Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A6 F406 I3 R1
|
15 |
135.2 |
6912603 |
92.5% |
6394157 |
99.0 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
NC_000913 |
3,798,659 |
(T)8→7 |
coding (654/1074 nt) |
waaU ← |
lipopolysaccharide core biosynthesis |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | NC_000913 | 3,798,652 | 0 | T | . | 90.6%
| 587.4
/ 57.9
| 159 | coding (661/1074 nt) | waaU | lipopolysaccharide core biosynthesis |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (10/5); new base . (69/75); total (79/80) |
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.86e-01 |
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
Only 100 of 178 total aligned reads displayed.
TCTTGCGGTAACCCGGTAAATATAATCCGATAATTTTCAAAGTGTGTTTTCACTTCTTGATATATAACTTTTATTTGCTCAAACGTAAGACGGCATATTTTTTTTGCACCTAATGGATTAATAATGACTATTCTTGTATCTCCAATAAATTCTTTTATTTTATCTTCAACATCTACTGGTAAATGCAAGTCG > NC_000913/3798555‑3798746
|
tCTTGCGGTAACCCGGTAAATATAATCCGATAATTTTCAAAGTGTGTTTTCACTTCTTGGTATATAACTTTTATTTGCTCAAACGTAAGACGGCATCtt > 1:2439963/1‑99 (MQ=255)
ttGCGGTAACCCGGTAAATATAATCCGATAATTTTCAAAGTGTGTTTTCACTTCTTGATATATAACTTTTATTTGCTCAAACGTAAGACGGCATAtttt > 1:3243657/1‑99 (MQ=255)
tGCGGTAACCCGGTAAATATAATCCGATAATTTTCAAAGTGTGTTTTCACTTCTTGATATATAACTTTTATTTGCTCAAACGTAAGACGGCATAttttt < 2:2924273/99‑1 (MQ=255)
tGCGGTAACCCGGTAAATATAATCCGATAATTTTCAAAGTGTGGTTTCACTTCTTGATATATAACTTTTATTTGCTCAAACGTAAGACGGCATAttttt < 1:1052242/99‑1 (MQ=255)
gCGGTAACCCGGTAAATATAATCCGATAATTTTCAAAGTGTGTTTTCACTTCTTGATATATAACTTTTATTTGCTCAAACGTAAGACGGCATAtttttt < 1:2016552/99‑1 (MQ=255)
cGGTAACCCGGTAAATATAATCCGATAATTTTCAAAGTGTGTTTTCACTTCTTGATATATAACTTTTATTTGCTCAAACGTAAGACGGCATAttttttt < 2:2463838/99‑1 (MQ=255)
gTAACCCGGTAAATATAATCCGATAATTTTCAAAGTGTGTTTTCACTTCTTGATATATAACTTTTATTTGCTCAAACGTAAGACGGCATAtttttttgc > 1:2689162/1‑97 (MQ=255)
tAACCCGGTAAATATAATCCGATAATTTTCAAAGTGTGTTTTCACTTCTTGATATATAACTTTTATTTGCTCAAACGTAAGACGGCATAtttttttgca > 1:3054319/1‑96 (MQ=255)
aaCCCGGTAAATATAATCCGATAATTTTCAAAGTGTGTTTTCACTTCTTGATATATAACTTTTATTTGCTCAAACGTAAGACGGCATAtttttttgcac < 2:347458/99‑5 (MQ=255)
aaCCCGGTAAATATAATCCGATAATTTTCAAAGTGTGTTTTCACTTCTTGATATATAACTTTTATTTGCTCAAACGTAAGACGGCATAtttttttgcac < 2:76864/99‑5 (MQ=255)
aCCCGGTAAATATAATCCGATAATTTTCAAAGTGTGTTTTCACTTCTTGATATATAACTTTTATTTGCTCAAACGTAAGACGGCATA‑TTTTTTTGCAcc < 1:105637/99‑1 (MQ=255)
cGGTAAATATAATCCGATAATTTTCAAAGTGTGTTTTCACTTCTTGATATATAACTTTTATTTGCTCAAACGTAAGACGGCATA‑TTTTTTTGCACCTaa < 2:3299370/99‑1 (MQ=255)
cGGTAAATATAATCCGATAATTTTCAAAGTGTGTTTTCACTTCTTGATATATAACTTTTATTTGCTCAAACGTAAGACGGCATA‑TTTTTTTGCACCTaa < 1:1137279/99‑1 (MQ=255)
ggTAAATATAATCCGATAATTTTCAAAGTGTGTTTTCACTTCTTGATATATAACTTTTATTTGCTCAAACGTAAGACGGCATA‑TTTTTTTGCACCTAAt > 1:1748822/1‑99 (MQ=255)
ataATCCGATAATTTTCAAAGTGTGTTTTCACTTCTTGATATATAACTTTTATTTGCTCAAACGTAAGACGGCATA‑TTTTTTTGCACCTAATGGATtaa > 1:1875633/1‑99 (MQ=255)
aaTCCGATAATTTTCAAAGTGTGTTTTCACTTCTTGATATATAACTTTTATTTGCTCAAACGTAAGACGGCATA‑TTTTTTTGCACCTAATGGATtaata > 2:3111678/1‑99 (MQ=255)
aaTCCGATAATTTTCAAAGTGTGTTTTCACTTCTTGATATATAACTTTTATTTGCTCAAACGTAAGACGGCATA‑TTTTTTTGCACCTAATGGATtaata > 1:988331/1‑99 (MQ=255)
tCCGATAATTTTCAAAGTGTGTTTTCACTTCTTGATATATAACTTTTATTTGCTCAAACGTAAGACGGCATA‑TTTTTTTGCACCTAATGGATTaataat < 1:2228992/99‑1 (MQ=255)
ccGATAATTTTCAAAGTGTGTTTTCACTTCTTGATATATAACTTTTATTTGCTCAAACGTAAGACGGCATA‑TTTTTTTGCACCTAATGGATTAATAATg > 1:3277952/1‑99 (MQ=255)
cGATAATTTTCAAAGTGTGTTTTCACTTCTTGATATATAACTTTTATTTGCTCAAACGTAAGACGGCATA‑TTTTTTTGCACCTAATGGATTAATAATGa < 2:2448131/99‑1 (MQ=255)
cGATAATTTTCAAAGTGTGTTTTCACTTCTTGATATATAACTTTTATTTGCTCAAACGTAAGACGGCATA‑TTTTTTTGCACCTAATGGATTAATAATGa < 1:2334346/99‑1 (MQ=255)
aTAATTTTCAAAGTGTGTTTTCACTTCTTGATATATAACTTTTATTTGCTCAAACGTAAGACGGCATA‑TTTTTTTGCACCTAATGGATTAATAATGACt > 1:2807425/1‑99 (MQ=255)
aaTTTTCAAAGTGTGTTTTCACTTCTTGATATATAACTTTTATTTGCTCAAACGTAAGACGGCATA‑TTTTTTTGCACCTAATGGATTAATAATGACTAt > 1:921755/1‑99 (MQ=255)
ttttCAAAGTGTGTTTTCACTTCTTGATATATAACTTTTATTTGCTCAAACGTAAGACGGCATA‑TTTTTTTGTACCTACTGTATTAATAATGACTATTc > 2:1593468/1‑99 (MQ=255)
ttttCAAAGTGTGTTTTCACTTCTTGATATATAACTTTTATTTGCTCAAACGTAAGACGGCATA‑TTTTTTTGCACCTAATGGATTAATAATGACTATTc > 1:2875306/1‑99 (MQ=255)
tttCAAAGTGTGTTTTCACTTCTTGATATATAACTTTTATTTGCTCAAACGTAAGACGGCATA‑TTTTTTTGCACCTAATGGATTAATAATGACTATTCt > 2:2651091/1‑99 (MQ=255)
ttCAAAGTGTGTTTTCACTTCTTGATATATAACTTTTATTTGCTCAAACGTAAGACGGCATA‑TTTTTTTGCACCTAATGGATTAATAATGACTATTCtt < 1:1634460/99‑1 (MQ=255)
ttCAAAGTGTGTTTGCACTTCTTGATGTGTAACTTTTATTTGCTCAAACGTAAGACGGCATATTTTTTTT‑CACCTAATGGATTAATAATGACTATTCtt < 1:1278684/99‑1 (MQ=255)
tCAAAGTGTGTTTTCACTTCTTGATATATAACTTTTATTTGCTCAAACGTAAGACGGCATATTTTTTTTGCACCTAATGGATTAATAATGACTATTCtt < 1:3086253/99‑1 (MQ=255)
tCAAAGTGTGTTTTCACTTCTTGATATATAACTTTTATTTGCTCAAACGTAAGACGGCATA‑TTTTTTTGCACCTAATGGATTAATAATGACTATTCTTg > 2:936062/1‑99 (MQ=255)
tCAAAGTGTGTTTTCACTTCTTGATATATAACTTTTATTTGCTCAAACGTAAGACGGCATA‑TTTTTTTGCACCTAATGGATTAATAATGACTATTCTTg < 2:1260831/99‑1 (MQ=255)
cAAAGTGTGTTTTCACTTCTTGATATATAACTTTTATTTGCTCAAACGTAAGACGGCATA‑TTTTTTTGCACCTAATGGATTAATAATGACTATTCTTGt < 2:2203596/99‑1 (MQ=255)
aaaGTGTGTTTTCACTTCTTGATATATAACTTTTATTTGCTCAAACGTAAGACGGCATA‑TTTTTTTGCACCTAATGGATTAATAATGACTATTCTTGTa > 1:474620/1‑99 (MQ=255)
aaGTGTGTTTTCACTTCTTGATATATAACTTTTATTTGCTCAAACGTAAGACGGCATA‑TTTTTTTGCACCTAATGGATTAATAATGACTATTCTTGTAt < 1:647651/99‑1 (MQ=255)
gtgtgtTTTCACTTCTTGATATATAACTTTTATTTGCTCAAACGTAAGACGGCATA‑TTTTTTTGCACCTAATGGATTAATAATGACTATTCTTGTAtct > 1:1962188/1‑99 (MQ=255)
ttttCACTTCTTGATATATAACTTTTATTTGCTCAAACGTAAGACGGCATA‑TTTTTTTGCACCTAATGGATTAATAATGACTATTCTTGTATCTCCAAt > 1:272057/1‑99 (MQ=255)
ttttCACTTCTTGATATATAACTTTTATTTGCTCAAACGTAAGACGGCATA‑TTTTTTTGCACCTAATGGATTAATAATGACTATTCTTGTATCTCCAAt > 2:2047881/1‑99 (MQ=255)
ttttCACTTCTTGATATATAACTTGTATTTGCTCAAACGTAAGACGGCATA‑TTTTTTTGCACCTAATGGATTAATAATGACTATTCTTGTATCTCCAAt < 2:753868/99‑1 (MQ=255)
ttCACTTCTTGATATATAACTTTTATTTGCTCAAACGTAAGACGGCATA‑TTTTTTTGCACCTAATGGATTAATAATGACTATTCTTGTATCTCCAATaa > 2:626670/1‑99 (MQ=255)
aCTTCTTGATATATAACTTTTATTTGCTCAAACGTAAGACGGCATA‑TTTTTTTGCACCTAATGGATTAATAATGACTATTCTTGTATCTCCAATAAAtt > 2:1986042/1‑99 (MQ=255)
cttcttGATATATAACTTTTATTTGCTCAAACGTAAGACGGCATA‑TTTTTTTGCACCTAATGGATTAATAATGACTATTCTTGTATCTCCAATAAATTc < 2:1777603/99‑1 (MQ=255)
cttcttGATATATAACTTTTATTTGCTCAAACGTAAGACGGCATA‑TTTTTTTGCACCTAATGGATTAATAATGACTATTCTTGTATCTCCAATAAATTc > 1:2516180/1‑99 (MQ=255)
ttcttGATATATAACTTTTATGTGCTCAAACGTAATACGGCATATTTTTTTTG‑ATCTAATGGATTAATAATGTCTATTTTTTTATCTCCATTAAATTCt > 2:1555953/1‑99 (MQ=255)
ttGATATATAACTTTTATTTGCTCAAACGTAAGACGGCATA‑TTTTTTTGCACCTAATGGATTAATAATGACTATTCTTGTATCTCCAATAAATTCtttt < 1:1811216/99‑1 (MQ=255)
gATATATAACTTTTATTTGCTCAAACGTAAGACGGCATA‑TTTTTTTGCACCTAATGGATTAATAATGACTATTCTTGTATCTCCAATAAATTCttttat < 1:1489539/99‑1 (MQ=255)
atatatAACTTTTATTTGCTCAAACGTAAGACGGCATA‑TTTTTTTGCACCTAATGGATTAATAATGACTATTCTTGTATCTCCAATAAATTCttttatt < 2:1322139/99‑1 (MQ=255)
tatataACTTTTATTTGCTCAAACGTAAGACGACATA‑TTTTTTTGCAACTAATGGATTAATAATGACTATTCTTGTATCTCCAATAAATACttttattt < 2:286946/99‑1 (MQ=255)
atataACTTTTATTTGCTCAAACGTAAGACGGCATA‑TTTTTTTGCACCTAATGGATTAATAATGACTATTCTTGTATCTCCAATAAATTCttttatttt < 1:2923929/99‑1 (MQ=255)
tataACTTTTATTTGCTCAAACGTAAGACGGCATA‑TTTTTTTGCACCTAATGGATTAATAATGACTATTCTTGTATCTCCAATAAATTCttttatttta < 2:1340635/99‑1 (MQ=255)
ataACTTTTATTTGCTCAAACGTAAGACGGCATA‑TTTTTTTGCACCTAATGGATTAATAATGACTATTCTTGTATCTCCAATAAATTCTtttattttat > 1:840509/1‑99 (MQ=255)
ataACTTTTATTTGCTCAAACGTAAGACGGCATA‑TTTTTTTGCACCTAATGGATTAATAATGACTATTCTTGTATCTCCAATAAATTCTtttattttat < 2:2761283/99‑1 (MQ=255)
taACTTTTATTTGCTCAAACGTAAGACGGCATATTTTTTTTGCACCTAATGGATTAATAATGACTATTCTTGTATCTCCAATAAATTCTtttattttat > 2:3009840/1‑99 (MQ=255)
taACTTTTATTTGCTCAAACGTAAGACGGCATATTTTTTTTGCACCTAATGGATTAATAATGACTATTCTTGTATCTCCAATAAATTCTtttattttat < 1:311735/99‑1 (MQ=255)
taACTTTTATTTGCTCAAACGTAAGACGGCATA‑TTTTTTTGCACCTAATTGATTAATAATGACTATTCTTGTATCTCCAATAAATTCTTTTATTTTATc > 2:2246806/1‑99 (MQ=255)
aaCTTTTATTTGCTCAAACGTAAGACGGCATATTTTTTTT‑TTTTTTTTTGATTAATAATGACTATTCTTGTATCTCCATTTAATTCTtttattttattt > 2:3349695/1‑97 (MQ=255)
aaCTTTTATTTGCTCAAACGTAAGACGGCATA‑TTTTTTTGCACCTAATGGATTAATAATGACTATTCTTGTATCTCCAATAAATTCTTTTATTTTATCt > 1:224320/1‑99 (MQ=255)
aCTTTTATTTGCTCAAACGTAAGACGGCATA‑TTTTTTTGCACCTAATGGATTAATAATGACTATTCTTGTATCTCCAATAAATTCTTTTATTTTATCtt < 2:1718088/99‑1 (MQ=255)
aCTTTTATTTGCTCAAACGTAAGACGGCATA‑TTTTTTTGCACCTAATGGATTAATAATGACTATTCTTGTATCTCCAATAAATTCTTTTATTTTATCtt > 2:1664434/1‑99 (MQ=255)
aCTTTTATTTGCTCAAACGTAAGACGGCATA‑TTTTTTTGCACCTAATGGATTAATAATGACTATTCTTGTATCTCCAATAAATTCTTTTATTTTATCtt > 1:2582779/1‑99 (MQ=255)
aCTTTTATTTGCTCAAACGTAAGACGGCATA‑TTTTTTTGCACCTAATGGATTAATAATGACTATTCTTGTATCTCCAATAAATTCTTTTATTTTATCtt > 1:3409794/1‑99 (MQ=255)
aCTTTTATTTGCTCAAACGTAAGACGGCATA‑TTTTTTTGCACCTAATGGATTAATAATGACTATTCTTGTATCTCCAATAAATTCTTTTATTTTATCtt > 1:1429984/1‑99 (MQ=255)
cTTTTATTTGCTCAAACGTAAGACGGCATA‑TTTTTTTGCACCTAATGGATTAATAATGACTATTCTTGTATGTCCAATAAATTCTTTTATTTTATCTTc > 1:3014961/1‑99 (MQ=255)
cTTTTATTTGCTCAAACGTAAGACGGCATA‑TTTTTTTGCACCTAATGGATTAATAATGACTATTCTTGTATCTCCAATAAATTCTTTTATTTTATCTTc < 1:71975/99‑1 (MQ=255)
ttttATTTGCTCAAACGTAAGACGGCATA‑TTTTTTTGCACCTAATGGATTAATAATGACTATTCTTGTATCTCCAATAAATTCTTTTATTTTATCTTCa > 2:1846367/1‑99 (MQ=255)
ttttATTTGCTCAAACGTAAGACGGCATA‑TTTTTTTGCACCTAATGGATTAATAATGACTATTCTTGTATCTCCAATAAATTCTTTTATTTTATCTTCa > 2:2804756/1‑99 (MQ=255)
ttttATTTGCTCAAACGTAAGACGGCATA‑TTTTTTTGCACCTAATGGATTAATAATGACTATTCTTGTATCTCCAATAAATTCTTTTATTTTATCTTCa > 1:627578/1‑99 (MQ=255)
ttttATTTGCTCAAACGTAAGACGGCATA‑TTTTTTTGCACCTAATGGATTAATAATGACTATTCTTGTATCTCCAATAAATTCTTTTATTTTATATTCa > 1:802367/1‑99 (MQ=255)
ttttATTTGCTCAAACGTAAGAAGTCATA‑TTTTTTTGAACCTACTGGATTATTTATGCCTATTCTTGTAGCTCCAATAAATTCTTTTATTTTATCttaa < 2:2425394/99‑3 (MQ=255)
tttATTTGCTCAAACGTAAGACGGCATA‑TTTTTTTGCACCTAATGGATTAATAATGACTATTCTTGTATCTCCAATAAATTCTTTTATTTTATCTTCaa < 2:1604997/99‑1 (MQ=255)
ttATTTGCTCAAACGTAAGACGGCATA‑TTTTTTTGCACCTAATGGATTAATAATGACTATTCTTGTATCCCCAATAAATTCTTTTATTTTATCTTCAAc < 2:1902553/99‑1 (MQ=255)
tATTTGCTCAAACGTAAGACGGCATA‑TTTTTTTGCACCTAATGGATTAATAATGACTATTCTTGTATCTCCAATAAATTCTTTTATTTTATCTTCAACa < 2:2140999/99‑1 (MQ=255)
tATTTGCTCAAACGTAAGACGGCATA‑TTTTTTTGCACCTAATGGATTAATAATGACTATTCTTGTATCTCCAATAAATTCTTTTATTTTATCTTCAACa < 2:458810/99‑1 (MQ=255)
aTTTGCTCAAACGTAAGACGGCATA‑TTTTTTTGCACCTAATGGATTAATAATGACTATTCTTGTATCTCCAATAAATTCTTTTATTTTATCTTCAACAt > 1:1739787/1‑99 (MQ=255)
aTTTGCTCAAACGTAAGACGGCATA‑TTTTTTTGCACCTAATGGATTAATAATGACTATTCTTGTATCTCCAATAAATTCTTTTATTTTATCTTCAACAt < 2:849060/99‑1 (MQ=255)
tttGCTCAAACGTAAGACGGCATATTTTTTTT‑TTTTTTTTTTATTAATAATGACTATTCTTGTATCTCTTATTAATTCTTTTTTTTTATCTTCAACCTc > 2:2517622/1‑99 (MQ=255)
tttGCTCAAACGTAAGACGGCATATTTTTTTT‑CATTTTTTGGATTAATAATGACTATTCTTGTATCTCCAATAAATTCTTTTATTTTATCTTCAACATc > 2:524562/1‑99 (MQ=255)
tttGCTCAAACGTAAGACGGCATA‑TTTTTTTGCACCTAATGGATTAATAATGACTATTCTTGTATCTCCAATAAATTCTTTTATTTTATCTTCAACATc > 2:3057728/1‑99 (MQ=255)
tttGCTCAAACGTAAGACGGCATA‑TTTTTTTGCACCTAATGGATTAATAATGACTATTCTTGTATCTCCAATAAATTCTTTTATTTTATCTTCAACATc < 1:1191791/99‑1 (MQ=255)
ttGCTCAAACGTAAGACGGCATA‑TTTTTTTGCACCTAATGGATTAATAATGACTATTCTTGTATCTCCAATAAATTCTTTTATTTTATCTTCAACATCt > 1:323357/1‑99 (MQ=255)
gtCAAACGTACGACGGCATA‑TTTTTTTGCACCTAATGGATTAATAATGACTATTCTTGTATCTCCAATAAATTCTTTTATTTTATCTTCAACATCTACt > 2:3171825/2‑99 (MQ=255)
cTCAAACGTAAGACGGCATA‑TTTTTTTGCACCTAATGGATTAATAATGACTATTCTTGTATCTCCAATAAATTCTTTTATTTTATCTTCAACATCTACt < 1:876105/99‑1 (MQ=255)
cTCAAACGTAAGACGGCATA‑TTTTTTTGCACCTAATGGATTAATAATGACTATTCTTGTATCTCCAATAAATTCTTTTATTTTATCTTCAACATCTACt < 2:2173013/99‑1 (MQ=255)
cTCAAACGTAAGACGGCATA‑TTTTTTTGCACCTAATGGATTAATAATGACTATTCTTGTATCTCCAATAAATTCTTTTATTTTATCTTCAACATCTACt < 2:1169879/99‑1 (MQ=255)
cTCAAACGTAAGACGGCATA‑TTTTTTTGCACCTAATGGATTAATAATGACTATTCTTGTATCTCCAATAAATTCTTTTATTTTATCTTCAACATCTACt < 1:3451719/99‑1 (MQ=255)
cTCAAACGTAAGACGGCATA‑TTCTTTTGTACCTAATGGATTAATAATGACTATTCTTGTATCTCCAATAAATTCTTTTATTTTATCTTCAACATCTACt < 1:3164453/99‑1 (MQ=255)
ttaaaCGTAAGACGGCATA‑TTTTTTTGCATCTAATGGTTTATTAATGACTATTTTTGTATTTTCAATTAATTATTTTATTTTATTTTTAATATTTATTg > 1:2454962/3‑99 (MQ=255)
tCAAACGTAAGACGGCATA‑TTTTTTTGCACCTAATGACTTAATAATGACTATTCTTGTACCTCACATAAATTTTTTTGTTTTACCTTCATCCTCTACTg > 2:2894142/1‑99 (MQ=255)
cAAACGTAAGACGGCATA‑TTTTTTTGCACCTAATGGATTAATAATGACTATTCTTGTATCTCCAATAAATTCTTTTATTTTATCTTCAACATCTACTgg > 1:1946273/1‑99 (MQ=255)
aaaCGTAAGACGGCATA‑TTTTTTTGCACCTAATGGATTAATAATGACTATTCTTGTATCTCCAATAAATTCTTTTATTTTATCTTCAACATCTACTGGt < 1:2729472/99‑1 (MQ=255)
aaaCGTAAGACGGCATA‑TGTTTTTACACCTACTCGCTTAATAACGACTAATCTTGTACCTCCAATAACCTCTTTTATTCTATCTTCAACATCTACtcat > 2:1051192/1‑96 (MQ=255)
aaCGTAAGACGGCATA‑TTTTTTTGCACCTAATGGATTAATAATGACTATTCTTGTATCTCCAATAAATTCTTTTATTTTATCTTCAACATCTACTGGTa > 1:2162880/1‑99 (MQ=255)
aCGTAAGACGGCATA‑TTTTTTTGCACCTAATGGATTAATAATGACTATTCTTGTATCTCCAATAAATTCTTTTATTTTATCTTCAACATCTACTGGTaa > 2:679834/1‑99 (MQ=255)
aaGACGGCATA‑TTTTTTTGCACCTAATGGATTAATAATGACTATTCTTGTATCTCCAATAAATTCTTTTATTTTATCTTCAACATCTACTGGTAAATGc > 1:2098329/1‑99 (MQ=255)
aGACGGCATA‑TTTTTTTGCACCTAATGGATTAATAATGACTATTCTTGTATCTCCAATAAATTCTTTTATTTTATCTTCAACATCTACTGGTAAATGCa > 2:956877/1‑99 (MQ=255)
aGACGGCATA‑TTTTTTTGCACCTAATGGATTAATAATGACTATTCTTGTATCTCCAATAAATTCTTTTATTTTATCTTCAACATCTACTGGTAAATGCa > 1:1703028/1‑99 (MQ=255)
gACGGCATA‑TTTTTTTGCACCTAATGGATTAATAATGACTATTCTTGTATCTCCAATAAATTCTTTTATTTTATCTTCAACATCTACTGGTAAATGCaa < 2:493553/99‑1 (MQ=255)
gACGGCATA‑TTTTTTTGCACCTAATGGATTAATAATGACTATTCTTGTATCTCCAATAAATTCTTTTATTTTATCTTCAACATCTACTGGTAAATGCaa > 1:3282292/1‑99 (MQ=255)
ggCATA‑TTTTTTTGCACCTAATGGATTAATAATGACTATTCTTGTATCTCCAATAAATTCTTTTATTTTATCTTCAACATCTACTGGTAAATGCAAGTc < 1:2415138/99‑1 (MQ=255)
gCATA‑TTTTTTTGCACCTAATGGATTAATAATGACTATTCTTGTATCTCCAATAAATTCTTTTATTTTATCTTCAACATCTACTGGTAAATGCAAGTCg > 2:3152254/1‑99 (MQ=255)
gCATA‑TTTTTTTGCACCTAATGGATTAATAATGACTATTCTTGTATCTCCAATAAATTCTTTTATTTTATCTTCAACATCTACTGGCCAATGCAAGTCg > 1:2622867/1‑99 (MQ=255)
|
TCTTGCGGTAACCCGGTAAATATAATCCGATAATTTTCAAAGTGTGTTTTCACTTCTTGATATATAACTTTTATTTGCTCAAACGTAAGACGGCATATTTTTTTTGCACCTAATGGATTAATAATGACTATTCTTGTATCTCCAATAAATTCTTTTATTTTATCTTCAACATCTACTGGTAAATGCAAGTCG > NC_000913/3798555‑3798746
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
N/A
