Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A11 F212 I1 R1
|
174 |
80.0 |
3892211 |
96.7% |
3763768 |
99.9 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
NC_000913 |
4,022,987 |
G→T |
A84A (GCG→GCT) |
tatC → |
TatABCE protein translocation system subunit |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | NC_000913 | 4,022,987 | 0 | G | T | 84.8%
| 238.6
/ 37.7
| 92 | A84A (GCG→GCT) | tatC | TatABCE protein translocation system subunit |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (7/7); new base T (36/42); total (43/49) |
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 |
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 8.13e-01 |
AGTTGCCGCAAGGTTCAACGATGATCGCCACCGACGTGGCCTCGCCGTTCTTTACGCCGATCAAGCTGACCTTTATGGTGTCGCTGATTCTGTCAGCGCCGGTGATTCTCTATCAGGTGTGGGCATTTATCGCCCCAGCGCTGTATAAGCATGAACGTCGCCTGGTGGTGCCGCTGCTGGTTTCCAGCTCTCTGCT > NC_000913/4022890‑4023085
|
aGTTGCCGCAAGGTTCAACGATGATCGCCACCGACGTGGCCTCGCCGTTCTTTACGCCGATCAAGCTGACCTTTATGGTGTCGCTGATTCTGTCAGCTcc < 2:1586829/100‑1 (MQ=255)
gTTGCCGCAAGGTTCAACGATGATCGCCACCGACGTGGCCTCGCCGTTCTTTACGCCGATCAAGCTGACCTTTATGGTGTCGCTGATTCTGTCAGCGCCg < 1:1148781/100‑1 (MQ=255)
ttGCCGCAAGGTTCAACGATGATCGCCACCGACGTGGCCTCGCCGTTCTTTACGCCGATCAAGCTGACCTTTATGGTGTCGCTGATTCTGTCAGCTCCgg < 2:1067784/100‑1 (MQ=255)
tGCCGCAAGGTTCAACGATGATCGCCACCGACGTGGCCTCGCCGTTCTTTACGCCGATCAAGCTGACCTTTATGGTGTCGCTGATTCTGTCAGCTCCGGt < 1:686459/100‑1 (MQ=255)
tGCCGCAAGGTTCAACGATGATCGCCACCGACGTGGCCTCGCCGTTCTTTACGCCGATCAAGCTGACCTTTATGGTGTCGCTGATTCTGTCAGCTCCGGt < 2:1797982/100‑1 (MQ=255)
tGCCGCAAGGTTCAACGATGATCGCCACCGACGTGGCCTCGCCGTTCTTTACGCCGATCAAGCTGACCTTTATGGTGTCGCTGATTCTGTCAGCTCCGGt < 2:445718/100‑1 (MQ=255)
tGCCGCAAGGTTCAACGATGATCGCCACCGACGTGGCCTCGCCGTTCTTTACGCCGATCAAGCTGACCTTTATGGTGTCGCTGATTCTGTCAGCGCCGGt < 2:1672543/100‑1 (MQ=255)
cGCAAGGTTCAACGATGATCGCCACCGACGTGGCCTCGCCGTTCTTTACGCCGATCAAGCTGACCTTTATGGTGTCGCTGATTCTGTCAGCTCCGGTGAt > 1:100445/1‑100 (MQ=255)
cGCAAGGTTCAACGATGATCGCCACCGACGTGGCCTCGCCGTTCTTTACGCCGATCAAGCTGACCTTTATGGTGTCGCTGATTCTGTCAGCTCCGGTGAt < 2:594813/100‑1 (MQ=255)
gCAAGGTTCAACGATGATCGCCAGCGACGTGGCCTCGCCGTTCTTTACGCCGATCAAGCTGACCTTTATGGTGTCGCTGATTCTGTAAGCTCCGGTGAtt < 1:178849/100‑1 (MQ=255)
aaGGTTCAACGATGATCGCCACCGACGTGGCCTCGCCGTTCTTTACGCCGATCAAGCTGACCTTTATGGTGTCGCTGATTCTGTCAGCTCCGGTGATtct > 2:1424020/1‑100 (MQ=255)
aGGTTCAACGATGATCGCCACCGACGTGGCCTCGCCGTTCTTTACGCCGATCAAGCTGACCTTTATGGTGTCGCTGATTCTGTCAGCTCCGGTGATtctc < 2:300271/100‑1 (MQ=255)
ggTTCAACGATGATCGCCACCGACGTGGCCTCGCCGTTCTTTACGCCGATCAAGCTGACCTTTGTGGTGTCGCTGATTCTGTCAGCTCCGGTGATTctct > 2:1852397/1‑100 (MQ=255)
gTTCAACGATGATCGCCACCGACGTGGCCTCGCCGTTCTTTACGCCGATCAAGCTGACCTTTATGGTGTCGCTGATTCTGTCAGCTCCGGTGATTCTCTa > 1:1462531/1‑100 (MQ=255)
gTTCAACGATGATCGCCACCGACGTGGCCTCGCCGTTCTTTACGCCGATCAAGCTGACCTTTATGGTGTCGCTGATTCTGTCAGCTCCGGTGATTCTCTa > 1:706624/1‑100 (MQ=255)
gTTCAACGATGATCGCCACCGACGTGGCCTCGCCGTTCTTTACGCCGATCAAGCTGACCTTTATGGTGTCGCTGATTCTGTCAGCTCCGGTGATTCTCTa > 2:275099/1‑100 (MQ=255)
gTTCAACGATGATCGCCACCGACGTGGCCTCGCCGTTCTTTACGCCGATCAAGCTGACCTTTATGGTGTCGCTGATTCTGTCAGCGCCGGTGATTCTCTa > 1:1375083/1‑100 (MQ=255)
tCAACGATGATCGCCACCGACGTGGCCTCGCCGTTCTTTACGCCGATCAAGCTGACCTTTATGGTGTCGCTGATTCTGTCAGCTCCGGTGATTCTCTATc > 1:698156/1‑100 (MQ=255)
tCAACGATGATCGCCACCGACGTGGCCTCGCCGTTCTTTACGCCGATCAAGCTGACCTTTATGGTGTCGCTGATTCTGTCAGCGCCGGTGATTCTCTATc > 1:634258/1‑100 (MQ=255)
cAACGATGATCGCCACCGACGTGGCCTCGCCGTTCTTTACGCCGATCAAGCTGACCTTTATGGTGTCGCTGATTCTGTCAGCTCCGGTGATTCTCTATCa < 2:396810/100‑1 (MQ=255)
aCGATGATCGCCACCGACGTGGCCTCGCCGTTCTTTACGCCGATCAAGCTGACCTTTATGGTGTCGCTGATTCTGTCAGCTCCGGTGATTCTCTATCAgg > 2:10289/1‑100 (MQ=255)
tgatCGCCACCGACGTGGCCTCGCCGTTCTTTACGCCGATCAAGCTGACCTTTATGGTGTCGCTGATTCTGTCAGCTCCGGTGATTCTCTATCAGGtgtg < 1:260907/100‑1 (MQ=255)
tccgatctccGACGTGGCCTCGCCGTTCTTTACGCCGATCAAGCTGACCTTTATGGTGTCGCTGATTCTGTCAGCTCCGGTGATTCTCTATCAGGTGTgg < 1:1702487/92‑1 (MQ=255)
gatCGCCACCGACGTGGCCTCGCCGTTCTTTACGCCGATCAAGCTGACCTTTATGGTGTCGCTGATTCTGTCAGCTCCGGTGATTCTCTATCAGGTGTgg < 2:31808/100‑1 (MQ=255)
gatCGCCACCGACGTGGCCTCGCCGTTCTTTACGCCGATCAAGCTGACCTTTATGGTGTCGCTGATTCTGTCAGCTCCGGTGATTCTCTATCAGGTGTgg > 1:53387/1‑100 (MQ=255)
tCGCCACCGACGTGGCCTCGCCGTTCTTTACGCCGATCAAGCTGACCTTTATGGTGTCGCTGATTCTGTCAGCTCCGGTGATTCTCTATCAGGTGTGGGc < 1:1856182/100‑1 (MQ=255)
cGCCACCGACGTGGCCTCGCCGTTCTTTACGCCGATCAAGCTGACCTTTATGGTGTCGCTGATTCTGTCAGCTCCGGTGATTCTCTATCAGGTGTGGGCa < 2:1793246/100‑1 (MQ=255)
cGCCACCGACGTGGCCTCGCCGTTCTTTACGCCGATCAAGCTGACCTTTATGGTGTCGCTGATTCTGTCAGCTCCGGTGATTCTCTATCAGGTGTGGGCa < 2:1730506/100‑1 (MQ=255)
gCCACCGACGTGGCCTCGCCGTTCTTTACGCCGATCAAGCTGACCTTTATGGTGTCGCTGATTCTGTCAGCTCCGGTGATTCTCTATCAGGTGTGGGCAt > 1:850869/1‑100 (MQ=255)
gCCACCGACGTGGCCTCGCCGTTCTTTACGCCGATCAAGCTGACCTTTATGGTGTCGCTGATTCTGTCAGCTCCGGTGATTCTCTATCAGGTGTGGGCAt > 1:850885/1‑100 (MQ=255)
ccACCGACGTGGCCTCGCCGTTCTTTACGCCGATCAAGCTGACCTTTATGGTGTCGCTGATTCTGTCAGCTCCGGTGATTCTCTATCAGGTGTGGGCAtt > 1:1539739/1‑100 (MQ=255)
aCCGACGTGGCCTCGCCGTTCTTTACGCCGATCAAGCTGACCTTTATGGTGTCGCTGATTCTGTCAGCTCCGGTGATTCTCTATCAGGTGTGGGCATTTa < 2:1080052/100‑1 (MQ=255)
aCCGACGTGGCCTCGCCGTTCTTTACGCCGATCAAGCTGACCCTTATGGTGTCGCTGATTCTGTCAGCTCCGGTGATTCTCTATCAGGTGTGGGCATTTa > 1:1752638/1‑100 (MQ=255)
ccGACGTGGCCTCGCCGTTCTTTACGCCGATCAAGCTGACCTTTATGGTGTCGCTGATTCTGTCAGCTCCGGTGATTCTCTATCAGGTGTggagatcgga > 2:1702498/1‑92 (MQ=255)
cGACGTGGCCTCGCCGTTCTTTACGCCGATCAAGCTGACCTTTATGGTGTCGCTGATTCTGTCAGCTCCGGTGATTCTCTATCAGGTGTGGGCATTTAt < 1:932960/99‑1 (MQ=255)
cGACGTGGCCTCGCCGTTCTTTACGCCGATCAAGCTGACCTTTATGGTGTCGCTGATTCTGTCAGCTCCGGTGATTCTCTATCAGGTGTGGGCATTTATc < 1:1191397/100‑1 (MQ=255)
gTGGCCTCGCCGTTCTTTACGCCGATCAAGCTGACCTTTATGGTGTCGCTGATTCTGTCAGCGCCGGTGATTCTCTATCAGGTGTGGGCATTTATCGccc < 1:1417641/100‑1 (MQ=255)
tGGCCTCGCCGTTCTTTACGCCGATCAAGCTGACCTTTATGGTGTCGCTGATTCTGTCAGCTCCGGTGATTCTCTATCAGGTGTGGGCATTTATCGcccc < 2:312519/100‑1 (MQ=255)
tGGCCTCGCCGTTCTTTACGCCGATCAAGCTGACCTTTATGGTGTCGCTGATTCTGTCAGCTCCGGTGATTCTCTATCAGGTGTGGGCATTTATCGcccc < 1:1727242/100‑1 (MQ=255)
ccTCGCCGTTCTTTACGCCGATCAAGCTGACCTTTATGGTGTCGCTGATTCTGTCAGCTCCGGTGATTCTCTATCAGGTGTGGGCATTTATCGCCCCAgc > 2:649172/1‑100 (MQ=255)
cTCGCCGTTCTTTACGCCGATCAAGCTGACCTTTATGGTGTCGCTGATTCTGTCAGCTCCGGTGATTCTCTATCAGGTGTGGGCATTTATCGCCCCAgcg > 1:274207/1‑100 (MQ=255)
cGCCGTGCTTTACGCCGATCAAGCTGACCTTTATTGTGTCGCTGATTCGGTCAGCGCCGGTGATTCTCTATCAGGTGTGGGCATTTATCGCCCCAgcgc < 2:354274/99‑1 (MQ=255)
cGTTCTTTACGCCGATCAAGCTGACCTTTATGGTGTCGCTGATTCTGTCAGCTCCGGTGATTCTCTATCAGGTGTGGGCATTTATCGCCCCAGCGCTGta > 1:1308432/1‑100 (MQ=255)
cTTTACGCCGATCAAGCTGACCTTTATGGTGTCGCTGATTCTGTCAGCTCCGGTGATTCTCTATCAGGTGTGGGCATTTATCGCCCCAGCGCTGTATAAg < 2:952233/100‑1 (MQ=255)
cTTTACGCCGATCAAGCTGACCTTTATGGTGTCGCTGATTCTGTCAGCTCCGGTGATTCTCTATCAGGTGTGGGCATTTATCGCCCCAGCGCTGTATAAg < 2:1347612/100‑1 (MQ=255)
tttACGCCGATCAAGCTGACCTTTATGGTGTCGCTGATTCTGTCAGCTCCGGTGATTCTCTATCAGGTGTGGGCATTTATCGCCCCAGCGCTGTATAAGc > 2:1582331/1‑100 (MQ=255)
ttACGCCGATCAAGCTGACCTTTATGGTGTCGCTGATTCTGTCAGCTCCGGTGATTCTCTATCAGGTGTGGGCATTTATCGCCCCAGCGCTGTATAAGCa < 2:169179/100‑1 (MQ=255)
ncGCCGATCAAGCTGACCTTTATGGTGTCGCTGATTCTGTCAGCTCCGGTGATTCTCTATCAGGTGTGGGCATTTATCGCCCCAGCGCTGTATAAGCATg > 1:89094/2‑100 (MQ=255)
aCGCCGATCAAGCTGACCTTTATGGTGTCGCTGATTCTGTCAGCGCCGGTGATTCTCTATCAGGTGTGGGCATTTATCGCCCCAGCGCTGTATAAGCATg < 2:1901104/100‑1 (MQ=255)
cGCCGATCAAGCTGACCTTTATGGTGTCGCTGATTCTGTCAGCTCCGGTGATTCTCTATCAGGTGTGGGCATTTATCGCCCCAGCGCTGTATAAGCATGa > 1:792976/1‑100 (MQ=255)
cGCCGATCAAGCTGACCTTTATGGTGTCGCTGATTCTGTCAGCTCCGGTGATTCTCTATCAGGTGTGGGCATTTATCGCCCCAGCGCTGTATAAGCATGa > 1:1356395/1‑100 (MQ=255)
cGCCGATCAAGCTGACCTTTATGGTGTCGCTGATTCTGTCAGCTCCGGTGATTCTCTATCAGGTGTGGGCATTTATCGCCCCAGCGCTGTATAAGCATGa < 1:1814598/100‑1 (MQ=255)
cGCCGATCAAGCTGACCTTTATGGTGTCGCTGATTCTGTCAGCTCCGGTGATTCTCTATCAGGTGTGGGCATTTATCGCCCCAGCGCTGTATAAGCATGa < 1:1738552/100‑1 (MQ=255)
gCCGATCAAGCTGACCTTTATGGTGTCGCTGATTCTGTCAGCGCCGGTGATTCTCTATCAGGTGTGGGCATTTATCGCCCCAGCGCTGTATAAGCATGaa > 1:565199/1‑100 (MQ=255)
cGATCAAGCTGACCTTTATGGTGTCGCTGATTCTGTCAGCTCCGGTGATTCTCTATCAGGTGTGGGCATTTATCGCCCCAGCGCTGTATAAGCATGAACg > 1:403647/1‑100 (MQ=255)
cGATCAAGCTGACCTTTATGGTGTCGCTGATTCTGTCAGCTCCGGTGATTCTCTATCAGGTGTGGGCATTTATCGCCCCAGCGCTGTATAAGCATGAACg < 2:1164009/100‑1 (MQ=255)
cGATCAAGCTGACCTTTATGGTGTCGCTGATTCTGTCAGCGCCGGTGATTCTCTATCAGGTGTGGGCATTTATCGCCCCAGCGCTGTATAAGCATGAACg > 1:1004955/1‑100 (MQ=255)
cGATCAAGCTGACCTTTATGGTGTCGCTGATTCTGTCAGCGCCGGTGATTCTCTATCAGGTGTGGGCATTTATCGCCCCAGCGCTGTATAAGCATGAACg > 2:1401224/1‑100 (MQ=255)
aTCAAGCTGACCTTTATGGTGTCGCTGATTCTGTCAGCTCCGGTGATTCTCTATCAGGTGTGGGCATTTATCGCCCCAGCGCTGTATAAGCATGAACGTc > 2:221941/1‑100 (MQ=255)
aTCAAGCTGACCTTTATGGTGTCGCTGATTCTGTCAGCGCCGGTGATTCTCTATCAGGTGTGGGCATTTATCGCCCCAGCGCTGTATAAGCATGAACGTc < 1:963843/100‑1 (MQ=255)
cAAGCTGACCTTTATGGTGTCGCTGATTCTGTCAGCTCCGGTGATTCTCTATCAGGTGTGGGCATTTATCGCCCCAGCGCTGTATAAGCATGAACGTCGc > 1:1596458/1‑100 (MQ=255)
aaGCTGACCTTTATGGTGTCGCTGATTCTGTCAGCTCCGGTGATTCTCTATCAGGTGTGGGGATTTATCGCCCCAGCGCTGTATAAGCATGAACGTCGcc < 1:1195387/100‑1 (MQ=255)
aGCTGACCTTTATGGTGTCGCTGATTCTGTCAGCTCCGGTGATTCTCTATCAGGTGTGGGCATTTATCGCCCCAGCGCTGTATAAGCATGAACGTCGCCt < 2:1422532/100‑1 (MQ=255)
aGCTGACCTTTATGGTGTCGCTGATTCTGTCAGCTCCGGTGATTCTCTATCAGGTGTGGGCATTTATCGCCCCAGCGCTGTATAAGCATGAACGTCGCCt > 1:1401353/1‑100 (MQ=255)
aGCTGACCTTTATGGTGTCGCTGATTCTGTCAGCTCCGGTGATTCTCTATCAGGTGTGGGCATTTATCGCCCCAGCGCTGTATAAGCATGAACGTCGCCt < 2:1462539/100‑1 (MQ=255)
cTGACCTTTATGGTGTCGCTGATTCTGTCAGCTCCGGTGATTCTCTATCAGGTGTGGGCATTTATCGCCCCAGCGCTGTATAAGCATGAACGTCGCCtgg > 1:1886873/1‑100 (MQ=255)
ngACCTTTATGGTGTCGCTGATTCTGTCAGCTCCGGTGATTCTCTATCAGGTGTGGGCATTTATCGCCCCAGCGCTGTATACGCATGAACGTCGCCtggt > 2:734970/2‑100 (MQ=255)
gACCTTTATGGTGTCGCTGATTCTGTCAGCTCCGGTGATTCTCTATCAGGTGTGGGCATTTATCGCCCCAGCGCTGTATAAGCATGAACGTCGCCtggtg < 1:1148074/100‑1 (MQ=255)
gACCTTTATGGTGTCGCTGATTCTGTCAGCTCCGGTGATTCTCTATCAGGTGTGGGCATTTATCGCCCCAGCGCTGTATAAGCATGAACGTCGCCtggtg > 2:1832413/1‑100 (MQ=255)
aCCTTTATGGTGTCGCTGATTCTGTCAGCTCCGGTGATTCTCTATCAGGTGTGGGCATTTATCGCCCCAGCGCTGTATAAGCATGAACGTCGCCtggtgg < 1:1794321/100‑1 (MQ=255)
ccTTTATGGTGTCGCTGATTCTGTCAGCTCCGGTGATTCTCTCTCAGGTGTGGGCATTTATCGCCCCAGCGCTGTATAAGCATGAACGTCGCCTggtggt < 2:479/100‑1 (MQ=255)
ccTTTATGGTGTCGCTGATTCTGTCAGCTCCGGTGATTCTCTATCAGGTGTGGGCATTTATCGCCCCAGCGCTGTATAAGCATGAACGTCGCCTggtggt < 2:1191409/100‑1 (MQ=255)
ccTTTATGGTGTCGCTGATTCTGTCAGCTCCGGTGATTCTCTATCAGGTGTGGGCATTTATCGCCCCAGCGCTGTATAAGCATGAACGTCGCCTggtggt > 1:330196/1‑100 (MQ=255)
tttATGGTGTCGCTGATTCTGTCAGCTCCGGTGATTCTCTATCAGGTGTGGGCATTTATCGCCCCAGCGCTGTATAAGCATGAACGTCGCCTGGTGGTGc > 1:504959/1‑100 (MQ=255)
ttATGGTGTCGCTGATTCTGTCAGCTCCGGTGATTCTCTATCAGGTGTGGGCATTTATCGCCCCAGCGCTGTATAAGCATGAACGTCGCCTGGTGGTGcc < 2:739331/100‑1 (MQ=255)
ttATGGTGTCGCTGATTCTGTCAGCTCCGGTGATTCTCTATCAGGTGTGGGCATTTATCGCCCCAGCGCTGTATAAGCATGAACGTCGCCTGGTGGTGcc < 2:672285/100‑1 (MQ=255)
ttATGGTGTCGCTGATTCTGTCAGCTCCGGTGATTCTCTATCAGGTGTGGGCATTTATCGCCCCAGCGCTGTATAAGCATGAACGTCGCCTGGTGGTGcc < 1:1557494/100‑1 (MQ=255)
ttATGGTGTCGCTGATGCTGTCAGCGCCGGTGATTCTCTATCAGGTGTGGGCATGTATCGCCCCAGCGCTGTATAAGCATGAACGTCGCCTGGTGGTGcc < 2:1541026/100‑1 (MQ=255)
tGGTGTCGCTGATTCTGTCAGCTCCGGTGATTCTCTATCAGGTGTGGGCATTTATCGCCCCAGCGCTGTATAAGCATGAACGTCGCCTGGTGGTGCCgct < 2:1226222/100‑1 (MQ=255)
tGGTGTCGCTGATTCTGTCAGCTCCGGTGATTCTCTATCAGGTGTGGGCATTTATCGCCCCAGCGCTGTATAAGCATGAACGTCGCCTGGTGGTGCCgct > 2:1284815/1‑100 (MQ=255)
ggTGTCGCTGATTCTGTCAGCTCCGGTGATTCTCTATCAGGTGTGGGCATTTATCGCCCCAGCGCTGTATAAGCATGAACGTCGCCTGGTGGTGCCgctg > 2:365300/1‑100 (MQ=255)
ggTGTCGCTGATTCTGTCAGCGCCGGTGATTCTCTATCAGGTGTGGGCATTTATCGCCCCAGCGCTGTATAAGCATGAACGTCGCCTGGTGGTGCCgctg > 1:675169/1‑100 (MQ=255)
gtgtCGCTGATTCTGTCAGCTCCGGTGATTCTCTATCAGGTGTGGGCATTTATCGCCCCAGCGCTGTATAAGCATGAACGTCGCCTGGTGGTGCCgctgc < 1:1209017/100‑1 (MQ=255)
tCGCTGATTCTGTCAGCTCCGGTGATTCTCTATCAGGTGTGGGCATTTATCGCCCCAGCGCTGTATAAGCATGAACGTCGCCTGGTGGTGCCGCTGCTgg < 1:1521596/100‑1 (MQ=255)
tCGCTGATTCTGTCAGCTCCGGTGATTCTCTATCAGGTGTGGGCATTTATCGCCCCAGCGCTGTATAAGCATGAACGTCGCCTGGTGGTGCCGCTGCTgg < 1:1424012/100‑1 (MQ=255)
gATTCTGTCAGCTCCGGTGATTCTCTATCAGGTGTGGGCATTTATCGCCCCAGCGCTGTATAAGCATGAACGTCGCCTGGTGGTGCCGCTGCTGGTTTcc < 2:330198/100‑1 (MQ=255)
gATTCTGTCAGCTCCGGTGATTCTCTATCAGGTGTGGGCATTTATCGCCCCAGCGCTGTATAAGCATGAACGTCGCCTGGTGGTGCCGCTGCTGGTTTcc > 2:350454/1‑100 (MQ=255)
cTGTCAGCTCCGGTGATTCTCTATCAGGTGTGGGCATTTATCGCCCCAGCGCTGTATAAGCATGAACGTCGCCTGGTGGTGCCGCTGCTGGTTTCCAGct > 2:1489614/1‑100 (MQ=255)
cTGTCAGCTCCGGTGATTCTCTATCAGGTGTGGGCATTTATCGCCCCAGCGCTGTATAAGCATGAACGTCGCCTGGTGGTGCCGCTGCTGGTTTCCAGc > 1:1692358/1‑99 (MQ=255)
gTCAGCTCCGGTGATTCTCTATCAGGTGTGGGCATTTATCGCCCCAGCGCTGTATAAGCATGAACGCCGCCTGGTGGTGCCGCTGCTGGTTTCCAGctc > 2:1936389/1‑99 (MQ=255)
tCAGCGCCGGTGATTCTCTATCAGGTGTGGGCATTTATCGCCCCAGCGCTGTATAAGCATGAACGTCGCCTGGTGGTGCCGCTGCTGGTTTCCAGctctc > 1:917655/1‑100 (MQ=255)
cAGCTCCGGTGATTCTCTATCAGGTGTGGGCATTTATCGCCCCAGCGCTGTATAAGCATGAACGTCGCCTGGTGGTGCCGCTGCTGGTTTCCAGctctct < 1:365298/100‑1 (MQ=255)
cgcCGGTGATTCTCTATCAGGTGTGGGCATTTATCGCCCCAGCGCTGTATAAGCATGAACGTCGCCTGGTGGTGCCGCTGCTGGTTTCCAGCTCTctgct > 1:19277/1‑100 (MQ=255)
|
AGTTGCCGCAAGGTTCAACGATGATCGCCACCGACGTGGCCTCGCCGTTCTTTACGCCGATCAAGCTGACCTTTATGGTGTCGCTGATTCTGTCAGCGCCGGTGATTCTCTATCAGGTGTGGGCATTTATCGCCCCAGCGCTGTATAAGCATGAACGTCGCCTGGTGGTGCCGCTGCTGGTTTCCAGCTCTCTGCT > NC_000913/4022890‑4023085
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
N/A
