Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A7 F422 I51 R1
|
223 |
69.9 |
1534784 |
95.1% |
1459579 |
214.4 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
NC_000913 |
3,708,080 |
T→G |
intergenic (‑375/+536) |
dppA ← / ← proK |
dipeptide/heme ABC transporter periplasmic binding protein; dipeptide chemotaxis receptor/tRNA‑Pro |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | NC_000913 | 3,708,080 | 0 | T | G | 100.0%
| 244.7
/ NA
| 68 | intergenic (‑375/+536) | dppA/proK | dipeptide/heme ABC transporter periplasmic binding protein; dipeptide chemotaxis receptor/tRNA‑Pro |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (0/0); new base G (30/38); total (30/38) |
CCATAAAATGCCCCTCGTGACCTACAATCTGTCAACAGAATGTGAAAACGTCAATACAGCCAACCGGGATTTACACCAACGGTGAGAATCCACACACAAAGATTAAAAAAACTTCAAACAGCTATTTGCAGCAGAGAAATTTGTGCTACTCCAACATGACCAGAACAATCAGCTTAATATTTAGCAACATTTGGTGATTAAGTTTTATGCATTTAATGAAAAAAATCTGAGGAAAAGGTGGATATCTGAGCGATTAATACCATGAACGCTAAAACGCACAGCGGAAAATGCCAGGGCCAGCCATAAGTAACGCAAAAAAAGATTTAAGCAAATATAAAAAAAGACAATGGTTTCTGTCACAAATCCGTTAATGGATAGTGAGATATGGGGCGCAAATTTGGCAGGGAAATGTGTGTCGTGTAGGTCGAATAAGGCGGTCGCGCCGCATC > NC_000913/3707853‑3708301
|
ccATAAAATGCCCCTCGTGACCTACAATCTGTCAACAGAATGTGAAAACGTCAATCCAGCCAACCGGGATTTACACCAACGGTGAGAATCCACACACAAAGATTAAAAAAACTTCAAACAGCTATTTGCAGCAGAGAAATTTGTGCTACTCCAACATGACCAGAACAATCAGCTTAATATTAAGCAACATTTGGTGATTAAGTTTTATGCATTTAATGAAAAAAATCGGAGGaaaa > 2:42415/1‑236 (MQ=255)
ccATAAAATGCCCCTCGTGACCTACAATCTGTCAACAGAATGTGAAAACGTCAATACAGCCAACCGGGATTTACACCAACGGTGAGAATCCACACACAAAGATTAAAAAAACTTCAAACAGCTATTTGCAGCAGAGAAATTTGTGCTACTCCAACATGACCAGAACAATCAGCTTAATATTTAGCAACATTTGGTGATTAAGGTTTATGCATTTAATGAAAAAAATCGGAGGaaaa > 1:687784/1‑236 (MQ=255)
tCGTGACCTACAATCTGTCAACAGAATGTGAAAACGTCAATACAGCCAACCGGGATTTACACCAACGGTGAGAATCCACACACAAAGATTAAAAAAACTTCAAACAGCTATTTGCAGCAGAGAAATTTGTGCTACTCCAACATGACCAGAACAATCAGCTTAATATTTAGCAACATTTGGTGATTAAGTTTTATGCATTTAATGAAAAAAATCGGAGGAAAAGGTGGATATCTGa < 2:82834/235‑1 (MQ=255)
tCGTGACCTACAATCTGTCAACAGAATGTGAAAACGTCAATACAGCCAACCGGGATTTACACCAACGGTGAGAATCCACACACAAAGATTAAAAAAACTTCAAACAGCTATTTGCAGCAGAGAAATTTGTGCTACTCCAACATGACCAGAACAATCAGCTTAATATTTAGCAACATTTGGTGATTAAGTTTTATGCATTTAATGAAAAAAATCGGAGGAAAAGGTGGATATCTGa < 1:286020/235‑1 (MQ=255)
gACCTACAATCTGTCAACAGAATGTGAAAACGTCAATACAGCCAACCGGGATTTACACCAACGGTGAGAATCCACACACAAAGATTAAAAAAACTTCAAACAGCTATTTGCAGCAGAGAAATTTGTGCTACTCCAACATGACCAGAACAATCAGCTTAATATTTAGCAACATTTGGTGATTAAGTTTTATGCATTTAATGAAAAAAATCGGAGGAAAAGGTGGATATCTGAGCGAt < 1:18220/236‑1 (MQ=255)
aCCTACAGTCTGTCAACAGAATGTGAAAACGTCAATACAGCCAACCGGGATTTACACCAACGGTTAGAATCCACACACAAAGATTAAAAAAACTTCAAACAGCTATTTGCAGCAGAGAAATTTGTGCTACTCCAACATGACCAGAACAATCAGCTTAATATTTAGCAACATTTGGTGATTAAGTTTTATGCATTTAATGAAAAAAATCGGAGGAAAAGGTGGATATCTGAGCGAtt < 2:90214/236‑1 (MQ=255)
gTCAACAGAATGTGAAAACGTCAATACATGCAACCGGGATTTACACCAACGGTGAGAATCCGCACACAAAGATTAAAAAAACTTCAAACAGCTATTTGCAGCAGAGAAATTTGTGCTACTCCAACATGACCAGAACAATCAGCTTAATATTTAGCAACATTTGGTGATTAAGTTTTATGCATTTAATGAAAAAAATCGGAGGAAAAGGTGGATATCTGAGCGATTAATACCATGaa < 2:530340/236‑1 (MQ=255)
aCAGAATGTGAAAACGTCAATACAGCCAACCGGGATTTACACCAACGGTGAGAATCCACACACAAAGATTAAAAAAACTTCAAACAGCTATTTGCAGCAGAGAAATTTGTGCTACTCCAACATGACCAGAACAATCAGCTTAATATTTAGCAACATTTGGTGATTAAGTTTTATGCATTTAATGAAAAAAATCGGAGGaaa < 1:641663/201‑1 (MQ=255)
aCAGAATGTGAAAACGTCAATACAGCCAACCGGGATTTACACCAACGGTGAGAATCCACACACAAAGATTAAAAAAACTTCAAACAGCTATTTGCAGCAGAGAAATTTGTGCTACTCCAACATGACCAGAACAATCAGCTTAATATTTAGCAACATTTGGTGAGTAAGTTTTATGCATTTAATGAAAAAAATCGGAGGaaa > 2:641663/1‑201 (MQ=255)
aaTGTGAAAACGTCAATACAGCCAACCGGGATTTACACCAACGGTGAGAATCCACACACAAAGATTAAAAAAACTTCAAACAGCTATTTGCAGCAGAGAAATTTGTGCTACTCCAACATGACCAGAACAATCAGCTTAATATTTAGCAACATTTGGTGATTAAGTTTTATGCATTTAATGAAAAAAATCGGAGGAAAAGGTGGATATCTGAGCGATTAATACCATGAACGCTaaaa > 1:263051/1‑236 (MQ=255)
aaTGTGAAAACGTCAATACAGCCAACCGGGATTTACACCAACGGTGAGAATCCACACACAAAGATTAAAAAAACTTCAAACAGCTATTTGCAGCAGAGAAATTTGTGCTACTCCAACATGACCAGAACAATCAGCTTAATATTTAGCAACATTTGGTGATTAAGCTTTATGCATTTAATGAAAAAAATCGGAGGAAAAGGTGGATATCTGAGCGATTAATACCATGAACGCTaaaa > 1:29148/1‑236 (MQ=255)
gtgAAAACGTCAATACAGCCAACCGGGATTTACACCAACGGTGAGAATCCACACACAAAGATTAAAAAAACTTCAAACAGCTATTTGCAGCAGAGAAATTTGTGCTACTCCAACATGACCAGAACAATCAGCTTAATATTTAGCAACATTTGGTGATTAAGTTTTATGCATTTAATGAAAAAAATCGGAGGAAAAGGTGGATATCTGAGCGATTAATACCATGaa < 1:259324/225‑1 (MQ=255)
gtgAAAACGTCAATACAGCCAACCGGGATTTACACCAACGGTGAGAATCCACACACAAAGATTAAAAAAACTTCAAACAGCTATTTGCAGCAGAGAAATTTGTGCTACTCCAACATGACCAGAACAATCAGCTTAATATTTAGCAACATTTGGTGATTAAGTTTTATGCATTTAATGAAAAAAATCGGAGGAAAAGGTGGATATCTGAGCGATTAATACCATGaa > 2:259324/1‑225 (MQ=255)
tgAAAACGTCAATACAGCCAACCGGGATTTACACCAACGGTGAGAATCCACACACAAAGATTAAAAAAACTTCAAACAGCTATTTGCAGCAGAGAAATTTGTGCTACTCCAACATGACCAGAACAATCAGCTTAATATTTAGCGACATTTGGTGATTAAGTTTTATGCATTTAATGAAAAAAATCGGAGGAAAAGGTGGATATCTGAGCGATTAATACCATGAACGCTAAAACGca < 1:546978/236‑1 (MQ=255)
aaaccgcAATACAGCCAACCGGGATTTACCACAACGGTGAGAATCCACACACAAAGATTAAAAAAACTTCAAACAGCTATTTGCAGCAGAGAAATTTGTGCTACTCCAACATGACCAGAACAATCAGCTTAATATTTAGCAACATTTGGTGATTAAGTTTTATGCATTTAATGAAAAAAATCGGAGGAAAAGGTGGATATCTGAGCGATTAATACCATGAACGCTAAAACGCACAg < 2:631373/230‑1 (MQ=255)
ccGGGATTTACACCCACGGTGAGAATCCACACACAAAGATTAAAAAAACTTCAAACAGCTATTTGCAGCAGAGAAATTTGTGCTACTCCAACATGACCAGAACAATCAGCTTAATATTTAGCAACATTTGGTGATTAAGTTTTATGCATTTAATGAAAAAAATCGGAGGAAAAGGTGGATATCTGAGCGATTAATACCATGAACGCTAAAACGCACAGCGGAAAATGCCAGGgc < 2:29148/234‑1 (MQ=255)
ccGGGATTTACACCAACGGTGAGAATCCACACACAAAGATTAAAAAAACTTCAAACAGCTATTTGCAGCAGAGAAATTTGTGCTACTCCAACATGACCAGAACAATCAGCTTAATATTTAGCAACATTTGGTGATTAAGTTTTATGCATTTAATGAAAAAAATCGGAGGAAAAGGTGGATATCTGAGCGATTAATACCATGAACGCTAAAACGCACAGCGGAAAATGcc < 2:545399/229‑1 (MQ=255)
ccGGGATTTACACCAACGGTGAGAATCCACACACAAAGATTAAAAAAACTTCAAACAGCTATTTGCAGCAGAGAAATTTGTGCTACTCCAACATGACCAGAACAATCAGCTTAATATTTAGCAACATTTGGTGATTAAGTTTTATGCATTTAATGAAAAAAATCGGAGGAAAAGGTGGATATCTGAGCGATTAATACCATGAACGCTAAAACGCACAGCGGAAAATGcc < 1:555771/229‑1 (MQ=255)
ccGGGATTTACACCAACGGTGAGAATCCACACACAAAGATTAAAAAAACTTCAAACAGCTATTTGCAGCAGAGAAATTTGTGCTACTCCAACATGACCAGAACAATCAGCTTAATATTTAGCAACATTTGGTGATTAAGTTTTATGCATTTAATGAAAAAAATCGGAGGAAAAGGTGGATATCTGAGCGATTAATACCATGAACGCTAAAACGCACAGCGGAAAATGCCAGGgc < 1:316705/234‑1 (MQ=255)
acCAACGGTGAGAATCCACACACAAAGATTAAAAAAACTTCAAACAGCTATTTGCAGCAGAGAAATTTGTGCTACTCCAACATGACCAGAACAATCAGCTTAATATTTAGCAACATTTGGTGATTAAGTTTTATGCATTTAATGAAAAAAATCGGAGGAAAAGGTGGATATCTGAGCGATTAATACCATGAACGCTAAAACGCACAGCGGAAAATGCCAGGgc < 2:624349/223‑1 (MQ=255)
acCAACGGTGAGAATCCACACACAAAGATTAAAAAAACTTCAAACAGCTATTTGCAGCAGAGAAATTTGTGCTACTCCAACATGACCAGAACAATCAGCTTAATATTTAGCAACATTTGGTGATTAAGTTTTATGCATTTAATGAAAAAAATCGGAGGAAAAGGTGGATATCTGAGCGATTAATACCATGAACGCTAAAACGCACAGCGGAAAATGCCAGGgc > 1:624349/1‑223 (MQ=255)
cGGTGAGAATCCACACACAAAGATTAAAAAAACTTCAAACAGCTATTTGCAGCAGAGAAATTTGTGCTACTCCAACATGACCAGAACAATCAGCTTAATATTTAGCAACATTTGGTGATTAAGTTTTATGCATTTAATGAAAAAAATCGGAGGAAAAGGTGGATATCTGAGCGATTAATACCATGAACGCTAAAACGCACAGCGGAAAATGCCAGGGCCAGCCATAAGTAACGCaa > 1:181839/1‑236 (MQ=255)
cacacacaAAGATTAAAAAAACTTCAAACAGCTATTTGCAGCAGAGAAATTTGTGCTACTCCAACATGACCAGAACAATCAGCTTAATATTTAGCAACATTTGGTGATTAAGTTTTATGCATTTAATGAAAAAAATCGGAGGAAAAGGTGGATATCTGAGCGATTAATACCATGAACGCTAAAACGCACAGCGGAAAATGCCAGGgc > 2:434008/1‑207 (MQ=255)
cacacacaAAGATTAAAAAAACTTCAAACAGCTATTTGCAGCAGAGAAATTTGTGCTACTCCAACATGACCAGAACAATCAGCTTAATATTTAGCAACATTTGGTGATTAAGTTTTATGCATTTAATGAAAAAAATCGGAGGAAAAGGTGGATATCTGAGCGATTAATACCATGAACGCTAAAACGCACAGCGGAAAATGCCAGGgc < 1:548785/207‑1 (MQ=255)
cacacacaAAGATTAAAAAAACTTCAAACAGCTATTTGCAGCAGAGAAATTTGTGCTACTCCAACATGACCAGAACAATCAGCTTAATATTTAGCAACATTTGGTGATTAAGTTTTATGCATTTAATGAAAAAAATCGGAGGAAAAGGTGGATATCTGAGCGATTAATACCATGAACGCTAAAACGCACAGCGGAAAATGCCAGGgc < 1:434008/207‑1 (MQ=255)
cacacacaAAGATTAAAAAAACTTCAAACAGCTATTTGCAGCAGAGAAATTTGTGCTACTCCAACATGACCAGAACAATCAGCTTAATATTTAGCAACATTTGGTGATTAAGTTTTATGCATTTAATGAAAAAAATCGGAGGAAAAGGTGGATATCTGAGCGATTAATACCATGAACGCTAAAACGCACAGCGGAAAATGCCAGGgc > 2:548785/1‑207 (MQ=255)
aaaGATTAAAAAAACTTCAAACAGCTATTTGCAGCAGAGAAATTTGTGCTACTCCAACATGACCAGAACAATCAGCTTAATATTTAGCAACATTTGGTGATTAAGTTTTATGCATTTAATGAAAAAAATCGGAGGAAAAGGTGGATATCTGAGCGATTAATACCATGAACGCTAAAACGCACAGCGGAAAATGCCAGGGCCAGCCATAAGTAACGCAAAAAAAGATTTAAGCAAat > 1:632567/1‑236 (MQ=255)
aGATTAAAAAAACTTCAAACAGCTATTTGCAGCAGAGAAATTTGTGCTACTCCAACATGACCAGAACAATCAGCTTAATATTTAGCAACATTTGGTGATTAAGTTTTATGCATTTAATGAAAAAAATCGGAGGAAAAGGTGGATATCTGAGCGATTAATACCATGAACGCTAAAACGCACAGCGGAAAATGCCAGGGCCAGCCATAAGTAACGCAAAAAAAGATTTAAGCAAatat > 1:611091/1‑236 (MQ=255)
ttAAAAAAACTTCAAACAGCTATTTGCAGCAGAGAAATTTGTGCTACTCCAACATGACCAGAACAATCAGCTTAATATTTAGCAACATTTGGTGATTAAGTTTTATGCATTTAATGAAAAAAATCGGAGGAAAAGGTGGATATCTGAGCGATTAATACCATGAACGCTAAAACGCACAGCGGAAAATGCCAGGGCCAGCCATAAGTAACGCAAAAAAAGATTTAAGCAAata < 2:263051/232‑1 (MQ=255)
aaaaaaCTTCAAACAGCTATTTGCAGCAGAGAAATTTGTGCTACTCCAACATGACCAGAACAATCAGCTTAATATTTAGCAACATTTGGTGATTAAGTTTTATGCATTTAATGAAAAAAATCGGAGGAAAAGGTGGATATCTGAGCGATTAATACCATGAACGCTAAAACGCACAGCGGaa > 2:31719/1‑181 (MQ=255)
aaaaaaCTTCAAACAGCTATTTGCAGCAGAGAAATTTGTGCTACTCCAACATGACCAGAACAATCAGCTTAATATTTAGCAACATTTGGTGATTAAGTTTTATGCATTTAATGAAAAAAATCGGAGGAAAAGGTGGATATCTGAGCGATTAATACCATGAACGCTAAAACGCACAGCGGaa < 1:31719/181‑1 (MQ=255)
cTTCAAACAGCTATTTGCAGCAGAGAAATTTGTGCTACTCCAACATGACCAGAACAATCAGCTTAATATTTAGCAACATTTGGTGATTAAGTTTTATGCATTTAATGAAAAAAATCGGAGGAAAAGGTGGATATCTGAGCGATTAATACCATGAACGCTAAAACGCACAGCGGAAAATGCCAGGGCCAGCCCTAAGTAACGCATAAAAAAATTTAAGCAAATCTAAAAAAAGACaa > 2:309728/1‑236 (MQ=255)
ctctgctgCTATTTGCAGCAGAGAAATTTGTGCTACTCCAACATGACCAGAACAATCAGCTTAATATTTAGCAACATTTGGTGATTAAGTTTTATGCATTTAATGAAAAAAATCGGAGGAAAAGGTGGATATCTGAGCGATTAATACCATGAACGCTAAAACGCACAGCGGAAAATGCCAGGGCCAGCCATAAGTAACGCAAAAAAAGATTTAAGCAAATATAAAAAAAGACAATg > 2:23750/8‑236 (MQ=255)
ttGCAGCAGAGAAATTTGTGCTACTCCAACATGACCAGAACAATCAGCTTAATATTTAGCAACATTTGGTGATTAAGTTTTATGCATTTAATGAAAAAAATCGGAGGAAAAGGTGGATATCTGAGCGATTAATACCATGAACGCTAAAACGCACAGCGGAAAATGCCAGGGCCAGCCATAAGTAACGCAAAAAAAGATTTAAGCAAATATAAAAAAAGACAATGGTTTc < 1:12790/229‑1 (MQ=255)
gtccatcaagaAATTTGTGCATCCTCAACTAGGACAGAAAAATCAGCTTAAAATTTAGCAACATTTGGTGATTAAGTTTTATGCATTTAATGAAAAAAATCGGAGGAAAAGGTGGATATCTGAGCGATTAATACCATGAACGCTAAAACGCACAGCGGAAAATGCCAGGGCCAGCCATAAGTAACGCAAAAAAAGATTTAAGCAAATATAAAAAAAGACAATGGTTTCTGTCACaa < 2:761269/228‑1 (MQ=255)
ggcagcaGAGAAATTTGTGCTACTCCAACATGACCAGAACAATCAGCTTAATATTTAGCAACATTTGGTGATTAAGTTTTATGCATTTAATGAAAAAAATAGGAGGAAAAGGTGGATATCTGAGCGATTAATACCATGAACGCTAAAACGCACAGCGGAAAATGCCAGGGCCAGCCATAAGTAACGCAAAAAAAGATTTAAGCAAATATAAAAAAAGACAATGGTTTCTGTcaca < 1:309728/234‑1 (MQ=255)
cagcagAGAAATTTGTGCTACTCCAACATGACCAGAACAATCAGCTTAATATTTAGCAACATTTGGTGATTAAGTTTTATGCATTTAATGAAAAAAATCGGAGGAAAAGGTGGATATCTGAGCGATTAATACCATGAACGCTAAAACGCACAGCGGAAAATGCCAGGGCCAGCCATAAGTAACGCAAAAAAAGATTTAAGCAAATATAAAAAAAGACAATGGTTTCTGTcac > 2:731397/1‑232 (MQ=255)
agcagAGAAATTTGTGCTACTCCAACATGACCAGAACAATCAGCTTAATATTTAGCAACATTTGGTGATTAAGTTTTATGCATTTAATGAAAAAAATCGGAGGAAAAGGTGGATATCTGAGCGATTAATACCATGAACGCTAAAACGCACAGCGGAAAATGCCAGGGCCAGCCATAAGTAACGCAAAAAAAGATTTAAGCAAATATAAAAAAAGACAATGGTTTCTGTCACAAATc < 2:181839/236‑1 (MQ=255)
cagAGAAATTTGTGCTACTCCAACATGACCAGAACAATCAGCTTAATATTTAGCAACATTTGGTGATTAAGTTTTATGCATTTAATGAAAAAAATCGGAGGAAAAGGTGGATATCTGAGCGATTAATACCATGAACGCTAAAACGca > 1:509887/1‑147 (MQ=255)
cagAGAAATTTGTGCTACTCCAACATGACCAGAACAATCAGCTTAATATTTAGCAACATTTGGTGATTAAGTTTTATGCATTTAATGAAAAAAATCGGAGGAAAAGGTGGATATCTGAGCGATTAATACCATGAACGCTAAAACGca < 2:509887/147‑1 (MQ=255)
tttGTGCTACTCCAACATGACCAGAACAATCAGCTTAATATTTAGCAACATTTGGTTATTAAGTTTTATGCATTTAATGAAAAAAATCGGAGGAAAAGGTGGATATCTGAGCGATTAATACCATGAACGCTAAAACGCACAGCGGAAAATGCCAGGGCCAGCCATAAGTAACGCAAAAAAAGATTTAAGCAAATATAAAAAAAGACAATGGTTTCTGTCACAAATCCGTTAATGGa < 1:745983/236‑1 (MQ=255)
tttGTGCTACTCCAACATGACCAGAACAATCAGCTTAATATTTAGCAACATTTGGTGATTAAGTTTTATGCATTTAATGAAAAAAATCGGAGGAAAAGGTGGATATCTGAGCGATTAATACCATGAACGCTAAAACGCACAGCGGAAAATGCCAGGGCCAGCCATAAGTAACGCAAAAAAAGATTTAAGCAAATATAAAAAAAGACAATGGTTTCTGTCACAAATCCGTTAATGGa < 2:510266/236‑1 (MQ=255)
ttGTGCTACTCCAACATGACCAGAACAATCAGCTTAATATTTAGCAACATTTGGTGATTAAGTTTTATGCATTTAATGAAAAAAATCGGAGGAAAAGGTGGATATCTGAGCGATTAATACCATGAACGCTAAAACGCACAGCGGAAAATGCCAGGGCCAGCCATAAGTAACGCAAAAAAAGATTTAAGCAAATATAAAAAAAGACAATGGTTTCTGTCACAAATCCGTTAATGGa < 1:42415/235‑1 (MQ=255)
tgtgCTACTCCAACATGACCAGAACAATCAGCTTAATATTTAGCAACATTTGGTGATTAAGTTTTATGCATTTAATGAAAAAAATCGGAGGAAAAGGTGGATATCTGAGCGATTAATACCATGAACGCTAAAACGCACAGCGGAAAATGCCAGGGCCAGCCATAAGTAACGCAAAAAAAGATTTAAGCAAATATAAAAAAAGACAATGGTTTCTGTCACAAATCCGTTAATGGATa < 2:632567/236‑1 (MQ=255)
gCTACTCCAACATGACCAGAACAATCAGCTTAATATTTAGCAACATTTGGTGATTAAGTTTTATGCATTTAATGAAAAAAATCGGAGGAAAAGGTGGATATCTGAGCGATTAATACCATGAACGCTAAAACGCACAGCGGAAAATGCCAGGGCCAGCCATAAGCAACGCAAAAAAAGATTTAATCAAATATAAAAAAAGACAATGGATTCTGTCACAAATACGGTAATGGATAATg > 2:663401/1‑236 (MQ=255)
ccATCATTACCAAAACAATCAGCTTAATATTTAGCAACATTTGGTGATTAAGTTTTATGCATTTAATGAAAAAAATCGGAGGAAAAGGTGGATATCTGAGCGATTAATACAATGAACGCTAAAACGCACAGCGGAAAATGCCAGGACCAGCCATAAGTAACGCAAAAAAAGATTTAAGCAAATATAAAAAAAGACAATGGTTTCTGTCACAAATCCGTTAATGGATAGTGAGata < 1:283888/235‑1 (MQ=255)
cATGACCAGAACAATCAGCTTAATATTTAGCAACATTTGGTGATTAAGTTTTATGCATTTAATGAAAAAAATCGGAGGAAAAGGTGGATATCTGAGCGATTAATACCATGAACGCTAAAACGCACAGCGGAAAATGCCAGGGCCAGCCATAAGTAACGCAAAAAAAGATTTAAGCAAATATAAAAAAAGACAATGGTTTCTGTCACAAATCCGTTAATGGATAGTGAGATATgggg < 2:156659/236‑1 (MQ=255)
aTGACCAAAACAATCAGCTTAATATTTAGCAACATTTGGTGATTAAGTTTTATGCATTTAATGAAAAAAATCGGAGGAAAAGGTGGATATCTGAGCGATTAATACCATGAACGCTAAAACGCACAGCGGAAAATGCCAGGGCCAGCCATAAGTAACGCAAAAAAAGATTTAAGCAAATATAAAAAAAGACAATGGTTTCTGTCACAAATCCGTTAATGGATAGTGAGATATGGGgc < 1:687394/236‑1 (MQ=255)
aCCAGAACAATCAGCTTAATATTTAGCAACATTTGGTGATTAAGTTTTATGCATTTAATGAAAAAAATCGGAGGAAAAGGTGGATATCTGAGCGATTAATACCATGAACGCTAAAACGCACAGCGGAAAATGCCAGGGCCAGCCATAAGTAACGCAAAAAAAGATTTAAGCAAATATAAAAAAAGACAATGGTTTCTGTCACAAATCCGTTAATGGATAGTGAGATATGGGGCGCa > 1:658472/1‑236 (MQ=255)
aCCAGAACAATCAGCTTAATATTTAGCAACATTTGGTGATTAAGTTTTATGCATTTAATGAAAAAAATCGGAGGAAAAGGTGGATATCTGAGCGATTAATACCATGAACGCTAAAACGCACAGCGGAAAATGCCAGGGCCAGCCATAAGTAACGCAAAAAAAGATTTAAGCAAATATAAAAAAAGACAATGGTTTCTGTCACAAATCCGTTAATGGATACTAGGATATTGGTCGCa > 2:687394/1‑236 (MQ=255)
aaCAATCAGCTTAATATTTAGCAACATTTGGTGATTAAGTTTTATGCATTTAATGAAAAAAATCGGAGGAAAAGGTGGATATCTGAGCGATTAATACCATGAACGCTAAAACGCACAGCGGAAAATGCCAGGGCCAGCCATAAGTAACGCAAAAAAAGATTTAAGCAAATATAAAAAAAGACAATGGTTTc < 2:298810/191‑1 (MQ=255)
aaCAATCAGCTTAATATTTAGCAACATTTGGTGATTAAGTTTTATGCATTTAATGAAAAAAATCGGAGGAAAAGGTGGATATCTGAGCGATTAATACCATGAACGCTAAAACGCACAGCGGAAAATGCCAGGGCCAGCCATAAGTAACGCAAAAAAAGATTTAAGCAAATATAAAAAAAGACAATGGTTTc > 1:298810/1‑191 (MQ=255)
aTCAGCTTAATATTTAGCAACATTTGGTGATTAAGTTTTATGCATTTAATGAAAAAAATCGGAGGAAAAGGTGGATATCTGAGCGATTAATACCATGAACGCTAAAACGCACAGCGGAAAATGCCAGGGCCAGCCATAAGTAACGCAAAAAAAGATTTAAGCAAATATAAAAAAAGACAATGGTTTCTGTCACAAATCCGTTAATGGATAGTGAGATATGGGGCGCAAATTTGGCa < 2:687784/236‑1 (MQ=255)
tCAGCTTAATATTTAGCAACATTTGGTGATTAAGTTTTATGCATTTAATGAAAAAAATCGGAGGAAAAGGTGGATATCTGAGCGATTAATACCATGAACGCTAAAACGCACAGCGGAAAATGCCAGGGCCAGCCATAAGTAACGCAAAAAAAGATTTAAGCAAATATAAAAAAAGACAATGGTTTCTGTCACAAATCCGTTAATGGATAGTGAGATATGGGgc > 1:3920/1‑223 (MQ=255)
tCAGCTTAATATTTAGCAACATTTGGTGATTAAGTTTTATGCATTTAATGAAAAAAATCGGAGGAAAAGGTGGATATCTGAGCGATTAATACCATGAACGCTAAAACGCACAGCGGAAAATGCCAGGGCCAGCCATAAGTAACGCAAAAAAAGATTTAAGCAAATATAAAAAAAGACAATGGTTTCTGTCACAAATCCGTTAATGGATAGTGAGATATGGGgc < 2:3920/223‑1 (MQ=255)
tCAGCTTAATATTTAGCAACATTTGGTGATTAAGTTTTATGCATTTAATGAAAAAAATCGGAGGAAAAGGTGGATATCTGAGCGATTAATACCATGAACGCTAAAACGCACAGCGGAAAATGCCAGGGCCAGCCATAAGTAACGCAAAAAAAGATTTAAGCAAATATAAAAAAAGACAATGGTTTCTGTCACAAATCCGTTAATGGATAGTGAGATATGGGGCGCAAATTTGGCAg > 2:314690/1‑236 (MQ=255)
tCAGCTTAATATTTAGCAACATTTGGTGATTAAGTTTTATGCATTTAATGAAAAAAATCGGAGGAAAAGGTGGATATCTGAGCGATTAATACCATGAACGCTAAAACGCACAGCGGAAAATGCCAGGGCCAGCCATAAGTAACGCAAAAAAAGATTTAAGCAAATATAAAAAAAGACAATGGTTTCTGTCACAAATCCGTTAATGGATAGTGAGATATGGGGCGCAAATTTGGCAg > 2:60089/1‑236 (MQ=255)
gCTTAATATTTAGCAACATTTGGTGATTAAGTTTTATGCATTTAATGAAAAAAATCGGAGGAAAAGGTGGATATCTGAGCGATTAATACCATGAACGCTAAAACGCACAGCGGAAAATGCCAGGGCCAGCCATAAGTAACGCAAAAAAAGATTTAAGCAAATATAAAAAAAGACAATGGTTTCTGTCACAAATCCGTTAATGGATAGTGAGATATGGGGCGCAAATTTGGCAGGGa < 1:731397/236‑1 (MQ=255)
ttAATATTTAGCAACATTTGGTGATTAAGTTTTATGCATTTAATGAAAAAAATCGGAGGAAAAGGTGGATATCTGAGCGATTAATACCATGAACGCTAAAACGCACAGCGGAAAATGCCAGGGCCAGCCATAAGTAACGCAAAAAAAGATTTAAGCAAATATAAAAAAAGACAATGGTTTCTGTCACAAATCCGTTAATGGATAGTGAGATATGGGGCGCAAATTTGGCAGGGaaa > 1:344761/1‑236 (MQ=255)
aGCAACATTTGGTGATTAAGTTTTATGCATTTAATGAAAAAAATCGGAGGAAAAGGTGGATATCTGAGCGATTAATACCATGAACGCTAAAACGCACAGCGGAAAATGCCAGGGCCAGCCATAAGTAACGCAAAAAAAGATTTAAGCAAATATAAAAAAAGACAATGGTTTCTGTCACAAATCCGTTAATGGATAGTGAGATATGGGGCGCAAATTTGGCAGGGAAATGTGTGTCg > 1:35502/1‑236 (MQ=255)
aGCAACATTTGGTGATTAAGTTTTATGCATTTAATGAAAAAAATCGGAGGAAAAGGTGGATATCTGAGCGATTAATACCATGAACGCTAAAACGCACAGCGGAAAATGCCAGGGCCAGCCATAAGTAACGCAAAAAAAGATTTAAGCAAATATAAAAAAAGACAATGGTTTCTGTCACAAATCCGTTAATGGATAGTGAGATATGGGGCGCAAATTTGGCAGGGAAATGTGTGTCg > 1:390557/1‑236 (MQ=255)
cAACATTTGGTGATTAAGTTTTATGCATTTAATGAAAAAAATCGGAGGAAAAGGTGGATATCTGAGCGATTAATACCATGAACGCTAAAACGCACAGCGGAAAATGCCAGGGCCAGCCATAAGTAACGCAAAAAAAGATTTAAGCAAATATAAAAAAAGACAATGGTTTCTGTCACAAATCCGTTAATGGATAGTGAGATATGGGGCGCAAATTTGGCAGGGAAATGTGTGTCgtg < 1:23750/236‑1 (MQ=255)
aTGCATTTAATGAAAAAAATCGGAGGAAAAGGTGGATATCTGAGCGATTAATACCATGAACGCTAAAACGCACAGCGGAAAATGCCAGGGCCAGCCATAAGTAACGCAAAAAAAGATTTAAGCAAATATAAAAAAAGACAATGGTTTCTGTCACAAATCCGTTAATGGATAGTGAGATATGGGGCGCAAATTTGGCAGGGAAATGTGTGTCGTGTAGGTCGAATAAGGCGGTcgcg < 2:611091/236‑1 (MQ=255)
aTGCATTTAATGAAAAAAATCGGAGGAAAAGGTGGATATCTGAGCGATTAATACCATGAACGCTAAAACGCACAGCGGAAAATGCCAGGGCCAGCCATAAGTAACGCAAAAAAAGATTTAAGCAAATATAAAAAAAGACAATGGTTTCTGTCACAAATCCGTTAATGGATAGTGAGATATGGGGCGCAAATTTGGCAGGGAAATGTGTGTCGTGTAGGTCGAATAAGGCGGTcgc > 1:110438/1‑235 (MQ=255)
gCATTTAATGAAAAAGATCGGAGGAAAAGGTGGATATCTGGGTGATTAATCCCATGAACGCTAAAACACACAGCGAAAAATGCCAGGGCAAGCCATAAGTAACGAAAAAAAAGATTTAAGCAAATATAAAAAAAGACAATGGTTTCTGTCACAAATCCGTTAATGGATAGTGAGATATGGGGCGCAAATTTGGCAGGGAAATGTGTGTCGTGTAGGTCGAATAAGGCGGTcgcg < 2:334609/234‑1 (MQ=255)
aTTTAATGAAAAAAATCGGAGGAAAAGGTGGATATCTGAGCGATTAATACCATGAACGCTAAAACGCACAGCGGAAAATGCCAGGGCCAGCCATAAGTAACGCAAAAAAAGATTTAAGCAAATATAAAAAAAGACAATGGTTTCTGTCACAAATc > 2:72090/1‑155 (MQ=255)
aTTTAATGAAAAAAATCGGAGGAAAAGGTGGATATCTGAGCGATTAATACCATGAACGCTAAAACGCACAGCGGAAAATGCCAGGGCCAGCCATAAGTAACGCAAAAAAAGATTTAAGCAAATATAAAAAAAGACAATGGTTTCTGTCACAAATc < 1:72090/155‑1 (MQ=255)
aTGAAAAAAATCGGAGGAAAAGGTGGATATCTGAGCGATTAATACCATGAACGCTAAAACGCACAGCGGAAAATGCCAGGGCCAGCCATAAGTAACGCAAAAAAAGATTTAAGCAAATATAAAAAAAGACAATGGTTTCTGTCACAAATCCGTTAATGGATAGTGAGATATGGGGCGCAAATTTGGCAGGGAAATGTGTGTCGTGTAGGTCGAATAAGGCGGTCGCGCCGCATc > 1:334609/1‑234 (MQ=255)
|
CCATAAAATGCCCCTCGTGACCTACAATCTGTCAACAGAATGTGAAAACGTCAATACAGCCAACCGGGATTTACACCAACGGTGAGAATCCACACACAAAGATTAAAAAAACTTCAAACAGCTATTTGCAGCAGAGAAATTTGTGCTACTCCAACATGACCAGAACAATCAGCTTAATATTTAGCAACATTTGGTGATTAAGTTTTATGCATTTAATGAAAAAAATCTGAGGAAAAGGTGGATATCTGAGCGATTAATACCATGAACGCTAAAACGCACAGCGGAAAATGCCAGGGCCAGCCATAAGTAACGCAAAAAAAGATTTAAGCAAATATAAAAAAAGACAATGGTTTCTGTCACAAATCCGTTAATGGATAGTGAGATATGGGGCGCAAATTTGGCAGGGAAATGTGTGTCGTGTAGGTCGAATAAGGCGGTCGCGCCGCATC > NC_000913/3707853‑3708301
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 9 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
N/A
