Sample Resequencing Stats

Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
ALE, Flask, Isolate Predicted Mutations Mean Coverage Total Reads Percent Mapped Mapped Reads Average Read Length
A5 F28 I1 R1 826 0.0 88706 74.7% 66263 57.1

Breseq alignment

BRESEQ :: Evidence
Predicted mutation
evidence seq id position mutation annotation gene description
RA W3110S.gb 4,012,231 C→G V451V (GTC→GTG)  rbbA → fused ribosome‑associated ATPases

Read alignment evidence...
  seq id position ref new freq score (cons/poly) reads annotation genes product
*W3110S.gb4,012,2310CG100.0% 191.4 / NA 98V451V (GTC→GTG) rbbAfused ribosome‑associated ATPases
Reads supporting (aligned to +/- strand):  ref base C (0/0);  new base G (0/98);  total (0/98)

GTGGCGAGGGATATGTTCTGGCAGTTGATGGTCGATCTCTCGCGCCAGGACAAAGTGACTA  >  W3110S.gb/4012199‑4012259
                                |                            
gTGGCGAGGGATATGTTCTGGCAGTTGATTGTGGATCTCTCGCGCCAGGACAAAGTGACTa  <  1:8516/61‑1 (MQ=255)
gTGGCGAGGGATATGTTCTGGCAGTTGATGGTGGATCTCTCGCGCGAGGACAAAGTGACTa  <  1:37296/61‑1 (MQ=255)
gTGGCGAGGGATATGTTCTGGCAGTTGATGGTGGATCTCTCGCGCCAGGACAAAGTGACTa  <  1:57923/61‑1 (MQ=255)
gTGGCGAGGGATATGTTCTGGCAGTTGATGGTGGATCTCTCGCGCCAGGACAAAGTGACTa  <  1:67323/61‑1 (MQ=255)
gTGGCGAGGGATATGTTCTGGCAGTTGATGGTGGATCTCTCGCGCCAGGACAAAGTGACTa  <  1:67115/61‑1 (MQ=255)
gTGGCGAGGGATATGTTCTGGCAGTTGATGGTGGATCTCTCGCGCCAGGACAAAGTGACTa  <  1:64209/61‑1 (MQ=255)
gTGGCGAGGGATATGTTCTGGCAGTTGATGGTGGATCTCTCGCGCCAGGACAAAGTGACTa  <  1:63886/61‑1 (MQ=255)
gTGGCGAGGGATATGTTCTGGCAGTTGATGGTGGATCTCTCGCGCCAGGACAAAGTGACTa  <  1:63642/61‑1 (MQ=255)
gTGGCGAGGGATATGTTCTGGCAGTTGATGGTGGATCTCTCGCGCCAGGACAAAGTGACTa  <  1:63405/61‑1 (MQ=255)
gTGGCGAGGGATATGTTCTGGCAGTTGATGGTGGATCTCTCGCGCCAGGACAAAGTGACTa  <  1:60935/61‑1 (MQ=255)
gTGGCGAGGGATATGTTCTGGCAGTTGATGGTGGATCTCTCGCGCCAGGACAAAGTGACTa  <  1:60048/61‑1 (MQ=255)
gTGGCGAGGGATATGTTCTGGCAGTTGATGGTGGATCTCTCGCGCCAGGACAAAGTGACTa  <  1:59072/61‑1 (MQ=255)
gTGGCGAGGGATATGTTCTGGCAGTTGATGGTGGATCTCTCGCGCCAGGACAAAGTGACTa  <  1:58213/61‑1 (MQ=255)
gTGGCGAGGGATATGTTCTGGCAGTTGATGGTGGATCTCTCGCGCCAGGACAAAGTGACTa  <  1:57960/61‑1 (MQ=255)
gTGGCGAGGGATATGTTCTGGCAGTTGATGGTGGATCTCTCGCGCCAGGACAAAGTGACTa  <  1:68533/61‑1 (MQ=255)
gTGGCGAGGGATATGTTCTGGCAGTTGATGGTGGATCTCTCGCGCCAGGACAAAGTGACTa  <  1:57733/61‑1 (MQ=255)
gTGGCGAGGGATATGTTCTGGCAGTTGATGGTGGATCTCTCGCGCCAGGACAAAGTGACTa  <  1:57065/61‑1 (MQ=255)
gTGGCGAGGGATATGTTCTGGCAGTTGATGGTGGATCTCTCGCGCCAGGACAAAGTGACTa  <  1:56583/61‑1 (MQ=255)
gTGGCGAGGGATATGTTCTGGCAGTTGATGGTGGATCTCTCGCGCCAGGACAAAGTGACTa  <  1:5436/61‑1 (MQ=255)
gTGGCGAGGGATATGTTCTGGCAGTTGATGGTGGATCTCTCGCGCCAGGACAAAGTGACTa  <  1:53626/61‑1 (MQ=255)
gTGGCGAGGGATATGTTCTGGCAGTTGATGGTGGATCTCTCGCGCCAGGACAAAGTGACTa  <  1:52639/61‑1 (MQ=255)
gTGGCGAGGGATATGTTCTGGCAGTTGATGGTGGATCTCTCGCGCCAGGACAAAGTGACTa  <  1:5238/61‑1 (MQ=255)
gTGGCGAGGGATATGTTCTGGCAGTTGATGGTGGATCTCTCGCGCCAGGACAAAGTGACTa  <  1:51758/61‑1 (MQ=255)
gTGGCGAGGGATATGTTCTGGCAGTTGATGGTGGATCTCTCGCGCCAGGACAAAGTGACTa  <  1:51198/61‑1 (MQ=255)
gTGGCGAGGGATATGTTCTGGCAGTTGATGGTGGATCTCTCGCGCCAGGACAAAGTGACTa  <  1:10673/61‑1 (MQ=255)
gTGGCGAGGGATATGTTCTGGCAGTTGATGGTGGATCTCTCGCGCCAGGACAAAGTGACTa  <  1:81641/61‑1 (MQ=255)
gTGGCGAGGGATATGTTCTGGCAGTTGATGGTGGATCTCTCGCGCCAGGACAAAGTGACTa  <  1:9571/61‑1 (MQ=255)
gTGGCGAGGGATATGTTCTGGCAGTTGATGGTGGATCTCTCGCGCCAGGACAAAGTGACTa  <  1:9182/61‑1 (MQ=255)
gTGGCGAGGGATATGTTCTGGCAGTTGATGGTGGATCTCTCGCGCCAGGACAAAGTGACTa  <  1:88254/61‑1 (MQ=255)
gTGGCGAGGGATATGTTCTGGCAGTTGATGGTGGATCTCTCGCGCCAGGACAAAGTGACTa  <  1:88227/61‑1 (MQ=255)
gTGGCGAGGGATATGTTCTGGCAGTTGATGGTGGATCTCTCGCGCCAGGACAAAGTGACTa  <  1:87459/61‑1 (MQ=255)
gTGGCGAGGGATATGTTCTGGCAGTTGATGGTGGATCTCTCGCGCCAGGACAAAGTGACTa  <  1:87351/61‑1 (MQ=255)
gTGGCGAGGGATATGTTCTGGCAGTTGATGGTGGATCTCTCGCGCCAGGACAAAGTGACTa  <  1:86619/61‑1 (MQ=255)
gTGGCGAGGGATATGTTCTGGCAGTTGATGGTGGATCTCTCGCGCCAGGACAAAGTGACTa  <  1:85642/61‑1 (MQ=255)
gTGGCGAGGGATATGTTCTGGCAGTTGATGGTGGATCTCTCGCGCCAGGACAAAGTGACTa  <  1:85336/61‑1 (MQ=255)
gTGGCGAGGGATATGTTCTGGCAGTTGATGGTGGATCTCTCGCGCCAGGACAAAGTGACTa  <  1:83906/61‑1 (MQ=255)
gTGGCGAGGGATATGTTCTGGCAGTTGATGGTGGATCTCTCGCGCCAGGACAAAGTGACTa  <  1:82821/61‑1 (MQ=255)
gTGGCGAGGGATATGTTCTGGCAGTTGATGGTGGATCTCTCGCGCCAGGACAAAGTGACTa  <  1:5089/61‑1 (MQ=255)
gTGGCGAGGGATATGTTCTGGCAGTTGATGGTGGATCTCTCGCGCCAGGACAAAGTGACTa  <  1:81513/61‑1 (MQ=255)
gTGGCGAGGGATATGTTCTGGCAGTTGATGGTGGATCTCTCGCGCCAGGACAAAGTGACTa  <  1:79656/61‑1 (MQ=255)
gTGGCGAGGGATATGTTCTGGCAGTTGATGGTGGATCTCTCGCGCCAGGACAAAGTGACTa  <  1:77123/61‑1 (MQ=255)
gTGGCGAGGGATATGTTCTGGCAGTTGATGGTGGATCTCTCGCGCCAGGACAAAGTGACTa  <  1:76953/61‑1 (MQ=255)
gTGGCGAGGGATATGTTCTGGCAGTTGATGGTGGATCTCTCGCGCCAGGACAAAGTGACTa  <  1:7681/61‑1 (MQ=255)
gTGGCGAGGGATATGTTCTGGCAGTTGATGGTGGATCTCTCGCGCCAGGACAAAGTGACTa  <  1:75114/61‑1 (MQ=255)
gTGGCGAGGGATATGTTCTGGCAGTTGATGGTGGATCTCTCGCGCCAGGACAAAGTGACTa  <  1:72336/61‑1 (MQ=255)
gTGGCGAGGGATATGTTCTGGCAGTTGATGGTGGATCTCTCGCGCCAGGACAAAGTGACTa  <  1:71935/61‑1 (MQ=255)
gTGGCGAGGGATATGTTCTGGCAGTTGATGGTGGATCTCTCGCGCCAGGACAAAGTGACTa  <  1:69724/61‑1 (MQ=255)
gTGGCGAGGGATATGTTCTGGCAGTTGATGGTGGATCTCTCGCGCCAGGACAAAGTGACTa  <  1:68597/61‑1 (MQ=255)
gTGGCGAGGGATATGTTCTGGCAGTTGATGGTGGATCTCTCGCGCCAGGACAAAGTGACTa  <  1:18954/61‑1 (MQ=255)
gTGGCGAGGGATATGTTCTGGCAGTTGATGGTGGATCTCTCGCGCCAGGACAAAGTGACTa  <  1:50661/61‑1 (MQ=255)
gTGGCGAGGGATATGTTCTGGCAGTTGATGGTGGATCTCTCGCGCCAGGACAAAGTGACTa  <  1:29366/61‑1 (MQ=255)
gTGGCGAGGGATATGTTCTGGCAGTTGATGGTGGATCTCTCGCGCCAGGACAAAGTGACTa  <  1:28952/61‑1 (MQ=255)
gTGGCGAGGGATATGTTCTGGCAGTTGATGGTGGATCTCTCGCGCCAGGACAAAGTGACTa  <  1:28387/61‑1 (MQ=255)
gTGGCGAGGGATATGTTCTGGCAGTTGATGGTGGATCTCTCGCGCCAGGACAAAGTGACTa  <  1:2448/61‑1 (MQ=255)
gTGGCGAGGGATATGTTCTGGCAGTTGATGGTGGATCTCTCGCGCCAGGACAAAGTGACTa  <  1:24104/61‑1 (MQ=255)
gTGGCGAGGGATATGTTCTGGCAGTTGATGGTGGATCTCTCGCGCCAGGACAAAGTGACTa  <  1:2379/61‑1 (MQ=255)
gTGGCGAGGGATATGTTCTGGCAGTTGATGGTGGATCTCTCGCGCCAGGACAAAGTGACTa  <  1:22563/61‑1 (MQ=255)
gTGGCGAGGGATATGTTCTGGCAGTTGATGGTGGATCTCTCGCGCCAGGACAAAGTGACTa  <  1:20622/61‑1 (MQ=255)
gTGGCGAGGGATATGTTCTGGCAGTTGATGGTGGATCTCTCGCGCCAGGACAAAGTGACTa  <  1:20187/61‑1 (MQ=255)
gTGGCGAGGGATATGTTCTGGCAGTTGATGGTGGATCTCTCGCGCCAGGACAAAGTGACTa  <  1:1963/61‑1 (MQ=255)
gTGGCGAGGGATATGTTCTGGCAGTTGATGGTGGATCTCTCGCGCCAGGACAAAGTGACTa  <  1:29437/61‑1 (MQ=255)
gTGGCGAGGGATATGTTCTGGCAGTTGATGGTGGATCTCTCGCGCCAGGACAAAGTGACTa  <  1:18838/61‑1 (MQ=255)
gTGGCGAGGGATATGTTCTGGCAGTTGATGGTGGATCTCTCGCGCCAGGACAAAGTGACTa  <  1:1856/61‑1 (MQ=255)
gTGGCGAGGGATATGTTCTGGCAGTTGATGGTGGATCTCTCGCGCCAGGACAAAGTGACTa  <  1:1739/61‑1 (MQ=255)
gTGGCGAGGGATATGTTCTGGCAGTTGATGGTGGATCTCTCGCGCCAGGACAAAGTGACTa  <  1:16996/61‑1 (MQ=255)
gTGGCGAGGGATATGTTCTGGCAGTTGATGGTGGATCTCTCGCGCCAGGACAAAGTGACTa  <  1:15052/61‑1 (MQ=255)
gTGGCGAGGGATATGTTCTGGCAGTTGATGGTGGATCTCTCGCGCCAGGACAAAGTGACTa  <  1:13530/61‑1 (MQ=255)
gTGGCGAGGGATATGTTCTGGCAGTTGATGGTGGATCTCTCGCGCCAGGACAAAGTGACTa  <  1:13271/61‑1 (MQ=255)
gTGGCGAGGGATATGTTCTGGCAGTTGATGGTGGATCTCTCGCGCCAGGACAAAGTGACTa  <  1:12532/61‑1 (MQ=255)
gTGGCGAGGGATATGTTCTGGCAGTTGATGGTGGATCTCTCGCGCCAGGACAAAGTGACTa  <  1:12510/61‑1 (MQ=255)
gTGGCGAGGGATATGTTCTGGCAGTTGATGGTGGATCTCTCGCGCCAGGACAAAGTGACTa  <  1:11454/61‑1 (MQ=255)
gTGGCGAGGGATATGTTCTGGCAGTTGATGGTGGATCTCTCGCGCCAGGACAAAGTGACTa  <  1:10752/61‑1 (MQ=255)
gTGGCGAGGGATATGTTCTGGCAGTTGATGGTGGATCTCTCGCGCCAGGACAAAGTGACTa  <  1:38770/61‑1 (MQ=255)
gTGGCGAGGGATATGTTCTGGCAGTTGATGGTGGATCTCTCGCGCCAGGACAAAGTGACTa  <  1:4908/61‑1 (MQ=255)
gTGGCGAGGGATATGTTCTGGCAGTTGATGGTGGATCTCTCGCGCCAGGACAAAGTGACTa  <  1:48772/61‑1 (MQ=255)
gTGGCGAGGGATATGTTCTGGCAGTTGATGGTGGATCTCTCGCGCCAGGACAAAGTGACTa  <  1:4875/61‑1 (MQ=255)
gTGGCGAGGGATATGTTCTGGCAGTTGATGGTGGATCTCTCGCGCCAGGACAAAGTGACTa  <  1:47131/61‑1 (MQ=255)
gTGGCGAGGGATATGTTCTGGCAGTTGATGGTGGATCTCTCGCGCCAGGACAAAGTGACTa  <  1:46661/61‑1 (MQ=255)
gTGGCGAGGGATATGTTCTGGCAGTTGATGGTGGATCTCTCGCGCCAGGACAAAGTGACTa  <  1:4640/61‑1 (MQ=255)
gTGGCGAGGGATATGTTCTGGCAGTTGATGGTGGATCTCTCGCGCCAGGACAAAGTGACTa  <  1:46340/61‑1 (MQ=255)
gTGGCGAGGGATATGTTCTGGCAGTTGATGGTGGATCTCTCGCGCCAGGACAAAGTGACTa  <  1:44784/61‑1 (MQ=255)
gTGGCGAGGGATATGTTCTGGCAGTTGATGGTGGATCTCTCGCGCCAGGACAAAGTGACTa  <  1:41224/61‑1 (MQ=255)
gTGGCGAGGGATATGTTCTGGCAGTTGATGGTGGATCTCTCGCGCCAGGACAAAGTGACTa  <  1:41191/61‑1 (MQ=255)
gTGGCGAGGGATATGTTCTGGCAGTTGATGGTGGATCTCTCGCGCCAGGACAAAGTGACTa  <  1:39067/61‑1 (MQ=255)
gTGGCGAGGGATATGTTCTGGCAGTTGATGGTGGATCTCTCGCGCCAGGACAAAGTGACTa  <  1:38224/61‑1 (MQ=255)
gTGGCGAGGGATATGTTCTGGCAGTTGATGGTGGATCTCTCGCGCCAGGACAAAGTGACTa  <  1:37095/61‑1 (MQ=255)
gTGGCGAGGGATATGTTCTGGCAGTTGATGGTGGATCTCTCGCGCCAGGACAAAGTGACTa  <  1:36041/61‑1 (MQ=255)
gTGGCGAGGGATATGTTCTGGCAGTTGATGGTGGATCTCTCGCGCCAGGACAAAGTGACTa  <  1:35210/61‑1 (MQ=255)
gTGGCGAGGGATATGTTCTGGCAGTTGATGGTGGATCTCTCGCGCCAGGACAAAGTGACTa  <  1:34952/61‑1 (MQ=255)
gTGGCGAGGGATATGTTCTGGCAGTTGATGGTGGATCTCTCGCGCCAGGACAAAGTGACTa  <  1:3495/61‑1 (MQ=255)
gTGGCGAGGGATATGTTCTGGCAGTTGATGGTGGATCTCTCGCGCCAGGACAAAGTGACTa  <  1:34281/61‑1 (MQ=255)
gTGGCGAGGGATATGTTCTGGCAGTTGATGGTGGATCTCTCGCGCCAGGACAAAGTGACTa  <  1:3351/61‑1 (MQ=255)
gTGGCGAGGGATATGTTCTGGCAGTTGATGGTGGATCTCTCGCGCCAGGACAAAGTGACTa  <  1:31597/61‑1 (MQ=255)
gTGGCGAGGGATATGTTCTGGCAGTTGATGGGGGATCTCTCGCGCCAGGACAAAGTGACTa  <  1:30474/61‑1 (MQ=255)
gTGGCGAGGGATATGTTCTGGCAGTTGAAGGTGGATCTCTCGCGCCAGGACAAAGTGACTa  <  1:61050/61‑1 (MQ=255)
 tGGCGAGGGATATGTTCTGGCAGTTGATGGTGGATCTCTCGCGCCAGGACAAAGTGACTa  <  1:85793/60‑1 (MQ=255)
             tGTTCTGGCAGTTGATGGTGGATCTCTCGCGCCAGGACAAAGTGACTa  <  1:80625/48‑1 (MQ=255)
               ttCTGGCAGTTGATGGTGGATCTCTCGCGCCAGGACAAAGTGACTa  <  1:35977/46‑1 (MQ=255)
                                |                            
GTGGCGAGGGATATGTTCTGGCAGTTGATGGTCGATCTCTCGCGCCAGGACAAAGTGACTA  >  W3110S.gb/4012199‑4012259

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑

GATK/CNVnator alignment

N/A