Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A3 F412 I3 R1
|
53 |
201.3 |
10250884 |
92.1% |
9441064 |
100.0 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
NC_000913 |
3,928,131 |
T→C |
V326A (GTC→GCC) |
asnA → |
asparagine synthetase A |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | NC_000913 | 3,928,131 | 0 | T | C | 100.0%
| 834.9
/ NA
| 232 | V326A (GTC→GCC) | asnA | asparagine synthetase A |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (0/0); new base C (129/103); total (129/103) |
Only 100 of 238 total aligned reads displayed.
GGTATCGGCCAGTCTCGTTTGACTATGCTGCTGCTGCAACTGCCGCATATCGGCCAGGTTCAGTGTGGAGTATGGCCAGCTGCTGTTCGCGAGAGCGTCCCTTCTCTGCTGTAATAATTTATCGCCGCCAGCGTCTGAGCAGGCGGCTTCGCATCCCGGTATCAAAGCGCCAGATATGATCGAAAATGCGCATG > NC_000913/3928034‑3928227
|
gTATCGGCCAGTCTCGTTTGACTATGCTGCTGCTGCAACTGCCGCATATCGGCCAGGTTCAGTGTGGAGTATGGCCAGCTGCTGTTCGCGAGAGCGcccc > 1:1617631/1‑100 (MQ=255)
gTATCGGCCAGGCTCGGTTGACTATGCTGCTTCTGCAACTGCCGTATATCGGCCATGTTCAGTGTGGAGTATGGCCAGCTGCTGTTCGCGATAGCGcccc < 2:1041268/100‑1 (MQ=255)
tATCGGCCAGTCTTGTTTGACTATGCTGCTGCTGCAACTGACGCATATCGGCCAGGTTCAGTGTGGAGTATGGCCAGCTGCTGTTCGCGAGAGCGCCCCt < 1:4555173/100‑1 (MQ=255)
tCGGCCAGTCTCGTTTGACTATGCTGCTGCTGCAACTGCCGCATATCGGCCAGGTTCAGTGTGGAGTATGGCCAGCTGCTGTTCGCGAGAGCGCCCCTtc < 1:594521/100‑1 (MQ=255)
tCGGCCAGTCTCGTTTGACTATGCTGCTGCTGCAACTGCCGCATATCGGCCAGGTTCAGTGTGGAGTATGGCCAGCTGCTGTTCGCGAGAGCGCCCCTtc > 2:4257899/1‑100 (MQ=255)
ggCCAGTCTCGTTTGACTATGCTGCTGCTGCAACTGCCGCATATCGGCCAGGTTCAGTGTGGAGTATGGCCAGCTGCTGTTCGCGAGAGCGCCCCTtctc > 1:3732087/1‑100 (MQ=255)
ggCCAGTCTCGTTTGACTATGCTGCTGCTGCAACTGCCGCATATCGGCCAGGTTCAGTGTGGAGTATGGCCAGCTGCTGTTCGCGAGAGCGCCCCTtctc > 1:1940622/1‑100 (MQ=255)
gCCAGTCTCGTTTGACTATGCTGCTGCTGCAACTGCCGCATATCGGCCAGGTTCAGTGTGGAGTATGGCCAGCTGCTGTTCGCGAGAGCGCCCCTTctct > 2:1998167/1‑100 (MQ=255)
cAGTCTCGTTTGACTATGCTGCTGCTGCAACTGCCGCATATCGGCCAGGTTCAGTGTGGAGTATGGCCAGCTGCTGTTCGCGAGAGCGCCCCTTCTctgc < 2:107622/100‑1 (MQ=255)
aGTCTCGTTTGACTATGCTGCTGCTGCAACTGCCGCATATCGGCCAGGTTCAGTGTGGAGTATGGCCAGCTGCTGTTCGCGAGAGCGCCCCTTCTctgct > 2:3615532/1‑100 (MQ=255)
gTCTCTTTTGACAATGCTGCTGCTGCCAACGCCGCATATAGGCCAGGTTCAGTGCGGTGTATGCCTAGCTGCTGTTCGCGAGGGCCCCCCTTCTctgctg < 2:1139412/100‑1 (MQ=255)
gTCTCGTTTGACTATGCTGCTGCTGCAACTGCCGCATATCGGCCAGGTTCAGTGTGGAGTATGGCCAGCTGCTGTTCGCGAGAGCGCCCCTTCTctgctg > 1:942720/1‑100 (MQ=255)
tctcGTTTGACTATGCTGCTGCTGCAACTGCCGCATATCGGCCAGGTTCAGTGTGGAGTATGGCCAGCTGCTGTTCGCGAGAGCGCCCCTTCTCTGCTGt < 1:488634/100‑1 (MQ=255)
cGTTTGACTATGCTGCTGCTGCAACTGCCGCATATCGGCCAGGTTCAGTGTGGAGTATGGCCAGCTGCTGTTCGCGAGAGCGCCCCTTCTCTGCTGtaat < 1:2172643/100‑1 (MQ=255)
cGTTTGACTATGCTGCTGCTGCAACTGCCGCATATCGGCCAGGTTCAGCGTGGAGTATGGCCAGCTGCTGTTCGCGAGAGCGCCCCTTCTCTGCTGtaat > 1:3297763/1‑100 (MQ=255)
cGTTTGACTATGCTGCGGCTGCAACTGCCGCATATCGGCCAGGTTCAGTGTGGAGTATGGCCAGCTGCTGTTCGCGAGAGCGCCCCTTCTCTGCTGtaat < 2:3573750/100‑1 (MQ=255)
gTTTGACTATGCTGCTGCTGCAACTGCCGCATATCGGCCAGGTTCAGTGTGGAGTATGGCCAGCTGCTGTTCGCGAGAGCGCCCCTTCTCTGCTGtaata > 1:3900136/1‑100 (MQ=255)
tttGACTATGCTGCTGCTGCAACTGCCGCATATCGGCCAGGTTCAGTGTGGAGTATGGCCAGCTGCTGTTCGCGAGAGCGCCCCTTCTCTGCTGtaataa < 2:1916110/100‑1 (MQ=255)
ccgatcTATGCTGCTGCTGCAACTGCCGCATATCGGCCAGGTTCAGTGTGGAGTATGGCCAGCTGCTGTTCGCGAGAGCGCCCCTTCTCTGCTGtaataa < 2:503261/95‑1 (MQ=255)
ttGACTATGCTGCTGCTGCAACTGCCGCATATCGGCCAGGTTCAGTGTGGAGTATGGCCAGCTGCTGTTCGCGAGAGCGCCCCTTCTCTGCTGTaataat < 2:1432208/100‑1 (MQ=255)
gACTATGCTGCTGCTGCAACTGCCGCATATCGGCCAGGTTCAGTGTGGAGTATGGCCAGCTGCTGTTCGCGAGAGCGCCCCTTCTCTGCTGTAATAAttt < 1:2579158/100‑1 (MQ=255)
cTATGCTGCTGCTGCAACTGCCGCATATCGGCCAGGTTCAGTGTGGAGTATGGCCAGCTGCTGTTCGCGAGAGCGCCCCTTCTCTGCTGTAATAATTTAt > 2:403233/1‑100 (MQ=255)
cTATGCTGCTGCTGCAACTGCCGCATATCGGCCAGGTTCAGTGTGGAGTATGGCCAGCTGCTGTTCGCGAGAGCGCCCCTTCTCTGCTGTAATAATCTAt < 1:3960982/100‑1 (MQ=255)
cTATGCTGCTGCTGCAACTGCCGCATATCGGCCAGGTTCAGTGTGGAGCATGGCCAGCTGCTGTTCGCGAGAGCGCCCCTTCTCTGCTGTAATAATTTAt > 2:3717478/1‑100 (MQ=255)
tgctgctgctgcAACTGCCGCATATCGGCCAGGTTCCGTGTGGAGTATGGCCAGCTGCTGTTCGCGAGAGCGCCCCTTCTCTGCTGTAATAAGTTATcgc > 2:4247095/1‑100 (MQ=255)
tgctgctgctgcAACTGCCGCATATCGGCCAGGTTCAGTGTGGAGTATGGCCAGCTGCTGTTCGCGAGAGCGCCCCTTCTCTGCTGTAATAATTTATcgc > 1:82686/1‑100 (MQ=255)
ctgctgctgcAACTGCCGCATATCGGCCAGGTTCAGTGTGGAGTATGGCCAGCTGCTGTTCGCGAGAGCGCCCCTTCTCTGCTGTAATAATTTATcgccg < 2:2946334/100‑1 (MQ=255)
tgctgctgcAACTGCCGCATATCGGCCAGGTTCAGTGTGGAGTATGGCCAGCTGCTGTTCGCGAGAGCGCCCCTTCTCTGCTGTAATAATTTATcgccgc > 1:1840106/1‑100 (MQ=255)
gctgctgcAACTGCCGCATATCGGCCAGGTTCAGTGTGGAGTATGGCCAGCTGCTGTTCGCGAGAGCGCCCCTTCTCTGCTGTAATAATTTATCgccgcc < 2:2917540/100‑1 (MQ=255)
gctgcAACTGCCGCATATCGGCCAGGTTCAGTGTGGAGTATGGCCAGCTGCTGTTCGCGAGAGCGCCCCTTCTCTGCTGTAATAATTTATCGCCGCCAGc > 2:1817298/1‑100 (MQ=255)
gctgcAACTGCCGCATATCGGCCAGGTTCAGTGTGGAGTATGGCCAGCTGCTGTTCGCGAGAGCGCCCCTTCTCTGCTGTAATAATTTATCGCCGCCAGc > 1:1093611/1‑100 (MQ=255)
gctgcAACTGCCGCATATCGGCCAGGTTCAGTGTGGAGTATGGCCAGCTGCTGTTCGCGAGAGCGCCCCTTCTCTGCTGTAATAATTTATCGCCGCCAGc > 1:3061592/1‑100 (MQ=255)
gctgcAACTGCCGCATATCGGCCAGGTTCAGTCTGGAGTATGGCCAGCTGCTGTTCGCGAGAGCGCCCCTTCTCTGCTGTAATAATTTATCGCCGCCAGc > 2:4572929/1‑100 (MQ=255)
ctgcAACTGCCGCATATCGGCCAGGTTCAGTGTGGAGTATGGCCAGCTGCTGTTCGCGAGAGCGCCCCTTCTCTGCTGTTATAATTTATCGCTGCCAGCg < 2:730440/100‑1 (MQ=255)
tgcAACTGCCGCATATCGGCCAGGTTCAGTGTGGAGTATGGCCAGCTGCTGTTCGCGAGAGCGCCCCTTCTCTGCTGTAATAATTTATCGCCGCCAGCGt > 1:463741/1‑100 (MQ=255)
tgcAACTGCCGCATATCGGCCAGGTTCAGTGTGGAGTATGGCCAGCTGCTGTTCGCGAGAGCGCCCCTTCTCTGCTGTAATAATTTATCGCCGCCAGCGt < 1:2503811/100‑1 (MQ=255)
gcAACTGCCGCATATCGGCCAGGTTCAGTGTGGCGTATGGCCAGCTGCTGTTCGCGAGAGCGCCCCTTCTCTGCTGTAATAATTTATCGCCGCCAGCGTc < 1:4903896/100‑1 (MQ=255)
cAACTGCCGCATATCGGCCAGGTTCAGTGTGGAGTATGGCCAGCTGCTGTTCGCGAGAGCGCCCCTTCTCTGCTGTAATAATTTATCGCCGCCAGCGTCt < 2:2051032/100‑1 (MQ=255)
cAACTGCCGCATATCGGCCAGGTTCAGTGTGGAGTATGGCCAGCTGCTGTTCGCGAGAGCGCCCCTTCTCTGCTGTAATAATTTATCGCCGCCAGCGTCt > 2:1575579/1‑100 (MQ=255)
aaCTGCCGCATATCGGCCAGGTTCAGTGTGGAGTATGGCCAGCTGCTGTTCGCGAGAGCGCCCCTTCTCTGCTGTAATAATTTATCGCCGCCAGCGTCTg < 1:1518554/100‑1 (MQ=255)
cTGCCGCATATCGGCCAGGTTCAGTGTGGAGTATGGCCAGCTGCTGTTCGCGAGAGCGCCCCTTCTCTGCTGTAATAATTTATCGCCGCCAGCGTCTGAg > 2:3172140/1‑100 (MQ=255)
cTGCCGCATATCGGCCAGGTTCAGTGTGGAGTATGGCCAGCTGCTGTTCGCGAGAGCGCCCCTTCTCTGCTGTAATAATTTATCGCCGCCAGCGTCTGAg > 1:284725/1‑100 (MQ=255)
cTGCCGCATATCGGCCAGGTTCAGTGTGGAGTATGGCCAGCTGCTGTTCGCGAGAGCGCCCCTTCTCTGCTGTAATAATTTATCGCCGCCAGCGTCTGAg > 2:1264173/1‑100 (MQ=255)
tGCCGCATATCGGCCAGGTTCAGTGTGGAGTATGGCCAGCTGCTGATCGCGAGAGCGCCCCTTCTCTGCTGTAATAATTTATCGCCGCCAGCGTCTGAGc < 2:4758610/100‑1 (MQ=255)
gCCGCATATCGGCCAGGTTCAGTGTGGAGTATGGCCAGCTGCTGTTCGCGAGAGCGCCCCTTCTCTGCTGTAATAATTTATCGCCGCCAGCGTCTGAGCa > 1:1203665/1‑100 (MQ=255)
cGCATATCGGCCAGGTTCAGTGTGGAGTATGGCCAGCTGCTGTTCGCGAGAGCGCCCCTTCTCTGCTGTAATAATTTATCGCCGCCAGCGTCTGAGCAgg > 1:1135746/1‑100 (MQ=255)
gCATATCGGCCAGGTTCAGTGTGGAGTATGGCCAGCTGCTGTTCGCGAGAGCGCCCCTTCTCTGCTGTAATAATTTATCGCCGCCAGCGTCTGAGCAggc < 1:2622603/100‑1 (MQ=255)
cATATCGGCCAGGTTCAGTGTGGAGTATGGCCAGCTGCTGTTCGCGAGAGCGCCCCTTCTCTGCTGTAATAATTTATCGCCGCCAGCGTCTGAGCAggcg > 1:2703845/1‑100 (MQ=255)
atatCGGCCAGGTTCAGTGTGGAGTATGGCCAGCTGCTGTTCGCGAGAGCGCCCCTTCTCTGCTGTAATAATTTATCGCCGCCAGCGTCTGAGCAggcgg > 1:2639611/1‑100 (MQ=255)
atCGGCCAGGTTCAGCGTGGAGTATGGCCAGCTGCTGTTCGCGAGAGCGCCCCTTCTCTGCTGTAATAATTTATCGCCGCCAGCGTCTGAGCAGGCGGCt < 2:494070/100‑1 (MQ=255)
cggccggcTTCAGGGTGGAGTATGGCCAGGTGCTGTGCGCGTGGGCGCCCCTGCCCTGCTGCAATGATTGATTGCCGCGAGCGTCTGAGCAGGCGGCGTc < 2:2086662/100‑1 (MQ=255)
cGGCCAGGTTCAGTGTGGAGTATGGCCAGCTGCTGTTCGCGAGAGCGCCCCTTCTCTGCTGTAATAATTTATCGCCGCCAGCGTCTGAGCAGGCGGCTTc < 1:669933/100‑1 (MQ=255)
cGGCCAGGTTCAGTGTGGAGTATGGCCAGCTGCTGTTCGCGAGAGCGCCCCTTCTCTGCTGTAATAATTTATCGCCGCCAGCGTCTGAGCAGGCGGCTTc < 1:2021980/100‑1 (MQ=255)
ggCCAGGTTCAGTGTGGAGTATGGCCAGCTGCTGTTCGCGAGAGCGCCCCTTCTCTGCTGTAATAATTTATCGCCGCCAGCGTCTGAGCAGGCGGCTTCg > 1:157178/1‑100 (MQ=255)
ggCCAGGTTCAGTGTGGAGTATGGCCAGCTGCTGTTCGCGAGAGCGCCCCTTCTCTGCTGTAATAATTTATCGCCGCCAGCGTCTGAGCAGGCGGCTTCg > 2:128228/1‑100 (MQ=255)
ggCCAGGTTCAGTGTGGAGTATGGCCAGCTGCTGTTCGCGAGAGCGCCCCTTCTCTGCTGTAATAATTTATCGCCGCCAGCGTCTGAGCAGGCGGCTTCg > 1:2469538/1‑100 (MQ=255)
ggCCAGGTTCAGTGTGGAGTATGGCCAGCTGCTGTTCGCGAGAGCGCCCCTTCTCTGCTGTAATAATTTATCGCCGCCAGCGTCTGAGCAGGCGGCTTCg > 2:2523403/1‑100 (MQ=255)
gCCAGGTTCAGTGTGGAGTATGGCCAGCTGCTGTTCGCGAGAGCGCCCCTTCTCTGCTGTAATAATTTATCGCCGCCAGCGTCTGAGCAGGCGGCTTCGc < 2:582220/100‑1 (MQ=255)
gCCAGGTTCAGTGTGGAGTATGGCCAGCTGCTGTTCGCGAGAGCGCCCCTTCTCTGCTGTAATAATTTATCGCCGCCAGCGTCTGAGCAGGCGGCTTCGc > 1:749804/1‑100 (MQ=255)
ccAGGTTCAGTGTGGAGTATGGCCAGCTGCTGTTCGCGAGAGCGCCCCTTCTCTGCTGTAATAATTTATCGCCGCCAGCGTCTGAGCAGGCGGCTTCGCa < 1:1306168/100‑1 (MQ=255)
ccAGGTTCAGTGTGGAGTATGGCCAGCTGCTGTTCGCGAGAGCGCCCCTTCTCTGCTGTAATAATTTATCGCCGCCAGCGTCTGAGCAGGCGGCTTCGCa < 1:4764140/100‑1 (MQ=255)
cAGGTTCAGTGTGGAGTATGGCCAGCTGCTGTTCGCGAGAGCGCCCCTTCTCTGCTGTAATAATTTATCGCCGCCAGCGTCTGAGCAGGCGGCTTCGCAt < 2:3523901/100‑1 (MQ=255)
cAGGTTCAGTATGGAGTATGGCCAGCTGCTGTTCGCGAGAGCGCCCCTTCTCTGCTGTAATAAGTTATCGCCGCGAGCATCTGAGCAGGCGGCTTCGCAt > 2:4807207/1‑100 (MQ=255)
ggTTCAGTGTGGAGTATGGCCAGCTGCTGTTCGCGAGAGCGCCCCTTCTCTGCTGTAATAATTTATCGCCGCCAGCGTCTGAGCAGGCGGCTTCGCATcc < 2:3540561/100‑1 (MQ=255)
ggTTCAGTGTGGAGTATGGCCAGCTGCTGTTCGCGAGAGCGCCCCTTCTCTGCTGTAATAATTTATCGCCGCCAGCGTCTGAGCAGGCGGCTTCGCATcc > 1:4463260/1‑100 (MQ=255)
ttCAGTGTGGAGTATGGCCAGCTGCTGTTCGCGAGAGCGCCCCTTTTCTGCTCTAATAATTTATCGCCGCCAGCGTCTGAGCAGGTGGCTTCGCATCCCg < 2:4751973/100‑1 (MQ=255)
ttCAGTGTGGAGTATGGCCAGCTGCTGTTCGCGAGAGCGCCCCTTCTCTGCTGTAATAATTTATCGCCGCCAGCGTCTGAGCAGGCGGCTTCGCATCCCg > 1:1378060/1‑100 (MQ=255)
ttCAGTGTGGAGTATGGCCAGCTGCTGTTCGCGAGAGCGCCCCTTCTCTGCTGTAATAATTTATCGCCGCCAGCGTCTGAGCAGGCGGCTTCGCATCCCg < 2:3856463/100‑1 (MQ=255)
ttCAGTGTGGAGTATGGCCAGCTGCTGTTCGCGAGAGCGCCCCTTCTCTGCTGTAATAATTTATCGCCGCCAGCGTCTGAGCAGGCGGCTTCGCATCCCg < 2:1320078/100‑1 (MQ=255)
gtgtGGAGTATGGCCAGCTGCTGTTCGCGAGAGCGCCCCTTCTCTGCTGTAATAATTTATCGCCGCCAGCGTCTGAGCAGGCGGCTTCGCATCCCGGTAt < 1:2081024/100‑1 (MQ=255)
gtgtGGAGTATGGCCAGCTGCTGTTCGCGAGAGCGCCCCTTCTCTGCTGTAATAATTTATCGCCGCCAGCGTCTGAGCAGGCGGCTTCGCATCCCGGTAt > 2:500935/1‑100 (MQ=255)
gtgtGGAGTATGGCCAGCTGCTGTTCGCGAGAGCGCCCCTTCTCTGCTGTAATAATTTATCGCCGCCAGCGTCTGAGCAGGCGGCTTCGCATCCCGGTAt > 1:3146719/1‑100 (MQ=255)
tgtgGAGTATGGCCAGCTGCTGTTCGCGAGAGCGCCCCTTCTCTGCTGTAATAATTTATCGCCGCCAGCGTCTGAGCAGGCGGCTTCGCCTCCCGGTATc > 2:80735/1‑100 (MQ=255)
tgGAGTATGGCCAGCTGCTGTTCGCGAGCGCGCCCCTTCTCTGCTGTAATAATTTATCGCCGCCAGCGTCTGAGCAGGCGGCTTCGCATCCCGGTATCan < 2:2192641/100‑2 (MQ=255)
tgGAGTATGGCCAGCTGCTGTTCGCGAGAGCGCCCCTTCTCTGCTGTAATAATTTATCGCCGCCAGCGTCTGAGCAGGCGGCTTCGCATCCCGGTATCaa < 1:432576/100‑1 (MQ=255)
gAGTATGGCCAGCTGCTGTTCGCGAGAGCGCCCCTTCTCTGCTGTAATAATTTATCGCCGCCAGCGTCTGAGCAGGCGGCTTCGCATCCCGGTATCAAAg > 1:3362307/1‑100 (MQ=255)
gAGTATGGCCAGCTGCTGTTCGCGAGAGCGCCCCTTCTCTGCTGTAATAATTTATCGCCGCCAGCGTCTGAGCAGGCGGCTTCGCATCCCGGTATCAAAg < 1:4149747/100‑1 (MQ=255)
gTATGGCCAGCTGCTGTTCGCGAGAGCGCCCCTTCTCTGCTGTAATAATTTATCGCCGCCAGCGTCTGAGCAGGCGGCTTCGCATCCCGGTATCAAAgcg > 1:3504279/1‑100 (MQ=255)
aTGGCCAGCTGCTGTTCGCGAGAGCGCCCCTTCTCTGCTGTAATAATTTATCGCCGCCAGCGTCTGAGCAGGCGGCTTCGCATCCCGGTATCAAAGCGcc < 2:4474061/100‑1 (MQ=255)
tGGCCAGCTGCTGTTCGCGAGAGCGCCCCTTCTCTGCTGTAATAATTTATCGCCGCCAGCGTCTGAGCAGGCGGCTTCGCATCCCGGTATCAAAGCGCCa > 2:2254470/1‑100 (MQ=255)
tGGCCAGCTGCTGTTCGCGAGAGCGCCCCTTCTCTGCTGTAATAATTTATCGCCGCCAGCGTCTGAGCAGGCGGCTTCGCATCCCGGTATCAAAGCGCCa < 2:1168445/100‑1 (MQ=255)
gCCAGCTGCTGTTCGCGAGAGCGCCCCTTCTCTGCTGTAATAATTTATCGCCGCCAGCGTCTGAGCAGGCGGCTTCGCATCCCGGTATCAAAGCGCCAGa > 1:1455954/1‑100 (MQ=255)
aGCTGCTGTTCGCGAGAGCGCCCCTTCTCTGCTGTAATAATTTATCGCCGCCAGCGTCTGAGCAGGCGGCTTCGCATCCCGGTATCAAAGCGCCAGatat < 1:4439195/100‑1 (MQ=255)
tgctgTTCGCGAGAGCGCCCCTTCTCTGCTGTAATAATTTATCGCCGCCAGCGTCTGAGCAGGCGGCTTCGCATCCCGGTATCAAAGCGCCAGATATGAt < 1:2952544/100‑1 (MQ=255)
ctgTTCGCGAGAGCGCCCCTTCTCTGCTGTAATAATTTATCGCCGCCAGCGTCTGAGCAGGCGGCTTCGCATCCCGGTATCAAAGCGCCAGATATGATCg < 1:5019747/100‑1 (MQ=255)
tgTTCGCGAGAGCGCCCCTTCTCTGCTGTAATAATTTATCGCCGCCAGCGTCTGAGCAGGCGGCTTCGCATCCCGGTATCAAAGCGCCAGATATGATCGa > 1:2415140/1‑100 (MQ=255)
tgTTCGCGAGAGCGCCCCTTCTCTGCTGTAATAATTTATCGCCGCCAGCGTCTGAGCAGGCGGCTTCGCATCCCGGTATCAAAGCGCCAGATATGATCGa > 2:2648918/1‑100 (MQ=255)
gTTCGCGAGAGCGCCCCTTCTCTGCTGTAATAATTTATCGCCGCCAGCGTCTGAGCAGGCGGCTTCGCATCCCGGTATCAAAGCGCCAGATATGATCGaa > 1:122358/1‑100 (MQ=255)
cgcgAGAGCGCCCCTTCTCTGCTGTAATAATTTATCGCCGCCAGCGTCTGAGCAGGCGGCTTCGCATCCCGGTATCAAAGCGCCAGATATGATCGAAAAt > 2:3039767/1‑100 (MQ=255)
cgcgAGAGCGCCCCTTCTCTGCTGTAATAATTTATCGCCGCCAGCGTCTGAGCAGGCGGCTTCGCATCCCGGTATCAAAGCGCCAGATATGATCGAAAAt < 2:4930819/100‑1 (MQ=255)
cgcgAGAGCGCCCCTTCTCTGCTGTAATAATTTATCGCCGCCAGCGTCTGAGCAGGCGGCTTCGCATCCCGGTATCAAAGCGCCAGATATGATCGAAAAt > 1:2228721/1‑100 (MQ=255)
cgcgAGAGCGCCCCTTCTCTGCTGTAATAATTTATCGCCGCCAGCGTCTGAGCAGGCGGCTTCGCATCCCGGTATCAAAGCGCCAGATATGATCGAAAAt > 2:2279024/1‑100 (MQ=255)
cgcgAGAGCGCCCCTTCTCTGCTGTAATAATTTATCGCCGCCAGCGTCTGAGCAGGCGGCTTCGCATCCCGGTATCAAAGCGCCAGATATGATCGAAAAt > 1:1006100/1‑100 (MQ=255)
gcgAGAGCGCCCCTTCTCTGCTGTAATAATTTATCGCCGCCAGCGTCTGAGCAGGCGGCTTCGCATCCCGGTATCAAAGCGCCAGATATGATCGAAAATg < 1:1991135/100‑1 (MQ=255)
cgAGAGCGCCCCTTCTCTGCTGTAATAATTTATCGCCGCCAGCGTCTGAGCAGGCGGCTTCGCATCCCGGTATCAAAGCGCCAGATATGATCGAAAATgc < 2:1514344/100‑1 (MQ=255)
cgAGAGCGCCCCTTCTCTGCTGTAATAATTTATCGCCGCCAGCGTCTGAGCAGGCGGCTTCGCATCCCGGTATCAAAGCGCCAGATATGATCGAAAATgc < 1:5079651/100‑1 (MQ=255)
cgAGAGCGCCCCTTCTCTGCTGTAATAATTTATCGCCGCCAGCGTCTGAGCAGGCGGCTTCGCATCCCGGTATCAAAGCGCCAGATATGATCGAAAATgc > 1:5209/1‑100 (MQ=255)
gagaGCGCCCCTTCTCTGCTGTAATAATTTATCGCCGCCAGCGTCTGAGCAGGCGGCTTCGCATCCCGGTATCAAAGCGCCAGATATGATCGAAAATgcg > 1:4946893/1‑100 (MQ=255)
gagCGCCCCTTCTCTGCTGTAATAATTTATCGCCGCCAGCGTCTGAGCAGGCGGCTTCGCATCCCGGTATCAAAGCGCCAGATATGATCGAAAATGCGCa < 2:4391114/100‑1 (MQ=255)
agCGCCCCTTCTCTGCTGTAATAATTTATCGCCGCCAGCGTCTGAGCAGGCGGCTTCGCATCCCGGTATCAAAGCGCCAGATATGATCGAAAATGCGCat < 1:1870671/100‑1 (MQ=255)
|
GGTATCGGCCAGTCTCGTTTGACTATGCTGCTGCTGCAACTGCCGCATATCGGCCAGGTTCAGTGTGGAGTATGGCCAGCTGCTGTTCGCGAGAGCGTCCCTTCTCTGCTGTAATAATTTATCGCCGCCAGCGTCTGAGCAGGCGGCTTCGCATCCCGGTATCAAAGCGCCAGATATGATCGAAAATGCGCATG > NC_000913/3928034‑3928227
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
N/A
