGCAAAAAGGCCACAAACGTGGGTCATTACG > NC_000913/3850564‑3851032
|
atCGCAAATACCCCCCGGCCCACCGCGCCCCGGCAG‑CCCCGCCAGCGCCTCGCGCCCCGAACCAAACTCGGCAACTACCTGCAAATCAGGTTCCAGCCCCAGCAGCTGCGCAAAGCCGGAGCGGACGATGAGGTGATCGTCTATAAGGGCAACGGTGATCATGGTCTTGTCCTGGC‑GGGTAAAAAAAATACGCGCTTAC‑CTTAACGATAAGCGCGATGTTGTTCAAGCCTTGAGCGGtt < 2:261066/239‑1 (MQ=255)
atCGCAAATACACACCTGCACACCGCGCCCCGGCAG‑CCCCGCCAGCGCCTCGCGCCCCGAACCAAACTCGGCAACTACCTGCAAATCAGGTTCCAGCCCCAGCAGCTGCGCAAAGCCGGAGCGGACGATGAGGTGATCGTCTATAAGGGCAACGGTGATCATGGTCTTGTCCTGGCGGGGGAAAAAAAAAACGC‑CTTCCTCTAAACG‑TAAACGCAATGTTTTTCAAACCCAGAGAGGtg > 1:636824/1‑238 (MQ=255)
cgcaacttccccccgcccacccGCCCCCCGGCAG‑CCCCGCCAGCCCCTCCCGCCCCGAACCAAACCCGGCAACTACCTGCAAATCAGGTTCCAGCCCCAGCAGCTGCGTAAAGCCGGAGCGGACGATGAGGTGATCGTCTATAAGGGCAACGGTGATCATGGTCTTGTCCTGGC‑GGGTAAAAAAAATACGCGCTTAC‑CTTAACGATAAGCGCGATGTTGTTCAAGCCTTGAGCGGTTAc < 2:799631/219‑1 (MQ=255)
ccaaaatccccccccgccccccGCCCCCCGCCAC‑CCCCCCCAGCCCCTCGCGCCCCGAACCAAACCCGGCAACTACCTGCAAATCAGGTTCCAGCCCCAGCAGCTGCGCAAAGCCGGAGCGGACGATGAGGTGATCGTCTATAAGGGCAACGGTGATCATGGTCTTGTCCTGGC‑GGGTAAAAAAAATACGCGCTTAC‑CTTAACGATAAGCGCGATGTTGTTCAAGCCTTGAGCGGTTAc < 1:730838/219‑1 (MQ=255)
tcccccccTGCCCACCGCGCCCCGGCAA‑CCCCGCCAGCGCCTCGCGCCCCGAACCAAACTCGGCAACTACCTGCAAATCAGGTTCCAGCCCCAGCAGCTGCGCAAAGCCGGAGCGGACGATGAGGTGATCGTCTATAAGGGCAACGGTGATCATGGTCTTGTCCTGGC‑GGGTAAAAAAAATACGCGCTTAC‑CTTAACGATAAGCGCGATGTTGTTCAAGCCTTGAGCGGTTACTGaaaa < 2:712151/233‑1 (MQ=255)
tACACACCTGCACACCGCGCCCCGGCAG‑CCCCGCCAGCGCCTCGCGCCCCGAACCAAACTCGGCAACTACCTGCAAATCAGGTTCCAGCCCCAGCAGCTGCGCAAAGCCGGAGCGGACGATGAGGTGATCGTCTATAAGGGCAACGGAGATCATGGTCTTGTCCTGGC‑GGGTGAAAAAAAAACCCCCTTAC‑CTTTAAGGTAAACGCGGAGTTGTTTCAGCCCTTAGAGGGTATTGaaaa > 1:36221/1‑239 (MQ=255)
cTGCACCCCGGCCCCCGGCAT‑CCCCGCCAGCCCCTCGCGCACCGAACCAAACTCGGCAACTACCTGCAAATCAGGTTCCAGCCCCAGCAGCTGCGCAAAGCCGGAGCGGACGATGAGGTGATCGTCTATAAGGGCAACGGTGATCATGGTCTTGTCCTGGC‑GGGTAAAAAAAATACTCGCTTAC‑CTTAACGATAAGCGCGATGTTGTTCAAGCCTTGAGCGGTTACTGAAAAAACACcg < 2:885834/239‑1 (MQ=255)
cTGCACACCGCGCCCCGGCAG‑CCCCGCCAGCGCCTCGCGCCCCGAACCAAACTCGGCAACTACCTGCAAATCAGGTTCCAGCCCCAGCAGCTGCGCAAAGCCGGAGCGGACGATGAGGTGATCGTCTATAAGGGCAACGGTGATCATGGTCTTGTCCTGGC‑GGGGAAAAAAAATACGCGCTTAC‑CTTAACGACAAACGCGAGTGTGTTCAAGCCTTGAACGGTTACTGaaaaacaaac > 2:148122/1‑233 (MQ=255)
cccccccccccccGGCCG‑CCCCGCCAGCGCCCCGCGCCCCGAACCAAGCTCGGCAACTACCTGCAAATCAGGTTCCAGCCCCAGCAGCTGCGCAAAGCCGGAGCGGACGATGAGGTGATCGTCTATAAGGGCAACGGTGATCATGGTCTTGTCCTGGC‑GGGTAAAAAAAATACGCGCTTAC‑CTTAACGATAAGCGCGATGTTGTTCAAGCCTTGAGCGGTTACTGAAAAAACACCGCGa < 1:597466/230‑1 (MQ=255)
cccccGCGCCCCGGCCGCCCCCGCCGGC‑CCTCGCCCCCCGAACCAAACCCGGCAACTTCCTGGAAAACAGGTTCCCTGCCCAGGCGCGGCCGAAAGGCGGGGGTGACGATGGGGTGATCCTTTATAAGGGCCACGGTGATCATGGGCTTGGCCTGGC‑GGGTAAAAAAAATACGCGCTTAC‑CTTAACGATAAGCGCGATGTTGTTCAAGCCTTGAGCGGTTACTGAAAAAACACCGCGAt < 1:533854/236‑1 (MQ=255)
acacCGCGCCCCGGCAG‑CCCCGCCAGCGCCTCGCGCCCCGAACCAAACTCGGCAACTACCTGCAAATCAGGTTCCAGCCCCAGCAGCTGCGCAAAGCCGGAGCGGACGATGAGGTGATCGTCTATAAGGGCAACGGTGATCATGGTCTTGTCCTGGC‑GGGTAAAAAAAATACGCGCTTAC‑CTTAACGATAAGCGCGATGTTGTTCAAGCCTTGAGCGGTTACTGAAAAAACACCGCGa < 2:750180/238‑1 (MQ=255)
ccccGCGCCCCGGCAG‑CCCCGCCAGCGCCTCGCGCCCCGAACCAAACCCGGCAACTACCTGCAAATCAGGTTCCAGCCCCAGCAGCTGCGCAAAGCCGGAGCGGACGATGAGGTGATCGTCTATAAGGGCAACGGTGATCATGGTCTTGTCCTGGC‑GGGTAAAAAAAATACGCGCTTAC‑CTTAACGATAAGCGCGATGTTGTTCAAGCCTTGAGCGGTTACTGAAAAAACACCGCGATc < 2:549307/237‑1 (MQ=255)
cgcCCCGGCAG‑CCCCGCCAGCGCCTCGCGCCCCGAACCAAACTCGGCAACTACCTGCAAATCAGGTTCCAGCCCCAGCAGCTGCGCAAAGCCGGAGCGGACGATGAGGTGATCGTCTATAAGGGCAACGGTGATCATGGTCTTGTCCTGGCGGGGAAAAAAAAAAACGC‑CTTAC‑CTTAACGATAAGGGCGATGTTGTTTAGGCCTTTAGCGGGTCCTGAAAAAAAACCACGATCTTGtt > 2:584056/1‑239 (MQ=255)
cgcCCCGGCAG‑CCCCGCCAGCGCCTCGCGCCCCGAACCAAACTCGGCAACTACCTGCAAATCAGGTTCCAGCCCCAGCAGCTGCGCAAAGCCGGAGCGGACGATGAGGTGATCGTCTATAAGGGCAACGGTGATCATGGTCTTGTCCTGGC‑GGGTAAAAAAAATACGCGCTTAC‑CTTAACGATAAGCGCGAAGTTGTTCAAGCCTTTAGGGGTTACTGAAAAAAAACCGCGATCTTGtt > 2:264108/1‑239 (MQ=255)
cgcCCCGGCAG‑CCCCGCCAGCGCCTCGCGCCCCGAACCAAACTCGGCAACTACCTGCAAATCAGGTTCCAGCCCCAGCAGCTGCGCAAAGCCGGAGCGGACGATGAGGTGATCGTCTATAAGGGCAACGGTGATCATGGTCTTGTCCTGGC‑GGGGTAAAAAAATACGCGCTTAC‑CTTTACGATTAGCGCCATGTTTTTCAAGACCTTAACGGTTCCTTGACAAACACCACGCTCTTGtt > 2:147649/1‑239 (MQ=255)
cgcCCCGGCAG‑CCCCGCCAGCGCCTCGCGCCCCGAACCAAACTCGGCAACTACCTGCAAATCAGGTTCCAGCCCCAGCAGCTGCGCAAAGCCGGAGCGGACGATGAGGTGATCGTCTATAAGGGCAACGGTGATCATGGTCTTGTCCTGGC‑GGGGAAAAAAAATACGCCATTAC‑CTTAACGGTAAACCCGATGTTGTTTAAACCTTGGGGGGTTACTTAAAAAAAACCCCGCACTTGtt > 2:664975/1‑239 (MQ=255)
cccGGCAC‑CCCCGCCAGCGCCTCGCGCCCCGAACCAAACCGCGGAACCACCTGCAAATCAGGGTCCAGCCCCAGCAGGTGCACAAAGCCGGAGCGGACGATGAGGTTATCGTCTATAAGGGCAACGGTGATCATGGTCTTGGCGTGGC‑GGGTAAAAAAAATACGCGCTTAC‑CTTAACGATAAGCGCGATGTTGTTCAAGCCTTGAGCGGTTACTGAAAAAACACCGCGATCTTGTTaaa < 1:834467/239‑1 (MQ=255)
ggCAG‑CCCCGCCAGCGCCTCGCGCCCCGAACCAAACTCGGCAACTACCTGCAAATCAGGTTCCAGCCCCAGCAGCTGCGCAAAGCCGGAGCGGACGATGAGGTGATCGTCTATAAGGGCAACGGTGATCATGGTCTTGTCCTGGC‑GGGTAAAAAAAATACGCGCTTAC‑CTTAACGATAAGCGCGATGTTGTTCAAGCCTTTAGCGGTTACTGAAAAAAAACCCCGAGCTTGTTAAACa > 2:248911/1‑238 (MQ=255)
cccccAGCGCCTCGCGCCCCGAACCAAACGCGGCAACTCCCTGCAAATCGGGTTCCAGCCCCAGCAGCTGCGCAAAGCCGGAGCGGACGATGAGGTGATCGTCTATAAGGGCAACGGTGATCATGGTCTTGTCCTGGC‑GGGTAAAAAAAATACGCGCTTAC‑CTTAACGATAAGCGCGATGTTGTTCAAGCCTTGAGCGGTTACTGAAAAAACACCGCGATCTTGTTAAACATCGtcgga < 1:247744/236‑1 (MQ=255)
ccGCAAGCGCCCCGCGCCCCCAACCAAAGCCGGCAACTACCGTCAAATCAGGTTCCAGCCCCAGGAGCTGTGCAAAGCCGGAGGGGACGATGAGGTGATCGTCTATAAGGGCAACGGTGATCATGGTCTGGTCCTGGC‑GGGTAAAAAAAATACGCGCTGAC‑CTTAACGATAAGCGCGATGTTGTTCAAGCCTTGAGCGGTTACTGAAAAAACACCGCGATCTTGTTAAACATCGtcgga < 1:100467/239‑1 (MQ=255)
ctccccccccGAACCAAACTGGGCAACTACCTGCAAAGCAGGTTCCAGCCCAAGACGCCGCGCAAAGCCGGAGCGGAAGATGAGGTGATCGTCTAAAAGGGCAACGGTTATCATGGTCTTGTCCTGGC‑GGGTAAAAAAAATACGCGCTTAC‑CTTAACGATAAGCGCGATGTTGTTCAAGCCTTGAGCGGTTACTGAAAAAACACCGCGATCTTGTTAAACATCGTCGGATCGGAC‑TGAt < 1:248911/233‑1 (MQ=255)
cgcgCCCCGAACCAAACTCGGCAACTACCTGCAAATCAGGTTCCAGCCCCAGCAGCTGCGCAAAGCCGGAGCGGACGATGAGGTGATCGTCTATAAGGGCAACGGTGATCATGGTCTTGTCCTGGC‑GGGGAAAAAAAAAACGGCCTTAC‑CTTAACGATAAGAGCCGTGTTGTTCCAACCTTTGGGGGGTACTGAAAAAACAACCCGGTCTTTTTAAAAACAGtcgggcagggctgaatc > 1:476495/1‑226 (MQ=255)
aaaCTCGGCAACTTCCTGCAAATCAGGTTCCAGCCCCAGCAGCTGCGCAAAGCCGGAGCGGACGATGAGGTGATCGTCTATAAGGGCAACGGTGATCATGGTCTTGTCCTGGC‑GGGTAAAAAAAATACGCGCTTAC‑CTTAACGATAAGCGCGATGTTGTTCAAGCCTTGAGCGGTTACTGAAAAAACACCGCGATCTTGTTAAACATCGTCGGATCGGAC‑TGATTACGCTGCACTTTCa < 2:313305/239‑1 (MQ=255)
aaaCCCGGCAACTACCTGCAAATCAGGTTCCAGCCCCAGCACGTTCGCAAAGCCGGAGCGGACGATGAGGTGATCGTCTATAAGGGCAACGGTGATCATGGTCTTGTCCTGGC‑GGGTAAAAAAAATACGCGCTTAC‑CTTAACGATAAGCGCGATGTTGTTCAAGCCTTGAGCGGTTACTGAAAAAACACCGCGATCTTGTTAAACATCGTCGGATCGGAC‑TGATTACGCTGCACTTTCa < 2:805103/239‑1 (MQ=255)
aaaCCCGGCAAATTCCTGCAAATCTGGTTCCAGCCCCAGCAGCCGCGCAAAGCCGGAGCGGACGACTAGGGGATCGTCTATAAGGGCAACGGTGATCATGGTCTTGTCCGGGC‑GGGTAAAAAAAAGACGCGCTTAC‑CTTAACGATAAGCGCGATGTTGTTCAAGCCTTGAGCGGTTACTGAAAAAACACCGCGATCTTGTTAAACATCGTCGGATCGGAC‑TGATTACGCTGCACTTTCa < 1:28782/239‑1 (MQ=255)
aCTGCCTGGAAATCAGGTTCCAGCCCCAGCAGCTTCGCAAAGGCGGAGCGGACGATGAGGTGATCGTCTATAAGGGCAACGGTGATCATGGTCTTGTCCTGGC‑GGGTAAAAAAAATACGCGCTTAC‑CTTAACGATAAGCGCGATGTTGTTCAAGCCTTGAGCGGTTACTGAAAAAACACCGCGATCTTGTTAAACATCGTCGGATCGGAC‑TGATTACGCTGCACTTTCACGACATCTTc < 2:108932/239‑1 (MQ=255)
ccTGCAAATCAGGTTCCAGCCCCAGCAGCTGCGCAAAGCCGGAGCGGACGATGAGGTGATCGTCTATAAGGGCAACGGTGATCATGGTCTTGTCCTGGC‑GGGTAAAAAAAATACGCGCTTAA‑CTTAACGATAAACGCGATGTTGTTCAAGCCTGTAAAGGTTACTGAAAAAAAACCGCCACCTTGTTAAACATCGCTGTGGCGGAC‑TGGTTAAGCCCCCCTTTTACCACAAATTCCa > 1:376979/1‑237 (MQ=255)
tggaaaTTAGGTTCCAGCCCCAGGAGCTGCGCAAAGCCGGAGCGGACGATGAGGTGATCGTCTATAAGGGCAACGGTGATCATGGTCTTGTCCTGGC‑GGGTAAAAAAAATACGTGCTTAC‑CTTAACGATAAGCGCGATGTTGTTCAAGCCTTGAGCGGTTACTGAAAAAACACCGCGATCTTGTTAAACATCGTCGGATCGGAC‑TGATTACGCTGCACTTTCACGACATCTTCCAGCtt < 2:197679/236‑1 (MQ=255)
tGCAAAGCAGGTTCCAGCCCCAGGAGCTGGCCAAAGCCGGAGCGGACGATGAGGTGATCGTCTATAAGGGCAACGGTGATCATGGTCGTGTCCTGGC‑GGGTAAAAAAAATACGCGCTTAC‑CTTAACGATAAGCGCGATGTTGTTCAAGCCTTGAGCGGTTACTGAAAAAACACCGCGATCTTGTTAAACATCGTCGGATCGGAC‑TGATTACGCTGCACTTTCACGACATCTTCCAGCtt < 2:773034/239‑1 (MQ=255)
gccAACTCAGGTTCCCGCCCCAGCCTCTGCTCAAGACCTGAGGTGACGATTGGGTGATTGTCTTTAAGGGCAACGGTGATCATGGTCTTGTCCAGGC‑GGGTAAAAAAAATACGCGCTTTC‑CTTAACGATAAGCGCGATGTTGTTCAAGCCTTGAGCGGTTACTGAAAAAACACCGCGATCTTGTTAAACATCGTCGGATCGGAC‑TGATTACGCTGCACTTTCACGACATCTTCCAGCtt < 1:597912/237‑1 (MQ=255)
tCAGGTTCCAGCCCCAGCAGCTGCGGAAAGCCGGAGCGGACGATGAGGTGATCGTCTATAAGGGCAACGGTGATCATGGTCTTGTCCTGGC‑GGGTAAAAAAAATACGCGCTTAC‑CTTAACGATAAGCGCGATGTTGTTCAAGCCTTGAGCGGTTACTGAAAAAACACCGCGATCTTGTTAAACATCGTCGGATCGGAC‑TGATTACGCTGCACTTTCACGACATCTTCCAGCTTATCGAt < 2:203209/239‑1 (MQ=255)
ggTTCCAGCCCCAGCAGCTGCGCAAAGCCGGAGCGGACGATGAGGTGATCGTCTATAAGGGCAACGGTGATCATGGTCTTGTCCTGGC‑GGGGAAAAAAAATACGCGCCTAC‑CTTAACGATAAGGGCGATGGTGTTCAAGCCTTGGACGGTTACTTAAAAAACACCGCGATCTTGTTAAAAATCGTCGGAACGGCA‑TGGTTACGACGCCCCTTCACGACAACTTCAAGCTTTTCGATTTg > 1:659260/1‑239 (MQ=255)
gTTCCAGCCCCAGCAGCTGCGCAAAGCCGGAGCGGACGATGAGGTGATCGTCTATAAGGGCAACGGTGATCATGGTCTTGTCCTGGC‑GGGTAAAAAAAATACGCGCTTAC‑CTTAACGATAAACGCGATGTTGTTCAAGCCTTGAGCGGTTACTGAAAAAACACCGCGATCTTGTTAAACATCGCGGGATCGGAC‑TGATTACGCTCCACTTTTCCGAAATCTTCCAGCTTATCGTTTTgg > 2:338424/1‑239 (MQ=255)
tCCAGCCCCAGCAGCTGCGAAAAGCCGGGGCGGACGAGGGGGTGATCTGCTATAAGGGCAACGGTGATCATGGTCTTGTCCTGGC‑GGGTAAAAAAAATACGCGCTTAC‑CTTAACGATAAGCGCGATGTTGTTCAAGCCTTGAGCGGTTACTGAAAAAACACCGCGATCTTGTTAAACATCGTCGGATCGGAC‑TGATTACGCTGCACTTTCACGACATCTTCCAGCTTATCGATTTGGc < 2:707603/238‑1 (MQ=255)
ccccggcgcggcgcAAAGCCGGGGCGGACGATGAGGTGATCGTTTATAAGGGCAACGGTGATCATGGTCTTGTCCTGGC‑GGGTAAAAAAAATACGCGCTTAC‑CTTAACGATAAGCGCGATGTTGTTCAAGCCTTGAGCGGTTACTGAAAAAACACCGCGATCTTGTTAAACATCGTCGGATCGGAC‑TGATTACGCTGCACTTTCACGACATCTTCCAGCTTATCGATTTGGCTTatcat < 1:580353/229‑1 (MQ=255)
cccAGCAGCTGCGCAAAGCCGGAGCGGACGATGAGGTGATCGTCTATAAGGGCAACGGTGATCATGGTCTTGTCCTGGC‑GGGTAAAAAAAATACGCGCTTAC‑CTTAACGATAAGCGCGATGTTGTTCAAGCCTTGAGCGGTTACTGAAAAAACACCGCGATCTTGTTAAACATCGTCGGATCGGAC‑TGATTACGCTGCACTTTCACGACATCTTCCAGCTTATCGATTTGGCTTatcat < 2:312313/239‑1 (MQ=255)
cccAGCAGCTGCGCAAAGCCGGAGCGGACGATGAGGTGATCGTCTATAAGGGCAACGGTGATCATGGTCTTGTCCTGGC‑GGGTAAAAAAAATACGCGCTTAC‑CTTAACGATAAGCGCGATGTTGTTCAAGCCTTGAGCGGTTACTGAAAAAACACCGCGATCTTGTTAAACATCGTCGGATCGGAC‑TGATTACGCTGCACTTTCACGACATCTTCCAGCTTATCGATTTGGCTTatcat < 2:65145/239‑1 (MQ=255)
cagcagCTGCGCAAAGCCGGAGCGGACGATGAGGTGATCGTCTATAAGGGCAACGGTGATCATGGTCTTGTCCTGGC‑GGGGAAAAAAAATACGCGCTTAC‑CTTAACGATAAGCGCGATGTTGTTCAAGCCTTGAGCGGTTACTGAAAAAACCCCGCGATCTTGTTAAACATCGTCGGATCGGAC‑CTGTTAAGCCTCACTTTCACCACAACTTCCAACTTTACGGTTTTGCTTatca > 1:701996/1‑236 (MQ=255)
gcAAAGCCGGAGCGGACGATGAGGTGATCGTCTATAAGGGCAACGGTGATCATGGTCTTGTCCTGGC‑GGGTAAAAAAAATACGCGCTTAC‑CTTAACGATAAGCGCGATGTTGTTCAAGCCTTGAGCGGTTACTGAAAAAACACCGCGATCTTGTTAAACATCGTCGGATCGGAC‑TGATTACGCTGCACTTTCACGACATCTTCCAGCTTATCGATTTGGCTTATCATCTGCTCCAGACg < 2:373670/239‑1 (MQ=255)
cggggggggcgttggtgggATCCTATATAAGGGCAAGGGTTCGCAGGGTATTTTCCTGGC‑GTGTAAAAGAAAATCGCGCTTAC‑CTTACCGATGAGCGCGATGTTGTTCAAGCCTTGGGCGGTTACTGAAAAAACCCCGCGATCTTGTTAAACATCGTCGGATCGGAC‑TGATTACGCTGCACTTTCACGACATCTTACAGCTTATCGATTTGGCTTATCATCGGCTCCAGACGCTGgt < 1:626069/219‑1 (MQ=255)
gAGCGGACGATGAGGTGATCGTCTATAAGGGCAACGGTGATCATGGTCTTGTCCTGGC‑GGGGAAAAAAAATACGCGCTTAC‑CTTAAAGCTAAGCGCGAGGTTGTTCCAGCCTTGGGCGGTTACTGGAAAAAAACCCCGGTCTTGTTAAACATCGGCGGACCGGAC‑TGGTTAAGCTGCACGTTACCGACATCTTCCAACTTATGGATTTGGCTCTTCAACTCTTCCACCCGCCGgtc‑gtc > 1:862613/1‑239 (MQ=255)
cGATGAGGTGATCGTCTATAAGGGCAACGGTTATCATGGTCTTGGCCTGGC‑GGGTAAAAAAAATACGCGCTTAC‑CTTAACGATAAGCGCGATGTTGTTCAAGCCTTGAGCGGTTACTGAAAAAACACCGCGATCTTGTTAAACATCGTCGGATCGGAC‑TGATTACGCTGCACTTTCACGACATCTTCCAGCTTATCGATTTGGCTTATCATCTGCTCCAGACGCTGGTC‑GTCATTGAc < 2:142297/238‑1 (MQ=255)
gaggAGGTGATCGTTTAAAAGGGCAACGGTGATCATGGTCTTGTCCTGGC‑GGGAAAAAAAAATACGCGCTTAC‑CTTAACGATAAGCGCGATGTTGTTCAAGCCTTGAGCGGTTACTGAAAAAACACCGCGATCTTGTTAAACATCGTCGGATCGGAC‑TGATTACGCTGCACTTTCACGACATCTTCCAGCTTATCGATTTGGCTTATCATCTGCTCCAGACGCTGGTC‑GTCATTGACCa < 2:163745/236‑1 (MQ=255)
tgtgtttttgtttataAGGGCAACCTTTACTATGGTTTTGTCCTGGC‑GGGTAACAAAAATCCGCGCTTAC‑CTAAACGATAAGCCGGATGTTGTTCAAGTCTTGAGCGGTTACTGAAAAAACACCGCGATCTTGCTAAACATCGTCGGATCGGAC‑TGATTACGCTGCACTTTCACGACATCTTCCAGCTTATCGATTTGGCTTATCATCTGCTCCAGACGCTGGTC‑GTCATTGACCAGTa < 1:240471/227‑1 (MQ=255)
ggTTATCTTTTATAAGGGCAACGGTGATCATGGTCTTGTCCTGGC‑GGGTAAAAAAAATACGCGCTTAC‑CCTAACGATAAGCGCTATGTTGTCCAAGTCTTGAGCGGTTACTGAAAAAACACCGCGATCTTGTTAAACATCGTCGTATCGGAC‑TGATTACGCTGCCCTTTCACGACATCTTCCAGCTTATCGATTTGGCTTATCATCTGCTCCAGACGCTGGTC‑GTCATTGACCAGTAGc < 1:148122/239‑1 (MQ=255)
tCGTCTATAAGGGCAACGGTGATCATGGTCTTGTCCTGGC‑GGGGAAAAAAAAAAACCGCTTAC‑CTTAACGCTAAGCGCGATTGTGTTCAAGCCTTTGGCGGGTAACGAAAAAAAACCGCGATCTTGTTAAACATCGTCGGATCGGGA‑TGATTAAGCGGCACTTTCACGACACTATCCAGCTTATCGGTTTTGCTTATCTTCTACCCCAGACCCCGgtcccgatttacccgaatcccaga > 1:526223/1‑218 (MQ=255)
cttttataAGGGCAACGTTGTCCATGGTCTTGTCCTGGC‑GGGTAAAAAAAATCCGGGCTTAC‑CTTAACGATAAGGGCGATGTTGTTCAAGCCTTGAGCGGTTACTGAAAAAACACCGCGATCTTGTTAAACATCGTCGGATCGGAC‑TGATTACGCTGCACTTTCACGACATCTTCCAGCTTATCGATTTGGCTTATCATCTGCTCCAGACGCTGGTC‑GTCATTGACCAGTAGCCAGat < 1:584056/234‑1 (MQ=255)
cggcTATAAGGGCAACGGTGATCATGGTCTTGTCCTGGC‑GGGTAAAAAAAATTCGCGCTTAC‑CTTAACGATAAGCGCGATGTTGTTCAAGCCTTGAGCGGTTACTGAAAAAACACCGCGATCTTGTTAAACATCGTCGGATCGGAC‑TGATTACGCTGCACTTTCACGACATCTTCCAGCTTATCGATTTGGCTTATCATCTGCTCCAGACGCTGGTC‑GTCATTGACCAGTAGCCAGat < 2:659260/235‑1 (MQ=255)
cAACGGTGATCATGGTCTTGTCCTGGC‑GGGTAAAAAAAATACGCGCTTAC‑CTTAACGATAAGCGCGATGTTGTTCAAGCCTTGAGCGGTTACTGAAAAAACACCGCGATCTTGTTAAACATCGTCGGATCGGAC‑TGATTACGCTGCACTTTCACGACATCTTCCAGCTTATCGATTTGGCTTATCATCTGCTCCAGACGCTGGTC‑GTCATTTACCAGTAg > 2:47329/1‑220 (MQ=255)
cAACGGTGATCATGGTCTTGTCCTGGC‑GGGTAAAAAAAATACGCGCTTAC‑CTTAACGATAAGCGCGATGTTGTTCAAGCCTTGAGCGGTTACTGAAAAAACACCGCGATCTTGTTAAACATCGTCGGATCGGAC‑TGATTACGCTGCACTTTCACGACATCTTCCAGCTTATCGATTTGGCTTATCATCTGCTCCAGACGCTGGTC‑GTCATTGACCAGTAg < 1:47329/220‑1 (MQ=255)
aaCGGTGATCATGGTCTTGTCCTGGC‑GGGTAAAAAAAATACGCGCTTAC‑CTTAACGATAAGCGCGATGTTGTTTAAACCTTGAGCGGTTACTTAAAAAACAACGCGCTCTTGTTAAACATCGTCGGGTAGGAC‑TGATTACACTGCAATTTCACAACATCTTCCCGCTTATCGATTTGGTTTATCATCTTCTCCCGACGCCGGTC‑GCCCTTGAACACAAGCCAAAAAAGGCTTTTGTCgg > 1:608580/1‑238 (MQ=255)
aaCGGTGATCATGGTCTTGTCCTGGC‑GGGTAAAAAAAATACGCGCTTAC‑CTTAACGATAAGCGCCGTGGTGTTCAAGGCTTGAGCGGTTACTGAAAAAACACCGCGCACTTGTTAAACCTCGTCGGATCGGCC‑TTGTTACGCTGCCCCTTCAAGACATCTCTCAGCTTCTCGATTTGGCTTATCTACCGCCCCGGACGCCGGTC‑GTCTTTTACCATTAGCCCACTAAGGCTTTTTTc > 1:167469/1‑237 (MQ=255)
aaCGGTGATCATGGTCTTGTCCTGGC‑GGGGAAAAAAAATACGCGCTTAC‑CTTAACGATAAGCGCGATGTTGTTCAAGCCTTTAGCGGTTACTGAAAAAAAACCGCGATCTTGTTAAACATCGTCGGATCGGAC‑TGATTACGCTGCACTTTTACGCCATCTTCCAACTTTTCGATTTGGCTTTTCTTTTTCTCCCAACCCTGGTC‑GCCATTGACCCGTAGCCCGAAATGGGtttttttgc > 1:140117/1‑234 (MQ=255)
aaCGGTGATCATGGTCTTGTCCGGGC‑GGGTAAAAAAAATTCGCGCTTAC‑CTTAACGATAAGCGCGATGTTGTTCAAGCCTGGAGCGGTTACGTAAAAAACACCGCGATCTTGTTAAACATCGGCGGATCGGAC‑TGATTACGCTGCACTTTCACGACATCTTCCAGCTTATCGATTTGGCTTATCATCTGCTCCAGACGCTGGTC‑GTCATTGACCAGTAGCCAGATATGGCTTTTGTCg < 2:345481/238‑1 (MQ=255)
aCGGTGATCATGGTCTTGTCCTGGC‑GGGTAAAAAAAATACGCGCTTAC‑CTTAACGATAAGCGCGATGTTGTTCAAGCCTTGAGCGGTTACTGAAAAAACACCGCGATCTTGTTAAAAATCGTCGGATCGGGA‑TGATTACGCCGCACCTTCACCACACCTTCCACCTTTTCGATTTGGCTTATCATCTGTCCCAGACGCCGGTCTGACTTTTCCCA‑TAACCAGATATGGCTTTTTTcccc > 1:745717/1‑236 (MQ=255)
aTCATGGTCTTGTCCTGGC‑GGGTAAAAAAAATACGCGCTTAC‑CTTAACGATAAGCGCGATGGTGTTCAAACCTTTAGCGGGTAATGAAAAAAAACCGCGATCTTGTTAAACATCGTCGGATCGGAC‑TGATTACGCTGCACTTTCACAACATCTTCCAGCTTATCGATTTGGGTTATCATCTGCTCCAGACGCCGGTC‑GCCATTTGCCAGTAGCCAAATAAGGCTTTTTGCCCCGTCCTg > 1:111769/1‑239 (MQ=255)
gtcttgtcttGGC‑GGGTAAAAAAAATCCGCGCTTGC‑CGTAACGATAAGCGCGATGTTGTTCAAGCCTTGAGCGGTTACTGAAAAAACACCGCGATCTTGTTAAACATCGTCGGATCGGAC‑TGATTACGCTGCACTTTCACGACATCTTCCAGCTTATCGATTTGGCTTATCATCTGCTCCAGACGCTGGTC‑GTCATTGACCAGTAGCCAGATATGGCTTTTGTCGCTGTCCTGAATCgg < 1:413297/239‑1 (MQ=255)
gtcttgtcttGGC‑GGGTAAAAAAAATACGCGCTTTC‑CTTAACGATAAGCGTGATCTTGGTCAAGCCTTTAGCGGTTACTGAAAAAACCCCGCGATCTTGTTAAACATCGTCGGATCGGAC‑TGATTACGCTGCACTTTCACGACATCTTCCAGCTTATCGATTTGGCTTATCATCTGCTCCAGACGCTGGTC‑GTCATTGACCAGTAGCCAGATATGGCTTTTGTCGCTGTCCTGAATCgg < 1:348215/239‑1 (MQ=255)
tcgtggccTGGA‑GGGTAAAAAAAAGACGGGCTTAC‑CTTAACGATAAGCGCGATGTTGTTCAAGCCTTGAGCGGTTACTGAAAAAACCCCGCGATCTTGTTAAACATCGTCGGATCGGAC‑TGATTACGCTGCACTTTCACGACATCTTCCAGCTTATCGATTTGGCTTATCATCTGCTCCAGACGCTGGTC‑GTCATTGACCAGTAGCCAGATATGGCTTTTGTCGCTGTCCTGAATCgg < 2:449883/232‑1 (MQ=255)
cTTGTCCTGGC‑GGGTAAAAAAAATACGCGCTTAC‑CTTAACGATAAGCGCGATGTTGTTCAAGCCTTGCGCGGTTACTGAAAAAACACCCCGATCTTTTTAAACATCTGCGGACCGGGC‑TGATTACGCTGCCCTTTCCCGACATATTCCACCTTTTAGCTTTTGCTTTCCATCCCCTCCCAACGCGGGTC‑GGCATTAACCACTAGCCAGAAATCGCtttttttcctctccgcaaatgggc > 1:511897/1‑219 (MQ=255)
cTTGTCCTGGC‑GGGTAAAAAAAATACGCGCTTAC‑CTTAACGATAAGCGCGATGTTGTTCAAGCCTTGAGCGGTTACTGAAAAAACACCGCGATCTTGTTAAACATCGTCGGATCGGAC‑TGATTACGCTGCACTTTCACGACATCTTCCAGCTTATCGATTTGGCTTATCATCTGCTCCAGACGCTGGTC‑GTCATTGACCAGTAGCCAGATATGGCTTTTGTCGCTGTCCTGAATCGGCa < 2:36221/239‑1 (MQ=255)
ttGGCCGGGC‑GGGTAAAAAAAATACGCGCTTTC‑CTTAAACATAAGCGCGATGTTGTTCAAGCCTTGAGCGGTTACTGAAAAAACACCGCGATCTTGGTAAACATCGTCGGATCGGAC‑TGATTACGCTGCACTTTCACGACATCGTCCAGCTTATCGATTTGGCGTATCATCTGCTCCAGACGCTGGTC‑GTCATTGACCAGTAGCCAGATATGGCTTTTGTCGCTGTCCTGAATCGGCAg < 1:147649/239‑1 (MQ=255)
tGTCCTGGC‑GGGTAAAAAAAATACGCGCTTAC‑CTTAACGATAAGCGCGATGTTGTTCAAGCCTTGCGCGGTTACTGAAAAAACACCGCGATCTTGTTAAACATCGTCGGGTCGGGC‑TGGTTACGCTGCACTTTCCCGCCATCTTCCAACCTATCGATTTGGCTTATCATATGCTCCCGAAGCTGGTC‑GTCCTTGTCCCGTCGCCAGATTTGGGGTTTTTCGCTTTTCTCAAATGGCAGa > 1:323241/1‑239 (MQ=255)
ggC‑GGGTAAAAAAAATACGCGCTTAC‑CTTAACCATAAGCGCGCTGTGGTTCAAACCTTTAGCGGTTACTGAAAAAACACCGCGGTCTTGTTTAACATCGTCGGGTCGGAC‑TGGTTACGCTGCACTTTCCAGCCATCCTTCTTCTTATCGATTTGGCTTAGCATCTTCTCCATACGGCGGGC‑GGCATTGACCCGTAGCCAGATAATGTTTTTGTTGCTGcccgagtacggcagaaaaaaa > 1:895133/1‑221 (MQ=255)
ggggggTAAAAAAAATTCACGCTTCC‑CTTAACGATAAGCGCGATGGTGGTCAAGCCTTGAGCGGTTACTGAAAAGACCCCGCGATCGTGTTAAACATCGTCGGATCGGAC‑TGATTACGATGCACTTTCACGACATCTTCCAGCTTATCGATTTGGCTTATCATCTGCTCCAGACGCTGGTC‑GTCATTGACCAGTAGCCAGATATGGCTTTTGTCGCTGTCCTGAATCGGCAGACAAAGa < 2:55916/236‑1 (MQ=255)
aC‑CTTAACGATAAGCGCGATGGTGTTCAAGCCTTGAGCGGTTACTGAAAAAACACCGCGATCTTGTTAAACATCGTCGGATCGGAC‑TGATTACGCTGCACTTTCACGACATCTTCCAGCTTATCGATTTGGCTTATCATCTGCTCCAGACGCTGGTC‑GTCATTGACCAGTAGCCAGATATGGCTTTTGTCGCTGTCCTGAATCGGCAGACAAAGAATGCCTTCAACGTT‑AAAAGCgc‑gg < 2:767898/239‑1 (MQ=255)
aCGATAAGCGCGATGTTGTTCAAGCCTTGAGCGGTTACTGAAAAAACACCGCGATCTTGTTAAACATCGTCGGATCGGAC‑TGATTACGCTGCACTTTCACGACATCTTCCAGCTTATCGATTTGGCTTATCATCTGCTCCAGACGCTGGTC‑GTCATTGACCAGTAGCCAGATATGGCTTTTGTCGCTGTCCTGAATCGGCAGCAAAAGAATGCCCTCAACCTT‑AAAAACCC‑GGCgggga > 1:34785/1‑237 (MQ=255)
aCGATAAGCGCGATGTTGTTCAAGCCTTGAGCGGTTACTGAAAAAACACCGCGATCTTGTTAAACATCGTCGGATCGGAC‑TGATTACGCTGCACTTTCACGACATCTTCCAGCTTATCGATTTGGCTTATCATCTGCTCCAGACGCTGGTC‑GTCATTGACAAGTAGCCAGAATTGGCTTTTTTCGCTTTCCTGAATCGTGAGACAAAAAAAGCCTCCAACGTTAAAAAGCG‑‑GGCGGGCa > 1:767898/1‑239 (MQ=255)
tAAGCGCGATGTTGTTCAAGCCTTGAGCGGTTACTGAAAAAACACCGCGATCTTGTTAAACATCGTCGGATCGGAC‑TGATTACGCTGCACTTTCACGACATCTTCAAGCTTATCGATTTGGCTTATCATCTGCTCCAGACGCTGGTC‑GTCATTGACCAGTAGCCAGATATGGCTTTTTCCGCTGTCCTCAATTGGCAGACAAAAAAATCCTTACAAGTT‑AAAAGCGC‑AGGGGAGaaaaa > 1:20536/1‑239 (MQ=255)
tAAGCGCGATGTTGTGCAAGCCTTGAGGGGTTACTGAAAAAACCCCGCGATCTTGTTAAACATCGGCGGATCGGAC‑TGATTACGCTGCACTTTCACGTCATCTTCCAGCTTATCGATTTGGCTTATCATCTGCTCCAGACGCTGGTC‑GTCATTGACCAGTAGCCAGATATGGCTTTTGTCGCTGTCCTGAATCGGCAGACAAAGAATGCCTTCAACGTT‑AAAAGCGC‑GGCGGGCaaaaa < 2:862904/239‑1 (MQ=255)
aGCGCGATGTTGTTCAAGCCTTGAGCGGTTACTGAAAAAACACCGCGATCTTGTTAAACATCGTCGGATCGGAC‑TGATTACGCTGCACTTTCACGACATCTTCCAGCTTATCGATTTGGCTTATCATCTGCTCCAGACGCTGGTC‑GTCATTGACCAGTAGCCAGATATGGCTTTTTTCGCTGTCCTGAATCGGCAGCCAAAGAATGCCTTCAACGTT‑AAAAGCGC‑GGCGGGGCAAAAg > 2:824134/1‑238 (MQ=255)
aGCGCGATGTTGTTCAAGCCTTGAGCGGTTACTGAAAAAACACCGCGATCTTGTTAAACATCGTCGGATCGGAC‑TGATTACGCTGCACTTTCACGACATCTTCCAGCTTATCGATTTGGCTTATCATCTGCTCCAGACGCTGGTC‑GTCATTGACCAGTAGCCAGATATGGCTTTTGTCGCTTTCCTGAATCGGCCGACAAAAAATTCCTTCAACGGT‑AAAACGGC‑GGCGGGGAAAAAgg > 1:716733/1‑239 (MQ=255)
tggttgtgttCAATCCTTTGGGGGTTAGTTAAAAAGCCCCCGTATCTTGTTAAACATCGTCGGGTCGGAC‑TTATTACGCTGCACTTTCACGACATCTTCCAGCTTATCGATTGGGCTTATCATCTGCGCCAGACGCTGGTC‑GTCATTGTCCAGTAGCCAGATATGGCTTTTGTCGCTGTCCTGAATCGGCAGACAAAGAATGCCTTCAACGTT‑AAAAGCGC‑GGCGGGCAAAAAGGCcac < 1:355406/233‑1 (MQ=255)
aTGTTGTTCAAGCCTTGAGCGGTTACTGAAAAAACACCGCGATCTTGTTAAACATCGTCGGATCGGAC‑TGATTACGCTGCACTTTCACGACATCTTCCAGCTTATCGATTTGGCTTATCATCTGCTCCAGACGCTGGTC‑GTCATTGACCAGTAGCCAGATATGGCTTTTGTCGCTGTCCTGAATCGGCAGACAAAGAATGCCTTCAACGTT‑AAAAGCGC‑GGCGGGCAAAAAGGCccca > 2:259542/1‑238 (MQ=255)
ttgttTAAGCTTTTAGGGTTTACTGTAAAGTCCCCGCGTTTCTGATAAACCTTGTCGTGGCGGACGTGTTCAC‑CTGCACTTTCGAGAAATCTGCCAGCTTTACGGTTTGGCTTAGCATCTGCTACAGACGCTTGTC‑CTCATTGACCAGAAGCCAGGTTTGGCTTTTGTCGCTGTCCTGAATCGGCAGACAAAGAATGCCTTCAACTTT‑AAAAGCGC‑GGCGGGCATAAAGGCCAGAATCg < 1:491089/239‑1 (MQ=255)
ttgttCAAGCCTTGAGGGGTTACTGAAAAAACCCCGCGATCTTGTTAAACATCGTCGGATCGGAC‑TGATTACGCTGCACTTTCACGACATCTTCCAGCTTATCGATTTGGCTTATCATCTGCTCCAGACGCTGGTC‑GTCATTGACCAGTAGCCAGATATGGCTTTTGTCGCTGTCCTGAATCGGCAGACAAAGAATGCCTTCAACGTT‑AAAAGCGC‑GGCGGGCAAAAAGGCCACAAACg < 2:636824/239‑1 (MQ=255)
ttCAAGCCTTGAGCGGTTACTGAAAAAACACCGCGATCTTGTTAAACATCGTCGGATCGGAC‑TGATTACGCTGCACTTTCACGACATCTTCCAGCTTATCGATTTGGCTTATCATCTGCTCCAGACGCTGGTC‑GTCATTGACCAGTAGCCAGATATGGCTTTTGTCGCTGTACTGAATCGGCAGAACAAGAATGACTTCAAAGTT‑AAAAGAGCGGGGGGGCAAAAAgcaaaaaaacagg > 1:386350/1‑227 (MQ=255)
aaGCCTTGAGCGGTTACTGAAAAAACACCGCGATCTTGTTAAACATCGTCGGATCGGAC‑TGATTACGCTGCACTTTCACGACATCTTCCAGCTTATCGATTTGGCTTATCATCTGCTCCAGACGCTGGTC‑GTCATTGACCAGTAGCCAGATATGGCTTTTGTCGCTGTCCTGAATCGGCAGACAAAGAATGCCTTCAACGTT‑AAAAGCGC‑GGCGGGCAAAAAGGCCACAAACGgggg > 2:842337/1‑237 (MQ=255)
acccTTGTGGGGTTTCTGAAAAACCCCCGCGGTTTTCTTAAAGATTGTCGGGTGTGGT‑TGATTACGCTGCACTTGCACGACATCTTCCAGCTTATCGATTTGGCTTCTCATCTGCTCCAGACGCTGGTC‑GTCATTGACCAGTAGCCGGATATGGCTTTTGTCGCTGTCCTGAATCGGCAGACAAAGAATGCCTTCAACGTT‑AAAAGCGC‑GGCGGGCAAAAAGGCCACAAACGTGGGTCa < 1:736512/237‑1 (MQ=255)
gCCTTGAGCGGTTACTGAAAAAACACCGCGATCTTGTTAAACATCGTCGGATCGGAC‑TGATTACGCTGCACTTTCACGACATCTTCCAGCTTATCGATTTGGCTTATCATCTGCTCCAGACGCTGGTC‑GTCATTGACCAGTAGCCAGATATGGCTTTTGTCGCTGTCCTGAATCGGCAGACAAAGAATGCCTTCAACGTT‑AAAAGCGC‑GGCGGGCAAAAAGGCCACAAACGTGGGTCAt > 2:641014/1‑239 (MQ=255)
gAGCGGTTACTGAAAAAACACCGCGATCTTGTTAAACATCGTCGGATCGGAC‑TGATTACGCTGCACTTTCACGACATCTTCCAGCTTATCGATTTGGCTTATCATCTGCTCCAGACGCTGGTC‑GTCATTGACCAGTAGCCAGATATGGCTTTTGTCGCTGACCTGAATCGGCCGACAAAGAATGCCTTCCACGTT‑AAAAACGC‑GGCGGgccaaaaagccaaaaaaagggggcaaaaag > 1:363679/1‑224 (MQ=255)
|
ATCGCAAATACACACCTGCACACCGCGCCCCGGCAG‑CCCCGCCAGCGCCTCGCGCCCCGAACCAAACTCGGCAACTACCTGCAAATCAGGTTCCAGCCCCAGCAGCTGCGCAAAGCCGGAGCGGACGATGAGGTGATCGTCTATAAGGGCAACGGTGATCATGGTCTTGTCCTGGC‑GGGTAAAAAAAATACGCGCTTAC‑CTTAACGATAAGCGCGATGTTGTTCAAGCCTTGAGCGGTTACTGAAAAAACACCGCGATCTTGTTAAACATCGTCGGATCGGAC‑TGATTACGCTGCACTTTCACGACATCTTCCAGCTTATCGATTTGGCTTATCATCTGCTCCAGACGCTGGTC‑GTCATTGACCAGTAGCCAGATATGGCTTTTGTCGCTGTCCTGAATCGGCAGACAAAGAATGCCTTCAACGTT‑AAAAGCGC‑GGCGGGCAAAAAGGCCACAAACGTGGGTCATTACG > NC_000913/3850564‑3851032
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 13 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
N/A
