Sample Resequencing Stats

Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
ALE, Flask, Isolate Predicted Mutations Mean Coverage Total Reads Percent Mapped Mapped Reads Average Read Length
A5 F28 I3 R2 489 0.0 1652083 58.3% 963164 55.2

Breseq alignment

BRESEQ :: Evidence
Predicted mutation
evidence seq id position mutation annotation gene description
RA W3110S.gb 3,098,818 G→A D189D (GAC→GAT)  ansB ← periplasmic L‑asparaginase II

Read alignment evidence...
  seq id position ref new freq score (cons/poly) reads annotation genes product
*W3110S.gb3,098,8180GA100.0% 826.1 / NA 287D189D (GAC→GAT) ansBperiplasmic L‑asparaginase II
Reads supporting (aligned to +/- strand):  ref base G (0/0);  new base A (287/0);  total (287/0)

Only 100 of 287 total aligned reads displayed.

CAGACTTGAAGGTCGCTACGTCGGTGGTGTTGGTTTTGGT  >  W3110S.gb/3098799‑3098838
                   |                    
cAGACTTGAAGGTCGCTACATCGGTGGTGTTGGTTTTgg   >  1:315180/1‑39 (MQ=255)
cAGACTTGAAGGTCGCTACATCGGTGGTGTTGGTTTTgg   >  1:939840/1‑39 (MQ=255)
cAGACTTGAAGGTCGCTACATCGGTGGTGTTGGTTTTGGt  >  1:649498/1‑40 (MQ=255)
cAGACTTGAAGGTCGCTACATCGGTGGTGTTGGTTTTGGt  >  1:685464/1‑40 (MQ=255)
cAGACTTGAAGGTCGCTACATCGGTGGTGTTGGTTTTGGt  >  1:632685/1‑40 (MQ=255)
cAGACTTGAAGGTCGCTACATCGGTGGTGTTGGTTTTGGt  >  1:61086/1‑40 (MQ=255)
cAGACTTGAAGGTCGCTACATCGGTGGTGTTGGTTTTGGt  >  1:580988/1‑40 (MQ=255)
cAGACTTGAAGGTCGCTACATCGGTGGTGTTGGTTTTGGt  >  1:567726/1‑40 (MQ=255)
cAGACTTGAAGGTCGCTACATCGGTGGTGTTGGTTTTGGt  >  1:558980/1‑40 (MQ=255)
cAGACTTGAAGGTCGCTACATCGGTGGTGTTGGTTTTGGt  >  1:533786/1‑40 (MQ=255)
cAGACTTGAAGGTCGCTACATCGGTGGTGTTGGTTTTGGt  >  1:527509/1‑40 (MQ=255)
cAGACTTGAAGGTCGCTACATCGGTGGTGTTGGTTTTGGt  >  1:521011/1‑40 (MQ=255)
cAGACTTGAAGGTCGCTACATCGGTGGTGTTGGTTTTGGt  >  1:513083/1‑40 (MQ=255)
cAGACTTGAAGGTCGCTACATCGGTGGTGTTGGTTTTGGt  >  1:487181/1‑40 (MQ=255)
cAGACTTGAAGGTCGCTACATCGGTGGTGTTGGTTTTGGt  >  1:481313/1‑40 (MQ=255)
cAGACTTGAAGGTCGCTACATCGGTGGTGTTGGTTTTGGt  >  1:461095/1‑40 (MQ=255)
cAGACTTGAAGGTCGCTACATCGGTGGTGTTGGTTTTGGt  >  1:447658/1‑40 (MQ=255)
cAGACTTGAAGGTCGCTACATCGGTGGTGTTGGTTTTGGt  >  1:4365/1‑40 (MQ=255)
cAGACTTGAAGGTCGCTACATCGGTGGTGTTGGTTTTGGt  >  1:418852/1‑40 (MQ=255)
cAGACTTGAAGGTCGCTACATCGGTGGTGTTGGTTTTGGt  >  1:407509/1‑40 (MQ=255)
cAGACTTGAAGGTCGCTACATCGGTGGTGTTGGTTTTGGt  >  1:405185/1‑40 (MQ=255)
cAGACTTGAAGGTCGCTACATCGGTGGTGTTGGTTTTGGt  >  1:393407/1‑40 (MQ=255)
cAGACTTGAAGGTCGCTACATCGGTGGTGTTGGTTTTGGt  >  1:381693/1‑40 (MQ=255)
cAGACTTGAAGGTCGCTACATCGGTGGTGTTGGTTTTGGt  >  1:371163/1‑40 (MQ=255)
cAGACTTGAAGGTCGCTACATCGGTGGTGTTGGTTTTGGt  >  1:352512/1‑40 (MQ=255)
cAGACTTGAAGGTCGCTACATCGGTGGTGTTGGTTTTGGt  >  1:328365/1‑40 (MQ=255)
cAGACTTGAAGGTCGCTACATCGGTGGTGTTGGTTTTGGt  >  1:806082/1‑40 (MQ=255)
cAGACTTGAAGGTCGCTACATCGGTGGTGTTGGTTTTGGt  >  1:977736/1‑40 (MQ=255)
cAGACTTGAAGGTCGCTACATCGGTGGTGTTGGTTTTGGt  >  1:9599/1‑40 (MQ=255)
cAGACTTGAAGGTCGCTACATCGGTGGTGTTGGTTTTGGt  >  1:930512/1‑40 (MQ=255)
cAGACTTGAAGGTCGCTACATCGGTGGTGTTGGTTTTGGt  >  1:898995/1‑40 (MQ=255)
cAGACTTGAAGGTCGCTACATCGGTGGTGTTGGTTTTGGt  >  1:890374/1‑40 (MQ=255)
cAGACTTGAAGGTCGCTACATCGGTGGTGTTGGTTTTGGt  >  1:88632/1‑40 (MQ=255)
cAGACTTGAAGGTCGCTACATCGGTGGTGTTGGTTTTGGt  >  1:875811/1‑40 (MQ=255)
cAGACTTGAAGGTCGCTACATCGGTGGTGTTGGTTTTGGt  >  1:87171/1‑40 (MQ=255)
cAGACTTGAAGGTCGCTACATCGGTGGTGTTGGTTTTGGt  >  1:849854/1‑40 (MQ=255)
cAGACTTGAAGGTCGCTACATCGGTGGTGTTGGTTTTGGt  >  1:837973/1‑40 (MQ=255)
cAGACTTGAAGGTCGCTACATCGGTGGTGTTGGTTTTGGt  >  1:829475/1‑40 (MQ=255)
cAGACTTGAAGGTCGCTACATCGGTGGTGTTGGTTTTGGt  >  1:309642/1‑40 (MQ=255)
cAGACTTGAAGGTCGCTACATCGGTGGTGTTGGTTTTGGt  >  1:785465/1‑40 (MQ=255)
cAGACTTGAAGGTCGCTACATCGGTGGTGTTGGTTTTGGt  >  1:777816/1‑40 (MQ=255)
cAGACTTGAAGGTCGCTACATCGGTGGTGTTGGTTTTGGt  >  1:76961/1‑40 (MQ=255)
cAGACTTGAAGGTCGCTACATCGGTGGTGTTGGTTTTGGt  >  1:765434/1‑40 (MQ=255)
cAGACTTGAAGGTCGCTACATCGGTGGTGTTGGTTTTGGt  >  1:761800/1‑40 (MQ=255)
cAGACTTGAAGGTCGCTACATCGGTGGTGTTGGTTTTGGt  >  1:755924/1‑40 (MQ=255)
cAGACTTGAAGGTCGCTACATCGGTGGTGTTGGTTTTGGt  >  1:741910/1‑40 (MQ=255)
cAGACTTGAAGGTCGCTACATCGGTGGTGTTGGTTTTGGt  >  1:714374/1‑40 (MQ=255)
cAGACTTGAAGGTCGCTACATCGGTGGTGTTGGTTTTGGt  >  1:704104/1‑40 (MQ=255)
cAGACTTGAAGGTCGCTACATCGGTGGTGTTGGTTTTGGt  >  1:69529/1‑40 (MQ=255)
cAGACTTGAAGGTCGCTACATCGGTGGTGTTGGTTTTGGt  >  1:688697/1‑40 (MQ=255)
cAGACTTGAAGGTCGCTACATCGGTGGTGTTGGTTTTGGt  >  1:1174466/1‑40 (MQ=255)
cAGACTTGAAGGTCGCTACATCGGTGGTGTTGGTTTTGGt  >  1:1362037/1‑40 (MQ=255)
cAGACTTGAAGGTCGCTACATCGGTGGTGTTGGTTTTGGt  >  1:133147/1‑40 (MQ=255)
cAGACTTGAAGGTCGCTACATCGGTGGTGTTGGTTTTGGt  >  1:1322647/1‑40 (MQ=255)
cAGACTTGAAGGTCGCTACATCGGTGGTGTTGGTTTTGGt  >  1:1319704/1‑40 (MQ=255)
cAGACTTGAAGGTCGCTACATCGGTGGTGTTGGTTTTGGt  >  1:1309239/1‑40 (MQ=255)
cAGACTTGAAGGTCGCTACATCGGTGGTGTTGGTTTTGGt  >  1:1294003/1‑40 (MQ=255)
cAGACTTGAAGGTCGCTACATCGGTGGTGTTGGTTTTGGt  >  1:127938/1‑40 (MQ=255)
cAGACTTGAAGGTCGCTACATCGGTGGTGTTGGTTTTGGt  >  1:1264808/1‑40 (MQ=255)
cAGACTTGAAGGTCGCTACATCGGTGGTGTTGGTTTTGGt  >  1:1256135/1‑40 (MQ=255)
cAGACTTGAAGGTCGCTACATCGGTGGTGTTGGTTTTGGt  >  1:121601/1‑40 (MQ=255)
cAGACTTGAAGGTCGCTACATCGGTGGTGTTGGTTTTGGt  >  1:1205761/1‑40 (MQ=255)
cAGACTTGAAGGTCGCTACATCGGTGGTGTTGGTTTTGGt  >  1:1184989/1‑40 (MQ=255)
cAGACTTGAAGGTCGCTACATCGGTGGTGTTGGTTTTGGt  >  1:1404466/1‑40 (MQ=255)
cAGACTTGAAGGTCGCTACATCGGTGGTGTTGGTTTTGGt  >  1:1168137/1‑40 (MQ=255)
cAGACTTGAAGGTCGCTACATCGGTGGTGTTGGTTTTGGt  >  1:115827/1‑40 (MQ=255)
cAGACTTGAAGGTCGCTACATCGGTGGTGTTGGTTTTGGt  >  1:1144024/1‑40 (MQ=255)
cAGACTTGAAGGTCGCTACATCGGTGGTGTTGGTTTTGGt  >  1:1134842/1‑40 (MQ=255)
cAGACTTGAAGGTCGCTACATCGGTGGTGTTGGTTTTGGt  >  1:1122329/1‑40 (MQ=255)
cAGACTTGAAGGTCGCTACATCGGTGGTGTTGGTTTTGGt  >  1:1114777/1‑40 (MQ=255)
cAGACTTGAAGGTCGCTACATCGGTGGTGTTGGTTTTGGt  >  1:1096995/1‑40 (MQ=255)
cAGACTTGAAGGTCGCTACATCGGTGGTGTTGGTTTTGGt  >  1:104124/1‑40 (MQ=255)
cAGACTTGAAGGTCGCTACATCGGTGGTGTTGGTTTTGGt  >  1:1031672/1‑40 (MQ=255)
cAGACTTGAAGGTCGCTACATCGGTGGTGTTGGTTTTGGt  >  1:1020835/1‑40 (MQ=255)
cAGACTTGAAGGTCGCTACATCGGTGGTGTTGGTTTTGGt  >  1:1014328/1‑40 (MQ=255)
cAGACTTGAAGGTCGCTACATCGGTGGTGTTGGTTTTGGt  >  1:1422700/1‑40 (MQ=255)
cAGACTTGAAGGTCGCTACATCGGTGGTGTTGGTTTTGGt  >  1:256448/1‑40 (MQ=255)
cAGACTTGAAGGTCGCTACATCGGTGGTGTTGGTTTTGGt  >  1:232118/1‑40 (MQ=255)
cAGACTTGAAGGTCGCTACATCGGTGGTGTTGGTTTTGGt  >  1:215600/1‑40 (MQ=255)
cAGACTTGAAGGTCGCTACATCGGTGGTGTTGGTTTTGGt  >  1:1976/1‑40 (MQ=255)
cAGACTTGAAGGTCGCTACATCGGTGGTGTTGGTTTTGGt  >  1:180329/1‑40 (MQ=255)
cAGACTTGAAGGTCGCTACATCGGTGGTGTTGGTTTTGGt  >  1:167743/1‑40 (MQ=255)
cAGACTTGAAGGTCGCTACATCGGTGGTGTTGGTTTTGGt  >  1:1644912/1‑40 (MQ=255)
cAGACTTGAAGGTCGCTACATCGGTGGTGTTGGTTTTGGt  >  1:1634538/1‑40 (MQ=255)
cAGACTTGAAGGTCGCTACATCGGTGGTGTTGGTTTTGGt  >  1:1632785/1‑40 (MQ=255)
cAGACTTGAAGGTCGCTACATCGGTGGTGTTGGTTTTGGt  >  1:1621767/1‑40 (MQ=255)
cAGACTTGAAGGTCGCTACATCGGTGGTGTTGGTTTTGGt  >  1:1608627/1‑40 (MQ=255)
cAGACTTGAAGGTCGCTACATCGGTGGTGTTGGTTTTGGt  >  1:1595286/1‑40 (MQ=255)
cAGACTTGAAGGTCGCTACATCGGTGGTGTTGGTTTTGGt  >  1:1572255/1‑40 (MQ=255)
cAGACTTGAAGGTCGCTACATCGGTGGTGTTGGTTTTGGt  >  1:1542628/1‑40 (MQ=255)
cAGACTTGAAGGTCGCTACATCGGTGGTGTTGGTTTTGGt  >  1:1530139/1‑40 (MQ=255)
cAGACTTGAAGGTCGCTACATCGGTGGTGTTGGTTTTGGt  >  1:1509433/1‑40 (MQ=255)
cAGACTTGAAGGTCGCTACATCGGTGGTGTTGGTTTTGGt  >  1:1489671/1‑40 (MQ=255)
cAGACTTGAAGGTCGCTACATCGGTGGTGTTGGTTTTGGt  >  1:1478508/1‑40 (MQ=255)
cAGACTTGAAGGTCGCTACATCGGTGGTGTTGGTTTTGGt  >  1:1461204/1‑40 (MQ=255)
cAGACTTGAAGGTCGCTACATCGGTGGTGTTGGTTTTGGt  >  1:1450306/1‑40 (MQ=255)
cAGACTTGAAGGTCGCTACATCGGTGGTGTTGGTTTTGGt  >  1:1445360/1‑40 (MQ=255)
cAGACTTGAAGGTCGCTACATCGGTGGTGTTGGTTTTGGt  >  1:143223/1‑40 (MQ=255)
cAGACTTGAAGGTCGCTACATCGGTGGTGTTGGTTTTGGt  >  1:1001535/1‑40 (MQ=255)
cAGACTTGAAGGTCGCTACAGCGGTGGTGTTGGTTTTGGt  >  1:302069/1‑40 (MQ=38)
                   |                    
CAGACTTGAAGGTCGCTACGTCGGTGGTGTTGGTTTTGGT  >  W3110S.gb/3098799‑3098838

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑

GATK/CNVnator alignment

N/A