Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A34 F5 I0 R1
|
408 |
67.6 |
2494072 |
96.8% |
2414261 |
139.8 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
freq |
annotation |
gene |
description |
| RA |
NC_000913 |
1,178,848 |
A→T |
5.6% |
K86* (AAA→TAA) ‡ |
nagK → |
N‑acetyl‑D‑glucosamine kinase |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | NC_000913 | 1,178,848 | 0 | A | T | 5.6%
| 253.3
/ 5.1
| 71 | K86* (AAA→TAA) ‡ | nagK | N‑acetyl‑D‑glucosamine kinase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (34/33); new base T (2/2); total (36/35) |
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 |
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 7.85e-01 |
ACGCATTTTTAGATGCAGTGTGTGAGCTGGTAGCTGAAGCTGACCAACGTTTTGGCTGTAAAGGTTCTGTCGGCATCGGTATTCCGGGAATGCCGGAAACAGAAGATGGTACGCTGTATGCCGCCAATGTCCCCGCTGCCAGCGGTAAACCGCTGCGTGCCGACCTGAGCGCACGTCTTGATCGCGATGTACGCCTTGATAACGATGCCAACTGTTTTGCCCTTTCAGAAGCCTGGGATGATGAATTTACTCAATATCCACTGGTGATGGGGTTGATTCTCGGCACCG > NC_000913/1178702‑1178989
|
aCGCATTTTTAGATGCAGTGTGTGAGCTGGTAGCTGAAGCTGACCAACGTTTTGGCTGTAAAGGTTCTGTCGGCATCGGTATTCCGGGAATGCCGGAAACAGAAGATGGTACGCTGTATGCCGCCAATGTCCCCGCTGCCAGCGGTaaa < 1:314157/149‑1 (MQ=255)
gCATTTTTAGATGCAGTGTGTGAGCTGGTAGCTGAAGCTGACCAACGTTTTGGCTGTAAAGGTTCTGTCGGCATCGGTATTCCGGGAATGCCGGAAACAGAAGATGGTACGCTGTATGCCGCCAATGTCCCCGCTGCCAGCGGTAAAcc > 2:141125/1‑149 (MQ=255)
gCATTTTTAGATGCAGTGTGTGAGCTGGTAGCTGAAGCTGACCAACGTTTTGGCTGTAAAGGTACTGTCGGCATCGGTATTCCGGGAATGCCGGAAACAGAAGATGGTACGCTGTATGCCGCCAATGTCCCCGCTGCCAGCGGTAAAcc > 3:356141/1‑149 (MQ=255)
aTTTTTAGATGCAGTGTGTGAGTTGGTAGCTGAAGCTGACCAACGTTTTGGCTGTAAAGGTTCTGTCGGCATCGGTATTCCGGGAATGCCGGAAACAGAAGATGGTACGCTGTATGCCGCCAATGTCCCCGCTGCCAGCGGTAAACCGc < 3:504094/149‑1 (MQ=255)
tttttAGATGCAGTGTGTGAGCTGGTAGCTGAAGCTGACCAACGTTTTGGCTGTAAAGGTTCTGTCGGCATCGGTATTCCGGGAATGCCGGAAACAGAAGATGGTACGCTGTATGCCGCCAATGTCCCCGCTGCCAGCGGTAAACCGCt > 3:388126/1‑149 (MQ=255)
tttAGATGCAGTGTGTGAGCTGGTAGCTGAAGCTGACCAACGTTTTGGCTGTAAAGGTTCTGTCGGCATCGGTATTCCGGGAATGCCGGAAACAGAAGATGGTACGCTGTATGCCGCCAATGTCCCCGCTGCCAGCGCTTTACCGCTgg < 3:536484/149‑2 (MQ=255)
ttAGATGCAGTGTGTGAGCTGGTAGCTGAAGCTGACCAACGTTTTGGCTGTAAAGGTTCTGTCGGCATCGGTATTCCGGGAATGCCGGAAACAGAAGATGGTACGCTGTATGCCGCCAATGTCCCCGCTGCCAGCGGTAAACCGCTGCg > 2:559295/1‑149 (MQ=255)
cAGTGTGTGAGCTGGTAGCTGAAGCTGACCAACGTTTTGGCTGTAAAGGTTCTGTCGGCATCGGTATTCCGGGAATGCCGGAAACAGAAGATGGTACGCTGTATGCCGCCAATGTCCCCGCTGCCAGCGGTAAACCGCTGCGTGCCGAc > 4:372448/1‑149 (MQ=255)
gtgAGCTGGTAGCTGAAGCTGACCAACGTTTTGGCTGTAAAGGTTCTGTCGGCATCGGTATTCCGGGAATGCCGGAAACAGAAGATGGTACGCTGTATGCCGCCAATGTCCCCGCTGCCAGCGGTAAACCGCTGCGTGCCGACCTGAgc < 4:314019/149‑1 (MQ=255)
gAGCTGGTAGCTGAAGCTGACCAACGTTTTGGCTGTAAAGGTTCTGTCGGCATCGGTATTCCGGGAATGCCGGAAACAGAAGATGGTACGCTGTATGCCGCCAATGTCCCCGCTGCCAGCGGTAAACCGCTGCGTGCCGACCTGAgcgc > 1:329109/1‑149 (MQ=255)
gAGCTGGTAGCTGAAGCTGACCAACGTTTTGGCTGTAAAGGTTCTGTCGGCATCGGTATTCCGGGAATGCCGGAAACAGAAGATGGTACGCTGTATGCCGCCAATGTCCCCGCTGCCAGCGGTAAACCGCTGCGTGCCGACCTGAgcgc > 4:235251/1‑149 (MQ=255)
aGCTGGTAGCTGAAGCTGACCAACGTTTTGGCTGTAAAGGTTCTGTCGGCATCGGTATTCCGGGAATGCCGGAAACAGAAGATGGTACGCTGTATGCCGCCAATGTCCCCGCTGCCAGCGGTAAACCGCTGCGTGCCGACCTGAGCGCa > 4:304240/1‑149 (MQ=255)
tGGTAGCTGAAGCTGACCAACGTTTTGGCTGTAAAGGTTCTGTCGGCATCGGTATTCCGGGAATGCCGGAAACAGAAGATGGTACGCTGTATGCCGCCAATGTCCCCGCTGCCAGCGGTAAACCGCTGCGTGCCGACCTGAGCGCACGt > 4:502656/1‑149 (MQ=255)
tgaagctgaCCAACGTTTTGGCTGTAAAGGTTCTGTCGGCATCGGTATTCCGGGAATGCCGGAAACAGAAGATGGTACGCTGTATGCCGCCAATGTCCCCGCTGCCAGCGGTAAACCGCTGCGTGCCGACCTGAGCGCACGTCTTGATc > 2:434132/1‑149 (MQ=255)
tgaagctgaCCAACGTTTTGGCTGTAAAGGTTCTGTCGGCATCGGTATTCCGGGAATGCCGGAAACAGAAGATGGTACGCTGTATGCCGCCAATGTCCCCGCTGCCAGCGGTAAACCGCTGCGTGCCGACCTGAGCGCACGTCTTGATc < 4:599814/149‑1 (MQ=255)
ctgaCCAACGTTTTGGCTGTAAAGGTTCTGTCGGCATCGGTATTCCGGGAATGCCGGAAACAGAAGATGGTACGCTGTATGCCGCCAATGTCCCCGCTGCCAGCGGTAAACCGCTGCGTGCCGACCTGAGCGCACGTCTTGATCGCGAt < 2:188202/149‑1 (MQ=255)
gaCCAACGTTTTGGCTGTAAAGGTTCTGTCGGCATCGGTATTCCGGGAATGCCGGAAACAGAAGATGGTACGCTGTATGCCGCCAATGTCCCCGCTGCCAGCGGTAAACCGCTGCGTGCCGACCTGAGCGCACGTCTTGATCGCGATGt < 1:341445/149‑1 (MQ=255)
cAACGTTTTGGCTGTAAAGGTTCTGTCGGCATCGGTATTCCGGGAATGCCGGAAACAGAAGATGGTACGCTGTATGCCGCCAATGTCCCCGCTGCCAGCGGTTTACCGCTgg > 2:433260/1‑111 (MQ=255)
cAACGTTTTGGCTGTAAAGGTTCTGTCGGCATCGGTATTCCGGGAATGCCGGAAACAGAAGATGGTACGCTGTATGCCGCCAATGTCCCCGCTGCCAGCGGTTTACCGCTgg < 1:433260/112‑2 (MQ=255)
cAACGTTTTGGCTGTAAAGGTTCTGTCGGCATCGGTATTCCGGGAATGCCGGAAACAGAAGATGGTACGCTGTATGCCGCCAATGTCCCCGCTGCCAGCGGTAAACCGc > 1:105734/1‑109 (MQ=255)
cAACGTTTTGGCTGTAAAGGTTCTGTCGGCATCGGTATTCCGGGAATGCCGGAAACAGAAGATGGTACGCTGTATGCCGCCAATGTCCCCGCTGCCAGCGGTAAACCGc < 2:105734/109‑1 (MQ=255)
cAACGTTTTGGCTGTAAAGGTTCTGTCGGCATCGGTATTCCGGGAATGCCGGAAACAGAAGATGGTACGCTGTATGCCGCCAATGTCCCCGCTGCCAGCGGTAAACCGCTGCGTGCCGACCTGAGCGCACGTCTTGATCGCGATGTACg > 1:523687/1‑149 (MQ=255)
ttttGGCTGTAAAGGTTCTGTCGGCATCGGTATTCCGGGAATGCCGGAAACAGAAGATGGTACGCTGTATGCCGCCAATGTCCCCGCTGCCAGCGGTAAACCGCTGCGTGCCGACCTGAGCGCACGTCTTGATCGCGATGTACGCCTTg > 4:79107/1‑149 (MQ=255)
tttGGCTGTAAAGGTTCTGTCGGCATCGGTATTCCGGGAATGCCGGAAACAGAAGATGGTACGCTGTATGCCGCCAATGTCCCCGCTGCCAGCGGTAAACCGCTGCGTGCCGACCTGAGCGCACGTCTTGATCGCGATGTACGCCTTGa < 2:232254/149‑1 (MQ=255)
ggCTGTAAAGGTTCTGTCGGCATCGGTATTCCGGGAATGCCGGAAACAGAAGATGGTACGCTGTATGCCGCCAATGTCCCCGCTGCCAGCGGTAAACCGCTGCGTGCCGACCTGAGCGCACGTCTTGATCGCGATGTACGCCTTGATaa < 2:130882/149‑1 (MQ=255)
gCTGTAAAGGTTCTGTCGGCATCGGTATTCCGGGAATGCCGGAAACAGAAGATGCTACGCTGTATGCCGCCAATGTCCCCGCTGCCAGCGGTAAACCGCTGCGTGCCGACCTGAGCGCACGTCTTGATCGCGATGTACGCCTTGATAAc < 1:447695/149‑1 (MQ=255)
cTGTAAAGGTTCTGTCGACATCGGTATTCCGGGAATGCCGGAAACAGAACATGGTACGCTGTATGCCGCCAATGTCCCCGCTGCCAGCGGTAAACCGCTGCGTGCCGACCTGTGCGCACGTCTTGATCGCGATGTACGCCTTGATAACg < 4:523521/149‑1 (MQ=255)
tGTAAAGGTTCTGTCGGCATCGGTATTCCGGGAATGCCGGAAACAGAAGATGGTACGCTGTATGCCGCCAATGTCCCCGCTGCCAGCGGTAAACCGCTGCGTGCCGACCTGAGCGCACGTCTTGATCGCGATGTACGCCTTGATAACGa < 2:236336/149‑1 (MQ=255)
tAAAGGTTCTGTCGGCATCGGTATTCCGGGAATGCCGGAAACAGAAGATGGTACGCTGTATGCCGCCAATGTCCCCGCTGCCAGCGGTAAACCGCTGCGTGCCGACCTGAGCGCACGTCTTGATCGCGATGTACGCCTTGATAACGa < 1:212223/147‑1 (MQ=255)
tAAAGGTTCTGTCGGCATCGGTATTCCGGGAATGCCGGAAACAGAAGATGGTACGCTGTATGCCGCCAATGTCCCCGCTGCCAGCGGTAAACCGCTGCGTGCCGACCTGAGCGCACGTCTTGATCGCGATGTACGCCTTGATAACGa > 2:212223/1‑147 (MQ=255)
ggTTCTGTCGGCATCGGTATTCCGGGAATGCCGGAAACAGAAGATGGTACGCTGTATGCCGCCAATGTCCCCGCTGCCAGCGGTAAACCGCTGCGTGTCGACCTGAGCGCACGTCTTGATCGCGATGTACGCCTTGATAACGATGCCaa > 1:95799/1‑149 (MQ=255)
gTCGGCATCGGTATTCCGGGAATGCCGGAAACAGAAGATGGTACGCTGTATGCCGCTAATGTCCCGGCTGCCAGCGGAAAACGGATGCGTGCCGACCTGAGCGCACGTCTTGATCGCGATGTACGCCTTGATAACGATGCCAACTGttt > 2:86667/1‑149 (MQ=255)
gTCGGCATCGGTATTCCGGGAATGCCGGAAACAGAAGATGGTACGCTGTATGCCGCCAATGTCCCCGCTGCCAGCGGTAAACCGCTGCGTGCCGACCTGAGCGCACGTCTTGa < 2:73558/113‑1 (MQ=255)
gTCGGCATCGGTATTCCGGGAATGCCGGAAACAGAAGATGGTACGCTGTATGCCGCCAATGTCCCCGCTGCCAGCGGTAAACCGCTGCGTGCCGACCTGAGCGCACGTCTTGa > 1:73558/1‑113 (MQ=255)
gTCGGCATCGGTATTCCGGGAATGCCGGAAACAGAAGATGGTACGCTGTATGCCGCCAATGTCCCCGCTGCCAGCGGTAAACCGCTGCGTGCCGACCTGAGCGCACGTCTTGATCGCGATGTACGCCTTGATAACGATGCCAACTGttt > 4:557001/1‑149 (MQ=255)
tCGGCATCGGTATTCCGGGAATGCCGGAAACAGAAGATGGTACGCTGTATGCCGCCAATGTCCCCGCTGCCAGCGGTAAACCGCTGCGTGCCGACCTGAGCGCACGTCTTGATCGCGATGTACGCCTTGATAACGATGCCAACTGtttt < 1:122705/149‑1 (MQ=255)
tCGGCATCGGTATTCCGGGAATGCCGGAAACAGAAGATGGTACGCTGTATGCCGCCAATGTCCCCGCTGCCAGCGGTAAACCGCTGCGTGCCGACCTGAGCGCACGTCTTGATCGCGATGTACGCCTTGATAACGATGCCAACTGtttt < 1:396223/149‑1 (MQ=255)
tCGGCATCGGTATTCCGGGAATGCCGGAAACAGAAGATGGTACGCTGTATGCCGCCAATGTCCCCGCTGCCAGCGGTAAACCGCTGCGTGCCGACCTGAGCGCACGTCTTGATCGCGATGTACGCCTTGATAACGATGCCAACTGtttt > 1:63457/1‑149 (MQ=255)
gCATCGGTATTCCGGGAATGCCGGAAACAGAAGATGGTACGCTGTATGCCGCCAATGTCCCCGCTGCCAGCGGTAAACCGCTGCGTGCCGACCTGAGCGCACGTCTTGATCGCGATGTACGCCTTGATAACGATGCCAACTGTTTTGcc > 4:341494/1‑149 (MQ=255)
gCATCGGTATTCCGGGAATGCCGGAAACAGAAGATGGTACGCTGTATGCCGCCAATGTCCCCGCTGCCAGCGGTAAACCGCTGCGTGCCGACCTGAGCGCACGTCTTGATCGCGATGTACGCCTTGATAACGATGCCAACTGTTTTGcc > 2:234518/1‑149 (MQ=255)
gCATCGGTATTCCGGGAATGCCGGAAACAGAAGATGGTACGCTGTATGCCGCCAATGTCCCCGCTGCCAGCGGTAAACCGCTGCGTGCCGACCTGAGCGCACGTCTTGATCGCGATGTACGCCTTGATAACGATGCCAACTGTTTTGcc < 3:372448/149‑1 (MQ=255)
gCATCGGTATTCCGGGAATGCCGGAAACAGAAGATGGTACGCTGTATGCCGCCAATGTCCCCGCTGCCAGCGGTAAACCGCTGCGTGCCGACCTGAGCGCACGTCTTGATCGCGATGTACGCCTTGATAACGATGCCAACTGTTTTGcc > 2:134219/1‑149 (MQ=255)
cATCGGTATTCCGGGAATGCCGGAAACAGATGATGGTACGCTGTATGCCGCCAATGTCCCCGCTGCCAGCGGTAAACCGCTGCGTGCCGACCTGAGCGCACGTCTTGATCGCGATGTACGCCTTGATAACGATGCCAACTGTTTTGccc < 1:404466/149‑1 (MQ=255)
cGGTATTCCGGGAATGCCGGAAACAGAAGATGGTACGCTGTATGCCGCCAATGTCCCCGCTGCCAGCGGTAAACCGCTGCGTGCCGACCTGAGCGCACGTCTTGATCGCGATGTACGCCTTGATAACGATGCCAACTGTTTTGCCCttt < 4:388126/149‑1 (MQ=255)
cGGTATTCCGGGAATGCCGGAAACAGAAGATGGTACGCTGTATGCCGCCAATGTCCCCGCTGCCAGCGGTAAACCGCTGCGTGCCGACCTGAGCGCACGTCTTGATCGCGATGTACGCCTTGATAACGATGCCAACTGTTTTGCCCttt > 3:241309/1‑149 (MQ=255)
tATTCCGGGAATGCCGGAAACAGAAGATGGTACGCTGTATGCCGCCAATGTCCCCGCTGCCAGCGGTAAACCGCTGCGTGCCGACCTGAGCGCACGTCTTGATCGCGATGTACGCCTTGATAACGATGCCAACTGTTTTGCCCTTTCAg < 4:241309/149‑1 (MQ=255)
ggAATGCCGGAAACAGAAGATGGTACGCTGTATGCCGCCAATGTCCCCGCTGCCAGCGGTAAACCGCTGCGTGCCGACCTGAGCGCACGTCTTGATCGCGATGTACGCCTTGATAGCGATGCCAACTGTTTTGCCCTGTCAGAAGCCTg < 2:523687/149‑1 (MQ=255)
aaTGCCGGAAACAGAAGATGGTACGCTGTATGCCGCCAATGTCCCCGCTGCCAGCGGTAAACCGCTGCGTGCCGACCTGAGCGCACGTCTTGATCGCGATGTACGCCTTGATAACGATGCCAACTGTTTTGCCCTTTCAGAAGCCTggg < 3:235251/149‑1 (MQ=255)
ccGGAAACAGAAGATGGTACGCTGTATGCCGCCAATGTCCCCGCTGCCAGCGGTAAACCGCTGCGTGCCGACCTGAGCGCACGTCTTGATCGCGATGTACGCCTTGATAACGATGCCAACTGTTTTGCCCTTTCAGAAGCCTGGgatga < 1:141125/149‑1 (MQ=255)
cGGAAACAGAAGATGGTACGCTGTATGCCGCCAATGTCCCCGCTGCCAGCGGTAAACCGCTGCGTGCCGACCTGAGCGCACGTCTTGATCGCGATGTACGCCTTGATAACGATGCCAACTGTTTTGCCCTTTCAGAAGCCTGGgatgat > 4:283792/1‑149 (MQ=255)
cGGAAACAGAAGATGGTACGCTGTATGCCGCCAATGTCCCCGCTGCCAGCGGTAAACCGCTGCGTGCCGACCTGAGCGCACGTCTTGATCGCGATGTACGCCTTGATAACGATGCCAACTGTTTTGCCCTTTCAGAAGCCTGGgatgat > 1:374216/1‑149 (MQ=255)
gAAACAGAAGATGGTACGCTGTATGCCGCCAATGTCCCCGCTGCCAGCGGTAAACCGCTGCGTGCCGACCTGAGCGCACGTCTTGATCGCGATGTACGCCTTGATAACGATGCCAACTGTTTTGCCCTTTCAGAAGCCTGGGAtgatga > 1:366051/1‑149 (MQ=255)
aaCAGAAGATGGTACGCTGTATGCCGCCAATGTCCCCGCTGCCAGCGGTAAACCGCTGCGTGCCGACCTGAGCGCACGTCTTGATCGCGATGTACGCCTTGATAACGATGCCAACTGTTTTGCCCTTTCAGAAGCCTGGGATGATGAAt < 2:374216/149‑1 (MQ=255)
gaagaTGGTACGCTGTATGCCGCCAATGTCCCCGCTGCCAGCGGTAAACCGCTGCGTGCCGACCTGAGCGCACGTCTTGATCGCGATGTACGCCTTGATAACGATGCCAACTGtttt > 3:172911/1‑117 (MQ=255)
gaagaTGGTACGCTGTATGCCGCCAATGTCCCCGCTGCCAGCGGTAAACCGCTGCGTGCCGACCTGAGCGCACGTCTTGATCGCGATGTACGCCTTGATAACGATGCCAACTGtttt < 4:172911/117‑1 (MQ=255)
gaagaTGGTACGCTGTATGCCGCCAATGTCCCCGCTGCCAGCGGTAAACCGCTGCGTGCCGACCTGAGCGCACGTCTTGATCGCGATGTACGCCTTGATAACGATGCCAACTGTTTTGCCCTTTCAGAAGCCTGGGATGATGAATTTAc > 1:17536/1‑149 (MQ=255)
gaTGGTACGCTGTATGCCGCCAATGTCCCCGCTGCCAGCGGTAAACCGCTGCGTGCCGACCTGAGCGCACGTCTTGATCGCGATGTACGCCTTGATAACGATGCCAACTGTTTTGCCCTTTCAGAAGCCTGGGATGATGAATTTACTCa > 1:610851/1‑149 (MQ=255)
tGTATGCCGCCAATGTCCCCGCTGCCAGCGGTAAACCGCTGCGTGCCGACCTGAGCGCACGTCTTGATCGCGATGTACGCCTTGATAACGATGCCAACTGTTTTGCCCTTTCAGAAGCCTGGGATGATGAATTTACTCAATATCCACTg < 3:304240/149‑1 (MQ=255)
ccgccAATGTCCCCGCTGCCAGCGGTAAACCGCTGCGTGCCGACCTGAGCGCACGTCTTGATCGCGATGTACGCCTTGATAACGATGCCAACTGTTTTGCCCTTTCAGAAGCCTGGGATGATGAATTTACTCAATATCCACTGGTGATg > 2:577232/1‑149 (MQ=255)
gccAATGTCCCCGCTGCCAGCGGTAAACCGCTGCGTGCCGACCTGAGCGCACGTCTTGATCGCGATGTACGCCTTGATAACGATGCCAACTGTTTTGCCCTTTCAGAAGCCTGGGATGATGAATTTACTCAATATCCACTGGTGATggg < 1:234518/149‑1 (MQ=255)
aTGTCCCCGCTGCCAGCGGTAAACCGCTGCGTGCCGACCTGAGCGCACGTCTTGATCGCGATGTACGCCTTGATAACGATGCCAACTGTTTTGCCCTTTCAGAAGCCTGGGATGATGAATTTACTCAATATCCACTGGTGATGGGGTTg < 1:57456/149‑1 (MQ=255)
cccGCTGCCAGCGGTAAACCGCTGCGTGCCGACCTGAGCGCACGTCTTGATCGCGATGTACGCCTTGATAACGATGCCAACTGTTTTGCCCTTTCAGAAGCCTGGGATGATGAATTTACTCAATATCCACTGGTGATGGGGTTGATtct < 1:434132/149‑1 (MQ=255)
ccGCTGCCAGCGGTAAACCGCTGCGTGCCGACCTGAGCGCACGTCTTGATCGCGATGTACGCCTTGATAACGATGCCAACTGTTTTGCCCTTTCAGAAg < 1:356872/99‑1 (MQ=255)
ccGCTGCCAGCGGTAAACCGCTGCGTGCCGACCTGAGCGCACGTCTTGATCGCGATGTACGCCTTGATAACGATGCCAACTGTTTTGCCCTTTCAGAAg > 2:356872/1‑99 (MQ=255)
ccGCTGCCAGCGGTAAACCGCTGCGTGCCGACCTGAGCGCACGTCTTGATCGCGATGTACGCCTTGATAACGATGCCAACTGTTTTGCCCTTTCAGAAGCCTGGGATGATGAATTTACTCAATATCCACTGGTGATGGGGTTGATtctc < 2:366051/149‑1 (MQ=255)
cGCTGCCAGCGGTAAACCGCTGCGTGTCGACCTGAGCGCACGTCTTGATCGCGATGTACGCCTTGATAACGATGCCAACTGTTTTGCCCTTTCAGAAGCCTGGGATGATGAATTTACTCAATATCCACTGGTGATGGGGTTGATTCTCg < 2:95799/149‑1 (MQ=255)
gcAGCGGTTTACCGCTGCGTGCCGACCTGAGCGCACGTCTTGATCGCGATGTACGCCTTGATAACGATGCCAACTGTTTTGCCCTTTCAGAAGCCTGGGATGATGAATTTACTCAATATCCACTGGTGATGGGGTTGATTCTCGGCAcc > 3:32983/2‑149 (MQ=255)
ccAGCGGTAAACCGCTGCGTGCCGACCTGAGCGCACGTCTTGATCGCGATGTACGCCTTGATAACGATGCCAACTGTTTTGCCCTTTCAGAAGCCTGGGATGATGAATTTACTCAATATCCACTGGTGATGGGGTTGATTCTCGGCAcc > 2:340602/1‑149 (MQ=255)
ccAGCGGTAAACCGCTGCGTGCCGACCTGAGCGCACGTCTTGATCGCGATGTACGCCTTGATAACGATGCCAACTGTTTTGCCCTTTCAGAAGCCTGGGATGATGAATTTACTCAATATCCACTGGTGATGGGGTTGATTCTCGGCAcc > 2:272664/1‑149 (MQ=255)
cAGCGGTAAACCGCTGCGTGCCGACCTGAGCGCACGTCTTGATCGCGATGTACGCCTTGATAACGATGCCAACTGTTTTGCCCTTTCAGAAGCCTGGGATGATGAATTTACTCAATATCCACTGGTGATGGGGTTGATTCTCGGCACCg < 1:513475/149‑1 (MQ=255)
gTAAACCGCTGCGTGCCGACCTGAGCGCACGTCTTGATCGCGATGTACGCCTTGATAACGATGCCAACTGTTTTGCCCTTTCAGAAGCCTGGGATGATGAATTTa < 1:32874/105‑1 (MQ=255)
gTAAACCGCTGCGTGCCGACCTGAGCGCACGTCTTGATCGCGATGTACGCCTTGATAACGATGCCAACTGTTTTGCCCTTTCAGAAGCCTGGGATGATGAATTTa > 2:32874/1‑105 (MQ=255)
|
ACGCATTTTTAGATGCAGTGTGTGAGCTGGTAGCTGAAGCTGACCAACGTTTTGGCTGTAAAGGTTCTGTCGGCATCGGTATTCCGGGAATGCCGGAAACAGAAGATGGTACGCTGTATGCCGCCAATGTCCCCGCTGCCAGCGGTAAACCGCTGCGTGCCGACCTGAGCGCACGTCTTGATCGCGATGTACGCCTTGATAACGATGCCAACTGTTTTGCCCTTTCAGAAGCCTGGGATGATGAATTTACTCAATATCCACTGGTGATGGGGTTGATTCTCGGCACCG > NC_000913/1178702‑1178989
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
N/A
