Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A7 F422 I53 R1
|
229 |
158.0 |
8090706 |
91.1% |
7370633 |
100.0 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
NC_000913 |
3,014,506 |
T→G |
Q184H (CAA→CAC) |
yqeC ← |
putative selenium‑dependent hydroxylase accessory protein |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | NC_000913 | 3,014,506 | 0 | T | G | 99.3%
| 495.8
/ ‑5.1
| 148 | Q184H (CAA→CAC) | yqeC | putative selenium‑dependent hydroxylase accessory protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (0/1); new base G (67/80); total (67/81) |
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 |
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.05e-01 |
Only 100 of 148 total aligned reads displayed.
GAGAAAAACGGTTAATGAACCAGACTCGCCGACAACCTTGCGGTACGTTTTTAAACGCCCCCTGAGGGTGGCGAACCAGCGCAACGAGATCGCTCAGTTGCAAGGTTGCATCAGGTGTTAACCCGGTAATATCAGCAAACTGCGACCAGCGATGGACATTTTCTGTGCTCACTTTCGCGCCCAAAGTATG > NC_000913/3014409‑3014598
|
agaAAAACGGTTAATGAACCAGACTCGCCGACAACCTTGCGGTACGTTTTTAAACGCCCCCTGAGGGTGGCGAACCAGCGCAACGAGATCGCTCAGGTGc > 1:560120/1‑100 (MQ=255)
agaAAAACGGTTAATGAACCAGACTCGCCGACAACCTTGCGGTACGGTTTTAAACGCCCCCTGAGGGTGGCGAACCAGCGCAACGAGATCGCTCCGGTGc > 1:868898/1‑100 (MQ=255)
agaAAAACGGTTAATGAACAAGACTCGCCGACAACCTTGCGGTACGTTTTTAAACGCCCCCTGAGGGTGGCGAACCAGCGCAACGAGATCGCTCAGGTGc > 2:3565769/1‑100 (MQ=255)
gaAAAACGGTTAATGAACCAGACTCGCCGACAACCTTGCGGTACGTTTTTAAACGCCCCCTGAGGGTGGCGAACCAGCGCAACGAGATCGCTCAGGTGCa > 2:2535302/1‑100 (MQ=255)
aaaaCGGTTAATGAACCAGACTCGCCGACAACCTTGCGGTACGTTTTTAAACGCCCCCTGAGGGTGGCGAACCAGCGCAACGAGATCGCTCAGGTGCAAg > 2:519448/1‑100 (MQ=255)
aaaCGGTTAATGAACCAGACTCGCCGACAACCTTGCGGTACGTTTTTAAACGCCCCCTGAGGGTGGCGAACCAGCGCAACGAGATCGCTTAGGTGCAAgg < 1:62035/100‑1 (MQ=255)
cGGTTAATGAACCAGACTCGCCGACAACCTTGCGGTACGTTTTTAAACGCCCCCTGAGGGTGGCGAACCAGCGCAACGAGATCGCCAAGGTGCAAGGTTg > 2:3435823/1‑100 (MQ=255)
ggTTAATGAACCAGACTCGCCGACAACCTTGCGGTACGTTTTTAAACGCCCCCTGAGGGTGGCGAACCAGCGCAACGAGATCGCTCAGGTGCAAGGttcc > 1:4061264/1‑98 (MQ=255)
ggTTAATGAACCAGACTCGCCGACAACCTTGCGGTACGTTTTTAAACGCCCCCTGAGGGTGGCGAACCAGCGCAACGAGATCGCTCAGGTGCAAGGTTGc < 1:907902/100‑1 (MQ=255)
gTTAATGAACCAGACTCGCCGACAACCTTGCGGTACGTTTTTAAACGCCCCCTGAGGGTGGCGAACCAGCGCAACGAGATCGCTCAGGTGCAAGGTTGCa < 2:719818/100‑1 (MQ=255)
tAATGAACCAGACTCGCCGACAACCTTGCGGCACGTCTTTAAACGCCCCCTGAGGGTGGCGAACAAGCGCCACGAGATCGCTCAGGTGAAAGGTTGCATc > 2:144262/1‑100 (MQ=255)
gggAACCAGACTCGCCGACGACCTTGCGGTACGTTTTTAGACGCCCCCTGAGGGTGGCGAACCAGCGCAACGAGATCGCTCAGGTGCAAGGTTGCATCAg < 2:2320025/98‑1 (MQ=255)
aTGAACCAGACTTGCGCACAACCCTGCGGTACCTTTTTAAACGCACCCGGAGGGTGGCGAACCAGCGCAACGAGATCGGTCAGGCGCGAGGTGGCATAAg > 2:2457575/1‑100 (MQ=255)
tGAACCAGACTCGCCGACAACCTTGCGGTACGTTTTTAAACGCCCCCTGAGGGTGGCGAACCAGCGCAACGAGATCGCTCAGGTGCAAGGTTGCATCAgg < 1:632953/100‑1 (MQ=255)
gAACCAGACTCGCCGACAACCTTGCGGTACGTTTTTAAACGCCCCCTGAGGGTGGCGAACCAGCGCAACGAGATCGCTCAGGTGCAAGGTTCCATCAGgt > 1:3120272/1‑100 (MQ=255)
aaCCAGACTCGCCGACAACCTTGCGGTACGTTTTTAAACGCCCCCTGAGGGTGGCGAACCAGCGCAACGAGATCGCTCAGTTGCAAGGTTGCATCAGgtg < 2:1107751/100‑1 (MQ=255)
aaCCAGACTCGCCGACAACCTTGCGGTACGTTTTTAAACGCCCCCTGAGGGTGGCGAACCAGCGCAACGAGATCGCTCAGGTGCAAGGTTGCATCAGgtg > 2:1328856/1‑100 (MQ=255)
aCCAGACTCGCCGACAACCTTGCGGTACGTTTTTAAACGCCCCCTGAGGGTGGCGAACCAGCGCAACGAGATCGCTCAGGTGCAAGGTTGCATCAGgtgt > 2:2142031/1‑100 (MQ=255)
aCCAGACTCGCCGACAACCTTGCGGTACGTTTTTAAACGCCCCCTGAGGGTGGCGAACCAGCGCAACGAGATCGCTCAGGTGCAAGGTTGCATCAGgtgt < 2:3483920/100‑1 (MQ=255)
ccAGACTCGCCGACAACCTTGCGGTACGTTTTTAAACGCCCCCTGAGGGTGGCGAACCAGCGCAACGAGATCGCTCAGGTGCAAGGTTGCATCAGGTGtt < 1:3058305/100‑1 (MQ=255)
cAGACTCGCCGACAACCTTGCGGTACGTTTTTAAACGCCCCCTGAGGGTGGCGAACCAGCGCAACGAGATCGCTCAGGTGCAAGGTTGCATCAGGTGTTa < 2:2163650/100‑1 (MQ=255)
cAGACTCGCCGACAACCTTGCGGTACGTTTTTAAACGCCCCCTGAGGGTGGCGAACCAGCGCAACGAGATCGCTCAGGTGCAAGGTTGCATCAGGTGTTa > 2:395081/1‑100 (MQ=255)
gACTCGCCGACAACCTTGCGGTACGTTTTTAAACGCCCCCTGAGGGTGGCGAACCAGCGCAACGAGATCGCTCAGGTGCAAGGTTGCATCAGGTGTTAAc < 1:2666652/100‑1 (MQ=255)
aCTCGCCGACAACCTTGCGGTACGTTTTTAAACGCCCCCTGAGGGTGGCGAACCAGCGCAACGAGATCGCTCAGGTGCAAGGTTGCATCAGGTGTTAAcc < 2:3798330/100‑1 (MQ=255)
cTCGCCGACAACCTTGCGGTACGTTTTTAAACGCCCCCTGAGGGTGGCGAACCAGCGCAACGAGATCGCTCAGGTGCAAGGTTGCATCAGGTGTTAAccc > 1:2516396/1‑100 (MQ=255)
cTCGCCGACAACCTTGCGGTACGTTTTTAAACGCCCCCTGAGGGTGGCGAACCAGCGCAACGAGATCGCTCAGGTGCAAGGTTGCATCAGGTGTTAAccc > 2:2592475/1‑100 (MQ=255)
cGCCGACAACCTTGCGGTACGTTTTTAAACGCCCCCTGAGGGTGGCGAACCAGCGCACCGAGATCGCTCAGGTGCAAGGTTGCATCAGGTGTTAACCCgg < 1:3470623/100‑1 (MQ=255)
cGCCGACAACCTTGCGGTACGTTTTTAAACGCCCCCTGAGGGTGGCGAACCAGCGCAACGAGATCGCTCAGGTGCAAGGTTGCATCAGGTGTTAACCCgg < 2:2804339/100‑1 (MQ=255)
ccGACAACCTTGCGGTACGTTTTTAAACGCCCCCTGAGGGTGGCGAACCAGCGCAACGAGATCGCTCAGGTGCAAGGTTGCATCAGGTGTTAACCCGGTa < 1:538934/100‑1 (MQ=255)
gACAACCTTGCGGTACGTTTTTAAACGCCCCCTGAGGGTGGCGAACCAGCGCAACGAGATCGCTCAGGTGCAAGGTTGCATCAGGTGTTAACCCGGTAat < 1:2927212/100‑1 (MQ=255)
gACAACCTTGCGGTACGTTTTTAAACGCCCCCTGAGGGTGGCGAACCAGCGCAACGAGATCGCTCAGGTGCAAGGTTGCATCAGGTGTTAACCCGGTAat < 1:2050359/100‑1 (MQ=255)
cAACCTTGCGGTACGTTTTTAAACGCCCCCTGAGGGTGGCGAACCAGCGCAACGAGATCGCTCAGGTGCAAGGTTGCATCACGTCTTACCCCCGTAatag > 1:1992504/1‑99 (MQ=255)
aaCCTTGCGGTACGTTTTTAAACGCCCCCTGAGGGTGGCGAACCAGCGCAACGAGATCGCTCAGGTGCAAGGTTGCATCAGGTGTTAACCCGGTAATATc < 2:1154125/100‑1 (MQ=255)
aaCCTTGCGGTACGTTTTTAAACGCCCCCTGAGGGTGGCGAACCAGCGCAACGAGATCGCTCAGGTGCAAGGTTGCATCAGGTGTTAACCCGGTAATATc < 1:750959/100‑1 (MQ=255)
aaCCTTGCGGTACGTTTTTAAACGCCCCCTGAGGGTGGCGAACCAGCGCAACGAGATCGCTCAGGTGCAAGGTTGCATCAGGTGTTAACCCGGTAATATc < 2:176705/100‑1 (MQ=255)
aCCTTGCGGTACGTTTTTAAACGCCCCCTGAGGGTGGCGAACCAGCGCAACGAGATCGCCCAGGGGCAAGGTTGCATCAGGCGTTAACCCGGTAATATcg > 1:375075/1‑99 (MQ=255)
ccgtGCGGTACGTTTTGAAACGCCGCCTGAGGGTGGCGAACCAGCGCAACGAGATCGCTCAGGTGCAAGGTTGCATCAGGTGTTAACCCGGTAATATCAg < 2:1226546/97‑1 (MQ=255)
ccTTGCGGTACGTTTTTAAACGCCCCCTGAGGGTGGCGAACCAGCGCAACGAGATCGCTCAGGTGCAAGGTTGCATCAGGTGTTAACCCGGTAATATCAg > 2:228575/1‑100 (MQ=255)
cTTGCGGTACGTTTTTAAACGCCCCCTGAGGGTGGCGAACCAGCGCAACGAGATCGCTCAGGTGCAAGGTTGCATCAGGTGTTAACCCGGTAATATCAGc < 2:904880/100‑1 (MQ=255)
cGGTACGTTTTTAAACGCCCCCTGAGGGTGGCGAACCAGCGCAACGAGATCGCTCAGGTGCAAGGTTGCATCAGGTGTTAACCCGGTAATATCAGCAAAc < 1:2162738/100‑1 (MQ=255)
gTACGTTTTTAAACGCCCCCTGAGGGTGGCGAACCAGCGCAACGAGATCGCTCAGGTGCAAGGTTGCATCAGGTGTTAACCCGGTAATATCAGCAAACTg < 1:1875557/100‑1 (MQ=255)
cGTTTTTAAACGCCCCCTGAGGGTGGCGAACCAGCGCAACGAGATCGCTCAGGTGCAAGGTTGCATCAGGTGTTAACCCGGTAATCTCCGCCCACTGCGa > 1:3041307/1‑100 (MQ=255)
cGTTTTTAAACGCCCCCTGAGGGTGGCGAACCAGCGCAACGAGATCGCTCAGGTGCAAGGTTGCATCAGGTGTTAACCCGGTAATATCAGCAAACTGCGa > 1:1790713/1‑100 (MQ=255)
cGTTTTTAAACGCCCCCTGAGGGTGGCGAACCAGCGCAACGAGATCGCTCAGGTGCAAGGTTGCATCAGGACTCAACCCGGTAATATCCGCATACGGctc > 1:1505/1‑98 (MQ=255)
gTTTTTAAACGCCCCCTGAGGGAGGCGAACCAGCGCAACGAGATCGCTCAGGTGCAAGGTTGCATCAGGTGTTAACCCGGTAATATCAGCAAACTGCGAc > 2:77539/1‑100 (MQ=255)
tttttAAACGCCCCCTGAGGGTGGCGAACCAGCGCAACGAGATCGCTCAGGTGCAAGGTTGCATCAGGTGTTAACCCGGTAATATCAGCAAACTGCGAcc < 2:518678/100‑1 (MQ=255)
ttttAAACGCCCCCTGAGGGTGGCGAACCAGCGCAACGAGATCGCTCAGGTGCAAGGTTGCATCAGGTGTTAACCCGGTAATATCAGCAAACTGCGACCa > 2:410054/1‑100 (MQ=255)
ttttAAACGCCCCCTGAGGGTGGCGAACCAGCGCAACGAGATCGCTCAGGTGCAAGGTTGCATCAGGTGTTAACCCGGTAATATCAGCAAACTGCGACCa > 2:1548097/1‑100 (MQ=255)
tttAAACGCCCCCTGAGGGTGGCGAACCAGCGCAACGAGATCGCTCAGGTGCAAGGTTGCATCAGGTGTTAACCCGGTAATATCAGCAAACTGCGACCAg > 2:1328542/1‑100 (MQ=255)
aaaCGCCCCCTGAGGGTGGCGAACCAGCGCAACGAGATCGCTCAGGTGCAAGGTTGCATCAGGTGTTAACCCGGTAATATCAGCAAACTGCGACCAGCGa > 2:1214013/1‑100 (MQ=255)
aaaCACCCCCTGAGGGTGGCGAACCAGCGCAACGAGATCGCTCAGGTGCAAGGGTGCATCAGGTGATAACCCGGTAATATCAGCAAACTGCGACCAGCGa > 1:4061579/1‑100 (MQ=255)
gccacccTCAGGG‑GGCGAACCAGCGCAACGAGATCGCTCAGGTGCAAGGTTGCATCAGGTGTTAACCCGGTAATATCAGCAAACTGCGACCAGCGATGGa > 2:1900777/5‑100 (MQ=255)
cGCCCCCTGAGGGTGGCGAACCAGCGCAACGAGATCGCTCAGGTGCAAGGTTGCATCAGGTGTTAACCCGGTAATATCAGCAAACTGCGACCAGCGATgg > 2:2067772/1‑100 (MQ=255)
cGCCCCCTGAGGGTGGCGAACCAGCGCAACGAGATCGCTCAGGTGCAAGGCTGCATCAGGTGTTAACCCGGTAATATCAGCAAACTGCGACCAGCGATgg > 2:3331048/1‑100 (MQ=255)
cccccTGAGGGTGGCGAACCAGCGCAACGAGATCGCTCAGGTGCAAGGTTGCATCAGGTGTTAACCCGGTAATATCAGCAAACTGCGACCAGCGATGGAc < 2:392155/100‑1 (MQ=255)
cccTGAGGGTGGCGAACCAGCGCAACGAGATCGCTCAGGTGCAAGGTTGCATCAGGTGTTGCGCCGGTAATATCAGCCCACTCCTTCCAGCCATGGCCAt > 1:689676/1‑100 (MQ=255)
cccTGAGGGTGGCGAACCAGCGCAACGAGATCGCTCAGGTGCAAGGTTGCATCAGGTGTCAACCCGGTAATATCATCCCACTCCGACCAGCTACGGCCAt > 1:81285/1‑100 (MQ=255)
cTGAGGGTGGCGAACCAGCGCAACGAGATCGCTCAGGTGCAAGGTTGCATCAGGTGTTAACCCGGTAATATCAGCAAACTGCGACCAGCGATGGACAttt < 1:3548277/100‑1 (MQ=255)
tGAGGGTGGCGAACCAGCGCAACGAGATCGCTCAGGTGCAAGGTTGCATCAGGTGTTAACCCGGTAATATCAGCAAACTGCGACCAGCGATGGACAtttt < 1:3742529/100‑1 (MQ=255)
gAGGGTGGCGAACCAGCGCAACGAGATCGCTCAGGTGCAAGGTTGCATCAGGTGTTAACCCGGTAATATCAGCAAACTGCGACCAGCGATGGACATTTTc < 1:1138428/100‑1 (MQ=255)
gAGGGTGGCGAACCAGCGCAACGAGATCGCTCAGGTGCAAGGTTGCATCAGGTGTTAACCCGGTAATATCAGCAAACTGCGACCAGCGATGGACATTTTc > 2:3842092/1‑100 (MQ=255)
gggTGGCGAACCAGCGCAACTAGATCGCTCAGGTGCAAGGTTGCATCAGGTGTTAACCCGGTAATATCAGCAAACTGCGACCAGCGATGGACATTTTCtg < 1:1009056/100‑1 (MQ=255)
gggTGGCGAACCAGCGCAACGAGATCGCTCAGGTGCAAGGTTGCATCAGGTGTTAACCCGGTAATATCAGCAAACTGCGACCAGCGATGGCCATTTTCtg > 1:3986691/1‑100 (MQ=255)
gggTGGCGAACCAGCGCAACGAGATCGCTCAGGTGCAAGGTTGCATCAGGTGTTAACCCGGTAATATCAGCAAACTGCGACCAGCGATGGACATTTTCtg < 1:1927839/100‑1 (MQ=255)
gggTGGCGAACCAGCGCAACGAGATCGCTCAGGTGCAAGGTTGCATCAGGTGTTAACCCGGTAATATCAGCAAACTGCGACCAGCGATGGACATTTTCtg < 1:351391/100‑1 (MQ=255)
gggTGGCGAACCAGCGCAACGAGATCGCTCAGGCGCAAGGTTGCATCAGGTGTTAACCCGGTAATATCAGCAAACTGCGACCAGCGATGGACATTTTCtg > 2:2433782/1‑100 (MQ=255)
ggTGGCGAACCAGCGCAACGAGATCGCTCAGGTGCAAGGTTGCATCAGGTGTTAACCCGGTAATATCAGCAAACTGCGACCAGCGATGGACATTTTCtgt < 2:310268/100‑1 (MQ=255)
gTGGCGAGCCAGCGCGACGAGATCGATCAGGTGCAATGTTGCATCAGGTGTTAACCCGGTAATTTCTGCAAACTGCGACCAGCGATGTACATTTTCcgtg < 2:873921/100‑1 (MQ=255)
tGGCGAACCAGCGCAACGAGATCGCTCAGGTGCAAGGTTGCATCAGGTGTTAACCCGGTAATATCAGCAAACTGCGACCAGCGATGGACATTTTCTGTGc < 1:2515772/100‑1 (MQ=255)
ggCGAACCGGCGCAACGAGCTCGCTCAGGTGCAAGGTTGCATCAGGTGTTAACCCGGTAATATCAGCAAACTGCGACCAGCGATGGACATTTTCTGTGCt < 2:3572547/100‑1 (MQ=255)
ggCGAACCAGCGCAACGAGATCGCTCAGGTGCAAGGTTGCATCAGGTGTTAAGCCGGTAATATCAGCAAACTGCGACCAGCGATGGACGTTTGCTGTGCt > 1:2880717/1‑100 (MQ=255)
ggCGAACCAGCGCAACGAGATCGCTCAGGCGCAAGGTTGCAACAGGTGTGAACCCGGTAATATCAGCAAACTTGGAGCAGCGATTGACATCTTCTGTACt > 1:2399280/1‑100 (MQ=255)
gCGAACCAGCGCAACGAGATCGCTCAGGTGCAAGGTTGCATCAGGTGTTAACCCGGTAATATCAGCAAACTGCGACCAGCGATGGACATTTTCTGTGCTc > 2:2997856/1‑100 (MQ=255)
cGAACCAGCGCAACGAGATCGCTCAGGTGCAAGGTTGCATCAGGTGTTAACCCGGTAATATCAGCAAACTGCGACCAGCGATGGACATTTTCTGTGCTCa > 2:3960633/1‑100 (MQ=255)
cGAACCAGCGCAACGAGATCGCTCAGGTGCAAGGTTGCATCAGGTGTTAACCCGGTAATATCAGCAAACTGCGACCAGCGACGGACATTTTCTGTGCTCa > 1:1367575/1‑100 (MQ=255)
aaCCAGCGCAACGAGATCGCTCAGGTGCAAGGTTGCATCAGGTGTTAACCCGGTAATATCAGCAAACTGCGACCAGCGATGGACATTTTCTGTGCTCACt < 1:167460/100‑1 (MQ=255)
aaCCAGCGCAACGAGATCGCTCAGGTGCAAGGTTGCATCAGGTGTTAACCCGGTAATATCAGCAAACTGCGACCAGCGATGGACATTTTCTGTGCTCACt < 1:2007297/100‑1 (MQ=255)
aaCCAGCGCAACGAGATCGCTCAGGTGCAAGGTTGCATCAGGTGTTAACCCGGTAATATCAGCAAACTGCGACCAGCGATGGACATTTTCTGTGCTCACt < 2:1577948/100‑1 (MQ=255)
aaCCAGCGCAACGAGATCGCTCAGGTGCAAGGTTGCATCAGGTGTTAACCCGGTAATATCAGCAAACCGCGACCAGCGATGGACATTTTCTGTGCTCACt < 2:42115/100‑1 (MQ=255)
ccAGCGCAACGAGATCGCTCAGGTGCAAGGTTGCATCAGGTGTTAACCCGGTAATATCAGCAAACTGCGACCAGCGATGGACATTTTCTGTGCTCACttt > 1:2904885/1‑100 (MQ=255)
ccAGCGCAACGAGATCGCTCAGGTGCAAGGTTGCATCAGGTGTTAACCCGGTAATATCAGCAAACTGCGACCAGCGATGGACATTTTCTGTGCTCACttt < 2:3762594/100‑1 (MQ=255)
cAGCGCAACGAGATCGCTCAGGTGCAAGGTTGCATCAGGTGTTAACCCGGTAATATCAGCAAACTGCGACCAGCGATGGACATTTTCTGTGCTCACTTTc < 2:1791163/100‑1 (MQ=255)
aGCGCAACGAGATCGCTCAGGTGCAAGGTTGCATCAGGTGTTAACCCGGTAATATCAGCAAACTGCGACCAGCGATGGACATTTTCTGTGCTCACTTTcg < 1:1121650/100‑1 (MQ=255)
cgcAACGAGATCGCTCAGGTGCAAGGTTGCATCAGGTGTTAACCCGGTAATATCAGCAAACTGCGACCAGCGATGGACATTTTCTGTGCTCACTTTcgcg < 1:606875/100‑1 (MQ=255)
cgcAACGAGATCGCTCAGGTGCAAGGTTGCATCAGGTGTTAACCCGGTAATATCAGCAAACTGCGACCAGCGATGGACATTTTCTGTGCTCACTTTcgcg < 2:2258465/100‑1 (MQ=255)
cgcAACGAGATCGCTCAGGTGCAAGGTTGCATCAGGTGTTAACCCGGTAATATCAGCAAACTGCGACCAGCGATGGACATTTTCTGTGCTCACTTTcgcg < 2:3049148/100‑1 (MQ=255)
cAACGAGATCGCTCAGGTGCAAGGTTGCATCAGGTGTTAACCCGGTAATATCAGCAAACTGCGACCAGCGATGGACATTTTCTGTGCTCACTTTCGCGcc > 1:273811/1‑100 (MQ=255)
cAACGAGATCGCTCAGGTGCAAGGTTGCATCAGGTGTTAACCCGGTAATATCAGCAAACTGCGACCAGCGATGGACATTTTCTGTGCTCACTTTCGCGcc > 2:2875781/1‑100 (MQ=255)
aaCGAGATCGCTCAGGTGCAAGGTTGCATCAGGTGTTAACCCGGTAATATCAGCAAACTGCGACCAGCGATGGACATTTTCTGTGCTCACTTTCGCGccc < 2:1083859/100‑1 (MQ=255)
aaCGAGATCGCTCAGGTGCAAGGTTGCATCAGGTGTTAACCCGGTAATATCAGCAAACTGCGACCAGCGATGGACATTTTCTGTGCTCACTTTCGCGccc < 1:232291/100‑1 (MQ=255)
aCGAGATCGCTCAGGTGCAAGGTTGCATCAGGTGTTAACCCGGTAATATCAGCAAACTGCGACCAGCGATGGACATTTTCTGTGCTCACTTTCGCGCCCa > 1:2592177/1‑100 (MQ=255)
aCGAGATCGCTCAGGTGCAAGGTTGCATCAGGTGTTAACCCGGTAATATCAGCAAACTGCGACCAGCGATGGACATTTTCTGTGCTCACTTTCGCGCCCa > 2:3259718/1‑100 (MQ=255)
aCGAGATCGCTCAGGTGCAAGGTTGCATCAGGTGTTAACCCGGTAATATCAGCAAACTGCGACCAGCGATGGACATTTTCTGTGCTCACTTTCGCGCCCa < 1:3973503/100‑1 (MQ=255)
cGAGATCGCTCAGGTGCAAGGTTGCATCAGGTGTTAACCCGGTAATATCAGCAAACTGCGACCAGCGATGGACATTTTCTGTGCTCACTTTCGCGCCCaa < 2:2455231/100‑1 (MQ=255)
aTCGCTCAGGTGCAAGGTTGCATCAGGTGTTAACCCGGTAATATCAGCAAACTGCGACCAGCGATGGACATTTTCTGTGCTCACTTTCGCGCCCAAAGTa < 1:3314116/100‑1 (MQ=255)
aTCGCTCAGGTGCAAGGTTACATCATGTCTTAACCCGGTAATATCAGCAAACTGCGACCAGCGATGTACATTTTCTGTGCTCACTTTCGCGCCCAAAGTa < 2:275706/100‑1 (MQ=255)
tCGCTCAGGTGCAAGGTTGCATCAGGTGTTAACCCGGTAATATCAGCAAACTGCGACCAGCGATGGACATTTTCTGTGCTCACTTTCGCGCCCAAAGTAt < 2:2248504/100‑1 (MQ=255)
cGCTCAGGTGCAAGGTTGCATCAGGTGTTAACCCGGTAATATCAGCAAACTGCGACCAGCGATGGACATTTTCTGTGCTCACTTTCGCGCCCAAAGTATg > 2:1461385/1‑100 (MQ=255)
cGCTCAGGTGCAAGGTTGCATCAGGTGTTAACCCGGTAATATCAGCAAACTGCGACCAGCGATGGACATTTTCTGTGCTCACTTTCGCGCCCAAAGTATg < 1:1301252/100‑1 (MQ=255)
cGCTCAGGTGCAAGGTTGCATCAGGTGTTAACCCGGTAATATCAGCAAACTGCGACCAGCGATGGACATTTTCTGTGCTCACTTTCGCGCCCAAAGTATg < 1:1851393/100‑1 (MQ=255)
|
GAGAAAAACGGTTAATGAACCAGACTCGCCGACAACCTTGCGGTACGTTTTTAAACGCCCCCTGAGGGTGGCGAACCAGCGCAACGAGATCGCTCAGTTGCAAGGTTGCATCAGGTGTTAACCCGGTAATATCAGCAAACTGCGACCAGCGATGGACATTTTCTGTGCTCACTTTCGCGCCCAAAGTATG > NC_000913/3014409‑3014598
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
N/A
