Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A7 F422 I52 R1
|
239 |
220.4 |
11079197 |
93.2% |
10325811 |
100.0 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
NC_000913 |
3,014,506 |
T→G |
Q184H (CAA→CAC) |
yqeC ← |
putative selenium‑dependent hydroxylase accessory protein |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | NC_000913 | 3,014,506 | 0 | T | G | 96.0%
| 581.0
/ 3.2
| 174 | Q184H (CAA→CAC) | yqeC | putative selenium‑dependent hydroxylase accessory protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (2/5); new base G (80/87); total (82/92) |
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 4.49e-01 |
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
Only 100 of 175 total aligned reads displayed.
TTGAGAAAAACGGTTAATGAACCAGACTCGCCGACAACCTTGCGGTACGTTTTTAAACGCCCCCTGAGGGTGGCGAACCAGCGCAACGAGATCGCTCAGTTGCAAGGTTGCATCAGGTGTTAACCCGGTAATATCAGCAAACTGCGACCAGCGATGGACATTTTCTGTGCTCACTTTCGCGCCCAAAGTATGTC > NC_000913/3014407‑3014600
|
ttGAGAAAAACGGTTAATGAACCAGACTCGCCGACAACCTTGCGGTACGTTTTTAAACGCCCCCTGAGGGTGGCGAACCAGCGCAACGAGATCGCTCAGt < 1:4853065/100‑1 (MQ=255)
gagaAAAACGGTTAATGAACCAGACTCGCCGACAACCTTGCGGTACGTTTTTAAACGCCCCCTGAGGGTGGCGAACCAGCGCAACGAGATCGCTCAGGTg < 1:988265/100‑1 (MQ=255)
gaAAAACGGTTAATGAACCAGACTCGCCGACAACCTTGCGGTACGTTTTTACACGCCCCCTGAGGGTGGCGAACCAGCGCAACGAGATCGCCCAGGTGCa > 1:5302258/1‑100 (MQ=255)
gaAAAACGGTTAATGAACCAGACTCGCCGACAACCTTGCGGTACGTTTTTAAACGCCCCCTGAGGGTGGCGAACCAGCGCAACGAGATCGCTCAGGTGCa > 2:3030528/1‑100 (MQ=255)
aaaaCGGTTAATTAACCATACTCGCCGACAACCTTGCGGTACGTTTTTAAACGCCCCCTGAGGGTGGCGAACCAGCGCAACGAGATCGCTCAGGTGCAAg < 2:4147254/100‑1 (MQ=255)
cGGTTAATGAACCAGACTCGCCGACAACCTTGCGGTACGTTTTTAAACGCCCCCTGAGGGTGGCGAACCAGCGCAACGAGATCGCTCAGGTGCAAGGTTg < 2:2681134/100‑1 (MQ=255)
tgTTAATGAACCAGACTCGCCGACAACCTTGCGGTACGTTTTTAAACGCCCCCTGAGGGTGGCGAACCAGCGCAACGAGATCGCTCAGGTGCAAGGTTGc < 1:4187564/99‑1 (MQ=255)
ggTTAATCAACCAGACTCGCCGACAACCTTGCGGTACGTTTTTAAACGCCCCCTGAGGGTGGCGAACCAGCGCAACGAGATCGCTCAGGTGCAAGGTTGc < 1:4938767/100‑1 (MQ=255)
gTTAATGAACCAGACTCGCCGACAACCTTGCGGTACGTTTTTAAACGCCCCCTGAGGGTGGCGAACCAGCGCAACGAGGTCGCTCAGGTGCAAGGTTGCa < 2:828259/100‑1 (MQ=255)
gTTAATGAACCAGACTCGCCGACAACCTTGCGGTACGTTTTTAAACGCCCCCTGAGGGTGGCGAACCAGCGCAACGAGATCGCTCAGGTGCAAGGTTGCa < 2:1335349/100‑1 (MQ=255)
ttAATGAACCAGACTCGCCGACAACCTTGCGGTACGTTTTTAAACGCCCCCTGAGGGTGGCGAACCAGCGCAACGAGATCGCTCAGGTGCCAGGTTGCAt > 1:2026362/1‑100 (MQ=255)
tAATGAACCAGACTCGCCGACAACCTTGCGGTACGTTTTTAAACGCCCCCTGAGGGTGGCGAACCAGCGCAACGAGATCGCTCAGGTGCAAGGTTGCATc < 1:3720574/100‑1 (MQ=255)
aTGAACCAGACTCGCCGACAACCTTGCGGTACGTTTTTAAACGCCCCCTGAGGGTGGCGAACCAGCGCAACGAGATCGCTCAGGTGCAAGGTTCCATCAg > 1:2662125/1‑100 (MQ=255)
tGAACCAGACTCGCCGACAACCTTGCGGTACGTTTTTAAACGCCCCCTGAGGGTGGCGAACCAGCGCAACGAGATCGCTCAGGTGCAAGGTTGCATCAgg > 1:3115157/1‑100 (MQ=255)
gAACCAGACTCGCCGACAACCTTGCGGTACGTTTTTAAACGCCCCCTGAGGGTGGCGAACCAGCGCAACGAGATCGCTCAGGTGCAAGGTTCCATCAGgt > 1:4022895/1‑100 (MQ=255)
aaCCAGACTCGCCGACAACCTTGCGGTACGTTTTTAAACGCCCCCTGAGGGTGGCGAACCAGCGCAACGAGATCGCTCAGGTGCAAGGTTGCATCAGgtg < 1:599283/100‑1 (MQ=255)
aaCCAGACTCGCCGACAACCTTGCGGTACGTTTTTAAACGCCCCCTGAGGGTGGCGAACCAGCGCAACGAGATCGCTCAGGTGCAAGGTTGCATCAGgtg < 1:2619082/100‑1 (MQ=255)
aaCCAGACTCGCCGACAACCTTGCGGTACGGTTTTAAACGCCCCCTGAGGGTGGCGAACCAGCGCAACGAGATCGCTCAGGTGCAAGGTTGCATCAGgtg < 1:1042637/100‑1 (MQ=255)
aCCAGACTCGCCGACAACCTTGCGGTACGTTTTTAAACGCCCCCTGAGGGTGGCGAACCAGCGCAACGAGATCGCTCAGTTGCAAGGTTGCATCAGgtgt < 1:3952817/100‑1 (MQ=255)
ccAGACTCGCCGACAACCTTGCGGTACGTTTTTAAACGCCCCCTGAGGGTGGCGAACCAGCGCAACGAGATCGCTCAGGTGCAAGGTTGCATCAGGTGtt < 1:4325085/100‑1 (MQ=255)
aGACTCGCCGACAACCTTGCGGTACGTTTTTAAACGCCCCCTGAGGGTGGCGAACCAGCGCAACGAGATCGCTCAGGTGCAAGGTTGCATCAGGTGTTaa < 2:1442180/100‑1 (MQ=255)
gACTCGCCGACAACCTTGCGGTACGTTTTTAAACGCCCCCTGAGGGTGGCGAACCAGCGCAACGAGATCGCTCAGGTGCAAGGTTGCATCAGGTGTTAAc < 1:2828281/100‑1 (MQ=255)
cTCGCCGACAACCTTGCGGTACGTTTTTAAACGCCCCCTGAGGGTGGCGAACCAGCGCAACGAGATCGCTCAGGTGCAAGGTTGCATCAGGTGTTAAccc < 1:312500/100‑1 (MQ=255)
cTCGCCGACAACCTTGCGGTACGTTTTTAAACGCCCCCTGAGGGTGGCGAACCAGCGCAACGAGATCGCTCAGGTGCAAGGTTGCATCAGGTGTTAAccc < 2:4889599/100‑1 (MQ=255)
cGCCGACAACCTTGCGGTACGTTTTTAAACGCCCCCTGAGGGTGGCGAACCAGCGCAACGAGATCGCTCAGGTGCAAGGTTGCATCAGGTGTTAACCCgg > 2:2027603/1‑100 (MQ=255)
gCCGACAACCTTGCGGTACGTTTTTAAACGCCCCCTGAGGGTGGCGAACCAGCGCAACGAGATCGCTCAGGTGCAAGGTTGCATCAGGTGTTAACCCGGt < 2:4739092/100‑1 (MQ=255)
ccGACAACCTTGCGGTACGTTTTTAAACGCCCCCTGAGGGTGGCGAACCAGCGCAACGAGATCGCTCAGGTGCAAGGTTGCATCAGGTGTTAACCCGGTa > 2:329699/1‑100 (MQ=255)
ccGACAACCTTGCGGTACGTTTTTAAACGCCCCCTGAGGGTGGCGAACCAGCGCAACGAGATCGCTCAGGTGCAAGGTTGCATCAGGTGTTAACCCGGTa < 1:445118/100‑1 (MQ=255)
gACAACCTTGCGGTACGTTTTTAAACGCCCCCTGAGGGTGGCGAACCAGCGCAACGAGATCGCTCAGGTGCAAGGTTGCATCAGGTGTTAACCCGGTAat < 1:1416596/100‑1 (MQ=255)
aCAACCTTGCGGTACGTTTTTAAACGCCCCCTGAGGGTGGCGAACCAGCGCAACGAGATCGCTCAGGTGCAAGGTTGCATCAGGTGTTAACCCGGTAata < 2:3806817/100‑1 (MQ=255)
aCAACCTTGCGGTACGTTTTTAAACGCCCCCTGAGGGTGGCGAACCAACGCAACGAGATCGCTCAGGTGCAAGGTTGCATCAGGTGTTAACCCGGTAata < 2:1189412/100‑1 (MQ=255)
cAAACTTGCGGTACGTTTTTAAACGCTCCCTGAGGGTGGCGAACCAGCGCAACGAGATCGCTCAGTTGCAAGGTTGCATCAGGTGTTAACCCGGTAatat > 2:1266256/1‑100 (MQ=255)
ncTTGCGGTACGTTTTTAAACGCCCCCTGAGGGTGGCGAACCAGCGCAACGAGATCGCTCAGGTGCAAGGTTGCATCAGGTGTTAACCCGGTAATATCAg > 2:4713866/2‑100 (MQ=255)
ccTTGCGGTACGTTTTTAAACGCCCCCTGAGGGTGGCGAACCAGCGCAACGAGATCGCTCAGGTGCAAGGTTGCATCAGGTGTTAACCCGGTAATATCAg < 2:814606/100‑1 (MQ=255)
ccTTGCGGTACGTTTTTAAACGCCCCCTGAGGGTGGCGAACCAGCGCAACGAGATCGCTCAGGTGCAAGGTTGCATCAGGTGTTAACCCGGTAATATCAg < 1:1449873/100‑1 (MQ=255)
ccTTGCGGTACGTTTTTAAACGCCCCCTGAGGGTGGCGAACCAGCGCAACGAGATCGCTCAGGTGCAAGGTTGCATCAGGTGTTAACCCGGTAATATCAg < 1:1635824/100‑1 (MQ=255)
cTTGCGGTACGTTTTTAAACGCCCCCTGAGGGTGGCGAACCAGCGCAACGAGATCGCTCAGGTGCAAGGTTGCATCAGGTGTTAACCCGGTAATATCAGc < 1:1093500/100‑1 (MQ=255)
cTTGCGGTACGTTTTTAAACGCCCCCTGAGGGTGGCGAACCAGCGCAACGAGATCGCTCAGGTGCAAGGTTGCATCAGGTGTTAACCCGGTAATATCAGc < 1:4530739/100‑1 (MQ=255)
ttGCAGTACGTTTTAAAATTCCCGCTTAGGGTGGCGAACAGGCGTATCGAGATCGCACAGTTGCAAGGTTGCATCAGGTGTTATCCCGCAAATCTCAgta < 2:5096321/100‑3 (MQ=255)
gCGGTACGTTTTTAAACGCCCCCTGAGGGTGGCGAACCAGCGCAACGAGATCGCTCAGGTGCAAGGTTGCATCAGGTGTTAACCCGGTAATATCAGCaaa > 2:550389/1‑100 (MQ=255)
cGGTACGTTTTTAAACGCCCCCTGAGGGTGGCGAACCAGCGCAACGAGATCGCTCAGGTGCAAGGTTGCTTCCGGTGTTACCCCTGTAACATCAGCacac > 1:5356541/1‑100 (MQ=255)
aCGTTTTTAAACGCCCCCTGAGGGTGGCGAACCAGCGCAACGAGATCGCTCAGGTGCAAGGTTGCATCAGGTGTTACCCCGTTAACATCCGCAAACTGCg > 1:4346097/1‑100 (MQ=255)
aCGTTTTTAAACGCCCCCTGAGGGTGGCGAACCAGCGCAACGAGATCGCTCAGGTGCAAGGTTGCATCAGGTCTTAACCCGTTAATATCAGCACACTGCg > 1:3837599/1‑100 (MQ=255)
cGTTTTTAAACGCCCCTTGAGGGTGGCGAACCAGCGCAACGAGATCGCTCAGGTGCAAGGTTGCATCGGGTGTTAACCCGGTGCTATCAGCAAACTGCGa > 2:4361331/1‑100 (MQ=255)
cGTTTTTAAACGCCCCCTGAGGGTGGCGAACCAGCGCAACGAGATCGCTCAGGTGCAAGGTTGCATCAGGTGTTAACCCGGTAATATCAGCAAACTGCGa > 2:323409/1‑100 (MQ=255)
gTTTTTAAACGCCCCCTGAGGGTGGCGAACCAGCGCAACGAGATCGCTCAGGTGCAAGGTTGCATCAGGTGTTAACCCGGTAATATCAGCAAACTGCGAc > 2:4143486/1‑100 (MQ=255)
tttttAAACGCCCCCTGAGGGTGGCGAACCAGCGCAACGAGATCGCTCAGGTGCAAGGTTGCATCAGGTGTTAACCCGGTAATATCAGCAAACTGCGAcc < 2:4279314/100‑1 (MQ=255)
tttttAAACGCCCCCTGAGGGTGGCGAACCAGCGCAACGAGATCGCTCAGGTGCAAGGTTGCATCAGGTGTTAACCCGGTAATATCAGCAAACTGCGAcc < 2:1260024/100‑1 (MQ=255)
ttttAAACGCCCCCTGAGGGTGGCGAACCAGCGCAACGAGATCGCTCAGGTGCAAGGTTCCATCGGGTGTTACCCCGGTAACATCAGCACACTGCGACCa > 1:5029443/1‑100 (MQ=255)
ttttAAACGCCCCCTGAGGGTGGCGAACCAGCGCAACGAGATCGCTCAGGTGCAAGGTTCCATCAGGTGTTACCCTGGTAACGTCAGCACACCCCGACCa > 1:2552854/1‑100 (MQ=255)
tAAACGCCCCCTGAGGGTGGCGAACCAGCGCAACGAGATCGCTCAGGTGCAAGGTTGCATCAGGTGTTAACCCGTTAATATCAGCAAACTGCGACCAGCg < 2:4377152/100‑1 (MQ=255)
tAAACGCCCCCTGAGGGTGGCGAACCAGCGCAACGAGATCGCTCAGGTGCAAGGTTGCATCAGGTGTTAACCCGGTAATATCAGCAAACTGCGACCAGCg < 1:2172976/100‑1 (MQ=255)
tAAACGCCCCCTGAGGGTGGCGAACCAGCGCAACGAGATCGCTCAGGTGCAAGGTTGCATCAGGTGTTAACCCGGTAATATCAGCAAACTGCGACCAGCg < 2:3976489/100‑1 (MQ=255)
aaaCGCCCCCTGAGGGTGGCGAACCAGCGCAACGAGATCGCTCAGGTGCAAGGTTGCATCAGGTGTTAACCCGGTAATATCAGCAAACTGCGACCAGCGa > 2:2167963/1‑100 (MQ=255)
aaaCGCCCCCTGAGGGTGGCGAACCAGCGCAACGAGATCGCTCAGGTGCAAGGTTGCATCAGGTGTTAACCCGGTAATATCAGCAAACTGCGACCAGCGa > 2:1842544/1‑100 (MQ=255)
aaCGCCCCCTGAGGGTGGCGAACCAGCGCAACGAGATCGCTCAGGTGCAAGGTTGCATCAGGTGTTAACCCGGTAATATCAGCAAACTGCGACCAGCGAt > 2:772247/1‑100 (MQ=255)
aaCGCCCCCTGAGGGTGGCGAACCAGCGCAACGAGATCGCTCAGGTGCAAGGTTGCATCAGGTGTTAACCCGGTAATATCAGCAAACTGCGACCAGCCAt > 2:1708442/1‑100 (MQ=255)
aCGCCCCCTGAGGGTGGCGAACCAGCGCAACGAGATCGCTCAGGTGCAAGGTTGCATCAGGTGTTAACCCGGTAATATCAGCAAACTGCGACCAGCGATg < 1:4182038/100‑1 (MQ=255)
aCGCCCCCTGAGGGTGGCGAACCAGCGCAACGAGATCGCTCAGGTGCAAGGTTGCATCAGGTGTTAACCCGGTAATATCAGCAAACTGCGACCAGCGATg < 1:3595761/100‑1 (MQ=255)
cGCCCCCTGAGGGTGGCGAACCAGCGCAACGAGATCGCTCAGGTGCAAGGTTGCATCAGGTGTTAACCCGGTAATATCAGCAAACTGCGACCAGCGATgg > 2:3812000/1‑100 (MQ=255)
cccccTGAGGGTGGCGAACCAGCGCAACGAGATCGCTCAGGTGCAAGGTTGCATCAGGTGTTAACCCGGTAATATCAGCAAACTGCGACCAGCGATGGAc > 2:3712876/1‑100 (MQ=255)
ncccTGAGGGTGGCGAACCAGCGCAACGAGATCGCTCAGGTGCAAGGTTGCATCAGGTGCTAACCCGGTAATATCAGCAAACTGCGACCAGCGATGGACa > 1:4417455/2‑100 (MQ=255)
ccccTGAGGGTGGCGAACCAGCGCAACGAGATCGCTCAGGTGCAAGGTTGCATCAGGTGTTAACCCGGTAATATCAGCAAACTGCGACCAGCGATGGACa > 2:1549447/1‑100 (MQ=255)
ccTGAGGGTGGCGAACCAGCGCAACGAGATCGCTCAGGTGCAAGGTTGCATCAGGTGTTAACCCGGTAATATCAGCAAACTGCGACCAGCGATGGACAtt > 1:1019559/1‑100 (MQ=255)
ccTGAGGGTGGCGAACCAGCGCAACGAGATCGCTCAGGTGCAAGGTTGCATCAGGTGTTAACCCGGTAATATCAGCAAACTGCGACCAGCGATGGACAtt > 2:1497625/1‑100 (MQ=255)
cTGAGGGTGGCGAACCAGCGCAACGAGATCGCTCAGGTGCAAGGTTGCATCAGGTGTTAACCCGGTAATATCAGCAAACTGCGACCAGCGATGGACAttt < 2:2975438/100‑1 (MQ=255)
tGAGGGTGGCGAACCAGCGCAACGAGATCGCTCAGGTGCAAGGTTGCATCAGGTGTTAACCCGGTAATATCAGCAAACTGCGACCAGCGATGGACAtttt > 2:4243374/1‑100 (MQ=255)
gAGGGTGGCGAACCAGCGCAACGAGATCGCTCAGGTGCAAGGTTGCATCAGGTGTTAACCCGGTAATATCAGCAAGCTGCGACCAGCGATGGACATTTTc < 2:5153406/100‑1 (MQ=255)
aGGGTGGCGAACCAGCGCAACGAGATCACTCAGGTGCAAGGTTGCATCAGGTGTTAACCCGGTAATATCAGCAAACTGCGACCAGCGATGGACATTTTCt < 2:1803194/100‑1 (MQ=255)
gggTGGCGAACCAGCGCAACGAGATCGCTCAGGTGCAAGGTTGCATCAGGTGTGAACCCGGTAATATCATCAAACTGCGACCAGCGATGGCCATTTTCtg > 1:1541062/1‑100 (MQ=255)
gTGGCGAACCAGCGCAACGAGATAGCTCAGGTGAAAGGTTGAATCAGATGTTAACACGGTAATATCAGATAACTGCGACCTGAGATGGACATATTCtgtc > 2:531363/1‑99 (MQ=255)
ggCGAACCAGCGCAACGAGATCGCTCAGGTGCAAGGTTGCATCAGGTGTTAACCCGGTAATATCAGCAAACTGCGACCAGCGATGGACATTTTCTGTGCt < 2:2350361/100‑1 (MQ=255)
ggCGAACCAGCGCAACGAGATCGCTCAGGTGCAAGGTTGCATCAGGTGTTAACCCGGTAATATCAGCAAACTGCGACCAGCGATGGACATTTTCTGTGCt > 1:1233586/1‑100 (MQ=255)
ccaaCCAGCGCAACAAGATCGCTCAGGTGCAAGAGTGCATCATGTGTTAACCCGGTAATATCAGCAAACTGCTACCAGCGATGGACATTTTCTGTGCTCa < 2:950159/98‑1 (MQ=255)
cGAACCAGCGCAACGAGATCGCTCAGGTGCAAGGTTGCATCAGGTGTTAACCCGGTAATATCAGCAAACTGCGACCAGCGATGGACATTTTCTGTGCTCa < 2:2379703/100‑1 (MQ=255)
aCCAGCGCAACGAGATCGCTCAGGTGCAAGGTTGCATCAGGTGTTAACCCGGTAATATCAGCAAACTGCGACCAGCGATGGACATTTTCTGTGCTCACtt < 2:1377569/100‑1 (MQ=255)
aCCAGCGCAACGAGATCGCTCAGGTGCAAGGTTGCATCAGGTGTTAACCCGGTAATATCAGCAAACTGCGACCAGCGATGGACATTTTCTGTGCTCACtt > 1:2624570/1‑100 (MQ=255)
ccAGCGCAACGAGATCGCTCAGGTGCAAGGTTGCATCAGGTGTTAACCCGGTAATATCAGCAAACTGCGACCAGCGATGGACATTTTCTGTGCTCACttt < 2:3934167/100‑1 (MQ=255)
ccAGCGCAACGAGATCGCTCAGGTGCAAGGTTGCATCAGGTGTTAACCCGGTAATATCAGCAAACTGCGACCAGCGATGGACATTTTCTGTGCTCACttt < 2:3934219/100‑1 (MQ=255)
cAGCGCAACGAGATCGCTCAGGTGCAAGGTTGCATCAGGTGTTAACCCGGTAATATCAGCAAACTGCGACCAGCGATGGACATTTTCTGTGCTCACTTTc > 1:2167896/1‑100 (MQ=255)
aGCGCAACGAGATCGCTCAGGTGCAAGGTTGCATCAGGTGTTAACCCGGTAATATCAGCAAACTGCGACCAGCGATGGACATTTTCTGTGCTCACTTTcg < 2:1844585/100‑1 (MQ=255)
aGCGCAACGAGATCGCTCAGGTGCAAGGTTGCATCAGGTGTTAACCCGGTAATATCAGCAAACTGCGACCAGCGATGGACATTTTCTGTGCTCACTTTcg < 1:4068517/100‑1 (MQ=255)
aGCGCAACGAGATCGCTCAGGTGCAAGGTTGCATCAGGTGTTAACCCGGTAATATCAGCAAACTGCGACCAGCGATGGACATTTTCTGTGCTCACTTTcg < 2:4033347/100‑1 (MQ=255)
cgcAACGAGATCGCTCAGGTGCAAGGTTGCATCAGGTGTTAACCCGGTAATATCAGCAAACTGCGACCAGCGATGGACATTTTCTGTGCTCACTTTcgcg > 1:4623136/1‑100 (MQ=255)
cgcAACGAGATCGCTCAGGTGCAAGGTTGCATCAGGTGTTAACCCGGTAATATCAGCAAACTGCGACCAGCGATGGACATTTTCTGTGCTCACTTTcgcg < 1:4886421/100‑1 (MQ=255)
cgcAACGAGATCGCTAAGGTGCAAGGTTGCATCAGGTGTTAACCCGTTAATATCAGGTAACTGGGCCCAGCGATGGACATTTTCTGTGCTCACTTTcgca < 2:5151042/100‑2 (MQ=255)
cAACGAGATCGCTCAGGTGCAAGGTTGCATCAGGTGTTAACCCGGTAATATCAGCAAACTGCGACCAGCGATGGACATTTTCTGTGCTCACTTTCGCGcc > 1:4548594/1‑100 (MQ=255)
cAACGAGATCGCTCAGGTGCAAGGTTGCATCAGGTGTTAACCCGGTAATATCAGCAAACTGCGACCAGCGATGGACATTTTCTGTGCTCACTTTCGCGcc < 2:4375380/100‑1 (MQ=255)
aCGAGATCGCTCAGTTGCAAGGTTGCATCAGGTGTTAACCCGGTAATATCAGCAAACTGCGACCAGCGATGGACATTTTCTGTGCTCACTTTCGCGCCCa < 1:1283234/100‑1 (MQ=255)
gaTCGCTCAGGTGCAAGGTTGCATCAGGTGTTAACCCGGTAATATCAGCAAACTGCGACCAGCGATGGACATTTTCTGTGCTCACTTTCGCGCCCAAAGt > 1:1913822/1‑100 (MQ=255)
gaTCGCTCAGGTGCAAGGTTGCATCAGGTGTTAACCCGGTAATATCAGCAAACTGCGACCAGCGATGGACATTTTCTGTGCTCACTTTCGCGCCCAAAGt < 1:3173881/100‑1 (MQ=255)
cGCTCAGGTGCAAGGTTGCATCAGGTGTTAACCCGGTAATATCAGCAAACTGCGACCAGCGATGGACATTTTCTGTGCTCACTTTCGCGCCCAAAGTATg > 1:57839/1‑100 (MQ=255)
cGCTCAGGTGCAAGGTTGCATCAGGTGTTAACCCGGTAATATCAGCAAACTGCGACCAGCGATGGACATTTTCTGTGCTCACTTTCGCGCCCAAAGTATg > 1:47146/1‑100 (MQ=255)
cGCTCAGGTGCAAGGTTGCATCAGGTGTTAACCCGGTAATATCAGCAAACTGCGACCAGCGATGGACATTTTCTGTGCTCACTTTCGCGCCCAAAGTATg < 1:1754760/100‑1 (MQ=255)
gCTCAGGTGCAAGGTTGCATCAGGTGTTAACCCGGTAATATCAGCAAACTGCGACCAGCGATGGACATTTTCTGTGCTCACTTTCGCGCCCAAAGTATGt < 1:520816/100‑1 (MQ=255)
cTCAGGTGCAAGGTTGCATCAGGTGTTAACCCGGTAATATCAGCAAACTGCGACCAGCGATGGACATTTTCTGTGCTCGCTTTCGCGCCCAAGGTAGGtc > 2:4408257/1‑100 (MQ=255)
cTCAGGTGCAAGGTTGCATCAGGTGTTAACCCGGTAATATCAGCAAACTGCGACCAGCGATGGACATTTTCTGTGCTCACTTTCGCGCCCAAAGTATGtc > 1:2317155/1‑100 (MQ=255)
cTCAGGTGCAAGGTTGCATCAGGTGTTAACCCGGTAATATCAGCAAACTGCGACCAGCGATGGACATTTTCTGTGCTCACTTTCGCGCCCAAAGTATGtc > 1:325201/1‑100 (MQ=255)
cTCAGGTGCAAGGTTGCATCAGGTGTTAACCCGGTAATATCAGCAAACTGCGACCAGCGATGGACATTTTCTGTGCTCACTTTCGCGCCCAAAGTATGtc < 2:2598974/100‑1 (MQ=255)
cTCAGGTGCAAGGTTGCATCAGGTGTTAACCCGGTAATATCAGCAAACTGCGACCAGCGATGGACATTTTCTGTGCTCACTTTCGCGCCCAAAGTATGtc > 1:5422671/1‑100 (MQ=255)
|
TTGAGAAAAACGGTTAATGAACCAGACTCGCCGACAACCTTGCGGTACGTTTTTAAACGCCCCCTGAGGGTGGCGAACCAGCGCAACGAGATCGCTCAGTTGCAAGGTTGCATCAGGTGTTAACCCGGTAATATCAGCAAACTGCGACCAGCGATGGACATTTTCTGTGCTCACTTTCGCGCCCAAAGTATGTC > NC_000913/3014407‑3014600
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
N/A
