Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A9 F110 I0 R1
|
49 |
71.1 |
1529928 |
95.4% |
1459551 |
140.9 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
freq |
annotation |
gene |
description |
| RA |
CP000730 |
2,371,220 |
C→T |
17.1% |
intergenic (‑4337/+1221) |
rpmC ← / ← pbuG |
ribosomal protein L29/NCS2 family nucleobase:cation symporter‑2 |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | CP000730 | 2,371,220 | 0 | C | T | 17.1%
| 161.7
/ 24.6
| 70 | intergenic (‑4337/+1221) | rpmC/pbuG | ribosomal protein L29/NCS2 family nucleobase:cation symporter‑2 |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (39/19); new base T (7/5); total (46/24) |
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 7.39e-01 |
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 8.08e-01 |
CTTCTACTACTGTTACAGGGATTAATTCACCGTTTTCTCCGAATACTTGTGTCATCCCAATTTTTCTTCCTAAGATTCCTTTGGTCATCGAAAGTCCACCTCCTAAAATTGTCTATTATAATTTGATTTCGATGTCTACACCAGATGGTAAGTTTAAGCCCATTAAAGCGTCAACTGTTTTTGGTGTTGGGTTTACAATATCGATTAAACGTTTGTGTGTACGTTGTTCGAATTGTTCACGTGAATCTTTATACTTATGCACGGCACGGATGATTGTGTAA > CP000730/2371080‑2371360
|
cTTCTACTACTGTTACAGGGATTAATTATCAGAGTTCTCCGAATACTTGTGTCATCCCAATTTTTCTTCCTAAGATTCCTTTGGTCATCGAAAGTCCACCTCCTAAAATTGTCTATTATAATTTGATTTCGATGTCTacac > 1:366416/1‑141 (MQ=255)
tCTACTACTGTTACAGGGATTAATTCACCGTTTTCTCCGAATACTTGTGTCATCCCAATTTTTCTTCCTAAGATTCCTTTGGTCATCGAAAGTCCACCTCCTAAAATTGTCTATTATAATTTGATTTCGATGTCTACACCa < 2:127644/141‑1 (MQ=255)
tactacTGTTACAGGGATTAATTCACCGTTTTCTCCGAATACTTGTGTCATCCCAATTTTTCTTCCTAAGATTCCTTTGGTCATCGAAAGTCCACCTCCTAAAATTGTCTATTATAATTTGATTTCGATGTCTACACCAGa > 2:615008/1‑141 (MQ=255)
tactGTTACAGGGATTAATTCACCGTTTTCTCCGAATACTTGTGTCATCCCAATTTTTCTTCCTAAGATTCCTTTGGTCATCGAAAGTCCACCTCCTAAAATTGTCTATTATAATTTGATTTCGATGTCTACACCAGATgg > 2:552407/1‑141 (MQ=255)
tGTTACAGGGATTAATTCACCGTTTTCTCCGAATACTTGTGTCATCCCAATTTTTCTTCCTAAGATTCCTTTGGTCATCGAAAGTCCACCTCCTAAAATTGTCTATTATAATTTGATTTCGATGTCTACATCAGATGGTaa > 1:349200/1‑141 (MQ=255)
tGTTACAGGGATTAATTCACCGTTTTCTCCGAATACTTGTGTCATCCCAATTTTTCTTCCTAAGATTCCTTTGGTCATCGAAAGTCCACCTCCTAAAATTGTCTATTATAATTTGATTTCGATGTCTACATCAGATGGTaa > 1:349131/1‑141 (MQ=255)
gTTACAAGCATTAATTCCCCGTTTTCTCCTAATACTTGTGTCATCCCAATTTTTCTTCCTAAGATTCCTTTGGTCATCGAAAGTCCACCTCCTAAAATTGTCTATTATAATTTGATTTCGATGTCTACACCAGATGGTAAg < 2:458882/141‑1 (MQ=255)
ttACAGGGATTAATTCACCTTTTTCTCCGAATACTTGTGTCATCCCAATTTTTCTTCCTAAGATTCCTTTGGTCATCGAAAGTCCACCTCCTAAAATTGTCTATTATAATTTGATTTCGATGTCTACACCAGATGGTAAGt < 2:361008/141‑1 (MQ=255)
ggATTAATTCACCGTTTTCTCCGAATACTTGTGTCATCCCAATTTTTCTTCCTAAGATTCCTTTGGTCATCGAAAGTCCACCTCCTAAAATTGTCTATTATAATTTGATTTCGATGTCTACATCAGATGGTAAGTTTAAGc > 1:458808/1‑141 (MQ=255)
aTTAATTCACCGTTTTCTCCGAATACTTGTGTCATCCCAATTTTTCTTCCTAAGATTCCTTTGGTCATCGAAAGTCCACCTCCTAAAATTGTCTATTATAATTTGATTTCGATGTCTACACCAGATGGTAAGTTTAAGccc > 2:296140/1‑141 (MQ=255)
ttAATTCACCGTTTTCTCCGAATACTTGTGTCATCCCAATTTTTCTTCCTAAGATTCCTTTGGTCATCGAAAGTCCACCTCCTAAAATTGTCTATTATAATTTGATTTCGATGTCTACACCAGATGGTAAGTTTAAGccct > 1:650018/1‑140 (MQ=255)
ttAATTCACCGTTTTCTCCGAATACTTGTGTCATCCCAATTTTTCTTCCTAAGATTCCTTTGGTCATCGAAAGTCCACCTCCTAAAATTGTCTATTATAATTTGATTTCGATGTCTACACCAGATGGTAAGTTTAAGCCCa > 2:528352/1‑141 (MQ=255)
ttAATTCACCGTTTTCTCCGAATACTTGTGTCATCCCAATTTTTCTTCCTAAGATTCCTTTGGTCATCGAAAGTCCACCTCCTAAAATTGTCTATTATAATTTGATTTCGATGTCTACACCAGATGGTAAGTTTAAGCCCa > 2:685640/1‑141 (MQ=255)
ttAATTCACCGTTTTCTCAGCCTACTGTTGTTGGCCCAATTTTTCTTCCTAAGATTCCTTTGGTCATCGAAAGTCCACCTCCTAAAATTGTCTATTATAATTTGATTTCGATGTCTACACCAGATGGTAAGTTTAAGCCCa > 1:756046/1‑141 (MQ=255)
tAATTCACCGTTTTCTCCGAATACTTGTGTCATCCCAATTTTTCTTCCTAAGATTCCTTTGGTCATCGAAAGTCCACCTCCTAAAATTGTCTATTATAATTTGATTTCGATGTCTACACCAGATGGTAAGTTTAAGCCCAt > 1:624056/1‑141 (MQ=255)
ttCACCGTTTTCTCCGAATACTTGTGTCATCCCAATTTTTCTTCCTAAGATTCCTTTGGTCATCGAAAGTCCACCTCCTAAAATTGTCTATTATAATTTGATTTCGATGTCTACACCAGATGGTAAGTTTAAGCCCATTaa > 2:241731/1‑141 (MQ=255)
cACCGTTTTCTCCGAATACTTGTGTCATCCCAATTTTTCTTCCTAAGATTCCTTTGGTCATCGAAAGTCCACCTCCTAAAATTGTCTATTATAATTTGATTTCGATGTCTACACAAGATGGTAAGTTTAAGCCCATTAAAg > 2:383053/1‑141 (MQ=255)
aCCGTTTTCTCCGAATACTTGTGTCATCCCAATTTTTCTTCCAAAGATTCCTTTTTTCATCGAAAGTCCACCGCCTAAAATTGTCTATTATAATTTGATTTCGATGTCTACACCAGATGGTAAGTTTAAGCCCATTAAAGc < 1:143207/141‑1 (MQ=255)
ttttttCCGAATACTTGTTTCATCCCAATTTTTCTTCCTAAGGTTCCTTTGGTCATCGAAAGTCCACCTCCTAAAATTGTCTATTATAATTTGATTTCGATGTCTACACCAGATGGTAAGTTTAAGCCCATTAAAGCGTCa < 2:345881/141‑1 (MQ=255)
ttCTCCGAATACTTGTGTCATCCCAATTTTTCTTCCTAAGATTCCTTTGGTCATCGAAAGTCCACCTCCTAAAATTGTCTATTATAATTTGATTTCTATGTCTACACCAGATGGTAAGGTTAAGCCCATTAAAGCGTCAAc > 1:469915/1‑141 (MQ=255)
tcCGAATACTTGTGTCATCCCAATTTTTCTTCCTAAGATTCGTTTGGTCATCGAAAGTCCACCTCCTAAAATTGTCTATTATAATTTGATTTCGATGTCTACACCAGATGGTAAGTTTAAGCCCATTAAAGCGTCAACTGt < 2:96619/141‑1 (MQ=255)
tcCGAATACTTGTGTCATCCCAATTTTTCTTCCTAAGATTCCTTTGGTCATCGAAAGTCCACCTCCTAAAATTGTCTATTATAATTTGATTTCGCTGTCTACACCAGATGGTAAGTTTAAGCCCATTAAAGCGATAACTGt > 2:17002/1‑141 (MQ=255)
ccGAATACTTGTGTCATCCCAATTTTTCTTCCTAAGATTCCTTGGGTCATCGAAAGTCCACCTCCTAAAATTGTCTATTATAATTTGATTTCGATGTCTACACCAGATGGTAAGTTTAAGCCCATTAAAGCGTCAACTGtt < 2:313149/141‑1 (MQ=255)
aCTTGTGTCATCCCAATTTTTCTTCCTAAGATTCCTTTGGTCATCGAAAGTCCACCTCCTAAAATTGTCTATTATAATTTGATTTCGATGTCTACACCAGATGGTAAGTTTAAGCCCATTAAAGCGTCAACTGTTTTTGgt < 1:7637/141‑1 (MQ=255)
ttCATCCCAATTTTTCCTCCTAAGATTCCTTTGGTCATCGAAAGTCCACCTCCTAAAATTGTCTATTATAATTTGATTTCGATGTCTACATCAGATGGTAAGTTTAAGCCCATTAAAGCGTCAACTGTTTTTGGTGTTggg < 1:743180/140‑1 (MQ=255)
gtCATCCCAATTTTTCTTCCTAAGATTCCTTTGGTCATCGAAAGTCCACCTCCTAAAATTGTCTATTATAATTTGATTTCGATGTCTACATCAGATGGTAAGTTTAAGCCCATTAAAGCGTCAACTGTTTTTGGTGTTggg < 1:743280/141‑1 (MQ=255)
tCATCCCAATTTTTCTTCCTAAGATTCCTTTGGTCATCGAAAGTCCACCTCCTAAAATTGTCTATTATAATTTGATTTCGATGTCTACACCAGATGGTAAGTTTAAGCCCATTAAAGCGTCAACTGTTTTTGGTGTTGGGt < 1:91031/141‑1 (MQ=255)
tCCCAATTTTTCTTCCTAAGATTCCTTTGGTCATCGAAAGTCCACCTCCTAAAATTGTCTATTATAATTTGATTTCGATGTCTACACCAGATGGTAAGTTTAAGCCCATTAAAGCGTCAACTGTTTTTGGTGTTGGGTTTa > 1:119708/1‑141 (MQ=255)
tCCCAATTTTTCTTCCTAAGATTCCTTTGGTCATCGAAAGTCCACCTCCTAAAATTGTCTATTATAATTTGATTTCGATGTCTACACCAGATGGTAAGTTTAAGCCCATTAAAGCGTCAACTGTTTTTGGTGTTGGGTTTa > 1:665124/1‑141 (MQ=255)
cccAATTTTTCTTCCTAAGATTCCTTTGGTCATCGAAAGTCCACCTCCTAAAATTGTCTATTATAATTTGATTTCGATGTCTACACCAGATGGTAAGTTTAAGCCCATTAAAGCGTCAACTGTTTTTGGTGTTGGGTTTAc < 2:107117/141‑1 (MQ=255)
ttttttttttttCCTCTGGTCAGCGAAAGTCCACCTCCTAAAATTGTCTATTATAATTTGATTTCGATTTCTACACCACATGGTAATTTTAAGCCCATTACAGCTTCAGCTGTTTTTGGGGTTGGGTTTACAATATCGttt > 2:342000/11‑141 (MQ=255)
aTTCCTTTGGTCATCGAAAGTCCACCTCCTAAAATTGTCTATTATAATTTGATTTCGATGTCTACACCAGATGGTAAGTTTAAGCCCATTAAAGCGTCAACTGTTTTTGGTGTTGGGTTTACAATATCGATTAAACGTTtg < 1:7103/141‑1 (MQ=255)
tttGGTCATCGAAAGTCCACCTCCTAAAATTGTCTATTATAATTTGATTTCGATGTCTACATCAGATGGTAAGTTTAAGCCCATTAAAGCGTCAACTGTTTTTGGTGTTGGGTTTACAATATCGATTAAACGTTTgtgtgt > 1:576441/1‑141 (MQ=255)
ttGGTCATCGAAAGTACACGTCCTAAAATTGTCTATTATAATTTGATTTCGATGTCTACACCAGATGGTAAGTTTAAGCCCATTAAAGCGTCAACTGTTTTTGGTGTTGGGTTTACAATATCGATTAAACGTTTGTGTGTa > 1:567394/1‑141 (MQ=255)
ggTCATCGAAAGTCCACCTCCTAAAATTGTCTATTATAATTTGATTTCGATGTCTACACCAGATGGTAAGTTTAAGCCCATTAAAGCGTCAACTGTTTTTGGTGTTGGGTTTACAATATCGATTAAACGTTTGTGTGTACg < 1:243424/141‑1 (MQ=255)
aTCGAAAGTCCACCTCCTAAAATTGTCTATTATAATTTGATTTCGATGTCTACATCAGATGGTAAGTTTAAGCCCATTAAAGCGTCAACTGTTTTTGGTGTTGGGTTTACAATATCGATTAAACGTTTGTGTGTACgttgt < 2:458808/141‑1 (MQ=255)
tCGAAAGTCCACCTCCTAAAATTGTCTATTATAATTTGATTTCGATGTCTACACCAGATGGTAAGTTTAAGCCCATTAAAGCGTCAACTGTTTTTGGTGTTGGGTTTACAATATCGATTAAACGTTTGTGTGTACgttgtt > 2:624615/1‑141 (MQ=255)
tCGAAAGTCCACCTCCTAAAATTGTCTATTATAATTTGATTTCGATGTCTACACCAGATGGTAAGTTTAAGCCCATTAAAGCGTCAACCGTTTTTGGTGTTGGGTTTACAATATCGATTAAACGTTTGTGTGTACgttgtt > 2:228789/1‑141 (MQ=255)
cGAAAGTCCACCTCCTGAAATTGTCTATTATAATTTGATTTCGATGTCTACACCAGATGGTAAGTTTAAGCCCATTAAAGCGTCAACTGTTTTTGGTGTTGGGTTTACAATATCGATTAAACGTTTGTGTGTAGGTTGTTc > 1:450524/1‑141 (MQ=255)
cGAAAGTCCACCTCCTAAAATTGTCTATTATAATTTGATTTCGATGTCTACACCAGATGGTAAGTTTAAGCCCATTAAAGCGTCAACTGTTTTTGGTGTTGGGTTTACAATATCGATTAAACGTTTGTGTGTACGTTGTTc < 2:639668/141‑1 (MQ=255)
aaGTCCACCTCCTAAAATTGTCTATTATAATTTGATTTCGATGTCTACACCAGATGGTAAGTTTAAGCCCATTAAAGCGTCTACTGTTTTTGGTGTTGGGTTTACAATATCGATTAAACGTTTGTGTGTACGTTGTTCGaa > 1:51104/1‑141 (MQ=255)
aGTCCACCTCCTAAAATTGTCTATTATAATTTGATTTCGATGTCTACACCAGATGGTAAGTTTAAGCCCATTAAAGCGTTAACTGTTTTTGGTGTTGGGTTTACAATATCGATTAAACGTTTGCGTGTACGTTGTTCGAAt < 2:616273/141‑1 (MQ=255)
ccACCTCCTAAAATTGTCTATTATAATTTGATTTCGATGTCTACACCAGATGGTAAGTTTAAGCCCATTAAAGCGTCAACTGTTTTTGGTGTTGGGTTTACAATATCGATTAAACGTTTGTGTGTACGTTGTTCGAATTGt > 2:572725/1‑141 (MQ=255)
ccACCTCCTAAAATTGTCTATTATAATTTGATTTCGATGTCTACACCAGATGGTAAGTTTAAGCCCATTAAAGCGTCAACTGTTTTTGGTGTTGGGTTTACAATATCGATTAAACGTTTGTGTGTACGTTGTTCGAATTGt > 2:413109/1‑141 (MQ=255)
ctcctAAAATTGTCTATTATAATTTGATTTCGATGTCTACACCAGATGGTAAGTTTAAGCCCATTAAAGCGTCAACTGTTTTTGGTGTTGGGTTTACAATATCGATTAAACGTTTGTGTGTACGTTGTTCGAATTGTTCAc < 2:469915/141‑1 (MQ=255)
tAAAATTGTCTATTATAATTTGATTTCGATGTCTACACCAGATGGTAAGTTTAAGCCCATTAAAGCGTCAACTGTTTTTGGTGTTGGGTTTACAATATCGATTAAACGTTTGTGTGTACGTTGTTCGCATTTTTCACGTGa > 1:50658/1‑141 (MQ=255)
aaTTGTCTATTATAATTTGATTTCGATGTCTACACCAGATGGTAAGTTTAAGCCCATTAAAGCGTCAACTGTTTTTGGTGTTGGGTTTACAATATCGATTAAACGTTTGTGTGTACGTTGGTCGAATTGTTCACGTGAATc > 1:89062/1‑141 (MQ=255)
aTTGTCTATTATAATTTGATTTCGATGTCTACACCAGATGGTAAGTTTAAGCCCATTAAAGCGTCAACTGTTTTTGGTGTTGGGTTTACAATATCGATTAAACGTTTGTGTGTACGTTGTTCGAGTTGTTCACGTGAATCt > 1:349900/1‑141 (MQ=255)
ttGTCTATTATAATTTGATTTCGATGTCTACACCAGATGGTAAGTTTAAGCCCATTAAAGCGTCAACTGTTTTTGGTGTTGGGTTTACAATATCGATTAAACGTTTGTGTGTACGTTGTTCGAATTGTTCACGTGAATCtt > 1:206836/1‑141 (MQ=255)
ttGTCTATTATAATTTGATTTCGATGTCCACACCAGATGGTAAGTTTAAGCCCATTAAAGCGTCAACTGTTTTTGGTGTTGGGTTTACAATATCGATTAAACGTTTGTGTGTACGTTGTTCGAATTGTTCACGTGAATCtt < 1:528352/141‑1 (MQ=255)
tGTCTATTATAATTTGATTTCGATGTCTACATCAGATGGTAAGTTTAAGCCCATTAAAGCGTCAACTGTTTTTGGTGTTGGGTTTACAATATCGATTAAACGTTTGTGTGTACGTTGTTCGAATTGTTCACGTGAATCttt > 2:98411/1‑141 (MQ=255)
tGTCTATTATAATTTGATTTCGATGTCTACACCAGATGGTAAGTTTAAGCCCATTAAAGCGTCAACTGTTTTTGGTGTTGGGTTTACAATATCGATTAAACGTTTGTGTGTACGTTGTTCGAATTGTTCACGTGAATAttt > 1:249881/1‑141 (MQ=255)
tCTATTATAATTTGATTTCGATGTCTACACCAGATGGTAAGTTTAAGGCCATTAAAGCGTCAACTGTTGTTGGTGTTGGGTTTACAATATCGATTAAACGTTTGTGTGTACGTTGTTCGAATTGTTCACGTGAATCtttct > 1:150395/1‑139 (MQ=255)
tCTATTATAATTTGATTTCGATGTCTACACCAGATGGTAAGTTTAAGCCCATTAAAGCGTCAACTGTTTTTGGTGTTGGGTTTACAATATCGATTAAACGTTTGTGTGTACGTTGTTCGAATTGTTCACGTGAATCTTtat < 1:296140/141‑1 (MQ=255)
cTATTATAATTTGATTTCGATGTCTACACCAGATGGTAAGTTTAAGCCCATTAAAGCGTCAACTGTTTTTGGTGTTGGGTTTACAATATCGATTAAACGTTTGTGTGTACGTTGTTCGAATTGTTCACGTGAATCTTtata > 1:141646/1‑141 (MQ=255)
cTATTATAATTTGATATCGATGTCTACACCAGATGGTAAGTTTAAGCCCATTAAAGCGTCAACTGTTTTTGGTGTTGGGTTTACAATATCGATTAAACGTTTGTGTGTACGTTGTTCGAATTGTTCACGTGAATCTTtata > 1:379267/1‑141 (MQ=255)
attatAATTTGATTTCGATGTCTACACCAGATGGTAAGTTTAAGCCCATTAAAGCGTCAACTGTTTTTGGTGTTGGGTTTACAATATCGATTAAACGTTTGTGTGTACGTTGTTCGAATTGTTCACGTGAATCTTTATACt > 2:722856/1‑141 (MQ=255)
attatAATTTGATTTAAATGTGTAAACCAGATGGTAAGTTTAAGCCCATTAAAGCGTCAACTGTTTTTGGTGTTGGGTTTACAATATCGATTAAACGTTTGTGTGTACGTTGTTCGAATTGTTCACGTGAATCTTTATACt > 2:163347/1‑141 (MQ=255)
tataATTTGATTTCGATGTCTACATCAGATGGTAAGTTTAAGCCCATTAAAGCGTCAACTGTTTTTGGTGTTGGGTTTACAATATCGATTAAACGTTTGTGTGTACGTTGTTCGAATTGTTCACGTGAATCTTTATACTTa < 1:12366/141‑1 (MQ=255)
taATTTGATTTCGATGTCTACACCAGATGGTAAGTTTAAGCCCATTAAAGCGTCAACTGTTTTTGGTGTTGGGTTTACAATATCGATTAAACGTTTGTGTGTACGTTGTTCGAATTGTTCACGTGCATCTTTATACTTTTg > 2:127115/1‑141 (MQ=255)
tcgATTTCGATCTCTACACCAGATGGTAAGTTTAAGCCCATTAAAGCGTCAACTGTTATTGGAGTGGGGTTTACAATATCGATTAAACGTTTGTGTGTACGTTGTTCGAATTGTTCACGTGAATCTTTATACTTATgcacg > 2:317260/3‑141 (MQ=255)
gATTTCGATGTCTACACCAGATGGTAAGTTTAAGCCCATTAAAGCGTCAACTGTTTTTGGTGTTGGGTTTACAATATCGATTAAACGTTTGTGTGTACGTTGTTCGAATTGTTCACGTGAATCTTTATACTTATgcacggc > 2:446901/1‑141 (MQ=255)
gATTTCGATGTCTACACCAGATGGTAAGTTTAAGCCCATTAAAGCGTCAACTGTTTTTGGTGTTGGGTTTACAATATCGATGAAACGTTTGTGTGTACGTTGTTCGAATTGTTCACGTGAATCTTTATACTTATgcacggc > 1:342455/1‑141 (MQ=255)
aTTTCGATGTCTACATCAGATGGTAAGTTTAAGCCCATTAAAGCGTCAACTGTTTTTGGTGTTGGGTTTACAATATCGATTAAACGTTTGTGTGTACGTTGTTCGAATTGTTCACGTGAATCTTTATACTTATgcacggca > 2:280437/1‑141 (MQ=255)
ttCTATGTCTACCCCAGATGGTTAGTTTAAGCCCATTAAAGCGTCAATTGCTTTTGGTGTTGGGTTTACAATATCGATTAAACGTTTGTGTGTACGTTGTTCGAATTGTTCACGTGAATCTTTATACTTATgcacggcacg < 2:518419/141‑1 (MQ=255)
ttCGATGTCTACACCAGATGGTAAGTTTAAGCCCATTAAAGCGTCAACTGTTTTTGGTGTTGGGTTTACAATATCGATTAAACGTTTGTGTGTACGTTGTTCGAATTGTTCACGTGAATCTTTATACTTATgcacggcacg > 2:639866/1‑141 (MQ=255)
ttCGATGTCTACACCAGATGGTAAGTTTAAGCCCATTAAAGCGTCAACTGTTTTTGGTGTTGGGTTTACAATATCGATTAAACGTTTGTGTGTACGTTGTTCGAATTGTTCACGTGAATCTTTATACTTATgcacggcacg < 1:615008/141‑1 (MQ=255)
gATGTCTACACCAGATGGTAAGTTTAAGCCCATTAAAGCGTCAACTGTTTTTGGTGTTGGGTTTACAATATCGATTAAACGTTTGTGTGTACGTTGTTCGAATTGTTCACGTGAATCTTTATACTTATGCACGGCACGgat > 1:531160/1‑141 (MQ=255)
tGTCTACCTCAGATGGTAAGTTTAAGCCCATTAAAGCGTCAACTGTTTTTGGTGTTGGGTTTACAATATCGATTAAACGTTTGTGTGTACGTTGTTCGAATTGTTCACGTGAATCTTTATACTTATGCACGGCACGgatga < 2:58202/141‑1 (MQ=255)
cTACATCAGATGGTAAGTTTAAGCCCATTAAAGCGTCAACTGTTTTTGGTGTTGGGTTTACAATATCGATTAAACGTTTGTGTGTACGTTGTTCGAATTGTTCACGTGAATCTTTATACTTATGCACGGCACGGATGATtg > 1:695025/1‑141 (MQ=255)
tACACCAGATGGTAAGTTTAAGCCCATTAAAGCGTCAACTGTTTTTGGTGTTGGGTTTACAATATCGATTAAACGTTTGTGTGTACGTTGTTCGAATTGTTCACGTGAATCTTTATACTTATGCACGGCACGGATGATtgt > 1:425781/1‑141 (MQ=255)
ccAGATGGTAAGTTTAAGCCCATTAAAGCGTCAACTGTTTTTGGTGTTGGGTTTACAATATCGATTAAACGTTTGTGTGTGCGTTGTGGGAATTGTTCACGTGAATCTTTATACTTATGCACGGCACGGATGATTGTGTaa > 1:61643/1‑141 (MQ=255)
|
CTTCTACTACTGTTACAGGGATTAATTCACCGTTTTCTCCGAATACTTGTGTCATCCCAATTTTTCTTCCTAAGATTCCTTTGGTCATCGAAAGTCCACCTCCTAAAATTGTCTATTATAATTTGATTTCGATGTCTACACCAGATGGTAAGTTTAAGCCCATTAAAGCGTCAACTGTTTTTGGTGTTGGGTTTACAATATCGATTAAACGTTTGTGTGTACGTTGTTCGAATTGTTCACGTGAATCTTTATACTTATGCACGGCACGGATGATTGTGTAA > CP000730/2371080‑2371360
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
N/A
