Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A23 F20 I1 R1
|
21 |
53.9 |
1121892 |
93.4% |
1047847 |
149.0 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
CP000730 |
2,224,814 |
T→C |
I121V (ATT→GTT) |
atpA ← |
F‑ATPase superfamily proton(H+)‑ or sodium (Na+)‑translocating F‑type ATPase epsilon alpha subunit |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | CP000730 | 2,224,814 | 0 | T | C | 100.0%
| 271.7
/ NA
| 78 | I121V (ATT→GTT) | atpA | F‑ATPase superfamily proton(H+)‑ or sodium (Na+)‑translocating F‑type ATPase epsilon alpha subunit |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (0/0); new base C (32/46); total (32/46) |
GATTAACTCACGTTGACCTCTACCAATTGGTACTAAAGCATCAATTGCTTTGATACCTGTTTGTAATGGCTCATCTACTGATTTACGATCCATTACACCAGTAGCTTTTTTCTCTACTGGACGTGTTTTAGTTGTGTTAATCGGTCCTTGTCCATCAATAGGTTGTCCTAATGGATTAACAACTCTTCCGATTAGTTCTTCACCTACTGGTACTTCCATGATACGACCAGTACGTTTAACTTCGTCACCTTCAGTAATACCTGTGTATGGTCCTAAAATAACCAC > CP000730/2224674‑2224958
|
tatTAACTCCCGTTGACCTCTACCAATTGGTACTAAAGCATCAATTGCTTTGATACCTGTTTGTAATGGCTCATCTACTGATTTACGATCCATTACACCAGTAGCTTTTTTCTCTACTGGACGTGTTTTAGTTGTGTTAACCGGTCCtt < 1:972625/148‑1 (MQ=255)
cTCACGTTGACCTCTACCAATTGGTACTAAAGCATCAATTGCTTTGATACCTGTTTGTAATGGCTCATCTACTGATTTACGATCCATTACACCAGTAGCTTTTTTCTCTACTGGACGTGTTTTAGTTGTGTTAACCGGTCCTTGTCCAt > 1:1008091/1‑149 (MQ=255)
cTCACCTTCACCTCTACCAATTTGTACTAAAGCATCAATTGCTTTGATACCTGTTTGTAATGGCTCATCTACTGATTTACGATCCATTACACCAGTAGCTTTTTTCTCTACTGGACGTGTTTTAGTTGTGTTAACCGGTCCTTGTCCAt < 1:776402/149‑1 (MQ=255)
cACGTTGACCTCTACCAATTGGTACTAAAGCATCAATTGCTTTGATACCTGTTTGTAATGGCTCATCTACTGATTTACGATCCATTACACCAGTAGCTTTTTTCTCTACTGGACGTGTTTTAGTTGTGTTAACCGGTCCTTGTCCATCa < 1:380101/149‑1 (MQ=255)
cACGTTGACCTCTACCAATTGGTACTAAAGCATCAATTGCTTTGATACCTGTTTGTAATGGCTCATCTACTGATTTACGATCCATTACACCAGTAGCTTTTTTCTCTACTGGACGTGTTTTAGTTGTGTTAACCGGTCCTTGTCCATCa > 1:398017/1‑149 (MQ=255)
cACGTTGACCCCTACCAATTGGTACTAAAGCATCAATTGCTTTGATACCTGTTTGTAATGGCTCATCTACTGATTTACGATCCATTACACCAGTAGCTTTTTTCTCTACTGGACGTGTTTTAGTTGTGTTAACCGGTCCTTGTCCATCa < 1:169954/149‑1 (MQ=255)
cACGGTTACCTCTACCAATTGGTACCACAGCATCAATTGCTTTGATACCTGTTTGTAATGGCTCATCTACTGATTTACGATCCATTACACCAGTAGCTTTTTTCTCTACTGGACGTGTTTTAGTTGTGTTAACCGGTCCTTGTCCATCa < 1:245329/149‑1 (MQ=255)
aCCTCTACCAATTGGTACTAAAGCATCAATTGCTTTGATACCTGTTTGTAATGGCTCATCTACTGATTTACGATCCATTACACCAGTAGCTTTTTTCTCTACTGGACGTGTTTTAGTTGTGTTAACCGGTCCTTGTCCATCAATAGGtt > 1:907540/1‑149 (MQ=255)
ccTCTACCAATTGGTACTAAAGCATCAATTGCTTTGATACCTGTTTGTAATGGCTCATCTACTGATTTACGATCCATTACACCAGTAGCTTTTTTCTCTACTGGACGTGTTTTAGTTGTGTTAACCGGTCCTTGTCCATCAATAGGTTg < 1:328529/149‑1 (MQ=255)
tctACCAATTGGTACTAAAGCATCAATTGCTTTGATACCTGTTTGTAATGGCTCATCTACTGATTTACGATCCATTACACCAGTAGCTTTTTTCTCTACTGGACGTGTTTTAGTTGTGTTAACCGGTCCTTGTCCATCAATAGGTTGTc < 1:170945/149‑1 (MQ=255)
ccAATTGGTACTAAAGCATCAATTGCTTTGATACCTGTTTGTAATGGCTCATCTACTGATTTACGATCCATTACACCAGTAGCTTTTTTCTCTACTGGACGTGTTTTAGTTGTGTTAACCGGTCCTTGTCCATCAATAGGTTGTCCTaa < 1:493680/149‑1 (MQ=255)
ccAATTGGTACTAAAGCATCAATTGCTTTGATACCTGTTTGTAATGGCTCATCTACTGATTTACGATCCATTACACCAGTAGCTTTTTTCTCTACTGGACGTGGTTTAGTTGTGTTAACCGGTCCTTGTCCATCAATAGGTTGTCCTaa > 1:1063253/1‑149 (MQ=255)
aaTTGGTACTAAAGCATCCATTGCTTTTATACTTTTTTTGAATGGCTCATCTACTGATTTACGATCCATTACACCAGTAGCTTTTTTCTCTACTGGACGTGTTTTAGTTGTGTTAACCGGTCCTTGTCCATCAATAGGTTGTCCTAATg < 1:206805/149‑1 (MQ=255)
aaTTGGTACTAAAGCATCAATTGCTTTGATACCTGTTTGTAATGGCTCATCTACTGATTTACGATCCATTACACCAGTAGCTTTTTTCTCTACTGGACGTGTTTTAGTTGTGTTAACCGGTCCTTGTCCATCAATAGGTTGTCCTAATg < 1:52773/149‑1 (MQ=255)
aaTTGGTACTAAAGCATCAATTGCTTTGATACCTGTTTGTAATGGCTCATCTACTGATTTACGATCCATTACACCAGTAGCTTTTTTCTCGACTGGACGTGTTTTAGTTGTGTTAACCGGTCCTTGTCCATCAATAGGTTGTCCTAATg < 1:159751/149‑1 (MQ=255)
ttGGTACTATAGCATCAATTGCTTTGATACCTGTTTGTAATGGCTCATCTACTGATTTACGATCCATTACACCAGTAGCTTTTTTCTCTACTGGACGTGTTTTAGTTGTGTTAACCGGTCCTTGTCCATCAATAGGTTGTCCTAATGGa < 1:750311/149‑1 (MQ=255)
ttGGTACTAAAGCATCAATTGCTTTGATACCTGTTTGTAATGGCTCATCTACTGATTTACGATCCATTACACCAGTAGCTTTTTTCTCTACTGGACGTGTTTTAGTTGTGTTCACCGGTCCTTGTCCATCAATAGGTTGTCCTAATGGa > 1:550923/1‑149 (MQ=255)
ttGGTACTAAAGCATCAATTGCTTTGATACCTGTTTGTAATGGCTCATCTACTGATTTACGATCCATTACACCAGTAGCTTTTTTCTCTACTGGACGTGTTTTAGTTGTGTTAACCGGTCCTTGTCCATCAATAGGTTGTCCTAATGGa > 1:237367/1‑149 (MQ=255)
cTAAAGCATCAATTGCTTTGATACCTGTTTGTAATGGCTCATCTACTGATTTACGATCCATTACACCAGTAGCTTTTTTCTCTACTGGACGTGTTTTAGTTGTGTTAACCGGTCCTTGTCCATCAATAGGTTGTCCTAATGGATTaaca < 1:361709/149‑1 (MQ=255)
cTAAAGCATCAATTGCTATGATACCTGTTTGTAATGGCTCATCTACTGATTTACGATCCATTACACCAGTAGCTTTTTTCTCTACTGGACGTGTTTTAGTTGTGTTAACCGGTCCTTGTCCATCAATAGGTTGTCCTAATGGATTaaca > 1:964034/1‑149 (MQ=255)
gCATCAATTGCTTTGATACCTGTTTGTAATGGCTCATCTACTGATTTACGATCCATTACACCAGTAGCTTTTTTCTCTACTGGACGTGTTTTAGTTGTGTTAACCGGTCCTTGTCCATCAATAGGTTGTCCTAATGGATTAACAActct > 1:1046321/1‑149 (MQ=255)
cATCAATTGCTTTGATACCTGTTTGTAATGGCTCATCTACTGATTTACGATCCATTACACCAGTAGCTTTTTTCTCTACTGGACGTGTTTTAGTTGTGTTAACCGGTCCTTGTCCATCAATAGGTTGTCCTAATGGATTAACAACTCtt < 1:1065112/149‑1 (MQ=255)
tCAATTGCTTTGATACCTGTTTGTAATGGCTCTCCTACTGATTTACGATCCATTACACCAGTAGCTTTTTTCTCTACTGGACGTGTTTTAGTTGTGTTAACCGGTCCTTGTCCATCAATAGGTTGTCCTAATGGATTAACAACTCTTcc < 1:1035164/149‑1 (MQ=255)
cAATTGCTTTGATACTTGTTTGTAATGGCTCATCTACTGATTTACGATCCATTACACCAGTAGCTTTTTTCTCTACTGGACGTGTTTTAGTTGTGTTAACCGGTCCTTGTCCATCAATAGCTTATCCTAATGGATTAACAACTCTTCCg < 1:790005/149‑1 (MQ=255)
aTTGCTTTGATACCTGTTTGTAATGGCTCATCTACTGATTTACGATCCATTACACCAGTAGCTTTTTTCTCTACTGGACGTGTTTTAGTTGTGTTAACCGGTCCTTGTCCATCAATAGGTTGTCCAAATGGATCAACCAATCTTCCGAt > 1:176004/1‑149 (MQ=255)
cTTTGATACCTGTTTGTAATGGCTCATCTACTGATTTACGATCCATTACACCAGTAGCTTTTTTCTCTACTGGACGTGTTTTAGTTGTGTTAACCGGTCCTTGTCCATCAATAGGTTGTCCTAATGGATTAACAACTCTTCCGCTTAGt > 1:436227/1‑149 (MQ=255)
tttGATACCTGTTTGTAATGGCTCATCTACTGATTTACGATCCATTACACCAGTAGCTTTTTTCTCTACTGGACGTGTTTTAGTTGTGTTAACCGGTCCTTGTCCATCAATAGGTTGTCCTAATGGATTAACAACTCTTCCGATTAGtt < 1:1032897/149‑1 (MQ=255)
aCCTGTTTGTAATGGCTCATCTACTGATTTACGATCCATTACACCAGTAGCTTTTTTCTCTACTGGACGTGTTTTAGTTGTGTTAACCGGTCCTTGTCCATCAATAGGTTGTCCTAATGGATTAACAACTCTTCCGATTAGTTCTTCAc < 1:535607/149‑1 (MQ=255)
ccTGTTTGTAATGGCTCATCTACTGATTTACGATCCATTACACCAGTAGCTTTTTTCTCTACTGGACGTGTTTTAGTTGTGTTAACCGGTCCTTGTCCATCAATAGGTTGTCCTAATGGATTAACAACTCTTCCGATTAGTTCTTCAcc > 1:179256/1‑149 (MQ=255)
ttGTAAGGGCTCATCTTCTGATTTACGATCCATTACACCAGTAGCTTTTTTCTCTACTGGACGTGTTTTAGTTGTGTTAACCGGTCCTTGTCCATCAATAGGTTGTCCTAATGGATTAACAACTCTTCCGATTAGTTCTTCACCTACTg < 1:160407/149‑1 (MQ=255)
tAATGGCTCATCTACTGATTTACGATCCATTACACCAGTAGCTTTTTTCTCTACTGGACGTGTTTTAGTTGTGTTAACCGGTCCTTGTCCATCAATAGGTTGTCCTAATGGATTAACAACTCTTCCGATTAGTTCTTCACCTACTGGTa < 1:341874/149‑1 (MQ=255)
aTGGCCAATCTACTGTGTTACGATCCATTACACCAGTAGCTTTTCTCTCTACTGGACGTGTTTTAGTTGTGTTAACCGGTCCGTGTCCATCAATAGGTTGTCCTAATGGATTAACAACTCTTCCGATTAGTTCTTCACCTACTGGTACt < 1:258982/149‑1 (MQ=255)
cTCATCTACTGATTTACGATCCATTACACCAGTAGCTTTTTTCTCTACTGGACGTGTTTTAGTTGTGTTAACCGGTCCTTGTCCATCAATAGGTTGTCCTAATGGATTAACAACTCTTCCGATTAGTTCTTCACCTACTGGTACTTCCa > 1:521526/1‑149 (MQ=255)
aTCTACCGATTTACGATCCATTACACCAGTAGCTTTTTTCTCTACTGGACGTGTTGTAGTTGTGTTAACCGGTCCTTGTCCATCAATAGGTTGTCCTAATGGATTAACAACTCTTCCGATTAGTTCTTCACCTACTGGTACTTCCATGa < 1:1120058/149‑1 (MQ=255)
tCTACTGATTTACGATCCATTACACCAGTAGCTTTTTTCTCTACTGGACGTGTTTTAGTTGTGTTAACCGGTCCTTGTCCATCAATAGGTTGTCCTAATGGATTAACAACTCTTCCGATTAGTTCTTCACCTACTGGTACTTCCATGAt > 1:633663/1‑149 (MQ=255)
tCTACTGATTTACGATCCATTACACCAGTAGCTTTTTTCTCTACTGGACGTGTTTTAGTTGTGTTAACCGGTCCTTGTCCATCAATAGGTTGTCCTAATGGATTAACAACTCTTCCGATTAGTTCTTCACCTACTGGTACTTCCATGAt < 1:168448/149‑1 (MQ=255)
tCTACTGATTTACGATCCATTACACCAGTAGCTTTTTTCTCTACTGGACGTGTTTTAGTTGTGTTAACCGGTCCTTGTCCATCAATAGGTTGTCCTAATGGATAAACCACACTTCCGGTTAGTTCTTCACCTACTGGTACTTCCATGAt > 1:864895/1‑149 (MQ=255)
tttACGATCCATTACACCAGTAGCTTTTTTCTCTACTGGACGTGTTTTAGTTGTGTTAACCGGTCCTTTTCCATCAATCGCTCGTCGTACTGGATTAACAACTCTTCCGATTAGTTCTTCACCTACTGGTACTACCCACATACGAGCAg > 1:262088/1‑149 (MQ=255)
cGATCCATTACACCAGTAGCTTTTTTCTCTACTGGACGTGTTTTAGTTGTGTTAACCGGTCCTTGTCCATCAATAGGTTGTCCTAATGGATTAACAACTCTTCCGATTAGTTCTTCACCTACTGGTACTTCCATGATACGACCAGTACg > 1:1066086/1‑149 (MQ=255)
gATCCATTACACCAGTAGCTTTTTTCTCTACTGGACGTGTTTTAGTTGTGTTAACCGGTCCTTGTCCATCAATAGGTTGTCCTAATGGATTAACAACTCTTCCGATTAGTTCTTCACCTACTGGTACTTCCATGATACGACCAGTCCGt > 1:342955/1‑149 (MQ=255)
gATCCATTACACCAGTAGCTTTTTTCTCTACTGGACGTGTTTTAGTTGTGTTAACCGGTCCTTGTCCATCAATAGGTTGTCCTAATGGATTAACAACTCTTCCGATTAGTTCTTCACCTACTGGTACTTCCATGATACGACCAGTACGt < 1:1029875/149‑1 (MQ=255)
gATCCATTAAACCAGTAGCTTCGTTCTCTACTGGACGTGTTTTAGTTGTGTTAACCGGTCCCTGTCCATCAATAGGTTGTCCTAATGGATTAACAACTCTTCCGATTAGTTCTTCACCTACTGGTACTTCCATGATACGACCAGTACGt < 1:292878/149‑1 (MQ=255)
ctCCATTACACCAGTAGCTTTTTTCTCTACTGGACGTGTTTTAGTTGTGTTAACCGGTCCTTGTCCATCAATAGGTTGTCCTAATGGATTAACAACTCTTCCGATTAGTTCTTCACCTACTGGTACTTCCATGATACGACCAGTACGtt < 1:59968/148‑1 (MQ=255)
acccATTACACCAGTAGCTTTTTTCTCTACTGGACGTGTTTTAGTTGTGTTAACCGGTCCTTGTCCATCAATAGGTTGTCCTAATGGATTAACAACTCTTCCGATTAGTTCTTCACCTACTGGTACTTCCATGATACGACCAGTACGtt < 1:421244/147‑1 (MQ=255)
aTCCCTTACACCAGTAGCTTTGTTCTCTTCTGGACGTGTTTTAGTTGTGTTACCCGAATTGATTGCGTCAATAGGTTGTCCTAATGGATTAACAACTCTTCCTATTAGTTCTTCACCTACTGGTACTTCCATGATACGACCAGTACGtt < 1:261017/149‑1 (MQ=255)
aTCAATTACACCAGTAGCTTTTTTCTCTACTGGACGTGTTTTAGTTGTGTTAACCGGTCCTTGTCCATCAATAGGTTGTCCTAATGGATTAACAACTCTTCCGATTAGTTCTTCACCTACTGGTACTTCCATGATACGACCAGTACGtt < 1:453352/149‑1 (MQ=255)
aTTACACCAGTAGCTTTTTTCTCTACTGGACGTGTTTTAGTTGTGTTAACCGGTCCTTGTCCATCAATAGGTTGTCCTAATGGATTAACAACTCTTCCGATTAGTTCTTCACCTACTGGTCCTTCCATGATACGACCAGTACGTTTAAc > 1:694871/1‑149 (MQ=255)
acacCAGTAGCTTTTTTCTCTACTGGACGTGTTTTAGTTGTGTTAACCGGTCCTTGTCCATCAATAGGTTGTCCTAATGGATTAACAACTCTTCCGATTAGTTCTTCCGCTACTGGTACTTCCATGATACGACCAGTACGTTTAACTTc > 1:796119/1‑149 (MQ=255)
acacCAGTAGCTTTTTTCTCTACTGGACGTGTTTTAGTTGTGTTAACCGGTCCTTGTCCATCAATAGGTTGTCCTAATGGATTAACAACTCTTCCGATTAGTTCTTCACCTACTGGTACTTCCATGATACGACCAGTACGTTTAACTTc < 1:474864/149‑1 (MQ=255)
acacCAGTAGCTTTTTTCTCTACTGGACGTGTTTTAGTTGTGTTAACCGGTCCTTGTCCATCAATAGGTTGTCCTAATGGATTAACAACTCTTCCGATTAGTTCTTCACCTACTGGTACTTCCATGATACGACCAGTACGTTTAACTTc < 1:88812/149‑1 (MQ=255)
acacCAGTAGCTTTTTTCTCTACTGGACGTGTTTTAGTTGTGTAATCCGGTCCTTGTCCATCAATAGGTTGTCCTAATGGATTAACAACTCTTCCGATTAGTTCTTCACCTACTGGTACTTCCATGATACGACCAGTACGTTTAACTTc < 1:27507/149‑1 (MQ=255)
cacCAGTAGCTTTTTTCTCTACTGGACGTGTTTTAGTTGTGTTAACCGGTCCTTGTCCATCAATAGGTTGTCCTAATGGATTAACAACTCTTCCGATTAGTTCTTCACCTACTGGTACTTCCATGATACGACCAGTACGTTTAACTTCg > 1:110134/1‑149 (MQ=255)
cccAGTAGCTTTTTTCTCTACTGGACGTGTTTTAGTTGTGTTAACCGGTCCTTGTCCATCAATAGGTTGTCCTAATGGATTAACAACTCTTCCGATTAGTTCTTCACCTACTGGTACTTCCATGATACGACCAGTACGTTTAACTTCGt < 1:975647/148‑1 (MQ=255)
acCAGTAGCTTTTTTCTCTACTGGACGTGTTTTAGTTGTGTTAACCGGTCCTTGTCCATCAATAGGTTGTCCTAATGGATTAACAACTCTTCCGATTAGTTCTTCACCTACTGGTACTTCCATGATAGGACCAGTAGGTTTAACTTCGt > 1:692103/1‑149 (MQ=255)
gTAGCTTTTCTCTCTACTGGACGTGTTTTAGTTGTGTTAACCGGTCCTTGTCCATCAATAGGTTGTCCTAATGGATTAACAACTCTTCCGATTAGTTCTTCACCTACTGGTACTTCCATGATACGACCAGTACGTTTAACTTCGTCAcc < 1:505910/149‑1 (MQ=255)
aGCTTTTTTCGCTACTGGACGTGTTTTAGTTGTGTTAACCGGTCCTTGTCCATCAATAGGTTGTCCTAATGGATTAACAACTCTTCCGATTAGTTCTTCACCTACTGGTACTTCCATGATACGACCAGTACGTTTAACTTCGTCACCtt < 1:305034/149‑1 (MQ=255)
tcTTTTCTCTCTACTGGACGTGTTTTAGTTGTGTTACCCGGTCCTTGTCCATCAATAGGTTGTCCTAATGGATTAACAACTCTTCCGATTAGTTCTTCACCTACTGGTACTTCCATGATACGACCAGTACGTTTAACTTCGTCACCTTc < 1:54796/148‑1 (MQ=255)
tgtttCTTTGCTGGACGTGTTGTAGTTGTGTTAACCGGTCCTTGTCCATCAATAGGTTGTCCTAATGGATTAACAACTCTTCCGATTAGTTCTTCACCTACTGGTACTTCCATGATACGACCAGTACGTTTAACTTCGTCACCTTCAGt < 1:776684/147‑1 (MQ=255)
tACTGGACGTGTTTTAGTTGTGTTAACCGGTCCTTGTCCATCAATAGGTTGTCCTAATGGATTAACAACTCTTGCGGTTAGTTCTTCACCTACTGGTACTTCCATGATACGACCACTCCGTTTAACTTCGTCACCTTCAGTAATACCtt > 1:990549/1‑148 (MQ=255)
tACTGGACGTGTTTTAGTTGTGTTAACCGGTCCTTGTCCATCAATAGGTTGTCCTAATGGATTAACAACTCTTCCGATTAGTTCTTCACCTACTGGTACTTCCATGATACGACCAGTACGTTTAACTTCGTCACCTTCACTAATAACtt > 1:940257/1‑148 (MQ=255)
cccggtcGTGTTTTAGTTGTGTTAACCGGTCCTTGTCCATCAATAGGTTGTCCTAATGGATTAACAACTCTTCCGATTAGTTCTTCACCTACTGGTACTTCCATGATACGACCAGTACGTTTAACTTCGTCACCTTCAGTAATACCtgt < 1:21155/143‑1 (MQ=255)
aCTGGACGTGTTTTAGGTGTGTTAACCGGTCCTTGTCCATCAATAGGTTGTCCTAATGGATTAACAACTCTTCCGATTAGTTCTTCACCTACTGGTACTTCCATGATACGACCAGTACGTTTAACTTCGTCACCTTCAGTAATACCtgt < 1:8873/149‑1 (MQ=255)
ttgACGTGTTTTAGTTGTGTGAACCGGTCCTTGTCCATCAATAGGTTGGCCTAATGGATTAACAACTCTTCCGATTCGTTCTTCACCTACTGGTACTTCCATGATACGACCAGTACGTTTAACTTCGTCACCTTCAGTAATACCTgtgt < 1:1075758/147‑1 (MQ=255)
ggACGTGTTTTAGTTGTGTTAACCGGTCCTTGTCCATCAATAGGTTGTCCTAATGGATTAACAACTCTTCCGATTAGTTCTTCACCTACTGGTACTTCCATGATACGACCAGTACGTTTAACTTCGTCACCTTCAGTAATACCTGTGTa > 1:498531/1‑149 (MQ=255)
gACGTGTTTTAGTTGTGTTAACCGGTCCTTGTCCATCAATAGGTTGTCCTAATGGATTAACAACTCTTCCGATTAGTTCTTCACCTACTGGTACTTCCATGATACGACCAGTACGTTTAACTTCTTCACCTTCAGTAATACCTgtgtct > 1:478981/1‑147 (MQ=255)
gACGTGTTTTAGTTGTGTTAACCGGTCCTTGTCCATCAATAGGTTGTCCTAATGGATTAACAACTCTTCCGATTAGTTCTTCACCTACTGGTACTTCCATGATACGACCAGTACGTTTAACTTCGTCACCTTCAGTAATACCTGTGTAt > 1:313169/1‑149 (MQ=255)
gtgtTTTAGTTGTGTTAACCGGTCCTTGTCCATCCATAGGTTGTCCTAATGGATTAACAACTCTTCCGATTAGTTCTTCACCTACTGGTACTTCCATGATACGACCAGTACGTTTAACTTCGTCACCTTCAGTAATACCTGTGTATGGt < 1:851692/149‑1 (MQ=255)
gtgtTTTAGTTGTGTTAACCGGTCCTTGTCCATCAATAGGTTGTCCTAATGGATTAACAACTCTTCCGATTAGTTCTTCACCTACTGGTACTTCCCTGATACGACCAGTACGTTTAACTTCGTCACCTTCAGTAATACCTGTGTATGGt < 1:1055250/149‑1 (MQ=255)
gtgtTTTAGTTGTGTTAACCGGTCCTTGTCCATCAATAGGTTGTCCTAATGGATTAACAACTCTTCCGATTAGTTCTTCACCTACTGGTACTTCCATGATACGACCAGTACGTTTAACTTCGTCACCTTCAGTAATACCTGTGTATGGt < 1:517423/149‑1 (MQ=255)
gtTTTAGTTGTGTTAACCGGTCCTTGTCCATCAATAGGTTGTCCTAATGGATTAACAACTCTTCCGATTAGTTCTTCACCTACTGGTACTTCCATGATACGACCAGTACGTTTAACTTCGTCACCTTCAGTAATACCTGTGTATGGTcc < 1:64190/149‑1 (MQ=255)
gtTTTAGTTGTGTTAACCGGTCCGTGTCCATCAATAGGTTGTCCTAATGGATTAACAACTCTTCCGATTAGTTCTTCACCTACTGGTACTTCCATGATACGACCAGTACGTTTAACTTCGTCACCTTCAGTAATACCTGTGTATGGTcc < 1:330785/149‑1 (MQ=255)
tttAGTTGTGTTAACCGGTCCTTGTCCATCAATAGGTTGTCCTAATGGATTAACAACTCTTCCGATTAGTTCTTCACCTACTGGTACTTCCATGATACGACCAGTACGTTTAACTTCGTCACCTTCAGTAATACCTGGGTATGGTGCTa > 1:194682/1‑149 (MQ=255)
ttAGTTGTGTTAACCGGTCCTTGTCCATCAATAGGTTGTCCTAATGGATTAACAACTCTTCCGATTAGTTCTTCACCTACTGGTACTTCCATGATACGACCAGTACGTTTAACTTCGTCACCTTCAGTAATACCTGTGTATGGTCCTaa > 1:588986/1‑149 (MQ=255)
ttGTGTTAACCGGTCCTTGTCCATCAATAGGTTGTCCTAATGGATTCACAACTCTTCCGATTAGTTCTTCACCTACTGGTACTTCCATGATACGACCAGTACGTTTAACTTCGTCACCTTCAGTAATACCTGTGTATGGTCCTAAAATa > 1:721643/1‑149 (MQ=255)
ttGTGTTAACCGGTCCTTGTCCATCAATAGGTTGTCCTAATGGATTAACAACTCTTCCGATTAGTTCTTCACCTACTGGTACTTCCATGATACGACCAGTACGTTTAACTTCGTCACCTTCAGTAATACCTGTGTATGGTCCTAAAATa > 1:722860/1‑149 (MQ=255)
ttGTGTTAACCGGTCCTTGTCCATCAAGGGGTTGTGCTAATGGATTAACAACTCTTACGATTAGTTCTTCACCTACTGGTACTTCCATGATACGACCAGTACGTTTAACTTCGTCACCTTCAGTAATACCTGTGTGTGGTCCTCAAATa > 1:604785/1‑149 (MQ=255)
gtgtTAACCGGTCCTTGTCCATCAATAGGTTGTCCTAATGGATTAACAACTCTTCCGATTAGTTCTTCACCTACTGGTACTTCCATGATACGACCAGTACGTTTAACTTCGTCACCTTCAGTAATACCTGTGTATGGTCCTAAAATAAc < 1:802093/149‑1 (MQ=255)
ttAACCGGTCCTTGTCCATCAATAGGTTGTCCTAATGGATTAACAACTCTTCCGGTTAGTTCTTCACCTACTGGTACTTCCATGATACGACCAGTAAGTTTCACTTCGTCACCTTCAGTAATTACTGTGTATGTTCCTGAAATAAcctc > 1:136532/1‑147 (MQ=255)
|
GATTAACTCACGTTGACCTCTACCAATTGGTACTAAAGCATCAATTGCTTTGATACCTGTTTGTAATGGCTCATCTACTGATTTACGATCCATTACACCAGTAGCTTTTTTCTCTACTGGACGTGTTTTAGTTGTGTTAATCGGTCCTTGTCCATCAATAGGTTGTCCTAATGGATTAACAACTCTTCCGATTAGTTCTTCACCTACTGGTACTTCCATGATACGACCAGTACGTTTAACTTCGTCACCTTCAGTAATACCTGTGTATGGTCCTAAAATAACCAC > CP000730/2224674‑2224958
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
N/A
