Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A11 F212 I0 R1
|
246 |
122.0 |
6097616 |
93.1% |
5676880 |
99.8 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
freq |
annotation |
gene |
description |
| RA |
NC_000913 |
4,022,987 |
G→T |
33.0% |
A84A (GCG→GCT) |
tatC → |
TatABCE protein translocation system subunit |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | NC_000913 | 4,022,987 | 0 | G | T | 33.0%
| 173.6
/ 97.9
| 126 | A84A (GCG→GCT) | tatC | TatABCE protein translocation system subunit |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (44/40); new base T (16/26); total (60/66) |
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.85e-01 |
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
Only 100 of 129 total aligned reads displayed.
GCAGTTGCCGCAAGGTTCAACGATGATCGCCACCGACGTGGCCTCGCCGTTCTTTACGCCGATCAAGCTGACCTTTATGGTGTCGCTGATTCTGTCAGCGCCGGTGATTCTCTATCAGGTGTGGGCATTTATCGCCCCAGCGCTGTATAAGCATGAACGTCGCCTGGTGGTGCCGCTGCTGGTTTCCAGCTCTCTGCTG > NC_000913/4022888‑4023086
|
gCAGTTGCCGCAAGGTTCAACGATGATCGCCACCGACGTGGCCTCGCCGTTCTTTACGCCGATCAAGCTGACCTTTATGGTGTCGCTGATTCTGTCAgcg < 1:1597771/100‑1 (MQ=255)
gTTGCCGCAAGGTTCAACGATGATCGCCACCGACGTGGCCTCGCCGTTCTTTACGCCGATCAAGCTGACCTTTATGGTGTCGCTGATTCTGTCAGCTCCg > 2:2413125/1‑100 (MQ=255)
ttGCCGCAAGGTTCAACGATGATCGCCACCGACGTGGCCTCGCCGTTCTTTACGCCGATCAAGCTGACCTTTATGGTGTCGCTGATTCTGTCAGCTCCgg < 2:1409041/100‑1 (MQ=255)
ttGCCGCAAGGTTCAACGATGATCGCCACCGACGTGGCCTCGCCGTTCTTTACGCCGATCAAGCTGACCTTTATGGTGTCGCTGATTCTGTCAGCTCCgg < 1:1336144/100‑1 (MQ=255)
tGCCGCAAGGTTCAACGATGATCGCCACCGACGTGGCCTCGCCGTTCTTTACGCCGATCAAGCTGACCTTTATGGTGTCGCTGATTCTGTCAGCGCCGGt > 1:2714078/1‑100 (MQ=255)
gCCGCTAGGTTCAACGATCATCGCCACCGACGTGGCCTCGCCGTTCTTTACGCCGATCAAGCTGACCTTTATGGTGTCGCTGATTCTGTCAGCGCCGGTg > 2:1240293/1‑100 (MQ=255)
gCCGCAAGGTTCAACGATGATCGCCACCGACGTGGCCTCGCCGTTCTTTACGCCGATCAAGCTGACCTTTATGGTGTCGCTGATTCTGTCAGCGCCGGTg < 1:110852/100‑1 (MQ=255)
gCCGCAAGGTTCAACGATGATCGCCACCGACGTGGCCTCGCCGTTCTTTACGCCGATCAAGCTGACCTTTATGGTGTCGCTGATTCTGTCAGCGCCGGTg < 1:1125726/100‑1 (MQ=255)
gCCGCAAGGTTCAACGATGATCGCCACCGACGTGGCCTCGCCGTTCTTTACGCCGATCAAGCTGACCTTTATGGTGTCGCTGATTCTGTCAACGCCGGt > 1:417943/1‑99 (MQ=255)
ccGCAAGGTTCAACGATGATCGCCACCGACGTGGCCTCGCCGTTCTTTACGCCGATCAAGCTGACCTTTATGGTGTCGCTGATTCTGTCAGCGCCGGTGa > 1:602092/1‑100 (MQ=255)
cGCAAGGTTCAACGATGATCGCCACCGACGTGGCCTCGCCGTTCTTTACGCCGATCAAGCTGACCTTTATGGTGTCGCTGATTCTGTCAGCTCCGGTGAt > 2:1888583/1‑100 (MQ=255)
gCAAGGTTCAACGATGATCGCCACCGACGTGGCCTCGCCGTTCTTTACGCCGATCAAGCTGACCTTTATGGTGTCGCTGATTCTGTCAGCGCCGGTGAtt < 2:867225/100‑1 (MQ=255)
cAAGGTTCAACGATGATCGCCACCGACGTGGCCTCGCCGTTCTTTACGCCGATCAAGCTGACCTTTATGGTGTCGCTGATTCTGTCAGCGCCGGTGATtc < 1:492206/100‑1 (MQ=255)
gTTCAACGATGATCGCCACCGACGTGGCCTCGCCGTTCTTTACGCCGATCAAGCTGACCTTTATGGTGTCGCTGATTCTGTCAGCTCCGGTGATTCTCTa < 2:609532/100‑1 (MQ=255)
tCAACGATGATCGCCACCGACGTGGCTTCGTCTTTCTTTATGCTGATCAAGCTGACCTTTATGGTGTCGCTGATTCTGTCAGCGCCGGTGATTCTCTATc < 1:1006850/100‑1 (MQ=255)
tCAACGATGATCGCCACCGACGTGGCCTTGCCGTTCTTTACGCCGATCAAGCTGACCTTTATGGTGTCGCTGATTCTGTCAGCTCCGGTGATTCTCTATc < 1:1440374/100‑1 (MQ=255)
tCAACGATGATCGCCACCGACGTGGCCTCGCCGTTCTTTACGCCGATCAAGCTGACCTTTATGGTGTCGCTGATTCTGTCAGCTCCGGTGATTCTCTATc < 2:2451024/100‑1 (MQ=255)
tCAACGATGATCGCCACCGACGTGGCCTCGCCGTTCTTTACGCCGATCAAGCTGACCTTTATGGTGTCGCTGATTCTGTCAGCTCCGGTGATTCTCTATc < 1:2227477/100‑1 (MQ=255)
tCAACGATGATCGCCACCGACGTGGCCTCGCCGTTCTTTACGCCGATCAAGCTGACCTTTATGGTGTCGCTGATTCTGTCAGCGCCGGTGATTCTCTATc > 1:492440/1‑100 (MQ=255)
tCAACGATGATCGCCACCGACGTGGCCTCGCCGTTCTTTACGCCGATCAAGCTGACCTTTATGGTGTCGCTGATTCTGTCAGCGCCGGTGATTCTCTATc > 1:1954540/1‑100 (MQ=255)
tCAACGATGATCGCCACCGACGTGGCCTCGCCGTTCTTTACGCCGATCAAGCTGACCTTTATGGTGTCGCTGATTCTGTCAGCGCCGGTGATTCTCTATc < 1:2235602/100‑1 (MQ=255)
aaCGATGATCGCCACCGACGTGGGCTCACCGCACTTTACGCCAATCAAGCTGAACCAACTGCTGTCGCCGATTATGTCAGCGCCGGTGATTCACTa > 2:1632925/1‑96 (MQ=255)
aaCGATGATCGCCACCGACGTGGCCTCGCCGTTCTTTACGCCGATCAAGCTGACCTTTATGGTGTCGCTGATTCTGTCAGCTCCGGTGATTCTCTATCAg < 2:18129/100‑1 (MQ=255)
aCGATGATCGCCACCGACGTGGCCTCGCCGTTCTTTACGCCGATCAAGCTGACCTTTATGGTGTCGCTGATTCTGTCAGCGCCGGTGATTCTCTATCAgg < 1:301628/100‑1 (MQ=255)
cGATGATCGCCACCGACGTGGCCTCGCCGTTCTTTACGCCGATCAAGCTGACCTTTATGGTGTCGCTGATTCTGTCAGCGCCGGTGATTCTCTATCAGgt > 1:420946/1‑100 (MQ=255)
cGATGATCGCCACCGACGTGACCTCGCCGTTCTTTACGCCGATCAAGCTGACCTTTATGGTGTCGCTGATTCTGTCAGCGCCGGTGATTCTCTATCAGgt > 2:1272403/1‑100 (MQ=255)
gatgatCGCCACCGACGTGGCCTCGCCGTTCTTTACGCCGATCAAGCTGACCTTTATGGTGTCGCTGATTCTGTCAGCGCCGGTGATTCTCTATCAGgtg < 1:2426274/100‑1 (MQ=255)
gatgatCGCCACCGACGTGGCCTCGCCGTTCTTTACGCCGATCAAGCTGACCGTTATGGTGTCGCTGATTCTGTCAGCTCTGGTTATTCTCTATCAGgtg < 2:340352/100‑1 (MQ=255)
tgatCGCCACCGACGTGGCCTCGCCGTTCTTTACGCCGATCAAGCTGACCTTTATGGTGTCGCTGATTCTGTCAGCGCCGGTGATTCTCTATCAGGtgtg > 1:617370/1‑100 (MQ=255)
gatCGCCACCGACGTGGCCTCGCCGTTCTTTACGCCGATCAAGCTGACCTTTATGGTGTCGCTGATTCTGTCAGCGCCGGTGATTCTCTATCAGGTGTgg > 1:93953/1‑100 (MQ=255)
atCGCCACCGACGTGGCCTCGCCGTTCTTTACGCCGATCAAGCTGACCTTTATGGTGTCGCTGATTCTGTCAGCGCCGGTGATTCTCTATCAGGTGTggg < 2:2714046/100‑1 (MQ=255)
tCGCCACCGACGTGGCCTCGCCGTTCTTTACGCCGATCAAGCTGACCTTTATGGTGTCGCAGATTCTGTCAGCGCCGGTGATTCTCTATCAGGTGTGGGc > 1:1623354/1‑100 (MQ=255)
cGCCACCGACGTGGCCTCGCCGTTCTTTACGCCGATCAAGCTGACCTTTATGGTGTCGCTGATTCTGTCAGCGCCGGTGATTCTCTATCAGGTGTGGGCa < 1:692297/100‑1 (MQ=255)
cGACGTGGCCTCGCCGTTCTTTACGCCGATCAAGCTGACCTTTATGGTGTCGCTGATTCTGTCAGCTCCGGTGATTCTCTATCAGGTGTGGGCATTTATc < 2:1893714/100‑1 (MQ=255)
gACGTGGCCTCGCCGTTCTTTACGCCGATCAAGCTGACCTTTATGGTGTCGCTGATTCTGTCAGCTCCGGTGATTCTCTATCAGGTGTGGGCATTTATCg < 1:607539/100‑1 (MQ=255)
gACGTGGCCTCGCCGTTCTTTACGCCGATCAAGCTGACCTTTATGGTGTCGCTGATTCTGTCAGCGCCGGTGATTCTCTATCAGGTGTGGGCATTTATCg < 2:1566762/100‑1 (MQ=255)
gTGGCCTCGCCGTTCTTTACGCCGATCAAGCTGACCTTTATGGTGTCGCTGATTCTGTCAGCTCCGGTGATTCTCTATCAGGTGTGGGCATTTATCGccc < 1:1654502/100‑1 (MQ=255)
tGGCCTCGCCGTTCTTTACGCCGATCAAGCTGACCTTTATGGTGTCGCTGATTCTGTCAGCGCCGGTGATTCTCTATCAGGTGTGGGCATTTATCGcccc < 2:181544/100‑1 (MQ=255)
ggCCTCGCCGTTCTTTACGCCGATCAAGCTGACCTTTATGGTGTCGCTGATTCTGTCAGCGCCGGTGATTCTCTATCAGGTGTGGGCATTTATCGCCCCa > 1:1106958/1‑100 (MQ=255)
ggCCTCGCCGTTCTTTACGCCGATCAAGCTGACCTTTATGGTGTCGCTGATTCTGTCAGCGCCGGTGATTCTCTATCAGGTGTGGGCATTTATCGCCCCa > 1:1552960/1‑100 (MQ=255)
gCCTCGCCGTTCTTTACGCCGATCAAGCTGACCTTTATGGTGTCGCTGATTCTGTCAGCTCCGGTGATTCTCTATCAGGTGTGGGCATTTATCGCCCCAg < 1:2589446/100‑1 (MQ=255)
gCCTCGCCGTTCTTTACGCCGATCAAGCTGACCTTTATGGTGTCGCTGATTCTGTCAGCGCCGGTGATTCTCTATCAGGTGTGGGCATTTATCGCCCCAg > 1:2027393/1‑100 (MQ=255)
tCGCCGTTCTTTACGCCGATCAAGCTGACCTTTATGGTGTCGCTGATTCTGTCAGCGCCGGTGATTCTCTATCAGGTGTGGGCATTTATCGCCCCAgcgc < 2:1138862/100‑1 (MQ=255)
cGCCGTTCTTTACGCCGATCAAGCTGACCTTTATGGTGTCGCTGATTCTGTCAGCTCCGGTGATTCTCTATCAGGTGTGGGCATTTATCGCCCCAGCGCt < 1:1600389/100‑1 (MQ=255)
gCCGTTCTTTACGCCGATCAAGCTGACCTTTATGGTGTCGCTGATTCTGTCAGCGCCGGTGATTCTCTATCAGGTGTGGGCATTTATCGCCCCAGCGCTg < 1:2304720/100‑1 (MQ=255)
accGTTCTTTACGCCGATCAAGCTGACCTTTATGGTGTCGCTGATTCTGCCAGCGCCGGTGATTCTCTATCAGGTGTGGGCGTTTATCGCCCCAGCGCTg > 1:2772489/2‑100 (MQ=255)
ccGTTCTTTACGCCGATCAAGCTGACCTTTATGGTGTCGCTGATTCTGTCAGCTCCGGTGATTCTCTATCAGGTGTGGGCATTTATCGCCCCAGCGCTGt < 1:693700/100‑1 (MQ=255)
ccGTTCTTTACGCCGATCAAGCTGACCTTTATGGTGTCGCTGATTCTGTCAGCGCCGGTGATTCTCTATCAGGTGTGGGCATTTATCGCCCCAgc > 2:2174808/1‑95 (MQ=255)
ccGTTCTTTACGCCGATCAAGCTGACCTTTATGGTGTCGCTGATTCTGTCAGCGCCGGTGATTCTCTATCAGGTGTGGGCATTTATCGCCCCAGCGCTGt > 1:1883009/1‑100 (MQ=255)
ccGTTCTTTACGCCGATCAAGCTGACCTTTATGGTGTCGCTGATTCTGTCAGCGCCGGTGATTCTCTATAAGGTATGGGCATTTAACGCCCCAgcgc > 1:1613833/1‑97 (MQ=255)
cGTTCTTTACGCCGATCAAGCTGACCTTTATGGTGTCGCTGATTCTGTCAGCGCCGGTGATTCTCTATCAGGTGTGGGCATTTATCGCCCCAGCGCTGta < 1:347030/100‑1 (MQ=255)
gTTCTTTACGCCGATCAAGCTGACCTTTATGGTGTCGCTGATTCTGTCAGCTCCGGTGATTCTCTATCAGGTGTGGGCATTTATCGCCCCAGCGCTGtat < 1:2413154/100‑1 (MQ=255)
gTTCTTTACGCCGATCAAGCTGACCTTTATAGTATCGCTGATTCTGTCAGCTCCGGTGATGCTCAATAAGGTGAGGGCatatataccccacgc > 2:2609376/1‑84 (MQ=255)
ttCTTTACGCCGATCAAGCTGACCTTTATGGTGTCGCTGATTCTGTCAGCGCCGGTGATTCTCTATCAGGTGTGGGCATTTATCGCCCCAGCGCTGtata > 1:1610716/1‑100 (MQ=255)
ttCTTTACGCCGATCAAGCTGACCTTTATGGTGTCGCTGATTCTGTCAGCGCCGGTGATTCTCTATCAGGTGTGGGCATTTATCGCCCCAGCGCTGtata < 2:2245554/100‑1 (MQ=255)
ttCTTTACGCCGATCAAGCTGAACTTTATGGTGTCGTTGATTCTGTCAGCTCCGGTGATTCTCTATCAGGTGTGGGCATTTATCGCCCCAGCGCTGtata < 1:129495/100‑1 (MQ=255)
tCTTTACGCCGATCAAGCTGACCTTTATGGTGTCGCTGATTCTGTCAGCGCCGGTGATTCTCTATCAGGTGTGGGCATTTATCGCCCCAGCGCTGTATaa > 1:1291163/1‑100 (MQ=255)
cTTTACGCCGATCAAGCTGACCTTTATGGTGTCGCTGATTCTGTCAGCGCCGGTGATTCTCTATCAGGTGTGTGCATTTATCGCCCCAGCGCTGTATAAg < 2:2545894/100‑1 (MQ=255)
cTTTACGCCGATCAAGCTGACCTTTATGGTGTCGCTGATTCTGTCAGCGCCGGTGATTCTCTATCAGGTGTGGGCATTTATCGCCCCAGCGCTGTATAAg < 2:48231/100‑1 (MQ=255)
cTTTACGCCGATCAAGCTGACCTTTATGGTGCCGCTGATTCTGTCAGCTCCGGTGATTCTCTATCAAGTGTAGGCATTTATCACACCAGCGCTGTATAAg > 1:1207934/1‑100 (MQ=255)
tttACGCCGATCAAGCTGACCTTTATGGTGTCGCTGATTCTGTCAGCGCCGGTGATTCTCTATCAGGTGTGGGCATTTATCGCCCCAGCGCTGTATAAGc > 1:500490/1‑100 (MQ=255)
tttACGCCGATCAAGCTGACCTTTATGGTGTCGCTGATTCTGTCAGCGCCGGTGATTCTCTATCAGATTTTGGCATTTATCGCCCCAGCGCTATATaa > 1:1354488/1‑98 (MQ=255)
ttACGCCGATCAAGCTGACCTTTATGGTGTCGCTGATTCTGTCAGCTCCGGTGATTCTCTATCAGGTGTGGGCATTTATCGCCACAGCGCTGTATAAGCa > 2:38553/1‑100 (MQ=255)
tACGCCGATCAAGCTGACCTTTATGGTGTCGCTGATTCTGTCAGCGCCGGTGATTCTCTATCAGGTGTGGGCATTTATCGCCCCAGCGCTGTATAAGCAt < 2:415973/100‑1 (MQ=255)
cGCCGATCAAGCTGACCTTTATTTTTTCTCTTATTCTTTCAGCTCCTTTTATTCTCTATCAGGTGTGGGCATTTATCGCCCCAGCGCTGTATAAGCATg < 1:2328370/99‑1 (MQ=255)
cGCCGATCAAGCTGACCTATATGGTGTCGCTGATTCTGTCAGCGCCGGTGATTCTCTATCAGGTGTGGGCATTTATCGCCCCAGCGCTGTATAAGCATGa > 2:973495/1‑100 (MQ=255)
gCCGATCAAGCTGACCTTTATGGTGTCGCTGATTCTGTCAGCTCCGGTGATTCTCTATAAGGTATGGGCATTTATCGCCCCAGCGCTGTATAAGCATGaa > 1:25077/1‑100 (MQ=255)
gCCGATCAAGCTGACCTTTATGGTGTCGCTGATTCTGTCAGCGCCGGTGATTCTCTATCAGGTGTGGGCATTTATCGCCCCAGCGCTGTATAAGCATGaa < 2:642587/100‑1 (MQ=255)
cGATCAAGCTGACCTTTATGGTGTCGCTGATTCTGTCAGCTCCGGTGATTCTCTATCAGGTGTGGGCATTTATCGCTCCAGCGCTGTATAAGCATGAACg < 2:143896/100‑1 (MQ=255)
aTCAAGCTGACCTTTATGGTGTCGCTGATTCTGTCAGCTCCGGTGATTCTCTATCAGGTGTGGGCATTTATCGCCCCAGCGCTGTATAAGCATGAACGTc < 1:994738/100‑1 (MQ=255)
tCAAGCTGACTTTTATGGTTTCGCTTATTCTGTCAGCGTCGGTGATTCTCTATCAGGTGTGGGCATTTATCGCCCCAGCGCTGTATAAGCATGAACGTCg < 1:2444272/100‑1 (MQ=255)
aGCTGACCTTTATGGTGTCGCTGATTCTGTCAGCTCCGGTGATTCTCTATCAGGTGTGGGCATTTATCGCCCCAGCGCTGTATAAGCATGAACGTCGCCt > 1:2261157/1‑100 (MQ=255)
aGCTGACCTTTATGGTGTCGCTGATTCTGTCAGCGCCGGTGATTCTCTATCAGGTGTGGGCATTTATCGCCCCAGCGCTGTATAAGCATGAACGTCGCCt > 1:123388/1‑100 (MQ=255)
aCCTTTATGGTGTCGCTGATTCTGTCAGCTCCGGTGATTCTCTATCAGGTGTGGGCATTTATCGCCCCAGCGCTGTATAAGCATGAACGTCGCCtggtgg > 1:1673102/1‑100 (MQ=255)
aCCTTTATGGTGTCGCTGATTCTGTCAGCGCCGGTGATTCTCTATCAGGTGTGGGCATTTATCGCCCCAGCGCTGTATAAGCATGAACGTCGCCtggtgg > 2:2192605/1‑100 (MQ=255)
ccTTTATGGTGTCGCTGATTCTGTCAGCGCCGGTGATTCTCTATCAGGTGTGGGCATTTATCGCCCCAGCGCTGTATAAGCATGAACGTCGCCTggtggt > 2:1466353/1‑100 (MQ=255)
ccTTTATGGTGTCGCTGATTCTGTCAGCGCCGGTGATTCTCTATCAGGTGTGGGCATTTATCGCCCCAGCGCTGTATAAGCATGAACGTCGCCTggtggt > 1:1917293/1‑100 (MQ=255)
ccTTTATGGTGTCGCTGATTCTGTCAGCGCCGGTGATTCTCTATCAGGTGTGGGCATTTATCGCCCCAGCGCTGTATAAGCATGAACGTCGCCTggtggt > 1:464796/1‑100 (MQ=255)
tttATGGTGTCGCTGATTCTGTCAGCTCCGGTGATTCTCTATCAGGTGTGGGCATTTATCGCCCCAGCGCTGTATAAGCATGAACGTCGCCTGGTGGTGc < 1:2363286/100‑1 (MQ=255)
tttATGGTGTCGCTGATTCTGTCAGCGCCGGTGATTCTCTATCAGGTGTGGGCATTTATCGCCCCAGCGCTGTATAAGCATGAACGTCGCCTGGTGGTGc > 1:2276642/1‑100 (MQ=255)
ttATGGTGTCGCTGATTCTGTCAGCTCCGGTGATTCTCTATCAGGTGTGGGCATTTATCGCCCCAGCGCTGTATAAGCATGAACGTCGCCTGGTGGTGcc > 1:2616324/1‑100 (MQ=255)
ttATGGTGTCGCTGATACTGTCAGCGCCGGTGATTCTCTATCAGGTGTGGGCATTTATCGCCCCAGCGCTGTATAAGCATGAACGTCGCCTGGTGGTGcc < 2:1765566/100‑1 (MQ=255)
tATGGTGTCGCTGATTCTGTCAGCGCCGGTGATTCTCTATCAGGTGTGGGCATTTATCGCCCCAGCGCTGTATAAGCATGAACGTCGCCTGGTGGTGCCg > 2:16789/1‑100 (MQ=255)
aTGGTGTCGCTGATTCTGTCAGCGCCGGTGATTCTCTATCAGGTGTGGGCATTTATCGCCCCAGCGCTGTATAAGCATGAACGTCGCCTGGTGGTGCCgc < 2:2410278/100‑1 (MQ=255)
ggTGTCGCTGATTCTGTCAGCGCCGGTGATTCTCTATCAGGTGTGGGCATTTATCGCCCCAGCGCTGTATAAGCATGAACGTCGCCTGGTGGTGCCgctg > 1:1032380/1‑100 (MQ=255)
tgtCGCTGATTCTGTCAGCGCCGGTGATTCTCTATCAGGTGTGGGCATTTATCGCCCCAGCGCTGTATAAGCATGAACGTCGCCTGGTGGTGCCgctgct < 1:670841/100‑1 (MQ=255)
tCGCTGATTCTGTCAGCGCCGGTTATTCTCTATCAGTTGTGGGCATTTATCGCGCCAGCGCTGTATAAGCATGAACGTCGCCTGGTGGTGCCGCTGCTgg < 1:404664/100‑1 (MQ=255)
cGCTGATTCTGTCAGCTCCGGTGATTCTCTATCAGGTGTGGGCATTTATCGCCCCAGCGCTGTATAAGCATGAACGTCGCCTGGTGGTGCCGCTGCTGGt > 1:2147926/1‑100 (MQ=255)
gCTGATTCTGTCAGCGCCGGTGATTCTCTATCAGGTGTGGGCATTTATCGCCCCAGCGCTGTATAAGCATGAACGTCGCCTGGTGGTGCCGCTGCTGGtt < 1:2874715/100‑1 (MQ=255)
gCTGATTCTGTCAGCGCCGGTGATTCTCTATCAGGTGTGGGCATTTATCGCCCCAGCGCTGTATAAGCATGAACGTCGCCTGGTGGTGCCGCTGCTGGtt < 2:157095/100‑1 (MQ=255)
cTGATTCTGTCAGCTCCGGTGATTCTCTATCAGGTGTGGGCATTTATCGCCCCAGCGCTGTATAAGCATGAACGTCGCCTGGTGGTGCCGCTGCTGGttt < 1:1577746/100‑1 (MQ=255)
gATTCTGTCAGCTCCGGTGATTCTCTATCAGGTGTGGGCATTTATCGCCCCAGCGCTGTATAAGCATGAACGTCGCCTGGTGGTGCCGCTGCTGGTTTcc < 1:369743/100‑1 (MQ=255)
cTGTCAGCTCCGTTGATTCTCTATCAGGTGTGGGCATTTATCGCCCCAGCGCTGTATAAGCATGAACGTCGCCTGGTGGTGCCGCTGCTGGTTTCCAg > 2:134220/1‑98 (MQ=255)
tGTCAGCGCCGGTGATTCTCTATCAGGTGTGGGCATTTATCGCCCCAGCGCTGTATAAGCATGAACGTCGCCTGGTGGTGCCGCTGCTGGTTTCCAGctc < 2:2755966/100‑1 (MQ=255)
tGTCAGCGCCGGTGATTCTCTATCAGGTGTGGGCATTTATCGCCCCAGCGCTGTATAAGCATGAACGTCGCCTGGTGGTGCCGCTGCTGGTTTCCAGctc < 2:865197/100‑1 (MQ=255)
tGTCAGCGCCGGTGATTCTCTATCAGGTGTGGGCATTTATCGCCCCAGCGCTGTATAAGCATGAACGTCGCCTGGTGGTGCCGCTGCTGGTTTCCAGctc < 2:1363417/100‑1 (MQ=255)
gTCAGCGCCGGTGATTCTCTATCAGGTGTGGGCATTTATCGCCCCAGCGCTGTATAAGCATGAACGTCGCCTGGTGGTGCCGCTGCTGGTTTCCAGctct > 2:1552527/1‑100 (MQ=255)
cAGCTCCGGTGATTCTCTATCAGGCGTGGGTATTTATCGCCCCAGCGCTGTATAAGCATGAACGTCGCCTGGTGGTGCCGCTGCTGGTTTCCAGctttct > 2:2111973/1‑100 (MQ=255)
aGCGCCGGTGATTCTCTATCAGGTGTGGGCATTTATCGCCCCAGCGCTGTATAAGCATGAACGTCGCCTGGTGGTGCCGCTGCTGGTTTCCAGCTCTctg > 2:1567998/1‑100 (MQ=255)
gcCGGTGATTCTCTATCAGGTGTGGGCATTTATCGCCCCAGCGCTGTATAAGCATGAACGTCGCCTGGTGGTGCCGCTGCTGGTTTCCAGCTCTctgctg < 1:2242854/100‑1 (MQ=255)
|
GCAGTTGCCGCAAGGTTCAACGATGATCGCCACCGACGTGGCCTCGCCGTTCTTTACGCCGATCAAGCTGACCTTTATGGTGTCGCTGATTCTGTCAGCGCCGGTGATTCTCTATCAGGTGTGGGCATTTATCGCCCCAGCGCTGTATAAGCATGAACGTCGCCTGGTGGTGCCGCTGCTGGTTTCCAGCTCTCTGCTG > NC_000913/4022888‑4023086
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
N/A
